2Y7JA

Structure of human phosphorylase kinase, gamma 2
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
ELPDWAAAKEFYQKYDPKDVIGRGVSSVVRRCVHRATGHEFAVKIMEVTAERLSPEQLEEVREATRRETHILRQVAGHPHIITLIDSYESSSFMFLVFDLMRKGELFDYLTEKVALSEKETRSIMRSLLEAVSFLHANNIVHRDLKPENILLDDNMQIRLSDFGFSCHLEPGEKLRELCGTPGYLAPEILKCSMDETHPGYGKEVDLWACGVILFTLLAGSPPFWHRRQILMLRMIMEGQYQFSSPEWDDRSSTVKDLISRLLQVDPEARLTAEQALQHPFFER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords PHOSPHORYLASE B KINASE GAMMA CATALYTIC CHAIN, TESTIS/LIVER I
publication title Structure of Human Phosphorylase Kinase, Gamma 2
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.19: Phosphorylase kinase.
pdb deposition date 2011-01-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2y7jA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2y7jA01
2R3PA 2UW8A 3RTPA 2CN5A 3VULA 3V5JA 4EH3A 4L67A 1QPJA 4GVJA 5FTOA 5T68A 4J71A 4C37A 5CSVA 3IONA 5DPVA 3W1FA 5M57A 1U59A 2CLQA 1NY3A 3DK6A 4TYEA 5HICA 2XIYA 5FBNC 3NS9A 4XG7A 2EB3A 2XS0A 3F3UA 3RAIA 3N4UA 4P7EA 3ZOSA 4DBNA 3U51A 3TDVA 4Z7HA 5D12A 1SYKA 1Q62A 3DAEA 3NCGA 4QQ5A 2ZB0A 3MY5A 1OL5A 5KMNA 3LM0A 4ZTNA 2PE2A 5HNGA 5EQEA 3EWHA 3ORIA 4WNPA 5AP4A 4XG3A 1JOWB 4C57A 1EH4A 3BYVA 4KRDA 2VGOA 5B2LA 5E90A 3FXXA 4CKJA 5KNJA 1SMHA 4YZMA 3TUBA 1M2RA 1ZOGA 4TWPA 5J1WA 3QHWA 4OBQA 3NWWA 4PF4A 4D1ZA 3TM0A 1OI9A 4ZJVA 5IMEA 5J7HA 3BLRA 5FG8A 2RL5A 4H3BA 3DJ6A 3ZRLA 3LJ0A 1YXSA 3KF7A 3QCSA 1XH7A 5D9HA 4FKOA 3FQEA 4KSPA 4IQ6A 3O7LB 4PY1A 3S95A 3ZS5A 4FG9A 3HV3A 1M14A 5ANJA 3KVXA 1U5RA 4YJSA 1XBAA 5BNJA 3MFRA 3F3WA 2IVSA 4BZNA 3OCGA 3C4XA 3TUDA 4F70A 2R3RA 1WFCA 4XOZA 2BDJA 4JDHA 5GJFA 5HCYA 3P1AA 3R63A 3P79A 4UMPA 5AV3A 2XCHA 2YN8A 4MF1A 4IC8A 1HOWA 2J0JA 2PUUA 3TG1A 4FKLA 3C5IA 2UW4A 5CX9A 4FSWA 5M09A 4GRBA 3DK7A 4CKIA 3EFKA 1ZY4A 3FQHA 5DLSA 4RJ8A 4NTTA 4CFFA 3KXZA 3UYSA 4BDCA 1YWRA 4BCOA 3DZOA 2B7AA 3DY7A 2R2PA 5HNBA 3NVKI 4X6QC 5L3AA 3M1SA 2CJMA 4M15A 5A4EA 3QRUA 2X2KA 3QD3A 2J90A 4RVMA 3PDTA 2C4GA 2Y4IB 5IQAA 4APPA 4L53A 3OUKA 3WE4A 5IA2A 5C4LA 2CKOA 4AS0A 3T3UA 3MB7A 2GDOA 4PTEA 5BVDA 5JEBA 3R7OA 4A7CA 1XH9A 3TKHA 4V04A 2F9GA 3S00A 3AMBA 5E91A 2JD5A 3BEAA 4UMQA 5H8BA 3D7ZA 4XBRA 4IX4A 1YI3A 4NU1A 1PKDA 3IW5A 4LOPA 4IFGA 4R3CA 5EYCA 4QYYA 2W5HA 4EI4A 3AMAA 4K8AA 4MCVA 4OGRA 1UNHA 3EN9A 4NM0A 4GK2A 1U54B 3GU6A 3HNGA 5IU2A 5TO8A 3RNYA 2WQBA 2ZYBA 1OGUA 3CIKA 3D4QA 3GGFA 3LXLA 4O27B 5EI2A 2F2UA 1JNKA 2BDWA 3QCYA 5DHJA 3RM6A 3D7TA 3ZRKA 5I4NA 3KK8A 5I9YA 4RIYB 1ZMVA 3QQHA 4FOBA 5F1ZA 3QLFA 4ZS0A 3K54A 5DA3A 4C38A 4IM3A 5EDPA 2OXYA 5EG3A 3V5PA 1RDQE 3C0IA 2QONA 3NGAA 3QUDA 4YZCA 2XUUA 3ORNA 5HE2A 4RA5A 4XV2A 3TV4A 3VBXA 4BCJA 2JDVA 4O2ZA 3RAWA 3B8QA 3PY3A 4R5YA 2F7EE 2PVFA 1KOBA 4P5QA 1FGKA 4F1OA 5ITAA 3WIGA 4HGEA 3FZ1A 4KSQA 5AP3A 3FYJX 3H4JA 2UZDA 3H0YA 3ZC6A 2W05A 3G51A 4CFXA 2C3LA 2ZDUA 1TQPA 3R1NA 4GJ3A 4OTRA 2X9FA 4X21A 1XH5A 4GK3A 3NYNA 4BB4A 4RZWA 4H39A 2YIWA 3Q5IA 4FSNA 4WKQA 1QPEA 2R3HA 1KOAA 3V5TA 4UWBA 4O6LA 4L45A 2BAJA 2OFVA 4FODA 4AP7A 4Z16A 2XCKA 3R9RA 3NZ0A 4USDA 2XJ1A 1X8BA 2VTLA 4IB3A 2QOIA 4UWYA 4WUAA 4ANQA 3FXWA 4G17A 2BRNA 1Q61A 2ERKA 5EW3A 2ITNA 2F57A 4TYIA 5H3QA 4FNXA 3A7JA 3FWQA 3GCSA 3PXFA 3BZ3A 3ORTA 4KA3A 3T3VA 4CYJA 3Q6UA 5IQHA 2BRGA 4QYFA 2VV9A 3ZLYA 3F5PA 4GG5A 4I5PA 2C6MA 5CVGA 3ZO1A 5EKNA 2PZPA 4ZS4A 3LCTA 5D1JA 1QPCA 1WBPA 4ZZMA 3DKCA 3BGZA 3HA6A 4MNEB 4PMMA 4WO5A 1SVEA 4AAAA 4R3PA 2OJFE 1MQ4A 2YERA 3FDNA 3VAPA 4MWIA 3F6XA 2YZAA 4ZTHA 5FP5A 3KRRA 1ZYLA 2B9HA 4YLKA 3FSKA 3VC4A 1H1PA 3E88A 3F88A 3QA8A 4HPUE 2Z2WA 4QRCA 3FZPA 3NUPA 3KRLA 2P55A 2ZV9A 5CXHA 5IG1A 3NLBA 3P7AA 2X2MA 3EQBA 4TW9A 3ZEPA 3WF9A 3EIDA 4G3EA 4MBLA 3TN8A 3BEGA 2Z7SA 4J7BA 4JG8A 5CEQA 4FNYA 1BL6A 3DKOA 4QNAA 4D9UA 3ZEWA 3FQSA 4CT2A 4U80A 4XUFA 1OIYA 5HKMA 5HQ0A 1UVRA 1KE7A 5EM8A 5I9WA 3MH2A 3L1SA 4O84A 4XS2A 1K2PA 4ACGA 2C3IB 3ZHPC 3MPTA 4Y5QA 4C3PA 3VUGA 3PPKA 3KXNA 4WG4A 4BDIA 1GY3A 3MVJA 3CPBA 2OG8A 3FUPA 4I5CA 5CENA 2I0VA 4WNOA 2GNIA 2XA4A 2E2BA 2ZM1A 1CKJA 2Y6OA 4FTMA 4EJ7A 3FI2A 1YXXA 3CC6A 4RLLA 4GH2A 5M44A 1OL7A 4O96A 2IPXA 2C6TA 2XB7A 3PE2A 4FTQA 4EK6A 5EDQA 1GZKA 3CP9A 4D2RA 2HZIA 3LMIA 3SW4A 4MAOA 4TL0A 1DM2A 5IEXA 3AD4A 4FV9A 1Y91A 4BIDA 4FGRA 2JGZA 2YIQA 4XV1A 5I5ZA 4RIYA 3QA0A 4A4LA 5A54A 4BDBA 2JKOA 4DFBA 2C47A 1U4DA 4KKHA 4CV8A 1BL7A 4YLJA 2QOKA 3LCDA 2X2LA 4JBPA 2JITA 3MA3A 2ITQA 3ERKA 2GFSA 3HUCA 4R1YA 2X81A 1QL6A 3VRYA 4DA5A 2Q0BA 3A4OX 3N4TA 1LPUA 1W7HA 4Q9ZA 5HD7A 2QHMA 1NT2A 4L7FA 3PIYA 5AP5A 3V04A 4DFYA 4DH8A 3IS5A 4FKRA 3QXPA 5DE2A 4F09A 3BQRA 3DGKA 5FEQA 2WB8A 4HOKA 1NVRA 5EM5A 3EN5A 3VWAA 3CD8A 3LFNA 5AV1A 3A7IA 5BMSA 3E64A 4FUYA 3MS9A 4O0VA 4M97A 1VYWA 4R3RA 4X2KA 3ZONA 3U87A 4I6FA 3NR9A 3QXOA 3BYMA 4BWPA 1GIJA 4NFNA 2ITWA 4DBXA 2XJ0A 4C61A 5HD4A 5LXMA 2EXCX 2VTIA 4FK3A 2V62A 4W9XA 3EMGA 2RGPA 4BWXA 2GS2A 5CU0A 5LJJA 4O0TA 4YLLA 1UKIA 4BY9E 4I0RA 3LFEA 3UIBA 4BKYA 3QX4A 3O51A 3L8VA 3AC2A 4Z9LA 4NM7A 2UUEA 4XH6A 4JLCA 3EHAA 3KXXA 5L8LA 3FLYA 2GNJA 3KXHA 3FYKX 3DLSA 3FHIA 2CDZA 4R8QA 2R3QA 3DDPA 4V05A 2WEVA 3BGPA 2FYSA 3D15A 4XCUA 2CGVA 1YKRA 4ORKA 4ZTMA 2Y0AA 2R7IA 4R6VA 4MK0A 2GS7A 5A4TA 3IOPA 2X6EA 4QTBA 2OICA 4G34A 2EB2A 2REIA 2GHLA 2PL0A 2UW7A 2WIHA 4ZY5A 4WBBB 1FVVA 3TDWA 3KREA 5HX8A 2I6LA 4HYHA 3UP7A 4OR5A 2OF4A 4QP8A 1REKA 3UG2A 4RIWB 4ZTSA 4BCPA 3DJ7A 4NH1A 4JDKA 3QL8A 3MESA 3EQDA 2X8EA 5FXSA 3LQ5A 5FTQA 4XMOA 5EQPA 4ANBA 1PXKA 2YM3A 4KIKA 4ANMA 4AZWA 1ND4A 2C1AA 3POOA 4IBMA 3MIAA 5CTPA 5JGDA 4O7TA 1ERKA 4ZZOA 2H9VA 2W1FA 5HCXA 2J51A 3DTCA 4FV2A 3ANRA 4TYJA 4QTDA 2PHKA 4ZMFA 2WAJA 3CTJA 3NUUA 4CCUA 4XG8A 3I0QA 3R9OA 4XP2A 1MQBA 2YM8A 4YPSA 3ZTXA 1R0EA 1SVHA 4FR4A 3NIZA 4B9DA 3ZLSA 4AN3A 1OVEA 5HE3A 4AOJA 2XJ2A 1MUOA 5E1SA 4IZAA 4X2FA 1PMNA 2VAGA 3PWDA 3R01A 2CCHA 3PSDA 2G2FA 1YWVA 4B99A 4O0SA 4CZYB 4WRSA 2WTKC 4OAVB 2BDFA 3FJQE 1H25A 4OTHA 2H8HA 4YJRA 4F4PA 2R5TA 5LWMA 3Q9YA 4YBKA 3E8CA 3NPCA 3CSVA 2DYLA 3G9LX 3DXNA 3SRVB 3VUHA 3SOAA 3C51A 3W2CA 4EOJA 4BTFA 2B1PA 3A60A 3C7QA 2V7AA 4KB8A 1GZNA 1PXNA 2W1IA 3K2LA 3QZHA 4FV4A 2OBJA 4O0YA 4PQNA 4R7HA 4WSQA 3WZDA 4BBEA 4RX9A 1XQZA 5LQFA 4JVGA 5DBXA 3GU5A 2J0MB 4C3FA 2GHGA 2IWIA 4ENXA 4I41A 4FV8A 5I9UA 1F0QA 4D4VA 5L2IA 3DPKA 4RX5A 1H1QA 4GU9A 3NUSA 3FLSA 4BTKA 4HVIA 4AX8A 3LQ3A 4WNMA 3ZRMA 2ZOQA 3BRBA 3VS6A 3PSCA 5B7VA 4GT5A 4E5AX 3SG8A 4UY9A 1GNGA 3MFTA 2PZ5A 5HE1A 3F3ZA 1OKYA 2HAKA 4D0WA 4U9AA 4F6WA 4BKJA 3FHRA 3OCSA 2OXXA 4RC3A 3BKBA 5ICPA 3G5DA 2UW3A 1H00A 2YFXA 4DEBA 3V01A 3IDBA 4EC8A 4FGBA 5CEKA 3BLHA 4M69A 3PG1A 1PY5A 5JN2A 4ONAA 2JEDA 4CXAA 2CSNA 2X1NA 4AT3A 3OY1A 4TWCA 4FSYA 3PJ2A 4CRSA 2VNYA 3KMUA 4O22A 5HG5A 1J91A 2PZYA 3COIA 3JVSA 1DAWA 3KXGA 1YWNA 4I0SA 4XBUA 3D14A 4LL0A 4A9SA 5E4HA 5AP1A 2QO2A 2VRXA 4CV9A 2OZAB 1Y57A 4GL9A 1CDKA 2QKWB 4U42A 3DFCB 3RPVA 2UW5A 1XH8A 2O63A 2I0EA 4L3LA 4N6YA 3EOCA 3QBNA 4BDAA 4TXCA 2VU3A 4FKJA 3LFAA 3WZEA 3ZFYA 3COKA 5M4CA 4GW8A 1P4FA 2WMRA 2YIXA 4CFVA 2Z02A 2X7FA 3VBTA 4DH7A 1YVJA 2IZUA 4C58A 2FSMX 4L42A 4FTUA 4IMYA 5TE0A 2C3JA 2VD5A 2LAVA 4HVDA 5EKOA 3FMJA 4BFMA 3PZHA 2I1MA 2W17A 3QWKA 4IAZA 4QP2A 5KMMA 4G9RA 2ZVAA 3A2CA 5GNKA 3ZUTA 1PF8A 3FZTA 4USFA 1CMKE 5JMSA 4C4EA 3Q04A 3F2RA 1YOLA 4ZAUA 2RKUA 3AQVA 3HEGA 4K2RA 5GIPE 1M17A 1PMUA 5HLPA 4YU2A 2PUPA 4ITHA 4GKHA 4PPAA 3R00A 4YHJA 3KRWA 5LVPA 5EW8A 5FP6A 1Q8WA 2P0CA 3ZSGA 3D5UA 3LMHA 4ZEGA 4U97A 3F69A 2UZVA 2VWUA 3C4CA 5KCVA 4ZOGA 4RQKA 2Y8OA 1FQ1B 4M7IA 3GOKA 3RHXA 3V5WA 4F65A 2UVZA 4CQEA 1XO2B 2C30A 2OI4X 3QF9A 1NW1A 4BZDA 2NP8A 3LMGA 5HO8A 4PX6A 5G1XA 3A7GA 4QMXA 2BAKA 5CF6A 4BDEA 1W82A 5KHXA 3VO3A 3BI6A 5HNIX 4GCJA 2BRHA 4AF3A 3KL8A 5HTIA 5LWNA 4B4LA 1VEBA 2OH4A 4LMUA 2HXQA 2W06A 3ID6C 5DFPA 2WMBA 3D0EA 2YIYA 3DQXA 3IW7A 3DLZA 4MWHA 4FA2A 4FV0A 2NRYA 3UO6A 4D5HA 3MV5A 1KE6A 4IM0A 4DFUA 4JS8A 4HJOA 4PDOA 4F7LA 2J5FA 2OO8X 4M14A 1LP4A 1NXKA 3U6JA 3AT2A 3TUCA 3I0OA 5HBHA 5EHYA 2ZJWA 3U6HA 1BX6A 2WTJA 4U6RA 3K3JA 1H1SA 4LMNA 3OWPA 2OIDA 3PVUA 5T6KA 1OL6A 2OH0E 2W0JA 3M42A 4CCBA 4E6QA 4FG7A 3AOXA 4UZHA 3ZZWA 1Z9XA 2BZJA 4F99A 3IDCA 4B8MA 4QTEA 5IEYA 4M68A 1YDTE 2R3JA 3H10A 2ITUA 4DEEA 4S31A 4RVLA 1GIHA 5IA5A 1ZYDA 2VX1A 3GC7A 4MD9E 4FZDB 2BFYA 4FTJA 5I9XA 4YSMA 1ZMUA 2WGJA 2WU7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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