2Y89A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase a (variant d11n)
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
244
structure length
240
Chain Sequence
MPLILLPAVNVVEGRAVRLVQGKAGSQTEYGSAVDAALGWQRDGAEWIHLVDLDAAFGRGSNHELLAEVVGKLDVQVELSGGIRDDESLAAALATGCARVNVGTAALENPQWCARVIGEHGDQVAVGLDVQIIDGEHRLRGRDGGDLWDVLERLDSEGCSRFVVTDITKDGTLGGPNLDLLAGVADRTDAPVIASGGVSSLDDLRAIATLTHRGVEGAIVGKALYARRFTLPQALAAVRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Isomerase
molecule keywords PHOSPHORIBOSYL ISOMERASE A
publication title Bisubstrate Specificity in Histidine/Tryptophan Biosynthesis Isomerase from Mycobacterium Tuberculosis by Active Site Metamorphosis.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 72
structure length 240
sequence length 244
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2y89A00
1OFEA 1LZOA 1W0MA 4JYDA 2PRHA 3GDKA 4O18A 2QJIA 2I9EA 1RQEA 3DGRA 3FKKA 3NOEA 4GUIA 4TMCA 3VNDA 4LT9A 5LNVA 2FB2A 1CW2A 3HGSA 1ZFJA 1FWRA 4QNEA 3TSMA 3QFEA 2ZRXA 2G96A 3QZEA 4JTEA 3W76A 2X1UA 1L6YA 1OFQA 4CCEA 1W3NA 3IVSA 3DZ1A 3W7HA 3HIJA 1WQ5A 1BWKA 1L9WA 1OFBA 3VE9A 3DFNA 4S2BA 3L9CA 1W1ZA 2NXHA 1JCNA 3PBVA 3N2XA 3CC1A 5D30A 3MHUA 3EXRA 3NQAA 1DKWA 3GDTA 3KRZA 3USBA 3W1QA 4AHQA 3THAA 2FIQA 3NM1A 4ALDA 4HN4A 3NDOA 3O1NA 1RPXA 5AHLA 4GRSA 1TPFA 2H90A 3S8HA 1XL9A 4A2RA 1XUZA 3ANYA 4OT7A 5EA9A 3GNNA 1Z48A 2YR1A 2TPSA 4N9EA 4JNMA 3HQ1A 2CZDA 4X3ZA 4O1AA 2ISSA 5K9XA 1I2QA 3S1WA 5I3IA 4JYEA 1IF2A 3N34A 4UR8A 3RLUA 4FNUA 4KFNA 1R2TA 4S1FA 4CNNA 1QPRA 3LHTA 4LWWA 3TAOA 4JD4A 4M6QA 3W7KA 1YTEA 3HGJA 3CTLA 1OG0A 2YPIA 2A0NA 3N9RA 1EX5A 3L66A 3N73A 3Q58A 1K8YA 2Y63A 5CPNA 4ADTA 4AVFA 2QDGA 3ABQA 1Z44A 2DZWA 5I3FA 5G4EA 1KM6A 2P10A 5D2XA 4M6PA 1KM0A 3EEGA 4IMEA 4RZ5A 4MOZA 3E49A 4I7VA 3WJZA 3RU6A 2O7QA 3EX4A 1IIGA 1XBVA 4UFKA 1W5QA 3QEZA 4Q32A 5TIMA 1LLZA 3IV3A 3STEA 2ZTJA 1GVRA 3I7RA 4MYAA 1LBMA 2OT1A 1X1OA 3OG3A 4IMDA 4JTIA 2RHGA 1A5BA 3NGJA 4HT3A 1VYSX 2CLHA 3W1LA 1J2WA 1OFDA 3I65A 3IVUA 1XDMA 3W71A 4MPQA 1GVFA 2GQ9A 3ATZA 1KBIA 3BGGA 3L21A 3RMJA 3NPWA 2YZRA 3TIMA 2ZRUA 3RF9A 4EF9A 2IQTA 3ABSA 5I3GA 3TFCA 3E0IA 5CZSA 3HMJG 1YDOA 1X8FA 3P74A 1P1XA 3LHZA 1QCWA 2C13A 4PL2A 3P81A 1KM2A 4NZFA 1I2PA 4LVBA 4JEQA 1TRIA 1JJKA 2RFGA 3LCIA 1I2RA 1W3IA 1GEQA 1VHNA 1KFLA 1KFJA 4JTGA 3TQ0A 1FCBA 3W7OA 4O4WA 3IVTA 1PCKA 4OV9A 3O06A 4JX5A 4L4LA 3IGXA 4UTTC 1QPQA 2UV8G 3T4CA 2J6XA 4GUGA 5AC8A 3BW3A 5ABTA 3DFOA 3ABRA 1B4KA 3GX9A 5D05A 1K7XA 3CHVA 3UWUA 5MHBA 1NVMA 1O4UA 5I3JA 4PFMA 1TPEA 1YYAA 4IPJA 3WJWA 1QMLA 3BARA 1U5JA 5AFDA 4UTWC 4H6KA 1FCQA 1WXJA 3VE7A 5LNSA 1PS9A 3FKRA 3NPXA 4AB4A 5HR6A 3EWWA 5F1UA 3FEMA 1H51A 2ZZ6A 3ATYA 4NU7A 3HOJA 5E1QA 1K8ZA 2DJLA 2PURA 3NQMA 5KINA 4FX8A 4RX0A 2ZTKA 4RK8A 1JQVA 1ZCOA 1YTKA 5DBUA 3M9YA 4CQ9A 2YGYA 1KFEA 3EXTA 4MZYA 2VFDA 1XBYA 4TX9A 3QW3A 4N4QA 1YXDA 2ISWA 3TFXA 5KZEA 3WJSA 1KM5A 3LBMA 2BLEA 2Z0IA 5F4SA 5AHIA 5EL1A 4AF0A 3FFSA 1KFKA 2H8XA 1ZAJA 3SJ3A 3UWZA 1OYBA 5DY3A 2E1DA 3U2OA 2A6LA 5D2TA 5G2HA 1NFBA 2QCEA 4FNSA 4IOTA 3WFAA 2YFNA 3CU2A 1DOSA 3IEBA 1GG0A 3MW7A 1LBFA 1IXNA 3KOFA 5HJLA 2ZZ1A 4O1BA 1C8VA 3BG5A 3QSTA 4FNQA 4NJJA 1HL2A 3BLIA 3MBDA 4ZQOA 2B7QA 2B7PA 4MY8A 3STFA 1EWEA 4ZQNA 4ADUA 3HG4A 1WBJA 4WY0B 3TX9A 1GTHA 3GIYA 2CFFA 1OX4B 2DZXA 1LROA 2EF9A 4HHPA 3TMLA 4PL1A 5FF7A 1GWJA 4O50A 3SIZA 5CZ0A 3NEVA 3C2RA 3S1VA 1DQXA 1YDNA 2R91A 1KTCA 2P1FA 1S3HA 5AHMA 2QKFA 3W70A 1I8JA 1HG3A 1ICQA 2NXGA 2EAWA 5KITA 2ZRZA 4UMCA 3F1QA 5HINA 1R30A 4XBSA 3PULA 5AB3A 1VHCA 2HMCA 3EX6A 1AW1A 3UWQA 1UCWA 1OABA 2RDUA 3TE9A 4DQWA 1TO3A 3KVKA 1ICPA 2ZRVA 2YX0A 3GNDA 1GTEA 3LCHA 4JTJA 1QDSA 3TXVA 4LOCA 2BXVA 2WKJA 2JBMA 3MYOA 3DFPA 3S5NA 4N9DA 1TPUA 2CZ5A 1W8SA 3TKFA 3S6DA 5HQEA 5TBOA 1GQNA 2F7FA 3FS2A 1HUVA 5J5RA 4DELA 2AGKA 5D32A 1JCXA 3MP5A 1ZNNA 4YLWA 4WY0A 3TQVA 1KM1A 3EX3A 1M5WA 4FF7A 5EKYA 3W1PA 3O16A 3A22A 2WSRA 3PS7A 3LM7A 1YTDA 4NQ1A 1OYCA 5AHFA 2VFIA 4FIQA 1A53A 4DPQA 4UUIA 1UBSA 4IQLA 2FPTA 3FOKA 3R8RA 1OF8A 3PR2A 4FX6M 1IXPA 1W31A 1KLZA 4I7UA 4OV4A 3TK7A 4UC5A 4NZJA 5C54A 3Q94A 3U6WA 1ML1A 1RZMA 2F84A 3GB6A 1TTJA 2PC4A 5HULA 1EP2A 1GJPA 1YPFA 1A5AA 2NUYA 3L67A 4K8HA 1G67A 4GBUA 4IX2A 4M5PA 3G1AA 2WSYA 1YPIA 4O19A 3LCWA 4O53A 1NF7A 3G0XA 3MI2A 3G1HA 1TV8A 4XBKA 3UZJA 3L65A 1KLYA 3A9IA 2FJKA 2H3DA 2V81A 3TQKA 3OA3A 2CLEA 3T55A 3CIXA 1ZAHA 2YW3A 3YPIA 3QM3A 5CSSA 3SY5A 3KVMA 5EYWA 3VKJA 3LCLA 3W74A 3ABOA 1OX6A 1GVOA 4CLMA 5DELA 1SO4A 1VCFA 1PIIA 1C29A 3O8AA 1K8XA 3W3OA 4UTJA 2ATSA 4OWGA 2XN1A 3S1XA 3P8JA 4WY0F 7TIMA 2Y61A 3QF0A 3UD6A 4BI6A 2X30A 4ICNA 4WQ6A 4QSHA 4QAIA 2H8ZA 5TQLA 1I2OA 3G0UA 3G3DA 2WNZA 2X2GA 4LUJA 4XKYA 2V2DA 3W7LA 3W1UA 3IIZA 1SPQA 3LTPA 4NNCA 3ZR4A 1VPXA 1JVNA 2R94A 5L6UA 4FNPA 1W37A 3G22A 3C2FA 1SSGA 4FEZA 1XI3A 2W6RA 5G1YA 3TJLA 2VOMA 4CNPA 2FPVA 1FDJA 2Z1BA 3LXBA 3W7GA 5DCEA 2EPHA 3S42A 2DORA 3QC3A 3NYZA 1B3OA 3OBKA 5AOUA 2QCDA 2YFOA 1AL8A 1FWWA 3B8DA 4JS3A 2YSWA 2PRLA 1I45A 3FIGA 2PE4A 2E6YA 3PAJA 2NWSA 4U28A 5U7SA 5HWNA 3TU9A 2VEPA 1OK4A 1YDVA 1ICSA 3PG8A 1JUKA 5CSRA 2J9ZA 1ALDA 4LC6A 1Q6RA 4A3UA 4Q33A 1W5OA 2VKZG 1R47A 4RCXA 2DZUA 1J4EA 5FF2A 2VEKA 1OFRA 1FDZA 4IMFA 3JR2A 2Q3OA 4LUIA 4ZQCA 4MY9A 1YLVA 4PA8A 1XXXA 3W1XA 3LGEA 4Q4KA 1OYAA 5DXYA 1UUOA 3ZS4A 3B4UA 3BV4A 4UFHA 1W5NA 2E68A 4KKXA 5G1TA 2GVLA 3KRSA 3QMSA 2VXNA 5AHNA 1GT8A 1QPNA 3W2JA 3B06A 3EKLA 4CQAA 3BK0A 1F2JA 4RLIA 1AK5A 2JKPA 1N55A 1OJXA 3G1VA 1H7OA 3PC0A 4NXSA 3OEXA 4IXXA 2FQIA 4AWTA 2OZ0A 3I6RA 2WV8A 1JQXA 3P80A 2VC6A 4UXDA 3P67A 1H60A 3C56A 3OHIA 1Q3NA 1XUUA 2Q8LA 5BW6A 5HR7A 5IBXA 3NL5A 4ORMA 2B0MA 4FX7A 3UXDA 3EWZA 1H50A 3ZWSA 3PSVA 3CWOX 4UTKA 3PY2A 5FI8A 3LHVA 3TCEA 4R34A 2ZZ4A 3QJAA 2V5BA 3P61A 3LLDA 1U83A 3W23A 1SFJA 4MYXA 4BWLA 3NL2A 3P5ZA 3DFSA 5LGZA 4ZQMA 2DZPA 1SW7A 4HNNA 1TPC1 3HPZA 5AYYA 4DO4A 3PWAA 1V7YA 4LY8A 3W7QA 4MY1A 5FEXA 4AWUA 3LDVA 5KZDA 4BI5A 1QOQA 3M5XA 4A2SA 1O60A 3KX6A 3LHUA 4GE8A 4AEOA 3BG3A 2ABAA 1MEHA 4UIOA 3LRKA 4JN6A 1H62A 2Y7GA 4GUJA 2PRMA 3TC7A 2FPYA 3NQVA 3DBPA 3DXIA 2V2HA 2XN2A 1VC4A 4GJ1A 3R2GA 3L68A 4NJGA 4Z1BA 4JX6A 2GVGA 4WOZA 5DCBA 4NJHA 1A5SA 4OU1A 1WAUA 4FNRA 3NQDA 3NQCA 2PCQA 3GXTA 3A21A 4TMBA 5D38A 2ZCGA 5F2MA 4EIVA 3HF3A 2JKAA 2JKEA 1OFAA 5G5IA 4X9SA 4LS1A 2BX7A 2JK2A 5L9FA 2B7NA 1F7BA 5LHFA 3C2OA 2V82A 1QO2A 2TRSA 5CG7A 4ZL1A 1UASA 1BWLA 4MVAA 1GG1A 2QCCA 4JTUA 3L2IA 4K39A 2VENA 4OHQA 4NT0A 3NL3A 4CNOA 3E9AA 4FHAA 3P8IA 4JTLA 1O95A 3W1MA 2A6NA 1QPOA 5EPDA 1G6CA 1OX5A 3TNOA 3MBFA 3W2LA 4N6FA 1L6SA 1XBXA 3T7VA 5F2LA 3SR7A 1H7XA 2HSAA 2P0OA 3LTYA 3NQ8A 3BLFA 5AHEA 3AJXA 4TU1A 2CU0A 3UNDA 4NVTA 1DL3A 2ZZ5A 3MMTA 3P84A 4NNAA 2YYTA 4UNKA 1LRNA 1Z41A 3E12A 5CPOA 4AAJA 3KFTA 4HSNA 2E6AA 4AHOA 3SI9A 4JTHA 3TXZA 4UFJA 3CEPA 2ZA1A 1N8FA 3LX9A 4AF0B 4OGZA 3O07A 2R14A 5F1VA 2NX3A 3SFKA 4RV8A 2RDTA 2JGQA 1VR6A 2WO5A 5FF3A 1DJQA 1F73A 1L6WA 3PBWA 2QF7A 4J9JA 3DKLA 3S0CA 2CLIA 4FB7A 3TSDA 1MSSA 2C15A 1TTQA 4AH7A 5KZMA 1PE1A 2VFHA 1F76A 3BW2A 1W5PA 4QIUA 1UB3A 3GYEA 4UTIA 5F2GA 4O16A 5DY2A 2RH9A 5H2ZA 5D03A 5KMYA 1PV8A 4UTLA 3TW7A 4HIBA 3F4WA 2A5HA 3LTSA 4P61A 1GVSA 3GDRA 1UUMA 1XCFA 2ZZ3A 4YL2A 3W1RA 4WOQA 3HG3A 3MYPA 2DZTA 4S2CA 2CLMA 1JCLA 2BWGA 5F4WA 1LRTA 2RKXA 5HUPA 3M6YA 4XTIA 2NWRA 3UWYA 3NXFA 4ZVJA 3BGJA 3QPYA 1LTDA 6TIMA 2X16A 1FDYA 2WJZA 3GVGA 3IGSA 3UWWA 4UTUA 3NZ1A 4LS2A 4K8EA 5FESA 4K36A 5AYZA 3NL6A 4LS0A 5K4ZA 3U8GA 2C6QA 1MO0A 1F6PA 2G5WA 2A7NA 3W2MA 3RFAA 4Y6GA 1EEPA 3E02A 3O6DA 2DZSA 5BNKA 4O54A 3FA5A 4Z1AA 5D09A 2W79A 3OIXA 3DFQA 4KFPA 3G1XA 2E77A 3W7IA 3KXQA 1R2SA 3S1UA 2Q3RA 3HB9A 2A7PA 1T96A 1K3UA 2QUUA 3GLCA 2RDWA 2E5CA 1LYXA 1X7FA 3EX1A 3NQ7A 1SZEA 5EBUA 3UY8A 2WNQA 5D02A 1M6JA 1D9EA 4MJMA 1HTIA 4O14A 4LU0A 1HO4A 5T26A 4DF1A 4C1KA 2WQPA 3B03A 3O6CA 1D3GA 1F74A 3PSWA 1G4SA 3C3NA 1JCYA 2NUWA 1FXPA 3E96A 1ME7A 5BOOA 1KTBA 3NM3A 4TO8A 2H6RA 3DFTA 3W7RA 5CKSA 1KM4A 3BPWA 4IPIA 1VCGA 1H1ZA 4AWSA 1LP6A 4O10A 3QW4B 4LNYA 4R53A 4O57A 3RLVA 2CLOA 3R12A 1EB3A 1FX6A 1QNVA 3RK8A 4YCPA 2GPTA 3I68A 3R13A 1BTMA 4UFLA 2LLEA 1XKYA 5D04C 3PUDA 4OBTA 3WK1A 2I1OA 1GOXA 4QM1A 2Y7DA 2ZYFA 1SW0A 3G18A 2ZDRA 1TV5A 1Q6LA 4U4MA 3R89A 1R46A 3N14A 4M7SA 4B5NA 2TSYA 3BW4A 3PG9A 4LV4A 1FXQA 1GZGA 4G1KA 3TMQA 2A7RA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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