2YHWA

High-resolution crystal structures of n-acetylmannosamine kinase: insights about substrate specificity, activity and inhibitor modelling.
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSVAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 106
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhwA02
5BN8A 4BRNA 5BPNA 3LDNA 3O08A 5KQDA 5AQHA 4EIAA 4RCHA 4CBXA 3FZFA 3BF3A 3HSCA 2A41A 3F9MA 5EVZA 4JNEA 2WUSA 5F1XA 3VERA 3W0LA 4NB4A 1D4XA 1BOTO 5AQNA 3QFPA 3CI5A 2HF3A 3QFUA 5EOYA 1GLLO 3LM2A 3WXJA 4E1JA 1T6DA 1NBWA 2I7PA 4J8FA 3VEOA 3O80A 3ULEA 1NGAA 3KVGA 3MMVA 1K8KA 4O8KA 2IIRA 3SLCA 3MDQA 4H5RA 5ADXH 4JHDB 4NO7A 4I6MB 5E26A 1BA0A 5BRDA 2YCHA 3C0BA 4XH4A 3HM8A 5AQSA 2P9UB 3CJAA 5BRHA 5AQGA 2E2OA 4BREA 3FE1A 2YI1A 3L6QA 4BVPA 1S22A 3UKRA 2HF4A 3M6GA 1BUPA 3FLCO 3FZLA 3HBTA 5AQKA 1QQMA 4JN4A 1ZBSA 1HLUA 2E8AA 4RTFD 3LL3A 4FWRA 1X3MA 2CGJA 3AARA 4BG8A 3GDQA 3GOIA 4B1UB 4WQ5C 3WEEA 1QQOA 3QICA 3SJHA 2H3GX 2Q1NA 2D0PA 2P9SA 4FWOA 4CZMA 1H1VA 2Q0UA 5AQQA 3UB5A 2P9LB 3D2FB 2P9KA 4A2BA 3VEVA 4H0OA 1TYQB 1S3XA 4BGAA 2E88A 2I7NA 4DCHA 5KQ8A 3I8BA 4FOEA 4BQLA 3I33A 4FPBA 2P9IA 4B1XB 1SQKA 2CGKA 2DPNA 3JXUA 4IXCA 5AQPA 4CZFA 1NLVA 4BC4A 1JCGA 4Z94A 4MLEA 1T6CA 5AZIB 3BUZB 2Q36A 2CH6A 1GLAG 3QMLA 2E2QA 3MN6A 1QQNA 4FPAA 2NRHA 1JCFA 3CIPA 4H5TA 4ISGA 3A8YA 3ATUA 1Q18A 5AQRA 3UKUA 3D7EO 4CZEA 5ADXA 4WYBA 3D2EA 2QXLA 4CZLA 1NGFA 4BVOA 4JD2A 3FFKB 3DXKB 2BUPA 4A2AA 2VYPA 5AQTA 5AQJA 1OKJA 4CZKA 4CBWA 4CD1A 1QHAA 1U2VB 1T44A 1IJJA 4EAHD 2E2NA 4B1WB 3SMSA 4Y0WA 3H3NO 2W41A 3WQUA 4AM6A 3VF4A 4CZHA 1TUYA 4BR0A 2FSNA 3O1BA 3ZETB 4BRAA 4K25A 3CHWA 3WUHA 5FPNA 4BC2A 5I9EB 1NM1A 3IFRA 3EKSA 1LOTB 5LJWA 4BRMA 3LDOA 3O8MA 1MA9B 2FLOA 5BN9A 1NGBA 2V52B 1BDGA 3IDHA 3WT0A 2P9NB 1X3NA 2V7ZA 3L0QA 1C0GA 1RDWX 3EZWA 5AQVA 3BF1A 3M1FA 3A5NC 5EXWA 2J4RA 4BRIA 4YDUA 1BA1A 4BR4A 3IMXA 5BR9A 1NMDA 2HOEA 2YHXA 3AAQA 3DJCA 3UE5A 1KAYA 1DGKN 3VETA 3GG4A 2FF3B 4H5VA 4DQ8A 2A42A 2VWBA 1GLFO 1NGGA 3ATVA 1KAXA 2IVPA 2Q31A 1V4TA 2QM1A 3RSEA 4HWIA 3GBTA 4IJAA 1YXQA 1P8ZA 3CJ7A 5AQXA 5F2RA 2HMPA 2QW9A 2PAVA 3CETA 3EKUA 5ELZA 1Y64A 2IVNA 2OANA 3B8AX 4O5FA 1Z05A 4JHDA 4I6MA 2W40A 4CZGA 2YJFA 3H45C 1NGJA 2P9UA 4H03B 5AQLA 1NGEA 3ENHA 3VEXA 2V51B 5KPZA 5E84A 2AP1A 2FXUA 1QZ5A 3CJ1A 3ZX3A 4BRLA 4CZIA 4M63C 1KXPA 1GLDG 2A6AA 2GWJA 4B1YB 5KPRA 1QZ6A 4ISFA 5AZJA 3A5MC 5AQZA 3UKRB 3C7NA 3CJCA 4CBUA 3JS6A 4BC5A 2KHOA 3H1QA 3DXMB 4HTLA 4B9QA 3G25A 2P9LA 3D2FA 4L3QA 4BR5A 1XUPO 4MO5A 3S41A 3M3ZA 2ASMA 4DB3A 4XH1A 3VEZA 5AQYA 1HJOA 2IVOA 3WEEB 2ZWHA 3AY9A 2P9SB 2P9KB 4C23A 1GLCG 2F9WA 5JICA 4FWSA 5AZIA 5KPTA 2E1ZA 2D0OA 3CQYA 3VF2A 5AQUA 4BG9A 2Q97A 3ZEUB 4WQ5A 4BRHA 4K43A 4QS7A 2QWLA 5FPEA 1BWFO 4B1VA 4FSVA 5FPMA 3EL2A 3P4IA 4IWVA 2D4WA 4XEIA 3U8XA 3SK3A 5BRFA 1E4GT 1LCUA 3O5BA 4QS8A 4WQ4C 3WQTA 3EO3A 1ZXOA 3HTVA 4LC9B 3U4LA 1U2VA 4FWLA 5JLHA 2FSKA 3CJBA 1GLJO 2CGLA 3D2EB 4H0VB 3LM9A 3VOVA 3A5OC 3MCPA 4JD2B 4JAXA 4PL7A 4CI6A 2CH5A 1DKGD 3ZETA 4BR2A 3VGKA 4PKIA 5AFUH 1CZAN 3QBWA 2V7YA 1V4SA 4BRGA 4EHTA 1HKBA 2FSJA 5AR0A 1SZ2A 4A61A 4BC3A 3VEYA 5BREA 2QWPA 1MWMA 4YDUC 3VEWA 2QWNA 2FF6A 4CZJA 3ZX2A 1G99A 3A5LC 4MO4A 2P9PB 4FWPA 1JCEA 2UYTA 1C0FA 4BRKA 2ZGZA 1HKCA 4BQZA 3O4WA 2P9NA 3FR0A 2GEMA 4BRFA 1BG3A 3H3OB 5JMVA 2QWRA 4F9OA 3GE1A 5BPLA 1NWKA 2PBDA 4B1ZA 5LY3A 5AQWA 4FL9A 3LDQA 3WXKA 3KHYA 1E4FT 4AM7A 4H5WA 2YHWA 3MN5A 3MK6A 2A3ZA 1NGIA 3BEXA 3R9PA 5B8HA 3ENOA 1U6ZA 1WUAA 3HI0A 4EHUA 1HX1A 1MWKA 1NGHA 1Z6RA 1BO5O 4FWNA 1ATRA 3ZX0A 3H6EA 4BRPA 1R59O 4ISEA 4FOIA 1ZC6A 5TKYA 3TU5A 3ULEB 2ZGYA 4FO0A 5AFUA 5F0XA 2GELA 3RSEB 5LJVA 2BTFA 1K8KB 2E20A 3FZHA 4BGBA 3AAPA 4BR7A 3GL1A 3MN9A 5EY4A 3BP8A 1IG8A 4M7XA 5AQMA 4K42A 3DWLA 5AQFA 1ESVA 4CJ7A 3DAWA 3W3DA 4KBOA 1YUWA 5JLFA 5CE3A 1MDUB 4QS9A 3VF6A 2E2PA 4FWKA 1ATSA 4K41A 5AQOA 1TUUA 4GY2B 4FWMA 3ID8A 3IUCA 3DXMA 3VGMA 2A5XA 1HKGA 1TYQA 1DEJA 3CQXA 1X9JA 4H0XB 3SMPA 1ATNA 2Q2RA 4IO8A 2F9TA 1RFQA 5AZJB 3R8EA 4IZ9A 3C7NB 3KZBA 3FGUA 2ITMA 3L4IA 1EQYA 1BU6O 2E1YA 2QWMA 2ASOA 1KAZA 4A62A 3R6MA 1NGDA 3A0IX 2ZF5O 1XQSC 4BRCA 1GLEG 4PKGA 3FZMA 2Q0RA 3ZEUA 4M7YA 5BPMA 2P9IB 4DHYA 4FWQA 3LDLA 3DXKA 4IJNA 2NLXA 5EX5A 1HUXA 2YHYA 3J8AA 4H5NA 1HPMA 1YVNA 4RWTA 2D1KA 4GNIA 4XH5A 3UKUB 3CJ9A 1WOQA 4CD3A 3H1VX 1NGCA 3VPZA 3QBXA 2NZTA 3QB0A 3WXLA 3VGLA 3LDPA 4BR9A 3FZKA 1J6ZA 3OHRA 5FPDA 4EFHA 1GLBG 3O6WA 3CERA 3H46O 3WXIA 2YJEA 4BROA 2QWQA 3EN9A 3VESA 2QWOA 3TPQA 2P9PA 2EWSA 1XC3A 4H0PA 4PKHA 1SAZA 1YAGA 4WQ4A 2A40A 3HZ6A 2GWKA 2ASPA 4H0YB 3U9DA 2GTDA 3MN7A 4BRQA 3QDKA 1RGIA 3VENA 4H0TB 2AA4A 3O1WA 4BRDA 2VCPA 2GUPA 4PL8A 5AQIA 3U9ZA 4MLHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZT3A 3T3FA 4CF0A 2DFFA 3BZCA 3HOSA 4NCBA 4BDYA 4CW7B 4CJTA 4JNEA 2WUSA 3VQEA 5F1XA 4FJGA 1NKEA 3MWPA 3O3HA 4GMJB 4ID1A 1Q9XA 3R3LA 3IAYA 3D45A 1Q82O 1TK8A 1VSEA 3TI0A 1NBWA 2I7PA 4J8FA 1LWCA 3O80A 3LPTA 3KVGA 3MMVA 3SV3A 1HNIA 3KLFA 1LV5A 1VQKN 1YTUA 5ADXH 1BA0A 3PSIA 5BRDA 2YCHA 3DLBA 3KK3A 4B3OA 3HM8A 5AQSA 3TAPA 1HQUA 2E2OA 2YI1A 2QA4N 3M6GA 4RW8A 4UY8O 1VRUA 4ILHA 2RE2A 4JN4A 1HLUA 1EO1A 1UA0A 2CGJA 2FBTA 4CHPA 3GDQA 1L3SA 3WNEA 1NK8A 3OYCA 2W42A 4KB0A 3SJHA 4LFBK 3HP9A 3T1YK 4FWOA 1W9HA 3CC2N 2FC0A 2R7YA 2BE2A 4CHYA 2HHHK 5CYMA 4BQLA 3I33A 2P9IA 3LP1A 4DV1K 3AO2A 5AQPA 4DFKA 1NLVA 5I3UA 4Z94A 1GOBA 2Q36A 2F4VK 1GLAG 2E2QA 4CFBA 1TL3A 2YKMA 2NRHA 4ISGA 1JLGA 4ELUA 3A8YA 3ATUA 4KHYA 1Q18A 3UKUA 3D2EA 3TR8A 4AHTA 2HNZA 3TANA 5AQTA 4CZKA 2P51A 4CD1A 4EAHD 4AHSA 3T1AA 2RKIA 3SUQA 3IS9A 3SMSA 4ELTA 1XNQK 3H3NO 2W41A 3E66A 4AM6A 3VF4A 4B3TK 2EX3A 3O1BA 1VQ8N 1JJ2M 4JS5A 1RDAA 2BANA 1NM1A 3CMAN 1NKBA 3SCXA 4F8RA 1WBDA 1ITGA 3THWB 1UOCA 3CFOA 5BN9A 2YHAA 3IDHA 1NJWA 2YX6A 3DLGA 3LWMA 3EZWA 3LALA 4BRIA 2XHBA 2O8EB 3ZLJA 3ZSZA 1O1WA 2I5JA 3HSTB 3LPUA 4LH4A 3UE5A 2OTLN 1DLOA 4CHZA 2OZSA 5KTQA 3OBWA 4DFPA 3QEXA 4PA1A 4CJLA 5LMUK 1SV5A 3ALYA 1BIZA 4F3OA 3RSEA 3BGRA 4YNQA 1IKVA 5HRNA 5F2RA 5T7BA 2PAVA 2OPSA 1VSDA 2UU9K 2OANA 3NF8A 4Y1CA 4JHDA 4I6MA 2KFZA 4M45A 2VGNA 4DV5K 5HBMA 4DS5A 3OYEA 3A2FA 1X1PA 3ENHA 5FLXO 3PX6A 5DK5A 4RW6A 5E84A 2GBZA 1RILA 1S1VA 4LF4K 5J2QA 3OYNA 4I2PA 2HHXA 1GLDG 2D5RA 4DMNA 1QZ6A 4AQYK 2XY8A 5AZJA 3CCQN 4O0IA 4BDZA 1KFSA 1Z25A 1RBUA 3UKRB 1TGOA 4BC5A 2KHOA 4HTLA 4B9QA 2IDOA 3G25A 4DFMA 2KZMA 2P9LA 4Z4FA 1XUPO 5HRRA 2QI2A 3M3ZA 3WNHA 4CFAA 4DB3A 3TAGA 4XH1A 4B8CA 1NOYA 3AA5X 3WEEB 1XHZA 3MWTA 3V81A 4FZXC 3AY9A 1NK4A 4DV4K 2ATQA 4FW2A 3OYJA 1U45A 2P9KB 5CR4A 2RF2A 5LL6Z 1GLCG 4FWSA 1NNEA 4B9VA 3VF2A 2Q97A 3B6PA 4YOXA 4BRHA 4K43A 4IO9L 1KC8O 3RRGA 1SL1A 5C42A 5FPMA 3P4IA 1QVFM 4Z4CA 4ZHRA 4DSKA 3T1HK 1E4GT 2F7TA 4WQ4C 4AHVA 3WQTA 3MECA 3HTVA 4FVMA 4CFCA 2FSKA 1GLJO 4X66K 4Z4IA 3VOVA 3A5OC 3DMJA 4JD2B 2RPIA 3ZETA 3CPEA 2HBKA 1V4SA 4NXMK 2FSJA 1K73O 4HTUA 4ID5A 4A61A 1MWMA 2NRZA 1BI4B 3VTIA 1S9GA 3ZX2A 4MO4A 3B6OA 3KLGA 1K8AO 4FWPA 3SAHA 4BRKA 2ZGZA 4IG3A 4F2SA 3G0ZA 1HKCA 1ZBIA 2Z1HA 3H3OB 4CJWA 2QWRA 4F9OA 5IWAK 2O8FB 1NWKA 5M1PA 4YOYA 1OVQA 3LDQA 3QERA 3ZYYX 3N4QA 3V1OA 1HNZK 3AVKA 4H5WA 4CGDA 3MK6A 5E41A 3TTFA 3VQDA 1NGIA 3BEXA 3R9PA 4OPKA 4EHUA 1Z6RA 1TKXA 3KJVA 5GIPA 4FWNA 1ATRA 5HL7L 1VK0A 1XI1A 4V19S 3K9KA 1IO2A 4BRPA 4K8ZA 3TU5A 3VQPA 3K5LA 5SWMA 5AFUA 5F0XA 2GELA 3AO1A 5LJVA 4I9LA 1HYVA 2BTFA 2E20A 3C95A 4XIUA 2ITGA 4M7XA 3AGKA 4K42A 5AQMA 2ZJRL 5AQFA 2B5JA 1ESVA 3G10A 4KI6A 1CXQA 4IDKA 2ZJQL 5JLFA 2QTDA 2PZSA 3V1RA 2P5OA 4FWKA 3SJJA 4KRFA 4PUOA 2JWLA 3S9HA 4GY2B 2NNWA 2KQ2A 3VQ7A 2A5XA 1DTTA 2YNGA 4F3TA 4AHRA 4N56A 5JS2A 3SZ2A 1ATNA 3VQ6A 2Q2RA 3R8EA 1RFQA 3Q7BA 3AVAA 4ILGB 4W5QA 4IZ9A 1VQ9N 2UXCK 1NOZA 3C7NB 2ITMA 4DF8A 4PWDA 3CCJN 1J54A 1M1KO 1BU6O 4M3ZA 3J80O 3L3UA 4A62A 2HBLA 3QNOA 1YT3A 1ZBUA 2OZMA 3A0IX 3EE8A 4IEIA 3CG7A 3RR7A 3FZMA 3RWUA 1Q7YO 4M7YA 5BPMA 3OW2M 2P9IB 1Z26A 1FKPA 4DHYA 2UUBK 3ZT0A 1FW6A 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3RMCA 3RMAA 3NGIA 1T6CA 4CJ4A 3QMLA 3MN6A 3SPZA 3L4QA 1S1XA 1XHXA 4JKAA 3CCMN 3U6FA 3CIPA 1RTDA 5AQRA 4CZEA 3D7EO 5ADXA 4CZLA 2QXLA 4JD2A 3FFKB 1BIUA 4E7HA 2BUPA 4A2AA 4FK0A 4FJKA 2FBVA 4GW6A 1J5EK 1Q86O 3P38A 3P1GA 3NBPA 4DF4A 4Y0WA 4WF9L 3T19A 4YORA 1BI4A 4CZHA 1RBVA 1TUYA 2DFEA 4JKGA 1T8EA 4CEDA 3ZETB 4BRAA 3QIOA 3CHWA 4OO1J 4BC2A 5FPNA 5I9EB 4C8NA 4YFUA 4BRMA 4CVNE 2O8FA 4B3SK 3RMBA 4JKDA 1MA9B 1W0HA 3QETA 4KHUA 1RDBA 4KH4A 2X78A 4WCEL 1C0GA 5MLCQ 3M1FA 5DM6L 1U49A 3PO4A 4BR4A 3LAMA 3TABA 2YHXA 4DR3K 4JI2K 3JYTA 4DQ8A 1GLFO 4AH9A 1QQCA 4FM1A 4CK1A 1Q9YA 1IBMK 1WSFA 3K5NA 3DLLL 1BHLA 1V4TA 2QM1A 1S1WA 3QINA 1HYSA 4IJAA 1YXQA 2F96A 1P8ZA 3CJ7A 4LH5A 2HMPA 2QW9A 3CETA 4FYDA 1Y64A 2IVNA 4JI3K 4O4GA 3S3MA 1HR0K 1BCOA 4CZGA 3CFRA 1NGJA 4H03B 2YNFA 2QXFA 4NLCA 1XWLA 4JKHA 5KPZA 3I8DA 4CJPA 3G71N 3NGZA 3CJ1A 1M90O 1RT4A 4CZIA 3OA9A 4KHQA 2GWJA 4IFEA 3A5MC 4JI4K 3BZKA 3C7NA 3CJCA 4CBUA 4CFDA 3H1QA 3PLAA 3MXMA 1TAUA 4CGIA 2HHWA 2X6NA 4CHNA 4M3XA 1KVCA 3V9ZA 2UUAK 3DLHA 4CEEA 4WFAL 3TARA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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