2YHYA

Structure of n-acetylmannosamine kinase in complex with n- acetylmannosamine and adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
313
structure length
308
Chain Sequence
GTLSALAVDLGGTNLRVAIVSMKGEIVKKYTQFNPKTYEERINLILQMCVEAAAEAVKLNCRILGVGISTGGRVNPREGIVLHSTKLIQEWNSVDLRTPLSDTLHLPVWVDNDGNCAALAERKFGQGKGLENFVTLITGTGIGGGIIHQHELIHGSSFCAAELGHLVVSLDGPDCSCGSHGCIEAYASGMALQREAKKLHDEDLLLVEGMSAVGALHLIQAAKLGNAKAQSILRTAGTALGLGVVNILHTMNPSLVILSGVLASHYIHIVKDVIRQQALSSVQDVDVVVSDLVDPALLGAASMVLDYT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords BIFUNCTIONAL UDP-N-ACETYLGLUCOSAMINE 2-EPIMERASE/N-ACETYLMAN
publication title Crystal Structures of N-Acetylmannosamine Kinase Provide Insights Into Enzyme Specificity and Inhibition
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 308
sequence length 313
ec nomenclature ec 2.7.1.60: N-acylmannosamine kinase.
pdb deposition date 2011-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2yhyA02
4H03B 3MCPA 2VYPA 5BN8A 5AZJA 1YAGA 2YJFA 4WQ4A 4BRGA 3QBXA 3DXKB 1GLDG 1HUXA 3C0BA 4A2BA 5KQDA 2YCHA 1U2VA 3U9DA 3ZETA 3H6EA 1NGIA 3VESA 1HJOA 2A5XA 3J8AA 1YUWA 3QDKA 4FWSA 2A40A 1QQOA 1XQSC 4CZGA 3KHYA 3BP8A 4BRCA 3QB0A 3B8AX 2YHYA 1MDUB 5AQHA 4B1ZA 2NRHA 4M7YA 4B1XB 3RSEA 1NGEA 1GLBG 4DQ8A 3O6WA 5AQJA 1GLJO 2A42A 2V7ZA 2FF3B 3HI0A 5EX5A 2AP1A 4EIAA 1BU6O 1RGIA 1C0FA 3DAWA 5I9EB 3A5LC 3EKUA 2YI1A 2ASMA 5KPZA 3HM8A 1ATNA 3O08A 2QW9A 5JLFA 3M3ZA 4BVOA 3CJ7A 2P9LB 4A61A 2P9PB 1ZXOA 5BN9A 1V4SA 5ELZA 4IZ9A 3EN9A 4IJNA 2QWQA 4FL9A 2P9KA 4FWOA 4ISFA 2BTFA 1Q18A 3MK6A 1X3NA 2F9TA 4CBUA 2ZGZA 5KQ8A 1KAZA 1MWMA 1GLAG 2CGJA 3R6MA 5BREA 4BC4A 4FSVA 4XEIA 2E1ZA 2HF3A 2P9LA 2P9PA 5AQXA 2CH5A 1T6CA 1NM1A 1K8KB 3CJAA 2I7PA 2WUSA 3UE5A 4FOIA 1S22A 2QWNA 4FWNA 5AQZA 1CZAN 5F0XA 4NO7A 2A41A 5AQMA 4B9QA 2DPNA 2IVPA 1RDWX 4O8KA 4CD3A 5AQGA 3CJ9A 1HKCA 2E8AA 3CJBA 3SMSA 3BUZB 2PAVA 3I33A 3AAPA 5BRFA 3TPQA 3O1WA 4BRAA 1S3XA 3O4WA 5ADXA 2IIRA 5JLHA 1JCFA 1X3MA 2VCPA 2V7YA 4JD2B 5CE3A 4PKHA 2E2PA 2GUPA 4AM6A 3H45C 3VEXA 2J4RA 5FPMA 3LDPA 3CQXA 1P8ZA 3ATVA 2HF4A 4PL8A 3A8YA 5KPRA 3FFKB 1OKJA 1ZC6A 2E2QA 4FO0A 4KBOA 3W3DA 4K42A 1BO5O 3LDNA 1KXPA 3O1BA 4B1YB 3KZBA 2E88A 4QS8A 4JD2A 3WXIA 3QFPA 1TYQB 3A5OC 1GLCG 5AQOA 4BRDA 4Y0WA 1QHAA 3QFUA 4NB4A 5AQKA 2QXLA 4RCHA 2OANA 4BRHA 5BRHA 3U9ZA 3FE1A 3I8BA 1XC3A 2GELA 4XH5A 1YVNA 4J8FA 3EZWA 3VF2A 1YXQA 4B1UB 5BPLA 1BDGA 2D0OA 4I6MB 4JAXA 5AZIA 5ADXH 1TYQA 4B1WB 2CH6A 3F9MA 1BA1A 4MLHA 4FWMA 3U4LA 1EQYA 3VF6A 3WXKA 1E4FT 4YDUA 4L3QA 3H3NO 4M63C 3DXMB 5BR9A 4BC3A 2IVNA 4QS7A 3JXUA 1R59O 2P9KB 3VOVA 4EHUA 4M7XA 3MN6A 3C7NB 2QM1A 3LM9A 4FWQA 4WYBA 5AQSA 1NWKA 3SK3A 4I6MA 3VEOA 2D4WA 2HMPA 1G99A 2Q1NA 2Q0UA 1XUPO 4BRLA 3U8XA 4WQ4C 4A2AA 5BRDA 3AAQA 4Z94A 4DB3A 3FZKA 3UKUB 5AFUA 3DXMA 3D2EA 1IG8A 1BWFO 3VGKA 4QS9A 1X9JA 4BC5A 1ATRA 4GY2B 3CJCA 3C7NA 4RTFD 4A62A 2FLOA 2ZF5O 4BR9A 4BREA 2IVOA 4IJAA 2V51B 2ZGYA 1QZ6A 4H5VA 5KPTA 5JMVA 3W0LA 3S41A 4H5NA 4FPAA 3LDQA 3UKUA 4B1VA 4WQ5A 4BRKA 3ZX0A 1Z05A 2YJEA 1BA0A 3GDQA 5AQWA 3VEWA 3D2FB 1T44A 3EKSA 3L4IA 3QMLA 3CERA 4H0YB 3M1FA 4GNIA 1SZ2A 4CZIA 5FPDA 5E84A 3TU5A 2Q31A 1HKBA 2EWSA 4DHYA 3BF1A 2FSNA 5BPMA 2F9WA 3H1QA 1NLVA 4JHDA 5F2RA 4ISGA 5EY4A 1TUYA 3HBTA 1NGAA 3VETA 4CD1A 1RFQA 5EXWA 3G25A 4IWVA 2QWLA 4H0XB 3O80A 5AFUH 3CI5A 3D2FA 3GE1A 1GLEG 2E2OA 3KVGA 4ISEA 1HKGA 1NGFA 1BUPA 3WXLA 2QWRA 4JN4A 1V4TA 4CJ7A 3CHWA 5AQNA 3R9PA 3H1VX 4K43A 4H0TB 3MN7A 2W40A 3FZLA 4PKGA 5AQIA 5AQFA 4RWTA 3SMPA 2QWMA 4BRMA 2A3ZA 5AQLA 5AZIB 3A5NC 4CBXA 2ASPA 3ZX3A 4DCHA 2Q97A 1GLLO 4FWKA 1Z6RA 3L0QA 3A5MC 1J6ZA 4FOEA 2ZWHA 3O8MA 5F1XA 1SAZA 3IMXA 3UB5A 3ZEUB 1JCGA 1NGHA 3HZ6A 3LDOA 3WQUA 3ZX2A 2W41A 4BC2A 3GL1A 1BOTO 1HLUA 2E2NA 4CBWA 4LC9B 3CIPA 2YHXA 3VGLA 4H5TA 5FPNA 3ATUA 3DWLA 2CGLA 3JS6A 4HTLA 3VERA 2P9NB 2D0PA 3BF3A 3O5BA 2PBDA 5LJVA 3MMVA 4BRQA 2CGKA 4CI6A 3FZMA 4XH4A 4H5RA 3QICA 3ZEUA 4H0OA 1H1VA 1HX1A 4H5WA 3EL2A 2P9SB 3D2EB 3LL3A 3GG4A 2E20A 4BR7A 2FSJA 3SLCA 2NLXA 1ESVA 4CZMA 3BEXA 3FZHA 3IDHA 2QWPA 4FWPA 3R8EA 1TUUA 2AA4A 2P9IB 3H3OB 2P9NA 3UKRB 1DKGD 2A6AA 3VEZA 5FPEA 2UYTA 1MWKA 1NMDA 3SJHA 4BGAA 1NGJA 1HPMA 1QQMA 2GWKA 4MLEA 2Q2RA 1SQKA 3DXKA 5E26A 2P9SA 4C23A 1ATSA 1KAYA 4HWIA 4FPBA 3VF4A 4FWLA 1ZBSA 5AQUA 1KAXA 3VPZA 4FWRA 2FXUA 1D4XA 3FLCO 2HOEA 2P9IA 3D7EO 1WUAA 4YDUC 4BVPA 1NBWA 3UKRA 1IJJA 4CZFA 3L6QA 1DEJA 5AQPA 4CZJA 4JHDB 4K41A 3LM2A 1NGBA 2KHOA 5LJWA 2BUPA 4CZKA 1Y64A 3ID8A 1C0GA 3P4IA 4CZLA 3IUCA 4BGBA 3CQYA 1QZ5A 2QWOA 5AQQA 4BG8A 2ASOA 2FSKA 3ULEB 3OHRA 4PL7A 3FZFA 4CZHA 3ENHA 1WOQA 3MN9A 3WEEB 1MA9B 4BRIA 3AARA 3WUHA 2V52B 3ENOA 3CETA 4E1JA 4BRPA 5JICA 2VWBA 3QBWA 5BPNA 4BQZA 4CZEA 1QQNA 1LCUA 2P9UB 5EVZA 5EOYA 4BR4A 3WXJA 4BR2A 5AQTA 3ULEA 1NGCA 3CJ1A 4H0VB 4WQ5C 2GEMA 3GOIA 3MDQA 5AQYA 3WEEA 1U6ZA 4BG9A 3VGMA 1NGDA 4AM7A 1K8KA 3GBTA 2D1KA 3EO3A 3A0IX 4K25A 3VEYA 3WQTA 3M6GA 3FGUA 1E4GT 3AY9A 4IXCA 2NZTA 4XH1A 4MO4A 4BR0A 3DJCA 4JNEA 4O5FA 4BRFA 3VENA 4IO8A 4H0PA 2ITMA 3FR0A 2P9UA 3IFRA 2GTDA 3H46O 5AZJB 1GLFO 3MN5A 4BRNA 4EAHD 1NGGA 2GWJA 4BQLA 5AQRA 5TKYA 5B8HA 1BG3A 2Q0RA 1DGKN 4EFHA 1U2VB 4F9OA 5LY3A 4BROA 3ZETB 4MO5A 2Q36A 1T6DA 1LOTB 3HSCA 5AR0A 3LDLA 4EHTA 3HTVA 4BR5A 2E1YA 3WT0A 4PKIA 5AQVA 2YHWA 2FF6A 2I7NA 1JCEA 3RSEB 2H3GX 3VEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H03B 2VQEK 2FBYA 4KB0A 5AZJA 4CEQA 4WQ4A 2ZM6K 3DXKB 2HNYA 2PZSA 2YCHA 1U2VA 1ASVA 3PX0A 3ZETA 4A59A 4TSXA 1YUWA 4FXDA 1QQOA 1S1UA 1VSFA 3V1RA 2VQFK 3L3VA 3HPGA 5AQJA 3IAYA 1JXEA 2A42A 2V7ZA 4PWDA 4QCLA 2O4GA 2AP1A 4AHRA 4EIAA 3LWLA 3THYA 1RGIA 1C0FA 3DLGA 3A5LC 5KPZA 2O8CB 4JKBA 4J2AA 5JLFA 2D0CA 2P9PB 5BN9A 2BE2A 5ELZA 4KV8A 4J2EA 3NF8A 3S3NA 1WSFA 3F2KA 2QKKA 4IJNA 4KAZA 4LD0A 4ISFA 2O4IA 4N5SA 3V81A 4B9LA 1XWLA 2ZGZA 1HMVA 5HROA 1KAZA 2CGJA 3R6MA 4E19A 3KLIA 4R79A 4BC4A 3J81O 4ZTJA 2WTUA 4OPHA 3M8RA 2I7PA 2WUSA 4NXNK 1S22A 2QWNA 2WFBA 3AGKA 2LSNA 1CZAN 3MWPA 3L4QA 2DPNA 2IVPA 4CHPA 3OYHA 1NJXA 2OPQA 4BWMA 1YF5L 4BY9C 1BI4A 3SMSA 4CF9A 5E41A 3G71N 3CQ8A 5JLHA 1X3MA 1VAZA 5CE3A 2O8EB 4O5BA 2OZMA 3VEXA 3OYAA 4JI1K 1T3VA 4CFBA 1P8ZA 3ATVA 4RW6A 1U47A 4FLYA 1T7PA 1OKJA 4CGFA 2E2QA 4KBOA 1VQON 4GVMA 4FM2A 1KXPA 4B1YB 3KZBA 3AGRA 2E88A 4KHWA 5AQOA 4GKJK 1TK8A 5AQKA 5CR4A 2OANA 4BRHA 2PYLA 5LMNK 3IKMA 4KO0A 2W6KA 3I0SA 2GELA 4IOXA 3ZT1A 1IBKK 3SNNA 3OYGA 3UIQA 5M1PA 2NRWA 4F8RA 1NK8A 3G10A 4I6MB 1TYQA 4DV1K 1BISA 4LFCK 3ZSZA 1U4BA 2CH6A 3K59A 4X64K 4FWMA 3O9QA 4L3QA 1WAJA 4M63C 3R3LA 3M8PA 3DXMB 4QS7A 3JXUA 3VOVA 1RTJA 3H08A 3CCMN 2DTUA 5KI6A 1G99A 3AVGA 2Q0UA 3N4PA 3OTOK 3TAEA 3SAHA 5KRTA 1EX4A 3VQ7A 3CM6A 3O9UA 4CGIA 3HK2A 3VQQA 4DB3A 4LF4K 4LY7A 2E5LK 3UKUB 4JEPA 3ZSWA 3LP3A 3D2EA 1IG8A 5FRNA 4PUOA 4FLUA 1VSHA 1X9JA 4KTQA 1KC8O 3NF9A 3CJCA 2HB5A 4RTFD 4OKEA 3O4NA 1OH7A 4BREA 3T1AA 1TKZA 3THVA 5M1OA 3CPWM 4B3SK 3L2QA 4AH9A 2WBNA 2IS3A 2VWJA 3AA3A 4Z4HA 4CEAA 4MFBA 4H5NA 4FPAA 1QQCA 3AA2A 3LDQA 4Y1DA 4BRKA 3ZX0A 3P38A 1Z05A 1BA0A 2FC0A 2ZD1A 4M3YA 1HYZA 2XY7A 1VHXA 3CC7N 3EKSA 1JLFA 3KLFA 3T3FA 1WAFA 5CYMA 3AVAA 5K14A 4B9TA 3CERA 3M1FA 4CZIA 1SZ2A 2RKIA 4GV9A 3TU5A 2Q31A 1HKBA 5GAGP 3BF1A 3CD6N 2KW4A 2PYJA 2VGMA 1EP4A 2FSNA 5BPMA 1NLVA 5FROA 4CF0A 5EY4A 4ILJA 2E4LA 1BQNA 2UXCK 3VETA 4CD1A 1RFQA 1VSEA 3E01A 1WSEA 4H0XB 3O9TA 2Z1JA 3D2FA 4DTOA 3RMAA 1JLCA 5GIOA 3LZIA 2Z1HA 2YNHA 3KVGA 1EETA 3C6UA 1BCOA 3WXLA 2W42A 1DT9A 4CJ7A 2Z1IA 2YNGA 4XIUA 4M3ZA 4K43A 4H0TB 3MN7A 4FW1A 3SQ1A 4PKGA 1RT7A 5AQFA 4RWTA 2KZZA 1CXUA 3L3UA 4DCHA 3F5TA 1C6VA 3L0QA 3A5MC 1J6ZA 2XO7A 4PQUA 2KTQA 2ZWHA 3O8MA 5F1XA 1SAZA 2YHBA 3IMXA 1VQ7N 4CJRA 3ZEUB 3LDOA 3WQUA 4QAGA 2HVHA 4FCYA 2W41A 1LWEA 1RBSA 2E2NA 4CBWA 3VGLA 5J2NA 3DOKA 5FPNA 3ATUA 1J9AA 3AA4A 3MCAB 4FK0A 1TK5A 1M90O 2PBDA 4JKAA 4BRQA 2CGKA 3EZ5A 4FJJA 4H5RA 1Q9XA 4H0OA 1HQEA 3D2EB 3LL3A 5H1SQ 3OVNA 2ITGA 4C8OA 3FZHA 1KLNA 4RG8A 2QWPA 1W9HA 4FWPA 3R8EA 5HRPA 1YHQN 3DLBA 2AA4A 2P9IB 3H3OB 3J7YP 4RW4A 3QINA 2P9NA 3SBGA 2A6AA 3VEZA 2NRZA 1NMDA 1FW6A 4N47A 1NGJA 4CESA 1QQMA 5C12A 3QEPA 1NK7A 4B3OA 1IKXA 1KAYA 4HWIA 4FPBA 4H4MA 3ENBA 3QIOA 5CYQA 4OKJA 5GIPA 4KFBA 4DQPA 4PY5A 3FLCO 3NH0A 2HOEA 4JS4A 4BE0A 4ELVA 2XHBA 1W7AA 1WUAA 4YDUC 4BVPA 1IJJA 2KQ2A 4CZJA 3OYIA 2IC3A 3D45A 3J80O 3HO1A 1KVBA 4HUGA 4FJ7A 3E9OA 4OO1J 2HNZA 1C0GA 4CZLA 3RTVA 4LF9K 1QZ5A 3SUQA 1BGXT 4KI6A 3QEIA 3G6EN 2FSKA 3PX4A 4CVNE 3WEEB 4A5AA 1MA9B 1TKDA 4DR7K 1DTTA 1CXQA 2UUCK 3CETA 4ZHRA 4BRPA 3QNNA 1Z25A 4M3UA 1RBTA 3PSIA 4U7BA 3TABA 1YJNN 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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