The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
78
|
structure length |
78
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Chain Sequence |
GSSGSSGRRAKALLDFERHDDDELGFRKNDIITIISQKDEHCWVGELNGLRGWFPAKFVEVLDERSKEYSIASGPSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
|
| molecule keywords |
RUN and TBC1 domain containing 3
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| publication title |
Solution structure of the SH3 domain of mouse RUN and TBC1 domain containing 3
rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
8
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| structure length |
78
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| sequence length |
78
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-06 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RQW A; 2LQN A; 2YT6 A; 4HVW A; 2JW4 A; 1AWW A; 2IIM A; 1ZUK A; 2KT1 A; 2JM8 A; 2O9V A; 4JJB A; 3UA7 A; 2F2X A; 2JM9 A; 2CUB A; 2VVK A; 2VWF A; 2KBT A; 2DIL A; 2K9G A; 4F14 A; 1G2B A; 1E7O A; 4CC2 A; 2DBK A; 2DJQ A; 2O88 A; 1I1J A; 1AD5 A; 1BK2 A; 3I35 A; 1UDL A; 5IXF A; 1GBQ A; 3RBB B; 1JXM A; 1RI9 A; 2AK5 A; 1E6G A; 2FPF A; 1HD3 A; 1UJ0 A; 2BZX A; 1YWO A; 2ED1 A; 2V1Q A; 2BZY A; 4J9B A; 3M0R A; 3PE0 A; 1WFW A; 1H8K A; 1WYX A; 4CC7 A; 3REA B; 3SEM A; 1NLO C; 1QKX A; 3U23 A; 5I22 A; 2AZV A; 1V1C A; 2RQV A; 3ZL7 C; 1K0S A; 4EIK A; 1MUZ A; 2EKH A; 5GJV B; 3NPF A; 2JS2 A; 4LN2 A; 2DRM A; 1WLP B; 1SHG A; 2RF0 A; 3UA6 A; 1WXU A; 2D1X A; 2DL5 A; 1M3A A; 4JJC A; 4OMO A; 2ABL A; 1BU1 A; 1KIK A; 1M30 A; 2KEA A; 1B3Q A; 1VYV A; 1T0J A; 1UHC A; 3EHQ A; 1TUD A; 2KE9 A; 1NYF A; 4DEX A; 3LH5 A; 2KYB A; 4J9I A; 5IHI A; 1SRL A; 2DL3 A; 4LE9 A; 1W1F A; 4OMN A; 1GCP A; 2ROL A; 2CH4 W; 1UG1 A; 2LQW A; 2J6O A; 5I11 A; 2EQI A; 2G6F X; 3C0C A; 2D8H A; 1PNJ A; 4IIO A; 5HCK A; 3GBQ A; 3EG0 A; 1W6X A; 2FRY A; 1UGV A; 4RTU A; 2HCK A; 3VS4 A; 2JTE A; 2LX7 A; 2YSQ A; 2C0T A; 3NGP A; 2O2O A; 3VS0 A; 4E6R A; 3EG3 A; 1NYG A; 3M0T A; 1WXB A; 2HBW A; 1ARK A; 1GCQ A; 2CRE A; 3EHR A; 2OI3 A; 2BZ8 A; 2KGT A; 2CT3 A; 1ZX6 A; 2NWM A; 2CSI A; 2H8H A; 1T3S A; 2AZS A; 3M0P A; 2J06 A; 5GJW B; 1H3H A; 1B07 A; 4OMP A; 2HDA A; 2KR3 A; 3NHN A; 1X69 A; 1ABQ A; 2EYX A; 1YCS B; 1QWF A; 2HEQ A; 4LNP A; 2J6F A; 4HXJ A; 4LUD A; 2KXD A; 3TVT A; 2CH4 A; 3TSW A; 2EPD A; 1WIE A; 3EG1 A; 4WCI A; 2J7I A; 2OAW A; 2GNC A; 1PRL C; 1WI7 A; 2X3X D; 4K11 A; 4DEY A; 3PVL A; 1YNZ A; 2EGA A; 2PNI A; 4GLM A; 4AFU C; 2GTJ A; 1CSK A; 1WA7 A; 2A36 A; 1T3L A; 1X6G A; 2MCN A; 1GCQ C; 2YUQ A; 1M27 C; 1MV3 A; 1H92 A; 1A0N B; 4KRT A; 2LJ1 A; 1UUE A; 2RQR A; 1YN8 A; 1NG2 A; 1UFF A; 4RTV A; 2DL8 A; 1PHT A; 1JQQ A; 1QKW A; 2FG0 A; 2JXB A; 3R6N A; 2FEI A; 1WXT A; 2RN8 A; 1X27 A; 2RQT A; 1Y57 A; 2SEM A; 1Z9Z A; 5EC7 A; 3VRY A; 4GBQ A; 1S1N A; 1NLP C; 1UE9 A; 3I9Q A; 4J9C A; 1JEG A; 1JU5 C; 2GTO A; 1QCF A; 1AWX A; 3VS5 A; 4D8K A; 4HVV A; 3VRZ A; 1AZG B; 4ZNX A; 2O31 A; 1W70 A; 2J6K A; 5IHN A; 2L3Q A; 2D0N A; 4JPB W; 2CDT A; 3I5S A; 2DX1 A; 2CT4 A; 4IIM A; 1OPL A; 4ORZ A; 1VYU A; 2LNH B; 3I5R A; 2ECZ A; 1X6B A; 2BTT A; 3SHW A; 4RTW A; 2C0I A; 2ENM A; 1YWP A; 1U06 A; 4OML A; 2DM1 A; 4JZ4 A; 1SSH A; 3QWX X; 2KRS A; 1UEC A; 1X43 A; 2FPD A; 4Y92 A; 2CUD A; 3EG2 A; 4AFZ C; 3RNJ A; 2EVR A; 1KSW A; 2DE0 X; 2FRW A; 2PZ1 A; 3FJ5 A; 3TSZ A; 3REB B; 1KJW A; 2P4R A; 2DBM A; 2EYZ A; 1AWJ A; 2D8J A; 3UF4 A; 3H0F A; 1GFD A; 4R0K A; 2O9S A; 5ECA A; 3NMZ C; 1Z9Q A; 3M0Q A; 2DNU A; 4ESR A; 3H0H A; 2E5K A; 3KFV A; 2YUN A; 2YUO A; 1AOJ A; 3IQL A; 1K76 A; 1TG0 A; 1UHF A; 2K2M A; 2KRM A; 2DMO A; 2DF6 A; 1NM7 A; 1J3T A; 4X1V A; 1X2K A; 3JV3 A; 1CKA A; 2JS0 A; 4Z89 A; 2RPN A; 1M8M A; 2ESW A; 2J05 A; 1AWO A; 2CSQ A; 3VS2 A; 2C0O A; 1VYT A; 1IO6 A; 1HJD A; 1SPK A; 2A28 A; 4CC4 B; 1K9A A; 1PKS A; 3M0S A; 1FYN A; 2I0N A; 1I07 A; 1NEB A; 2K79 A; 1RLQ C; 1K4U S; 1FMK A; 2KNB B; 4HVU A; 1JO8 A; 3CQT A; 2ED0 A; 5IHK A; 2LP5 A; 2RNA A; 2LCS A; 1ZLM A; 1K1Z A; 1U3O A; 2EYY A; 4F16 A; 2DL4 A; 1TUC A; 2DVJ A; 1PRM C; 1U5S A; 2YDL A; 4OMM A; 4AFS C; 2DL7 A; 4J9H A; 2K7A A; 1ABO A; 2LJ3 A; 2SRC A; 1CKB A; 2DA9 A; 5FW9 A; 3VS6 A; 2VKN A; 4LUE A; 2LZ6 B; 4Z8A A; 2YUP A; 4A63 B; 1ZBJ A; 1AZE A; 2JMC A; 1T0H A; 3H0I A; 1VA7 A; 4J9E A; 1NEG A; 2JT4 A; 2F2W A; 1RLP C; 4JZ3 A; 2KRO A; 2M0Y A; 1OOT A; 1XOV A; 2HSP A; 1SHF A; 1ZUY A; 1G83 A; 3VS1 A; 1I0C A; 3EGU A; 2FPE A; 1BBZ A; 4HCK A; 1SEM A; 4JJD A; 2MIO A; 2AKK A; 1BB9 A; 5IH2 A; 2KRN A; 4RTZ A; 1AVZ C; 1OV3 A; 1ZSG A; 2A08 A; 4RTX A; 1PWT A; 2ROT A; 1JXO A; 4RUG A; 5IXB A; 2RQU A; 2EGC A; 2EYW A; 4FSS A; 2L3P A; 2KYM A; 3ULR B; 2OJ2 A; 1WDX A; 2LMJ A; 1PKT A; 1YP5 A; 3M0U A; 2MOX A; 1OEB A; 2LJ0 A; 1GL5 A; 1AEY A; 4Z88 A; 2KXC A; 2L0A A; 2W0Z A; 1OPK A; 4J9F A; 2M51 A; 1ZUU A; 1SRM A; 2EW3 A; 5L23 A; 3H41 A; 2KT8 A; 2W10 A; 2L3S A; 1M3C A; 1GBR A; 5FWB A; 4CC3 A; 4F17 A; 1UJY A; 3O5Z A; 2DYB A; 4J9D A; 2L2P A; 4M4Z A; 2K6D A; 1EFN A; 4D8D A; 1QLY A; 1GFC A; 4RTY A; 2A37 A; 2EBP A; 4AG1 C; 4AFQ C; 3VS3 A; 4AG2 C; 4OMQ A; 2F2V A; 1MV0 B; 3VS7 A; 1M3B A; 1E6H A; 5FWC A; 2V1R A; 1KFZ A; 2JMA A; 4RTT A; 2K3B A; 2GGR A; 2B86 A; 1QWE A; 2EGE A; 1GRI A; 1WX6 A; 4J9G A; 2PTK A; 1N5Z A; 1K0X A; 2AKL A; 2DLP A; 2XMF A; 1UTI A; 3UAT A; 3QWY A; 3A98 A; 2RMO A; 2NUZ A; 2GBQ A; 1LCK A; 2QDL A; 2DRK A; 3THK A; 1X2Q A; 3PVQ A; 1Y0M A; 2GQI A; 2FO0 A; 1HSQ A; 4QT7 A; 1RUW A; 2X3W D; #chains in the Genus database with same CATH topology 3E9G A; 2KMT A; 1AWW A; 1M2V A; 5GAN 4; 4D6W A; 4LDV A; 1ZUK A; 2X9H A; 1QQJ A; 2F69 A; 2KT1 A; 3CCE A; 2JM8 A; 3RKW A; 9ATC B; 2F2X A; 4AT1 B; 1SSF A; 4HT8 A; 2CUB A; 1IXD A; 4F14 A; 1YIJ T; 4CC2 A; 4E7H A; 1ZHI A; 2O88 A; 3RMS A; 2E65 A; 1BK2 A; 3I35 A; 1N8R C; 3GNG A; 1GBQ A; 1JXM A; 3L2Q A; 1RI9 A; 2AK5 A; 2CZ7 B; 1HD3 A; 3JCM h; 2ED1 A; 3JB9 D; 1G3Y A; 3TCJ A; 3EH1 A; 4OB0 B; 4C92 B; 4CC7 A; 4HCB A; 3OA6 A; 3SEM A; 1NLO C; 3SWN B; 3J7A F; 3EFO A; 2JZ2 A; 2QG9 B; 5KH6 A; 1V1C A; 1PSF A; 3E19 A; 1KQ2 A; 2RHY A; 2DRM A; 3CME T; 2EJ9 A; 1WXU A; 4MML A; 4LDY A; 3OW2 A; 1YIT A; 2CP2 A; 1TUG B; 3OYI A; 2D0Q B; 1YCY A; 4LDX A; 1QVG S; 2X51 A; 5GAN f; 3CC4 T; 3CME Q; 2CS7 A; 2KE9 A; 3UWN A; 2JOY A; 3LH5 A; 2FYK A; 3HFN A; 5IHI A; 4M77 E; 4OMN A; 1Y07 A; 2HQE A; 2LQW A; 4Q5W A; 1BI2 A; 3ZBD A; 2D8H A; 1PNJ A; 2R5M A; 4IIO A; 2JN0 A; 1W6X A; 2FRY A; 4RTU A; 1Y96 A; 1IGU A; 2VGM A; 7AT1 B; 2EFI A; 4QVD A; 1NYG A; 2HBW A; 1GCQ A; 1LPL A; 2RI2 A; 2QYZ A; 3EHR A; 2VYT A; 4MZM A; 1ZX6 A; 3M58 A; 3BDU A; 3C95 A; 4M78 E; 1NPR A; 4RKU E; 3M4G A; 5GAN 5; 3JB9 J; 1VQK T; 1O75 A; 1N9S A; 2QK0 A; 2A7Y A; 3NHN A; 4N4G A; 1ABQ A; 5C0M A; 1MHN A; 2J6F A; 1AT1 B; 2KDS A; 4M7A D; 2CH4 A; 2OAW A; 3CCL T; 3G6E A; 2X3X D; 1OQK A; 4FCY A; 5LJ5 f; 1OUL A; 1YJN Q; 2GTJ A; 3QDR B; 2A36 A; 2D9T A; 1LNX A; 2YUQ A; 4PLL A; 2DTO A; 4KRT A; 4BB7 A; 4CRI A; 2LJ1 A; 3EG9 A; 1K9M U; 2VC8 A; 1UUE A; 4TVR A; 2RQR A; 4M7D D; 1NG2 A; 3G4S Q; 4A4E A; 3GOX A; 4PJO F; 3M4Y A; 4JLI A; 3QYG B; 2RQT A; 2SEM A; 4M77 G; 2E4H A; 4ZGJ B; 3S3N A; 1VQ8 Q; 1JU5 C; 4UC4 A; 5GAN 2; 2P0P A; 1QVF A; 4M75 E; 1VQL T; 3CCJ T; 2RA2 A; 3HKS A; 4NOY A; 4OF1 A; 1VUB A; 1G5V A; 2L3Q A; 1V76 A; 1ZQ1 A; 3KUF A; 3CC2 T; 1VYU A; 4LXC A; 4M77 C; 2KQW A; 1VQ5 T; 2BTT A; 3MEV A; 3SHW A; 4RTW A; 2ENM A; 1U06 A; 1MMD A; 3CPW A; 5LJ3 e; 1S72 Q; 3MO8 A; 4QQD A; 3MP6 A; 1SSH A; 3QWX X; 4B6M A; 4AFZ C; 3RNJ A; 3I55 A; 1KSW A; 2DE0 X; 4QQ6 A; 1QW1 A; 4M78 C; 3UF4 A; 5ECA A; 1ACM B; 1Z9Q A; 4KH0 B; 4X9D A; 1U8R A; 2YRD A; 3E1S A; 3JB9 I; 1RL2 A; 3KFV A; 3QBY A; 4BD3 A; 1AOJ A; 2RHI A; 4C8Q B; 3M9Q A; 2LCL A; 1TOV A; 2KRM A; 4RCC A; 4FM4 B; 3L2R A; 2DMO A; 1YBY A; 2DF6 A; 1VQP Q; 1J3T A; 5D6W A; 4MZP A; 1K9M R; 2L5Q A; 2DZ9 A; 4Z89 A; 1Q81 C; 2ESW A; 2FZK B; 2O4X A; 4HCC A; 3NFC A; 5GAN j; 3CCV Q; 3JCM f; 3VS2 A; 5CQX A; 2C0O A; 1AHJ B; 1HK9 A; 1PKS A; 3M0S A; 4DOW A; 1FYN A; 2RJC A; 1RLQ C; 1YJW Q; 4LDU A; 1N9R A; 4XU1 A; 4HVU A; 4J6W A; 3CCR T; 2QTX A; 4C92 F; 2ED0 A; 2JUF A; 2FHD A; 3KXT A; 2LP5 A; 1G8X A; 2RNA A; 2LT1 A; 3M5A A; 2LCS A; 2PUO B; 1YHQ Q; 1NE8 A; 2YRC A; 2X35 A; 1VQM Q; 3HFO A; 1U5S A; 2YDL A; 2QA4 Q; 4M75 C; 3FB9 A; 1ABO A; 4MMK A; 4MDX A; 2RI5 A; 2LJ3 A; 2XDP A; 5FW9 A; 1CKB A; 2DA9 A; 2VKN A; 2PVG B; 5L8R E; 1VQ9 A; 4A63 B; 2OTL A; 4IUQ A; 3CCU Q; 1VA7 A; 3G71 Q; 3INZ A; 1X01 A; 3VKI A; 5LJ5 j; 2RI3 A; 5A0D A; 2MI6 A; 2M0Y A; 2HSP A; 3UT1 A; 1VOM A; 1WHG A; 1I0C A; 1QVF P; 1BBZ A; 1OX8 A; 1SEM A; 4JJD A; 2MIO A; 2AKK A; 3MP1 A; 1QP3 A; 2COZ A; 2PU9 B; 1VQ4 Q; 1OV3 A; 5GAN d; 4DBQ A; 2BE7 D; 2ROT A; 1JXO A; 5FU7 B; 3OYB A; 3QDF A; 1X6O A; 3ZFJ A; 1WDX A; 2PUK B; 1MMN A; 5LJ3 h; 2V8K A; 1RAB B; 2RHZ A; 1PKT A; 3CPW P; 3M0U A; 4M77 D; 5EG2 A; 1OEB A; 2E1H A; 4Z88 A; 2KXC A; 2HMA A; 3BDL A; 4J9F A; 3URG A; 1ZUU A; 2EW3 A; 4J8O A; 5FU6 C; 4C0Z A; 4CI0 C; 5C6S A; 5KYX A; 5CR2 A; 2K4Y A; 2D6F A; 3VJP A; 2QQB A; 2WAC A; 1WQ7 A; 1YI2 T; 2CP3 A; 3I56 A; 2DYB A; 4M4Z A; 1NPP A; 4D8D A; 4M78 D; 2LTO A; 1I81 A; 2MYS A; 2EBP A; 1K8A C; 1MV0 B; 1M3B A; 2V1R A; 4XAX B; 1VQ9 Q; 4BE1 A; 5LJ5 d; 3JB9 H; 5GAO r; 2B86 A; 2CYZ B; 1M90 C; 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1GCP A; 2ROL A; 1YJ9 A; 3HSB A; 2J6O A; 5I11 A; 2P4T A; 1N6A A; 3JCM d; 3GNF B; 2YSQ A; 2O2O A; 2WSF E; 2Y4X A; 3EG3 A; 4XTU A; 1WXB A; 1ARK A; 2HSE B; 1Q95 G; 3ASK A; 1QVF S; 4M7A C; 2LCC A; 1VQ6 Q; 1M8V A; 2JTM A; 2XD0 A; 1YIJ A; 4PL6 A; 1H3H A; 1B07 A; 2QEX T; 4OMP A; 2DTH A; 1X69 A; 2DIQ A; 3HPW A; 2YWW A; 1QWF A; 2PVD B; 2R57 A; 4HKE A; 4HXJ A; 4LUD A; 2AT1 B; 5HKC A; 5GAM d; 3MPU B; 5GAO l; 2J7I A; 3CPW S; 1OU8 A; 1KHC A; 1TWB A; 2YLC A; 3CPF A; 2HL5 C; 4QVC A; 3OYE A; 2EIF A; 4C8Q A; 3P8D A; 4KUI A; 1D09 B; 4VUB A; 1NZ9 A; 2OTJ Q; 4M7A F; 1N8R R; 1T3L A; 1X6G A; 2LQ8 A; 4NS5 A; 1GCQ C; 1MV3 A; 3LX7 A; 3EGD A; 4J5Y A; 4PJL A; 4WF2 A; 3RDV A; 3ME9 A; 4E7Z A; 1XNI A; 3S6W A; 1SG5 A; 2EJF A; 3J80 E; 5LJ3 f; 1HXD A; 2QI2 A; 2K3Y A; 1PHT A; 4AMC A; 1Q7Y C; 3QO3 A; 3VYG A; 5IT9 E; 3UDC A; 5GMK e; 1KC8 C; 1W2B A; 1R0B G; 4M78 B; 3M56 A; 1Y57 A; 1Z9Z A; 4M7D F; 4HA8 A; 4GY5 A; 4GBQ A; 3CC4 A; 1NLP C; 1UE9 A; 3I9Q A; 4X9C A; 2GTO A; 1VQO Q; 1QCF A; 1AWX A; 3VV0 A; 1VQN Q; 1PC0 A; 3NTI A; 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