2YWPA

Crystal structure of chk1 with a urea inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
269
structure length
269
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRAVDCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Synthesis and biological evaluation of 1-(2,4,5-trisubstituted phenyl)-3-(5-cyanopyrazin-2-yl)ureas as potent Chk1 kinase inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 269
sequence length 269
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2007-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2ywpA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2ywpA01
4CLIA 5KX8A 3FZSA 3KCKA 2HENA 3HYHA 4EL9A 1PJKA 2IVTA 4UV0A 2J2IB 2W4KA 4FG9A 3UVQA 4Y95A 2OIDA 3MVLA 4QO9A 3UNZA 3ROCA 3ZZWA 1H1WA 4KWPA 4YSMA 4G3GA 3FZ1A 4I21A 3OT8A 4USEA 4KS8A 3ORLA 4J8MA 1OL7A 3MB7A 4I92A 4L67A 1SVEA 4I41A 3AT2A 1OMWA 3DV3A 1R1WA 4ONAA 3ANQA 3Q4UA 4GVAA 4RLKA 2Z2WA 5IA1A 3OWJA 4C35A 4FIHA 2OXDA 3DJ5A 4AW1A 4HYHA 3W2SA 3JUHA 4RIYA 2X8EA 5A3XA 3IKAA 4FV7A 1H1PA 4IZ5A 3RKBA 4F1OA 4B0GA 3CD8A 4YU2A 3UO4A 3GI3A 1Q41A 5EDQA 3GBZA 2XIYA 4IMYA 2QOBA 5BYZA 3RJCA 4MEDA 3DBQA 4O0WA 3C7QA 3D94A 4IH8A 3H30A 3N4VA 4ASEA 4FTUA 3FXWA 1Q8YA 2ETKA 4ZZNA 3BHTA 4CKRA 3PSCA 4UMUA 2UUEA 4EH3A 2F4JA 5AMNA 2OXYA 3V5QA 4BC6A 5KO1A 3H9FA 2LAVA 3R71A 3KULB 4UWCA 1I44A 2DWBA 5BNJA 4EC8A 2HK5A 2XB7A 1JBPE 1W84A 4RGJA 3SLSA 5CF4A 1KUTA 4RZWA 4F99A 3SG8A 4NTTA 4ZTQA 3UJGA 1TQMA 3EQDA 4M69B 4RX5A 5EQYA 5IQDA 2G2IA 3EN6A 1KOAA 2BALA 2EXEA 4OTIA 3CBLA 4O38A 4BCGA 2JDOA 3QALE 2QI8A 3BGPA 4PDPA 5IA5A 2B0QA 5JRQA 4YZMA 1UU7A 2CJMA 4CZYB 3Q2MA 5M44A 3FMLA 1FVTA 2WPAA 2GNLA 1E1VA 5JFWA 4BIEA 1L8TA 2ITTA 1NVRA 4M0ZA 3SRVA 3KEXA 4WOVA 1UVRA 3DKGA 2ZJWA 3OCBA 4XP3A 3SOCA 3GU8A 3TT0A 3BE2A 5BUJA 2GS6A 3U54A 4C3RA 5GIPE 5BPYA 3HUCA 2B55A 3HV6A 3LIJA 4ZMEA 3K5UA 1BL7A 3EFJA 3ZO1A 1Q3DA 2WXVA 4D4YA 2CKPA 1OKVA 5FGKA 3POZA 1ZWSA 3WIGA 4XV9A 2OH4A 3MGYA 3UG1A 3I7CA 3FJQE 3VQHA 3QTRA 3QWJA 1JNKA 4CFUA 4PNIA 3O8PA 4RIYB 4BN1A 1B39A 4ASDA 2BIKB 5JGBA 4FTCA 3UNKA 3ORIA 4IAKA 3A7JA 3WOWA 3I79A 1TKIA 2VWYA 3AD4A 3NUSA 4FG7A 4PTEA 2PVMA 4X2FA 3V3VA 4CSVA 2PTKA 5CS6A 4I6FA 4U41A 1RE8A 5H9BA 5CENA 3UIMA 1HOWA 3EKNA 4FYNA 3VN9A 3ZO3A 3UBDA 4YBKA 4CMUA 2AUHA 2QOIA 1UA2A 3C0HA 2XKCA 4X6RA 5DRDA 4UYAA 4HPUE 5AP7A 4F7NA 4O83A 2RL5A 5JZJA 4IJPA 3VBXA 3AC5A 4M84A 3GVUA 3HVCA 3K3IA 3BRBA 2Y6MA 3EIDA 4OW8A 3QZFA 5E92A 5JRSA 3V8SA 3H9OA 5EG3A 4C61A 3OS3A 3W33A 2VGOA 5HTBA 5CANA 3RPOA 3KN5A 2BILB 3G5DA 3OCGA 3B8QA 4Y46A 2WMXA 1CMKE 3NVKI 5A4TA 2QO9A 3HRCA 4EZ7A 4IZ7A 4AGWA 4IFCA 5H8BA 2W96B 4FTRA 2B1PA 3KC3A 1YVJA 4TYGA 2OZOA 2NP8A 3T3UA 4K18A 2C6OA 3TJDA 4D2PA 1Y91A 2V7AA 3PJ8A 3VO3A 4DGGA 2C6LA 1CKPA 3Q6UA 3SRVB 1LEZA 5EM7A 1TQIA 4LOOA 4BTJA 4ZZOA 4CVAA 4TYEA 5HU3A 5KMIA 3NYXA 4PP9A 2BDFA 2OU7A 3N4TA 2ITZA 4MHAA 4QTCA 2XIXA 1H08A 3QTIA 4L01A 4D2WA 5FTOA 2JKOA 5ANKA 3KY2A 3HV5A 4EHZA 3EJ1A 5HO7A 2WHBA 3QQKA 2IZUA 4AZWA 3OG7A 4B9DA 4YPDA 3LFDA 3W32A 4YLLA 4FKLA 5K4JA 1KE9A 2VN9A 3WILA 3PRFA 5EI6A 2HZ0A 1REJA 3KGAA 3W55A 5IPJA 2RIOA 4F64A 5E8YA 4PF4A 2YZAA 3SG9A 4C4GA 3L9NA 5EW3A 4ARKA 3ELJA 3DFAA 4O21A 3CQWA 3FMNA 4AGUA 3O23A 3QQHA 3NLBA 5L2SA 2IW9A 2WO6A 4YZCA 2PZPA 3RPSA 4ANNA 4F4PA 1VYWA 4GV1A 1ERKA 2V22A 1XH9A 4KNBA 1KOBA 2R0UA 3U6JA 3VS6A 3R1QA 4H3QA 2QOOA 2BAKA 3MY5A 3R28A 4C58A 3R1YA 3BU3A 4YZ9A 5EHYA 3PG3A 5ANDA 2CLQA 2PE1A 3DLZA 5FG8A 4OTQA 3QQJA 4EZ3A 4IC8A 5CY3A 3FKOA 3R8MA 3A4OX 4PX6A 4BGQA 3JY9A 4CTBA 4EOQA 3O8TA 5IQHA 4DFBA 3M42A 4N6ZA 3MH3A 3ZOSA 4Q5HA 1XBAA 4TXCA 3RM6A 4EHGA 2PVRA 1H27A 3IOPA 4DEGA 4AE6A 2YM3A 4AOIA 5CU0A 2GNJA 4W4VA 1OVEA 4R3CA 3LFBA 4IVBA 4UXQA 5HO6A 4C57A 2PL0A 2RF9A 1WBVA 3F3TA 2ZMDA 1KE8A 3HL7A 3HV4A 3TM0A 4FKRA 3CTJA 2WAJA 1Y8YA 3E63A 4JJRA 4DG2E 4EH4A 3HRBA 3R01A 4E7WA 3ZZEA 4A9SA 2WTIA 3Q04A 4RX9A 4L53A 5ETAA 1REKA 3LQ8A 2J0KA 2XVDA 4YJUA 3BBWA 4D9TA 2JIVA 4FVRA 3IW6A 4G16A 4U5JA 4XCUA 4FTKA 3OY3A 4M3QA 4IDTA 3JS2A 2UVYA 1YWRA 3MWUA 3BYMA 4L43A 4CFXA 4JT3A 3TUBA 3OUNB 4UYNA 4CV8A 4HGEA 4UMPA 2DS1A 4I93A 3U6IA 4O82A 3QKLA 5EI8A 3IECA 4F7JA 2BRBA 3EYGA 3POOA 4OLIA 1R78A 4UMQA 1K9AA 4A4XA 3OWLA 4JR3A 4QMUA 2CN5A 1PW2A 2OGVA 3C4ZA 4O7SA 3P5KA 4ZSEA 2GHLA 5IQGA 4IB5A 4HGTA 4ZJVA 1V0PA 1XO2B 5AUZA 4JBPA 3MA3A 3ATTA 4BBMA 5EM8A 4A07A 3D5VA 1R0PA 5M53A 4G3EA 3E8DA 4NW6A 4S33A 2C5NA 3PLAE 1ZZLA 3TNWA 2FUMA 3P9JA 2W9ZB 3WIKA 4UMRA 5CAPA 4L3LA 4YHFA 5GZ8A 4QP1A 4DF3A 4ZP5A 2CDZA 3RWQA 4OT6A 3PWYA 5T68A 2UZNA 2ACXA 3QRTA 4B4LA 4EJ7A 4FKJA 4QP8A 2XBAA 3DS6A 3FBVA 3KRXA 3QF9A 2X9EA 2EUFB 1YKRA 3QWKA 4YTCA 4FL2A 2X39A 3A7GA 3FMKA 1XH4A 5TF9A 2ONLC 4BCPA 3VJNA 2BFXA 2J5EA 3AQVA 4E4XA 3Q53A 3RINA 3COHA 5CVFA 4XG6A 3ZDIA 3ALNA 1YXSA 4YC3A 4JG8A 5HE0A 4PMPA 1NW1A 2EB2A 4MCVA 3E92A 3MESA 5JEBA 3UQCA 2XJ1A 2HELA 3S2PA 3H0YA 4L6QA 1P4OA 4UWBA 4ZSGA 3TDWA 2ZAZA 4BKJA 4B99A 3HA6A 3NUNA 5JGDA 3DPKA 1CTPE 3Q6WA 4CZTA 2C3IB 3BV3A 3QD4A 1UWHA 4RWIA 4QNAA 3OD6X 4JVGA 2IPXA 3JYAA 1JKLA 2Z7QA 4FOCA 3G9LX 5E8ZA 3EQBA 1ZYDA 4HVSA 5CTPA 4R3RA 4L44A 1BL6A 2P2IA 3UQGA 4AN9A 4NL0A 3ZU7A 4GK3A 5JQ8A 5IQBA 5IZFA 4GG5A 5E90A 1FQ1B 2RFSA 3LXKA 4BGHA 4LV5A 4EQUA 3NIEA 4FI1A 2RFEA 3MVHA 5DE2A 4I1ZA 1RW8A 4R5YA 3PLSA 5GHVA 5JFSA 3GCVA 4OTGA 2IG7A 2VTTA 4QTEA 2EVAA 3BU6A 3P7AA 4QMWA 4ZTMA 4V0GA 5H2UA 2BHHA 4IFGA 2XP2A 3E93A 3P7BA 3VUMA 3ZFYA 4WBBB 4TL0A 3VUGA 4ZY5A 1J7UA 2FSMX 3QLFA 4QNYA 4YJOA 4I5CA 4WNOA 4TWOA 2GNIA 2WIHA 4O2ZA 5EI2A 2OJ9A 2CCHA 3I5ZA 5FQDC 3VIDA 4FGBA 4AU8A 4BTFA 4AFJA 2C4GA 4O7TA 5AV3A 1H4LA 1FINA 2WKMA 5E8TA 3WZKA 5H8EA 5AUUA 4L8MA 4DGOA 1G8AA 2ZYBA 3OCTA 4JLCA 2QLQA 3L9PA 2BZHB 5JFVA 4ZAUA 5DRBA 3ZEWA 2Y0AA 3P4KA 1GIIA 4C02A 4D4SA 3GU6A 4AOTA 4U42A 4UXLA 5L2IA 3NRMA 2ZDTA 3CEKA 3DOGA 3NYNA 3FZRA 4QYHA 5GJDA 2FH9A 4XX9A 2UW0A 2CKEA 4H1JA 5C03A 1PXMA 3UIXA 4Q9ZA 3UO5A 3EKKA 1J3HA 4NM3A 3ZXTA 5LXMA 3S0OA 3VBTA 5DVRA 3SAYA 2KTYA 4QOXA 4A06A 1J91A 3L8VA 4HYSA 5DR6A 2W1DA 3PJ1A 3F3VA 1F3MC 3LCSA 4CCBA 5E4HA 5LVNA 3ROYA 3GU4A 5AWMA 4IVAA 2RKUA 4IM3A 4P7EA 4XRJA 1XKKA 2BIYA 4DBXA 1L3RE 3FQSA 2GS2A 4S31A 4DGMA 1H1RA 5K0KA 5F9EA 4JR7A 5ACKA 4O7WA 3M11A 3WZEA 3PVWA 3RCJA 3D83A 4GW8A 3MDYA 3QRIA 4L45A 4OTRA 3QZHA 4TT7A 3O50A 2FVDA 3N9XA 5HGIA 4F65A 2R3JA 4NK9A 3LLTA 5CSWA 5BYLA 3A4PA 3RM7A 4EKLA 1ZXEA 2RSVA 3HX4A 3MPTA 4FSNA 4JIKA 3V8WA 3DK3A 3UOKA 4JQ7A 4O7ZA 3BLRA 3MB6A 3EQCA 4H58A 4V0GB 3WZDA 3DZOA 2SRCA 5JZNA 2QR8A 4IIRA 3I4BA 3QCXA 3BGQA 2HXLA 2UZTA 5KZ0A 4BYIA 5DGZA 4BZDA 2F2CB 3C50A 3H4JA 2JEDA 3CPBA 4JI9A 2V5QA 3ZH8A 4ANOA 5LWMA 3BYVA 1ZYJA 2R3FA 4IANA 4YJPA 2XNNA 5AIRA 2XBJA 3VBVA 2VTAA 4RMZA 2XMYA 1NVQA 3MYGA 3DNEA 5CEIA 5DOSA 2XIRA 5ITAA 4RVLA 2PMLX 4QMVA 2PVHA 3DK7A 4HVIA 5IQCA 5I4NA 3EFWA 4FUYA 5CSVA 5FBOA 4EOOA 3VBWA 4QP9A 4RFMA 3PZHA 5TT7A 3C13A 4UALA 3L8PA 4YTHA 4ITJA 1SNUA 3KCFA 4O0SA 2WB8A 2FGIA 2OJIA 3RALA 3FI2A 5JKGA 4FZAB 3L1SA 4ASXA 1P5EA 5CEPA 3VS7A 5FM2A 4AA0A 2R9SA 4NM7A 1U59A 5CEKA 4DEAA 4QQJA 5I9XA 3E88A 3ZLSA 3EZVA 4W9WA 4C3PA 4C7TA 4BIBA 2JAMA 3PA3A 4Z9LA 5ANJA 2A27A 2ZV8A 5IA4A 4L46A 1RDQE 3QZIA 4MKCA 4RX8A 1H07A 1URWA 4USDA 3QBNA 4FF8A 3A2CA 1YW2A 1I09A 2PVKA 4QP2A 3FC2A 1XBBA 3NW5A 3OY1A 1WBPA 4C36A 2QOHA 3MVMA 5G1XA 2WMSA 3ULIA 2XKEA 3OW3A 2VX0A 3GCSA 1KWPA 3NYOA 4AW2A 4BHNA 3PJCA 2PVYA 5IMXA 3Q2JA 1ZOEA 3Q4CA 4HVGA 4D2TA 3SD0A 2PUNA 2C69A 3P78A 2QOKA 4H39A 5CWZA 1ZOHA 5DG5A 3ZEPA 2VO6A 4PTGA 3TNPC 1B6CB 2F7XE 3LCTA 3R22A 1YI3A 4P5ZA 2HW7A 4QMTA 2AC3A 2WIPA 4AN3A 4WRGA 4PL5A 3OT3A 4GL9A 5CU4A 5HG9A 5HICA 3R9OA 2IZTA 3GCUA 3BEAA 4O91A 4CQEA 5H3QA 2QOFA 4K0YA 5HBJA 5FEDA 5FWKK 5J87A 5JMSA 5TO8A 3F9NA 3QGYA 3BU5A 4F09A 5HIEA 4GK4A 4RC4A 1ZMWA 3HMPA 4QP7A 2OIBA 4ZJJA 4ANMA 2X9FA 4APCA 5KMNA 3M2WA 2E9UA 3DNDA 2BAQA 2G1TA 1ZAOA 3WZUA 5EOBA 5LVOA 4XBRA 3ODZX 4PQNA 3QQLA 4ACMA 4IW0A 3KL8A 4QPAA 5HVYA 3MY0A 3R8PA 4DHFA 4GFGA 1WCCA 4DCEA 3HLLA 2BPMA 4AT5A 3R9HA 4HCUA 1B38A 4FBXA 1OIYA 1JOWB 4WNKA 2GTNA 3GC0A 5LMKA 2UZEA 3G90X 4QRCA 5I9ZA 2C0TA 4CFWA 4RJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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