The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
28
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sequence length |
115
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MRVAIPAEDDRGIKSNVSKHFGRSRYFVFVDIEGEDVKNVEVVEVPFGDLPNFIKDHGAKIVLTYGIGRRAIEYFNSLGISVVTGVYGRISDVIKAFIGGKLKIDYDWKE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Structural genomics, unknown function
|
| molecule keywords |
Hypothetical protein PH0822
|
| publication title |
Crystal structure of PH0822
rcsb |
| source organism |
Pyrococcus horikoshii
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| total genus |
28
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| structure length |
110
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| sequence length |
115
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF02579 | Nitro_FeMo-Co | Dinitrogenase iron-molybdenum cofactor |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Nucleotidyltransferase; domain 5 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QTD A; 1EO1 A; 2RE2 A; 1T3V A; 1O13 A; 2WFB A; 1RDU A; 1P90 A; 2KLA A; 2YX6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3TAE A; 4G1Q A; 1YAG A; 3VA0 A; 1C0G A; 1T6D A; 3ULD A; 1VSJ A; 3WNG A; 1S1V A; 4FYD A; 3U4L A; 3K59 A; 1GLL O; 3K2P A; 4JI4 K; 2WUS A; 4FSV A; 3SQ4 A; 2ZJR L; 3A5M C; 1BUP A; 1IBK K; 4PKG A; 2YHB A; 2OZM A; 1XC9 A; 3ZT0 A; 4C23 A; 2A1S A; 3QNN A; 1SZ2 A; 3THY A; 2YKM A; 3P38 A; 4BDZ A; 1SS6 A; 3C6A A; 4MFB A; 3HO1 A; 4LH5 A; 4RW4 A; 1JXE A; 2HNY A; 1Q7Y O; 3MX5 A; 4O5B A; 1IKY A; 3O5B A; 4JEP A; 3LP1 A; 1E4F T; 3C95 A; 5J2Q A; 4JI8 K; 2HBJ A; 4IO8 A; 3A5N C; 3SMS A; 3GG4 A; 2F9W A; 3H3O B; 2A41 A; 1R0A A; 1W7A A; 2RKI A; 3H08 A; 4DSE A; 1TAQ A; 3OYM A; 2WC9 A; 1MDU B; 3WXJ A; 2P5G A; 3AVJ A; 1D9F A; 1NK7 A; 5DMR A; 3L3U A; 3O3G A; 1E3M A; 3F9K A; 3EE9 A; 4CF8 A; 4FZX C; 2A3Z A; 3EO3 A; 4NLC A; 4CER A; 1KLN A; 4KHP K; 3OYF A; 3NHG A; 1RT1 A; 2Y1I A; 5IT9 O; 3LDQ A; 3WNE A; 3U6F A; 4DR5 K; 3ZET B; 4I2P A; 3KLH A; 1I39 A; 4FLV A; 4KFB A; 1RDW X; 3M8S A; 3LZI A; 1X9S A; 2CGL A; 1K8K B; 5BPL A; 4CHY A; 1SL2 A; 4IG0 A; 1FJG K; 4CCH A; 2O8C A; 4B9L A; 3CQX A; 2EHG A; 3SBT A; 4C8N A; 1QHT A; 2PFU A; 5FRN A; 1GLJ O; 3DLR A; 1KXP A; 2QXL A; 3BEX A; 2NZT A; 3PIO L; 1NOZ A; 4UQG A; 3HBT A; 3C94 A; 2HBL A; 1WB9 A; 3NGY A; 2QWO A; 1Y64 A; 4WYB A; 4KI4 A; 3UE5 A; 1UOC A; 4CK2 A; 4YFU A; 3FE1 A; 5AQF A; 3AVC A; 3OYA A; 2HHS A; 1TKT A; 3D2F B; 4N76 A; 2Q3S A; 4BRI A; 4WQ4 C; 1QSS A; 2Q0U A; 1TYQ A; 3T69 A; 4DTM A; 2P9N A; 4GW6 A; 5C24 A; 5FPE A; 4F8R A; 2QI2 A; 1ITG A; 5HLF A; 4FJ8 A; 5BN9 A; 3SNN A; 4ICL A; 5AQX A; 3H3N O; 4LY7 A; 2Z1H A; 3VES A; 3IDH A; 1DT9 A; 3D0P A; 3BUZ B; 1NGJ A; 1RT5 A; 4O0J A; 5DM7 L; 1GOC A; 3VEW A; 5LMN K; 3E66 A; 4YDU A; 3TAB A; 3O3H A; 4H4O A; 2F4V K; 3MAQ A; 3V1R A; 2XY6 A; 4DUZ K; 4C1N K; 4XH4 A; 4IEE A; 2HF4 A; 1CZA N; 3QLH A; 2OTL N; 1EP4 A; 3F9M A; 5LJV A; 5SWM A; 1QHA A; 2F96 A; 3CJB A; 2CGJ A; 4HWI A; 5BR8 K; 4FJI A; 4IOA L; 2R7Y A; 1RDD A; 4HUF A; 1S5J A; 2B6A A; 5J2P A; 1B9F A; 3VF2 A; 3OYH A; 1NKC A; 1J6Z A; 4EP4 A; 3ZEU A; 4RG8 A; 2QM1 A; 1N34 K; 4Z4G A; 4WQ4 A; 1MWM A; 3SYZ A; 2YCH A; 2VGM A; 3I0S A; 3CCL N; 3H45 C; 1VQP N; 4CGF A; 2JWK A; 4LF5 K; 4AF1 A; 4JI7 K; 2KQ2 A; 5KRS A; 1GLE G; 5T7B A; 4CJ4 A; 1VQM N; 4GKJ K; 1ZBH A; 2RPI A; 3SCX A; 3TI0 A; 4BRM A; 2G8F A; 4DV1 K; 4HTU A; 3ZSQ A; 1OVQ A; 4CIE A; 1YUW A; 4DV2 K; 2ASO A; 3LWL A; 4E7H A; 1RBT A; 5C15 A; 3MN9 A; 4E1N A; 1HYV A; 1U2V B; 4K0K K; 1K8K A; 3BP8 A; 4WE1 A; 3O9R A; 1NGE A; 2HHT A; 5KI6 A; 3CQY A; 4FPB A; 2W6K A; 1TVR A; 3TAM A; 1KC8 O; 4DR7 K; 2PYJ A; 4M7X A; 3GL1 A; 1EX4 A; 3SV4 A; 3H1Q A; 4HCC A; 2HB5 A; 3AGR A; 4B3M K; 1GOA A; 1C0T A; 3ITH A; 3TTD A; 4CES A; 3NE6 A; 4C8K A; 1Q9X A; 1VSF A; 2UYT A; 4FPA A; 3L4I A; 5AQZ A; 2AP1 A; 4FM2 A; 3SUP A; 4BVP A; 1CZ9 A; 3D2F A; 3QEW A; 3D2E A; 1VQ5 N; 5K14 A; 1ZXO A; 4B1X B; 2P9K B; 1IBM K; 4B9S A; 1L3S A; 3CMA N; 1L3T A; 3WUH A; 2YX6 A; 4J8F A; 5JLF A; 2GUP A; 3SV3 A; 3DLE A; 4LFB K; 2FBY A; 4XEI A; 2D1K A; 4FW2 A; 5AQS A; 3RTV A; 4E1J A; 2VG5 A; 3VQQ A; 3CHW A; 3KK7 A; 2ASP A; 1U49 A; 5BPM A; 1TV6 A; 2YKN A; 5AQW A; 4DU4 A; 4FXD A; 4YOU A; 2HHU A; 4DSK A; 4FJ9 A; 5HBM A; 1XNQ K; 4QS7 A; 3CPE A; 4BRL A; 5E26 A; 2CH5 A; 4B1Y B; 3CCM N; 4F3T A; 3THX B; 4H5N A; 3NF9 A; 4JN4 A; 3VGM A; 5KGX A; 4FLU A; 5AQU A; 1QZ6 A; 3RVC A; 1VQO N; 1LW0 A; 1IJJ A; 3EZW A; 2VGN A; 3MWT A; 1Q8I A; 4RCH A; 4FWS A; 3ZSZ A; 4CFA A; 3J80 O; 4LSN A; 1IH7 A; 3OJS A; 4CEQ A; 1L5U A; 1BI4 B; 5GAD P; 5F2R A; 4BE2 A; 3DRR A; 3KKR A; 5JLH A; 3E01 A; 3CG7 A; 1KVC A; 1RBU A; 4DR6 K; 2YHY A; 2YNG A; 4ILH A; 3LZJ A; 4NYF A; 4YOX A; 1NK9 A; 4ZHR A; 3HXM A; 4PL8 A; 4CFB A; 3AVK A; 1I94 K; 3P83 D; 3CM6 A; 3MX2 A; 1XMO K; 3THW A; 2E1Y A; 5GIN A; 4NXN K; 1NM1 A; 4NCB A; 4Y1C A; 2QA4 N; 4BR5 A; 1UA1 A; 4CJL A; 5M1F A; 4M3Z A; 4CW7 B; 4CHP A; 4DV5 K; 2HBM A; 1KFD A; 3MXI A; 1TUU A; 5AQI A; 1QTM A; 2AA4 A; 2BAN A; 1TK5 A; 4BC3 A; 2A5X A; 3CC7 N; 2ITM A; 4LF6 K; 1JCF A; 1U2V A; 4BR9 A; 5FRM A; 1S3X A; 3DAW A; 3AV9 A; 1LAV A; 4DV3 K; 3CC4 N; 4LFC K; 3K5N A; 2P9I B; 1HKB A; 4DTJ A; 4AQY K; 4BE1 A; 3J8A A; 1OH8 A; 4CEA A; 5DK5 A; 2WOM A; 5C0Y A; 1QVF M; 5I42 A; 3U9D A; 1U04 A; 3LL3 A; 1RT7 A; 3AVL A; 3CC2 N; 4ZTJ A; 5C42 A; 1EQY A; 2LSN A; 3VF4 A; 3VA3 A; 4IWV A; 4RTF D; 4IFE A; 1HPM A; 1VAZ A; 2P9K A; 5AJ3 K; 4WCE L; 3RWU A; 3OS1 A; 3BGR A; 4W5T A; 5HRN A; 4JI0 K; 4CGH A; 3OYB A; 1YVU A; 5EVZ A; 4U7B A; 1NU0 A; 1FW6 A; 3CCU N; 4MQ3 A; 4BG9 A; 4DLE A; 3AVI A; 2Y1J A; 1JJ2 M; 3K9J A; 3O1B A; 3D6R A; 5BRE A; 1WLJ A; 3WEE B; 3HJF A; 1NLV A; 3IG1 A; 3PO4 A; 3KZB A; 1YIJ N; 1RBS A; 4BWJ A; 3VQ6 A; 3OYJ A; 2P9P B; 1SQK A; 2NRH A; 4CZK A; 3B6P A; 1BQN A; 3QIN A; 1N33 K; 4DSI A; 2FBV A; 3OYI A; 3CPW M; 1YJ9 N; 5KGW A; 1VRU A; 4CJS A; 4CJ7 A; 4CJQ A; 1RCH A; 4CGJ A; 1HNX K; 1BI4 A; 3I8D A; 4ELT A; 4B3O A; 3F2K A; 2FF6 A; 2I7N A; 4K41 A; 4IEI A; 4FJH A; 3CCV N; 3PX4 A; 3CFR A; 3FFK B; 2ZD1 A; 2OCE A; 4AHT A; 4WFB L; 5D3G A; 1XI1 A; 4NXM K; 3LP0 A; 2W40 A; 4B3T K; 3G4S N; 3QES A; 3CIP A; 2D0B A; 5BRF A; 3RR7 A; 3ZYY X; 4BRQ A; 3KHY A; 5AQP A; 2E6L A; 5C10 A; 1WNS A; 1WUA A; 3KVG A; 5KPR A; 3EKU A; 1S1T A; 3HOT A; 1XQS C; 3CJ1 A; 3QO9 A; 2WFB A; 3O4Q A; 1BCO A; 2W42 A; 3VET A; 2DY4 A; 1G15 A; 1IG9 A; 4A62 A; 1JL2 A; 4E7I A; 4B08 A; 1LV5 A; 4IO9 L; 1FKP A; 1BA1 A; 2G8K A; 3QFU A; 1VQ6 N; 1MU2 A; 4EIA A; 5AQO A; 3ENH A; 1RTJ A; 4LSL A; 1J5O A; 3L2R A; 1KAY A; 4H0O A; 1HMV A; 2HBK A; 4FWO A; 4BC4 A; 3WXL A; 2VG7 A; 4J2E A; 5KRT A; 3C7N B; 4CJK A; 4IOC L; 3MEC A; 3HVR A; 1JL1 A; 4FLW A; 3HST B; 5JS1 A; 3DLG A; 4R79 A; 1QVG M; 2VCP A; 5AQG A; 3VER A; 3NF6 A; 4HUE A; 2XY5 A; 3KWI A; 3RMA A; 4OJR A; 3SJH A; 4BRE A; 3HK2 A; 4CIG A; 4M3U A; 2J4R A; 3RMC A; 1NK5 A; 1WAJ A; 3EE8 A; 1C0F A; 4CF9 A; 3SAF A; 3ZSY A; 1V4T A; 1S1U A; 2E6M A; 4DQ8 A; 2P9L B; 1RTI A; 2NRZ A; 1ATR A; 4CFD A; 3AA4 A; 3T3F A; 4QAG A; 4IKF A; 1EKE A; 4JLH A; 5LL6 Z; 1TYQ B; 4DQR A; 1TUY A; 4Z4C A; 2P9N B; 4A2B A; 3G25 A; 4JHD B; 1NGG A; 1RTH A; 3MK6 A; 4H0P A; 3TSU A; 4DS5 A; 1RNH A; 3WXM B; 3FZL A; 1IKW A; 2P9P A; 2HHW A; 4YNQ A; 3MN6 A; 4JS4 A; 4E89 A; 3SUO A; 4MLE A; 5HRS A; 4DSJ A; 4B9U A; 2NUB A; 2QKB A; 3R1X A; 3TU5 A; 4Q0B A; 1O1W A; 1RDU A; 3FZF A; 3VF6 A; 2ETJ A; 2GEL A; 4DF4 A; 1VQ9 N; 3HI0 A; 4CEE A; 3BZC A; 4M63 C; 4DMN A; 2G8U A; 3EEQ A; 4BR0 A; 4FJM A; 4DSL A; 4OX9 K; 2E2O A; 3DWL A; 4E3S A; 3TAG A; 5DM6 L; 5CHI A; 4H5V A; 5HRO A; 2QWN A; 3ENB A; 2D0C A; 3RSE B; 4CVN E; 4KHN A; 1YIT N; 4JK9 A; 5IWA K; 2XO7 A; 1X9J A; 1ZBU A; 3CI5 A; 1JCE A; 2NRX A; 3SUN A; 3QB0 A; 4PKH A; 4WQ5 C; 2QWQ A; 5TKW A; 4FVM A; 4ID5 A; 2OZS A; 2ZJP L; 2WBN A; 3NVK A; 4MLH A; 3MDQ A; 1NKB A; 2GWJ A; 3GOI A; 3LDL A; 1GOB A; 2HOE A; 4PKI A; 3ZEU B; 4BAC A; 4O44 A; 4I9L A; 5AQV A; 1WSJ A; 3DMJ A; 4JKG B; 3SQ2 A; 2RF2 A; 2QWL A; 1U47 A; 3AAP A; 2RHK A; 5AQM A; 4AM6 A; 2UXD K; 4CZL A; 4OVL A; 3V4I A; 3MED A; 1J54 A; 3SLC A; 5HRP A; 4KBO A; 2CH6 A; 4M3T A; 1TK8 A; 4RW9 A; 3I56 N; 2Z1J A; 4ISE A; 4JKA A; 2A1R A; 3OVN A; 3LAM A; 3M6G A; 3OYN A; 5AFU H; 1N36 K; 2Q36 A; 4OKE A; 4DTU A; 2XRI A; 3EL2 A; 4FZY A; 1S22 A; 1F21 A; 3VEV A; 4IDK A; 1TL1 A; 2DFE A; 3KWG A; 5AQR A; 5CZ1 A; 3DRS A; 1N8R O; 4LF8 K; 1S9G A; 1LOT B; 3C7N A; 1B92 A; 4BRG A; 5GAE P; 1Q86 O; 4N41 A; 3HTV A; 1QSL A; 3IRX A; 2VQF K; 2KHO A; 1ZBI A; 2I7P A; 4CZE A; 3A2F A; 3SPY A; 2KFZ A; 3WNH A; 1N32 K; 4H0V B; 2D0P A; 3ATU A; 4WQ5 A; 2BH1 A; 4KI6 A; 2HHV A; 1KVA A; 3QBX A; 1NK8 A; 3CQ8 A; 4ELV A; 4DTS A; 3TAQ A; 4KTQ A; 4CEF A; 5AQJ A; 3DOL A; 4CJF A; 2IS3 A; 3O1W A; 2ZWH A; 2P9L A; 4M7Y A; 1JLA A; 4JI5 K; 3P4I A; 3NGI A; 4ILJ A; 1W97 L; 3L3V A; 5AQN A; 3D2E B; 1X9W A; 4YOR A; 3PSF A; 3GBT A; 4FM1 A; 1ASU A; 4JHD A; 4A57 A; 4AHR A; 4OPK A; 2GTD A; 2PYL A; 2BDP A; 1U45 A; 1HRH A; 3LP2 A; 1DTQ A; 4FWK A; 1C1A A; 5ADX A; 4HVJ A; 1Z26 A; 4M3W A; 2W6L A; 2IVP A; 3N4Q A; 4EP5 A; 2KFN A; 3DLH A; 4KHW A; 3KJV A; 2ITG A; 4H0Y B; 3LAK A; 3NMU A; 3KIO A; 1YXQ A; 4OLA A; 4FJJ A; 1HNI A; 3OYC A; 1OVY A; 2YI1 A; 4H0X B; 1NK4 A; 3KD1 E; 3Q7C A; 4B1U B; 5F1X A; 4DV4 K; 3C6U A; 2X6N A; 3RSE A; 2NRW A; 3QIC A; 5CYM A; 4FK2 A; 1Z05 A; 1KRP A; 2NRR A; 3O9Q A; 3L2U A; 4A61 A; 3SZ2 A; 3SK3 A; 2Q2R A; 2ZGZ A; 4W5O A; 1Q81 O; 2DPN A; 4H8K A; 4DLG A; 3OBY A; 4A59 A; 1SUQ A; 5AQK A; 4JKC A; 1L3V A; 1C6V A; 1SL1 A; 1NBW A; 4CGD A; 1RT4 A; 4PY5 A; 4DV7 K; 2YNF A; 1XHZ A; 1BCM A; 4B8C A; 1M90 O; 1JLB A; 4JKG A; 2FBX A; 3QDK A; 3V81 A; 4BRH A; 2E5L K; 1C0M A; 3WXI A; 4H03 B; 4JKB A; 4FJN A; 4I9Q A; 3G10 A; 3HT3 A; 2IOC A; 4B9M A; 4O8U A; 4AHC A; 3CFO A; 3THW B; 4O4G A; 4Z4H A; 2E88 A; 3DJC A; 1VSI A; 1KAZ A; 5AQL A; 2JWL A; 3D7E O; 4H5T A; 1N5Y A; 1Z6R A; 1VSH A; 4OGC A; 3ZX0 A; 1O13 A; 3EKS A; 4DR2 K; 3B8A X; 3AVF A; 3NFA A; 1ZBS A; 4KO0 A; 4FOE A; 3B6O A; 3BDP A; 3R3L A; 5CZ2 A; 4BRN A; 3VMF B; 1YTU A; 4BR4 A; 1TKD A; 5TKY A; 4M42 A; 1DTT A; 2O8F B; 4DTP A; 1XC3 A; 2GUI A; 3ZSO A; 4DHY A; 1HKG A; 3KK1 A; 3ZX2 A; 3PO5 A; 2Z1G A; 1FKO A; 1HLU A; 2KZM A; 4NYN A; 1HJO A; 1NJW A; 3L2Q A; 4DG1 A; 2ZQB A; 3THV A; 3TSP A; 1JKH A; 4ISF A; 5CR4 A; 2FF3 B; 3ZT2 A; 4CK1 A; 1QZ5 A; 1WSF A; 3UKR B; 4DF8 A; 3SQ1 A; 4FK0 A; 2NNW A; 5F0X A; 3EYZ A; 2E4L A; 3LWM A; 2FSJ A; 1T8E A; 5EOY A; 3HYF A; 3TTF A; 2E2N A; 4WFN L; 4HTL A; 4FWM A; 2GEM A; 1WSH A; 3CF5 L; 3ISN C; 1BU6 O; 1YTA A; 4KKO A; 4CGI A; 4CZG A; 4FWR A; 4FJG A; 3L6Q A; 3HPO A; 4Y1D A; 3AO1 A; 1R59 O; 3LM9 A; 3G0Z A; 2V7Z A; 4YY3 K; 2ZJQ L; 3V9X A; 5I9E B; 3NF8 A; 3KK3 A; 4BWM A; 4IXC A; 4MO4 A; 3FZH A; 1HUX A; 3SBG A; 4F3O A; 4IDH A; 1TGO A; 3P31 A; 3ZT1 A; 3PV8 A; 3EN9 A; 3V1O A; 1VQ4 N; 1ZBF A; 1YVN A; 4UY8 O; 2O4G A; 2P51 A; 5CE3 A; 3NBP A; 4KRE A; 1EWR A; 2GWK A; 2OPQ A; 1VQN N; 2IVO A; 3AVN A; 2X78 A; 4OPA A; 3R8E A; 4W5R A; 2VG6 A; 2OTJ N; 2Q31 A; 3VQ9 A; 3ZLJ A; 4FZZ A; 3DM2 A; 3E9O A; 3MCP A; 2O4I A; 3QEX A; 3VQ4 A; 3HOS A; 4B9V A; 4JKE A; 4BGA A; 4DQQ A; 1XMQ K; 1BHL A; 1IO2 A; 3OYL A; 4F4K A; 1NWK A; 2UUA K; 2ZE2 A; 1ESV A; 1NGH A; 1GLD G; 2IIR A; 4F2R A; 2UXB K; 3ZSX A; 1SL0 A; 4MDA A; 3CXC M; 4GVE A; 3CJA A; 3S9H A; 1LCU A; 2FBT A; 4KH6 A; 4X64 K; 4FM0 A; 4LFA K; 4DCH A; 3QEV A; 5GAH P; 3AO3 A; 2IAJ A; 3KLI A; 3MCA B; 4FL9 A; 2PY5 A; 3GE1 A; 2JLE A; 3P1G A; 1T44 A; 1E4G T; 1TK0 A; 1TAU A; 4OKK A; 5KPZ A; 1NMN A; 4IBN A; 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