The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
29
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
CQEANYGALLRELCLTQFQVDMEAVGETLWCDWGRTIRSYRELADCTWHMAEKLGCFWPNAEVDRFFLAVHGRYFRSCPIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein transport
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| molecule keywords |
Receptor activity-modifying protein 1
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| publication title |
Crystal structure of the human receptor activity-modifying protein 1 extracellular domain.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
29
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-04-24 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | DNA polymerase; domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQF A; 3N7P D; 3N7R C; 2XVT A; 3AQE A; 3N7S C; 2YX8 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2Z7J A; 2KFZ A; 3MFI A; 1N61 A; 2OXO A; 5J2C A; 2W8K A; 4CF3 A; 3JPP A; 3GV8 B; 4IRK A; 1IM4 A; 3RJG A; 2KEY A; 3EW9 A; 5J2I A; 3RBE A; 2HMX A; 2IOF A; 1COO A; 1CI4 A; 4EEL A; 5DQI A; 5CB1 A; 2BCR A; 5CEH A; 3PX4 A; 3ETL A; 2E1E A; 1YZ7 A; 2HW3 A; 4M9L A; 1K1S A; 2V4Q A; 1N62 A; 3PW4 A; 1FO4 A; 1WWU A; 3PVX A; 3PSF A; 9ICV A; 2BPG A; 1S76 D; 1JXL A; 2DQN B; 7ICT A; 2KIC A; 3KKA A; 2AXT U; 4M9J A; 1KEJ A; 4I27 A; 8ICO A; 1H38 A; 4F92 B; 1ZQN A; 2C28 A; 3RR7 A; 2KTQ A; 2AJQ A; 4ED6 A; 1ZQW A; 4GC6 A; 4UBB A; 2W43 A; 4YMM A; 1NK7 A; 2D3D A; 8ICS A; 3Q8S B; 4CF4 A; 3BDP A; 3H40 A; 3ICX A; 1SZP A; 2KZZ A; 2KD1 A; 1COK A; 1PK1 B; 3PR5 B; 2YB4 A; 5G5H A; 2LYA A; 4FS2 A; 3H8M A; 1T3N A; 4I2D A; 5KT2 A; 4NLK A; 5EWE A; 4DSK A; 1QQ7 A; 3RH6 A; 4ZOH C; 3QZ8 A; 1JXE A; 4RQ4 A; 5AM0 A; 1Y88 A; 4UAV A; 2YTU A; 2ALZ A; 3IM1 A; 4F72 A; 3CNH A; 4QWE A; 1B4F A; 4O0I A; 2W9B B; 5KFG A; 3PV8 A; 3RB0 A; 3ISB A; 1Z4N A; 1S8O A; 4F3O A; 1D8Y A; 3M9N B; 2R8H A; 2H3I A; 2MSN A; 2WB1 F; 3NS1 A; 4QWC A; 2KHQ A; 2WAQ C; 3H8J A; 4DSI A; 2W7P A; 2EZZ A; 3M9M B; 4DQP A; 2NRZ A; 3KZI U; 1NJY A; 4EZ9 A; 3M1Y A; 5HHH A; 2A19 A; 2DWQ A; 3KKA C; 3ZDE A; 2JGA A; 2C2D A; 2PMZ C; 8ICM A; 5KFL A; 3UMC A; 3D2S A; 2F2A B; 2L5Y A; 3BS5 A; 2ES6 A; 5HNK A; 1XC9 A; 9ICO A; 1WUD A; 3CW2 C; 3RH4 A; 1U49 A; 3OJS A; 2ODG A; 1KQQ A; 3FYH A; 2FPK A; 4J9R A; 5DDM A; 5KL8 B; 2B0C A; 2PMZ F; 4P0P A; 4OO1 J; 1O08 A; 5TIS U; 4RQ6 A; 1D9D A; 3K1Z A; 4YN4 A; 4BDP A; 1U4B A; 9ICB A; 3QU4 A; 2KIW A; 5III A; 4MFA A; 1TVA A; 7ICO A; 2EQY A; 4QWB A; 3BQ7 A; 2JV3 A; 2HDO A; 4C4T A; 3VC8 A; 1L7N A; 4YXM A; 9ICA A; 4P2H A; 1SL1 A; 4KX5 A; 1UHU A; 1Q3U A; 2BGW A; 1JRP A; 1X40 A; 2HI0 A; 1YZ6 A; 1ZXI A; 3T5J A; 2RP5 A; 4FS1 A; 1CUK A; 1O03 A; 2BCQ A; 5J0R A; 2DPI A; 3TFR A; 1V97 A; 2JZB B; 4CF5 A; 1B43 A; 1Z1B A; 4KLS A; 3QNM A; 2KKP A; 4RT2 A; 2K4E A; 4DQQ A; 2YB1 A; 2DKZ A; 3KHR A; 2K4I A; 1N5W A; 4DL7 A; 4M04 A; 7ICS A; 5DKW A; 4KX3 A; 2MAX A; 4QZB A; 5BOL A; 2ZIU A; 1KW4 A; 3GV5 B; 3I1Y A; 4NLB A; 3F53 A; 1L3T A; 1JUD A; 5DB9 A; 4TUQ A; 4DL4 A; 3C1Z A; 2XGP A; 1PZN A; 2XIC A; 4QZD A; 4DS5 A; 1HUZ A; 1L3U A; 1SKW A; 1PVR A; 4YFK A; 2K4P A; 1DGJ A; 2KZ3 A; 5EE3 A; 2AHO B; 3IG8 A; 1ZQS A; 5J2B A; 8ICV A; 8ICR A; 4QIW C; 5AKK A; 3HW8 A; 2JRZ A; 3JPN A; 3SI8 A; 7ICV A; 2VA3 A; 4Q44 A; 3CP8 A; 2AH5 A; 3PW5 A; 5IIJ A; 5T14 A; 2Q0Z X; 5KFP A; 5DQG A; 4LZG A; 3BQT A; 1X6I A; 1DXS A; 2XCA A; 2NRW A; 9ICG A; 3MFH A; 4YR2 A; 1ZQF A; 4PHP A; 8ICU A; 3HPO A; 4O5K A; 1X9M A; 4UB5 A; 4PL1 A; 3RRG A; 4US9 A; 3SAG A; 3RBD A; 2VKQ A; 2JXJ A; 4YMN A; 5HR7 A; 1SIJ A; 4ECR A; 4F50 A; 1Z00 A; 3RH5 A; 2EZX A; 1ZQG A; 4US8 A; 4UB4 A; 1FFV A; 3PW7 A; 1ZQU A; 1RXV A; 5EE9 A; 1KTQ A; 2N1R A; 4J9L A; 5ALN A; 3PW0 A; 5IIL A; 1SKR A; 2MUT A; 5DLG A; 1DGS A; 4F2R A; 5ALL A; 4Q45 A; 1TV9 A; 3TKA A; 8ICZ A; 2RHF A; 1NNL A; 3HJE A; 2FPM A; 4G9B A; 4JWN A; 5J2D A; 5KFA A; 5ALV A; 4ECW A; 4GXJ A; 4ELV A; 2OEH A; 2HHS A; 1TK8 A; 3RJH A; 1ZQX A; 1ZQZ A; 2LYB A; 5EE0 A; 4U7C A; 4RQ3 A; 2B6G A; 2BPC A; 2ZIW A; 5IIM A; 2EAN A; 4G3I A; 3H8W A; 4RUC A; 2F8K A; 4DFJ A; 2LPE A; 5ALJ A; 2WF8 A; 2E8O A; 9ICN A; 4YVZ A; 2FLP A; 4ELU A; 2I1Q A; 1T4G A; 1KSP A; 1N60 A; 4M9H A; 4QWD A; 1SL0 A; 1ZQQ A; 4ECU A; 4R64 A; 4F91 B; 3JPO A; 4UAU A; 5CJ7 A; 4J9O A; 2XGQ A; 3IV6 A; 1ZQO A; 4YR0 A; 4RPY A; 3AU2 A; 2JH7 A; 4MHV A; 2HVH A; 2G0A A; 4DSF A; 3AU6 A; 1HIW A; 9ICI A; 4R63 A; 4OJO A; 4P0Q B; 5J0P A; 4DCC A; 4FZM A; 3QXG A; 2D8C A; 2W04 A; 1LKY B; 4I2F A; 3V7K A; 7ICK A; 1KFD A; 2K4H A; 3T5L A; 2WTF A; 4MFF A; 3BQ0 A; 4NLC A; 3HIL A; 1QLN A; 1MN8 A; 2QKQ A; 2HHU A; 2V4R A; 2YMM A; 3K4G A; 2QB0 B; 1UQV A; 5KG1 A; 2JEJ A; 1X2I A; 4F2S A; 3V6H A; 4MF2 A; 2OWO A; 3HX0 A; 4ED2 A; 2HHT A; 1BGX T; 9ICW A; 3C21 A; 5KAF U; 4EX7 A; 4RPZ A; 3TAC B; 4O5E A; 4E0D A; 4XUS A; 2LI6 A; 5J2H A; 4YP3 A; 4O3R A; 2AGO A; 5EOZ A; 2BPF A; 2ZXH A; 1LV5 A; 1Q46 A; 2BQR A; 4FE3 A; 1JIH A; 1D8B A; 1XSN A; 1CEZ A; 5J2G A; 1T7P A; 9ICF A; 3BZC A; 3ZI4 A; 2GH1 A; 5AI4 A; 9ICE A; 4QZC A; 4M6W B; 3ZDD A; 1HUO A; 2HSZ A; 3Q8P B; 2GOL A; 4J9K A; 2C2E A; 3T3F A; 3LK9 A; 3PMN A; 1KFS A; 3UMG A; 2G09 A; 4DOC A; 2BHN A; 4OJP A; 4DL2 A; 3Q8K A; 3RR8 A; 2LHT A; 1VDV A; 1XSP A; 5FP0 A; 1HEK A; 2KV2 A; 3H4D A; 1X6J A; 4MF8 A; 2PFQ A; 4RNM A; 3EYZ A; 1JRO A; 3A0B U; 7ICM A; 4AP9 A; 8ICI A; 4C7Z A; 4JV1 A; 3MGI A; 3I76 A; 3D2N A; 1L6N A; 4TQR A; 5G5G A; 1L7P A; 4BXO B; 5J0W A; 4USA A; 2HHX A; 3BQ2 A; 3QUQ A; 3RJI A; 8ICQ A; 3RF9 A; 3LWL A; 4Y2P A; 4PHE A; 2RDI A; 3RB3 A; 2JH1 A; 2WF7 A; 1IV8 A; 5J2E A; 4UAY A; 4J03 A; 1FEZ A; 3T5K A; 1ZQT A; 2ZUC A; 1S10 A; 3DEE A; 4IS7 A; 4EEN A; 2I5H A; 5KFC A; 3EPG A; 4R8U B; 2H3Z A; 1WCL A; 1DOQ A; 4KLI A; 5ALG A; 1XO1 A; 3GIK A; 2MRL A; 4HAI A; 2KNJ A; 1L3S A; 1QQ5 A; 2ZJA A; 8ICN A; 4BGD A; 4QZI A; 4Y2J A; 7ICP A; 5A0L A; 5JUM A; 4FBU A; 5JTI A; 2A1J B; 1RZT A; 4C80 A; 1UA1 A; 3RJJ A; 1URJ A; 7ICR A; 2HHV A; 5J29 A; 5J0X A; 2F3N A; 1A77 A; 3AQE A; 4QW9 A; 5KG4 A; 2B21 A; 4ED8 A; 4PZO A; 1AQ6 A; 5ALQ A; 3EUB 2; 4KLF A; 3F5A A; 3BQ1 A; 3T79 A; 3BJY A; 9ICU A; 3AN1 A; 3LVW A; 5ALE A; 4YD2 A; 4GFJ A; 8ICK A; 2BR0 A; 2LM4 A; 3Q8L A; 1N2X A; 5DG9 A; 5AK3 A; 3SZ2 A; 3NGD A; 5DB6 A; 4PL2 A; 2J6S A; 5KFS A; 3Q8R B; 4X5V A; 3OHB A; 2XID A; 4M9G A; 2EAO A; 4CRX A; 4DQI A; 4J9N A; 2ZIV A; 5D4B A; 4RPX A; 1S0M A; 1V85 A; 2K8C B; 3WK9 A; 4PZN A; 5KFJ A; 1A0P A; 3WKE A; 4C0Z A; 1TAU A; 4HYK A; 3NTU A; 8ICH A; 2W9C B; 3M8S A; 1Q3V A; 1OXJ A; 2VAN A; 2JEI A; 1A76 A; 5AIC A; 1UT5 A; 3MC1 A; 3O0F A; 5KT3 A; 1YT3 A; 5J2K A; 4YMO A; 5KFR A; 1ZQJ A; 4GXI A; 4RQ5 A; 3K1R B; 3M6Z A; 2WB1 C; 3C29 A; 3QEB Z; 2ESE A; 3MR5 A; 1ED1 A; 3RRH A; 3G6X A; 3HRD D; 2OYY A; 4ECY A; 3T5H A; 1B22 A; 1RM6 C; 4DLE A; 3MR6 A; 2E1F A; 3I28 A; 2R8I A; 4NLN A; 5KFX A; 3ISC A; 4RQ7 A; 8ICF A; 5J0Q A; 4QW8 A; 2FDR A; 3TQ1 A; 4QZ9 A; 3C2K A; 2XCP A; 1X9S A; 5D49 A; 5HML A; 1BPZ A; 5CWR A; 4EYH B; 3C1Y A; 3C2M A; 1QH9 A; 3RB4 A; 3SEN A; 4F5P A; 4QZ8 A; 2I9G A; 2P6U A; 5KFU A; 2H5X A; 3M9O B; 2PFP A; 5KFD A; 1TKD A; 3KTQ A; 5J8Y A; 4Z6E A; 5F9N A; 3FDS A; 1Z3E B; 5KT4 A; 2EAM A; 3Q8M A; 3UPQ A; 5KFT A; 5AKL A; 1PK1 A; 3QU5 A; 5L1M A; 3OHA A; 2E8M A; 3D6J A; 1JX4 A; 3F2D A; 1NK5 A; 4B9U A; 4UB6 U; 3ETR A; 2ZG6 A; 5AI9 A; 1MQ2 A; 1SGG A; 1S97 A; 2YY6 A; 4C8M A; 2VIX A; 4K4I A; 4F8R A; 1S0V A; 2W8L A; 3RFA A; 2EDU A; 4FFD A; 2W9B A; 4EBC A; 5ALT A; 5J2A A; 4EBE A; 4UQG A; 4IRC A; 1J2M A; 3PO4 A; 1BPY A; 2KSO B; 1S5L U; 3IP4 B; 2HHQ A; 5EWF A; 2YN4 A; 2PFO A; 3ZDC A; 4KLQ A; 3D2Q A; 1S77 D; 1L5U A; 1SXE A; 3RAQ A; 2PFN A; 5KFY A; 3BS7 A; 3OTQ A; 2FE9 A; 4OJ5 A; 4NLG A; 2HCF A; 3WK5 A; 2PKE A; 4IQW A; 1PUZ A; 3WKD A; 3MGH A; 2GO7 A; 1QQ6 A; 4KLT A; 1DK2 A; 5CRX A; 2JR5 A; 9ICQ A; 4DL6 A; 4A8E A; 5CR0 A; 8ICW A; 4GLX A; 3CRX A; 3WKC A; 3E58 A; 1RG6 A; 2K8B B; 4IR9 A; 8ICL A; 3N7P D; 3RJE A; 2ZXI A; 4I2I A; 4QZH A; 2CXY A; 1P7D A; 2KG5 A; 3GQC A; 5HP4 A; 4UAZ A; 4M2Y A; 4J9P A; 1D9F A; 4BWM A; 2F44 A; 4RU9 A; 1ZQI A; 2YML A; 3N97 B; 2FLL A; 4ICA A; 4F5R A; 5J8Y C; 5AI5 A; 4PPX A; 3RB6 A; 4F5Q A; 5AM4 A; 4KLJ A; 1J97 A; 5F9L A; 2W3R A; 2NRV A; 9ICC A; 4TUP A; 3ONN A; 5J0O A; 2ASL A; 3F2B A; 2W9A A; 3PW2 A; 4Q8E A; 1Z19 A; 4OJL A; 1BVS A; 4PGQ A; 2Y1J A; 2H3V A; 3AM9 A; 2DBY A; 2LYH A; 4PHA A; 5C5J A; 4NXZ A; 1T94 A; 3MGV A; 3AL0 B; 2HOQ A; 4NWI A; 2I6X A; 2G07 A; 1X9W A; 1U47 A; 1ZQL A; 5AHX A; 4WJ3 B; 1BNO A; 5KL1 B; 3WK8 A; 2JZB A; 4BUG A; 5DBB A; 5DQH A; 1V9P A; 4RQ1 A; 9ICK A; 5KG2 A; 4TUR A; 1WG8 A; 2AQ0 A; 5KFO A; 1LB2 B; 1ZQP A; 3KBB A; 9ICR A; 3B9J A; 3V72 A; 3N4M B; 2DFL A; 1L8O A; 4Y2Y A; 2Y1I A; 1ZQD A; 1PK3 A; 1QSY A; 1XNS A; 3GV7 B; 1NK0 A; 4RNO A; 3KD3 A; 5AI0 A; 5KG6 A; 5IIO A; 3NVW A; 2DF4 B; 4EYI B; 4CGZ A; 4Q43 A; 1U45 A; 1U9L A; 3SAF A; 5DB8 A; 4DQS A; 3IRU A; 2AGQ A; 2E3T A; 4UW9 A; 3THV A; 4ZH4 A; 3LDA A; 3SEI A; 4RZR A; 4K4G A; 1SXD A; 1PVP A; 4IQV A; 8ICA A; 2KJ9 A; 3H8S A; 2P6R A; 7ICU A; 5J0T A; 7ICQ A; 4NL9 A; 3VCB A; 4C7Y A; 2IMW P; 3H4B A; 4KMO B; 2W11 A; 9ICL A; 4M0A A; 2NO4 A; 4PH5 A; 3EPI A; 1ZET A; 2DGZ A; 2VJ4 A; 7ICG A; 3UQ0 A; 4F93 B; 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2BZF A; 8ICJ A; 3TAR A; 5KT5 A; 4I28 A; 2FI1 A; 1D8L A; 5KFB A; 4YCX A; 4P0Q A; 4I2G A; 2KFN A; 2HBJ A; 4Y2S A; 1LKY A; 3C23 A; 3F5E A; 4QZA A; 4F4X A; 3AMZ A; 5KG7 A; 2IOH A; 1J2N A; 2KE7 A; 5DBA A; 5ALS A; 1XWL A; 3SQI A; 4ELT A; 4B9N A; 4DSL A; 4PGX A; 3PSP A; 4ED1 A; 2JMG A; 2KKV A; 2QB0 A; 2YQE A; 5AKE A; 1IIP A; 3GU3 A; 1ZD4 A; 7ICE A; 2KVC A; 3EWA A; 5GTH U; 4B6J A; 1VLB A; 1KBU A; 8ICC A; 2XC9 A; 4J9S A; 1ZRN A; 4JWM A; 4NM2 A; 4Y2Q A; 4Q8F A; 2YX8 A; 4TQS A; 3QX7 A; 2BCV A; 4DFK A; 5D46 A; 4OD0 A; 2K8A A; 2IOF K; 4TUS A; 3IG5 A; 2XO7 A; 1L3V A; 5HR6 A; 2R8G A; 2YMQ A; 3WK7 A; 3B0X A; 4R66 A; 4XQ8 A; 5J0Y A; 2Y0S C; 3HKZ C; 3ZD8 A; 5ALR A; 5CHG A; 1RPL A; 4M6W A; 2WF9 A; 1QSS A; 4PJ0 U; 5ALM A; 3SD7 A; 4O3S A; 1N56 A; 2C2R A; 9ICP A; 3CYM A; 5DB7 A; 2O6K A; 2W7O A; 3MDA A; 8ICB A; 2FPL A; 4I2H A; 1KFT A; 4JUZ A; 3MR2 A; 2Y0S F; 3HKZ F; 4DL3 A; 2OHF A; 1MA7 A; 8ICX A; 3NAS A; 2OCE A; 3L3F X; 4NJ8 A; 3WU2 U; 4BXO A; 3JPQ A; 4BX9 C; 4QZF A; 4OJ6 A; 4KLO A; 3GIL A; 3QU7 A; 3Q8Q B; 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