2Z0IA

Crystal structure of 5-aminolevulinic acid dehydratase (alad) from mus musculus
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
323
structure length
283
Chain Sequence
VLHSGYFHPLLRSWQTAASTVSASNLIYPIFVTDVPDDVQPIASLPGVARYGVNQLEEMLRPLVEAGLRCVLIFGVPSREDSPTIEAVRLLRKTFPSLLVACDVCLLSEESRQRLAEVALAYAKAGCQVVAPSDMMDGRVEAIKAALLKHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQYQLPPGARGLALRAVARDIQEGADMLMVKPGLPYLDMVREVKDKHPELPLAVYQVSGEFAMLWHGAQAGAFDLRTAVLETMTAFRRAGADIIITYFAPQLLKWLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Delta-aminolevulinic acid dehydratase
publication title Crystal Structure of 5-aminolevulinic acid dehydratase (ALAD) from Mus musculus
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 283
sequence length 323
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2007-05-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2z0iA00
3Q58A 4FNUA 4Y96A 3UWYA 1XUUA 5C5YA 3QMRA 3GKAA 1ZAHA 4ICNA 4FNPA 4IUOA 5BOOA 4AHQA 1F2JA 1KTNA 2ZRZA 3B0PA 1OFRA 2QAPA 4GUGA 1R2SA 1DQXA 4Y8FA 4ZVJA 4O1BA 1ZY9A 3TROA 4JTGA 1OFBA 4E2DA 2P10A 1KFJA 1ZNNA 4H6KA 1Q6LA 3IIZA 4OT7A 3DFNA 3TAOA 2NV2A 3HOJA 4RXGA 4UNLA 3NZRA 3TSMA 3ELFA 5FEZA 4PL1A 2H8ZA 3LHYA 1FQ0A 1I2PA 3W72A 1NEYA 2NUXA 2CZEA 1WBHA 2WKJA 1TQJA 1KM0A 3RF9A 3G0SA 2A5HA 2EHHA 3GIYA 3GDMA 1FDJA 4AF0B 2O7SA 4QM1A 3NM3A 1B9BA 4NJJA 3QW4B 4UMBA 1VH7A 4HNTA 1XBYA 3CWNA 5F4XA 3G1FA 3PC0A 4QAIA 4ZQMA 2E09A 1JJKA 2ISSA 3MI6A 4BI5A 3HG5A 4RXFA 4JR5A 2Z2UA 1OX4B 2VFIA 4I9AA 2VFEA 3C61A 4MY1A 4RLIA 1KFLA 1EWDA 3S6DA 5I3IA 1QNVA 1FWNA 4GUFA 1H7WA 3MYOA 1V5XA 4EF8A 5CSSA 4OV9A 3NPUA 1I2QA 1OYBA 1QFEA 4NU7A 4WY0B 4ZQOA 1IGSA 4UFMA 3HB9A 3UY7A 5EPDA 3NOEA 4UTTA 2J9ZA 1ML1A 5D2TA 3O05A 4UR7A 4JTIA 3GNNA 5HJLA 2JKPA 3STFA 1TJRA 4PTNA 5F2MA 2ZRXA 3PAJA 1QDSA 4A3UA 2B4GA 3DKLA 5G4EA 1QOQA 2QCNA 3O8AA 4KWVA 5MHBA 2NUYA 4QIUA 4MZYA 1LZOA 3HF3A 1GYLA 2RH9A 5D30A 5DLCA 4A22A 3M9YA 2A0NA 3UZJA 3C2OA 2Y7FA 2ZFAA 2V30A 2G96A 2VKZG 2E6DA 1SO6A 3ZFHA 4IWWA 1WOBA 1PHQA 1HL2A 1DHPA 1H7PA 4Y90A 2ZRUA 1TPB1 1L6YA 1N7KA 3W2KA 3HG2A 4S2CA 3TFXA 3QYQA 5F4SA 4O16A 3OVQA 3E12A 3W7MA 1YPFA 4RZ5A 5F1VA 1YDOA 3D0CA 3QQ0A 3DAQA 2Y63A 1DJQA 3MHFA 2CLLA 5CZJA 5AN7A 1JUEA 3GXPA 5CZTA 4LC6A 1I2NA 1VJIA 3PB0A 3C52A 3NL2A 1QOPA 4N9DA 1QWGA 5CG7A 5TBOA 4LV9A 3M41A 3W1UA 4IMEA 1GTHA 3LXAA 3WFAA 1ADOA 4O11A 1G69A 4JY8A 1M7OA 3OEXA 2A6NA 3CWOX 2HS8A 2X1SA 2I1OA 2GVGA 5KITA 4AMAA 1XUZA 2A6LA 2OCZA 1HUVA 1VC4A 4GUHA 5HUOA 4BK9A 2R91A 4PC8A 3TE9A 4X9SA 1Y0EA 5D38A 3W1MA 1RZMA 5K3VA 2A1YA 4XQ6A 5AC8A 4FNSA 5HQEA 2E1DA 1QCWA 3WJSA 4AAJA 5EMUA 1I8JA 3TXZA 1GYNA 4JGDA 3W6YA 4A2SA 5F2GA 1YXCA 1H5YA 5DCEA 1TO3A 4X3ZA 4LVAA 3W2LA 3B03A 2RFGA 4FF7A 1THFD 3DKJA 4BF9A 2V9DA 1GVQA 4BWLC 4UTHA 2PC4A 3IVSA 1ZCOA 2Y7DA 3BVJA 3DI0A 4QITA 3DGRA 3LI0A 4UTJA 3NA8A 2F84A 3MHGA 3OIXA 5C6MA 3F1QA 3EX2A 4H3DA 4ZZ9A 3P82A 5BRBA 4GC4A 3FYPA 3GDLA 3LV6A 4BI7A 1AK5A 4PCFA 4DELA 4IMFA 1L2UA 1XC4A 4WY0F 2O7QA 3G8RA 3M16A 3P7YA 2V2HA 5D2XA 1UASA 4ZMGA 3LRKA 3U8GA 5DBTA 1F5ZA 3Q94A 3C2RA 1EPXA 3DFQA 4W9TA 4RX0A 1LM1A 4FX8A 3M7WA 3B04A 4LW7A 5HR6A 1I4NA 3MBDA 2Y62A 3TAKA 5HINA 1JUBA 5L9FA 1WQ5A 2FPVA 3W7JA 1P4CA 3DU0A 3LXBA 5KSWA 2NUWA 4TIMA 4A21A 5ABTA 1O60A 5CKSA 3LHZA 1VQTA 3W1TA 3TFCA 2JKEA 1C29A 3EWZA 1LOQA 3HGOA 1P5BA 1G7VA 3LTPA 3TIMA 4DF2A 3NNTA 3SI9A 5IBXA 5FEWA 1KBJA 2W6RA 1VYRA 2ZZ4A 4JX4A 4PFMA 1Q6RA 5DXYA 3DHFA 1T96A 1EEPA 3NQGA 3MHUA 4ONVA 3BO9A 5DBUA 3IEBA 2AQWA 3VI2A 3MO7A 3HGRA 1QAPA 2RDUA 3KFTA 4Y9AA 5D37A 3WK0A 3B4UA 4LS1A 2EPHA 1TQXA 3RMJA 3A23A 4LOCA 3GDTA 4K8HA 3M5VA 1UUMA 3W2MA 5AC6A 3S1WA 4HNVA 3W70A 3U2OA 2JKAA 3G1DA 2G97A 4U4MA 4X22A 3FJ6A 5CPMA 3TXVA 3LRLA 1RD5A 2EF9A 4O54A 2OX1A 3ABOA 4K38A 1W37A 5BNKA 5AOUA 1EP2A 1PS9A 1SW3A 3TK7A 3WJXA 1BTMA 2VELA 4XKYB 1VS1A 3LHTA 3HGJA 4O4WA 3TX9A 3LM7A 3CQ0A 2QCDA 4JIPA 2E68A 4IQLA 1MZHA 1IIHA 1OHLA 2ISVA 1KFKA 3G1HA 2ZCGA 5F4WA 3FLUA 3BGJA 4LNYA 3O16A 3IIPA 1R30A 1H1ZA 3O1NA 3WJZA 1UUOA 1FWSA 2W79A 4BFAA 4QQ3A 1GVOA 4NZJA 1WV2A 5H2ZA 4JEQA 1Q3NA 2DZXA 1H60A 4IXHA 3G8EA 1UJPA 3W71A 4UTWA 2PRMA 3C2EA 1FXQA 4NX5A 4ADSA 1GVSA 2ZA3A 3QF0A 3ANYA 2QKFA 2Y89A 4JTFA 1P0KA 3JS3A 2B7NA 2CLIA 4YWIA 4HKPA 3W75A 3E9AA 3FOKA 1N8FA 1X8FA 1FWTA 3QC3A 1PCWA 4EIVA 2H3BA 1H50A 3C8FA 2FPTA 4OQVA 2P0OA 1TPVA 1PIIA 2ABBA 3M43A 3O6CA 2ZZ6A 3Q2DA 4U28A 5EA9A 4ADTA 3R2GA 3S5ZA 3B0UX 1OK6A 2RDTA 3S42A 1C8VA 3NAVA 3N34A 4JXCA 3PSWA 1KA9F 3ATYA 3LOTA 1GT8A 3G1YA 3M5ZA 1ICQA 3P84A 4O53A 4BI6A 1LLWA 2AGKA 1YPIA 5H91A 3FJLA 1PV8A 1LOLA 1FY6A 4O4VA 2ZZ1A 2GPTA 3MP4A 3G3MA 1YADA 2FB2A 1B3OA 3DENA 1H62A 4MLJA 4MFEA 1WA3A 3EWWA 1N55A 3LLFA 4Q32A 5J5DA 3KRZA 3PSVA 1W5PA 4JDYA 2Z6JA 1LCOA 4UXDA 4L4LA 3W7GA 1O5XA 4ORMA 4LS2A 1F7BA 3CPRA 3CEPA 4NZFA 1JR1A 4FEZA 3C2VA 8TIMA 4JY9A 5HWNA 2E77A 2QJIA 3TQKA 5D2YA 2QJHA 3F4WA 5BMWA 4YCOA 3NQAA 3WK3A 1H7NA 1KFEA 4JNMA 1JRBA 5D03A 1Q6OA 3HJZA 3KVMA 3PM6A 1UB3A 3KVLA 4K6AA 5A8GA 3NPXA 1XBZA 4CNPA 2WQPA 1UBSA 3W2JA 1CX9A 1OX5A 3W73A 1ICSA 4MJZA 3O15A 1TPWA 1IXOA 3NXFA 4S2BA 2E5CA 3EWXA 3UWWA 1TRIA 2CLEA 3BPWA 5HNRA 3NM1A 2A21A 2FLIA 5C54A 4WZHA 3C0JA 4LV4A 5KZDA 2YX0A 3GAYA 2E6AA 3C56A 1FWWA 1O94A 1L6SA 3TSBA 3W1XA 3W7NA 1VGAA 3QPYA 3W1LA 3M47A 4POCA 1OYAA 3KHJA 4TMBA 2DU2A 1GJPA 4AF0A 1YXYA 3NPVA 1WXJA 5TQLA 4PL2A 1OFPA 3RLVA 4UFHA 2PRLA 1OX4A 1RQEA 3TR2A 5D09A 1LRNA 1JCMP 4MKNA 2I9EA 4JX5A 3NQMA 3TW6A 1FXPA 1B57A 4NJKA 5FF4A 5I3JA 4HPJA 1TTPA 3NPWA 4WY0A 2DZTA 1YXDA 2OT1A 3GYEA 4DBDA 2VENA 2NXGA 2WSRA 1U5JA 3TMQA 1KV5A 4LVBA 1KM4A 2FDSA 1OF8A 3L21A 3MJYA 4DBEA 1SW0A 3PR2A 5G1YA 2YPIA 1LOSA 3MWAA 5HMSA 1SSGA 2QJGA 1B4KA 4EF9A 4JYDA 3UPWA 4QISA 1H7RA 3HG3A 5G2IA 1G6CA 3EWBX 1SZEA 1W3NA 1FUYA 1OYCA 4K7YA 2BLEA 3I7SA 4E2BA 3KRSA 4OGZA 4UFKA 3O6DA 1QMLA 2JGYA 4MJMA 3TNOA 1D3GA 3HPZA 3INPA 2BWGA 2ZA2A 3G0UA 4O28A 1LP6A 4GUJA 3R89A 4OV4A 2D73A 3SECA 5KZEA 2CLMA 4HHPA 4PA8A 1TPC1 3W83A 1TPEA 2WSQA 4QNWA 3SW6A 1ZFJA 3EXTA 4O19A 1I45A 4HIBA 5DELA 3HQ1A 3M6YA 1GTEA 4E38A 1S5VA 1XXXA 2CLOA 2OJPA 2XN1A 4DQWA 1JQVA 3EX3A 1SO3A 2X30A 4WD0A 1FWRA 5LNUA 2CLFA 2IQTA 2DZUA 3M44A 4TMCA 4ORIA 3DXIA 2A85A 5K4ZA 3FS2A 4Z0JA 2BX7A 2P1FA 5J5RA 1FDZA 3KOFA 5LHFA 3CHVA 4BWLA 5C55A 1LBLA 3IIOA 3DHDA 2J9XA 1KW1A 4FNTA 4MOZA 5AB3A 1SSDA 1AMKA 4DO6A 3UY8A 3W84A 3W7PA 4RK8A 3SSJA 3S5YA 3N2MA 4MUZA 3W76A 2CU0A 2Y61A 4AVFA 1R47A 1OFEA 4UCGA 3Q37A 1VPXA 4IMDA 5G4WA 4RJEA 2V0TA 1EP1A 3TV8A 4IMCA 2QCGA 3W7RA 4O17A 4MYXA 1Z44A 1J4EA 1BWKA 2YFNA 2VFFA 1G4TA 1HG3A 3IV3A 2GQAA 1K7FA 1KM5A 3NQ8A 5G2WA 4D2JA 3S1XA 4B5NA 1O4UA 3OG3A 4Z1BA 1SPQA 2Y7GA 3G1SA 3TQVA 3EWYA 1IIGA 1QPRA 3W2NA 2ZTKA 3QQ1A 1K3UA 3W88A 3IGUA 1GVFA 3UXAA 4LRSA 1I2RA 4UTMA 3O07A 4Q33A 3LLDA 3IIVA 2EAWA 1R2TA 3T4CA 3G1VA 1NSJA 3HIJA 3L65A 3DFOA 4GUIA 3A9IA 1EB3A 4JTSA 4HSNA 2QCLA 1SO5A 1JQXA 1RPXA 3N9RA 4FB7A 2XN0A 3SY5A 3W1RA 2EKCA 3SJ3A 2XN2A 1S5WA 4JX6A 1WYIA 3SIZA 2Q8ZA 4YLWA 3MI3A 1RQBA 5A5WA 4NUWA 5AYXA 1FCQA 5DY3A 3G1XA 2Q3RA 3M5YA 2G5WA 2RHGA 3PVFA 1ICPA 1NF7A 3SFKA 4HPXA 1E51A 2H3DA 3GDKA 5FI8A 5DCBA 1TV7A 4N02A 4QJ1A 3NQFA 3O06A 5FESA 3GXTA 1XBVA 3HO8A 3NQDA 3NQCA 4QSHA 3H53A 3LV5A 2CZDA 3GR7A 1NAL1 3HBLA 4UNKA 3MW7A 1PE1A 4IPIA 4K8EA 4XUGA 2C18A 3T40A 4UTKA 4OBTA 3EWUA 3E0IA 1JUKA 5AFDA 5K7JA 1H1YA 4AWUA 2DJXA 3QSTA 3VE9A 1TTJA 4NXKA 4RR4A 1ONRA 3RNDA 2J27A 3ZWTA 3GX9A 1QO5A 3EKZA 2Z1BA 4XTDA 2GOUA 4R53A 2J9YA 1KM1A 7TIMA 4FXSA 5LGXA 3NQEA 3W7OA 4JYEA 4MVAA 4JTKA 2C14A 4WJEA 3SR7A 5EYWA 3BLIA 4LT9A 3UNDA 1XM3A 1H7OA 1A5CA 3HMJG 4JYFA 1YDNA 2QF7A 1TPUA 1OABA 1F6PA 1SZFA 4CCDA 1GWJA 4FX7A 5G1TA 1DBTA 2GQ9A 1SFJA 5F2IA 5I3GA 2GJLA 3LDVA 2VEMA 4JTHA 2CWNA 4OWGA 4LVFA 3JR2A 4E0CA 5D05A 3R5EA 1AW2A 4LVGA 3BARA 2QCMA 1TIMA 3G18A 3BG9A 4WX2A 4Z1DA 3W3OA 5K9XA 4KWWA 6ALDA 2QCCA 3IGSA 3NYZA 2E5DA 3NQ7A 1TPH1 4XKYA 1J2WA 4JD4A 1SUXA 1ZAIA 4Z1CA 5LKYA 4GRSA 1DORA 5LNWA 3W7HA 3QZEA 1IXPA 1KTBA 1WOAA 4RCXA 3HPXA 5U4NA 3UZ5A 5EY5A 1GG1A 1QPQA 4WXZA 3F4NA 2C1HA 1SU5A 3TJXA 3EEGA 4XBSA 2FJKA 1O95A 2UV8G 3P67A 1L9WA 1M7PA 1OK4A 2CZ5A 4O10A 4R7JA 4X2RA 4EWND 3W1PA 3KAOA 4GNJA 4AEOA 3RU6A 3TSDA 3BGGA 2XFWA 5FEPA 4AHOA 2C13A 2H8XA 3O63A 2OZ0A 3LB0A 2C0AA 3W2UA 1A50A 3HG4A 1TYGA 4CCEA 1TV8A 2DORA 1RVGA 3W7IA 1SW7A 1VYPX 2Z6IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3S2M A;  3Q58 A;  3CQK A;  3L23 A;  1NJJ A;  4OZO A;  1B3W A;  3EA3 A;  4AHQ A;  1F2J A;  3ZLF A;  3EPO A;  2ZRZ A;  3WQF A;  3B0P A;  2RAG A;  5T8G A;  2QAP A;  1R2S A;  2HNH A;  3TRO A;  5DT5 A;  4JTG A;  1OFB A;  2Z1W A;  2AKM A;  4Q6J A;  1MDR A;  1Q6L A;  3IIZ A;  4OT7 A;  3DFN A;  3TAO A;  4GKL A;  3TTS A;  1UD8 A;  1JDD A;  2H8Z A;  3LHY A;  3T05 A;  8CGT A;  4KEV A;  3W72 A;  1NEY A;  5BCA A;  3ITY A;  4LXF A;  1ITX A;  1KM0 A;  1IZK A;  2C91 A;  2PMQ A;  3EZ4 A;  1HP5 A;  1V6T A;  3SDO A;  3GDM A;  2O7S A;  3A4W A;  1B9B A;  1TWS A;  4GH3 A;  3SAZ A;  4HNT A;  1XBY A;  3CWN A;  3TEV A;  5F4X A;  3SCP A;  2P88 A;  3WD1 A;  5AYI A;  4LY4 A;  3HG5 A;  4RXF A;  1OX4 B;  2VFE A;  3PWI A;  1W3J A;  1V0K A;  3S6D A;  3SRF A;  2DGA A;  1H7W A;  3MYO A;  2PD9 A;  4NU7 A;  3ITT A;  1B9Z A;  1DE6 A;  4H19 A;  4QGC A;  3NOE A;  3QOM A;  4GIS A;  3T9P A;  2J9Z A;  4S23 A;  3MKC A;  4LX4 A;  4QLL A;  2JKP A;  3WBX A;  1TJR A;  4F0H A;  1FOB A;  4PRT A;  3WUF A;  5EFD A;  5IDZ A;  2G3F A;  1LUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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