2Z1BA

Crystal structure of 5-aminolevulinic acid dehydratase (alad) from mus musculs
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
326
structure length
290
Chain Sequence
HQSVLHSGYFHPLLRSWQTAASTVSASNLIYPIFVTDVPDDVQPIASLPGVARYGVNQLEEMLRPLVEAGLRCVLIFGVPSRDSEDSPTIEAVRLLRKTFPSLLVACDVCLCPLSEESRQRLAEVALAYAKAGCQVVAPSDMMDGRVEAIKAALLKHGLGNRVSVMSYSAKFASCFYGPFRDAAQYQLPPGARGLALRAVARDIQEGADMLMVKPGLPYLDMVREVKDKHPELPLAVYQVSGEFAMLWHGAQAGAFDLRTAVLETMTAFRRAGADIIITYFAPQLLKWLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Delta-aminolevulinic acid dehydratase
publication title Crystal Structure of 5-aminolevulinic acid dehydratase (ALAD) from Mus musculs
rcsb
source organism Mus musculus
total genus 73
structure length 290
sequence length 326
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2007-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2z1bA00
3M44A 3LGEA 3VCRA 1ICQA 5AOUA 3NO5A 2QCMA 3GKAA 3I7QA 1BWKA 3QH2A 1A50A 4GUJA 2V0TA 3S1VA 5LGZA 2V8ZA 1A5BA 3TMQA 3Q2DA 3QMTA 2YYTA 5E1QA 1WQ5A 3O8AA 2RDTA 4NZFA 4DPPA 4MVAA 4AF0A 3W7DA 5AC8A 3C0JA 4LVAA 4FNRA 3C2FA 3GYEA 3MMTA 4YMZA 2ZZ7A 2I9EA 2VENA 2YFNA 3L0NA 4DF1A 3PR2A 1GVFA 2ZTJA 2QR6A 5K4XA 4NNBA 3S1XA 3HG3A 3M9YA 1X7FA 1OG0A 3IGUA 1QO5A 3IGSA 5AYYA 3W71A 3PBVA 4M19A 1U83A 3EXTA 4GE8A 3NVTA 1AG1O 3BPWA 4A21A 1FDYA 4NT0A 2OZ0A 4Z0JA 3DFNA 1EP1A 1HO4A 1I2QA 1UB3A 5HR6A 3G8RA 1VPXA 1GOXA 3W1LA 5BRBA 1ZY9A 3GZ3A 3T78A 3S8HA 1VC4A 5E0KA 4RV8A 3W7KA 2H8ZA 3N34A 4EVZA 3QQ1A 3LBCA 2CZEA 1F5ZA 4MUZA 3W3OA 4ADTA 3LOTA 3N19B 4KFPA 2GQ8A 1Q6OA 1AL8A 3PBYA 2QCLA 3NXFA 3EX4A 4JD4A 3W1MA 5AN7A 1O95A 3G1AA 2J9YA 4N4QA 3HPSA 1JQXA 1JCJA 3LV5A 2TYSA 1FWWA 1EUNA 2XFWA 4ONVA 4EWND 4NUWA 3T4CA 1GG1A 3DFSA 2TPSA 5LHEA 3TAOA 3I68A 2DZXA 1F2JA 1GEQA 1W3IA 3GDTA 1KLYA 3BLEA 4O8RA 2CLMA 3BW2A 2ZZ1A 5FF7A 4A3UA 1C9DA 3NPWA 1WBJA 4PA8A 4UFJA 2Y88A 3PG9A 2WSRA 3W7IA 4NJHA 3IIXA 3LB0A 2VFEA 4HN4A 4WXZA 3EX3A 1VHCA 1S5TA 3ZS4A 1OX5A 2Z2UA 3LCHA 1QR7A 1Z42A 2R8WA 2ZRUA 3NQ6A 3W2LA 3VNDA 1DQXA 3INPA 4JTLA 1QPOA 1GVQA 1S3HA 4N9EA 2YR1A 2WNNA 1R30A 3H55A 5LNRA 2QJHA 4OT7A 2JGQA 3LTSA 3B4UA 4MY1A 1DOSA 3W1NA 3TDFA 5H2ZA 3ABSA 1I2PA 3A5FA 4AAJA 4H3DA 1JULA 4IUOA 5F1VA 1TPB1 4JS3A 3V75A 5D2WA 1YDNA 1R2SA 1KM1A 3CWOX 2JKAA 1C29A 3P5YA 4IMCA 1MEHA 3ABRA 2H8XA 3NQGA 1MSSA 1FX6A 3FEMA 4UTLA 3NQDA 1L9WA 3NG3A 4WD0A 4YXGA 5D05A 1YPIA 4A22A 1HG3A 3L0KA 3S5OA 3MI6A 4IX2A 4X3ZA 3O07A 4MIMA 1VCGA 4MZYA 1H1YA 1IXOA 3F4NA 1H62A 3SECA 2J9ZA 3RFAA 2A2IA 1GVOA 2YW3A 3LCXA 1QDSA 2FTPA 2J9XA 3M5ZA 4LV4A 1KV5A 5HUOA 4BWLA 3TFCA 3DFQA 3NPXA 2J24A 1I2OA 4WQ6A 2QF7A 5HQEA 1B57A 2DZUA 4S1FA 3S1UA 3HG5A 1FCQA 1XUUA 4O0ZA 3G1VA 4JTJA 3H54A 1SW3A 3LBMA 3GAYA 4Y6GA 3KHJA 1G7UA 4QISA 1VLWA 3O6CA 4PTNA 1OFAA 4UXDA 4GNJA 2NWRA 4ZQMA 1JRBA 2A7PA 5HULA 4O57A 1FBAA 2P0OA 2QUTA 4IMDA 4NNCA 4NJIA 1Y0EA 1TPFA 3G18A 1AK5A 3ABQA 2BZNA 4PCFA 1K8XA 1BEUA 4LS1A 5D33A 3FKRA 4JX5A 4M6PA 3GK0A 6ALDA 3IVUA 1ADOA 5EMUA 2QCCA 1NF0A 3SW6A 1UCWA 5CKSA 3C56A 2HS6A 3TXZA 1ZAHA 5F2LA 5FF0A 1L6YA 1KFEA 3LHZA 2B7OA 2E5DA 1ALDA 1OJXA 1RR2A 4CLMA 3LTPA 3S6DA 5HUPA 4ZL1A 3G24A 4O14A 1FCUA 4MOZA 3QPYA 1KM5A 1S5VA 4CQ9A 5SWUA 4GUIA 1ZALA 3G1XA 3KRSA 5KTLA 4BI5A 1I45A 1LRNA 2VEMA 1H7XA 2I1OA 1Q6LA 1LORA 5EYWA 3BLIA 1OK6A 2W6RA 1GQNA 1H60A 3EWUA 3G0UA 1WOBA 4IJBA 1JJKA 4JICA 5DELA 4NVTA 1W3TA 2ATMA 4JY9A 2W0UA 3CEPA 3E12A 3P84A 1NAL1 1VS1A 1I8JA 1ZNNA 1DV7A 3CLMA 3SGUA 3FIGA 3G0XA 4AWSA 1JCMP 1Q6RA 4MLRA 1J5TA 4DO4A 1H7OA 1W31A 4UCGA 4FXRA 3GDRA 4YWIA 3IIPA 4JTFA 4GFSA 1XC4A 2FFCA 3W86A 5BOOA 1EA0A 3DXIA 4UC5A 2VFHA 3D0CA 3WK2A 3ZWSA 1DQWA 1KFCA 3FFSA 1X8FA 3E02A 5TQLA 4P61A 1VYRA 3FLUA 5KZEA 1VRDA 1XDLA 3A23A 4XZ9A 4QIUA 3DI0A 3HIJA 5KZMA 1KW1A 3FJ6A 1T99A 2CLFA 1FXQA 3S9YA 3WJYA 1EIXA 5F2MA 4OU1A 2ABBA 1LRQA 3MBFA 1PV8A 1SQ7A 3W6YA 3BG9A 1G4PA 3LM7A 1O94A 3NEVA 4O50A 3I7RA 2FDSA 3LHTA 3UY8A 1ZENA 2ZTKA 3M5YA 5T26A 2ISSA 4XBKA 3UWQA 3USBA 3IEBA 4K37A 3TU9A 1F76A 4N2YA 3UWZA 4NJKA 3OG3A 4UFIA 2VFDA 1LZOA 2A7RA 3DBPA 4LC8A 5CGQA 2G5WA 3WK0A 4XBSA 3TK7A 3IIZA 3GR8A 2B7QA 1XBYA 5AHNA 2A21A 3F4WA 3C61A 5DLCA 4OV4A 3N3MA 4LVGA 1SR9A 3TV8A 3CM4A 4XTDA 1N8FA 2WO5A 4FNPA 1F05A 5LNSA 3G8EA 1SZGA 3W72A 2O7SA 3L66A 5AFDA 1TPC1 4OV9A 4LC6A 2FJKA 1H7PA 4TO8A 1SUXA 4UTJA 3CTLA 4NU7A 1NSJA 1X1OA 5FF2A 2VFGA 3PULA 5K9XA 2EKCA 1VH7A 4FIQA 3PUDA 3RNDA 2YZRA 2ZDRA 4FIRA 3OVPA 4Z1BA 2DZTA 1OFQA 1H63A 1LLZA 4JTHA 3EX2A 1TRDA 1H1ZA 2C1HA 4H6KA 2RHGA 4R34A 3W74A 1A5SA 3KAOA 2TSYA 1BWLA 3NQAA 2V2DA 4GRSA 4M7SA 1GYNA 3WJWA 2ZA3A 3LHVA 4R33A 2FPVA 5EKYA 5G1YA 1VJIA 3ELFA 4YLWA 4TU1A 3OVQA 3W1RA 3UWYA 3MP4A 2VOMA 2J88A 3NQEA 2YGYA 4A2SA 2CLIA 3DENA 7TIMA 4E2DA 1OK4A 2WSQA 2Y7DA 2VEIA 3UPWA 1W5PA 3SGZA 1OX4A 5I3JA 4FB7A 1SO3A 1CX9A 3LLDA 1LLWA 4UTWA 3W2KA 1G4EA 2FLIA 4GUFA 3QMRA 2QKFA 4JN6A 1QOPA 2Q3OA 3NQ8A 1LOQA 4DQWA 5BNKA 2H3BA 3NM3A 4DBEA 1VYSX 1JQVA 3OIXA 1QCWA 2NUYA 3UWVA 5AC7A 2GVGA 1T8XA 3LRKA 2JK2A 3GX9A 3P8JA 2Q3RA 1FY6A 3UWUA 1BTMA 3R8RA 5GVJA 3BARA 1AL7A 3A24A 3MJYA 1KTBA 5DCBA 3TR2A 2AGKA 5AHIA 3QEZA 2QUUA 2QJIA 5EL1A 1UJPA 5EPDA 2BWGA 3BVJA 4RXGA 3UNDA 5L6UA 1HL2A 3W2UA 4LVFA 2CLHA 2ZFAA 3TJXA 2EF9A 3C6CA 1EWDA 2OMAA 2GJNA 5LNUA 1O4UA 4JIQA 1QPNA 1PHWA 1SFLA 2YFOA 4IOTA 3P82A 5G4EA 3GR7A 1RD5A 1M7OA 4KKXA 4K36A 1FUYA 4O4VA 4OWGA 2H6RA 4B5NA 3LHWA 3SR7A 1K8ZA 2Y7EA 4ZQPA 3LXAA 2Z0IA 1TB3A 3TX9A 1I4NA 3H53A 4O1CA 1W8SA 1GVRA 1O5XA 3O06A 4UTMA 4IMEA 4C1LA 4QSHA 2QJGA 5ABTA 3LRMA 3W1PA 1XM3A 4TMCA 4LOCA 1GYLA 2R91A 4Y96A 2J6XA 1G4SA 1SO5A 4I7WA 3CC1A 3LCGA 4LUJA 2F84A 2PCQA 4JTKA 4E2BA 1UUMA 3IRDA 1KM0A 3NL5A 1HFBA 4JTTA 3ZFHA 1MEWA 1DHPA 3NOEA 2DP3A 3AJXA 3HOJA 2OJPA 3LCWA 3ZWTA 2C18A 3C3NA 1ZAIA 5C5YA 3E0IA 3W07A 5L9FA 4UNKA 2O7QA 1KFJA 1KM3A 1XBZA 3WFAA 1H7WA 3MYOA 5J5RA 4UTIA 2PRLA 1QPRA 3NZ1A 1YADA 3ABOA 5U7SA 1XFBA 1C8VA 1XXXA 5D32A 4U4MA 3KRUA 5CZTA 1AW5A 1XCFA 1PVNA 1SZEA 5KITA 5I3KA 1TO3A 2ZQ0A 3M16A 2CWNA 4ML9A 2E77A 3SI9A 2A4AA 3W1QA 4Z08A 2WNZA 4FNSA 1DVJA 2OT1A 2WV8A 3HG4A 1LYXA 3S42A 2WNQA 1FDZA 3NPUA 4UR7A 3RLVA 1LOSA 5FF4A 4CCCA 1D3HA 3B0UX 3W2MA 3M6YA 1FWSA 3PG8A 5K2ZA 1OX6A 1NF7A 3UXAA 1W5QA 1G7VA 3MO7A 3DI1A 5AHMA 4A2RA 2ZBTA 3KVKA 1L6WA 2V82A 4LS2A 3L0GA 1SW7A 4MLJA 1TJPA 3UY7A 2NLIA 3C2EA 3N73A 4XTIA 1VCVA 1K3UA 4IX0A 5CZSA 4BWLC 4HHPA 4M6QA 3UZJA 1ME7A 2ZA2A 3CPRA 5EBUA 2DJXA 1KFBA 1EEPA 1RQEA 3TNOA 1OFBA 2E6DA 3DHDA 4RK8A 5DXXA 2ZRYA 4XUGA 2ZA1A 5A5WA 5HWNA 4O16A 1DBTA 4NXSA 3W7RA 1D9EA 3UQNA 4O18A 1PCWA 5D2XA 1K8YA 1N55A 3UPBA 3QF0A 1E51A 5F4XA 2VEPA 3W9ZA 4UFMA 3W7PA 4IXXA 1MO0A 3YPIA 2JGYA 5LZLA 1UBSA 3NPVA 2ALDA 1I2NA 5G4WA 1W54A 4XWUA 1SZFA 4BI7A 3P8IA 1TTIA 4AWUA 2CLLA 3C2VA 3G1FA 3C2RA 5LNWA 2ATSA 3LXCA 4IXHA 5D37A 5G2HA 4ZQRA 3W85A 1RPXA 1H7NA 4FX7A 2YW4A 3PS7A 4PL2A 1TPDA 1T0OA 1YLVA 3THAA 1PS9A 4UUIA 1KV8A 2QDHA 4UFKA 3EWWA 2C3ZA 3DFPA 4PL1A 1CI1A 3P81A 4Y90A 1W56A 1LCOA 5LNVA 5BW6A 2V2CA 3NQFA 1G4TA 3NM1A 3BW3A 4QJ1A 1V7YA 1SO6A 3BLFA 4Q32A 1BKSA 1X6UA 2V5LA 3O6YX 1B4EA 3IIVA 1IGSA 5J5DA 4UFLA 4O0KA 3W75A 3T55A 1OYAA 3T40A 3EB2A 2V81A 1I2RA 1QAPA 3PSVA 2ZZ2A 1FWTA 3NGJA 4X22A 3GDLA 1VQTA 4O54A 2RFGA 1SFJA 5CZ0A 5AHLA 2A1YA 5IBXA 1TTJA 3G1YA 3R89A 4WJEA 3VI2A 3MYPA 2DZSA 1IIHA 2GUUA 3HGSA 3JR2A 1FQ0A 2NWSA 4IQLA 4MPQA 3U6WA 4RZ6A 3SIZA 3DH7A 1RZMA 5CPNA 3P60A 4WX2A 3B0PA 3HGOA 4NQ1A 3DKJA 3G0SA 3IVTA 4LS0A 5I3HA 4LNYA 3V1PA 4DPQA 2Y61A 3VE7A 5DN1A 3KVLA 3M5VA 4FXSA 3LDVA 3LRLA 4JNMA 1EB3A 2PE4A 4JDBA 4NXKA 2BX7A 4YCOA 3DFTA 3O16A 3GKFA 2CZDA 2E1DA 1Q6QA 1DORA 2R14A 5G5IA 4BK9A 6TIMA 1XL9A 4UTTC 3CT7A 3PC0A 1XDMA 4MY8A 5K4ZA 4I9AA 1WXJA 3PY2A 2ZRWA 4GC4A 3P61A 5BMWA 5K9CA 1YDOA 4L4MA 2X1UA 3L5AA 3A22A 4TMBA 1V5XA 3BO9A 1ZFJA 3TH6A 1OFRA 4HNNA 3CU2A 1W5NA 4O53A 4K8EA 1GTEA 4Z1CA 1W5OA 2VC6A 2YCEA 1TREA 2ZZ6A 3NR0A 3QSRA 4JX4A 1VHNA 3HQ1A 3TQ0A 1B9BA 5F4WA 4JX6A 4FO4A 3C4UA 2E6FA 2TRSA 3GB6A 3STGA 3BGJA 5EA9A 4ZQCA 3TQKA 4NZJA 5DY2A 3VKJA 4N02A 3TSBA 5G2WA 4JYDA 1TTPA 1JR1A 2C16A 3P62A 3UWWA 3E96A 2G97A 2IQTA 1KTNA 2C6QA 3LHYA 1LOLA 1F6PA 4O17A 2E68A 4LTSA 4NX0A 1UUOA 2A5HA 4Y9AA 1KM4A 1YPFA 2Z1BA 4QITA 3MP3A 1M6JA 3GIYA 4ZMGA 3O63A 4IMFA 4OGZA 5C55A 3TKFA 1KA9F 1QMLA 4QM1A 4C1KA 4N9CA 4RZ5A 4R53A 1NVMA 4LW7A 4MYAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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