2Z2SB

Crystal structure of rhodobacter sphaeroides sige in complex with the anti-sigma chrr
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
193
structure length
182
Chain Sequence
TIRHHVSDALLTAYAAGTLSEAFSLVVATHLSLCDECRARAGALDAVGGSLMEETAPVALSEGSLASVMAQLDRDPRAPAPLADYVGRRLEDVRWRTLGGGVRQAILPTGGEAIARLLWIPGGQAVPDHGHRGLELTLVLQGAFRDETDRFGAGDIEIADQELEHTPVAERGLDCICLAATD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords RpoE, ECF SigE
publication title A conserved structural module regulates transcriptional responses to diverse stress signals in bacteria.
pubmed doi rcsb
source organism Rhodobacter sphaeroides
total genus 40
structure length 182
sequence length 193
chains with identical sequence D, F, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-05-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF12973 Cupin_7 ChrR Cupin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.1320 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 2z2sB01
2.60.120.10 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2z2sB02
3PNAA 2PA7A 5KHJA 3U11A 1H1MA 4Q0PA 5LRSA 4HSLA 4QMAA 1ZRDA 5KHIA 3RZZA 4KL1A 2PHLA 2UYAA 4NQWB 2KXLA 5JAXA 1O4TA 4XFIA 2O8QA 4OFGA 1O7FA 4XFCA 3H9AA 4YSFA 1IPKA 3RNSA 2GC2A 3S0MA 4MGYE 4ZU7A 4MGZE 3I54A 4JTNA 1CAWA 2ZCWA 3CLPA 4PIYA 2CGPA 2FMYA 4L11A 3M3IA 1SQ4A 3FFQA 3WW3A 1CAUA 3CO2A 4R52A 1YHFA 1RTVA 1Q5OA 4I3PA 2D40A 1O3RA 1I5ZA 3D0JA 2PFWA 2VQAA 2B5HA 1OMIA 4Q29A 4IEPA 2GC1A 3EO6A 4META 4FAHA 3QACA 1J3QA 1VR3A 1ZZBA 2XLGA 2HJIA 2I45A 4HN1A 2BEOA 3G7DA 3OD0A 3LZZA 4N9IA 2H0VA 1ZVFA 1RC6A 3E97A 1NE6A 2ETEA 2FQPA 1CX4A 3RYKA 4AVAA 3IWZA 4LULA 4ONUA 1ZZ7A 3IBMA 3CEWA 2D5HA 3LA2A 4QM9A 2GZWA 1J3RA 3ES4A 3SCFA 1UIKA 4QM8A 3E6CC 1GQHA 4PJYA 4XFGA 4LA3A 2BNOA 3NSTA 4LLOA 1O3SA 2XL9A 2PAKA 3CJXA 4KWJA 1CAVB 2UY9A 2IXJA 2OZJA 4YARA 4JV4A 3MDPA 3L2HA 2PAMA 1YFXA 2MNGA 2GAUA 5I0TA 3NVCA 1WLTA 2UYBA 2BGCA 2IC1A 1JUHA 2IXLA 3BCWA 5KHGA 3I59B 2BYVE 1DGWA 3B02A 1RUOA 5I0UA 2MHFA 3E6DA 4D7TA 4XF3A 4Q0QA 4X6QB 4AVCA 5BPXA 3WW1A 3DKWA 1Q3EA 1NYWA 1RUNA 4IEVA 4Q0UA 4WVZA 4XF9A 1Q43A 2CAUA 5I0SA 2Z2SB 3E5QA 4AQ6A 2CAVA 4JTOA 4LEJA 2OPKA 2WFPA 4OLLA 5I93A 4GULA 3HUGB 4XF4A 1NE4A 1ZZ6A 3ACLA 1OFNA 4MZUA 5BY5A 3BALA 4HVRA 4FBFA 1EPZA 3EHKA 4FT8A 3H1WA 4HVOA 1QXRA 1Y9QA 3GBFA 2IXCA 2XHKA 4I09A 1IPJA 2ATFA 5LRRA 1XE8A 4IETA 1NXMA 3SCHA 4F7ZA 5LEKA 4YYOA 3M70A 5FLJA 4DINB 3IIAA 1XE7A 1X8MA 4O9EA 1VP6A 4I2OA 3FWEA 2OYZA 4Q0SA 4YNIA 4Q0VA 1ZX5A 3EBRA 3D0SA 5BV6A 5AVPA 3EJKA 3I7DA 1J59A 4QGMA 2HKXA 1UCXA 4LUKA 2O1QA 3LWCA 3IDCB 1RGSA 5CADA 4QGLA 5FQ0B 4BIFA 3MYXA 4IEXA 5BXXA 4EWDA 4EROA 3BPZA 3BU7A 4QXKA 3DV8A 4Z82A 4EV0A 1LB2A 1SFNA 5FPXA 3UKTA 2B9UA 1CAXB 4ZU4A 2IXIA 4MX3A 1FT9A 3SMHA 1YFUA 4O9GA 2H6BA 4N9HA 1ZREA 4E2SA 3D82A 4IEZA 3SCGA 1QY4A 3DN7A 3H1MA 4HLTA 1FI2A 5T3NA 4IEUA 4K8FA 1WGPA 2PQQA 4XF1A 3PLQA 3S7EA 3N4MA 4UBGA 3CF6E 1PMIA 3H7JA 2EVXA 4H7LA 2V09A 1H1IA 1QXJA 3NKTA 3MZHA 4JVAA 5I0RA 5C8WA 3NL1A 3ZDSA 4MUVA 4J1WA 2K9ZA 3KSCA 2XKPA 3OF1A 1ZZ9A 1L3JA 1LR5A 4IEWA 4PIZA 2BNNA 3TNQA 4MGKE 2WC2A 4IEQA 4E2GA 3ST7A 3HQXA 2XLAA 4NVPA 2Z69A 2QNKA 4Z07A 3LA3A 5I8TA 1CAWB 2VPVA 5KHHA 2IXHA 2QJVA 5CVRA 3UKNA 1CAUB 4J1XA 4IERA 4HVQA 1EP0A 2H6CA 4LA2A 3RDIA 3OCPA 2PAEA 5EFUA 5JR7B 3ELNA 1RL3A 3HIFA 2XGXA 1UW8A 1J58A 3KMHA 2MPFA 1I6XA 5F1RA 2ET1A 4XF0A 2QCSB 4AQ2A 2BNMA 2Q4SA 3ETQA 3H8UA 1J1LA 1PM7A 3RYPA 3C3VA 3S7IA 5I91A 1O3QA 3E5UA 4BHPA 4LUMA 2DCTA 2GC0A 4KWLA 2QDRA 4KWKA 4WZCA 1XRUA 2B8MA 5E1RA 3H3ZA 2D93A 2EAAA 3JZVA 4BYYA 3IDBB 3PVBB 4HBNA 4IESA 4MGIE 4XFFA 1DZRA 5I8SA 3OGJA 1X7NA 1O5UA 3VHRA 2F4PA 3CL1A 1Y3TA 5FDBA 3H50A 2CV6A 2XL7A 1EYBA 4YRDA 1CGPA 4EWAA 1DZTA 1YFWA 5BUVA 4CYDA 1OI6A 1G6NA 2IXKA 4XFHA 3RPQA 4IEYA 4BH9A 4E2QA 3HT1A 1CAVA 1ZRFA 3BB6A 4L2NA 1ZZ8A 1YWKA 1ZNPA 1SEFA 4I01A 5J3UA 1TQ5A 5FLIA 3SXWA 2K0GA 3O14A 4X6RB 1J3PA 4F8AA 1V70A 5LEJA 3I59A 1DGRA 3OTFA 5FCCA 3SHRA 5K8SA 4IEOA 5C6CA 2C0ZA 2Q1ZB 4I0AA 4I02A 3R6SA 4QX5A 1FXZA 1X8EA 4AVBA 2GH2A 4ORFA 2Y0OA 4HZFA 1YUDA 4P9GA 3FJSA 1LRHA 3LAGA 4MV2A 4RD7A 2GC3A 1YLLA 1OD5A 3KGZA 3TNPB 2XKOA 4MH0E 4R8HA 4WBBA 5J48A 3NJZA 3DL3A 3WW2A 5KBFA 1O5LA 2E9QA 1UPIA 4HN0A 4UXAA 5CU1A 1VJ2A 3NW4A 5E16A 1U12A 1X82A 5JSRA 1NZCA 3USSA 2OA2A 1UIJA 2VECA 4PIXA 4XETA 2QVSB 3FHIB 5EZWA 2OZ6A 1QWRA 4EWEA 1EY2A 5JCTA 1HW5A 5JSPA 3LA7A 1LKNA 4LTAA 1GQGA 3FE5A 4KU7A 3LOIA 1WA4A 3KCCA 3FZ3A 3GYDA 5HI0A 5FPZA 2ZKLA 1YFYA 4QGNA 3WW4A 4FAGA 2PYTA 3U0ZA 4UBHA 3FX3A 3UKVA 4KU8A 3H3UA 4XFAA 5D1IA 4I0BA 2EA7A 5FLHA 4HSJA 1ZRRA 3H7YA 4HMZA 5FQ0A 2Q0AA 3KGLA 3H1YA 3ES1A 3HT2A 4ZU5A 2PTMA 5I8YA 4B29A 1CAXA 2GU9A 2P17A 1UD1A 5J7MA 3U10A 4AXOA 1O3TA 4A2UA 2PHDA 3EQEA 1ZZCA 4D7SA 2ET7A 4XEZA 2UY8A 4XFBA 4TLFA 5KHKA 2Q30A 3QOPA 2N7GA 1ZRCA 3RYRA 3E6BA 2D5FA 2XLFA 3MPBA 3ROUA 3E5XA 5JSOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OIIA 2DTYA 3CCYA 4IE4A 3MCZA 1IGNA 4CP9A 3U4XA 2R16A 2E63A 5JMOA 5F6LB 2GA1A 1PGL1 1JKPC 3KM5A 2YB7A 3TP0A 4CSWA 1U5TC 4IZZA 5HS9A 1W6OA 3V8LA 3LFKA 5D8LB 4NIGA 1SQ4A 3CCVI 3WEZA 5GPCA 1HQNA 4KA4A 5CBLA 4QPGB 3PMEA 1H6YA 2AR6A 1VQ8I 3JRGA 2E1MC 1IUFA 2P0WA 4A0XA 4JHZA 1GP6A 1W0NA 1L0OC 5L19A 1RUC3 3LDRA 2XB5A 1V5FA 5CG8A 2CRGA 1I1EA 3VBFB 2VC0A 2RREA 1VMHA 5EYXA 1UFMA 3LAPA 4QM9A 1QU3A 3CZUA 1BK0A 3SEQA 3CBNA 3MZYA 4XFGA 3G2BA 3RPUD 2W47A 2HQRA 4V1PA 2GNDA 4S05A 4Q4X2 5J1XA 2JG9B 3HN3A 3IAS2 1J84A 4U36A 3S15J 1W9SA 5I0TA 3DU5A 2ARBA 2IJLA 4YVSC 1PYVA 3EDPA 5HODA 4YELA 1PUEE 1M4WA 2A3YA 2ZJQF 4IV3A 1G9BA 2P4EA 2Y48A 3FXLA 4ZY9A 2KRHA 3VDDB 3AKQA 4M6XA 3VSLA 2Q8CA 4Y15A 3H1CA 3P9KA 3KEYA 2WWUA 5LZ6A 2OPKA 1UOFA 4FQZA 5KXDA 1ITYA 2BDRA 3F8FA 4EEFG 1NE4A 4IL6C 4KDPA 2GBYA 3VKNA 4XICA 3BTAA 3KV4A 1FTTA 3WD5A 2H1KA 3BTYA 2XGDA 2FXAA 1U5ZA 5FLXK 1E3PA 4S04A 3GXOA 1F5JA 1XGSA 2LBFA 1XE8A 4IETA 1NXMA 5DG1A 4RQPA 5JXGA 4AYUA 2QZ2A 3IKTA 2G7UA 1EH7A 4XLFA 1LU2A 2FMDA 3ZRGA 4Q0VA 3DXTA 4NPRA 2M3AA 1S2BA 3X29B 2Y6KA 3T3YA 4SLIA 4QGMA 1R083 5IYYA 1TP4A 2WFF1 4FXKB 3LWCA 5EZGA 2W7NA 1BEV1 2LMDA 1K4SA 1XB4A 1QGPA 1D0GA 4EV0A 1I50J 1NX9A 5T52A 2QVOA 4P5HA 2AUYA 1IKPA 4EQQA 4CEWC 2RS52 5CFCA 4QX3A 1WQ2A 3WU0A 2F6CA 1MZBA 1O4YA 5H9PA 2WN3A 3SH3A 4N53A 4D0QA 1CR7A 2KD7A 3VBUB 3VD4A 2FOWA 3QODA 1MJ9A 4XBFA 1YFHA 3K48A 1GWKA 1F15A 5E18F 1X36A 3VBSA 5ACA1 1X9PA 1KU9A 2A73B 2XPJA 2ORXA 2VJ4A 3G3ZA 1VQOI 4MGKE 2YGLA 5BNGA 2WWYA 3DTIA 4P9YA 2E33A 4UT5A 5A2QZ 2VPVA 2NVUB 1SD4A 4NQWA 3G1MA 5CVRA 4ZYHA 4NWWA 1ZQ3P 1UYZA 1XS9A 1HRV1 1V9U3 2E51A 2IS1A 4Q1PA 4BISA 5JZGB 4A5MA 2LTNA 3KMHA 3IKWA 2Y0IA 2Q5TA 1VBA3 3ETQA 3GFLA 3VYRB 4KGQA 4HBLA 1US2A 1ZBE3 4JGYB 3IZOA 4XLCA 2DO7A 1JTYA 2R7SA 1W6PA 5SV5A 1C8M3 4NUBA 3LL7A 4L9VA 3CZJA 3MUY1 4AFAA 2M7AA 4IUGA 1NCQA 5J98B 5IFTA 1VBD1 4LFUA 4XVHA 2P5KA 1WPKA 1EUUA 1D0ZA 3RSNA 4QX0A 4B3NA 3TAYA 3FZVA 2LALA 4YZ3A 3T4VA 5M3MJ 2EXIA 3PVOA 1DDLA 3BJAA 3BR3A 1TNSA 3L2WA 3LGRA 5J1YA 5DPNA 4KICA 4BK5A 3T30A 3S2WA 3ZGKA 4ENKA 3WQ0A 3SHRA 2A6ZA 5FXZA 2V79A 3WTVC 4XJ9A 5EHDA 1RUG3 3NWTA 4G6TB 3PJYA 4ORFA 1QXPA 1MZ6A 3W5NA 4RYDA 4D3WA 2DU1A 5CIRA 3G4SI 3UGHA 4V19K 4L5IA 2VULA 1H9PA 3TWIA 1AJOA 5E1XA 3ZYGA 2C5DA 4F91B 3WXPA 1V5EA 3R05A 4AQSA 5E89A 5J09A 1R64A 3PUFA 5JSRA 1NZCA 3K70C 3USSA 1OPMA 3J8F3 4NIIA 4B3XA 5T5PA 3BI3A 1RJ7A 2DQLA 3HJEA 2R7DA 5A3MA 4ZS3A 4TLGA 2LM3A 1LUJB 1YJWI 2QCOA 1LHNA 1ZM1A 3QPSA 2VZQA 1G59A 2F5VA 2ZEZA 5GPAA 5D1IA 4CDGA 1W6MA 2J5PA 2ZMKA 1LCLA 2NP0A 3ZMNA 4DXZA 1QJY3 1HBXG 2L9LA 2K27A 2W82A 1OPCA 1AOYA 1HRI1 1YXWA 1WMDA 4CDUC 3DGTA 4E27A 2VCBA 3IRQA 3CZ6A 1WRJA 3FHNA 1UWWA 4CA9A 2ZO4A 1AR93 3B01A 1PVEA 3FMRA 3LCPA 4XUQA 3A02A 1KFUL 1JUSA 3IAQA 4XFBA 3LDBA 5BNNC 2WAQA 1REPC 5KNLA 3OS2A 4IHSA 2VNVA 3FL7A 5F6KA 1ZYRF 3GBWA 3BR6A 2XGEA 3CESA 2CUFA 4GB31 1HLCA 5KHJA 1MJAA 1YQ6A 2V1UA 4GALA 3HHGA 5FO7B 4HL0A 4Z6YA 1ZRDA 4ESJA 2BXYA 1NUKA 1A5JA 4COZA 2XVLA 3VBOB 4BJ0A 1K7AA 3MEPA 4M3CF 1DQ1A 4EJTA 2CUEA 3WW3A 4M0HA 1YHFA 3SZTA 1Q5OA 4IW3A 2KR2A 2HLEA 1I5ZA 2JKXA 1E0EA 3EO6A 3NKGA 1MJBA 5M5XJ 5TSWA 5JR2A 1J3QA 1E5HA 2L7ZA 5D5UB 4XRSG 4N9IA 1ZVFA 1N1SA 4A0YA 3O0XA 1CX4A 2VMGA 1ASJ3 1R4NB 1ZZ7A 1HSTA 3X2QH 3JR9A 4W97A 5EGOB 2IVIB 1OFSA 1A6CA 2CHHA 2HWD3 2ZHLA 2J22A 2W91A 1BK1A 3WTXC 3BG5A 1FBQA 4LLOA 3ZXLA 3NQOA 1HXS3 3CMYA 3MDPA 1TMF1 2Y60A 3AKSA 1BC7C 4INDA 3SZGA 2A3SA 1FX5A 1VQ7I 2K5CA 3OYAA 3R0RA 4AU7A 4QSHA 2COBA 1WCUA 4BEHA 1O57A 4OQ8A 2ZMLA 5F5QA 5DAVA 4UF0A 1WMFA 3M07A 3VKMA 3WP3A 1RUNA 1NYWA 1JHFA 1CQ9A 1PIV1 5T55A 3MLLA 5IVVA 4OLLA 2OXBA 1STMA 5FKOA 1W6QA 1WCSA 4FPFA 3THCA 4UW6A 4BQ2A 4FBFA 2GIZA 1XN7A 5HXVA 2CL2A 5HV0A 5EIYB 5GLUA 1QRYA 1SAUA 1AYN3 4AI9A 5IJRA 2ATFA 4UUSB 3SCHA 2ZNYA 2J1AA 2VZ3A 3JREA 1TT5B 1BJZA 3QYBA 1RKTA 4G6DA 1QHDA 1R1A2 3WP5A 3O1PA 5GLTA 4CYCA 5AVPA 5IUQA 1UCXA 2JXAA 4UY8I 1UX6A 4BIFA 2RAEA 3PM1A 1CJDA 1TZOA 4G12A 4CXYA 1VALA 4B8XA 5LCWL 5FLMJ 1HDPA 4O65A 5IVEA 2VTFA 2E19A 2K02A 1PMHX 2W95A 3NARA 3W2AA 1SDWA 1T98A 2P81A 2CNAA 1WGPA 2HDDA 4XF1A 1XG1A 5IP9J 1MBFA 4MADA 3SHFA 1ENSA 2W84A 4YGCA 3S8PA 3ZM8A 2PI0A 1W8UA 2W52A 4K8RB 1SMVA 3GTJJ 2DFIA 1YI7A 2CGOA 2D3RA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3PNA A;  2PA7 A;  5KHJ A;  3U11 A;  1H1M A;  4Q0P A;  5LRS A;  4HSL A;  4QMA A;  1ZRD A;  5KHI A;  3RZZ A;  4KL1 A;  2PHL A;  2UYA A;  4NQW B;  2KXL A;  5JAX A;  1O4T A;  4XFI A;  2O8Q A;  4OFG A;  1O7F A;  4XFC A;  3H9A A;  4YSF A;  1IPK A;  3RNS A;  2GC2 A;  3S0M A;  4MGY E;  4ZU7 A;  4MGZ E;  3I54 A;  4JTN A;  1CAW A;  2ZCW A;  3CLP A;  4PIY A;  2CGP A;  2FMY A;  4L11 A;  3M3I A;  1SQ4 A;  3FFQ A;  3WW3 A;  1CAU A;  3CO2 A;  4R52 A;  1YHF A;  1RTV A;  1Q5O A;  4I3P A;  2D40 A;  1O3R A;  1I5Z A;  3D0J A;  2PFW A;  2VQA A;  2B5H A;  1OMI A;  4Q29 A;  4IEP A;  2GC1 A;  3EO6 A;  4MET A;  4FAH A;  3QAC A;  1J3Q A;  1VR3 A;  1ZZB A;  2XLG A;  2HJI A;  2I45 A;  4HN1 A;  2BEO A;  3G7D A;  3OD0 A;  3LZZ A;  4N9I A;  2H0V A;  1ZVF A;  1RC6 A;  3E97 A;  1NE6 A;  2ETE A;  2FQP A;  1CX4 A;  3RYK A;  4AVA A;  3IWZ A;  4LUL A;  4ONU A;  1ZZ7 A;  3IBM A;  3CEW A;  2D5H A;  3LA2 A;  4QM9 A;  2GZW A;  1J3R A;  3ES4 A;  3SCF A;  1UIK A;  4QM8 A;  3E6C C;  1GQH A;  4PJY A;  4XFG A;  4LA3 A;  2BNO A;  3NST A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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