2ZGZA

Parm with gmppnp
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
molecule keywords Plasmid segregation protein parM
publication title Molecular structure of the ParM polymer and the mechanism leading to its nucleotide-driven dynamic instability
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-01-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 2zgzA01
3UKRA 3C7NA 2IVOA 2IIRA 3BP8A 3WEEB 1NGJA 3H6EA 4XH5A 3LDNA 4WQ5C 4CZJA 2I7NA 3O1WA 4Z94A 5FPDA 2QWRA 2W41A 3QB0A 4H03B 2CH6A 2QM1A 5AZJA 4AM7A 3VERA 1HPMA 4FWKA 2QWMA 5AQWA 3HZ6A 1BDGA 2AP1A 1TUUA 1YAGA 3EL2A 4FSVA 1TYQA 2VCPA 5AQJA 1JCEA 4B1YB 4CJ7A 3VOVA 1QZ6A 3W3DA 4MLHA 4BRDA 4H0YB 3TU5A 2HOEA 3HTVA 4F9OA 1NBWA 3O08A 3P4IA 3D7EO 5AQYA 3H46O 1HX1A 3WUHA 2FF6A 2FLOA 4BC5A 3EO3A 1GLJO 4ISEA 4H5WA 1GLCG 2Q31A 5AZJB 5EX5A 3U9DA 2V7ZA 5KPZA 3VEXA 3UKUA 2HMPA 4A62A 2OANA 2Q36A 3FE1A 1HKCA 2A41A 4EHUA 1TYQB 4H5NA 2WUSA 1BOTO 3D2FB 2ASOA 2YCHA 1CZAN 2E8AA 1T6CA 5F1XA 5EXWA 5AQTA 1RGIA 2BTFA 1GLFO 2J4RA 3GBTA 4DHYA 4JNEA 3MN6A 4YDUC 2E1ZA 3WT0A 1KXPA 3WXJA 3ZETA 3QMLA 3LM9A 4L3QA 4WQ5A 3ZX2A 2P9LA 4BVPA 3R8EA 3WQUA 3CJCA 3UKUB 3CETA 4B1UB 4BC3A 4FWPA 2P9SB 4BRFA 5AFUA 4WYBA 1NGBA 1T6DA 1HJOA 2Q0RA 3HBTA 2DPNA 3H3OB 3CQXA 2QWOA 1NMDA 2ZGYA 1NGIA 2QWLA 3CJ1A 4QS8A 5CE3A 2P9IB 3VF4A 4CBUA 1SQKA 4BQLA 3RSEB 4BQZA 4XEIA 1X3MA 3ZETB 4EIAA 4IJNA 3AAPA 3VEWA 5BR9A 2P9LB 4FWOA 3FR0A 2E1YA 2ITMA 2CH5A 4A2AA 3TPQA 4IZ9A 2FSJA 5AQHA 2YJEA 1XUPO 3WXKA 2QXLA 4HTLA 1RFQA 3EN9A 3ENOA 4K41A 5KQ8A 2P9NA 3SMSA 3IDHA 4KBOA 5AQFA 3WXIA 4NB4A 4H0VB 4MLEA 4H5VA 4JD2A 4AM6A 1C0GA 1ZXOA 5AQRA 4XH1A 1U2VA 1NGHA 2D0PA 3KVGA 3I8BA 3H45C 4ISGA 4B9QA 3DAWA 2BUPA 3W0LA 1MWKA 4GY2B 4B1XB 5BRFA 1MWMA 3H1QA 4BRIA 2W40A 1GLAG 2HF4A 4JAXA 2P9PA 2ZWHA 4FO0A 5ELZA 5AZIB 3FZKA 4I6MA 2E2QA 5EVZA 3CJ9A 4FWMA 2QWPA 3I33A 1QQNA 4QS7A 1NGFA 3FGUA 1NM1A 2P9NB 3QFUA 2VYPA 2UYTA 4A61A 1XQSC 3BEXA 1V4TA 5AQIA 3H1VX 4JD2B 1Z6RA 1U2VB 3CERA 3C7NB 1NGDA 2VWBA 3O80A 3UKRB 4BR0A 5BRHA 3B8AX 2E2OA 3SJHA 1K8KA 1BWFO 3O4WA 5EY4A 4B1VA 3DJCA 1DEJA 4H0OA 4BGBA 4CZHA 3O1BA 2P9PB 4BR5A 5JLHA 2A6AA 1BA1A 4BRCA 4FL9A 3CJAA 4FWLA 4FOEA 3WQTA 4RWTA 3A5LC 1NGGA 4EFHA 3ATVA 3UB5A 1BG3A 3FZLA 1QQOA 1BO5O 4B1WB 1SAZA 3VGLA 1HLUA 4ISFA 2F9WA 4H5RA 4DB3A 4M63C 4O8KA 2Q0UA 5AQLA 4BREA 1K8KB 3GOIA 1LOTB 2E2PA 3D2EA 4O5FA 1X3NA 1D4XA 2F9TA 1KAZA 1S3XA 5TKYA 3C0BA 2V52B 5LJWA 4CZMA 3CHWA 3VEZA 5BPMA 3MMVA 1ZBSA 2CGJA 1NGCA 2A42A 3GG4A 2E88A 2GWJA 3O8MA 3L4IA 1S22A 4IWVA 1MA9B 4BRKA 2IVPA 4FWQA 5AQGA 4BR2A 5BN8A 4JHDA 4IO8A 1NLVA 4CD1A 5FPMA 4PKIA 4BC2A 5ADXH 4RTFD 5JMVA 3VEVA 4CZFA 5AQUA 1JCGA 5AQOA 4EHTA 1V4SA 3EKSA 2CGKA 3JS6A 3J8AA 4QS9A 3GL1A 3SK3A 3S41A 4H5TA 3EKUA 5JICA 3FFKB 3G25A 4BRGA 4CD3A 3AY9A 3M3ZA 1QZ5A 1RDWX 2E20A 4H0XB 4C23A 3A5NC 2KHOA 2GELA 4CZKA 1QQMA 3AAQA 4PKGA 4RCHA 4CZGA 5FPNA 3IMXA 4XH4A 1ATNA 1C0FA 1E4FT 3ATUA 3VEYA 2P9UA 4J8FA 5AQPA 3DXMA 3L0QA 3O6WA 4JHDB 4Y0WA 5LJVA 4M7YA 2ASMA 3U4LA 5E84A 5KPTA 2PBDA 3O5BA 3MN7A 1DKGD 1GLLO 4FPAA 3VGMA 1MDUB 3R6MA 1GLDG 5LY3A 2ZGZA 2GUPA 2NZTA 4B1ZA 4BRPA 5JLFA 2YHXA 2EWSA 4BRLA 3MK6A 4H0PA 5AQVA 5AQZA 1KAXA 1YVNA 4BG9A 2QWNA 5E26A 5BRDA 1P8ZA 4YDUA 4GNIA 3VF2A 5EOYA 5KPRA 3CJBA 2P9UB 3QDKA 3DXMB 4CZEA 5I9EB 2YI1A 2ASPA 3VENA 3OHRA 3QFPA 4BC4A 4FWSA 4FWRA 3HSCA 4JN4A 4BRAA 2NLXA 2HF3A 3QBXA 1X9JA 4MO5A 4K25A 3FLCO 3VF6A 2A3ZA 1Q18A 3H3NO 2AA4A 1WUAA 3LDOA 3MN5A 5BPNA 2Q97A 1TUYA 3A5OC 1NGEA 2A5XA 4HWIA 1R59O 1GLEG 2NRHA 3BF3A 4BRMA 2PAVA 1ESVA 3CIPA 3VESA 3ZX0A 3FZFA 4FWNA 3ZX3A 3QBWA 5AR0A 1DGKN 3IFRA 2Q2RA 4I6MB 2FXUA 5AQQA 3MDQA 1JCFA 3D2FA 3GE1A 4BR4A 1EQYA 3IUCA 4WQ4C 4EAHD 3A0IX 1HKBA 3F9MA 4CI6A 1J6ZA 2P9KA 1IJJA 3ID8A 1XC3A 2YHWA 3FZMA 4MO4A 1BU6O 1ATSA 2ZF5O 3MN9A 4IJAA 5BN9A 5AQMA 1NWKA 1HKGA 5F0XA 2D4WA 4LC9B 3ENHA 1BA0A 2I7PA 2Q1NA 5FPEA 3QICA 5BREA 4PL8A 3LL3A 1U6ZA 3CJ7A 1G99A 2V51B 2A40A 2P9SA 2YHYA 5AQKA 3ULEA 1YXQA 3R9PA 2YJFA 3LDLA 2D0OA 3LDQA 2QWQA 1QHAA 1ZC6A 4PL7A 3A8YA 2P9KB 1ATRA 5BPLA 1HUXA 1NGAA 3HI0A 1LCUA 2P9IA 3ZEUA 3U9ZA 4BVOA 4CBWA 1Z05A 2FSNA 1E4GT 3DXKA 3RSEA 4E1JA 5AFUH 3SMPA 5AQNA 5ADXA 5F2RA 3D2EB 3JXUA 5KQDA 3BF1A 3GDQA 3U8XA 4BG8A 4K43A 3UE5A 3KHYA 3L6QA 3CQYA 3VEOA 3ULEB 5AQSA 1WOQA 2E2NA 3MCPA 1OKJA 2V7YA 2FSKA 5AQXA 4A2BA 4BR9A 2GWKA 4CZIA 3ZEUB 3M6GA 2QW9A 1KAYA 4FPBA 3FZHA 3VGKA 4BROA 3EZWA 2H3GX 4WQ4A 3AARA 1Y64A 3A5MC 4BRHA 3DXKB 3KZBA 4M7XA 4PKHA 3LM2A 4CZLA 3WEEA 3M1FA 2GTDA 2FF3B 4DQ8A 3LDPA 4BR7A 1GLBG 1YUWA 5B8HA 4K42A 1BUPA 3DWLA 5AZIA 3HM8A 1T44A 3CI5A 2CGLA 3BUZB 4CBXA 2IVNA 4FOIA 4IXCA 1SZ2A 4DCHA 2D1KA 4NO7A 3WXLA 4BGAA 3SLCA 4BRQA 1H1VA 1IG8A 2GEMA 4BRNA 4H0TB 3VPZA 3VETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3O3FA 4NYNA 4CHPA 3U6FA 2NRRA 4WQ5C 3O1WA 1CZ9A 1HQUA 4Z94A 5FPDA 3J81O 4JS5A 1A5XA 1QQCA 1ZBHA 5J2MA 1RT3A 3VN5A 3AVGA 3MX5A 5AZJA 4DKWA 3DLEA 3VERA 3KLFA 5AQWA 4OJRA 3EL2A 4FSVA 3CFRA 3OYKA 1TYQA 2VCPA 5AQJA 1JCEA 4O0JA 4I2QA 4BRDA 3TU5A 4JI8K 3WXMB 2HOEA 4FXDA 4LFBK 3AVBA 3K2PA 3O9QA 1NBWA 1T8EA 5AQYA 2QK9A 2FLOA 3MXMA 4AH9A 1RT5A 4HHTA 3TAEA 5GINA 2ZD1A 1NG9A 1HNIA 3V9WA 1SV5A 1RDAA 3PSFA 4JKCA 1U4BA 3DLRA 3CFOA 3RMDA 3DMJA 1VK0A 2YCHA 2DTUA 1T6CA 1I94K 5DM7L 2BTFA 3KKRA 2VQEK 5HL7L 4DHYA 3QO9A 4YDUC 5M1NA 3V9XA 5HP1A 1KXPA 3WXJA 4U67L 4NLBA 4X64K 3OA9A 3UKUB 4B1UB 2P5OA 4KH6A 1KFDA 2IAJA 1HJOA 1N6QA 3IKMA 3CQXA 1R0AA 1NMDA 4CJFA 3AO4A 2YNFA 2QWLA 1W0HA 1P90A 4IFVA 4KTZA 5KI6A 1UA1A 3LPTA 1SQKA 4FZYA 4FJJA 2HVIA 3RSEB 1W9HA 4BQZA 2OA8A 3IAYA 4KHQA 1X3MA 3HPHA 4FJMA 2IC3A 3VEWA 4BE1A 4B9UA 2OPRA 1KVAA 4FWOA 1KC8O 2E1YA 4JKDA 2ITMA 4CK3A 4FJGA 2XY6A 2CH5A 1C1BA 2FSJA 4GVMA 3AVMA 1XUPO 3WXKA 1VSMA 1KVBA 3EN9A 4BE0A 4K41A 1L3UA 2P9NA 3SMSA 4FK4A 1WLJA 3HK2A 4JI0K 4DF4A 3P83D 4H5VA 5CY4A 3QIOA 4FCYA 5AQRA 1U2VA 4GV6A 1B9DA 3KVGA 4B3TK 1YITN 5FRMA 3AGRA 2O8EB 1LWFA 3H1QA 1GLAG 2HF4A 2KW4A 4FO0A 3V9ZA 4GW6A 1BQNA 1C6VA 4YOUA 3NH0A 2XY5A 1BIZA 1GOCA 4FM1A 4I6MA 1OVYA 4FWMA 2QWPA 3VQPA 1NM1A 3C65A 4E1NA 2WONA 1IG9A 3UKRB 1TV6A 3C7NB 1NGDA 3G4SN 2E2OA 2ZQBA 5EY4A 3DLKA 5DK5A 4H0OA 3DM2A 5CR4A 4R79A 3SNNA 2P9PB 3QIPA 4JK8A 5JLHA 3SUOA 2A6AA 3HP6A 1BA1A 1A5WA 1T3VA 3WQTA 4RWTA 3QERA 4EFHA 1NGGA 3UB5A 3HP9A 3OYCA 1QQOA 2HHTA 4KI4A 4CEFA 2ZJPL 4ISFA 2BE2A 4DB3A 5J2QA 4B8AB 5AQLA 4RW8A 4IG3A 1YJWN 3DI6A 4M3XA 4IOCL 4O4GA 4O5FA 1RBVA 3KLGA 2F9TA 4CHNA 1S3XA 3S9HA 1WAJA 1S9EA 4KREA 3MEEA 4JLHA 3O9UA 5LJWA 3VEZA 1VHXA 3PLAA 1HMVA 3MMVA 2Q3SA 4K8XA 3T69A 2D5RA 3O8MA 3THWB 4CCHA 1N5YA 2IVPA 3TARA 2YV0X 1VSDA 4IO8A 1NLVA 4LF4K 5ADXH 4BC2A 3TAMA 2Y1JA 3L3UA 5KRTA 3VEVA 5FLXO 2DFHA 3NF9A 3EKSA 2CGKA 4E7LA 3J8AA 4QS9A 2KTQA 3EKUA 3FFKB 1FW6A 3AY9A 4CHZA 3JYTA 2WC9A 1RILA 3A5NC 2GELA 1VSLA 3TSPA 3HVRA 4NXNK 4FJ5A 4CJ3A 3O9TA 3ATUA 3VEYA 1VSJA 3M8RA 3AO1A 1VQ8N 5M1OA 3CCVN 3QEPA 4JHDB 4PQUA 5LJVA 4CFBA 4QOZB 2VGMA 4IEIA 4HUFA 1GLLO 3ZSZA 2IDOA 2GUPA 2NZTA 1TKDA 1NJYA 2EWSA 3CM6A 5LL6Z 2OCEA 4H0PA 1QHTA 2OPQA 4BG9A 3EYZA 4H4MA 5BRDA 4B9VA 4YDUA 5MLCQ 3N4PA 3VF2A 5KPRA 3HSTB 5KGWA 3CJBA 4F2SA 4JI5K 4CZEA 4FJIA 4O55A 4E89A 3VQDA 3OBWA 4FWSA 3ALYA 5C2FA 4DWIA 5CZ1A 4BRAA 2NLXA 3I0SA 2HF3A 3QBXA 4MO5A 4K25A 3HRGA 2A3ZA 3KJVA 1WUAA 4KRFA 1D8YA 4B08A 2Q97A 3VTIA 1TUYA 2A5XA 3E66A 1Z25A 3NDKA 1R59O 1HYSA 1GLEG 4Y1CA 2KKZA 4JI7K 2VGNA 4BRMA 3ZX0A 4FJ9A 4FWNA 1Q81O 3QBWA 5KRSA 3MCAB 3E9PA 2HBLA 4NYFA 2FXUA 3AV9A 3MDQA 3K9JA 4LF7K 1JCFA 3THXA 4CJLA 3KK1A 3D0PA 2KZZA 1J6ZA 1IJJA 4WCEL 1A5VA 4MO4A 1KQSM 1BU6O 5HRNA 1BCOA 5BN9A 5AQMA 4W5NA 2Z1HA 2YHBA 2D4WA 4W5TA 2VQFK 2I7PA 1BISA 1TGOA 5FPEA 1D5AA 4CECA 5BREA 3AVFA 3WNGA 1N33K 5GAEP 4N76A 2PYLA 4G9ZA 3MEDA 3R9PA 1LAWA 3CMAN 4B3MK 1ZC6A 3A8YA 1SKWA 4FLXA 3IS9A 3HI0A 4CHYA 3SQ1A 4OKKA 1CXQA 4J2DA 3RSEA 3KLEA 3ZSOA 3SMPA 4JYAK 3V1QA 3CYMA 1S6PA 4FYDA 5C12A 1WAFA 5KGXA 3AVNA 5I42A 4O44A 3MEGA 3T19A 3CQYA 4F4KA 3P31A 1FXXA 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4DFKA 1RTHA 2P9LA 5AJ3K 2EHGA 1VQ5N 4FWPA 2O8CB 5AFUA 1NGBA 3PIPL 2DPNA 3H3OB 2QWOA 4CFCA 5TKWA 3ZSRA 3CJ1A 4JKEA 4IDHA 3S3MA 4Y1DA 1HNVA 4LF8K 2F8SA 4V19S 4XEIA 3ZETB 4JKGA 2O4GA 5I3UA 3AAPA 2ZJQL 3U3GA 1KSPA 3ITHA 3FR0A 4DV7K 3TTFA 4HUEA 4KO0A 4A2AA 4IZ9A 4BY9C 3G0ZA 4LF9K 1QE1A 2QXLA 4HTLA 1ILYA 4CGHA 3SQ2A 2D0BA 3IDHA 4KBOA 3WXIA 4CJSA 2HHHK 4MLEA 4JD2A 4AM6A 4DTRA 2D0PA 4B9QA 4FZXC 3OYJA 1MWKA 1TKTA 4B1XB 5BRFA 4DSIA 1OH7A 3AVKA 4BRIA 4MFBA 4CVNE 5ELZA 1NJWA 2HHSA 4FLVA 5EVZA 4EZ9A 1HNZK 3NH2A 3I55N 3I33A 1NGFA 4CIGA 2VYPA 1XNRK 1UAXA 3TAPA 1V4TA 1JLGA 3H1VX 2OTJN 4C1NI 5BRHA 3CERA 2VWBA 3O80A 1W7AA 3VQBA 3SJHA 2JWLA 1K8KA 1VQKN 4B1VA 3DJCA 1DEJA 4CZHA 3QEVA 3EE9A 3CQ8A 1NKCA 5HRSA 2PY5A 3CM5A 5D3GA 3RMAA 1ZYQA 4Z4HA 5C42A 3ATVA 1VQ7N 4DR3K 4ILJA 4FLWA 3TTCA 3CCQN 4I9QA 3CPWM 3T1HK 1SAZA 2UUCK 2F9WA 4H5RA 1J54A 3K5MA 4QCLA 4Q0BA 4AHSA 2O8DA 1D9FA 4YHHK 2E2PA 2KLAA 1S1VA 1X3NA 1GOBA 4WFNL 4DTNA 3CCUN 3BZKA 5TKYA 1X9MA 4CZMA 5BPMA 3KLIA 1JXEA 3LP1A 2YNHA 4C8MA 3VQ4A 3RMBA 4M3ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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