The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
52
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sequence length |
140
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structure length |
140
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGHAGEYGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSDLSNLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage, oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Water-mediated variability in the structure of relaxed-state haemoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
52
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| structure length |
140
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| sequence length |
140
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-04-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y4P A; 5JDO C; 3P5Q B; 1HLB A; 1YVQ A; 3ZJR A; 1O1P B; 3CIU A; 3OZU A; 4L2M A; 3IC2 B; 1YHU D; 2MGG A; 4MXL A; 1MLS A; 1YDZ A; 3WCP A; 2YRS B; 1G9V B; 5E6E B; 5E83 B; 1EMY A; 2RAO A; 3G4Y A; 3PI4 A; 1BAB A; 1LFQ A; 1B86 A; 2Z6T A; 2OLP A; 3PT8 A; 4FH6 A; 2DXM A; 1ABW B; 4C0N A; 3WCW B; 3OZW A; 2QRW A; 4DC8 A; 3ECX A; 4AVD A; 3HXN B; 1MLN A; 4MQH B; 1DXT B; 1MLL A; 1MKO A; 1MYT A; 1ECD A; 1YHE B; 1XZU B; 2OIF A; 3E55 A; 1DWR A; 3OO4 A; 1CMY B; 3LHB A; 1GBU B; 1C7D B; 1J52 A; 2OHA A; 2ZS1 B; 3VRF B; 3WI8 A; 3GYS B; 4N7O B; 2ZSP A; 3PEL A; 2AUP A; 2GNV A; 4YU3 B; 4UZV A; 3SZK B; 4YU4 B; 3S65 A; 4F6D A; 3VAU A; 1JPB A; 4JAC A; 4N7P A; 1O1N A; 3V2Z A; 3LQD B; 1H1X A; 1HBG A; 3QZX A; 2D2N D; 1SPG A; 4ZVA A; 2VLY A; 1Y83 A; 2R1H A; 5HAV A; 3QJB B; 1RPS A; 1Y0A B; 1QXE A; 1OR6 A; 2H8F A; 1BBB B; 1CLS A; 3PI2 A; 1JP8 A; 1MLK A; 1YEO B; 3NFE A; 2H8D A; 1A4F B; 3S66 A; 3KMF C; 1Y8I A; 1SHR B; 1MBA A; 6HBI A; 1C7B A; 3ZOM A; 2QU0 A; 2H35 A; 5ILM A; 2ZSQ A; 1YH9 A; 4U8U A; 3OJ1 A; 4F6J A; 3PT7 B; 1JP6 A; 1YIE B; 1J40 A; 2PEG B; 1F5P A; 3UHR A; 3GKV B; 4ROM B; 3MN0 A; 6HBW B; 2RI4 A; 4IRO B; 4HRR A; 4O4Z A; 1A00 B; 1LA6 B; 1ECA A; 1BVD A; 1ABS A; 1JL6 A; 1HRM A; 1GZX B; 3MOU A; 3ECZ A; 1K0Y B; 1HBA B; 4HRT A; 1NWI A; 2AUQ A; 1J41 B; 4F4O B; 2MGD A; 3ARL A; 2G0S A; 4O4T A; 2M6Z A; 3MJU B; 1CQ2 A; 1XZ2 B; 1DO3 A; 3GDJ B; 4MQG B; 1S5Y A; 3G4V A; 5C6E A; 1VWT A; 1NZ4 A; 3ARK A; 2ZFO D; 3V2V A; 2O5M X; 2ZFB B; 1Y2Z B; 2G0X A; 3CY5 B; 1GLI A; 4ROL B; 1LFT B; 2OH9 A; 3ASE A; 2NRM A; 1Y0D B; 1Y8K B; 1LH3 A; 3QM7 A; 1GCV A; 5E29 A; 1J7W A; 1QXD B; 1MBD A; 1BZ1 A; 3FH9 A; 3HEN A; 1G09 A; 2Z85 A; 3PIA B; 3TLD A; 1HHO A; 1FHJ B; 1LH7 A; 1U7R A; 1Y8W B; 1K1K B; 3OVU C; 1O1O B; 4OOD A; 3VRE A; 1QSH B; 1YCB A; 2ZLW A; 1Y8H A; 1GDL A; 1BAB B; 1S5X A; 1LFQ B; 1NIH A; 3B75 B; 3WCV C; 1MOH A; 3GQP B; 3GK9 A; 1MCY A; 2DXM B; 105M A; 1XXT B; 3AT5 B; 4MQC A; 1Y7Z A; 1YOG A; 3WCU D; 1C7C A; 1UFP A; 3D17 A; 4M4A B; 1FN3 A; 1YGF A; 2GTL A; 1HGC A; 1J7S A; 2W6V B; 1LFV A; 108M A; 2ZLV A; 4H2L B; 1CH9 A; 1Y4B B; 3OO4 B; 2WTH A; 2HBG A; 4B3W A; 1N9X A; 3R5I A; 3PEL B; 3S48 C; 3K8B A; 4XS0 A; 1S6A A; 4LPI A; 1HAC B; 4G51 B; 2E2Y A; 2ZS0 A; 4NXC A; 3ZJH A; 1SDL A; 2ZFO C; 1Y35 B; 1XZ4 B; 5EET A; 2O5B X; 1NS9 A; 2HBF B; 1LH1 A; 5JGG B; 2HZ3 A; 1LH2 A; 4B4Y A; 1YMA A; 3HF4 A; 2NX0 A; 4BJA A; 1MZ0 A; 3D1A A; 2R1H B; 1MNK A; 1FAW A; 2BW9 M; 2EB9 A; 2FRK X; 3A5B A; 2DN1 A; 2H8F B; 1CH3 A; 2WTG A; 3GLN A; 4O1T A; 1KR7 A; 2D2M D; 2W31 A; 3UGZ A; 1Y7D B; 2ZLT A; 2FRF A; 2H8D B; 1HDS A; 3S66 B; 1CO9 A; 2MYB A; 1O1J A; 1ASH A; 1SI4 B; 1MTJ A; 3AT6 B; 3DHR A; 1RTE A; 3MJP B; 1YOH A; 5C6Y A; 2D5Z A; 3FS4 A; 1FSX A; 4G1B A; 3AQ6 A; 3P5Q A; 1O1P A; 1G08 A; 1MNO A; 5HLU A; 2ZT1 A; 5SW7 A; 3IC2 A; 1Y0T B; 1YZI A; 2QSS B; 1CBL A; 2YRS A; 1G9V A; 5E6E A; 5E83 A; 5JDO F; 2GNW A; 4NXA A; 3A59 B; 2BKM A; 4HRT B; 102M A; 1YG5 B; 2R4X A; 2M6Z B; 3OZV A; 3WFU A; 5D5R A; 4TWU A; 2O5O X; 1DO4 A; 4O35 A; 3M3A A; 3WCT D; 3KUN A; 4UIQ A; 3UHG A; 5F2A A; 1VWT B; 3HXN A; 4MQH A; 1DXT A; 1CP0 A; 3MKB A; 4WCH D; 1YHE A; 2MGJ A; 4L7Y B; 1DM1 A; 3ODQ A; 2FRJ X; 1BVC A; 4GZG A; 2GRZ A; 3AQ9 A; 1CMY A; 1Y4V B; 1C7D A; 1J7W B; 2ZS1 A; 3VRF A; 112M A; 3FH9 B; 4ZVB A; 1MOC A; 4N7O A; 1G09 B; 1HHO B; 4YU3 A; 1Y4G B; 3SZK A; 3HYU B; 4HHB B; 4IT8 A; 1D8U A; 4NI0 B; 2MYE A; 1X9F D; 1S5X B; 2ZT0 A; 5HLX A; 3LQD A; 3UHV A; 1MYG A; 1Y22 B; 3VRG A; 1ECN A; 2AV3 A; 1O1K A; 3HHB B; 1Y5K B; 1NPF A; 3DR9 A; 3UHX A; 1B0B A; 3QJB A; 2HZ2 A; 1HDA A; 1Y0A A; 4MQC B; 4XDI A; 1XYE B; 1UVY A; 1BBB A; 1HLM A; 2MGB A; 3UH7 A; 2ZLX B; 1PBX B; 4ILZ A; 5JDO D; 4KN3 A; 5CN7 A; 1HGC B; 1YEO A; 1QSI B; 2V1F A; 2W6X A; 1A4F A; 1SHR A; 4F6I A; 1BZ0 B; 1VXD A; 1NQP B; 1Y7G B; 1MTK A; 1Y46 B; 3K8B B; 4XS0 B; 2PEG A; 3UHZ A; 2ZS0 B; 3RGK A; 2NRL A; 1V9Q A; 1SDL B; 4ROM A; 1NS9 B; 3AQ8 A; 1OJ6 A; 3G52 A; 1GDI A; 4C44 A; 2G3H A; 1A00 A; 1NWN A; 1LA6 A; 3HF4 B; 1NS6 A; 1SPE A; 3QJE B; 1FAW B; 1HBA A; 1A3N A; 2HBD A; 4F4O A; 3W4U A; 2BK9 A; 3UHQ A; 2VLX A; 1CQX A; 1V4U B; 2GTL C; 3ZJI A; 1RQA B; 2HBE B; 3WTG B; 2ZLT B; 3LB3 A; 1XZ2 A; 2ZT2 A; 1JWN A; 1DWS A; 3GDJ A; 4MQG A; 4UUR A; 1MBS A; 1EBT A; 1AJ9 B; 3A2G A; 2AUO A; 3BJ3 B; 2AUR A; 2MGK A; 4FWZ A; 2BWH A; 2ZFB A; 3ORD A; 1Y2Z A; 2O5L X; 7HBI A; 2LH6 A; 1MLH A; 1LFT A; 1ABY B; 1IRD B; 1Y0D A; 1Y8K A; 1CIO A; 3FS4 B; 1FSX B; 3NL7 A; 1YE0 A; 1G08 B; 1QXD A; 1FCS A; 5SW7 B; 3PIA A; 4H07 A; 3WCW D; 1YZI B; 2R50 A; 2XKG A; 1FHJ A; 1Y8W A; 2VRY A; 1K1K A; 1NPG A; 1Y7C B; 1O1O A; 1JZL A; 1QSH A; 4DWT A; 1O1I A; 3UBC A; 1YFF B; 3G53 A; 5CN6 A; 3B75 A; 3GQP A; 1MYJ A; 1I3D A; 4HSW A; 1XXT A; 3AT5 A; 107M A; 1HAB B; 5CN8 A; 1O1M B; 4M4A A; 1MYH A; 3MKB B; 1Y4Q A; 2MGA A; 2W6V A; 3ODQ B; 2VEE A; 4H2L A; 1Y4B A; 2VM0 A; 1YHU B; 1EWA A; 1GBV A; 2BLJ M; 3ZJO A; 4QAU A; 3VHB A; 1HCO B; 1A6K A; 1GVH A; 3IA3 B; 3QMA A; 1CH5 A; 1HAC A; 4G51 A; 3G46 A; 2O5T X; 3D1K B; 1Y35 A; 1XZ4 A; 2MGL A; 2HBF A; 1I3E A; 3VRG B; 5JGG A; 1MLR A; 1YHR B; 4HBI A; 3UHU A; 1O1K B; 3UHC A; 1DLW A; 2ZSR A; 3M38 A; 5KKK A; 1LJW A; 1HDA B; 1VXC A; 3WCW C; 101M A; 1L2K A; 1BIJ A; 1O1L A; 3UHT A; 5CHQ A; 3O7N A; 4OF9 A; 1Y7D A; 2ZLU B; 1MLG A; 1MBN A; 2O5S X; 2MBW A; 1J7Y B; 1YE2 B; 1CO8 A; 4NZI A; 1Y09 A; 3NML A; 1SI4 A; 1JP9 A; 3AT6 A; 2ZS1 C; 3UHN A; 1CH7 A; 3MJP A; 3UHE A; 1DTI A; 1HBH B; 1NZ2 A; 1HDB B; 1R1Y A; 3ZHW A; 3UH5 A; 3WCV D; 5EV5 A; 3QQR A; 2VYZ A; 1LUE A; 2G14 A; 3GQG A; 4M4B B; 5EQM A; 2OHB A; 2D2N B; 1Y0T A; 1NXF A; 2QSS A; 1EW6 A; 1VXA A; 5B85 A; 1NS6 B; 1HBB B; 1HV4 A; 3PI1 A; 3ZJJ A; 1VRF A; 3A59 A; 1A3N B; 2HBD B; 3W4U B; 5EU2 A; 5AZR A; 3BOM A; 1YG5 A; 5AZQ A; 1V75 A; 3ZJN A; 1MLM A; 2V1G A; 5CNB A; 2LH3 A; 1S61 A; 3A9M A; 3RJ6 A; 2EVK A; 5F0B A; 1Y0C B; 1NEJ B; 3QM6 A; 2VYY A; 4L7Y A; 1MWD A; 1Y01 B; 2C0K A; 1HGA A; 3GOU B; 4PNJ A; 3ECL A; 3NL7 B; 3UHI A; 1Y4V A; 1VXG A; 1YE0 B; 2R4Z A; 3MYM A; 5AB8 A; 2R4W A; 1Y4G A; 2BMM A; 3HYU A; 2NSS A; 4HHB A; 3OGB A; 110M A; 1A01 A; 3QQQ A; 2W6W A; 1O1I B; 3UHH A; 3UGY A; 4NI0 A; 1KD2 A; 1Y22 A; 1Y4R A; 5HY8 B; 1LFY A; 4N7N A; 3HHB A; 1Y5K A; 3EU1 A; 2VHB A; 3QJC A; 1MNJ A; 1MLJ A; 1XYE A; 1CH4 A; 2LH5 A; 1IWH B; 2LH1 A; 1HBS B; 2ZLX A; 1PBX A; 2XKI A; 1XZV A; 5EE4 C; 5ILR A; 1A9W E; 1QSI A; 2V1J A; 1Y4Q B; 5CNG A; 3KUO A; 5EOH A; 1BZ0 A; 1GBV B; 2EB8 A; 1NQP A; 2D6C A; 1Y7G A; 2Z6N B; 1S0H A; 1Y46 A; 1NAZ A; 5CND A; 2LH7 A; 3NG6 A; 3AQ7 A; 2HBC B; 3LB1 A; 5CHR A; 1UIW A; 2ZT4 A; 2O5Q X; 2XYK A; 3ARJ A; 1RQ3 B; 4FWX A; 2ZST A; 3WCU B; 3H58 A; 1HGB B; 3QJE A; 1THB B; 3AG0 A; 3NMM B; 1JY7 A; 1IT3 A; 1LJW B; 2GDM A; 1MBO A; 4N8T B; 4U8U D; 3ED9 A; 1UX8 A; 1JL7 A; 1BIJ B; 1IRC A; 4HSX A; 1O1L B; 3ONZ B; 1IDR A; 1V4U A; 2MGI A; 2R80 B; 1RQA A; 2HBE A; 1N9F A; 3WTG A; 1V4X B; 2ZSS A; 1Y09 B; 1AJ9 A; 1YMC A; 3BJ3 A; 3HEO A; 5ILE A; 1NZ3 A; 4FH7 A; 1MLQ A; 1CH1 A; 4ODC A; 109M A; 1R1Y B; 1ABY A; 1IRD A; 3ZH0 A; 2CMM A; 3E4N A; 4MAX A; 3GQG B; 1WLA A; 1JF3 A; 2W72 B; 1XZ5 B; 2G11 A; 3GKT A; 1LFL B; 2VLZ A; 3UHK A; 1HV4 B; 1Y7C A; 2D2M B; 2XKH A; 5B84 A; 4MBN A; 4JYQ A; 1YFF A; 3UH6 A; 2HHD A; 2PGH B; 4NK2 A; 3BOM B; 1BZR A; 1MYZ A; 3BCQ B; 104M A; 3UHB A; 1QPW A; 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1YEV B; 2MGF A; 1Y85 B; 1EBC A; 1NGK A; 1RVW B; 1MLF A; 2DC3 A; 2DN2 B; 2SPL A; 1CG8 B; 1W92 A; 1Y0C A; 1NEJ A; 1M6C A; 5CMV A; 4ODC B; 1UC3 A; 1VXE A; 3GOU A; 1GDK A; 2ZS0 C; 3H57 A; 5D1V A; 4MQK A; 2DHB B; 5CN9 A; 5IKS A; 4PQC A; 1HBR B; 4F69 A; 2Z6S A; 1JDO A; 2Z8A A; 1Y4F B; 5EYJ A; 2MGH A; 3PI3 A; 3E5I A; 3OO5 B; 1Y31 B; 1UX9 A; 2HHD B; 1DXU A; 1VXH A; 4NS2 A; 5HY8 A; 1QPW B; 2MGC A; 1WMU B; 2ZS1 D; 3A5A A; 3IC0 B; 2BLH A; 1IBE B; 1G0A A; 2MYD A; 2ZFO A; 1YMB A; 1IWH A; 1HBS A; 2V1E A; 3GQR B; 1YVT B; 2R4Y A; 3EDB A; 5EUI B; 1MBC A; 2EVP A; 2HBS A; 1YEN A; 1RQ4 B; 4F68 A; 1T1N B; 2Z6N A; 1PMB A; 3M3B A; 2IG3 A; 1MGN A; 1X46 A; 3EOK A; 1XZ7 B; 2HBC A; 1A9W A; 1CBM A; 4AVE A; 1V07 A; 1MOB A; 2BNL A; 3K9Z A; 1M9P B; 1Y5J B; 1DXV B; 3G4W A; 1VXB A; 1DWT A; 4X0L B; 1RQ3 A; 3UHW A; 1FLP A; 5CNE A; 3WCU A; 3WFT A; 1HGB A; 3QJD B; 1THB A; 3NMM A; 4N8T A; 1A0Z B; 1MYM A; 3QM8 A; 103M A; 1A3O A; 1SWM A; 1XY0 A; 4MU5 A; 3ONZ A; 5MBA A; 2SPM A; 2QMB A; 2R80 A; 1V4X A; 2ZWJ A; 1BJE A; 1CG5 B; 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