2ZOXA

Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic beta-glucosidase
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
466
structure length
466
Chain Sequence
MAFPAGFGWAAATAAYQVEGGWDADGKGPCVWDTFTHQGGERVFKNQTGDVACGSYTLWEEDLKCIKQLGLTHYRFSLSWSRLLPDGTTGFINQKGIDYYNKIIDDLLKNGVTPIVTLYHFDLPQTLEDQGGWLSEAIIESFDKYAQFCFSTFGDRVKQWITINQANVLSVMSYDLGMFPPGIPHFGTGGYQAAHNLIKAHARSWHSYDSLFRKKQKGMVSLSLFAVWLEPADPNSVSDQEAAKRAITFHLDLFAKPIFIDGDYPEVVKSQIASMSQKQGYPSSRLPEFTEEEKKMIKGTADFFAVQYYTTRLIKYQENKKGELGILQDAEIEFFPDPSWKNVDWIYVVPWGVCKLLKYIKDTYNNPVIYITENGFPQSDPAPLDDTQRWEYFRQTFQELFKAIQLDKVNLQVYCAWSLLDNFEWNQGYSSRFGLFHVDFEDPARPRVPYTSAKEYAKIIRNNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Cytosolic beta-glucosidase
publication title Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 185
structure length 466
sequence length 466
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2008-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2zoxA00
5AYIA 5HPOA 2VT0A 5ECUA 3FAXA 1V6XA 4H41A 4M80A 4CKQA 3AMCA 2VCCA 2B31A 2WHKA 1DTUA 3WUFA 4E8CA 5DF0A 3LPGA 2J8FA 5BXPA 5CPTA 3WNPA 3IK2A 2ZICA 5FIPA 1V3HA 2D0HA 1NWTA 2OSWA 2O9PA 1B1YA 2WMKA 4RE2A 1KWKA 4MJ2A 3MSGA 1KGXA 2YL6A 2X09A 3AIRA 2QLYA 5BWFA 2DSWA 1KQZA 5CG0A 3FY1A 3RJYA 2G41A 5IFTA 4P7RA 4PCSA 3WDPP 1CNVA 4CU8A 2XFYA 1BQCA 2DT1A 1GVIA 3AIBA 3VIOA 2GJXB 4V28A 3GXMA 2PC8A 2FH8A 1WDPA 2FGLA 5CXPA 4P8UA 1JDAA 1GOMA 2YDSA 1TUXA 1EGZA 4M1RA 3MS8A 2CYGA 5M03A 1B0IA 4AEEA 3U57A 1OGGA 1E9LA 1GZJA 2ZUVA 3VD9A 3DYOA 3TONA 2XM2A 3IANA 2QV4A 2PWGA 3AMKA 3GNPA 4PN2A 5A6SA 3W37A 2DSVA 3CGTA 1TVNA 3N04A 1WB0A 3K46A 1VEPA 1UD4A 3PZIA 2D0FA 5BXSA 2ZX8A 1MYRA 3W26A 2NT0A 3BH4A 4PTMA 5DT5A 3RILA 5A6BA 1XGZA 1GUVA 3ZOAA 4JHOA 1PIFA 1C7SA 4DUWA 2J7EA 2A3AA 4A3YA 1W32A 3VOCA 2BFGA 1IT0A 4KRTA 4D6FA 1V3LA 5CQ1A 3OIHA 2X2YA 3PZTA 4EK7A 4Z2GA 4ZEPA 1C91A 2CESA 2WW5A 1V0LA 2GJRA 4N42A 5M5DA 5HDRA 1J01A 2EPKX 3BAWA 4PMDA 1E71M 4KGLA 5E6YA 2ZUUA 2G8ZA 1D2KA 4MNMA 5GNXA 3L4YA 1B30A 3WNOA 1NP0A 2CBVA 1E6NA 4J3WA 3U7BA 1K9FA 3BLKA 5E70A 3KZSA 1E6QM 2VTFA 1BYBA 2VRQA 1BGAA 3N18A 3AS3A 4PUEA 1B3ZA 4W89A 5ABFB 5BRPA 3SCNA 5I5RA 2ZUMA 1V3KA 3FXYA 4F79A 3MV11 1KR1A 5A8OA 2BY3A 1CXLA 1LQ0A 5A8MA 1TCMA 2J7BA 1MFUA 4U33A 2EPOA 1LWJA 3MU7A 4V2XA 5JBFA 1H09A 4GQRA 5BYWA 2FGZA 1QBAA 4B3LA 1FP8A 3L4ZA 3OGSA 4U5KA 1QNPA 3UR7A 1QNRA 1CENA 4PYSA 1GORA 4PTXA 2W4XA 3QHOA 3QOKA 2XUCA 5KEZA 2Y24A 1QI5A 4UQCA 1ZBVA 3WNMA 1V6VA 3MUY1 3ZSTA 4J3XA 4XZWA 1OT1A 1UWQA 4LXFA 2XWEA 4KGJA 3N11A 3WQ5A 5A2CA 1UD3A 4DUXA 4FLQA 1D3CA 4IPNB 1ISYA 3OLDA 3N17A 1MXDA 1PZ3A 3BCDA 1AVAA 3KEHA 3DHUA 1CGWA 3AS2A 1W1PA 3CLWA 3GDBA 1VIWA 3MV01 4XZBA 2E3ZA 3OZOA 1W3HA 1E4LA 1LL4A 4RE3A 2VX6A 3AZRA 4C7GA 1VBUA 1A3HA 4PTVA 4AD3A 4W8AA 4PMRA 1LG1A 2AMGA 2VZTA 3TA9A 2ZE0A 2CBUA 1PX3A 3VIMA 3AMDA 3VNZA 4JL1A 3QHMA 3GXDA 3BCFA 2VO5A 3ZT7A 1RD6A 5BRQA 1GHRA 2VQUA 3PTKA 1QHPA 1W2VA 3AZTA 1O7AA 4Z2IA 1UWSA 1TFVA 1GONA 1ZBWA 5CSYA 4WIWA 2F8QA 3KL3A 4UFMA 1V0KA 4D6CA 3WQWA 3RM9A 3DC0A 2ZUNA 1XH0A 4AW7A 2VX5A 2VCBA 4TVCA 4D1JA 1KWGA 3GH4A 3ZMRA 3S2CA 4X0VA 3ALFA 4B3KA 4UQEA 1FH9A 1NH6A 3VNYA 2DSKA 4H2CA 3SURA 1V02E 3WD1A 4DWSB 1XH1A 1G5AA 5E9AA 2AOSA 1XC6A 2BY0A 3PTMA 2VQTA 2WC3A 1TVPA 4GZJA 4YHGA 1JZ2A 4UZUA 2JF7A 3N13A 1SFSA 4UFLA 4LYPA 1R7AA 2WZHA 2XTKA 1EOKA 3CO4A 1FA2A 1JFHA 2BY1A 1NQ6A 1C7TA 2XPKA 3TTSA 1E15A 4EAMA 2WBKA 5JUVA 4AZHA 2W92A 2WK2A 1GW1A 3TOPA 2J74A 3AJ7A 1JAEA 1XYZA 4PSPA 4S3KA 1HKMA 1Q6GA 4E8DA 4HZ8A 3EDDA 4RE4A 3AYSA 4GI8A 1UG6A 4QLLA 4CVWA 2CXGA 5I78A 4MNLA 5DMYA 1GNXA 2CIPA 2WMGA 4PRWA 3WQ8A 4W84A 1MQRA 1WKYA 1TA3A 3VIGA 1TE1A 4HZ7A 3CMGA 4ATWA 3AMGA 3VD4A 4PEEA 2Y8KA 2EEXA 4BQ4A 2A3CA 2X8RA 3AICA 1Q6DA 1NARA 4CU6A 1AMYA 4F9JA 4GI6A 4CCEA 2DT2A 2VRJA 1OGSA 3GNOA 3ARVA 2YL5A 1W3KA 3MUIA 2X0YA 1H0IA 2G3NA 3AHXA 1DWIM 1J0JA 2CKSA 1VFFA 4J28A 2XVGA 2BHYA 3AIUA 2XM1A 3GXIA 4UQAA 3CHEA 3GBDA 4AC1X 2CETA 2WZEA 4BCEA 3TP4A 3U5YA 2A3EA 2Z1KA 4V27A 2OSXA 3HMCA 1DWJM 1K9TA 4Z2HA 8A3HA 1E70M 5A69A 1G9HA 4W86A 2WHJA 2CERA 4LPCA 3ZJ8A 1EDGA 1CYGA 1V3JA 1C90A 2OWCA 1W1YA 1ZJAA 1KCLA 1XYFA 3WH5A 3QOMA 5C70A 1HNYA 4J27A 7A3HA 1KGWA 2J7FA 2YL8A 3RM4A 2V38A 1QVBA 5BXRA 4Y7EA 2WCSA 1ZU8A 4D6GA 1W3LA 1OWQA 2VUYA 5IXEA 1VRXA 1UOKA 2D3LA 4UQDA 3ARXA 4RL3A 2J7HA 2O92A 1JZ3A 4JIEA 2QHAA 2C7FA 1BYAA 1E4MM 1QI3A 4UOJA 1KXVA 1G01A 3VM5A 3IAQA 2BVTA 2O9OA 3APGA 3MO4A 4WLCA 5C8BB 3UG3A 3UERA 2ZWYA 3VVGA 4GO9A 2OYLA 1EIBA 3WD0A 1WO2A 4YN5A 3BMVA 3B8SA 1L0PA 3II1A 3SUSA 4X9YA 2D24A 2PI6A 1VBRA 3VIJA 4P7QA 2PWEA 4UFHA 4GZIA 4Q22A 3VD5A 1PZ2A 4XUYA 4M81A 4KWUA 3DECA 2IXUA 3N1AA 1HKKA 2ZX7A 3IJ8A 5FD0A 1V6UA 3F5JA 4LYRA 2WCGA 1SYTA 4OUEA 1VF8A 4GQQA 1HJWA 4D71A 3NCOA 5M3WA 3A4WA 1UWIA 2Q8XA 5HBFA 4AD1A 3AMLA 4AWEA 4HA3A 1QNSA 4B9YA 4HA4A 3WQ6A 2D2OA 4HMEA 4BQ5A 4TVUA 4FF5A 2WLYA 1MW1A 2J7GA 1JL8A 3WF2A 2VX4A 1LWHA 3VDCA 4L4PA 3WEOA 3VGEA 3POCA 3K1DA 3FHAA 4GKLA 4GI9A 3WDIA 2PBGA 4N0RA 7CGTA 1EH9A 1LLOA 3AYRA 5IHRA 2YDQA 4FLOA 1HVXA 1K9EA 2ZUWA 7TAAA 2WSKA 1PEZA 3BXWA 1MW2A 1EO5A 2CKRA 2XFFA 2OYMA 3SEPA 3T08A 1ZB5A 3NSXA 3VUPA 3F5KA 1CGTA 1E56A 2D0GA 2YBTA 3QR3A 4M8UA 5A8NA 4C7FA 3CZ8A 2PWHA 4TOQA 3ARWA 3ZR6A 1M04A 1BVNP 3QHNA 2PWDA 1LL7A 2XG9A 2BVDA 2CPUA 3BSGA 3SUVA 2HISA 4OBRA 3MMDA 1PX4A 1UR1A 4PMNA 4BA0A 2XYLA 3W82A 4MNJA 1US3A 1UR8A 4H04A 1GJUA 1UA3A 4HMDA 4NRRA 5D9PA 1WZLA 5EFDA 5A1AA 5FKYA 2C0HA 1ODZA 1C3FA 2JIWA 3T0DA 1E6PA 3W6LA 3RPMA 2JFEX 3ARRA 1UZ4A 4CD7A 2WYSA 1UR9A 3BAYA 1J12A 3WBEA 4QLJA 2WMFA 4XB3A 1XHGA 1CEOA 2J78A 3WL1A 2GK1B 4D1IA 1WP6A 1V3MA 1JDDA 3ZT6A 1J9YA 5IDIA 1HJSA 3ZQ9A 3VX0A 1QI4A 3CUHA 1KXQA 1FP9A 5LYRA 3VPLA 3WH7A 1JZ8A 1KB3A 3RDKA 4MB3A 5BCAA 4QP0A 2FHCA 2VC9A 1R85A 4CCDA 1X1NA 2UY2A 4P7LA 3WF0A 4TX6A 1ZJBA 4MAVA 3WNKA 4P8XA 3MMUA 1E40A 6CGTA 1CBGA 3PZQA 2UY5A 3W6MA 1GHSA 4JAWA 5I0DA 4C7DA 3TTQA 4AY1A 4WKAA 4QAWA 3OA5A 1W91A 1M53A 2F61A 1KCKA 4W8LA 3AIQA 2ZUTA 3KL5A 2XWDA 2QMJA 2VZOA 3WSUA 2V5CA 4ACYA 1VJZA 3ZJ7A 1LF1A 4HPHA 1QI0A 1ZBKA 1ISZA 2NT1A 3L4WA 4CN4A 5D9MA 5A2AA 4MB1A 3WUBA 3ZSSA 1HL8A 3OZPA 1RPKA 3WDQA 3CZKA 4WF7A 1GOOA 2E40A 4CD4A 5GQBA 1FFRA 2VX7A 1UWUA 3AHZA 3MANA 3OLGA 4JHZA 1UR0A 1LL6A 1JXJA 1C8YA 1Q6EA 2ZXDA 3EDEA 2FHBA 4AISA 1GOWA 1UH3A 4QLKA 1JYNA 4AZIA 5DT7A 2VI0A 5DO8A 3W38A 3BSHA 1LJYA 2DH3A 2WC7A 1O6IA 2WVVB 1UQYA 4MJ4A 2IUZA 2GDUA 3L4UA 1JF6A 5C71A 4CGTA 3VD3A 4W7UA 1E0WA 3MUZ1 1E6ZA 2VOTA 2XVKA 3AXHA 4R27A 1JZ7A 2UY4A 4UNIA 3O9NA 2GDVA 3ZT5A 4LQ1A 4A4AA 2Y8VA 4MNKA 4B15A 3WUGA 3NDYA 4BZYA 2X05A 2D22A 1IV8A 4W85A 5CLTA 4XV0A 4BF7A 4HMCA 1E5NA 2VZSA 3OG2A 1TMQA 2G4FA 4PMUA 3CTTA 3K4AA 4W7WA 4OOZA 1M01A 4U2ZA 3UCQA 1BPLB 4X0NA 4EKJA 2UWFA 4KMQA 3SUUA 1JZ5A 3WFZA 5E0CA 1EXPA 2J7CA 5GPRA 4KH2A 5A8QA 5HXMA 4JFSA 3ZM8A 1X6NA 3EDKA 2WC4A 4MAZA 4PMVA 3W27A 2GJXA 1E4NA 4PTWA 3L2LA 3RM8A 4AD5A 4J3UA 3I3BA 3L4VA 4QCEA 3VMPA 3G6LA 3NJ3A 5ABHA 1H0GA 3ARTA 3WF3A 2A3HA 3ARUA 3CMJA 4B16A 3AS0A 4W5ZA 3GBEA 4A3HA 2BHUA 2VCAA 1YHTA 2WANA 4U31A 3KWXA 5DFAA 4UQBA 3VILA 2OYKA 1RH9A 4J7RA 1B2YA 4OBSA 3FW6A 3T2PA 4ZENA 4OOUA 3SCOA 1W9UA 1UH4A 1TA3B 2XGBA 5AYBA 1E1FA 1NWRA 1ZS2A 2JALA 2NW0A 4GINA 3GXFA 3MUAA 3PZMA 4JKLA 4BS0A 3T2QA 3S6TA 4U2YA 5A6BD 1EA9C 1JYXA 4H8VA 3CUGA 3WH9A 1XH2A 1WZKA 4JKMA 3K8MA 5A95A 2Y2WA 1CGVA 1J18A 1H1NA 2ZOXA 1DEDA 1HL9A 1QPKA 1S46A 4M24A 5HNNA 6A3HA 1WDSA 1H41A 3I3EA 3T0AA 3ECQA 2VNCA 3AHTA 5ABGA 4NF7A 2WZIA 4ACZB 2J62A 3SUTA 2YIHA 3L2MA 2BXZA 1IZKA 2W66A 3CZLA 1J0YA 3WKZA 1HJXA 4H8HA 4PBGA 4F66A 3HU7A 2D23A 1WAWA 4W5UA 1K9DA 1M7XA 3GH5A 3O2LA 5ABFA 1OBAA 1E0XA 1KGUA 1DWFM 1R86A 3W4RA 2V3DA 4Z2JA 4PMOA 6TAAA 5HPCA 1LG2A 3BGAA 4P8WA 1V0MA 4JCMA 4WKHA 4ZE4A 5IHSA 3PN8A 3AFBA 5ABEA 1HKJA 3ZJ6A 2X1IA 3GZAA 1BG9A 3OLEA 4P7OA 2JEQA 4PCTA 1XSIA 1OM0A 1C92A 4PMXA 3B9AA 1UD2A 3VKKA 2WB5A 1CIUA 2G3IA 1W3JA 3M07A 2JE8A 3SUWA 4CU7A 4HTYA 1BTCA 1XV8A 3WL0A 1VENA 4UTFA 1BLIA 1GOQA 1BYDA 2DH2A 2JF6A 4L4OA 4AD0A 3FAWA 1E1EA 4ML4A 1HT6A 1KFWA 3EYPA 3WELA 5BROA 1UR2A 3ARZA 3AHVA 2FH6A 1BVZA 5A3HA 2V5DA 1H2JA 2VRKA 3NDZA 1TZ7A 1SR0A 3FHQA 2YLAA 1U2YA 1EQCA 1CTNA 3AIEA 3WF4A 4PUDA 4PSRA 1E6XM 3T2OA 2YOCA 4F9DA 4GZEA 4DWSC 3WDRA 3VGDA 3LPPA 1OCQA 2F2HA 1Z32X 2YBUA 2XVLA 2XJ7A 1CXKA 2CNCA 1MXGA 3RIKA 2XIBA 3AISA 4H7VA 3SCTA 1JXKA 4FLRA 3PZ9A 3J7HA 2GVYA 2DPEA 2PWFA 1AQ0A 1JGIA 5FCZA 1H5VA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5AYI A;  5HPO A;  2VT0 A;  5ECU A;  3FAX A;  1V6X A;  4H41 A;  4M80 A;  4CKQ A;  3AMC A;  2VCC A;  2B31 A;  2WHK A;  1DTU A;  3WUF A;  4E8C A;  5DF0 A;  3LPG A;  2J8F A;  5BXP A;  5CPT A;  3WNP A;  3IK2 A;  2ZIC A;  5FIP A;  1V3H A;  2D0H A;  1NWT A;  2OSW A;  2O9P A;  1B1Y A;  2WMK A;  4RE2 A;  1KWK A;  4MJ2 A;  3MSG A;  1KGX A;  2YL6 A;  2X09 A;  3AIR A;  2QLY A;  5BWF A;  2DSW A;  1KQZ A;  5CG0 A;  3FY1 A;  3RJY A;  2G41 A;  5IFT A;  4P7R A;  4PCS A;  3WDP P;  1CNV A;  4CU8 A;  2XFY A;  1BQC A;  2DT1 A;  1GVI A;  3AIB A;  3VIO A;  2GJX B;  4V28 A;  3GXM A;  2PC8 A;  2FH8 A;  1WDP A;  2FGL A;  5CXP A;  4P8U A;  1JDA A;  1GOM A;  2YDS A;  1TUX A;  1EGZ A;  4M1R A;  3MS8 A;  2CYG A;  5M03 A;  1B0I A;  4AEE A;  3U57 A;  1OGG A;  1E9L A;  1GZJ A;  2ZUV A;  3VD9 A;  3DYO A;  3TON A;  2XM2 A;  3IAN A;  2QV4 A;  2PWG A;  3AMK A;  3GNP A;  4PN2 A;  5A6S A;  3W37 A;  2DSV A;  3CGT A;  1TVN A;  3N04 A;  1WB0 A;  3K46 A;  1VEP A;  1UD4 A;  3PZI A;  2D0F A;  5BXS A;  2ZX8 A;  1MYR A;  3W26 A;  2NT0 A;  3BH4 A;  4PTM A;  5DT5 A;  3RIL A;  5A6B A;  1XGZ A;  1GUV A;  3ZOA A;  4JHO A;  1PIF A;  1C7S A;  4DUW A;  2J7E A;  2A3A A;  4A3Y A;  1W32 A;  3VOC A;  2BFG A;  1IT0 A;  4KRT A;  4D6F A;  1V3L A;  5CQ1 A;  3OIH A;  2X2Y A;  3PZT A;  4EK7 A;  4Z2G A;  4ZEP A;  1C91 A;  2CES A;  2WW5 A;  1V0L A;  2GJR A;  4N42 A;  5M5D A;  5HDR A;  1J01 A;  2EPK X;  3BAW A;  4PMD A;  1E71 M;  4KGL A;  5E6Y A;  2ZUU A;  2G8Z A;  1D2K A;  4MNM A;  5GNX A;  3L4Y A;  1B30 A;  3WNO A;  1NP0 A;  2CBV A;  1E6N A;  4J3W A;  3U7B A;  1K9F A;  3BLK A;  5E70 A;  3KZS A;  1E6Q M;  2VTF A;  1BYB A;  2VRQ A;  1BGA A;  3N18 A;  3AS3 A;  4PUE A;  1B3Z A;  4W89 A;  5ABF B;  5BRP A;  3SCN A;  5I5R A;  2ZUM A;  1V3K A;  3FXY A;  4F79 A;  3MV1 1;  1KR1 A;  5A8O A;  2BY3 A;  1CXL A;  1LQ0 A;  5A8M A;  1TCM A;  2J7B A;  1MFU A;  4U33 A;  2EPO A;  1LWJ A;  3MU7 A;  4V2X A;  5JBF A;  1H09 A;  4GQR A;  5BYW A;  2FGZ A;  1QBA A;  4B3L A;  1FP8 A;  3L4Z A;  3OGS A;  4U5K A;  1QNP A;  3UR7 A;  1QNR A;  1CEN A;  4PYS A;  1GOR A;  4PTX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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