The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| publication title |
Visualizing breathing motion of internal cavities in concert with ligand migration in myoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
64
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-09-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQ9 A; 1ASH A; 4N7P B; 5EE4 C; 1DO1 A; 1HV4 B; 1Y7G B; 4N7O B; 1JPB A; 1A6M A; 2ZS0 A; 3R0G A; 3WCT D; 2MYE A; 1DXU B; 1C7D A; 1MBA A; 2EVP A; 1YDZ A; 5CMV A; 4N7P A; 3ONZ A; 1HV4 A; 1CO8 A; 1Y7G A; 1HHO B; 1NQP A; 2MHB A; 2H8D B; 3M39 A; 1Y8H B; 1IT3 A; 1WVP A; 1YGF A; 1MBI A; 1CG8 B; 1K0Y B; 4HHB B; 1ABY B; 1HHO A; 3IA3 B; 1MOC A; 2H8D A; 1Y8H A; 3DHR A; 2MGB A; 5C6E A; 4XDI A; 1YOI A; 1AJH A; 4MU5 A; 2O5M X; 1JWN A; 1YHU C; 1Y7Z B; 2H35 B; 4HRT B; 1LFV B; 2D2M B; 2AA1 B; 3VAU A; 2V1E A; 4MQC B; 1NS9 B; 3CY5 B; 4GZG A; 1LFV A; 2D2M A; 2ZSN A; 1Y4R B; 3IC2 B; 1A9W E; 1DO7 A; 4O4T A; 4MQC A; 1NS9 A; 3D1A B; 3PEL B; 1TU9 A; 3CY5 A; 4MXK A; 1ABS A; 1YE0 B; 1CH5 A; 2W6X A; 1Y8K B; 4UUR A; 1W92 A; 3GQR B; 1O1K B; 1UC3 A; 1X9F B; 3D1A A; 3PEL A; 4MBA A; 3QZZ A; 1YE0 A; 1NS6 B; 2D2N B; 1Y8K A; 1OUT B; 1BIN A; 1FAW A; 3UGY A; 3GQR A; 4G51 B; 1O1K A; 1HLB A; 5MBN A; 1IRC A; 1X9F A; 3WCV C; 4F6F A; 4MQJ A; 1NS6 A; 2D2N A; 3G52 A; 1OUT A; 3VHB A; 1FDH G; 3VRF B; 1HCO A; 4G51 A; 3QJE B; 2V1I A; 106M A; 1CH1 A; 1A0U B; 1ITH A; 1UVX A; 3A2G A; 4ROL A; 4UZV A; 1BVC A; 4JAC A; 1HDB B; 3A59 B; 2BLJ M; 1Y0D B; 1YMB A; 3A5G A; 1XXT B; 3EOK A; 2W72 C; 1Y0D A; 2OLP A; 2GTL C; 1AJ9 A; 1QSH B; 3MYN A; 3NL7 B; 3HEO A; 1YVQ B; 1Y0C B; 1HAB B; 1YIH A; 3NL7 A; 1RQ4 A; 2HBE B; 1JEB B; 1J3Z B; 4F6G A; 1IRD A; 3QM7 A; 1HAB A; 1CH4 A; 1LFL B; 3VRE B; 2W31 A; 5JDO C; 4F4O B; 1J52 A; 3PI2 A; 1RTE A; 2HBE A; 3D1K A; 1CBM A; 3QM8 A; 1YH9 B; 1COH A; 4MQG B; 5EUI B; 1C40 B; 1LFL A; 1HRM A; 2LH5 A; 1XY0 B; 4F4O A; 1A3O B; 2EVK A; 1I3D A; 2G0V A; 3G46 A; 1MYF A; 1YH9 A; 3ARK A; 1C40 A; 3UHZ A; 1XY0 A; 3W4U B; 1QXE B; 1A3O A; 3S1J A; 4MXL A; 1YE2 A; 1H97 A; 1XZ7 B; 1MYZ A; 3HF4 B; 1QXE A; 1DXV B; 1Y85 B; 4NI0 A; 1DM1 A; 4KN3 A; 3BOM B; 1DLW A; 3MKB A; 1N9H A; 3KUN A; 3E4N A; 1HBS B; 2DN2 A; 1Y85 A; 1Y31 A; 2O5T X; 3OZW A; 1YZI B; 1ABW A; 1Y45 B; 1R1Y B; 1LUE A; 4MBN A; 4ESA B; 1J41 B; 1MLN A; 1S5Y B; 1YZI A; 3OVU C; 3ZJS A; 2R50 A; 2IN4 A; 1MCY A; 4ESA A; 4PQ6 A; 5KDQ B; 1LFY B; 2D60 B; 2OH8 A; 5EV5 A; 3UH7 A; 3WCW D; 1DXD A; 1J40 B; 4U8U A; 1A0Z B; 1LFY A; 2MGD A; 1Y4G B; 1V4X A; 1VXC A; 3ARJ A; 1O1M B; 1JW8 A; 1MZ0 A; 1Y4B B; 5KKK A; 3EDA A; 2FRK X; 1A0Z A; 2Z8A A; 1Y4G A; 5MBA A; 1O1M A; 2DN1 B; 4G1V A; 2QMB B; 3S1I A; 5IKS A; 2ZT0 A; 1NAZ A; 4NXA A; 2LH2 A; 2O5B X; 4JYQ A; 3EU1 A; 1LH3 A; 2QMB A; 1BJE A; 5E29 B; 1LA6 B; 1LTW A; 4FH6 A; 1XYE B; 2HZ3 A; 1CIO A; 1M9P A; 1Y2Z B; 1GCV B; 4L7Y A; 3UHC A; 1RPS A; 2ZST A; 3B75 A; 111M A; 4U8U C; 1G0B B; 1IDR A; 2LH6 A; 1CP0 A; 1CH9 A; 1Y2Z A; 1GCV A; 3WFT A; 1Y35 A; 1SDL A; 2QRW A; 1BZZ B; 3QZX A; 2M6Z A; 1JZL A; 1YHR B; 1V75 A; 1UX9 A; 5HLX A; 1CBL A; 3UHG A; 2R1H A; 1XQ5 B; 3QQQ A; 1S56 A; 1SI4 B; 1LFZ B; 1QXD B; 1MNJ A; 3GDJ B; 3NML A; 3IXF A; 2WTH A; 5E83 B; 1XQ5 A; 3PI9 B; 1SI4 A; 1LFZ A; 1QXD A; 4O35 A; 3GQP A; 3ZJP A; 2VLZ A; 1BZ0 A; 1JZM A; 3MOU A; 1YEQ A; 3PI9 A; 1KD2 B; 1MLM A; 1VXD A; 1B0B A; 4FC3 B; 1MLK A; 5EET A; 1BZR A; 1Y0T A; 3O7N A; 1KD2 A; 3S66 A; 1HGA B; 3GKV B; 2OH9 A; 1HBB A; 1MLQ A; 1URV A; 2GNW A; 1O1I B; 3UHV A; 3ZJN A; 4MQI B; 1Y8I B; 1V4W B; 1J7S B; 1HGA A; 1JP6 A; 3O89 A; 2VEB A; 3EDB A; 1HGB A; 3E5O A; 4N7N B; 3PI8 B; 4MQI A; 1FHJ B; 1Y8I A; 1V4W A; 2SPN A; 2ZS1 D; 1VXE A; 3KUO A; 3ZJL A; 1GZX A; 1Y5F B; 1IT2 A; 1Y7C A; 1BZ6 A; 1MOB A; 2MBW A; 1VHB A; 2MB5 A; 1J7Y B; 1YHE B; 1JY7 A; 1RQA B; 3A5A A; 1OFJ A; 3UHE A; 5AB8 A; 1X3K A; 1F63 A; 1Y7D B; 3UI0 A; 2GKN A; 3P5Q A; 1J7Y A; 2VYY A; 1YFF B; 5JOM A; 1SWM A; 1WMU A; 105M A; 1DWS A; 2O5O X; 2ZFB B; 1HBA B; 1OR4 A; 1VRF A; 3QJB A; 3WCP A; 2GL3 A; 1JZK A; 5F0B A; 1YFF A; 2DC3 A; 2VEE A; 1FSL A; 1F5O A; 1R1X A; 1LHT A; 3LB3 A; 1YHU B; 1HBA A; 2GRH A; 2W6W A; 2VM0 A; 3VRG B; 3HRW B; 3PT8 A; 2ZFO A; 3QJD B; 2FAL A; 1EWA A; 2BLH A; 1YHU A; 1C7C B; 4ROM A; 3HRW A; 3VRG A; 2KSC A; 1YDZ B; 4DC7 A; 2LH1 A; 3M3B A; 3WCU D; 3ONZ B; 3FH9 A; 1JP8 A; 1NQP B; 1C7C A; 1UT0 A; 2MHB B; 2MGC A; 1YGF B; 4NXC A; 5HLQ A; 2DN3 B; 4AVD A; 3DHR B; 5C6E B; 107M A; 5E6E B; 1J3Y B; 3WCV B; 2VYZ A; 4AVE A; 1NZ4 A; 2ZS0 D; 5HY8 B; 2DN3 A; 3HXN A; 3LQD A; 2HBC B; 1QPW B; 1CP5 A; 4HSW A; 5E6E A; 1J3Y A; 3WCV A; 1NWI A; 2O5Q X; 1MBD A; 2O5L X; 2ZFO C; 1DTM A; 5HY8 A; 3ZOM A; 1O1L B; 3U3E A; 2HBC A; 1QPW A; 1YVT B; 3BCQ A; 1N9F A; 2ZSZ A; 4O1T A; 3OK5 A; 1O1L A; 2G3H A; 1FDH A; 1YVT A; 2VHB A; 2W72 B; 3RGK A; 1Y4F A; 1Y83 A; 3WCT C; 2GTL B; 3SZK B; 1MLR A; 3MN0 A; 3LHB A; 1VRE A; 4DWT A; 1DWT A; 1QSI B; 3PI4 A; 3GQG A; 3A9M A; 2NX0 A; 2ZLW B; 4F69 A; 2W72 A; 2HHE A; 4NZI A; 1FAW B; 2GTL A; 1MLS A; 3SZK A; 1Z8U B; 3PIA B; 3ZJQ A; 1QSI A; 2D2M D; 2VYW A; 2ZLW A; 4MQJ B; 1LH7 A; 1IOP A; 5AZR A; 2G0R A; 1NIH A; 3ZH0 A; 1A4F B; 1MLJ A; 3K8B B; 1HCO B; 3PIA A; 3OZV A; 1HDS A; 1NZ3 A; 2BWH A; 1GDK A; 1MBN A; 2D6C A; 3OJ1 A; 1A4F A; 3MJU A; 2GKM A; 3K8B A; 4ROL B; 5HLU A; 1A6N A; 1LHS A; 2HBS A; 3MYM A; 4F68 A; 3HHB B; 1BUW B; 1X9F D; 1VXG A; 4DWU A; 2QFK A; 5KER A; 112M A; 3EOK B; 1YG5 B; 2D2N D; 4YU3 A; 1AJ9 B; 1AJG A; 3HHB A; 2XKH A; 1BUW A; 3FS4 A; 1CMY B; 2Z6N B; 1CQ2 A; 5CNG A; 1LH6 A; 1YG5 A; 1GDI A; 1YIH B; 3E55 A; 1RQ4 B; 1CMY A; 2Z6N A; 1V07 A; 3D17 A; 1IRD B; 1MDN A; 2ZLV B; 3WFW A; 1IBE A; 3BA2 A; 1MLL A; 1CH2 A; 3UHS A; 4NK1 A; 3GYS B; 5JDO F; 3ECZ A; 4MQK A; 1A00 B; 1FN3 B; 2BKM A; 1YOG A; 3G4V A; 3D1K B; 1DWR A; 3UBC A; 4M4A B; 1SPE A; 2ZLV A; 1COH B; 1PMB A; 1MNI A; 1OR6 A; 2E2Y A; 3GYS A; 2G12 A; 3PI3 A; 1A00 A; 1FN3 A; 1PBX B; 4TWU A; 1NXF A; 4M4A A; 1CH7 A; 1T1N A; 2HZ2 A; 3ODQ A; 1GLI B; 2ZLT B; 1PBX A; 1YE2 B; 5EOH A; 1YOH A; 4WJG A; 1V4U B; 1GLI A; 1ECA A; 2ZLT A; 4NI0 B; 1MTJ A; 3AQ7 A; 1JP9 A; 3MKB B; 1V4U A; 1GDJ A; 3A5B A; 3QM9 A; 3ZOL A; 3H57 A; 2DN2 B; 3UGZ A; 1XZ4 B; 2LH7 A; 3UH6 A; 1Y31 B; 1DXC A; 1ABW B; 2FRI X; 1CQX A; 1XZ4 A; 1VXH A; 3HC9 A; 3BJ1 A; 3UHB A; 3WTG B; 2XYK A; 5CN7 A; 3UBV A; 2OHA A; 1MBO A; 5HBI A; 1MNH A; 2NRL A; 3UHU A; 2MGE A; 3WTG A; 1O1O B; 3WFX A; 5HAV A; 1SPG B; 1OUU B; 5SW7 B; 2AUQ A; 3M38 A; 1G0A A; 2PEG A; 4U8U B; 2ZT1 A; 3WCW A; 1O1O A; 1V4X B; 1M6M A; 1YEU A; 1SPG A; 1OUU A; 4H07 A; 5SW7 A; 1DO4 A; 4X0L B; 4PNJ A; 1NWN A; 5EYJ A; 3UHD A; 2OHB A; 4X0L A; 1HGC A; 5B84 A; 1XCH A; 4YU4 B; 1FCS A; 2V1G A; 3QJC A; 2G14 A; 1JF4 A; 3SDH A; 3EU1 B; 1UFP A; 4G1B A; 1S69 A; 4TWV A; 1ECO A; 4KMW A; 4YU4 A; 1G9V B; 2V1H A; 1YGD B; 3PT7 A; 1TES A; 1CG5 B; 1YEO B; 2Z85 A; 3BJ2 A; 1Q1F A; 1M9P B; 2ZSX A; 4O4Z A; 1G9V A; 4L7Y B; 1YGD A; 1UVY A; 1RPS B; 3B75 B; 3S65 B; 1CG5 A; 1YEO A; 1Y22 A; 1O16 A; 5EYS A; 1KR7 A; 3WCW C; 3UHQ A; 103M A; 3GLN A; 1Y35 B; 1DXT B; 1SDL B; 2M6Z B; 1MKO A; 4KJT A; 3S65 A; 1OFK A; 1V75 B; 3RJ6 A; 1J7W B; 2WTG A; 4L2M A; 3NMM A; 3V2Z A; 1MTI A; 2R1H B; 2QLS B; 1DXT A; 4WCH D; 1C7B B; 1CH3 A; 1J7W A; 1HBH A; 2R80 A; 5CNF A; 3QQR A; 104M A; 1N9X A; 4PQB A; 2QLS A; 3MVC A; 4IRO A; 1C7B A; 3GQP B; 1EBT A; 2ZT4 A; 1OJ6 A; 1NGK A; 1BZ0 B; 2HBG A; 3UH3 A; 1MWD A; 1A3N B; 1YEQ B; 1BAB A; 1BZ1 B; 1SDK A; 2HCO A; 5CN5 A; 4FWY A; 4ZVA A; 2G10 A; 2SPM A; 1B86 A; 1MWB A; 2R4X A; 1Y0T B; 1A3N A; 1MLH A; 1YMC A; 5D5R A; 1S0H A; 1BZ1 A; 3S66 B; 3A0G A; 3AT5 B; 1HBB B; 2AUR A; 5EQM A; 3ECX A; 3ZJR A; 5ILR A; 1XZV A; 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1YIE A; 2SPL A; 2D5X A; 3HXN B; 3LQD B; 2HHD B; 3D7O A; 2VRY A; 4H0B A; 1HBI A; 3TM9 A; 1LFQ A; 5M3S A; 1DLY A; 2G11 A; 1NEJ B; 2HHD A; 2HBF B; 4N7O A; 3BCQ B; 1GDL A; 2GRZ A; 1MYJ A; 1CIK A; 1Y5K B; 1DXU A; 2PGH B; 1VXB A; 1NEJ A; 4FWX A; 1HDA B; 1V5H A; 1MLG A; 1I3E A; 2HBF A; 4PQC A; 2MYA A; 1N9I A; 1Y4F B; 1Y83 B; 5D1V A; 2PGH A; 1Y5K A; 1DUK A; 2ZLX B; 1CG8 A; 1HDA A; 4HHB A; 1K0Y A; 3WCU C; 2BNL A; 3GQG B; 3WCV D; 2H8F B; 1ABY A; 1G09 B; 4C0N A; 2EKT A; 4FH7 A; 2HHE B; 3TM3 A; 4N8T B; 2C0K A; 4NK2 A; 1HLM A; 2ZLX A; 4QAU A; 2H8F A; 1G09 A; 1URY A; 3UHT A; 1NIH B; 1Y7Z A; 3SDN A; 4N8T A; 1F5P A; 1Y09 B; 2H35 A; 4HRT A; 3UHX A; 1HDS B; 4DC8 A; 2AA1 A; 4SDH A; 2ZS0 C; 1YMA A; 3MJU B; 1Y09 A; 2EF2 A; 2R4Z A; 2HBS B; 3AQ8 A; 1Y4R A; 3IC2 A; 3G4U A; 3UHR A; 2GTL D; 1MBS A; 3DR9 A; 5KER B; 4F6D A; 1VXF A; 1WLA A; 4YU3 B; 1F65 A; 2MGH A; 4ILZ A; 3FS4 B; 3G53 A; 5CNE A; 1NPG A; 2G0X A; 4MQH B; 5JDO D; 3WI8 A; 4F6I A; 1O1P B; 1RQ3 B; 3HEP A; 3D17 B; 1MBC A; 4MQH A; 1IBE B; 3VRF A; 2LHB A; 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