2ZTKA

Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with homocitrate
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
320
structure length
312
Chain Sequence
MREWKIIDSTLREGEQFEKANFSTQDKVEIAKALDEFGIEYIEVTTPVASPQSRKDAEVLASLGLKAKVVTHIQCRLDAAKVAVETGVQGIDLLFGTGRDIPRIIEEAKEVIAYIREAAPHVEVRFSAEDTFRSEEQDLLAVYEAVAPYVDRVGLADTVGVATPRQVYALVREVRRVVGPRVDIEFHGHNDTGCAIANAYEAIEAGATHVDTTILGIGERNGITPLGGFLARMYTLQPEYVRRKYKLEMLPELDRMVARMVGVEIPFNNYITGETAFSHKAGMHLKAIYINPEAYEPYPPEVFGVKRKLIIA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Homocitrate synthase
publication title Mechanism of substrate recognition and insight into feedback inhibition of homocitrate synthase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 117
structure length 312
sequence length 320
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2008-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2ztkA01
4N9DA 2NUXA 4GFSA 1EA0A 3G8EA 3R12A 4JGDA 4X2RA 1OYCA 2YGYA 4UFKA 3HBLA 2QCCA 4HHPA 4RZ4A 2V2DA 3KOFA 5FEXA 1VCVA 3MO7A 3HGJA 2R14A 4U28A 3MW7A 4YWIA 4M6PA 4ZZ9A 3C2RA 3B06A 1ADOA 3T44A 4ICNA 4DPQA 5K4XA 2JKAA 2X16A 3D0CA 5CPMA 3YPIA 2ZYFA 3LDVA 2ATMA 4UFJA 2RDWA 4NT0A 4MJZA 4LUIA 2CLFA 5D38A 4IXHA 2TPSA 2QCMA 3B4UA 4MY8A 5LGXA 4UFMA 2NX1A 5HNRA 1KLZA 2DZWA 4LTSA 4N02A 1B57A 3FS2A 3W74A 4RXGA 1ZCOA 1JCNA 4JN6A 3A23A 3TFCA 5HWMA 3VFLA 2CZ5A 4DO6A 3OHIA 2O7SA 4I7WA 4O12A 1KM3A 3S1XA 3S1VA 1VZWA 3MP5A 5HQEA 3PR2A 3NGJA 1PS9A 4D2JA 5GVJA 1WOAA 4O1BA 3M5XA 2FB3A 2NZLA 2YXGA 4JYDA 4TX9A 2J9YA 1SW3A 1FWTA 2J6XA 1J4EA 1UCWA 3DXIA 1JULA 5LNWA 2CLOA 1DVJA 1OX4A 3LRKA 1F05A 1WDWA 1EWEA 1TPB1 4GWEA 2V9DA 2Y7EA 3DFSA 4KFOA 5I3FA 2A6LA 3KRSA 5EA9A 3L65A 3EWWA 3FJLA 2R8WA 1LP6A 1P1XA 5L9FA 1TPVA 1BKSA 2QEZA 1O4UA 1OFEA 3TSDA 2RDTA 3W23A 3FIGA 3HO8A 3HG5A 5FF2A 1XBXA 3VKJA 3W2JA 3PBUA 3NM3A 1IXOA 1DHPA 2RFGA 3LHUA 2C13A 1FCQA 1KM6A 4OBTA 3KHJA 5F2LA 2VFIA 5AHEA 3MYPA 4OGZA 1EUAA 4DBDA 1QPRA 1L2UA 4IMFA 4ONVA 3OIXA 4WOZA 2LLEA 3N19B 3FJ6A 3R13A 1EB3A 3A21A 3NO5A 4LU0A 3LGEA 3B05A 1OFPA 4CQ8A 1PVNA 3N9RA 4OV9A 1PCWA 3M9YA 4O4VA 5D37A 4HNNA 2QAFA 3E9AA 2PRLA 1W8SA 4FNSA 1EPXA 3L68A 1S5WA 4R53A 2O7QA 4HT3A 1TPUA 1RQEA 3MBDA 3VI2A 1H7XA 3W7RA 3CM4A 2V5BA 1TB3A 4TMBA 2PURA 1DL3A 5DCDA 5CZTA 1RVGA 5DCBA 2UV8G 2QJGA 2ISSA 4O0ZA 3SR7A 3QMSA 4P2VA 4K36A 3GDLA 3N2XA 2YCEA 3UWZA 2YFNA 4O50A 1OVDA 1TCDA 1RV8A 3IVTA 3NQ6A 2DZSA 4ML9A 2A6NA 3QSTA 2A7RA 4CNOA 4RK8A 4LV9A 4WQ6A 3BO9A 1Z42A 1N8FA 2B4GA 3WFAA 1MEWA 3PBYA 1H1ZA 3FLUA 1QNVA 2NV1A 3HMJG 2RKXA 4X9SA 3LCXA 2W79A 1VCGA 4IPIA 4NNBA 3EB2A 4GUGA 4WY0B 1FX6A 2QCNA 3TMQA 5FI8A 4MUZA 1HUVA 1OF6A 1EEPA 2Y70A 1OYAA 1FWRA 1LZOA 3GVGA 3NQCA 1KA9F 2WSQA 1JUKA 4PTNA 2FPYA 4YLWA 2A21A 3THAA 1G4PA 2QJHA 3LHVA 1WQ5A 4O1AA 3ABOA 3DFQA 3LTSA 2X2GA 2J88A 5HMSA 3H53A 2J9XA 2QKFA 3N14A 3A22A 1MSSA 3EXTA 3LX9A 2QF7A 3LXAA 1VYSX 3S5NA 3G1SA 1QDSA 3HQ1A 2OMAA 2J27A 2XN0A 2WSRA 4PODA 3W83A 4LS1A 4FIRA 5DXYA 3T78A 3UZ5A 1W56A 3RNDA 1OFAA 3NQVA 3PUOA 1SW0A 3H54A 1LOLA 3L9CA 3C52A 4DELA 3W3OA 3OEXA 3IIVA 4LRTA 1VYRA 3KRUA 1AG1O 3GYEA 1PCKA 3UZJA 3G1HA 4DF1A 1GVOA 3LCGA 2CLHA 2PCQA 3EWZA 5K2ZA 1H7PA 1K3UA 1LBMA 3TR2A 2D73A 3G0UA 3WK2A 4AF0A 5HR7A 3M5YA 1TTQA 2DJLA 1OK6A 1TTJA 1KV8A 3SGZA 4Y6GA 3WK0A 1TPC1 4QSHA 4N9EA 3UWVA 3NVTA 3UPBA 4H3DA 1LORA 3O6DA 3L5MA 2A4AA 2V0TA 3QF0A 5DBTA 3TSBA 3NYZA 1RZMA 1SU5A 2YDAA 2P10A 5LNVA 3EX3A 4WD0A 4JTUA 2ZZ2A 4QNWA 4LUJA 2GQ8A 1R2RA 1B4KA 3CIXA 3M5ZA 4IQLA 1KFBA 5BMXA 1YDNA 1Q6LA 3I7QA 2HS6A 3CU2A 3S1UA 2YSWA 3CTLA 5U4NA 4OV4A 1FXPA 4ZVJA 3DHFA 1NFBA 1NVMA 1JUEA 2B7PA 3TC7A 1F2JA 3OVQA 3W7KA 3WJZA 4IUOA 5D2WA 1NF7A 4LNYA 3LHWA 3ZR4A 2VELA 1D3GA 1UUMA 2VEPA 1IGSA 2ZTKA 5KTLA 3RLUA 4CCCA 4JXCA 3USBA 3RF9A 2NLIA 4IMCA 5HWJA 1ZALA 5G1YA 2OT0A 3EKLA 5LNSA 5LHEA 2FPTA 2J9ZA 3S5YA 2VFHA 5AHLA 2WO5A 3OVPA 3R2GA 3RLVA 1XCFA 2V8ZA 1RD5A 3S42A 3WJWA 1SPQA 3LTYA 1XI3A 1WA3A 3L0GA 3SI9A 1TRIA 4ADUA 3GXTA 5K9CA 1K7XA 1R47A 4LRSA 3LTPA 4IMEA 1JRCA 4CQAA 3QZEA 1GZGA 4Q4KA 1C29A 3P5ZA 4DO5A 3QQ1A 3UWWA 1YADA 3PULA 4Z1AA 1GYNA 4ZQMA 1YTEA 1LRTA 5FF0A 4A21A 2B7NA 1X7FA 1KM2A 4AHPA 5C54A 3C3NA 1T99A 3FYOA 4JYEA 1H51A 3DBPA 3W7LA 3NQ7A 5F2GA 2FFCA 4MKNA 3WK3A 1XKYA 1ZNNA 2JK2A 5C2XA 3SY5A 4RZ5A 4ADTA 3W1UA 4ZQNA 2F84A 1R46A 3QQ0A 2VEKA 2C16A 3P80A 4FHAA 2OZ0A 3GAKA 5D04C 3AJXA 2W0UA 3PS7A 2Y63A 1JRBA 3W22A 4IJBA 2Y7GA 1B4EA 4L4MA 4Z1BA 2NXHA 1SSDA 3I68A 3S8HA 5CPLA 1QMLA 2E6AA 4AHQA 2V2HA 1FDZA 3W71A 4UUIA 2BSLA 4HNVA 1TIMA 4LW7A 1WYIA 1O5XA 5G4WA 4BWLC 1UUOA 3PB0A 1RR2A 1TPEA 2TMDA 4JEQA 5TBOA 2V81A 3W86A 3HPXA 4UTJA 3UWUA 4UFHA 2EGZA 4MYXA 1H7OA 3OVRA 3PSWA 3WJYA 3PM6A 2QCGA 3EXRA 4J9JA 3SW6A 1Q3NA 3Q94A 4P61A 3G3DA 4O4WA 5DN1A 3EWXA 4KFPA 1AW1A 8TIMA 3ABQA 2VEMA 1I2OA 3PAJA 1WOBA 4I9AA 1NSJA 3T4CA 4K37A 1KFEA 1GT8A 4K6AA 2JKEA 3TCEA 2G95A 1EIXA 2WKJA 3P8IA 3QW3A 4NNCA 4JTLA 2TYSA 2DZTA 1KM4A 4EF9A 1IIGA 2J24A 4O8RA 4EWND 3HG2A 2I1OA 4HN4A 2CU0A 3EKZA 3W76A 4JTKA 5HR6A 2H6RA 3FKRA 1N55A 2E6FA 3U8GA 4AAJA 5AYXA 3R5EA 3MBFA 4Q32A 4WY0F 1RQHA 1VCFA 1W3IA 4NJIA 5HINA 5CZJA 1QAPA 3FYPA 4AWSA 3W1LA 1OFQA 2Y7FA 2Z6JA 4EF8A 1T0OA 1KM1A 5D2VA 3TROA 2YX0A 3C8FA 4XKYA 4PEKA 4RCXA 3F4NA 3M0ZA 1NEYA 4AMAA 1K7FA 3SFKA 4UXDA 4UC5A 5AB3A 1ZAIA 1B9BA 1XDLA 4PA8A 5D05A 2DZXA 3LCIA 4UFIA 1ONRA 5D09A 2ABAA 3EWYA 2CLMA 3STCA 3G1FA 5FEZA 1AW5A 4MOZA 4A2SA 3NG3A 4IWWA 3LLFA 1SZNA 3U6WA 3LOTA 1LRQA 1G69A 4UTKA 3BLFA 2P1FA 4Z0SA 5EBUA 1OF8A 3CHVA 3QFEA 4HNUA 3HB9A 1G4SA 4QAIA 4LWWA 3VE9A 2QUUA 4IOTA 3NNTA 2H8XA 1DV7A 4FEZA 1GPWA 1PE1A 4FB7A 2EHHA 5BRBA 1OX4B 4ORIA 1BWKA 5J5DA 2FIQA 3ATYA 1AK5A 2C14A 3TFXA 3IEBA 1G6CA 1C8VA 2X1UA 5C6MA 1WAUA 2YPIA 4MYAA 4N6FA 3QMTA 4FXRA 4MY1A 1KLYA 4B5NA 1A50A 4GUHA 1C9DA 1MEIA 3TH6A 1SQ7A 5DLCA 2CLIA 4R34A 2GQ9A 3IIPA 3EX1A 4GXMA 1P0NA 3LERA 5CPNA 3W70A 4K8HA 1LROA 1TREA 1V7YA 1SR9A 3NEVA 3S6DA 3N34A 2A0NA 3M44A 2G5WA 3AO0A 1HL2A 3TJLA 1ZAJA 3A24A 1LBFA 1D3HA 3I65A 4O14A 4FF7A 2AQWA 4PL2A 1TJPA 3QH2A 4JS3A 5DBUA 3TAKA 1MZHA 5CZ0A 4O15A 4JNMA 1I2NA 3LI0A 3I7SA 4X3ZA 4RJEA 1JQXA 2E68A 2VENA 4LVBA 3NL5A 1FUYA 2Q8ZA 4GJ1A 2EF9A 3UXDA 4LS0A 2JGYA 2NX3A 1GVRA 3O8AA 2GJNA 1X6UA 5AHNA 1XFBA 5EYWA 3B03A 5IBXA 4K38A 3TJXA 5AC8A 3GDTA 3EEGA 2ZZ1A 1N7KA 1JUBA 3CB8A 3NQMA 1A5SA 3NQEA 3LBMA 4OE7A 4QITA 4MPQA 1WX0A 1F7BA 1H1YA 4RX0A 3NL3A 3TQ0A 3TQVA 1TMHA 2GQAA 3UPWA 2RDUA 1LDCA 1GG0A 5DELA 3IVSA 3P82A 2ZZ3A 4GUFA 4JD4A 4LY8A 1S3HA 1TRDA 3SGUA 4XTIA 1JR1A 5KZDA 1FQ0A 1UBSA 4UMAA 1AL7A 2VFDA 3MUXA 1EP1A 3KVLA 2GVJA 4TMCA 2ZRWA 4LV4A 4AH7A 1YLVA 4WXYA 3TA6A 2ISWA 1SO6A 4A3UA 3GNNA 5I3IA 1G7UA 2P0OA 2YYUA 2CZEA 4WJEA 2Q8LA 3GAYA 1F73A 3LRMA 3OBKA 2Z0IA 3PF3A 1B3OA 2A1YA 3G1XA 1U83A 3VCRA 1EUNA 2DJXA 4YXGA 1W1ZA 4LC6A 1XM3A 4NXKA 1KFLA 4AEOA 1H61A 4O1CA 3B8DA 1X1ZA 3UD6A 2Y62A 1P0KA 3BLIA 1SFLA 1OX5A 2ZZ4A 3O16A 3CWOX 2E6YA 5K9XA 5EL1A 3DKJA 3NDOA 4XBKA 3WK1A 4EIVA 1YPFA 1I45A 1I4NA 1YTKA 2NWRA 2Y88A 2BZNA 4UNLA 4XQ6A 3S5OA 1KFCA 1PHQA 5D30A 1YDVA 1A53A 3SJ3A 3LHYA 4IPJA 4E2BA 3OA3A 3MP3A 4IGHA 3ZWTA 2PE4A 3QYQA 1VLIA 5LZLA 3CLMA 5ABTA 3E12A 1FY6A 3T55A 3NPXA 1OFDA 1O95A 1YPIA 4JTHA 3W7CA 2EAWA 2V82A 4DO4A 1TO3A 1GOXA 1GTEA 5DY3A 2HTMA 2WV8A 3GR7A 1XUUA 5BMWA 1EP2A 3CIWA 3MHFA 4WUIA 3STFA 4JTJA 1LYXA 5FEWA 5LSMA 3UYCA 1GEQA 1F6KA 4YCOA 2VKZG 4BK9A 1Q45A 1VC4A 3W85A 3QRHA 3MP4A 4HSNA 4R7JA 2FJKA 1QOQA 2Y85A 7TIMA 2ZA3A 5CZSA 5FESA 2CLKA 4A29A 3DH7A 3MMTA 1QO2A 5BNKA 3U2OA 4E2DA 3DZ1A 2Y89A 4JDYA 5G5IA 4WY0A 3M1ZA 1OFOA 3PSVA 4AB4A 3C61A 4N2YA 4MLJA 3W7OA 4IMDA 1TTIA 1OABA 1R30A 5BW6A 5LNUA 4TIMA 3H55A 3C4UA 5SWUA 2WNZA 3GKAA 4UTIA 3V75A 1XBVA 4UTTA 4CQ9A 5L6UA 1H5YA 4M6QA 4UNKA 4O54A 1FCBA 4DF2A 4ORMA 2WSYA 4UTMA 5KSWA 3BV4A 1QPOA 5AOUA 3L2IA 1GJPA 3O06A 3LXBA 3NZRA 2QDGA 4Y90A 1JCJA 4H4IA 3LV6A 2ISVA 5EKYA 1TPFA 1XC4A 4YL2A 3BK0A 2H8ZA 1H7RA 4QIUA 3L67A 1OFRA 4AXKA 5F2MA 4HSOA 3TE9A 4EVZA 2BTMA 3G24A 4QQ3A 2WNNA 1HTIA 2YR1A 2A7NA 4IX2A 5A8GA 1TV5A 2IQTA 2YW3A 1GTHA 3IVUA 3HG3A 4S2BA 4CLMA 2ALDA 4RV8A 1AL8A 3HPSA 2DZVA 1YDOA 4RLIA 3K30A 4UCGA 3ABRA 3TMLA 5CPOA 1DKWA 1W5NA 1R2TA 4S1FA 5KMYA 2HSAA 4FNQA 3W7IA 4DBEA 3GDMA 1LM1A 1UB3A 1JCMP 5HUOA 3L5AA 1GVSA 3LCWA 1W3TA 4NJJA 3W1PA 5LHFA 5C55A 1VGAA 2B7QA 2ZCGA 1VYPX 1DOSA 4AWTA 3KXQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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