2ZV9A

Lyn tyrosine kinase domain-pp2 complex
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
264
structure length
256
Chain Sequence
PAWEIPRESIKLVKKLGAGQFGEVWMGYYNNSTKVAVKTLKPGTMSVQAFLEEANLMKTLQHDKLVRLYAVVTKEEPIYIITEFMAKGSLLDFLKSDEGGKVLLPKLIDFSAQIAEGMAYIERKNYIHRDLRAANVLVSESLMCKIADFGLARVIEGAKFPIKWTAPEAINFGCFTIKSNVWSFGILLYEIVTYGKIPYPGRTNADVMSALSQGYRMPRMENCPDELYDIMKMCWKEKAEERPTFDYLQSVLDDFY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Tyrosine-protein kinase Lyn
publication title Crystal Structures of the Lyn Protein Tyrosine Kinase Domain in Its Apo- and Inhibitor-bound State
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 78
structure length 256
sequence length 264
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-11-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2zv9A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2zv9A01
4LMNA 4O27B 4PMSA 3NW6A 3BV2A 3OROA 5ANKA 1OIUA 3W8QA 1TVOA 4MD7E 2HWPA 4OTQA 5LWNA 2XK7A 4TXCA 5AP2A 3OHTA 5HG7A 1H08A 4FZAB 4M69A 3NUYA 3QQKA 4CD0A 3E3BX 3SGCA 2AUHA 3LXNA 2R3IA 2VTNA 4RVLA 3VBYA 3LZBA 4Y83A 5IUHA 2JDRA 1U59A 3IGGA 3G9NA 5CSHA 3ZRLA 2HENA 2ITNA 1PRYA 4K11A 4Z55A 3D94A 3CQEA 3BELA 2X8EA 3DS6A 4YZCA 3VUHA 2WMRA 4EOQA 3FZRA 5A46A 2C3IB 4IAZA 4O82A 1LEZA 2BROA 2ZM1A 4FV6A 4FTMA 4DGOA 5M57A 4OTPA 2OJJA 3QBNA 3ZRMA 4BI0A 3SLSA 3K3JA 3F61A 4AAAA 4ZAUA 2QOHA 2UZOA 4PDYA 3DV3A 4L8MA 4C36A 2OGVA 3PJ3A 5LARA 4CGAA 3K3IA 2LAVA 4CV8A 2R7BA 2PMIA 3FMDA 3MY0A 4R5YA 4Y73A 3E8CA 3LFSA 5KMKA 2JLDA 3S2PA 3WZKA 1CSNA 2ZB0A 3C0GA 2QC6A 4KS8A 3TDVA 3HUCA 2C4GA 1PXLA 4I94A 4OW8A 2JEDA 3BGQA 4WO5A 5JGAA 1W8CA 1CDKA 2WTCA 5HGIA 5BQ0A 4M84A 4MNEA 3FMJA 3KMMA 4FKRA 1XJDA 1YHWA 3NMUF 2Y4PA 5CAPA 3FQHA 3R71A 2P2HA 3NYVA 3DLZA 4DG0E 1IRKA 4NKAA 4WIHA 3GI3A 2WZJA 4GFGA 3U4WA 2WAJA 5EOBA 2IVVA 5HBJA 4DEDA 4AF3A 4DEGA 3UGCA 4E6QA 4S34A 4O84A 2G01A 2JDVA 2YDKA 3FMNA 3HV5A 3OXIA 3SHEA 4EOMA 2OSCA 3QX4A 4G16A 5FLFA 4LL5A 3R01A 3A8XA 4PMPA 4PRJA 3D4QA 3KGAA 4GKHA 2WTKC 3ZUUA 1YRPA 4C0TA 1REJA 5KX8A 2EB2A 2XB7A 2VWIA 1IAHA 4ANSA 2NPQA 3MY5A 3OT8A 3LCDA 4FSYA 3P1AA 4LRMA 3ZO3A 3LCKA 4EH4A 4XHKB 2R5TA 3VJNA 4U40A 2XJ0A 3ORKA 4C38A 4Y5QA 5DLSA 5CEPA 5FDXA 5DFPA 3FKLA 2YM8A 3F69A 2JFMA 2VWZA 3GOKA 3R7GA 4RQVA 5HO6A 1H8FA 2PVHA 3GB2A 4WG3A 3ZZEA 4B8LA 4DH3A 4L00A 3LJ0A 4KAOA 3SOAA 1KSWA 2YAKA 3D5WA 1RE8A 4BF2A 3KVXA 4QP9A 1MRUA 2WTWA 2GS7A 5LCKA 3ZFMA 4FKSA 4BIBA 3QD3A 4AS0A 4TPTA 4AT5A 3V5QA 2DWBA 5ETFA 1JSTA 5D7AA 5TOZA 5EOLA 2XIKA 4FTOA 3SD0A 1JAMA 4NWMA 4BDHA 4WSQA 3ZLSA 4BDJA 5CASA 5HO7A 4MKCA 4DFYA 4DG2E 5JH6A 5KMLA 5IQHA 3C5UA 5KMOA 5C8NA 1YXXA 4ANNA 5CANA 3KREA 3TI1A 4PUZA 2QU5A 5HZNA 3B8RA 3ERKA 4PPCA 1URCA 4RWKA 2R3RA 5EKNA 5HU3A 4K33A 5DT4A 3F7ZA 2RF9A 1LEWA 4YNOA 2ZOQA 4FGBA 3PLAE 3UNKA 2YA9A 2B9FA 4GT3A 1ZLTA 2F57A 4IAFA 4QPMA 4RIOA 4K1BA 4G3DA 2GNHA 4U6RA 3RCJA 4DC2A 4DTKA 3SW7A 4EHZA 4UYNA 1WZYA 3BEGA 3OCGA 4ID7A 5IEYA 5M56A 1Q4LA 4DEEA 3R0TA 4TW9A 5CVGA 4EOIA 1PKDA 4QMTA 3UVQA 4F70A 1KE5A 3MVMA 2RG5A 3ZM9A 5IQFA 4FE2A 3WYXA 4XYFA 3EFKA 3R02A 3CJFA 4JQ8A 4ZSJA 5BPYA 4ITJA 3TNWA 3ZUVA 5J87A 2WU7A 4NIFB 4BDIA 2O5KA 2R2PA 3FKNA 4P7EA 3TV4A 3Q4CA 3PVUA 4E1ZA 4DITA 5BYZA 3HGKA 4C58A 4FSNA 3OCTA 3R7OA 2VO6A 4IAYA 5IEVA 2SRCA 3E5AA 2Y6MA 3FZPA 3LXLA 3QTUA 3CY2A 1BI8A 3FSFA 4G9RA 4UY9A 4XNEA 4FSZA 5LMAA 4QMXA 4OBPA 5EQYA 4OLIA 4L6QA 4E6DA 3SX9A 2FUMA 3VBTA 4ZLYA 5BUJA 4O2PA 4AGDA 4IX6A 2KTYA 4FX3A 5K9IA 5F95A 2XH5A 5E1SA 5AP6A 2DQ7X 3VS3A 5KBRA 3R7UA 4LRKA 3D7ZA 3OF0A 4JXFA 5FEDA 4FOCA 2IVUA 3C4EA 2WMTA 3C7QA 4IB5A 5DI1A 4UX9A 3KC3A 2OIDA 2YDIA 3PSBA 3WF8A 5EM8A 3RP9A 3A7GA 2GPHA 4TYHA 3U51A 3BHYA 1B39A 3BHHA 4ZTRA 4RPVA 4QYFA 2BRNA 3VF9A 4F0FA 1V0BA 4LG4A 3ZYAA 4I1ZA 3LPBA 3R21A 4H39A 4I5HA 4E5WA 1PYXA 3GQLA 3KCFA 4BDDA 5AUTA 5CF5A 2CPKE 5IUIA 4UEUA 4GFMA 1WBOA 5DR6A 4FIJA 2BIYA 4QNAA 3QFVA 2OFVA 4E6AA 2ITZA 1J7LA 4IVDA 4BN1A 4FL2A 1Q62A 4FV7A 4FUXA 5AUXA 2O2UA 3FC1X 4QTEA 3U8WA 3OEZA 4EJ7A 5EDPA 5K5NA 5ANIA 3QZFA 2YABA 4MEDA 3RKBA 3PY1A 4DTAA 1Q8YA 3E7OA 4RIYA 3U6HA 2E2BA 4XG4A 2JC6A 3EYHA 3WBLA 5HLNA 4FEQA 4KS7A 4D1SA 3FKOA 2P55A 1Q8WA 4B7TA 4F7NA 2DYLA 4GIHA 3I81A 3SXSA 3AD6A 4AZEA 3OW3A 5FEQA 1PMEA 2V7OA 3FPMA 3PA4A 4FZFB 1XH5A 3PE1A 4CKIA 4QP2A 4RGJA 3TWJA 3QTSA 1XBCA 5FM2A 5HTIA 2PYWA 5B0XA 2OJFE 5L8LA 4DCAA 4RQKA 4L68A 3FL4A 1I09A 4CT1A 4EOLA 2OFUA 4QMWA 5FTGA 2WOUA 4N6YA 4DLIA 4JAIA 3H10A 5IKWA 4HVIA 4CVAA 2CKQA 1J1BA 3FZSA 5DHJA 3MW1A 2X39A 2HXLA 3QC9A 5DRBA 2HY81 1CKJA 4BCQA 3RK9A 4FBXA 2JGZA 3MH1A 4NW5A 2CHLA 1XBAA 5EQEA 4XMOA 4B6LA 2YCSA 3HA8A 4DBNA 3VS1A 3Q5IA 3F5PA 3EOCA 3MVHA 3PYYA 4YJQA 3UO5A 3Q4TA 3VUDA 3VHEA 2QG7A 3G6GA 2W4OA 2YM7A 3LAUA 4RSSA 2C1BA 2NP8A 5CYIA 4O7LA 1DI9A 5CF4A 1PXOA 1CKPA 4IX4A 4Z7GA 4FOBA 1SM2A 2XYNA 4L44A 3FLSA 2R3PA 5L8KA 1FBNA 4MX9A 5A6NA 1TKIA 2I1MA 3QTWA 4BDBA 3RAWA 3QUEA 5AV4A 2J50A 1FMKA 3SKCA 4Y8DA 5CZHA 2QO2A 3MTFA 2I0VA 4AZSA 3MIYA 4X2NA 3FI8A 2C0TA 4A07A 2W05A 4G3FA 1Q41A 2OXYA 2PMNX 2Z8CA 4FL3A 1KV2A 3D5UA 4DLJA 4IB1A 4RWIA 4Y72A 2XP2A 3PWDA 1JVPP 4FIEA 4JR3A 4I23A 4QMZA 5AR8A 4ZJVA 4LFIA 3T3UA 2XS0A 3FL5A 4EHEA 3QHWA 3IS5A 3P9JA 2C3KA 5BUEA 3GT8A 3QCQA 3FZTA 2JKQA 2CLQA 2EXMA 2JAMA 2W5AA 1BMKA 2JD5A 3KFAA 5EI6A 2VTRA 4AN9A 4ANBA 3OWPA 2F9GA 4CZTA 3GC8A 1QPJA 5EG3A 3TJCA 3ULIA 4A4XA 3ZC6A 4F9BA 4LGDA 5HOAA 2DS1A 4J98A 3MB6A 4F0IA 2C5NA 3COIA 3W2PA 4E4LA 5KKRB 5BVKA 2YIRA 1JOWB 2E9PA 3GBZA 4WBOA 4AQCA 5ANJA 4EZ5A 3L9MA 3GFWA 4AGCA 1WVXA 3TKIA 4YGAA 4FT7A 5CU0A 5HQ0A 2V22A 4ARKA 2WTVA 3OCSA 4DGNA 3MJ1A 4RIWB 4L53A 1H07A 4X21A 3IQ7A 3R8LA 5K4JA 4KIOA 4EHGA 3AC8A 3CJGA 3QQGA 3FDNA 2ZM3A 4YHJA 2R3GA 4OT6A 4KABA 1QPDA 2ETMA 4B0GA 1XWSA 3AC4A 3ALOA 4QT1A 2EXCX 3CBLA 3Q6WA 4GEOA 4EQCA 3DNDA 3Q96A 5JZJA 3NUNA 3FBVA 3FZ1A 3QQLA 1GY3A 3BBTB 4L9IA 3MV5A 3NNUA 5G1XA 2G2IA 3UOJA 1B38A 1OZ1A 3ZO2A 4FV1A 5CU2A 3HA6A 4EONA 4C59A 2CKPA 4PPBA 3TTIA 3DAJA 3IDCA 5GZ8A 4PDOA 1F5QA 5L2SA 3F88A 4V0GA 1JKKA 2EUFB 5IQBA 4ZSEA 4E8AA 1OPKA 3FQSA 1YXUA 4IADA 5AV0A 3H9RA 3PRIA 4FKLA 2V7AA 3I5NA 4UV0A 4DH1A 4F1TA 4K77A 3IOPA 4QMSA 4RX5A 2O64A 2I0HA 2QOFA 5C27A 3KB7A 3FYJX 5KMNA 1LR4A 3CPBA 1YXTA 3VS0A 3ZSHA 1VEBA 1GIHA 4EH3A 3PJ8A 3DKFA 3R04A 1OUKA 3MN3A 4W9WA 1L8TA 3TEIA 4H1MA 4MTAA 2IZRA 2ERZE 2XRUA 2QG5A 3ODZX 4RFMA 5L4QA 5IQDA 4JBQA 4M68A 5AP0A 3C0HA 5IPJA 5CEIA 2UW3A 3TNHA 1HCLA 4GV1A 4JDIA 2B54A 3OOGA 4Q2AA 3HRCA 5EHOA 3ZH8A 1PMVA 3UO6A 4FF8A 5JFSA 4FTCA 1ZZ2A 2H96A 3R8PA 3HX4A 1XBBA 4I6HA 4I5PA 2Q0BA 4AN2A 5EKOA 2VWWA 2WMAA 4ZZOA 2E9OA 4RFYA 3VULA 3GC9A 3PA5A 4KKGA 2HZ4A 4C2VA 4IB0A 2YM5A 1BYGA 3OBJA 3OG7A 5M4CA 4C33A 2G2HA 4BKJA 4QP1A 4F65A 3VRZA 2E9NA 5C9CA 1HCKA 3HZTA 2IW9A 1ZMWA 3IK3A 5E90A 2X7FA 4EYMA 3NW7A 4L67A 4AWIA 3T8OA 5L6OA 5DOSA 4OTIA 3EHAA 5ACKA 4WG4A 4IAAA 4D55A 1Q8TA 5KBQA 2GFCA 4FEXA 3HMPA 1ZYLA 3LJ1A 4EEVA 3GENA 3JVSA 3D15A 5CNOA 3KQ7A 2W17A 1E1XA 5EW8A 4BCFA 3VIDA 1ZXEA 3ZBFA 2Y0AA 3IW7A 3L8VA 4IDTA 4A9RA 4M69B 2OXXA 3HP5A 5IQAA 2W5HA 2QVSE 3BU5A 3MYGA 4PF4A 4BI2A 3DZQA 4RIXB 2YWVA 3IW4A 4CQEA 3L9NA 2PVLA 4PTEA 5L6PA 2PVKA 1GIIA 4G34A 4K0YA 2YM3A 1PMNA 3EZRA 4QTAA 4GK3A 3RVGA 3P79A 4IWQA 3EZVA 4E73A 3M1SA 4CSVA 3D5XA 5GHVA 4FG8A 2B9IA 5GJFA 3RPRA 5KMIA 3OTVA 3Q4UA 4QP6A 4PY1A 2JFLA 5FXRA 4D2VA 4IWPA 3PPJA 1YHSA 3MY1A 1BX6A 4L7SA 1J1CA 4GMYA 4QPAA 2VTHA 4FTJA 4FT9A 4RJ4A 1CKIA 4X6RA 1H00A 5BYYA 5JFWA 2R9SA 4ZSLA 3T3VA 2ONLC 3CCNA 3QRUA 3LFAA 4XG2A 5TE0A 3PZEA 2ZMCA 4I20A 2BDFA 2GU8A 2R64A 5AIRA 2I40A 2YJSA 3N9XA 2OICA 4AW0A 4F6WA 3Q52A 2XK9A 2F49A 4FUYA 3F5GA 3UZPA 4AA4A 4K18A 3P7AA 1OPLA 4U45A 4B4LA 3OFMA 2HW6A 4NSTA 3GUBA 4PPAA 4C4FA 4DT8A 3ACJA 4FVQA 3V8TA 4IAKA 2Y4IB 3C5IA 3DTCA 4YSJA 2ETKA 3E64A 4JQEA 3QLGA 5CXHA 4FTAA 4Y95A 4AGUA 3GCUA 4IZ7A 4YZMA 2EWAA 3NNVA 3EN5A 4IANA 3TKUA 3TKHA 1FPUA 3QUPA 3PUPA 1W83A 2VWBA 5M55A 3PLSA 4U0IA 4EZ3A 5I5ZA 3IW5A 3HMOA 2CJMA 3QKMA 5IA4A 2F2UA 2HZIA 1SNUA 2UZVA 5DWRA 3ZMMA 2VAGA 3R28A 5E8SA 3QZIA 3GGFA 4GFOA 3IONA 4CTBA 1GJOA 1BL7A 2FO0A 2R3JA 3UOKA 3V51A 3DCVA 4YPSA 1H24A 2XZSA 4XJ0A 3V8WA 1TQPA 4GCJA 4UN0C 3BU3A 4P4CA 1YDTE 2RSVA 4FNZA 5IQGA 3GC0A 3RTPA 2H34A 4DG3E 4MVFA 2BKZA 4QQCA 1SZMA 1EH4A 4BTMA 4YLJA 2OG8A 1QMZA 3BYSA 2QKWB 3PA3A 3A8WA 3SDJA 4L3JA 4U3ZA 4YTIA 5HCZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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