The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
61
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
AFVGLSDSEEKLVRDAWAPIHGDLQGTANTVFYNYLKKYPSNQDKFETLKGHPLDEVKDTANFKLIAGRIFTIFDNCVKNVGNDKGFQKVIADMSGPHVARPITHGSYNDLRGVIYDSMHLDSTHGAAWNKMMDNFFYVFYECLDGRCSQFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin V
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| publication title |
pH-dependent structural changes in haemoglobin component V from the midge larva Propsilocerus akamusi (Orthocladiinae, Diptera)
pubmed doi rcsb |
| total genus |
61
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2008-12-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1RQ4 B; 1MBD A; 3IC2 A; 5CND A; 2E2Y A; 1GZX B; 1Y5K A; 2MGE A; 1MOC A; 1EMY A; 2G10 A; 3WCT B; 1MLM A; 2BW9 M; 1XZ5 A; 4ROM B; 3UHR A; 4KMW A; 1DLW A; 1O1J A; 1UMO A; 1YHU C; 1DUO A; 1Y0A B; 4F6G A; 2GKM A; 2O5O X; 3WFT A; 1GCW A; 5CN7 A; 1J41 B; 1MBN A; 3ASE A; 1MLH A; 1FN3 B; 2D2M A; 1JZL A; 3ONZ B; 1Y8I A; 5HY8 B; 1RVW B; 1CG8 A; 1MYT A; 3QQQ A; 1J3F A; 1JEB A; 1EBC A; 1Y4R A; 5KDQ A; 3KUN A; 5ILP A; 4IT8 A; 5AZR A; 1FDH A; 4MQG A; 3HYU B; 1PBX B; 112M A; 3LR9 A; 2OHA A; 4YU3 A; 1YHE A; 5JGG A; 1MLG A; 2LH7 A; 1LA6 A; 1YIH A; 4XS0 A; 4FC3 A; 2ZSX A; 2GRZ A; 2HBE A; 5CN8 A; 1JF4 A; 2MGG A; 3MVC A; 3RJN B; 1C7C B; 3MYN A; 3HHB A; 3DHR A; 3UHU A; 2QFK A; 1DXT A; 5EYJ A; 5HU6 A; 1J7W B; 1FSX B; 3EU1 B; 2Z85 A; 3NL7 A; 2W6Y A; 1Y4G A; 3OO5 B; 1XY0 A; 2ZLT A; 2IN4 A; 1I3E A; 3M38 A; 4F6F A; 1VXD A; 1V4X B; 4TWU A; 1BBB A; 3NFE B; 1WVP A; 1NZ5 A; 1YIE A; 3KUO A; 1DXV A; 3PEL A; 1N9H A; 4F4O B; 4G51 B; 1HBS A; 4ESA A; 4DWU A; 3A2G A; 1G0B B; 1VXA A; 3A5B A; 1HCO B; 1Y0C B; 1MNI A; 1A4F B; 3V2Z A; 2MHB B; 3HRW A; 1ECN A; 2QMB A; 1NQP A; 4NS2 A; 1DO4 A; 1GDI A; 4DC7 A; 4F69 A; 2D5X A; 1NZ4 A; 2D6C A; 2ZLW A; 1Y8H A; 1Y4F B; 1A01 A; 3HXN A; 3ODQ A; 1O1K B; 2QLS A; 5CN5 A; 1DWR A; 2EKT A; 1V5H A; 3QJD A; 4DWT A; 3BJ2 B; 2ZST A; 1YOG A; 2DN3 A; 2Z6N A; 1MBO A; 3GYS B; 3FS4 A; 3DR9 A; 2Z6S A; 1G0A B; 1DM1 A; 1SI4 B; 2GNW A; 4N7O A; 4O2G A; 3WTG B; 1R1X A; 3LQD B; 3UHW A; 1MTK A; 2R4Z A; 4WCH D; 2HHD B; 2G0V A; 1J3Y B; 1DXU A; 3UHV A; 2ZFO D; 1NZ3 A; 1A6K A; 2LH3 A; 3FH9 B; 3ARJ A; 5CHR A; 1G08 A; 3OJ1 A; 5AB8 A; 2WTH A; 1YHU B; 3K3U A; 1OFK A; 3CIU A; 4NK1 A; 1SDL B; 3O7N A; 1MOH A; 3ZHW A; 2R80 A; 1YEQ B; 1C40 B; 5C6Y A; 2LH1 A; 1K0Y A; 2GTL B; 5E83 A; 1HGA A; 1RQ3 A; 1ECA A; 5EE4 D; 1W92 A; 5ILE A; 1YH9 A; 1QXD B; 4MQH A; 1XZ4 A; 1O1L A; 1R1Y B; 1OJ6 A; 3GDJ B; 4KJT A; 4XDI A; 1LHT A; 3A59 A; 1XZV B; 4N7P A; 1Y5F B; 1J40 A; 1GCV B; 101M A; 1CH3 A; 1MBS A; 1HLB A; 2XKI A; 1O1P B; 3G4Y A; 3E55 A; 4OF9 A; 2D5Z A; 3UHQ A; 1CBM A; 2FAM A; 3VRE A; 2ZSN A; 1YCA A; 3IA3 B; 107M A; 3PI2 A; 2V1F A; 1J7Y A; 3OVU C; 4PQB A; 2RAO A; 2MYC A; 1CH9 A; 2HBD B; 4HHB B; 2G3H A; 3A0G B; 3KMF A; 5JDO C; 3E4N A; 1JY7 A; 3GQP B; 3WHM B; 4MQI A; 1CH1 A; 3OK5 A; 3OO4 A; 6HBW A; 1B86 B; 1LFQ A; 1YVQ A; 7HBI A; 1SHR B; 3GOU B; 3ZJQ A; 2C0K A; 1Y35 B; 2ZFO A; 1NEJ A; 1XQ5 B; 4N8T B; 1BUW B; 1XZ7 A; 1HBH B; 3GKT A; 3AT5 A; 2NX0 A; 3PI9 B; 1O1O B; 3OZV A; 1KD2 B; 1BVC A; 2V1E A; 3GQR A; 2D2N A; 2DXM A; 4N7N B; 1Y7Z A; 2H8D A; 4ZVA A; 3BJ3 B; 1GDK A; 1CBL A; 2QSS B; 3G4Q A; 1MNH A; 3S66 B; 4U8U D; 1V4W B; 2FRJ X; 1S0H A; 3G46 A; 2BWH A; 2BMM A; 3UH3 A; 1SPE A; 2ZT2 A; 3NMM A; 1CG5 A; 1HDB A; 2ZS1 D; 4PQC A; 2GDM A; 4ILZ A; 2H35 B; 3LB3 A; 1A0Z A; 1Y4P B; 1QXE A; 3WCU A; 1GLI B; 1MLJ A; 1WMU A; 5EUI A; 1JL7 A; 2VLY A; 4ZVB A; 4L2M A; 3R5I A; 1HSY A; 1JPB A; 1LFZ B; 1JDO A; 1HDS A; 1MDN A; 3VHB A; 1DKE A; 1C7B B; 3S1I A; 1Y7G B; 2ZLV A; 3UHZ A; 5CNF A; 1YEN B; 3HEP A; 2MGC A; 3BJ1 B; 3UHH A; 1RQ4 A; 2VM0 A; 1MYF A; 5E6E B; 1IOP A; 1NPG A; 1MLS A; 1GZX A; 1YE0 B; 3R0G A; 5EET A; 3ZJN A; 1BZ0 B; 1YDZ B; 1RSE A; 3WCT A; 4YU4 B; 4NI0 B; 4ROM A; 1THB B; 1X9F C; 2BLJ M; 3QJE B; 1Y0A A; 1LFV B; 3PI4 A; 1J41 A; 2ZFB B; 2D2M D; 2V1K A; 1FN3 A; 1FAW B; 3ONZ A; 5HY8 A; 1RVW A; 2NRM A; 5EQM A; 1EWA A; 1DO7 A; 4TYX A; 2D60 B; 2SPM A; 3MJP B; 1DO1 A; 3D1K B; 1YG5 B; 5CMV A; 3O89 A; 1HDA B; 3HYU A; 1PBX A; 3MOU A; 1HBA B; 3D4X B; 4UZV A; 1BIN A; 1UT0 A; 2G12 A; 3WFX A; 1Y8W B; 4NZI A; 2OLP A; 3SZK B; 3WCW C; 1ITH A; 3BOM B; 3A5A A; 1GDJ A; 1OR4 A; 2O5Q X; 2ZS1 C; 1NWN A; 1C7C A; 2VLZ A; 1DXC A; 1MLK A; 1X46 A; 2W72 C; 3UHE A; 1J7W A; 1FSX A; 1BAB B; 3EU1 A; 1G9V B; 3OO5 A; 4F6B A; 1MLR A; 4F6I A; 1V4X A; 1S6A A; 4JYQ A; 2BNL A; 3NFE A; 4NI1 B; 3G53 A; 1B0B A; 4NXA A; 1V75 B; 4F4O A; 4G51 A; 3TM9 A; 3UHD A; 4M4A B; 3OZU A; 1G0B A; 3QQR A; 1HCO A; 2MGA A; 3WI8 A; 1Y0C A; 5F0B A; 2FAL A; 1QI8 B; 1A4F A; 2ZS0 C; 2MHB A; 2AUO A; 3QM6 A; 1Y4F A; 1Y0T B; 1HV4 B; 1O1K A; 1DTM A; 4B4Y A; 3BJ2 A; 1CMY B; 1J52 A; 3GYS A; 2D2M C; 1G0A A; 3E5I A; 1SI4 A; 1SDK B; 4MBN A; 1RQA B; 3WTG A; 3LQD A; 1F63 A; 3DUT B; 1F5O A; 1HHO B; 4L7Y B; 1HJT A; 2HHD A; 3WCV B; 2BKM A; 1MLN A; 2V1H A; 5JDO E; 1EW6 A; 2AV0 A; 1J3Y A; 2MBW A; 4H0B A; 1RTX A; 4C0N A; 1A3N B; 3FH9 A; 1X9F B; 2MGH A; 3UHK A; 1YHU A; 2SPL A; 1MBI A; 1M6C A; 3D17 B; 1HRM A; 1SDL A; 4ROL B; 3S65 B; 3GLN A; 2MGL A; 1YEQ A; 1C40 A; 4MXK A; 4WJG 1; 1XZU B; 2EB9 A; 2GTL A; 1MNJ A; 1ABS A; 5KKK A; 2ZLX B; 1FLP A; 1RTE A; 1QXD A; 1Y09 B; 3HEO A; 3GQG B; 3LHB A; 4G1V A; 1YEO B; 1R1Y A; 3GDJ A; 3UHN A; 3ECX A; 2DHB B; 1LTW A; 1XZV A; 4IRO B; 1NIH B; 1Y5F A; 1AZI A; 4MQJ B; 1GCV A; 1HBR B; 3SDH A; 1DLY A; 1O1P A; 3UHT A; 5CNG A; 3QM7 A; 1YGD B; 2VLX A; 1O1M B; 5HLU A; 1I3D A; 1MYG A; 1YOI A; 3OZW A; 1HAB B; 2BLI A; 2V1I A; 3A9M A; 2FRK X; 4H2L B; 3GKV B; 4UUR A; 2HBD A; 2OHB A; 2ZSQ A; 4HHB A; 1DWS A; 2EF2 A; 1O1N B; 1Y0D B; 4HRR B; 1C7D B; 1IDR A; 3A0G A; 3K8B B; 1AJH A; 5CHQ A; 2PEG B; 3GQP A; 3WHM A; 1MGN A; 1TES A; 4GZG A; 2G0X A; 2ZS0 B; 2G11 A; 1B86 A; 2MGF A; 3PT8 B; 1Z8U B; 1LH5 A; 1DO3 A; 1Y7D B; 1SHR A; 1YHR B; 3GOU A; 2MYA A; 1MYI A; 1Y35 A; 2GRF A; 1BZ6 A; 1UC3 A; 1YEV B; 1XQ5 A; 1S5Y B; 4N8T A; 1IRD B; 1BUW A; 109M A; 1EBT A; 1HBH A; 1CH4 A; 3PI9 A; 1O1O A; 3E5O A; 1NXF A; 3EOK B; 1KD2 A; 1ASH A; 2D2N D; 1CIK A; 1MWD A; 2W6V B; 5EOH A; 4N7N A; 1V4U B; 1V9Q A; 3BJ3 A; 1BZ1 B; 2R1H B; 2ZLU B; 2QSS A; 3S66 A; 1CLS B; 5CN4 A; 1V4W A; 1DUK A; 3DHT B; 3VAU A; 1AJG A; 5MBA A; 1VRE A; 4HSW A; 2W6W A; 3VRF B; 2H35 A; 1GVH A; 1IRC A; 4MQC B; 3MJU B; 1Y4P A; 2R50 A; 3WCU D; 3HF4 B; 1GLI A; 1X3K A; 5EV5 A; 3W4U B; 2Z6T A; 3TLD A; 1LFZ A; 1DTI A; 1F5P A; 1GBU B; 2DN2 B; 1C7B A; 4AVD A; 2HBF B; 3ZJR A; 1Y7G A; 1FSL A; 2BK9 A; 1YEN A; 1Y2Z B; 4HRT B; 4B3W A; 2HBS B; 3BJ1 A; 4M4B B; 1S5X B; 4KMV A; 4O4Z A; 2MGB A; 1QPW B; 5E6E A; 1AJ9 B; 2QU0 B; 1YE0 A; 1J7S B; 1MOA A; 1BZ0 A; 3WCT D; 4DC8 A; 1YDZ A; 4YU4 A; 4NI0 A; 2SPN A; 3S48 C; 1THB A; 5F2A A; 1YZI B; 3QJE A; 3D7O B; 3H57 A; 1LFV A; 2OH9 A; 5HBI A; 3PIA B; 3UHC A; 2ZFB A; 1FAW A; 1VXB A; 3WCV D; 2ZFO C; 3WR1 B; 1VWT A; 2D60 A; 3IC0 B; 1O1I B; 1ECD A; 1CQ2 A; 3MJP A; 5HLQ A; 1FHJ B; 3BCQ B; 2ZWJ A; 1YG5 A; 3D1K A; 1Q1F A; 5IKS A; 1HDA A; 2KSC A; 1HBA A; 2D2N C; 2MGJ A; 3ZJL A; 2VYW A; 3D4X A; 3A5G A; 1HAC B; 1YVT B; 2ZT4 A; 1F65 A; 2V1J A; 1GBV B; 5CNE A; 1Y8W A; 2CMM A; 1YCB A; 3PI1 A; 1NS6 B; 4X0L B; 1MTI A; 4C44 A; 3AQ7 A; 3SZK A; 4SDH A; 1Y31 B; 3UGY A; 3BOM A; 1Y4B B; 5EE4 C; 2HZ3 A; 2VEB A; 3UHB A; 1YE2 B; 1MNK A; 2EVK A; 3ECZ A; 3WCU C; 1BAB A; 2HBC B; 3M39 A; 1G9V A; 2ZSP A; 1G09 B; 3WCP B; 2QRW A; 2GLN A; 5C6E B; 1OUU B; 1MNO A; 4WJG A; 2YRS B; 1YFF B; 4NI1 A; 3TM3 A; 1TU9 A; 3D1A B; 2HHE B; 2HCO B; 2G0Z A; 1V75 A; 3P5Q B; 3UHI A; 4JAC A; 4M4A A; 2MYB A; 1SPG B; 1LJW B; 1QI8 A; 4VHB A; 2EVP A; 3V2V A; 1HGB B; 2O5M X; 3M3B A; 3UH5 A; 1Y0T A; 2G0S A; 1HV4 A; 1LFT B; 111M A; 3LB2 A; 1XCH A; 3QZX A; 3RGK A; 1CMY A; 1CH2 A; 3H58 A; 1SDK A; 1DWT A; 2MGK A; 1RQA A; 3K9Z A; 1Y5J B; 2R4X A; 3PT7 B; 3DUT A; 1PMB A; 1HHO A; 1LHS A; 5D1V A; 2QSP B; 4L7Y A; 1QSI B; 1Y22 B; 3WCV A; 1RPS B; 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1YHR A; 1YGF B; 1ABW B; 3ZJM A; 1YEV A; 1CH7 A; 5ILM A; 2ZT3 A; 1S5Y A; 1IRD A; 3AQ9 A; 1KFR A; 1CO8 A; 3MKB B; 1XZ2 B; 3WFU A; 1S69 A; 1U7R A; 1VHB A; 3EOK A; 2MYE A; 3NG6 B; 2W6V A; 2GTL C; 2ZT1 A; 6HBI A; 4F6D A; 5MBN A; 1V4U A; 5EU2 A; 3QJB B; 1A0U B; 1LH7 A; 1BZ1 A; 2R1H A; 3VRG B; 1Y46 B; 2EKU A; 2ZLU A; 3ZJI A; 1CH5 A; 1CLS A; 5KER B; 4BJA A; 3PI8 B; 1BZR A; 3DHT A; 1MLL A; 1CQX A; 3MYM A; 1M9P B; 2B7H B; 1Y4V B; 3VRF A; 1HBB B; 1A00 B; 4MQC A; 4MQK B; 3MJU A; 1MCY A; 1GJN A; 4ODC B; 1HGC B; 3HF4 A; 1HBI A; 5JDO F; 3M3A A; 1COH B; 2GNV A; 3LR7 A; 4U8U B; 5B85 A; 3W4U A; 1JZK A; 1A9W E; 3WCW B; 4KN3 A; 3G4W A; 2ZS1 B; 1GBU A; 1QSH B; 1Y01 B; 2DN2 A; 1Y83 B; 5HAV A; 1IWH B; 2HBF A; 2W72 B; 1Y85 B; 1Y2Z A; 4HRT A; 2HBS A; 3ZJJ A; 1UIW B; 1URY A; 4M4B A; 1S5X A; 3LB4 A; 1QPW A; 1AJ9 A; 1A6N A; 2QU0 A; 1J7S A; 2IG3 A; 2DN1 B; 2ZSY A; 1Y8K B; 1Y0W B; 2G14 A; 2XYK A; 1YZI A; 1NGK A; 3D7O A; 1LFY B; 4FH7 A; 3IC2 B; 3PIA A; 2OIF A; 1Y5K B; 1MBC A; 2WTG A; 2LH6 A; 1MLU A; 1XZ5 B; 1MLO A; 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