2CABA

Structure, refinement and function of carbonic anhydrase isozymes. refinement of human carbonic anhydrase i
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNQDRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydro-lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE FORM B
publication title Structure, refinement, and function of carbonic anhydrase isozymes: refinement of human carbonic anhydrase I
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1983-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2cabA00
5EZTX 1IF4A 12CAA 5IPZA 5AMGA 3DA2A 3B4FA 4YVYA 4QTLA 3RLDA 5E5RA 1CINA 1G52A 5BRVA 3ZNCA 5JGSB 1CAKA 4JS6A 1HECA 3T5ZA 9CA2A 4RIVA 5DSLA 5JEGB 3IBUA 1G0EA 4CACA 1YO0A 3F7BA 1G1DA 1IF7A 1TB0X 2CA2A 3P55A 3KONA 1HCBA 2VVAX 1UGEA 1DCBA 1CNCA 1XPZA 2NMXA 5E2RA 1YDDA 5G0CA 4RFCA 1THKA 4Z1EA 3DVCA 3DD0A 3D8WA 4Q8ZA 2NNSA 1FSQA 1G54A 2AW1A 3S77B 4ITOA 5DOHA 2GD8A 3MNAA 4QSBA 2NWYA 2FOYA 4L5WA 4E3FA 1YDCA 1BNTA 1BICA 1CANA 1TE3X 1FQLA 3N0NA 4Q06A 5JGTB 3T82A 3K2FA 5DSPA 3V2JA 4MLTA 3KS3A 5CA2A 1CNYA 3JXFA 1KWRA 3R16A 4FL7A 3L14A 4Q78A 1H4NA 1FR4A 1ZNCA 4KV0A 3IBLA 2FNNA 3DVDA 1KWQA 3KOIA 1Z93A 4YGJA 5FDIA 1RZDA 3OY0A 4TWLA 4ZAOA 5G0BA 4Q99A 4Q7SA 1CAOA 1CVCA 4MDMA 4QSJA 1I8ZA 1UGCA 2EU3A 3MNJA 1I9NA 3IGPA 4GL1X 1CAIA 1FLJA 2NXTA 1FR7A 4ZX1A 3M5SA 5EH8A 4KNNA 4KP8A 1G53A 3U45X 1DMXA 4QJOA 2AX2A 5EOIA 3CZVA 5JDVB 1LZVA 1ZFQA 1TEUX 1HUGA 1KOQA 5JEHB 1FQRA 3RZ1B 3ML2A 3PJJA 3Q31A 4BCWA 3P5AA 4K13A 4ZWIA 3IBIA 1CAHA 1UGAA 3IBNA 4MLXA 5E2NA 1TG3A 1FQMA 3P3JA 1CRAA 1F2WA 1JV0A 1YO2A 5FLOA 3RJ7A 3KIGA 1BNVA 3P44A 4E3HA 1DMYA 1CCTA 3M1QA 3DD8A 2FMZA 3HKQA 4CNWA 4QSAA 4Q6EA 2GEHA 4YYTA 3KWAA 3M04A 4FIKA 3D0NA 3ZP9A 5FLRA 1I90A 3KNEA 1TH9A 3M96A 4K1QA 2HL4A 5FL4A 1Z9YA 4K0SA 4Q0LA 5FNKA 3CYUA 3M2YA 4R5BA 4RUZA 1IF6A 3KKXA 1CVBA 4CNRA 4JSWA 3P4VA 1XEGA 5FNIA 5DOGA 3BL1A 2NWOA 4Q7WA 1V9IC 4IDRX 2WD3A 3M3XA 4Q81A 1EOUA 3K7KA 4MTYA 5DSNA 2WEGA 3RG3A 5FLTA 5L6KA 4QJXA 1CIMA 1LG6A 3B1BA 1CVHA 1HVAA 3FW3A 4ILXA 1I91A 5JESB 3F7UA 2NXSA 1CAYA 1G3ZA 1RJ5A 2HKKA 3R17B 4YWPA 4QEFA 2ABEA 1LGDA 1T9NA 4QJMA 3S73B 5J8ZA 2NN1A 4Z0QA 6CA2A 1CNWA 3V3IB 4N16A 3OKVA 4M2RA 1RZBA 4Q8YA 3N2PA 4Q87A 5SZ4A 5DSRA 3DCWA 3RG4A 3HFPA 4YHAA 5JG3B 3P58A 3D92A 5DSOA 3MNUA 3MNKA 4X5SA 4K0ZA 1HEAA 1HEDA 4QY3A 1FQNA 3DCSA 3N3JA 3CAJA 1G4JA 5SZ7A 4RUYA 4YXUA 2FOUA 4RFDA 3S76A 1ZSBA 8CA2A 3PYKA 4PXXA 1BV3A 5FNHA 3FE4A 4KNIA 3S75B 2NNOA 3MMFA 3K34A 1BN1A 4LP6A 3T84A 3V3FA 1I9PA 3P3HA 5L3OA 4LU3A 2X7SA 4YGKA 5EHWA 1CNIA 1BZMA 3P5LA 4QJPA 4KUYA 1I9QA 5JQTA 4YXOA 4JSZA 1G0FA 1AZMA 3MDZA 4HEZA 5DVXA 5G03A 4LHIA 5FL6A 2HD6A 5FNJA 5SZ5A 3DC9A 5EKMA 4CA2A 3ML5A 4M2WA 1HEBA 4PQ7A 4Q9YA 4ZX0A 4ETQC 2QOAA 3U47A 4QIZA 3F4XA 5DSKA 1YO1A 1MUAA 5EH7A 3RYVB 5EHVA 4WW6A 1OKMA 3S74B 1CZMA 4RN4A 2W2JA 4QK2A 4YGNA 1TG9A 3MHLA 3MHIA 3M1WA 4HT0A 4R59A 3TMJA 4YXIA 4TWMA 4HEWA 1H9NA 3DVBA 3C7PA 2Q1QA 4Q07A 3T83A 3UYNA 1BN4A 3F8EA 5LMDA 3EFIA 3MHOA 3MWOA 4WUPA 1RJ6A 1J9WA 4KUWA 4C3TA 2Q1BA 3RZ7A 4Z1JA 3RYJB 7CA2A 1RZAA 5BRWA 1G48A 1CRMA 4JSSA 1CNXA 5HPJA 1RAZA 5SZ2A 1BN3A 3D9ZA 4HT2A 4Q90A 2FNMA 2FNKA 2QO8A 3S78B 4KNMA 2QP6A 5DSIA 1URTA 4G0CA 1ZSCA 4WR7A 3OYSA 4Q7PA 5FLPA 4XE1A 1G46A 1CNGA 4K0TA 4XIXA 1OQ5A 3U7CA 4E5QA 4MDGA 1CNJA 5A25A 1CALA 4WW8A 4QSIA 3NB5A 2NN7A 3UYQA 4FU5A 4CNVA 1RAYA 1UGFA 2FMGA 3SBHA 2WEHA 3N4BA 1KOPA 3W6IA 5AMLA 4FPTA 5DSJA 5A6HA 2H15A 5CLUA 2EU2A 3DCCA 2HOCA 5FNMA 4E9OX 1JD0A 1BNQA 4PYYA 5FLSA 4MDLA 3NI5A 1TTMA 3KLDB 4Y0JA 4YX4A 3M2XA 5E28A 1HCAA 4Q09A 2VVBX 4ITPA 3RYZA 3M14A 4ZWZA 5CJFA 2HFWA 5BRUA 1BNWA 3DBUA 4E3DA 2CBEA 2X7TA 3V7XA 2ZNCA 2FW4A 1CVDA 3U3AX 1OKLA 2NXRA 4XIWA 4KNJA 3MZCA 3HKNA 5FLQA 1ZFKA 2EZ7A 1ZGEA 1I9LA 3RYXB 4M2VA 4DZ7A 3M67A 1FSNA 1CCUA 1IF5A 1CNKA 3RZ8A 1FSRA 5SZ3A 3MNHA 5DSMA 4HU1A 1CVEA 5EIJA 2WD2A 1XQ0A 5C8IA 3M5TA 3CA2A 4HBAA 5DSQA 1CVAA 1CA3A 3JXGA 2NWZA 1G4OA 5FDCA 4COQA 3T85A 3RZ5A 1IF8A 1Y7WA 1RZEA 2OSFA 4XZ5A 3OIMA 1TBTX 3V3GB 1CCSA 3EFTA 1UGGA 2NNGA 3IAIA 3TVNX 5JEPB 1ZE8A 5E2KA 3MHMA 3LXEA 1TEQX 2CABA 3D93A 4E3GA 4Q49A 2IT4A 4WUQA 1UGDA 1CAJA 4FVOA 3HKTA 1ZSAA 4PYXA 2WEOA 5EKHA 2CBCA 3M2NA 4QJ0A 3V3HB 2H4NA 1AM6A 3BL0A 3MHCA 3S8XA 5BYIA 3OILA 1ZGFA 5SZ1A 1HUHA 2WEJA 5E2SA 1A42A 1CILA 2Q38A 2FOQA 4N0XB 5FL5A 4KAPA 4XFWA 1CNBA 4FRCA 1XEVA 3M40A 4JSAA 1BCDA 2CBDA 4FVNA 4KUVA 3SAPA 1ZH9A 5SZ6A 4RUXA 1LG5A 3VBDA 1OKNA 2NWPA 5DRSA 3S71B 5SZ0A 5AMDA 3HKUA 4HF3A 4R5AA 4Q7VA 2CBAA 4ZWYA 5JG5B 3OYQA 1CVFA 2POVA 1G45A 1I9OA 4G7AA 5E5UA 4KP5A 3TVOX 4QJWA 4WL4A 1CNHA 1BNUA 4E4AA 1BNNA 3V2MA 1Z97A 3DAZA 5EKJA 2F14A 2O4ZA 3M1JA 5EHEA 1UGBA 3M5EA 3GZ0A 4Z1NA 4RIUA 2FOVA 1JCZA 4BF6A 3S72B 2CBBA 4YGFA 2HNCA 4UOVA 3IEOA 4BF1A 2ILIA 2FOSA 4YGLA 1V9EA 4L5UA 3S97A 4RH2A 5JQ0A 1YDAA 3M1KA 1AVNA 3M98A 3KOKA 4L5VA 3RZ0B 4Q6DA 1DCAA 5E2MA 3RYYA 4Q08A 4Q83A 1I9MA 5FNLA 2X7UA 5BNLA 5CACA 4DZ9A 4ZWXA 3SBIA 3JXHC 2POWA 4HEYA 3V3JA 3V5GA 4M2UA 4QK3A 1CAZA 4QK1A 3PO6A 1CA2A 1YDBA 3W6HA 5G01A 4QIYA 1CAMA 2NNVA 1G6VA 4PZHA 2POUA 3OKUA 3OIKA 3FFPX 3QYKA 1LUGA 4Z1KA 3HS4A 1RZCA 3RGEA 1BNMA 4MO8A 1IF9A 3MNIA 1H9QA 3MYQA 3SAXA 4Q8XA 3BETA 4IWZA 2OSMA 5FNGA 3HLJA 3S9TA 5EH5A 3M2ZA 1MOOA 3T5UA 3NJ9A 4CQ0A 3DC3A 3DV7A 1KEQA 4CNXA 4E49A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EZT X;  1IF4 A;  12CA A;  5IPZ A;  5AMG A;  3DA2 A;  3B4F A;  4YVY A;  4QTL A;  3RLD A;  5E5R A;  1CIN A;  1G52 A;  5BRV A;  3ZNC A;  5JGS B;  1CAK A;  4JS6 A;  1HEC A;  3T5Z A;  9CA2 A;  4RIV A;  5DSL A;  5JEG B;  3IBU A;  1G0E A;  4CAC A;  1YO0 A;  3F7B A;  1G1D A;  1IF7 A;  1TB0 X;  2CA2 A;  3P55 A;  3KON A;  1HCB A;  2VVA X;  1UGE A;  1DCB A;  1CNC A;  1XPZ A;  2NMX A;  5E2R A;  1YDD A;  5G0C A;  4RFC A;  1THK A;  4Z1E A;  3DVC A;  3DD0 A;  3D8W A;  4Q8Z A;  2NNS A;  1FSQ A;  1G54 A;  2AW1 A;  3S77 B;  4ITO A;  5DOH A;  2GD8 A;  3MNA A;  4QSB A;  2NWY A;  2FOY A;  4L5W A;  4E3F A;  1YDC A;  1BNT A;  1BIC A;  1CAN A;  1TE3 X;  1FQL A;  3N0N A;  4Q06 A;  5JGT B;  3T82 A;  3K2F A;  5DSP A;  3V2J A;  4MLT A;  3KS3 A;  5CA2 A;  1CNY A;  3JXF A;  1KWR A;  3R16 A;  4FL7 A;  3L14 A;  4Q78 A;  1H4N A;  1FR4 A;  1ZNC A;  4KV0 A;  3IBL A;  2FNN A;  3DVD A;  1KWQ A;  3KOI A;  1Z93 A;  4YGJ A;  5FDI A;  1RZD A;  3OY0 A;  4TWL A;  4ZAO A;  5G0B A;  4Q99 A;  4Q7S A;  1CAO A;  1CVC A;  4MDM A;  4QSJ A; 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