2IT4A

X ray structure of the complex between carbonic anhydrase i and the phosphonate antiviral drug foscarnet
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Phosph(on)ate as a zinc-binding group in metalloenzyme inhibitors: X-ray crystal structure of the antiviral drug foscarnet complexed to human carbonic anhydrase I.
pubmed doi rcsb
total genus 71
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2it4A00
5DSMA 1G54A 1FLJA 4QIZA 4Q09A 4QJOA 3T84A 3JXFA 5EKHA 2HFWA 4Q8ZA 1CAJA 3IEOA 4Q7VA 3HKQA 3K7KA 3F4XA 3TVOX 5FLOA 1CAZA 3DC3A 1CAKA 1CNCA 4Q7PA 1BNNA 4HEWA 1CNIA 1ZFQA 3N0NA 2AW1A 3M14A 4RIVA 1CVBA 3D0NA 2GD8A 5FNMA 1TE3X 2WEJA 3RYYA 4Q7WA 3M98A 1CZMA 5J8ZA 3IBIA 3V3HB 1CNGA 1KWRA 3S78B 4QJ0A 2X7SA 4JSAA 3MNHA 1HCAA 3IBUA 4WW8A 2POWA 5AMLA 4Q8YA 3DCWA 5IPZA 4FU5A 5DOGA 1TBTX 3JXHC 3IBNA 3NB5A 2NMXA 5E2MA 3LXEA 5LMDA 5FLSA 1HUGA 4QIYA 2FOUA 4N0XB 3DVDA 4QK2A 1KWQA 1ZNCA 4PYXA 4TWMA 4MDLA 4BF6A 4ZWIA 1THKA 4Z1EA 1JCZA 1LUGA 5EKJA 4RFCA 9CA2A 1FSRA 1MOOA 3BL0A 4KAPA 4YXOA 1CNBA 5DOHA 4Z1JA 1ZE8A 3RGEA 3DCSA 3ZP9A 3HKTA 5BRVA 3RG3A 5L3OA 4R5AA 1BNUA 4QK3A 3S72B 4R59A 3V7XA 4YGNA 4Q08A 4C3TA 1I9PA 1MUAA 1BNMA 3KLDB 3MNJA 1FSQA 4Z1KA 1I9MA 5FLRA 1J9WA 3W6IA 2FOYA 4RUYA 3BL1A 5EOIA 4Q87A 1HECA 2NN7A 4LHIA 1HVAA 3S76A 1CNHA 4ZWYA 2FMZA 5FLTA 5JGSB 2ILIA 4PZHA 3MMFA 5EHWA 3CZVA 3K2FA 3RYXB 1ZFKA 4QSJA 3ML5A 3M2XA 4KP5A 4N16A 4HT2A 1I9QA 3DC9A 3DA2A 3T5ZA 3P4VA 1FQMA 1G4JA 3KOIA 5AMGA 1UGBA 1YO0A 1CVFA 3OIKA 3M5EA 3TMJA 1FQRA 3RZ8A 1HEAA 1I8ZA 3RYVB 4Q78A 3M04A 4MTYA 3MZCA 3DBUA 1ZH9A 1BCDA 4MLTA 3NI5A 3RYZA 3JXGA 2NNGA 4K0TA 2HOCA 4YXUA 1I91A 2FOSA 2FOVA 2HNCA 1OKNA 3D9ZA 4KNJA 2NN1A 3B4FA 4XFWA 5JG3B 2W2JA 3V3FA 1BICA 1G3ZA 4ZAOA 2NXTA 2Q1BA 4K0SA 2CBEA 1CCSA 1V9EA 2FNMA 3RZ5A 4HT0A 1AZMA 2WEGA 4WUPA 4QJPA 3M2YA 2IT4A 4YGJA 4JSSA 5FDCA 4QSAA 6CA2A 3N4BA 2WEHA 3OKUA 3M67A 3HS4A 1BN4A 5CLUA 4KUYA 1UGFA 3F7UA 3OKVA 3M3XA 4ITOA 2H4NA 3C7PA 4K0ZA 3QYKA 4DZ9A 4ZX1A 4YGLA 5DVXA 1TEQX 3P3HA 4WUQA 4XIWA 2WD2A 4HU1A 4KNNA 5DSPA 2Q1QA 1RZBA 3PJJA 3V2JA 4QSBA 4FRCA 1UGEA 4FL7A 4CACA 4Q9YA 3K34A 1RZCA 5DSIA 1TTMA 3PYKA 2NWZA 1Z97A 3MNKA 4Q07A 5C8IA 4HEYA 1HCBA 1BNQA 1H4NA 3RG4A 3RZ0B 4BCWA 1CNYA 1OKMA 1FR4A 3M2ZA 4M2VA 4QSIA 3ZNCA 3MDZA 5DSOA 1LG5A 1UGAA 3M1WA 4FVNA 4KNIA 4Q8XA 1RZEA 5E5UA 1CA3A 1F2WA 4JSZA 3T82A 1DCAA 3V3IB 5EH5A 1AM6A 1FR7A 3P5AA 4YYTA 4Q49A 4CNWA 5G01A 4L5UA 4KUWA 1CCTA 2CBAA 4E4AA 1IF8A 1YO1A 5JQTA 5EZTX 3V2MA 4JS6A 5A6HA 5DSLA 3P5LA 3M1QA 1RJ6A 5HPJA 4WW6A 3MNIA 4QJWA 1XEVA 3DVCA 4ETQC 1YDDA 1CCUA 1H9NA 2HD6A 2NWYA 5E2NA 4ILXA 3F8EA 2CBCA 7CA2A 1OQ5A 3EFIA 3S75B 5CJFA 3RLDA 3V3GB 3RJ7A 4E3HA 5E2RA 3UYNA 4E49A 2ZNCA 1ZSBA 3VBDA 4PQ7A 4Q6EA 4KV0A 5JDVB 4HEZA 5SZ3A 2GEHA 2NWPA 1IF4A 1CVEA 2EZ7A 2WEOA 3N3JA 4XZ5A 2EU3A 4FVOA 4RIUA 4QJMA 1FQNA 3DD0A 5FNJA 2POUA 1KEQA 3KOKA 2NNSA 5L6KA 1CANA 4PXXA 4Q6DA 4PYYA 3DD8A 1CVDA 4QY3A 1CAOA 3IAIA 4YHAA 1H9QA 4Q81A 4HF3A 2FMGA 2NNOA 3HKNA 1IF7A 3D93A 5JEPB 3ML2A 1CVCA 1G6VA 2QP6A 3L14A 3MYQA 4CNRA 4QEFA 4YXIA 3SBIA 4YX4A 4QTLA 1IF5A 1I9NA 5JG5B 2HL4A 3OYSA 12CAA 4K1QA 2F14A 1V9IC 4XE1A 4Z1NA 3M40A 1DMXA 3TVNX 1XQ0A 5EKMA 2OSMA 4UOVA 2VVBX 1Z9YA 1BN1A 3U7CA 3W6HA 3CYUA 1AVNA 5DSKA 3P44A 4M2UA 5CACA 3SAPA 3MNAA 3U45X 3DVBA 3KIGA 1CNWA 2NXRA 4QK1A 1LZVA 5FNKA 1BV3A 4M2WA 3S73B 4ZWZA 2CABA 1CVHA 1CAIA 1G52A 5JEHB 1T9NA 3S74B 3HFPA 3P58A 4YWPA 1LG6A 5FLPA 1TG3A 5EHEA 1I9LA 1I90A 4RN4A 3MHCA 1CVAA 1ZGFA 5DSNA 3D8WA 3T85A 1YDAA 1G1DA 1BZMA 2NXSA 1TH9A 5FL6A 3M1JA 3M5SA 4R5BA 4YGFA 1ZGEA 3OYQA 4CQ0A 1KOQA 3P3JA 3IGPA 3S97A 4MDGA 1G0EA 3KWAA 1CINA 4E5QA 4G7AA 1JV0A 3T83A 5BYIA 1G45A 5FLQA 1KOPA 4Y0JA 1CAYA 5JQ0A 3RZ7A 2POVA 5JESB 3MNUA 1URTA 4Q0LA 4Q83A 3D92A 3S9TA 2AX2A 3NJ9A 3MHOA 5E5RA 1LGDA 2FOQA 2O4ZA 1Y7WA 3T5UA 4TWLA 3PO6A 5FNLA 1HUHA 2WD3A 4E9OX 1RAZA 4WL4A 4COQA 1ZSAA 1CRMA 1RZAA 3KNEA 3M1KA 3S71B 3DV7A 5SZ4A 1BNWA 1UGDA 5FNHA 1Z93A 3MWOA 1CAHA 3RYJB 3OILA 3V5GA 2H15A 4RUXA 4RUZA 4MO8A 2Q38A 1BNTA 4M2RA 5E2SA 1G0FA 4Q7SA 5DRSA 5EH7A 2FNNA 2HKKA 1A42A 3DCCA 4IWZA 5CA2A 3FFPX 3N2PA 3U47A 2NNVA 5SZ1A 1YO2A 1TG9A 4FIKA 4HBAA 2EU2A 1CNKA 1TEUX 3OY0A 1CNXA 5JGTB 5DSRA 2CBDA 5FL4A 4YVYA 3P55A 3S77B 1CNJA 3MHLA 5JEGB 1XEGA 3HLJA 1DMYA 1OKLA 1ZSCA 4ITPA 4E3FA 5SZ5A 5E2KA 3HKUA 1HEBA 4KNMA 5DSQA 3FW3A 1XPZA 5FNIA 3Q31A 5EH8A 4MLXA 5DSJA 1FQLA 1G4OA 3DAZA 4G0CA 4KP8A 5G0BA 4E3GA 3EFTA 1I9OA 3MHIA 3R17B 4X5SA 2ABEA 5FDIA 5BRUA 5FL5A 2OSFA 5EIJA 1G46A 4LP6A 3CA2A 1IF9A 3BETA 3SAXA 3GZ0A 5G0CA 3IBLA 1CA2A 1CILA 4WR7A 5AMDA 1CAMA 4FPTA 4L5WA 3SBHA 4RH2A 4XIXA 3M96A 1CRAA 1YDBA 1BNVA 1CALA 3KKXA 5SZ0A 4Q99A 3B1BA 3U3AX 4ZX0A 4GL1X 1RZDA 4Q90A 3RZ1B 2VVAX 1RAYA 2X7TA 3S8XA 1FSNA 5G03A 3FE4A 1BN3A 4K13A 1G48A 4JSWA 5SZ7A 4KUVA 4CNVA 1RJ5A 4IDRX 1UGCA 4QJXA 1YDCA 5EHVA 4LU3A 2QO8A 4BF1A 4MDMA 4DZ7A 1HEDA 1TB0X 2FNKA 4Q06A 1G53A 4E3DA 3M2NA 8CA2A 1DCBA 3M5TA 4ZWXA 5E28A 2NWOA 3KS3A 3OIMA 5FNGA 5SZ2A 2FW4A 4CNXA 5BNLA 4Z0QA 3MHMA 3CAJA 4CA2A 5A25A 1UGGA 5BRWA 1CIMA 3F7BA 3V3JA 1IF6A 4L5VA 2CBBA 2X7UA 2CA2A 3KONA 5SZ6A 4YGKA 4RFDA 2QOAA 1JD0A 3R16A 1EOUA 3UYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DSM A;  1G54 A;  1FLJ A;  4QIZ A;  4Q09 A;  4QJO A;  3T84 A;  3JXF A;  5EKH A;  2HFW A;  4Q8Z A;  1CAJ A;  3IEO A;  4Q7V A;  3HKQ A;  3K7K A;  3F4X A;  3TVO X;  5FLO A;  1CAZ A;  3DC3 A;  1CAK A;  1CNC A;  4Q7P A;  1BNN A;  4HEW A;  1CNI A;  1ZFQ A;  3N0N A;  2AW1 A;  3M14 A;  4RIV A;  1CVB A;  3D0N A;  2GD8 A;  5FNM A;  1TE3 X;  2WEJ A;  3RYY A;  4Q7W A;  3M98 A;  1CZM A;  5J8Z A;  3IBI A;  3V3H B;  1CNG A;  1KWR A;  3S78 B;  4QJ0 A;  2X7S A;  4JSA A;  3MNH A;  1HCA A;  3IBU A;  4WW8 A;  2POW A;  5AML A;  4Q8Y A;  3DCW A;  5IPZ A;  4FU5 A;  5DOG A;  1TBT X;  3JXH C;  3IBN A;  3NB5 A;  2NMX A;  5E2M A;  3LXE A;  5LMD A;  5FLS A;  1HUG A;  4QIY A;  2FOU A;  4N0X B;  3DVD A;  4QK2 A;  1KWQ A;  1ZNC A;  4PYX A;  4TWM A;  4MDL A;  4BF6 A;  4ZWI A;  1THK A;  4Z1E A;  1JCZ A;  1LUG A;  5EKJ A;  4RFC A;  9CA2 A;  1FSR A;  1MOO A;  3BL0 A;  4KAP A;  4YXO A;  1CNB A;  5DOH A;  4Z1J A;  1ZE8 A;  3RGE A;  3DCS A;  3ZP9 A;  3HKT A;  5BRV A;  3RG3 A;  5L3O A;  4R5A A;  1BNU A;  4QK3 A;  3S72 B;  4R59 A; 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