2NN1A

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase i
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nn1A00
3M5SA 3PYKA 3IGPA 3V3JA 4QK3A 1ZSBA 4JSAA 5JGSB 3NJ9A 4KNIA 1UGEA 4RUZA 1BNQA 3MNIA 3KOIA 3M2YA 3MDZA 3MZCA 1HEAA 5SZ4A 3F4XA 4QK1A 5C8IA 3HKQA 2NNVA 5FLQA 1V9EA 5FLOA 5FLSA 1G0FA 4Z1NA 1JD0A 1UGFA 5EKMA 5EOIA 2QO8A 1BZMA 4FIKA 2OSMA 3KONA 4HT2A 1CVCA 3EFIA 1BNWA 1I90A 3M98A 4K13A 2NWZA 3M5TA 5JESB 2ABEA 4K1QA 5E5RA 5DOGA 3DC3A 4Q0LA 4QY3A 3S75B 3GZ0A 4FL7A 3RYVB 5BRWA 4PQ7A 1TG3A 5FL4A 5FNGA 3DCWA 4XIXA 1CNWA 5BNLA 1BNTA 3SBHA 4E3HA 4E3GA 3DVCA 3OKVA 4GL1X 3OIMA 1FQMA 3DD8A 1G0EA 1CNXA 3MHIA 4ZWZA 3M67A 4HT0A 2CBAA 4Q81A 1XEVA 1TG9A 3KLDB 5DSPA 4PXXA 4JSZA 3HLJA 1Y7WA 4MDLA 3DV7A 4KNJA 12CAA 2FMZA 2VVBX 3K34A 4PYXA 4RFCA 3TMJA 5DSQA 1RAYA 4KAPA 5FLTA 4YXOA 5DSIA 1G53A 4CNRA 3NB5A 4YGKA 5EKHA 5FNMA 4E3DA 3ZP9A 1YDAA 4L5UA 3CYUA 3UYNA 4WW6A 5JG3B 2NWOA 5A25A 4XFWA 1HEBA 3M3XA 1T9NA 5FNKA 1I9LA 3M14A 1BN1A 1CILA 4Q8ZA 2NN1A 3IAIA 3P4VA 3BETA 2AX2A 5EHWA 3P44A 5E2RA 1H4NA 4XE1A 4Q7VA 1BCDA 2NMXA 4KUYA 3HFPA 4YGFA 2WEOA 1TBTX 2WEHA 3HS4A 2FOVA 2NXTA 2HKKA 1YO1A 5DOHA 3OY0A 3D93A 1ZFQA 4TWMA 2CBCA 1CRAA 1BN4A 1ZSAA 3KIGA 3P3HA 5E28A 4LU3A 1URTA 3S9TA 1G48A 1FR4A 5JQ0A 3SBIA 1FQNA 1KOQA 2FW4A 1CAZA 3D0NA 4TWLA 4FVNA 4WUPA 1TTMA 5FNHA 5G0CA 1FQLA 1BN3A 4LP6A 3NI5A 5CJFA 1LUGA 4HEZA 3RZ1B 4BCWA 1ZGEA 2FMGA 4Q07A 1A42A 5DRSA 5SZ5A 1RAZA 1CVBA 1ZGFA 2CBBA 3SAPA 4MDGA 4COQA 1AM6A 3QYKA 3MHOA 5LMDA 1CNGA 1BICA 5FLPA 3KS3A 1IF5A 3U3AX 4KUWA 3D8WA 3FW3A 5EHEA 3KNEA 1RZCA 2W2JA 2WEJA 4Q09A 2FOYA 4WW8A 5DSRA 3M04A 4E49A 1RZEA 4K0ZA 1F2WA 3T5UA 4WR7A 1CCSA 3DVBA 1DMXA 3OYSA 3RGEA 4PZHA 1CNKA 3JXFA 2CBDA 3HKTA 3IBUA 4QK2A 4RFDA 3M1QA 1CAOA 3M96A 4XIWA 1MOOA 4K0TA 3HKUA 1G54A 4E9OX 1BNUA 4MO8A 5CA2A 1AZMA 1FR7A 4CNVA 3KOKA 1DCAA 3B1BA 5JG5B 3FFPX 1CNBA 2F14A 3N3JA 2X7TA 4Q83A 1TEQX 3MHMA 4Q90A 1CAHA 5SZ0A 5EKJA 1TB0X 1UGCA 3RJ7A 3T5ZA 4Z1JA 5FNLA 4HEWA 5SZ2A 1G46A 1TH9A 2NWYA 3MNJA 4YVYA 3DC9A 2Q38A 5BYIA 1I9NA 3M5EA 1UGDA 3RYYA 4Q8XA 1CA3A 1KEQA 4XZ5A 1KOPA 4BF6A 1G6VA 5CACA 5JGTB 3ZNCA 3JXGA 1I91A 3DCSA 4Z1KA 4KP5A 5FL5A 1CAMA 1ZSCA 4Q6EA 3T85A 3UYQA 1I8ZA 4LHIA 3RG3A 3BL1A 4QIYA 4Q6DA 5G03A 3IBLA 5FL6A 5FLRA 2NN7A 4FU5A 3U47A 1CAIA 2ZNCA 1CCUA 3FE4A 5L6KA 3P5AA 1BNMA 1BNVA 2O4ZA 4YX4A 4X5SA 3MNAA 4E3FA 3DA2A 1H9QA 3LXEA 4QJMA 3K7KA 4Z1EA 5AMLA 3T83A 5DSOA 3S77B 3W6IA 3S74B 5EIJA 1THKA 1XPZA 1G4JA 4QJWA 4Q8YA 1CRMA 4Q7PA 2QOAA 1UGBA 1YDBA 1CVDA 4Q06A 3CZVA 1ZFKA 3V2JA 5EH7A 1RJ6A 3IEOA 3M40A 2HD6A 3HKNA 3MWOA 3TVNX 3V3GB 2ILIA 4MTYA 4N0XB 4RIUA 4E5QA 1XEGA 3N0NA 5DSNA 2NNGA 3N2PA 4CNWA 4FVOA 4CA2A 5E2NA 1CNCA 4QJOA 3V3IB 4KNNA 1BV3A 3RZ0B 3PJJA 4FRCA 1AVNA 3V3HB 5DSLA 4IDRX 1I9MA 1G4OA 3EFTA 4C3TA 4QJXA 3OIKA 1Z97A 4ETQC 1XQ0A 5EH5A 1OKNA 6CA2A 3K2FA 1CVEA 3L14A 4G0CA 5E2SA 4KP8A 5FNJA 1CAJA 1FSRA 1CAKA 1I9QA 4QTLA 5JEPB 3ML2A 2Q1BA 4MDMA 1YO2A 4MLTA 4YGLA 3S71B 4HEYA 3SAXA 8CA2A 1UGAA 5E5UA 5BRUA 3F7BA 1CVAA 5EH8A 2NNOA 2X7UA 4QJPA 4UOVA 3RYZA 3V5GA 5E2KA 4ILXA 2NWPA 1CAYA 4YXUA 5JDVB 2GD8A 2CABA 4IWZA 3CAJA 3Q31A 2CA2A 3V7XA 1FSNA 4HBAA 3W6HA 2EU3A 4R5AA 5HPJA 2FNNA 5JEGB 1HVAA 4RN4A 3M2ZA 1RZAA 4RUYA 3JXHC 3S78B 1G52A 4BF1A 1CA2A 1ZNCA 4Q08A 4QSIA 5DSKA 2HL4A 2AW1A 1LG6A 4Z0QA 4Q7WA 1CZMA 1JV0A 1DMYA 5DVXA 5AMGA 1RZDA 4Q9YA 4WUQA 4QSAA 4QIZA 3S8XA 1MUAA 3B4FA 3TVOX 5JQTA 3N4BA 5FDIA 1EOUA 3DD0A 4Q78A 1HCBA 3IBNA 4K0SA 1FQRA 2H15A 1V9IC 4YGJA 4ZWIA 4N16A 1DCBA 3ML5A 4RUXA 3T82A 1CINA 4E4AA 3RZ7A 3M2NA 4FPTA 3OYQA 5E2MA 2X7SA 1KWQA 4Q49A 1CALA 2POUA 5JEHB 2FNMA 3T84A 2HNCA 4HU1A 2EZ7A 2Q1QA 1CCTA 3F8EA 2WD2A 2EU2A 1JCZA 3D9ZA 5L3OA 1YDDA 2FOQA 3P5LA 5FNIA 1YDCA 3S73B 3M2XA 2QP6A 4M2VA 3KKXA 3U7CA 4YGNA 3BL0A 3VBDA 3S76A 1UGGA 3DAZA 1RJ5A 3M1WA 1FSQA 1IF8A 5SZ3A 3RYJB 1OKMA 1ZE8A 1J9WA 3CA2A 1FLJA 1LGDA 3R16A 2NXSA 1H9NA 4WL4A 1YO0A 1LZVA 5CLUA 3U45X 3DVDA 4M2WA 3C7PA 4M2UA 3RZ5A 4YHAA 5A6HA 1HEDA 3M1JA 4KUVA 1CVHA 1CNHA 1OQ5A 1KWRA 2GEHA 4QSJA 3R17B 3IBIA 4HF3A 2NNSA 4YYTA 5DSMA 1G1DA 2POWA 3PO6A 2POVA 3OILA 4DZ9A 5J8ZA 4QJ0A 3DBUA 3MNHA 3RYXB 4CQ0A 2FNKA 3M1KA 5EZTX 4Q7SA 1TE3X 1TEUX 2HOCA 1Z93A 1IF4A 1CIMA 5SZ6A 4QSBA 4M2RA 3OKUA 1OKLA 2NXRA 1IF9A 4R59A 5EHVA 3RZ8A 5FDCA 3MYQA 3RG4A 1G45A 4ITOA 4MLXA 2OSFA 3P58A 3P55A 4L5VA 2IT4A 4RH2A 4JSSA 3MHLA 4DZ7A 1CNIA 4CNXA 4KNMA 4R5BA 3S72B 5IPZA 3D92A 4Q87A 3V3FA 3MMFA 1CNYA 4ZX0A 5G0BA 4L5WA 5DSJA 3KWAA 2FOSA 4ZX1A 4Y0JA 4QEFA 1HECA 1I9PA 1IF6A 3S97A 4G7AA 4CACA 2H4NA 2FOUA 2HFWA 2VVAX 1HUGA 5BRVA 3F7UA 9CA2A 2CBEA 5SZ7A 4JSWA 1CANA 4JS6A 1G3ZA 3MNKA 4ITPA 1RZBA 4YWPA 4YXIA 1I9OA 4ZWYA 5G01A 4ZAOA 4RIVA 2WD3A 3MHCA 4Q99A 1HCAA 3P3JA 1HUHA 5SZ1A 5AMDA 1BNNA 1IF7A 1CVFA 3RLDA 2WEGA 1CNJA 1ZH9A 3MNUA 3DCCA 4KV0A 1LG5A 3V2MA 4PYYA 1Z9YA 4ZWXA 7CA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M5S A;  3PYK A;  3IGP A;  3V3J A;  4QK3 A;  1ZSB A;  4JSA A;  5JGS B;  3NJ9 A;  4KNI A;  1UGE A;  4RUZ A;  1BNQ A;  3MNI A;  3KOI A;  3M2Y A;  3MDZ A;  3MZC A;  1HEA A;  5SZ4 A;  3F4X A;  4QK1 A;  5C8I A;  3HKQ A;  2NNV A;  5FLQ A;  1V9E A;  5FLO A;  5FLS A;  1G0F A;  4Z1N A;  1JD0 A;  1UGF A;  5EKM A;  5EOI A;  2QO8 A;  1BZM A;  4FIK A;  2OSM A;  3KON A;  4HT2 A;  1CVC A;  3EFI A;  1BNW A;  1I90 A;  3M98 A;  4K13 A;  2NWZ A;  3M5T A;  5JES B;  2ABE A;  4K1Q A;  5E5R A;  5DOG A;  3DC3 A;  4Q0L A;  4QY3 A;  3S75 B;  3GZ0 A;  4FL7 A;  3RYV B;  5BRW A;  4PQ7 A;  1TG3 A;  5FL4 A;  5FNG A;  3DCW A;  4XIX A;  1CNW A;  5BNL A;  1BNT A;  3SBH A;  4E3H A;  4E3G A;  3DVC A;  3OKV A;  4GL1 X;  3OIM A;  1FQM A;  3DD8 A;  1G0E A;  1CNX A;  3MHI A;  4ZWZ A;  3M67 A;  4HT0 A;  2CBA A;  4Q81 A;  1XEV A;  1TG9 A;  3KLD B;  5DSP A;  4PXX A;  4JSZ A;  3HLJ A;  1Y7W A;  4MDL A;  3DV7 A;  4KNJ A;  12CA A;  2FMZ A;  2VVB X;  3K34 A;  4PYX A;  4RFC A;  3TMJ A;  5DSQ A;  1RAY A;  4KAP A;  5FLT A;  4YXO A;  5DSI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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