2NN7A

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase i
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nn7A00
4YGNA 1LGDA 5FL6A 12CAA 1OKNA 3B1BA 5DRSA 3D9ZA 1CVBA 1HCBA 4HF3A 1TH9A 3PJJA 3V5GA 1CNBA 3M40A 3OILA 3DVBA 4ZWZA 2AX2A 4N0XB 3MWOA 4ZX1A 2NNGA 3S71B 2QO8A 5BRUA 1BNNA 3M14A 4MDGA 4Q7SA 4MLXA 4YWPA 4RFDA 3R17B 2VVAX 3UYNA 1BNVA 2FMZA 2WEHA 1CCUA 1RJ5A 1DMYA 2EZ7A 1G52A 4RIVA 1UGDA 5LMDA 1CNIA 1CAKA 1HUHA 4JSWA 1G54A 2HKKA 4XFWA 4Q7WA 3S72B 3P5LA 3W6IA 1H9QA 4Q81A 1YDAA 5DOHA 1BZMA 4KNIA 4YGKA 4GL1X 1ZFKA 4CACA 4Z1NA 3IBIA 4K0ZA 3M1WA 4WUQA 2NXSA 4K13A 3PYKA 3S78B 3B4FA 5A25A 3VBDA 1OQ5A 5HPJA 3MNIA 5G0CA 2CBBA 1F2WA 5DSPA 4HT2A 1FSRA 1J9WA 3P5AA 1I8ZA 5EKHA 2X7SA 4Q49A 2EU3A 3N0NA 5EH7A 2FNMA 1A42A 4QSBA 1JD0A 1KWRA 3DC9A 3HFPA 5FL4A 4YHAA 3ZP9A 1ZH9A 2FOQA 2Q1BA 3F4XA 4CNXA 4RUXA 4FL7A 3RYXB 5SZ3A 5JEGB 1G53A 1I9QA 3OKUA 4ITOA 3M96A 3RGEA 3M2YA 5AMLA 2CA2A 4M2VA 1IF7A 3V3JA 1JCZA 1CINA 3KIGA 3KNEA 4QY3A 4ETQC 4HBAA 2QP6A 4CNWA 4QJXA 5C8IA 2WEOA 3ZNCA 5JG5B 2GEHA 4HEWA 1G3ZA 3K34A 5E2RA 5EOIA 3F7BA 4LP6A 3RZ0B 1ZNCA 3S76A 3S73B 1OKMA 1YO1A 1TG9A 3V3HB 4JSAA 1CIMA 4ZAOA 3T5UA 5JGSB 3EFIA 3KWAA 3OYSA 1IF8A 2OSMA 1CNHA 5DSIA 8CA2A 4E3DA 3DA2A 1BNQA 3M98A 1HECA 2FOYA 4YXIA 1CRMA 3MNHA 4Q83A 5FNLA 1IF4A 3RYJB 1YO0A 5JEPB 1G46A 3KONA 4C3TA 3MDZA 4KP8A 1CAIA 1CCTA 1KOQA 3MHOA 4PZHA 3FE4A 5IPZA 2NN1A 4E3FA 1Y7WA 4Q6DA 4RUZA 5FLSA 3JXHC 1CNGA 3DCWA 2X7UA 3HS4A 3S74B 1MUAA 3SBIA 1FLJA 4X5SA 5BYIA 4G7AA 5A6HA 3RLDA 4HU1A 4QK3A 5EZTX 4TWMA 3RZ1B 4IWZA 3N2PA 3P55A 4Q7PA 5L6KA 3V3GB 1IF6A 4KV0A 5FNIA 4FPTA 1I90A 2NNSA 1TB0X 2FNNA 3M67A 4YXOA 5FNGA 4WW8A 3S8XA 1CZMA 4L5UA 4KUYA 1IF9A 4LHIA 4CNVA 2POVA 4QSAA 3C7PA 3HKUA 3MZCA 1I91A 5FNHA 1RZBA 6CA2A 3R16A 1KEQA 5FLTA 1ZSCA 2NWOA 1YDCA 3MMFA 3NB5A 1CRAA 4XIXA 1BN1A 4L5WA 3RYYA 2Q1QA 3QYKA 5G0BA 1LG5A 3M2ZA 5FLPA 1H4NA 4WUPA 4HEYA 3KS3A 4Z0QA 5SZ0A 4YVYA 3LXEA 3DVDA 4Q06A 1G0FA 3DV7A 2Q38A 1KOPA 4RIUA 1BV3A 3P3JA 1HEBA 4KNNA 1DCAA 3HLJA 4ZWXA 4KUVA 3RYVB 2WD2A 1EOUA 5BRVA 3V3IB 3Q31A 3P3HA 3T85A 1URTA 3RZ8A 5E2MA 3D0NA 4QJOA 1I9LA 4CA2A 2H15A 3RG4A 4Z1KA 4Q87A 2HFWA 5L3OA 1ZSBA 1G48A 2HOCA 2FOUA 3PO6A 3D8WA 5JQ0A 2CABA 5DSOA 1ZFQA 3MYQA 4R5BA 4TWLA 2ABEA 4PXXA 1RAYA 1HCAA 5J8ZA 5JQTA 2WD3A 1RZEA 1ZGEA 4WL4A 2NXTA 5SZ1A 5EKJA 5FLRA 4E5QA 3TMJA 4FRCA 1BNMA 4YGFA 3HKTA 2WEJA 4MO8A 2WEGA 1FQMA 5EHEA 4E4AA 5E2NA 5JG3B 2FMGA 3M1JA 4Q8ZA 1UGGA 5SZ2A 4Q9YA 4IDRX 5EHVA 4E3HA 4JS6A 3MNKA 2O4ZA 4G0CA 2FOSA 5E5UA 1RAZA 2FNKA 4K1QA 3F7UA 1RZDA 4Q07A 5G01A 3NI5A 1HUGA 2NNVA 4K0TA 3T5ZA 1CAJA 3RZ5A 5AMDA 5DSLA 2NXRA 3RG3A 4BCWA 1Z97A 3V7XA 3K2FA 1YO2A 4Q8YA 4CQ0A 1MOOA 1RJ6A 4RUYA 4MTYA 5DSKA 3S75B 2W2JA 5FDIA 5EKMA 1I9PA 3TVNX 3D92A 5EH8A 3U3AX 5FDCA 3ML5A 1CAOA 3IBUA 4PYXA 5AMGA 2H4NA 2OSFA 4BF1A 3N4BA 5E28A 1TEQX 2POWA 4K0SA 3RJ7A 1CNWA 3M04A 2CBDA 2HD6A 3M5SA 4YYTA 4R59A 3DAZA 3IGPA 4LU3A 5BNLA 1CNKA 1BNUA 4WR7A 4YGJA 3M1QA 3V3FA 5SZ5A 3JXGA 4DZ9A 1FQRA 3MHIA 3W6HA 3HKNA 3MNUA 4QJPA 1FR7A 4Y0JA 4ZWYA 3DCCA 1H9NA 2NWYA 1THKA 5FLOA 4YX4A 1AZMA 3TVOX 3KOKA 4JSSA 3SAXA 1CVDA 5CLUA 2X7TA 1DMXA 4XIWA 3UYQA 1CA3A 1TEUX 1FSQA 2POUA 3OIMA 1CVFA 2IT4A 3U45X 1XQ0A 3F8EA 3MNJA 1CAMA 4KNMA 2CBEA 4R5AA 4KUWA 4Z1JA 4MDLA 1CVEA 3S97A 3M1KA 4YXUA 4QSIA 1Z93A 1G6VA 3IBLA 1HEAA 5FNKA 5CA2A 1TG3A 2FW4A 1XPZA 1UGFA 3IEOA 1ZSAA 3T84A 3IAIA 3P58A 2NN7A 3M2XA 4Q99A 4ILXA 1BNTA 3NJ9A 2CBAA 5DSMA 3M3XA 4ITPA 3KKXA 2CBCA 4PYYA 1LZVA 4QK2A 3MHCA 3U47A 5BRWA 5DOGA 2HL4A 4CNRA 3P4VA 4RFCA 3HKQA 4RH2A 4KNJA 3CYUA 5EHWA 5E2SA 4Q08A 1FQNA 1CNYA 4HT0A 3BL0A 4BF6A 4Q90A 4QIZA 4PQ7A 4QTLA 4M2WA 3CA2A 4XZ5A 1OKLA 4QSJA 1UGCA 3RZ7A 3M5EA 1DCBA 2NNOA 1BNWA 1G45A 3L14A 4KAPA 5EIJA 5JEHB 3M5TA 4QEFA 1TTMA 4ZX0A 5E5RA 1CNXA 9CA2A 5FNJA 3MNAA 4QJWA 1I9NA 2EU2A 1JV0A 2FOVA 3MHMA 3DBUA 1ZE8A 1V9EA 3EFTA 4E49A 3KLDB 3SAPA 2NWPA 1TE3X 3CZVA 3BL1A 5FL5A 1BCDA 5DSJA 1HEDA 1RZCA 5DVXA 2NMXA 1BICA 7CA2A 1UGBA 5SZ7A 5CJFA 4HEZA 4Q8XA 1RZAA 5CACA 3DD8A 3OY0A 4RN4A 4QK1A 1T9NA 4XE1A 2HNCA 1UGEA 1FR4A 1V9IC 4WW6A 1G1DA 3DVCA 4Q6EA 3S77B 1CVHA 3D93A 1YDBA 1CVCA 1G4JA 1CAYA 1CCSA 3JXFA 4M2UA 4COQA 3DCSA 3V2MA 3OYQA 3KOIA 4QJMA 5JGTB 1CAZA 4E3GA 5JESB 2ZNCA 3DC3A 1CNJA 4YGLA 5DSQA 3IBNA 4MLTA 3FFPX 2ILIA 4L5VA 3S9TA 1CALA 5G03A 4QIYA 1HVAA 2AW1A 2NWZA 4FIKA 3RYZA 5FLQA 3DD0A 4KP5A 4Q78A 1CANA 3GZ0A 1CNCA 4FU5A 4Q7VA 1AVNA 4N16A 1FQLA 1LUGA 5SZ4A 5SZ6A 3M2NA 2VVBX 1LG6A 4JSZA 4Z1EA 1ZGFA 4FVNA 1I9MA 3CAJA 5E2KA 1Z9YA 4FVOA 1AM6A 1IF5A 3OIKA 3BETA 1BN3A 1FSNA 1YDDA 3U7CA 4M2RA 2QOAA 1TBTX 1UGAA 1CILA 1I9OA 3OKVA 3FW3A 3P44A 3V2JA 4Q09A 4ZWIA 1G0EA 4Q0LA 1G4OA 5DSRA 4DZ7A 3N3JA 1CVAA 1BN4A 5EH5A 1KWQA 2GD8A 1XEGA 2F14A 3T82A 5DSNA 5JDVB 3MHLA 1CA2A 3K7KA 4MDMA 1XEVA 4QJ0A 4E9OX 4UOVA 3SBHA 1CAHA 3ML2A 5FNMA 3T83A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4YGN A;  1LGD A;  5FL6 A;  12CA A;  1OKN A;  3B1B A;  5DRS A;  3D9Z A;  1CVB A;  1HCB A;  4HF3 A;  1TH9 A;  3PJJ A;  3V5G A;  1CNB A;  3M40 A;  3OIL A;  3DVB A;  4ZWZ A;  2AX2 A;  4N0X B;  3MWO A;  4ZX1 A;  2NNG A;  3S71 B;  2QO8 A;  5BRU A;  1BNN A;  3M14 A;  4MDG A;  4Q7S A;  4MLX A;  4YWP A;  4RFD A;  3R17 B;  2VVA X;  3UYN A;  1BNV A;  2FMZ A;  2WEH A;  1CCU A;  1RJ5 A;  1DMY A;  2EZ7 A;  1G52 A;  4RIV A;  1UGD A;  5LMD A;  1CNI A;  1CAK A;  1HUH A;  4JSW A;  1G54 A;  2HKK A;  4XFW A;  4Q7W A;  3S72 B;  3P5L A;  3W6I A;  1H9Q A;  4Q81 A;  1YDA A;  5DOH A;  1BZM A;  4KNI A;  4YGK A;  4GL1 X;  1ZFK A;  4CAC A;  4Z1N A;  3IBI A;  4K0Z A;  3M1W A;  4WUQ A;  2NXS A;  4K13 A;  3PYK A;  3S78 B;  3B4F A;  5A25 A;  3VBD A;  1OQ5 A;  5HPJ A;  3MNI A;  5G0C A;  2CBB A;  1F2W A;  5DSP A;  4HT2 A;  1FSR A;  1J9W A;  3P5A A;  1I8Z A;  5EKH A;  2X7S A;  4Q49 A;  2EU3 A;  3N0N A;  5EH7 A;  2FNM A;  1A42 A;  4QSB A;  1JD0 A;  1KWR A;  3DC9 A;  3HFP A;  5FL4 A;  4YHA A;  3ZP9 A;  1ZH9 A;  2FOQ A;  2Q1B A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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