3A0IX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a0iX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3a0iX01
2P9PB 3LDOA 2QM1A 5AFUA 3H1VX 3O80A 4WQ4A 5EVZA 3EO3A 2PBDA 4H0VB 1HLUA 2GWKA 3FFKB 3SMPA 3R8EA 4BRQA 2QWMA 4KBOA 1GLAG 3A8YA 4Y0WA 1QZ5A 5KPTA 3AY9A 3L4IA 2AP1A 2BTFA 1JCGA 1LCUA 2Q0UA 5E26A 1BOTO 4C23A 3LDNA 3VGLA 3WQTA 5AQVA 2A3ZA 2YJEA 4BVPA 4CZEA 4CZMA 3O8MA 3KVGA 5AQHA 5AQNA 4BRDA 4FSVA 2D0PA 4CD1A 1NWKA 2QW9A 1KAYA 2GELA 4H5WA 3VEZA 1NBWA 1MA9B 4MLHA 3DXKA 4B1WB 3SLCA 4I6MA 1BO5O 3VGMA 4BRGA 2A6AA 2IVOA 3VESA 3DXMA 1BA0A 3MCPA 3O5BA 4BC2A 1NGIA 2D1KA 3CJCA 4IO8A 4NO7A 2P9UA 1Q18A 1NGHA 2Q1NA 1G99A 3WEEB 2J4RA 1QZ6A 5AQPA 3ATVA 1GLJO 1TYQB 2GTDA 4FWNA 4JHDA 3CIPA 4JNEA 2UYTA 1DGKN 5AQIA 3O4WA 3MN9A 3UB5A 3VF6A 3QB0A 1HJOA 2A42A 3UKUA 4BR9A 1TYQA 2W41A 3HM8A 2P9SB 3WT0A 3I8BA 3ZX0A 1U2VA 5BRDA 1Z6RA 5EY4A 5AQSA 3ZX2A 5AQOA 2NZTA 3O6WA 3U9DA 3KHYA 2YCHA 2I7NA 3EZWA 3A5OC 3ID8A 4BQZA 1KXPA 3D2FA 4BQLA 3C7NA 4A2AA 2P9KA 3RSEB 2E1YA 2GUPA 3C0BA 4PKHA 1K8KA 1YVNA 2E2QA 2CGLA 3LM9A 1Z05A 4QS9A 2P9NA 5BRFA 2E2NA 4BC5A 5AQXA 3RSEA 4B1UB 4JN4A 3HSCA 1DEJA 2Q36A 2ASMA 5F2RA 3JS6A 3KZBA 4BREA 3BEXA 2VCPA 3BUZB 4FWOA 3MMVA 1T6CA 3FR0A 3QBWA 4EFHA 5AR0A 4BRNA 5CE3A 1NMDA 3DJCA 1ATRA 4CBXA 1GLBG 4BVOA 1KAZA 4E1JA 4BRLA 3JXUA 1V4TA 3MN7A 3R6MA 2KHOA 4JD2B 3SMSA 3LDQA 2EWSA 4M7YA 5F1XA 1T44A 3HI0A 4WQ5C 2P9PA 1XC3A 3VEVA 3HTVA 4FWKA 2QWLA 3HZ6A 3B8AX 4BGBA 5KPZA 5AQZA 1X3MA 3A5NC 3SJHA 3H6EA 3QFPA 3FZFA 4WYBA 4EIAA 5I9EB 1GLFO 2P9LB 3H45C 4CI6A 1QHAA 4CJ7A 5KPRA 5FPMA 2FSJA 3H3OB 3QICA 1X9JA 2HF4A 1JCFA 2CGJA 2CH6A 3EN9A 5AQGA 4CZGA 1NGGA 2OANA 3OHRA 4CZFA 1RGIA 2IVPA 2WUSA 2QWNA 4IJNA 5JICA 2NRHA 3IFRA 2DPNA 4EHUA 2QWQA 5BPLA 3VETA 4NB4A 2P9IB 1H1VA 3ZETB 2A40A 1GLLO 4H03B 4M63C 1S22A 3CJAA 3MN5A 3FZHA 1NGDA 4H5VA 4Z94A 2IVNA 3UKRB 4YDUA 2GEMA 3CQYA 4FWRA 4BC4A 3LDLA 4BRMA 2FLOA 3CETA 5B8HA 2V7YA 2V52B 3CQXA 5BREA 4M7XA 3P4IA 4RCHA 1D4XA 3ENOA 3WEEA 4DB3A 3H3NO 5BPNA 1BWFO 4H0TB 4EHTA 4K42A 3WUHA 1ATNA 5F0XA 4WQ4C 1EQYA 4XH1A 4A62A 4B9QA 4L3QA 2W40A 3CJ1A 4B1YB 3M1FA 1C0GA 3FZKA 3VGKA 3TU5A 2VYPA 4ISFA 3WXKA 2P9SA 1NGCA 2YJFA 2ASPA 3IUCA 2E8AA 4DQ8A 1C0FA 2ZGYA 3G25A 3WXLA 4CZIA 4PKGA 1GLEG 4H0OA 3HBTA 2YHWA 4IWVA 2FF6A 4DCHA 4BRKA 3MDQA 2Q2RA 3WXJA 3ZEUB 1T6DA 3F9MA 3BF3A 3LL3A 5JLHA 3VERA 3AAQA 4RWTA 4FOEA 3ZEUA 2QWOA 3ENHA 3O1BA 4XH5A 4CZKA 2E2OA 1YAGA 4RTFD 5EX5A 5AQMA 1QQNA 2E20A 3VEYA 3FGUA 1J6ZA 2AA4A 4FWSA 4IXCA 3BF1A 2F9WA 3ULEB 4QS8A 3H1QA 5AQWA 1XUPO 5E84A 2FSKA 5AQQA 3DWLA 4BRPA 5EOYA 2E2PA 3WXIA 3DAWA 4CZHA 2ZWHA 4CZLA 4YDUC 4FO0A 4BRFA 4F9OA 5AQUA 3FZMA 3A5LC 2V51B 3VEWA 3D2EB 1IG8A 3VPZA 4JD2A 4BRAA 4FWPA 3QDKA 1QQMA 1NM1A 3AARA 4CBWA 5TKYA 4CD3A 2HF3A 3IDHA 3VEXA 3BP8A 1NGEA 4JAXA 4MO5A 1BG3A 2IIRA 1RFQA 2YHXA 1HKGA 2CH5A 4XH4A 2ITMA 3FE1A 1S3XA 5KQDA 4H0YB 2H3GX 1NGFA 2Q31A 3MN6A 4J8FA 1HKBA 3VF2A 1NGBA 4HWIA 1ATSA 3AAPA 3CJBA 5LJVA 1NGJA 2A5XA 1KAXA 3M3ZA 3S41A 3ATUA 1JCEA 4ISGA 1RDWX 2PAVA 2P9LA 5AQKA 5AQJA 2QWPA 3QBXA 5BN8A 4BR0A 4AM7A 2CGKA 4B1VA 3U8XA 2GWJA 5BRHA 2A41A 2HMPA 1ZXOA 5FPDA 3QMLA 1LOTB 5BN9A 4ISEA 3FZLA 3MK6A 4EAHD 3D7EO 4FOIA 4B1ZA 2ZF5O 4H5RA 4PL7A 1YUWA 1MDUB 2VWBA 4QS7A 3LM2A 2ZGZA 4GY2B 3L0QA 3A5MC 3GDQA 5AQLA 3CJ7A 4FWQA 4K41A 2YHYA 4O5FA 2P9IA 4LC9B 3ZETA 4BROA 4CZJA 5ADXH 3DXKB 1WUAA 5AQRA 4PKIA 3SK3A 4BR4A 4I6MB 2QWRA 5AQYA 4FL9A 2HOEA 2FF3B 3W3DA 5LY3A 3DXMB 4IJAA 4O8KA 1ZBSA 3L6QA 2E1ZA 1XQSC 3UKRA 3VOVA 2Q0RA 2YI1A 1GLCG 4GNIA 2P9UB 3M6GA 1MWMA 5FPEA 3VEOA 1BUPA 4A61A 1TUUA 1BDGA 3CI5A 5KQ8A 4FWLA 5AQFA 5LJWA 1GLDG 1DKGD 5AZIB 4BRHA 4JHDB 4BR7A 1HPMA 1BA1A 4A2BA 2ASOA 4PL8A 1NLVA 3LDPA 1HUXA 3UKUB 3U9ZA 3H46O 1V4SA 3A0IX 1P8ZA 5AZIA 3EL2A 3GE1A 4H0XB 3W0LA 2NLXA 1ESVA 4FPAA 2E88A 4AM6A 4WQ5A 1U2VB 4BR2A 4BG8A 5ADXA 1TUYA 5AQTA 1CZAN 5EXWA 1HKCA 2I7PA 4H0PA 4H5NA 3U4LA 3CJ9A 3D2FB 2V7ZA 2D0OA 3VENA 4FWMA 3C7NB 3QFUA 5JLFA 4XEIA 2P9KB 1SAZA 1K8KB 3EKUA 2BUPA 1X3NA 1IJJA 2P9NB 1WOQA 2FSNA 1BU6O 3O08A 1OKJA 1SQKA 4HTLA 1YXQA 3ZX3A 3GL1A 5ELZA 4BRIA 4K25A 3GG4A 5AFUH 1QQOA 5JMVA 4MLEA 4BRCA 4BR5A 3GBTA 4H5TA 1Y64A 4K43A 3O1WA 3ULEA 2QXLA 2F9TA 5AZJB 1ZC6A 3I33A 4CBUA 3TPQA 3IMXA 4IZ9A 4BG9A 2D4WA 4B1XB 1E4FT 3CERA 3R9PA 4BGAA 3VF4A 5AZJA 1R59O 4DHYA 1E4GT 3CHWA 2FXUA 3FLCO 5FPNA 4BC3A 4MO4A 3UE5A 2Q97A 1U6ZA 3D2EA 3GOIA 3EKSA 4FPBA 3WQUA 5BPMA 3J8AA 1SZ2A 5BR9A 1NGAA 1MWKA 1HX1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OLBA 1T03A 4F3OA 2NUBA 3H1VX 3EY1A 4WQ4A 1U45A 3CCEN 1RDCA 1YHQN 2UXBK 4JK9A 3TARA 5JVGL 2YKNA 4KBOA 4OKKA 1WBDA 3AVLA 1JXEA 2EX3A 3A8YA 3L2QA 4CJUA 3B6OA 3OBYA 3AY9A 4FZXC 2AP1A 3I55N 5J2NA 3DOLA 4CF9A 1BOTO 4C23A 4E3SA 3LDNA 1VQ5N 4DV4K 5AQVA 3LP2A 3MWPA 1C0TA 4R79A 1UA1A 1L3SA 4IEIA 4B3MK 1KVBA 3ALYA 4HHTA 4I7FA 4M45A 3TSUA 4JRQA 2P51A 4ID1A 3OYEA 4CD1A 3KLHA 5GAGP 4BE1A 3WXMB 4H5WA 4CEDA 4AHVA 5CYMA 3C6TA 3S3OA 2KZZA 2RE2A 3OTOK 4BWJA 3TTDA 2X74A 2A6AA 3QLHA 3THWB 4CJ5A 1BA0A 4BC2A 3CJCA 1WSFA 2O4IA 4DSIA 2YX6A 1HPZA 3PX6A 1YIJN 5J2QA 1NGHA 2Q1NA 2KFNA 3WEEB 3PIOL 4GV9A 4JI8K 4F8RA 1GLJO 4FWNA 4M41A 4JS4A 3CIPA 3CC2N 4HUGA 3OYLA 4CEOA 2ATQA 3QB0A 4CJEA 1KCFA 3WT0A 2YKMA 1TL3A 2UXDK 3SI6A 2R7YA 2NZTA 3U9DA 2OCEA 2YCHA 2I7NA 3CCQN 1I3AA 3TABA 4DQSA 2HB5A 4RW4A 4A2AA 3RSEB 5I3UA 4A59A 1YVNA 2CGLA 3KK2A 1N32K 2W42A 1D5AA 3V9ZA 5AQXA 3QESA 3SAHA 4E19A 4JN4A 1P90A 3JS6A 1QHTA 2WFBA 1VQ4N 4BREA 3BUZB 4DQQA 3NAEA 5AR0A 5CE3A 4JI2K 1NMDA 3O9TA 1ATRA 4DV3K 1RT6A 3NBPA 4E1JA 2BDPA 1V4TA 3OYMA 5DMRA 4JD2B 2HVHA 4LFBK 4OLAA 4MDAA 2VG6A 3HI0A 1K73O 3TSPA 3HTVA 2QWLA 4JI4K 2FBVA 4BGBA 5KPZA 3U6FA 3HRGA 3H6EA 4EIAA 3LAMA 5I9EB 3P83D 4CJ7A 5FPMA 3CM6A 5LMNK 3VA0A 3LAKA 1X9JA 2ZM6K 4LD0A 4YOYA 1C1AA 1NG9A 1IO2A 2CH6A 3EN9A 3ZSWA 4RW8A 1XI1A 4J2DA 2QI2A 4OKEA 1N5YA 5M1QA 3WNGA 5GAEP 1QE1A 4WE1A 4UQGA 1RT7A 4OGCA 3T3FA 3SCXA 5HRNA 4CGFA 3ZETB 4E0DA 2O8BB 2E4LA 2F8SA 4PA1A 3G10A 4M63C 1QVGM 2OA8A 4FLUA 4JS5A 3NF7A 3DOKA 1XWLA 4FWRA 3UKRB 4JI5K 2FLOA 2F4VK 3EYZA 2D5RA 2PFUA 2V7YA 4CJVA 2HW3A 4LH5A 3CQXA 3SV3A 4DB3A 3H3NO 4KFBA 3VQ6A 1WN7A 2WONA 4DFKA 3J7AP 4CEEA 4A62A 4DTPA 4L3QA 1WNSA 2W40A 4B1YB 1R0AA 1NJWA 3M1FA 1JLQA 1X1PA 3FZKA 5M1NA 4ISFA 1KFDA 2P9SA 3K0SA 1NGCA 2ASPA 1YITN 2UUBK 2ZGYA 2DFEA 1NK8A 1NK9A 2EHGA 4PKGA 3PLAA 2Q3SA 5C25A 1FXXA 1WSGA 3LANA 2ZJPL 2YHWA 1WLJA 4BRKA 3MDQA 3OS0A 4FJ8A 2HHTA 1XNRK 1T3VA 4MDBA 3D45A 5JLHA 2GX9A 3AAQA 4CJSA 4FM2A 2PYLA 4RWTA 1VQKN 3ZEUA 1TV6A 3ENHA 3O1BA 4CZKA 2E2OA 3SZ2A 1LAVA 2F7TA 4FVUA 2IAJA 2OTJN 4OPAA 2G8KA 3VEYA 4YOVA 4KTWA 3OYJA 3AO4A 3HO1A 4C8NA 4QS8A 1Q9YA 5AQWA 4J2AA 4H4OA 3SUOA 2D0BA 4EP5A 5EOYA 2GV9A 3TAQA 1W2BM 3WXIA 3JYTA 3ZLJA 1ITGA 2ZWHA 1J5OA 4FO0A 3QERA 3DM2A 1IH7A 2VWJA 1FW6A 5AQUA 3OS2A 1U47A 3D2EB 1D9FA 5J2MA 2ZQBA 3QDKA 4JYAK 4CBWA 5TKYA 4CD3A 3BP8A 4JAXA 1YI2N 4B9NA 2YHXA 2CH5A 4OJRA 3IKMA 4ZTFA 1IKVA 1S3XA 4H0YB 4TSXA 2AJQA 3VF2A 4HWIA 4HVJA 2PZSA 4JI3K 1ATSA 3L8BA 3TAGA 2QEXN 1LW2A 3M3ZA 4ELVA 2B5JA 4IBNA 2P9LA 3LWMA 3SJJA 2QWPA 1NNEA 3AA4A 4CIFA 3UIQA 2CGKA 4FK0A 3KLGA 4XIUA 3U8XA 3VQAA 5KRSA 3HPOA 3QMLA 3CYMA 5BR8K 2BGGA 1LOTB 5BN9A 2NRXA 3V9XA 3MK6A 2HVIA 3D7EO 3NGYA 4DR4K 1YUWA 4GY2B 3P31A 2VG5A 5AQLA 4FWQA 3LZJA 4O5FA 4OX9K 1EWQA 2G8FA 5AQRA 4PKIA 3EE9A 4IFYA 3TTFA 2FF3B 3HXMA 4IJAA 4O8KA 2HMIA 4DKWA 1ZBSA 3IAYA 3THYA 1A5VA 3J81O 1XQSC 1S1TA 4CHNA 1BUPA 1TUUA 4DTMA 5I42A 3CI5A 5AQFA 3RVCA 1GLDG 1Q82O 1HPMA 1RCHA 3QIOA 4PL8A 1NLVA 4ILGB 3AO2A 3KD1E 1HUXA 4JKCA 1RTDA 4NYNA 4BDPA 1L5UA 1V4SA 4HUEA 3AVKA 5AZIA 4AM6A 5E41A 3K2PA 4M3UA 3OJUA 1Z26A 4DFMA 4W5OA 1HMVA 4FWMA 3QFUA 2HHWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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