3A5FA

High-resolution structure of dhdps from clostridium botulinum in complex with pyruvate
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
291
structure length
289
Chain Sequence
SIFKGSGVAIITPFTNTGVDFDKLSELIEWHIKSKTDAIIVCGTTGEATTMTETERKETIKFVIDKVNKRIPVIAGTGSNNTAASIAMSKWAESIGVDGLLVITPYYNKTTQKGLVKHFAVSDAVSTPIIIYNVPGRTGLNITPGTLKELCEDKNIVAVEASGNISQIAQIKALCGDKLDIYSGNDDQIIPILALGGIGVISVLANVIPEDVHNMCELYLNGKVNEALKIQLDSLALTNALFIETNPIPVKTAMNLMNMKVGDLRLPLCEMNENNLEILKKELKAYNLM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
publication title The high resolution structure of DHDPS from Clostridium botulinum
rcsb
source organism Clostridium botulinum a
total genus 111
structure length 289
sequence length 291
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2009-08-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3a5fA00
3Q58A 2C6QA 2E6DA 5U7SA 2ZRYA 3MBDA 4NNAA 2NXGA 4UMAA 4FNUA 1JCXA 2V81A 5KTLA 2J24A 3G18A 3QW3A 4MJZA 4O1CA 3O63A 1VLIA 3WK1A 1W5NA 3UZ5A 1W0MA 3W7QA 5FF3A 2YGYA 2QUTA 4LVBA 2X1UA 1W31A 3CPRA 4IMDA 2CLFA 1R2SA 2YZRA 3PULA 3ATZA 4OU1A 1BWLA 3OIXA 4G1KA 3W1RA 4BFAA 1RVGA 4U28A 2QEZA 3SGZA 4DO4A 2ZTJA 1SUXA 5AOUA 4Z1BA 2AGKA 1TPEA 1H1ZA 3HJZA 4N9CA 1JCNA 3UNDA 1L9WA 1N55A 3M43A 3MO7A 1JJKA 3C56A 3LHTA 4IX0A 2NX9A 5J5RA 4EF8A 3KVMA 1VYRA 4NXKA 4XZ9A 4MOZA 3NQFA 4JS3A 4M6PA 5G2HA 1SZGA 1TQXA 1OX4A 3P8JA 4O13A 2QCGA 1M6JA 2I14A 2DZSA 3W76A 2PRLA 4MZ8A 5KMYA 4O10A 2RKXA 1TPDA 4YCOA 3GNDA 3MYOA 5BMWA 3MI2A 4PODA 5C2XA 1KW1A 3P8IA 1JUKA 3NVTA 3NOEA 3TIMA 3OVQA 2ZTKA 4M6QA 3W2NA 4IJBA 2V5LA 4JGDA 3FFSA 4OQVA 4GBUA 2WOQA 4UTWA 1AG1O 4ZQPA 2BWGA 3LGEA 5HUPA 1VCFA 3R5EA 2DORA 4JTLA 3GXNA 3LX9A 4AVFA 3SFKA 4O54A 3IRDA 3P67A 3EB2A 3QC3A 3OA3A 3G1DA 4A22A 4K7YA 1C29A 5EPDA 2QCNA 1TRIA 1G6CA 1YLVA 3LCWA 3PG8A 3W74A 3R2GA 5AHIA 4JXCA 1OYBA 4MFEA 4UTLA 5MHBA 3HPSA 1F6PA 3W2KA 3LCHA 2A7NA 5AB3A 4ORIA 1FXPA 5GVJA 3P5YA 4BI7A 2V30A 3G1VA 4LV4A 1QWGA 3CLMA 5FF4A 2FIQA 1FWRA 4IPJA 2YPIA 2W0UA 2B4GA 2QCHA 1TTQA 3DAQA 1X1OA 3WFAA 2P1FA 1FDYA 1C9DA 3HPZA 4KWVA 3HQ1A 3G24A 3NQ6A 1P0NA 4UNLA 4JEQA 3I65A 4UFKA 3NEVA 2NUWA 2FB2A 4LS2A 3BLEA 4LRSA 1TV7A 2JGQA 1JULA 5C54A 2ISVA 4BK9A 1SO6A 1VH7A 1LTDA 2QDHA 2Z6JA 2Y61A 3T7VA 5ABTA 2LLEA 2V5BA 2C16A 4IMGA 4ZQCA 4FXSA 4AWTA 2XN1A 1DORA 4IX2A 3GKAA 3M7WA 3RU6A 4AAJA 5CSSA 1GVQA 4AHOA 4ZZ9A 5AYZA 3TW6A 3A22A 4RLIA 1JCLA 1IGSA 1N8FA 5I3FA 3QFEA 2HTMA 2YDAA 3L67A 4N9EA 3BGJA 1S5TA 1O94A 3ATYA 2CLMA 3B05A 3GXTA 2G95A 2RDWA 5FESA 3CM4A 4BF9A 4PC8A 1KM5A 3E12A 2Y63A 3TXZA 1ZCOA 4RV8A 1AW1A 1CX9A 3TROA 3IVUA 2ISWA 4AB4A 5F4XA 1WA3A 1G69A 5D37A 4ZQRA 1O5XA 1NAL1 2A6NA 1EP3A 4ADSA 5D2TA 1Q6RA 3NXFA 1AK5A 2ZDRA 5DCDA 3TQ0A 4QJ1A 5K4ZA 4AEOA 3W7LA 3T40A 1VC4A 1PVNA 2A6LA 1KFCA 1FXQA 5LGZA 4TO8A 4UCGA 4QIUA 2CLIA 1A5BA 3PR2A 3ABRA 2WSRA 1HUVA 4XKYA 2A4AA 3T55A 4CNPA 3M6YA 1RPXA 5T26A 3L2IA 3NGJA 2R94A 1SPQA 1VRDA 2OCZA 2BX7A 1FCQA 4LTSA 1D9EA 1W5OA 4LT9A 3S1WA 5K2ZA 4R33A 1OF6A 1ZENA 1S3HA 4JYFA 5BW6A 3NQ7A 1R46A 1AW2A 1B3OA 1YXCA 3NQCA 1LCOA 2WNNA 3EWXA 5DBTA 3LERA 5AN7A 5HMSA 3G1HA 3IIOA 4E2DA 3FA5A 2X1TA 1RZMA 3N19B 3RF9A 1H50A 3FOKA 2BSLA 4LC6A 3NQDA 4LC8A 1IXPA 4LVAA 1ICQA 3O6DA 3EWUA 4K38A 3TXVA 1CI1A 4GXMA 4ALDA 4NJKA 5AHEA 5H2ZA 1P5BA 1DQXA 1XDMA 2WQPA 3I68A 1YADA 3EEGA 3NNTA 2P10A 2NLIA 4O28A 5LNSA 2QUVA 2G5WA 3UWQA 1LOSA 4BR1A 3N9SA 3PS7A 4Q4KA 4EF9A 5DY3A 1QO2A 1QPRA 4AF0B 3TDFA 1GTEA 1KBJA 3LBMA 5D05A 4I7VA 3LXCA 3TU9A 3P60A 4GE8A 2C3ZA 3MMTA 4U4MA 1TTJA 3ZWSA 1U5JA 1ZAJA 4UFIA 1YPIA 4A29A 2O7SA 2X16A 5CKSA 3N2XA 1A53A 1V5XA 2QCMA 5HWMA 3S5ZA 5K9CA 3N3MA 1G4EA 4PA8A 1LLWA 4IWWA 3UWWA 1R30A 5D2VA 3TQVA 1PCWA 4MPQA 3LXAA 3W7OA 4DBDA 2YW4A 3FEMA 1V7YA 4AMAA 1AL7A 5AHLA 2VFHA 4ZMGA 3QSRA 1GQNA 1WYIA 1SFJA 4XBSA 4DF1A 1TPUA 3PSWA 3G8EA 4ZVJA 3RFAA 3W1UA 1UUOA 3PVFA 1EIXA 3NL5A 1OFAA 2DZWA 2ZRWA 4XQ6A 1QOPA 1ZNNA 5KITA 3PBUA 1WV2A 3GB6A 3MHGA 3JRKA 3LCIA 1UJPA 2AAMA 3DZ1A 1I4NA 5TQLA 4IXHA 4JYEA 4N4PA 1T99A 2EGZA 2CZ5A 3VKJA 3BLIA 1G67A 3EX6A 3MJYA 3SJ3A 4LY8A 3VE9A 4FF7A 3UWUA 3P7YA 1B9BA 4E0CA 4WXZA 3STFA 1Q6OA 2WNQA 1F2JA 3S1XA 3U6WA 1O95A 4LWWA 4UTKA 3DI0A 3HIJA 4UTTA 1ZAIA 1JCYA 4AH7A 3DI1A 1CW2A 4CCDA 1R2TA 5CZTA 2A21A 3NQEA 3W7RA 5AC7A 3SECA 3KAOA 3HG3A 2E5DA 5D32A 2H8XA 1HO4A 4JX6A 2Z1BA 2IQTA 4CCCA 2UV8G 4O14A 3W1XA 3C8FA 3PBYA 1FDJA 3T78A 3HGSA 1J2WA 1OK6A 4JTJA 3W22A 4GJ1A 2ZZ3A 3CIWA 4M19A 1E51A 2B0MA 4GUIA 2QR6A 3B04A 3TR2A 1Z48A 3W2MA 5D2XA 4DEFA 2VENA 3S0CA 2Y7EA 1W56A 3ABQA 2QJIA 2WSQA 4UFHA 4P2VA 5F2GA 2DZXA 3M5YA 5AHMA 3DHDA 2VFGA 4HNNA 3OHIA 1GG1A 4DQWA 3W71A 1W8SA 2ZZ4A 3S1VA 3DFTA 3O1NA 4WY0B 2VEIA 4WOZA 2Z6IA 1JCJA 1WOAA 4O15A 2PURA 3U8GA 4X9SA 5G4WA 3W1MA 2ZCGA 3E02A 1MO0A 4JX5A 2VEKA 5LNVA 2FQIA 3W7NA 2DJXA 5FEZA 1W37A 1F05A 1KFKA 3GAYA 5FF7A 1KTCA 3DFSA 2WNZA 3SW6A 4JY9A 5G5IA 2Y7DA 4HIBA 1ONRA 4DPPA 3IIVA 2GJNA 4AHQA 2X1RA 1W1ZA 3LTPA 7TIMA 1SW0A 3M44A 1TB3A 5CSRA 3PC0A 1LOLA 1YDOA 4GC4A 3MP3A 3N9RA 3PWAA 2E5BA 3NPXA 1YTEA 4WD0A 5EMUA 3EWWA 2OJPA 4Z08A 2YSWA 4N6FA 3W72A 3N73A 4X22A 1XM3A 3W75A 3DFOA 2NX3A 3IGUA 2DJLA 4XWUA 4LUJA 1OFOA 3SIZA 2Y89A 1YXYA 5LSMA 3JS3A 2V8ZA 4DO6A 1H51A 4KFNA 1ZFJA 2W79A 1TPH1 4K7VA 5K4XA 4UTWC 1TREA 4JTHA 2V82A 1WX0A 3LLFA 3L21A 3BV4A 3W2UA 3W7GA 4AHPA 4GWEA 2YFOA 3G1XA 1W5MA 4Q33A 3W1LA 3MHFA 5DN1A 2QAFA 3PB2A 3LM7A 3MP4A 3O16A 3C2FA 3EKLA 1EEPA 1FCVA 1KM2A 3H55A 4O0ZA 1LBFA 4S2CA 2Y85A 3W7DA 1X6UA 1TPVA 4HSNA 4M6VA 2F84A 3NA8A 3THAA 3TAKA 1GZGA 1TYGA 4CNNA 3GDTA 1F6KA 1VCGA 1EPXA 1ZJIA 3HG4A 1JRCA 2GQ9A 2WJZA 4D2JA 2E6FA 3HGRA 3LCFA 1TPFA 1VHNA 4UTMA 1ICSA 1KM3A 3LHUA 3CQ0A 4MLJA 5J5DA 5HR6A 1KM4A 3UZJA 1F76A 3QMSA 1DJQA 3Q2DA 1OFBA 3BPWA 1LYXA 3S1UA 1IF2A 1LLZA 1VHCA 2V2CA 2C1HA 1NF7A 3LI1A 5G2IA 4MZYA 3PUEA 1JQVA 3M1ZA 1WDWA 4FNQA 2CLHA 3RK8A 1K7XA 4HKPA 5G1TA 3INPA 3MI6A 3GDLA 1KM0A 4NXSA 1PCKA 4IPIA 5KSWA 4H6KA 2RH9A 4UTHA 5AYYA 1OFEA 3M0ZA 3FKKA 1H62A 3LI0A 4OV4A 2J9XA 1H61A 1SQ7A 3QM3A 2QJHA 2OT1A 1A5CA 4LS0A 4CQAA 3NQAA 4NJJA 4MLRA 2QUUA 3DENA 3F4WA 4IGHA 1VYPX 3L65A 3QF0A 3UQNA 2VEMA 5FEPA 4GUJA 1F7BA 4HPXA 2EPHA 4AWUA 4PH6A 1KBIA 1T8XA 4O11A 4WUIA 3GYEA 3MBFA 3W9ZA 1OX4B 2Q8ZA 4X3ZA 2GVLA 1SZEA 2C13A 3V1PA 1YPFA 1EUNA 1AW5A 1KLYA 5CPOA 2ZBTA 4O50A 3KXQA 4FX8A 4MZ1A 5CGQA 4XBKA 2Y7FA 2XN0A 1LBMA 1OFQA 1FY6A 1T0OA 3A9IA 3ZS4A 3DKLA 1YTDA 5BMXA 4IMEA 1FDZA 1OVDA 1PL9A 1DVJA 4JYDA 1QPNA 4GRSA 2V2DA 4QNWA 5EY5A 3NR0A 4C1LA 5AYXA 2FDSA 2ZA2A 4TIMA 4N4QA 1UASA 4EWND 2EF9A 3GR8A 1PV8A 5L6UA 1EA0A 3G0XA 2J9ZA 1GWJA 2GVJA 3MUXA 1RR2A 5DBUA 4QQ3A 5HR7A 1SU5A 2R14A 3NZ1A 1I8JA 2ZRXA 3PY2A 1WAUA 1J5TA 3TSBA 3O05A 2RFGA 2WSYA 3S5YA 4HPJA 4Z0SA 4C1KA 4AXKA 1SSDA 4ADUA 4NVTA 4WY0F 1FWSA 3PUOA 4RCXA 3JR2A 3LHZA 3EX1A 3B0PA 1Q3NA 2GUUA 4JN6A 4IMFA 2J88A 2JKAA 4MJMA 4O57A 3TA6A 4E38A 1SR9A 5A5WA 4O0KA 3CU2A 3BW3A 4NNCA 5HNRA 2E5CA 4IUOA 4OT7A 5HQEA 4NZJA 3L66A 2YXGA 1MEHA 1I2NA 3TE9A 2DU2A 3TX9A 4JX4A 3NL2A 1QNVA 5KZDA 3EWZA 5F4SA 1F73A 5EL1A 3KVLA 2R91A 2E6YA 3W83A 3LBCA 2BLEA 3YPIA 5BRBA 4IMCA 4BI6A 4OE7A 1F5ZA 5K7JA 4YXGA 3P74A 5KZMA 1OHLA 4A21A 2B7OA 3MHUA 1THFD 3HG5A 5D38A 3TK7A 4ZQNA 1EP1A 1KV8A 3NQMA 5LNUA 3K30A 2TSYA 3NQGA 3W7IA 2JGYA 3GK0A 3R8RA 4IQLA 4K8EA 4K8HA 1TPB1 4LU0A 5LNWA 4MIMA 2Q3OA 4J9JA 3LV5A 2CWNA 2NUXA 1YDVA 4CQ8A 5I3KA 4Y8FA 4LUIA 4EOUA 4CQ9A 3FJ6A 3A21A 2J9YA 1NFBA 3P81A 3GDRA 1SW3A 3W70A 1NSJA 5I3JA 1GEQA 1UB3A 4BWLA 4FXRA 1BKSA 2YFNA 5CZ0A 1RQHA 4H3DA 4QISA 1OFPA 2J6XA 2ZRUA 5FF2A 1GVOA 3S6DA 3KRZA 1TQJA 3WJSA 4AF0A 3TC6A 1OYCA 1IIGA 3W86A 3F03K 2QAPA 3TAOA 1L6WA 3GX9A 1YYAA 3GZ3A 1TV8A 4UTTC 1H7PA 5LHFA 3BG9A 5LHEA 3HOJA 3N2MA 3WJXA 4O1AA 4YMZA 2FB3A 3GVGA 2CZEA 2CW6A 3EXTA 3LRLA 2YYUA 3UY8A 4DF2A 4JTSA 4ORMA 3BLFA 4L4MA 4N9DA 3S5OA 4FX7A 5IBXC 4UR8A 3L68A 4Y90A 3B03A 2OZ0A 3NAVA 2H8ZA 4JTTA 4P61A 3DGRA 2R8WA 4X2RA 4NJHA 3E0IA 3C61A 2NWSA 5DXYA 1DL3A 1MXSA 2NZLA 1ZALA 3MWAA 2JKPA 4FNRA 4I7UA 2J27A 2A2IA 2Y70A 5F2LA 1ML1A 1F74A 3M5ZA 3EXRA 5AFDA 2FPVA 4K6AA 4H4IA 2C15A 3NPVA 2ZRZA 1XBVA 5I3HA 1JUEA 4MKNA 1VLWA 2PRMA 3BW2A 4UMBA 3G1SA 1H60A 4Y6GA 1WBJA 4DXVA 5U4NA 1ME7A 4OGZA 1PHQA 3EWYA 2QCDB 3SY5A 2OT0A 5HINA 2FPTA 3RLUA 1S5VA 3R12A 4JTFA 4MY9A 1GOXA 2ZZ1A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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