3A5NC

Crystal structure of a dictyostelium p109a ca2+-actin in complex with human gelsolin segment 1
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
370
structure length
359
Chain Sequence
QALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAALNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAAAAIVRDIKEKLAYVALDFEAEMQTAASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Contractile protein
molecule keywords Gelsolin
publication title Structural basis for actin assembly, activation of ATP hydrolysis, and delayed phosphate release
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 117
structure length 359
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5nC01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a5nC02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a5nC03
5BRHA 4BRFA 4CD1A 1SZ2A 5JLFA 2E20A 3O1BA 4A2AA 1GLCG 5F0XA 2W40A 1IG8A 3WQTA 5AFUA 2D4WA 2BUPA 3VERA 3FE1A 1QQOA 2QWQA 2CH6A 3JS6A 3VEOA 4CBXA 4RWTA 4JHDB 2AA4A 3L6QA 2OANA 2P9UB 2A42A 2FSKA 3VGLA 3MN7A 1ZBSA 1NBWA 1YXQA 3VEWA 3DXKB 4BRLA 5LJWA 2J4RA 4EAHD 1BA0A 2I7NA 3FZFA 3O5BA 3QFUA 2QWNA 3D2EB 1R59O 3MN6A 5CE3A 2P9SB 4BG8A 3HZ6A 4FOEA 1TYQB 4I6MB 3LDOA 3M6GA 3UKUB 2QW9A 4DCHA 2V7YA 4ISGA 4RTFD 4BRGA 1RFQA 4QS7A 5AQFA 3U9ZA 3DXMB 3LDQA 3VF6A 4EIAA 2FF6A 3W3DA 1SAZA 3ZETA 4FL9A 1NGFA 2GUPA 3GE1A 4BRPA 1U6ZA 2CH5A 2GEMA 3H1VX 3IFRA 4H5VA 3VGMA 5AQZA 1DEJA 4CZJA 5AQPA 3VEXA 3BF1A 4M7YA 3O4WA 5FPEA 4XH4A 2QWPA 1IJJA 3M3ZA 1EQYA 1S22A 5EY4A 2ZGZA 5JICA 3QBXA 5AQGA 1ZC6A 4DQ8A 4BRIA 2YHWA 2YHXA 4H0YB 2ITMA 4CZHA 2D0PA 2GWKA 3QDKA 1MWMA 1DGKN 2Q36A 3DJCA 3R6MA 4FWLA 2P9LA 3LM9A 1JCGA 4FPAA 4H0TB 2FF3B 4PL8A 4JNEA 5E26A 5B8HA 1HUXA 2YHYA 1GLBG 1J6ZA 5EVZA 5JMVA 1GLFO 5BN9A 2ASPA 1NMDA 4YDUC 4CZLA 5EOYA 2VWBA 2Q97A 1QZ5A 3WXJA 3LDLA 4QS9A 3GL1A 5BN8A 1XQSC 3H6EA 3I8BA 4H5WA 1H1VA 1WUAA 3O8MA 3HM8A 3BP8A 5AZIA 4IZ9A 3M1FA 4IO8A 3H46O 4IXCA 3IMXA 3SK3A 5AQHA 3VEZA 3FZLA 3MMVA 1X3MA 3AAQA 3L0QA 4BRHA 3FLCO 3ENOA 4DB3A 3SMPA 3A5LC 3D2FA 1QQNA 3KHYA 3U4LA 4B1XB 1BG3A 2A5XA 2CGLA 2NZTA 1Q18A 4BRMA 3ZEUA 4XEIA 4LC9B 1KAZA 3QFPA 2EWSA 3A0IX 1KXPA 3WEEA 3ATUA 3ULEA 4B1VA 4H0VB 5AQMA 3FZKA 3AARA 2E88A 2A3ZA 4CZMA 1QHAA 3CJBA 3KVGA 4O5FA 1OKJA 3GBTA 3ZETB 2A41A 4FOIA 5AQUA 1GLJO 3A8YA 3DWLA 2QWOA 3H3NO 4FWQA 3W0LA 4WQ4A 5LY3A 1T6CA 2IVNA 2W41A 1MDUB 4BRDA 2GELA 2V52B 4IJNA 3SLCA 1BU6O 2VYPA 2Q2RA 5AQIA 3CQXA 5E84A 1SQKA 3P4IA 5KQDA 3MDQA 2QWRA 2HMPA 2Q31A 5ADXH 3ZX2A 5AQVA 5F2RA 3WUHA 4BR5A 2ZF5O 4K43A 1X9JA 2A40A 1D4XA 2P9LB 4C23A 3JXUA 1U2VA 5JLHA 3VPZA 3CJCA 5AQTA 3C7NA 3L4IA 1NM1A 2E1ZA 5KPTA 1C0GA 2YI1A 3UE5A 5ADXA 3FFKB 4K41A 2P9PB 2E2NA 5AQXA 3HSCA 5AZIB 4PKGA 4FWPA 1MA9B 3CERA 3U8XA 1KAXA 3TU5A 2V51B 2NLXA 3A5MC 1NGBA 3LDPA 3VGKA 5AQNA 3QBWA 1YVNA 3D2FB 4AM6A 4B1YB 2NRHA 1YUWA 3H45C 1NGDA 4BRKA 3ATVA 1NGGA 4FWSA 1XC3A 3ZEUB 2IIRA 4HTLA 3ENHA 3U9DA 3WEEB 4BG9A 1CZAN 3ULEB 4A2BA 2YCHA 5KQ8A 2HF4A 3IUCA 3H1QA 4CBUA 4CBWA 3S41A 4E1JA 1GLEG 1LCUA 3CETA 4BQLA 3UB5A 3FZMA 2V7ZA 4J8FA 1Z05A 2P9KA 3EZWA 3ZX3A 4WQ5C 4IWVA 4BC3A 4Z94A 2P9NA 2H3GX 2F9TA 5EXWA 1BA1A 1E4GT 1ESVA 4BC5A 4BVPA 4NO7A 4MLHA 3QMLA 4F9OA 1BUPA 1BWFO 4H0OA 3VEVA 1HJOA 1TUYA 1NGIA 5TKYA 3MN5A 2D0OA 3AY9A 3DAWA 3DXKA 1JCEA 1V4TA 4XH1A 4XH5A 5AZJA 3FGUA 5AQSA 1U2VB 4JD2A 1HKGA 1DKGD 1NLVA 2KHOA 4WQ4C 4JAXA 3CJAA 1T44A 3ID8A 3C7NB 4BGAA 4FWMA 1Z6RA 3UKRA 1ATSA 2D1KA 3HI0A 3MK6A 2E2PA 3EKSA 4CZIA 3AAPA 1RGIA 3CIPA 1K8KA 3VF4A 4EHTA 3VOVA 4B9QA 3VF2A 1JCFA 2YJFA 1G99A 4BR7A 4Y0WA 4A61A 4CZGA 4FWNA 4NB4A 2VCPA 5AQLA 4YDUA 3VETA 4BQZA 3G25A 1KAYA 4FWOA 4O8KA 4BRAA 1ZXOA 4BC4A 4M7XA 3KZBA 4BC2A 2ZWHA 3CJ1A 1ATNA 2F9WA 2QWMA 2E2QA 5BPMA 5EX5A 3WXKA 3EO3A 2FLOA 3BF3A 3J8AA 1TUUA 3A5OC 2ASOA 4BR2A 1NGJA 2E2OA 5BRDA 5FPDA 4PKIA 5AQRA 4A62A 3O1WA 4PL7A 3R9PA 5ELZA 1XUPO 2I7PA 4H5NA 1NGHA 4CI6A 2QM1A 5BREA 2P9KB 1HKBA 3IDHA 3ZX0A 1NWKA 1MWKA 1RDWX 2P9NB 3VENA 2UYTA 3RSEA 4CZEA 1HX1A 3MCPA 4K25A 1HLUA 2HF3A 2P9IA 4EHUA 2E1YA 2E8AA 2BTFA 3O08A 5KPRA 3HTVA 4H5RA 4EFHA 1X3NA 5AZJB 3BEXA 4JD2B 2FSNA 1V4SA 3R8EA 3BUZB 3O80A 5AQQA 4H0XB 4BREA 4CZFA 3UKRB 4FPBA 3LDNA 4CJ7A 4M63C 2IVOA 2YJEA 4BGBA 4H0PA 4BRCA 4BROA 2DPNA 3CQYA 1GLAG 1K8KB 2Q0UA 3GOIA 4GNIA 1E4FT 1QZ6A 4AM7A 4RCHA 4B1UB 4BR9A 4PKHA 4JN4A 5BR9A 3CHWA 3HBTA 1NGCA 1BOTO 2PBDA 5AQYA 3WT0A 1S3XA 5LJVA 4B1WB 3SJHA 3F9MA 4QS8A 2CGKA 3CJ7A 1NGAA 1T6DA 3B8AX 1P8ZA 4FWKA 2PAVA 1HKCA 2GTDA 3SMSA 3VESA 4CZKA 4JHDA 1YAGA 3QB0A 2P9UA 3H3OB 4L3QA 5FPNA 3MN9A 5BRFA 2Q0RA 4FWRA 3O6WA 4BR0A 4KBOA 4B1ZA 3LM2A 5KPZA 1ATRA 4BR4A 3GDQA 5F1XA 3D2EA 2ASMA 2P9SA 4ISFA 3WXLA 4BRNA 4K42A 2Q1NA 1TYQA 4I6MA 1LOTB 2P9PA 1BDGA 3UKUA 1C0FA 3OHRA 4GY2B 3A5NC 3QICA 4BVOA 5AQJA 3DXMA 2ZGYA 3I33A 5I9EB 4CD3A 2GWJA 3RSEB 1NGEA 3FZHA 2CGJA 3WQUA 5FPMA 2QXLA 2FSJA 4ISEA 4MLEA 5AQOA 3CJ9A 2P9IB 5BPNA 3WXIA 1BO5O 3EKUA 3FR0A 4WYBA 5AQWA 5AQKA 5BPLA 3TPQA 3VEYA 4WQ5A 4MO5A 2WUSA 3CI5A 1Y64A 3C0BA 2QWLA 4FO0A 4BRQA 2AP1A 4H03B 1GLDG 3GG4A 1GLLO 3EN9A 3LL3A 3D7EO 5AFUH 5AR0A 1WOQA 2FXUA 2A6AA 4H5TA 4FSVA 1QQMA 4MO4A 2IVPA 4HWIA 1HPMA 2HOEA 3EL2A 4DHYA 4IJAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CD1A 2I5JA 5JLFA 3QNOA 4O0JA 4JV5K 3O1BA 4OVLA 3M8PA 2FBTA 1RT7A 4ELVA 5AFUA 5KRTA 2HHVA 4DSFA 4B3OA 4IFVA 1NJIO 2QWQA 3L2RA 1HNZK 4JHDB 2G8IA 2O8DB 3WNEA 3MN7A 3CC4N 3C94A 3DXKB 4CF1A 2QKBA 3CCLN 3CCRN 3ENBA 4J2EA 2I7NA 3SQ2A 3HZ6A 5C2FA 4NYNA 4I6MB 4DCHA 4BRGA 4BWMA 4YY3K 4DFKA 3EY1A 3LDQA 1T3VA 3LPUA 3W3DA 2X74A 3HPOA 1U6ZA 2CH5A 2GEMA 3VN5A 4GV9A 3IFRA 4H5VA 4U7BA 3SV4A 4FW2A 4CZJA 2UU9K 4CJUA 3O4WA 4RW4A 4BE2A 4B08A 1NOZA 1TGOA 2QWPA 2WONA 4DU3A 2IOCA 4X64K 1HQUA 5M1OA 3BZCA 1BQNA 2VGNA 2C1GA 2YHXA 5JENA 1VSIA 1OH6A 2Q36A 4CJLA 2P9LA 2ZD1A 4H0TB 1TKDA 2FF3B 4IBNA 4PL8A 2YHYA 4A5AA 5EVZA 2O8EA 3CM5A 1SL1A 2Q97A 2XO7A 3WXJA 3PX0A 2EX3A 4H5WA 1H1VA 1TKTA 3BP8A 2X78A 3VQAA 3M1FA 3V1RA 2PYLA 4IXCA 4PHTX 3FLCO 1T8EA 3AVNA 3D2FA 5KRSA 1QQNA 3KHYA 4KHNA 5C25A 1IKYA 1Q18A 4BRMA 1N8RO 1VQKN 3C65A 4XEIA 1O1WA 1KAZA 4LC9B 3E9OA 3QFPA 2EWSA 3HOTA 3ULEA 3NGYA 1QHAA 3K5NA 3CJBA 3DM2A 4O5FA 1NK9A 3NCIA 4O55A 4CHOA 5I3UA 2RF2A 2A41A 4FOIA 2HHIA 1GLJO 3A8YA 4FWQA 5M1KA 3QERA 2KZMA 4BDPA 2IVNA 2W41A 4IDHA 1HNXK 1TV6A 3AA4A 4IJNA 4FLXA 4PUOA 3J7ZO 4DQRA 1L5UA 5AQIA 2UUCK 1A5VA 3ZSWA 1SQKA 3P4IA 4YOTA 1OVYA 2ETJA 1OH7A 4AHVA 4CHQA 2B5JA 1S1VA 3H08A 1TAQA 4KB0A 4FJ7A 3U3YA 2P9LB 3MX2A 3CMEN 4E7JA 4ELTA 1HYSA 5KI6A 4DLEA 3VPZA 3CC2N 3V1QA 2O8EB 3K9JA 2HBMA 3TTFA 3KLFA 4LF5K 1K8AO 2YI1A 2ITGA 3TAEA 3DRSA 2P9PB 4IEIA 3OYEA 4O5BA 4YOYA 1SUQA 3U8XA 3JYTA 1WSFA 1YJNN 3E1YA 1NGBA 1JL2A 3VGKA 5J2QA 1XMQK 4AM6A 3D2FB 4JK8A 4I2QA 1W7AA 1N33K 4CJPA 3CMAN 1S1XA 3ENHA 4KKOA 1CZAN 3ULEB 3VQ6A 2YCHA 4KFBA 1KRPA 4Z4FA 4CBUA 2D0CA 1W9HA 1N6QA 4ILGB 4JK9A 4E1JA 1TK5A 1GLEG 3LWMA 3RMCA 2UUBK 4BQLA 3MEDA 4XIUA 1FK9A 2HHXA 4ID1A 1IH7A 3MEGA 4I2PA 3EYZA 5GAHP 1Q81O 1BA1A 1REVA 4M41A 4BC5A 4NO7A 1CZ9A 4F9OA 3G0ZA 4HTUA 3DLHA 3LZIA 1HJOA 1NGIA 4C1NK 5TKYA 4QOZB 3ZSVA 1NK0A 3D6RA 3OYMA 4XH1A 4E1NA 1KD1O 1DKGD 3MCAB 3SBGA 3ZSXA 3T1YK 4CJ4A 4FVUA 4DR3K 4E3SA 3SUNA 3CCUN 4FWMA 1GOBA 2D5RA 3T3FA 4B3TK 3MK6A 5GAEP 5T7BA 3ULDA 4PWDA 3VF4A 3VOVA 3QNNA 1T05A 1BIZA 2P1JA 1I94K 4Y0WA 1NKEA 3QEIA 4NB4A 3F9KA 5CYMA 3MXJA 4DMNA 4FYDA 4BQZA 3OYLA 4IFYA 3Q7BA 4KO0A 3M8RA 1CLQA 4PQUA 4B3MK 1S9EA 1NNEA 3SAHA 2WFBA 3CFPA 1YJWN 4NYFA 3TAFA 4CJ5A 5BPMA 3KD1E 1QQCA 2XY7A 1BHLA 2D0AA 4EP4A 1NGJA 3CCVN 3EZ5A 2D0BA 1X9WA 1FKPA 3D45A 4A62A 4DFJA 4V19S 1CXUA 1HJRA 2UYTA 4KAZA 2YNHA 3RSEA 3S3OA 1HX1A 1IO2A 3K57A 2HF3A 4EHUA 2E8AA 2BTFA 3HTVA 1SV5A 1VQON 2KW4A 4KV8A 5IT9O 4CGFA 3OJSA 4DQQA 4WF9L 3ZYYX 4CHNA 4JS4A 4KI6A 3O3HA 3KTQA 5J2MA 4M63C 2NRWA 2YJEA 1XHXA 3BY5A 4BRCA 4W5RA 4PA1A 2O8BA 4FJ5A 4K8ZA 1QZ6A 3V9WA 3AVJA 4C8OA 4BR9A 3CF5L 5BR9A 1B92A 3MWTA 4RW9A 3CHWA 1QE1A 3HBTA 4CEQA 4DU1A 3WT0A 3ZT4A 3O9SA 5FROA 2HHUA 5DM7L 4B1WB 1VQNN 4FZYA 3B6OA 1F21A 4KRFA 3CJ7A 3B8AX 4CJ3A 3O3FA 2PAVA 1HKCA 5C10A 1JJ2M 3T1HK 1BI4A 1I39A 3MWPA 1LWEA 1VSKA 3VESA 3SPZA 3HPGA 3ZCMA 5CHIA 2P9UA 3H3OB 4KTWA 1GOCA 5KTQA 5FPNA 2A1SA 2Q0RA 3O6WA 2BANA 5M1PA 4GVEA 4KBOA 1VQ7N 1J54A 2YHBA 3L2QA 4F2RA 5F1XA 3D2EA 4MDAA 1L3TA 2P9SA 4ISFA 4K42A 1VQPN 1C0TA 3UKUA 1S1UA 1C0FA 3OHRA 3HM9A 1VQ9N 3OVNA 3IKMA 4DLGA 3I0RA 3RSEB 2CGJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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