3A62A

Crystal structure of phosphorylated p70s6k1
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
288
structure length
263
Chain Sequence
KIRPECFELLRVLGKGGYGKVFQVRKVTGANTGKIFAMKVLKKAERNILEEVKHPFIVDLIYAFQTGGKLYLILEYLSGGELFMQLEREGIFMEDTACFYLAEISMALGHLHQKGIIYRDLKPENIMLNHQGHVKLTDFGLCHFCGTIEYMAPEILMRSGHNRAVDWWSLGALMYDMLTGAPPFTGENRKKTIDKILKCKLNLPPYLTQEARDLLKKLLKRNAASRLGAGPGDAGEVQAHPFFRHINWEELLARKVEPPFKPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Ribosomal protein S6 kinase beta-1
publication title Structural basis of human p70 ribosomal S6 kinase-1 regulation by activation loop phosphorylation.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 263
sequence length 288
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3a62A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3a62A01
1H0VA 4DE4A 3OCSA 1H27A 4M68A 1W98A 2R2PA 3LCOA 3PXRA 4S32A 1KV2A 2VN9A 2XMYA 5HOAA 3BIZA 4AOIA 4FKVA 3EHAA 3NSZA 3H3CA 4G16A 4JAIA 3R7VA 5D11A 3QTWA 4AQCA 3GCUA 3OCBA 4M0ZA 5I5ZA 3OY3A 4RJ4A 4PL3A 4LYNA 3VUMA 3H10A 5HEZA 3PXQA 4IM0A 2XKCA 5EHLA 3QTXA 5HIEA 5AIKA 5BVFA 5IKWA 2OIBA 3C1XA 1G5SA 2C5NA 2BR1A 3HV5A 5HVYA 4L67A 4ASDA 4C02A 5C8KA 1WVYA 5FP6A 5CSPA 2CHLA 3ZYAA 1B38A 4R7IA 3HV4A 3NUAA 5AUXA 5KZIA 2XZSA 3OW4A 3V5WA 3H9OA 5IQHA 1P4OA 3FMHA 3QQHA 5D12A 4C4HA 3NYVA 4DLIA 3CPCA 2X8DA 4BCQA 5BNJA 1R0EA 1KE5A 1RW8A 4FKOA 2V7OA 2R3QA 3QTUA 3TUDA 3N4VA 3UYSA 3EN9A 4XMOA 3SXFA 2QODA 2ZMDA 3R0TA 1JSVA 4RVTA 3SGCA 2A4LA 4LG4A 4QQ5A 1ZMVA 2ZV9A 3UVQA 3I7CA 3Q4TA 3MA6A 1Q62A 4C3RA 2GNGA 1YXTA 3AGLA 4TYJA 4K1BA 4F1TA 2C6MA 3NW5A 2J5FA 4TYHA 1OI9A 3NNVA 4JI9A 4XNEA 5LVLA 4GYIA 5JRSA 4M97A 5AP3A 3QRKA 3RAWA 2YZLA 1A06A 2WTKB 4DH3A 2B9HA 5KBQA 3CD8A 3LJ1A 4FIEA 4C61A 5KKRC 3LCKA 2CGXA 3ORLA 3MS9A 3RK7A 4JXFA 3JVRA 4QMWA 4L68A 5CSXA 3BU3A 3R30A 2Z2WA 5CXHA 3NS9A 3F5UA 4TXCA 3WZUA 4W4XA 5ANGA 2PUIA 4BIEA 4R1YA 4GK4A 4FTJA 4I3ZA 1ZWSA 3ORZA 2X2LA 3LE6A 3EOCA 4JDKA 4JDHA 3SW7A 3UO4A 3NIEA 5TT7A 4UY9A 3RPYA 3L1SA 2GNFA 4WA9A 3L9LA 5ETCA 3ZSIA 4C33A 3PVUA 5AP4A 2ZV2A 2C5XA 2ITVA 3QZHA 4KA3A 3P78A 1WBNA 5HD7A 2CPKE 4NT4A 3RAKA 4BIBA 5JEBA 2AYPA 1A9UA 1MUOA 3KL8A 2C3JA 4FTLA 4FTRA 4FUYA 4I23A 3Q2MA 3U51A 3GGFA 3W55A 2WXVA 1PXOA 4FYNA 2IVUA 4TY1A 4I94A 4AE6A 4PX6A 3AD5A 4EH2A 3F88A 3UNZA 3I0QA 4FVQA 3T3VA 5IQCA 3A7JA 4FKUA 1LR4A 3MFRA 4QMXA 5H8EA 5DN3A 5HNIX 3KMMA 2GMXA 4GVAA 4WRGA 3E3PA 3GP0A 4FSMA 4I6FA 4EQCA 5HI2A 5J9YA 5GIPE 1H0WA 1ZZ2A 2JBOA 4I0RA 4JL9A 3VUTA 2BDWA 3LXKA 1Y6AA 1OIRA 2HW6A 4L3JA 3IW6A 3C4WA 4M8TA 1ZOEA 2FSLX 3KF4A 3BLRA 4EJ7A 3KKVA 2JBPA 5KO1A 5T3QA 2BKZA 2OXXA 4ANQA 4TWOA 3FMMA 4DA5A 2Z7LA 3Q4CA 1UWHA 4UEUA 1G8SA 4QMYA 5E91A 3UOHA 2R3RA 4FTTA 4LMUA 2FVDA 2VTMA 1M7NA 2W1CA 5GZ8A 3FLSA 3UO5A 4FEXA 4C3PA 3MGYA 2ERKA 3PPKA 1VJYA 4FSTA 4O38A 2X7FA 4MXCA 4ZSJA 5IISA 5A4TA 2JKQA 3LMHA 1FPUA 3ZEPA 4X6QC 3FDNA 4E6CA 2XKDA 1PXKA 3HEGA 2GQGA 4FTMA 4Z3VA 4AZTA 2RFNA 4YJVA 4O0RA 4C59A 2YM6A 3FUPA 3HLLA 3SG9A 3TKUA 3AC1A 5KHXA 3ANRA 4BCJA 4FX3A 2ITPA 5CS6A 3MPTA 2JD5A 3ETAA 3QHWA 4B99A 3Q52A 4D5KA 4CKRA 3QC9A 3M1SA 4DEIA 4HVHA 2R3PA 4BDFA 2YIXA 3A8XA 4A9YA 4F09A 5IEVA 3WE4A 4TYIA 4LUEA 4WSYA 4BCMA 4NK9A 4O2ZA 4D1XA 3QYWA 1F3MC 3UMWA 5ITAA 5KX8A 2J0MB 4EQMA 4YJRA 1S9JA 2WQMA 3PJ2A 3SC1A 3LJ2A 3R7EA 3O8UA 4CCUA 3FPQA 2XRWA 3R9RA 2I6LA 3KFAA 2DUVA 3AD6A 3ZO1A 3E63A 4U44A 4B9DA 3ZC6A 4DINA 3R71A 2F49A 3RP9A 4YURA 2BFXA 4X7QA 4NZWB 5IH6A 4ZMEA 2BAJA 4MYGA 4CV9A 3VF8A 4FSZA 4DEBA 4ZZNA 4W8DA 3DKCA 5IA0A 4HVSA 3JY0A 3R8ZA 2WU6A 4FYOA 1XO2B 4GG5A 4V04A 4PNKA 3P5KA 4EBWA 1J7IA 4WBBB 4IWDA 5B0XA 2BROA 1O6YA 2WOUA 4QP3A 1CKPA 2ZB0A 5EW9A 3GVUA 3VS4A 4BDHA 4GKIA 4MCVA 5KMKA 3KK9A 3CXWA 3LFEA 4D55A 5D10A 3EKKA 2Y7JA 1IA9A 2BTRA 1F0QA 2XIYA 1RJBA 1YOJA 5CVGA 4FL3A 5AUZA 4XG8A 2PVHA 3BHYA 2OJFE 4GG7A 3MWUA 3HUCA 5T6KA 4MWHA 5EDPA 3ORNA 3QYZA 2HOGA 3PE1A 3QZGA 2X8IA 2X7OA 4M84A 3RHXA 4FV9A 4AX8A 4AE9A 3LZBA 2XJ0A 4FTNA 3R83A 3ZU7A 3K5UA 4GFMA 4RT7A 1P14A 2DS1A 3E92A 2GFCA 3V5JA 4GU9A 4D9UA 3OS3A 5C01A 4IX5A 3TUCA 4GU6A 1Q24A 5DE2A 2HYYA 2Y6MA 2BZHB 4OT6A 4BTJA 1OZ1A 5F94A 3OG7A 4UMRA 5AUUA 2XF0A 1OITA 3PG3A 3QD4A 4L43A 5AV0A 4YLLA 4ERWA 3HRFA 3FSFA 2UW8A 4MX9A 1YI4A 5DFPA 3AC4A 3VUHA 3R2BA 2UW3A 4G3CA 4E93A 3TTIA 5L2TA 3OWJA 3O50A 1R39A 4KNBA 4QYYA 5EYCA 5HX8A 3B2TA 3P7AA 4BL1A 5I3RA 4G6OA 3II5A 1W83A 3C51A 4O83A 3A7IA 4UZHA 3QLGA 5IUHA 4D5HA 2PVMA 3MW1A 4D2SA 3FWQA 3FMKA 2PVRA 2EXCX 3OTVA 3S95A 5L8JA 3PIYA 4PMMA 4D4VA 3COMA 5IA5A 4RPVA 4EORA 3AQVA 1Z57A 4KABA 1KOBA 2IVVA 4RIYB 5EQYA 2BCJA 3FLZA 5J8IA 3UC4A 3UNKA 1CKIA 4RQKA 3RK5A 5M53A 5HG7A 5FTGA 3NPCA 4D2TA 4U0IA 2A2AA 5E8UA 2I1MA 1QMZA 4YZBA 2W0JA 2YERA 4I6BA 4MXZA 5HLPA 3NLBA 3DOGA 4Y73A 2X9FA 3EFWA 4NFNA 5A14A 4UYNA 3O17A 3ZBXA 5HICA 4F9YA 1XWSA 3GNIB 2RG5A 3GFWA 4KBCA 4WIHA 1PF8A 4QP9A 2QNJA 4RA4A 4EZ5A 3DNDA 4X2JA 1M7QA 4EOJA 3UQFA 3BYVA 4FTAA 4RG0A 3F5PA 5L2QA 3UQGA 4FOCA 5LXMA 2UW6A 3QQKA 4ZLOA 2UVXA 3W2PA 4YHTA 3B8QA 5HBJA 2YIYA 1KSWA 3CCNA 2GHLA 2BFYA 4H3QA 3BX5A 4L01A 1IAJA 3DDQA 1MRVA 4J52A 4WNOA 4ASEA 3BQRA 2WTCA 3R01A 4OTDA 4XS2A 4Z16A 2JDOA 1GNGA 3IGOA 5EI2A 4C2WA 2ERZE 4EHGA 4ANSA 3QCQA 2JKMA 5M4CA 3P4KA 2HCKA 4GL9A 5M08A 2XEZA 3ZHPC 4NSTA 2ETKA 4RC2A 4QP6A 4E5WA 2FO0A 4RJ3A 3E5AA 4BTKA 2XCHA 4G17A 3HKOA 4JBVA 4IM2A 4Q5HA 2BRBA 3T8OA 1QPJA 5DI1A 3VUKA 3DKFA 4CZTA 4DFNA 2GS6A 3RM6A 3RTPA 5L8LA 2FSMX 3HA8A 4IB5A 4BDBA 4UMTA 1JSTA 4FUXA 3VUGA 4QQJA 3Q32A 4D58A 1REJA 1K2PA 2OI4X 1NXKA 2ETRA 4DFXE 5K5XA 5K3YA 1J7LA 2XH5A 2Z7RA 2HWOA 2OH0E 1XHAA 2R5TA 4K0YA 1Q8ZA 5K0XA 3TEIA 4N57A 4IWPA 3ULZA 3QTIA 2GS7A 4J1RA 4DFBA 4KBKA 1YXVA 3LAUA 4PMSA 4RC3A 3V8SA 1GOLA 3KK8A 4JJRA 2RIOA 4NJ3A 4BDIA 4BDCA 4BC6A 5DEYA 3QLFA 3GFEA 5LMBA 3MB6A 2B54A 2UZBA 4MK0A 4F9BA 2QOIA 1ZYDA 2Z8CA 1FVRA 5F95A 4U42A 2O5KA 3T3UA 2J0JA 5CLPA 3LCTA 4MXOA 4NM5A 4AW1A 1OBDA 4KWPA 4L45A 3AMAA 4FEUA 3R7OA 1CM8A 3KB7A 5CYIA 4R6VA 3D4QA 2OXYA 4C34A 1M2RA 2BRGA 4HZSA 4N6ZA 4KIKB 4A06A 1CKJA 2P3GX 3WF6A 5HIBA 3LJ0A 4UALA 3HMMA 3GOKA 4WNKA 2GNHA 4RIXB 4DGGA 5EM5A 1BUHA 1GIHA 1OPKA 4MQ1A 4P5ZA 4WBOA 3LFDA 5CEPA 4KS8A 2P4IA 2ZMCA 3VHEA 2XS0A 3IDBA 4R77A 1P2AA 2FYSA 3BRBA 3PWDA 3U6IA 4RSSA 5CEIA 4K33A 3LM5A 4Y5HA 4CFUA 2W1EA 2PK9A 2VUWA 1FVTA 4Q9SA 4WUAA 1R78A 1XH4A 3VN9A 3L8VA 2XNGA 3MTLA 4BCKA 2C6EA 2FB8A 5L2WA 4GSBA 2I0EA 5CANA 5JMSA 5DBXA 5EM8A 4BVUA 5M4UA 4DGOA 3WYXA 3MY5A 4F9CA 3FZ1A 4PDOA 5AR3A 5IQBA 3QCYA 4YSJA 2EXEA 3AC3A 5HO7A 4ANBA 4W4YA 4TWCA 3DU8A 3QF9A 1BL7A 1GJOA 4IACA 4O84A 2B9FA 4O0SA 3W2RA 2ITNA 4XRLA 3UIUA 5L2IA 3ZXZA 4CTCA 5LCJA 2C6IA 3EQBA 3MFUA 3D5VA 4AACA 5DOSA 2CJMA 4MBLA 2VAGA 4EH4A 5FM2A 5A6OA 1JLUE 4Q2AA 4QPMA 2ITUA 3QQFA 4FKWA 2WMRA 3LXLA 3W2QA 4FF8A 4FG9A 5CF5A 3QZIA 2BDJA 3FZPA 2YEXA 2C5VA 3R21A 1U4DA 3KMUA 5CZIA 5HO6A 3P08A 5IU2A 4M7IA 3D14A 1PXPA 3MVHA 3VS1A 5LOHA 3ENHA 4QT1A 3CIKA 3Q4ZA 3H0ZA 2BPMA 4OBPA 1M52A 3BHVA 2RFSA 5ETIA 4YNOA 4DH8A 4YU2A 3T9IA 3Q2JA 3SRVA 3QD0A 3SW4A 2W5HA 4R3PA 4IM3A 2A1AB 4IAYA 2C6LA 4C4GA 5GZAA 5HZNA 1DAYA 4C2VA 4RIOA 5M06A 3F6XA 2UW5A 3NAXA 1UA2A 4QNAA 3QA8A 3BU6A 5G6VA 3GU6A 1KE9A 2C5YA 2ZV8A 2HXQA 3S0OA 5FG8A 3FLWA 3EQHA 4ZOGA 3V5PA 1G8AA 3OFMA 3ACJA 3A61A 3EZRA 4J53A 4NH1A 5A46A 1URWA 4NKAA 2CKOA 2VWZA 2WTVA 3OOMA 2XM8A 4OTPA 3PXKA 4ZTHA 3NMUF 1FBNA 4ITJA 1HCKA 4XG7A 4DYMA 4RFYA 2UW7A 3TZ7A 3B8RA 4LI5A 2QI8A 4L7SA 4GUBA 4IC7A 3KRXA 2XNOA 3R9HA 1GZ8A 1Y91A 3EKNA 4FTIA 5JZJA 3I7BA 2F7ZE 3BU5A 4J97A 2WMWA 5HNBA 5IDNA 5IQIA 2VWYA 5B7VA 4L3LA 3HAVA 1V0BA 2OIQA 1DS5A 4E6QA 3ZUVA 2Y4PA 5E4HA 5JFXA 2JDTA 5IQAA 4WG4A 2GFSA 4ID7A 4H3BA 3VO3A 2V7AA 3BYOA 5EQEA 2UV2A 4HOKA 2WMBA 5KMLA 5BYZA 2UVYA 2JDVA 4QTEA 2XNEA 4EBVA 4BHNA 4UXQA 4E8AA 4QMZA 5AA9A 1YWNA 5LVOA 3R8PA 3CC6A 3WF5A 1RE8A 3MA3A 5BUEA 2J0IA 2OF2A 2WHBA 4EC9A 2YM8A 4YTFA 4BDGA 2C0OA 3N9XA 4K6ZA 5M07A 1STCE 3LFBA 3NAYA 3FSKA 4UB7A 4BFMA 3W1FA 2PZ5A 5I9YA 4EK3A 2CGVA 5AEPA 3G51A 4EL9A 3GUBA 3P9JA 4EHEA 1PXJA 2VV9A 3MIYA 3C7QA 2WD1A 2Y6OA 3SOAA 3D15A 4ZTSA 3IO7A 2XBJA 4GUEA 4Y46A 4YMJA 2PHKA 4OBOA 4X6RA 1PMVA 1YXUA 3HDNA 2YCRA 1NVSA 2EB2A 2NPQA 5HO8A 3NIZA 3DT1A 1ZZLA 2OSCA 4JX3A 4JX7A 2XIXA 1CMKE 4YJNA 4HVIA 5J7HA 1SNUA 4FTCA 4XV1A 5FQDC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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