3A8YA

Crystal structure of the complex between the bag5 bd5 and hsp70 nbd
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
385
structure length
385
Chain Sequence
FTMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
publication title The C-terminal BAG domain of BAG5 induces conformational changes of the Hsp70 nucleotide-binding domain for ADP-ATP exchange
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 385
sequence length 385
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3a8yA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3a8yA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3a8yA04
1BG3A 2E2OA 2YI1A 1QQMA 2IVNA 3GDQA 1QZ5A 3GBTA 3D2EB 2J4RA 4JHDB 5AQLA 5AQGA 1NGGA 3VF4A 3VGKA 4FPAA 1ZXOA 1MWKA 4FSVA 2FF3B 4H0YB 3D2FA 4GNIA 5AQSA 4BQLA 3EKSA 1NGDA 1TUYA 1HKBA 2CGKA 4B1UB 4BG8A 4BRGA 1GLJO 2IVPA 3O1BA 3MN5A 3UKRA 3H45C 4MO4A 3DJCA 3TPQA 4EHUA 1QQOA 3JXUA 2P9NA 3FLCO 2P9SA 1V4SA 3CI5A 1ATSA 1CZAN 3BUZB 3CERA 4A61A 3ZEUA 1TUUA 3L4IA 2NZTA 3QFUA 4YDUC 5JICA 3FE1A 1NBWA 3M1FA 1HLUA 3CJ7A 2P9IB 3WQTA 2GTDA 2QWQA 1OKJA 2CGJA 1JCEA 3CETA 3ULEB 2VYPA 3AARA 2E20A 3FZMA 1H1VA 3BEXA 3U9DA 4KBOA 4BRQA 3J8AA 3RSEB 3R9PA 3SK3A 4BR0A 4BREA 2P9KA 4H5TA 1WOQA 3LM9A 3ENHA 4M63C 4BRNA 4QS9A 4Z94A 2A40A 5KQ8A 2QW9A 3HSCA 3I33A 4BQZA 4GY2B 1E4FT 4H0VB 4BRCA 4B1WB 3VEOA 4DCHA 1KAZA 3QMLA 3HZ6A 1SZ2A 4M7YA 4WQ5C 3U9ZA 2YHXA 3S41A 3QFPA 4H5NA 2DPNA 4PKGA 3ATUA 2CH5A 4JD2A 1NLVA 4J8FA 1NM1A 1HJOA 4BRFA 2I7PA 4MLEA 4FPBA 1NMDA 1YVNA 3MMVA 3VF6A 4B1VA 2E2PA 1GLBG 3FZLA 4BROA 1NGBA 2V51B 1Y64A 2E8AA 5BREA 2PBDA 2E2NA 4A2BA 2AA4A 2FSJA 3O08A 3VGMA 1DKGD 4RWTA 4LC9B 1ATNA 3SMPA 2D0OA 2V7YA 4H5WA 2FF6A 2ASMA 2BUPA 3LDQA 4IZ9A 1MDUB 3O4WA 2CH6A 2Q31A 2OANA 4BC3A 4CD3A 1Z6RA 3O6WA 4QS8A 2NRHA 2QWMA 1HPMA 3WEEB 2ZF5O 4Y0WA 5AQOA 5AQXA 5CE3A 3UB5A 4AM6A 3DXMB 3A8YA 4FWKA 2YJFA 4H5RA 3HM8A 4FWLA 5FPNA 4PKIA 3OHRA 1NGFA 5AQRA 4BR4A 4H0OA 2HOEA 3HI0A 2KHOA 1LCUA 1IG8A 1GLCG 3C7NB 5TKYA 1P8ZA 1JCGA 2P9LA 1ZBSA 1MA9B 4PKHA 1TYQA 3FFKB 2FXUA 1NGJA 1BU6O 2Q0UA 2P9PA 5JLHA 4YDUA 5KPTA 1BOTO 1T6CA 2QM1A 3G25A 4CZLA 4B1ZA 1YXQA 4E1JA 3CJ9A 1XUPO 2HF4A 4BRDA 3VEYA 1G99A 5AZIA 3SLCA 2HMPA 5AQQA 3WXJA 4H0TB 4CZKA 3MN9A 3KZBA 3LDLA 2GWKA 4JAXA 1BUPA 3IUCA 5BPMA 3CQYA 5AQZA 3AY9A 3DXKA 4I6MB 1U2VA 1ATRA 5F2RA 1T44A 3CJCA 4CBXA 1YUWA 4FOEA 3VERA 4BVOA 2CGLA 3LDPA 3U4LA 1RFQA 5AZJB 2W40A 4WQ5A 4F9OA 2A5XA 3VETA 1NGIA 3M6GA 3H46O 5ADXH 2A42A 4BG9A 1Z05A 4BVPA 5BPNA 2Q2RA 2QWPA 3WXIA 2A3ZA 1C0GA 1ZC6A 3ZX3A 3GE1A 3MN6A 4BRLA 3FGUA 5BPLA 3D2EA 4IJNA 4JHDA 3GL1A 3SMSA 4BRPA 4XH5A 5BN8A 3AAQA 3HBTA 4NB4A 4HTLA 2D1KA 1Q18A 3D7EO 1X3NA 3VF2A 4BC4A 2V52B 3UKUB 4BC5A 3ID8A 3VENA 1NGCA 5KPZA 4IO8A 1BDGA 3ATVA 4M7XA 5BRHA 4BR9A 2I7NA 3R6MA 3C0BA 3ZETB 4JNEA 4K41A 2H3GX 3EKUA 4WYBA 2GUPA 5AQKA 2P9UB 3R8EA 2IVOA 2YHWA 5AQJA 5EX5A 2F9WA 1DEJA 1K8KB 4FWNA 1BWFO 4RTFD 5AQPA 4FWOA 1C0FA 2P9IA 2QXLA 4XH1A 3MN7A 3ULEA 5AQFA 4BRKA 2ASPA 3EO3A 2QWLA 3H1VX 5E84A 4BGBA 1S22A 4FO0A 1EQYA 4B1YB 2ZGZA 4EIAA 5F1XA 3RSEA 3A0IX 2PAVA 5E26A 3M3ZA 1GLDG 3WUHA 3H6EA 4CZFA 5JLFA 2Q1NA 1XQSC 3TU5A 5AQHA 3VESA 5JMVA 2V7ZA 2QWOA 1KXPA 4L3QA 3D2FB 3ENOA 4CZGA 3EN9A 4CI6A 4DB3A 3O80A 1S3XA 4H03B 4BRMA 1GLAG 1HKGA 3H1QA 4IXCA 4ISGA 1HUXA 4ISFA 1KAYA 5AQMA 4BC2A 3UKRB 1NWKA 1QZ6A 4DHYA 3MK6A 2EWSA 3JS6A 3L6QA 4FOIA 2P9NB 3HTVA 4H5VA 2IIRA 1D4XA 1R59O 2P9SB 4FWRA 4WQ4A 5EVZA 3ZEUB 3GG4A 3CQXA 3H3NO 3CJ1A 1E4GT 2A41A 3AAPA 3F9MA 2WUSA 4PL8A 5AFUH 3O8MA 1IJJA 2BTFA 1HKCA 4BRIA 4CD1A 2E88A 1QHAA 3A5NC 1X3MA 3WQUA 5EXWA 3IMXA 3WEEA 4FWSA 4FWQA 3DXMA 4IJAA 1J6ZA 2P9KB 5AQUA 3H3OB 4H0XB 3CHWA 3UE5A 4CZMA 3MCPA 4O5FA 3DWLA 1GLFO 4K25A 3LL3A 3WXLA 4FWPA 3C7NA 5I9EB 3FZKA 5LY3A 4CJ7A 1NGEA 2F9TA 3CIPA 5LJVA 4WQ4C 5EY4A 4B9QA 4CZEA 2VCPA 5BRDA 5BR9A 4CZIA 1RGIA 2YJEA 5B8HA 4A62A 1WUAA 1BO5O 4JD2B 4XH4A 3CJAA 5KPRA 1JCFA 1DGKN 4CZHA 3QBWA 4FL9A 4FWMA 4A2AA 3QB0A 2GELA 1YAGA 2GWJA 5BN9A 3BF3A 4QS7A 2FSKA 4ISEA 3QDKA 2NLXA 2Q36A 5AQNA 4RCHA 4MO5A 4I6MA 5AQIA 5F0XA 5AQVA 3MDQA 1GLEG 3FZHA 3DAWA 2A6AA 4K42A 3KHYA 2Q0RA 1U6ZA 2VWBA 3I8BA 3SJHA 4BR7A 4BRHA 3LDOA 4BRAA 3WT0A 2ZGYA 5AZJA 1ESVA 3O1WA 4DQ8A 3VPZA 4NO7A 3FZFA 5AQYA 1MWMA 1LOTB 1RDWX 4HWIA 3IFRA 3FR0A 3VEWA 2YHYA 4B1XB 4EAHD 5AR0A 5FPMA 4H0PA 2D0PA 3A5MC 3VEZA 5AQWA 1V4TA 2P9LB 3VEXA 3ZX2A 4MLHA 5EOYA 5AFUA 1TYQB 3A5LC 3VOVA 2ZWHA 3QBXA 2QWRA 1BA0A 4EHTA 3EL2A 1SAZA 2P9PB 2ITMA 4O8KA 2HF3A 4BR2A 4XEIA 4CBWA 4K43A 3BP8A 4JN4A 3L0QA 4EFHA 3VEVA 1SQKA 2Q97A 3UKUA 2E1ZA 1KAXA 5FPDA 5ELZA 3BF1A 3GOIA 1QQNA 5AZIB 2YCHA 1HX1A 4BGAA 2UYTA 4IWVA 2ASOA 5ADXA 3LM2A 4BR5A 3KVGA 5AQTA 2FLOA 5KQDA 2W41A 3A5OC 3ZETA 2AP1A 3ZX0A 4PL7A 1XC3A 2QWNA 5FPEA 1T6DA 3QICA 3W0LA 2P9UA 3DXKB 3WXKA 1U2VB 3IDHA 3VGLA 5LJWA 5BRFA 4AM7A 2E2QA 3W3DA 4CBUA 1X9JA 2FSNA 1K8KA 3CJBA 1GLLO 2E1YA 3EZWA 1NGAA 3P4IA 4C23A 2GEMA 2D4WA 4CZJA 3U8XA 3B8AX 3LDNA 1BA1A 3O5BA 1NGHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IDKA 2YI1A 4I2QA 3K59A 3GDQA 2D0CA 2J4RA 3PSFA 3CC4N 3AVJA 4FPAA 1ZXOA 4FW2A 1MWKA 3AVCA 4FSVA 2FF3B 4KH5A 3KD1E 3J7YP 1TVRA 2CGKA 1RT6A 3HPHA 2D56A 2IVPA 1S1XA 1I2UA 3UKRA 2KFZA 3DJCA 3TPQA 2XY7A 4KKOA 5C15A 4B9SA 3FLCO 2YHBA 2K35A 2UXCK 3CI5A 4JK8A 3VQ8A 4FM2A 3BUZB 3CERA 3I0SA 3ZT2A 2NZTA 4FJ5A 3P83D 5JVHL 3VMFB 4FJ7A 3VQ6A 1JZAA 3U3YA 4CEEA 2QWQA 1L3UA 3OYEA 3PUFA 3BZKA 3AA4A 1C0MA 5CR4A 3KP1A 1TV6A 3SJJA 4BRQA 3CCLN 1CXUA 3SK3A 2YNHA 1WMTA 2KYQA 1HNZK 1Y97A 1VSKA 4FJXA 3THVA 4BRNA 3PX0A 3GKUA 2HW3A 4K0KK 3OYFA 2A40A 4ILGB 3T7ZA 1RBTA 3PSMA 1HYVA 3I33A 1REVA 5GIPA 4BRCA 4DCHA 3CC7N 1EETA 1JXBA 4WQ5C 3U9ZA 3S41A 3HRGA 2KJAA 3CCJN 2DPNA 4JD2A 3L2QA 1HJOA 1U45A 1NMDA 3AVIA 4B1VA 2E2PA 2ZM6K 2P1JA 3KC6A 4GV9A 4BE0A 4IOXA 4YOVA 2V51B 5FDLA 3ITHA 4TSXA 5BREA 4DF4A 2E2NA 1WSIA 1DKGD 3VQPA 1S72N 2HBLA 2FF6A 4DSFA 3LDQA 4DV2K 1L5UA 1W2BM 2CH6A 2Q31A 4NYFA 4F2SA 1N4NA 1XC9A 3O6WA 4QS8A 1YTUA 5CE3A 1TAQA 3QNNA 4AM6A 3OYMA 3KK7A 2UUAK 1LV5A 3IRXA 1MR4A 1OH6A 3T1YK 1PE4A 4CESA 1DJTA 1NGFA 3ZT4A 4BR4A 4H0OA 2HOEA 4H4MA 2ATBA 4J2DA 1UAXA 1P8ZA 2P9LA 4PKHA 2YKNA 4B9MA 4GV6A 2FXUA 1OZZA 1P00A 1RDCA 4FJMA 3SQ0A 1NK4A 5JLHA 1GPSA 4PA1A 5M1OA 3G25A 4CZLA 1FH3A 3LP3A 5J2PA 1W97L 4DLGA 4F3TA 3F2KA 1XUPO 1CZ9A 3THXA 1YT3A 3L4QA 3RMBA 3SLCA 3LWLA 3M8SA 3WXJA 3Q7BA 5KTQA 4KRFA 1E3MA 4JI1K 3CQYA 4LFBK 4WCEL 1LQHA 4B9NA 4KTQA 4OGEA 3ZSWA 3DXKA 1U2VA 1MU2A 1RILA 1I6GA 3CJCA 4FXDA 4OKEA 1YUWA 3S9HA 3VERA 4DKWA 4FW1A 3QIOA 3U4LA 3TSQA 4E7JA 1X1PA 4CGJA 4IEEA 2QXFA 4WQ5A 4F9OA 4FLVA 3H46O 5ADXH 4DS5A 4B9UA 4JI2K 5JVGL 3O3HA 3SPZA 3GE1A 3MN6A 4BRLA 3FGUA 5CHIA 4R79A 4JHDA 3CCVN 4A59A 4I9QA 4XH5A 2F96A 2X6SA 3AAQA 4NB4A 4CFCA 3G4SN 4BC5A 3CCQN 4DR5K 4K8XA 4WE1A 1C1BA 5BRHA 4HHFA 2LT8A 3C0BA 1CLQA 3V9UA 4AEIA 4JNEA 4B3RK 2AJQA 2H3GX 1XMQK 3V6DA 2O8CB 1DTTA 5AQJA 1SKWA 4WFAL 4AF1A 3DM2A 1BWFO 3A2FA 4PUOA 4FWOA 4N41A 2P9IA 1VSJA 5M1FA 4DQIA 3OYDA 1IKVA 4M3WA 1XNQK 1NMNA 5AQFA 2UUCK 3KOYA 3AO5A 4BGBA 4ZHRA 4FO0A 5E41A 3AO3A 1RTDA 3LPTA 2P5GA 2HHWA 3NAEA 5KGWA 5JLFA 2LY6A 2Q1NA 4KYPA 5AQHA 1BIUA 2ASCA 4KV8A 5JMVA 3HP6A 3NE6A 2QWOA 3QESA 1JJ2M 2KKZA 1I94K 4H03B 4BRMA 1GLAG 3S5TA 4X65K 3H1QA 2NRTA 1HUXA 1FW6A 4BC2A 3UKRB 1QZ6A 5DK5A 3O9UA 3IG1A 1JXEA 5SWMA 1YITN 4Q5VA 4Z4EA 1DTQA 2IIRA 1D4XA 1KVBA 5KRTA 5EVZA 4CF2A 3T69A 3JYTA 4DQPA 3OS2A 4AHRA 1E4GT 2G8KA 2A41A 3SAGA 2QK9A 4AHVA 4CEBA 1IJJA 5CYQA 3SV3A 3EYZA 2PFUA 4DV3K 1X3MA 2ETJA 5EXWA 4OO1J 4FJ8A 1GOCA 3QO9A 4FVUA 2O8FA 4CW7B 4DV7K 1Z26A 4JYAK 1L3TA 4E7HA 4YOYA 1Q81O 3R3LA 3CHWA 1QTMA 3ZSZA 3DWLA 4DSKA 1IKWA 1BCMA 4C8KA 5I9EB 5LY3A 2E3FA 4ILHA 1NGEA 2VQFK 4CJRA 1KCFA 4CZEA 1WAJA 1TKZA 1X9SA 4RW9A 3SQ4A 2YJEA 1NK7A 4A62A 3NHGA 4JD2B 4XH4A 1C6VA 4JRQA 2OPSA 4CZHA 3AVKA 3QBWA 4UQGA 1KV0A 2W6LA 5C2DA 1VSDA 4FWMA 3L2RA 1FK9A 1Q82O 4A2AA 2BANA 4QS7A 2FSKA 5AQNA 1RT4A 4MO5A 3SV4A 4XIUA 2OA8A 2C1IA 5AQIA 1LW0A 4GMJB 4CGFA 3MDQA 4DFKA 2A6AA 3PIPL 2LSNA 3QEXA 2Q0RA 2VWBA 4BRHA 1VQMN 3LDOA 4BRAA 4CF9A 4Y1DA 1X9WA 2NUBA 2ZGYA 3AVFA 2GV9A 3NGZA 1KFDA 1I6FA 3FZFA 5AQYA 3HT3A 2YHYA 2O8DA 1TL3A 3A5MC 1DQ7A 1T3VA 3KWGA 2P9LB 4M42A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4IDK A;  2YI1 A;  4I2Q A;  3K59 A;  3GDQ A;  2D0C A;  2J4R A;  3PSF A;  3CC4 N;  3AVJ A;  4FPA A;  1ZXO A;  4FW2 A;  1MWK A;  3AVC A;  4FSV A;  2FF3 B;  4KH5 A;  3KD1 E;  3J7Y P;  1TVR A;  2CGK A;  1RT6 A;  3HPH A;  2D56 A;  2IVP A;  1S1X A;  1I2U A;  3UKR A;  2KFZ A;  3DJC A;  3TPQ A;  2XY7 A;  4KKO A;  5C15 A;  4B9S A;  3FLC O;  2YHB A;  2K35 A;  2UXC K;  3CI5 A;  4JK8 A;  3VQ8 A;  4FM2 A;  3BUZ B;  3CER A;  3I0S A;  3ZT2 A;  2NZT A;  4FJ5 A;  3P83 D;  5JVH L;  3VMF B;  4FJ7 A;  3VQ6 A;  1JZA A;  3U3Y A;  4CEE A;  2QWQ A;  1L3U A;  3OYE A;  3PUF A;  3BZK A;  3AA4 A;  1C0M A;  5CR4 A;  3KP1 A;  1TV6 A;  3SJJ A;  4BRQ A;  3CCL N;  1CXU A;  3SK3 A;  2YNH A;  1WMT A;  2KYQ A;  1HNZ K;  1Y97 A;  1VSK A;  4FJX A;  3THV A;  4BRN A;  3PX0 A;  3GKU A;  2HW3 A;  4K0K K;  3OYF A;  2A40 A;  4ILG B;  3T7Z A;  1RBT A;  3PSM A;  1HYV A;  3I33 A;  1REV A;  5GIP A;  4BRC A;  4DCH A;  3CC7 N;  1EET A;  1JXB A;  4WQ5 C;  3U9Z A;  3S41 A;  3HRG A;  2KJA A;  3CCJ N;  2DPN A;  4JD2 A;  3L2Q A;  1HJO A;  1U45 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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