3A9IA

Crystal structure of homocitrate synthase from thermus thermophilus complexed with lys
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
375
structure length
347
Chain Sequence
REWKIIDSTLREGEQFEKANFSTQDKVEIAKALDEFGIEYIEVTTPVASPQSRKDAEVLASLGLKAKVVTHIQCRLDAAKVAVETGVQGIDLLFGTSKYLDIPRIIEEAKEVIAYIREAAPHVEVRFSAEDTFRSEEQDLLAVYEAVAPYVDRVGLADTVGVATPRQVYALVREVRRVVGPRVDIEFHGHNDTGCAIANAYEAIEAGATHVDTTILGIGERNGITPLGGFLARMYTLQPEYVRRKYKLEMLPELDRMVARMVGVEIPFNNYITGETAFSHKAGMHLKAIYINPEAYEPYPPEVFGVKGLHYGEEELHRVTQHIKALADRGQLTLEELDRILREWITA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Homocitrate synthase
publication title Mechanism of substrate recognition and insight into feedback inhibition of homocitrate synthase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 129
structure length 347
sequence length 375
ec nomenclature ec 2.3.3.14: Homocitrate synthase.
pdb deposition date 2009-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3a9iA01
4BR1A 4AB4A 1QO2A 4S2BA 5D30A 2ALDA 4DBDA 4FO4A 3KX6A 2WQPA 3GXNA 3O05A 3NEVA 1S5WA 1XKYA 1FCQA 1FDZA 1IF2A 4LRSA 1YXYA 1ML1A 1A5BA 5FESA 4K36A 4K38A 4Z1DA 2Y7GA 3B06A 2DJLA 3O6CA 4M7TA 5HUOA 2RDTA 2EKCA 3QYQA 3THAA 1YDNA 2ZRZA 4O11A 4ADTA 1F05A 1G4PA 5LKYA 2NX3A 4QM1A 3LCFA 3P62A 3W73A 5KINA 1P0KA 1RZMA 5DCDA 3USBA 3C2EA 3NZ1A 1TV5A 1WDWA 3EEGA 1YTKA 3MBFA 4HNNA 1OF6A 3HPXA 3BV4A 1O94A 3EWWA 3ZFHA 3NXFA 3G1FA 1XBVA 3EXTA 2Y63A 3STCA 4NJHA 1SSDA 2E6FA 3TUUA 3TA6A 2AAMA 3O07A 5C55A 5CZSA 3LHWA 5E1QA 3UZ5A 5L6UA 3CC1A 3GXTA 3FEMA 1PCKA 5LNVA 1VCFA 2ATSA 4MVAA 1QMLA 1LP6A 5U4NA 1TRDA 2HS6A 4QITA 3E0IA 3OA3A 3O16A 2OZ0A 3UWWA 3EKZA 4RKAA 3NG3A 4MLRA 1NF0A 3DI1A 3E9AA 3TX9A 3LXAA 4NX5A 1WOBA 1JUKA 1RV8A 4OGZA 1H1ZA 4A29A 4MPQA 2PRLA 3K30A 3PG8A 2ZRYA 3PBYA 1ZCOA 3LRKA 4FIRA 5CG7A 1ZNNA 4Z0SA 3TSMA 1HO4A 4RR4A 3RU6A 1JJKA 3FFSA 2NX9A 5D37A 3YPIA 5DELA 1MEHA 1J2WA 2H6RA 2NLIA 3BARA 3G0XA 5KSWA 1WX0A 1QPNA 4GUHA 2DZPA 4O1BA 4BK9A 2ZZ7A 3N9RA 2V9DA 3PSVA 1S5VA 2HS8A 3PWAA 4N6FA 2QAFA 4O57A 1F73A 4RXGA 1P0NA 1OFEA 3IGXA 3GDLA 4IX2A 2Y6ZA 3S5OA 4CCDA 1KFLA 3EXSA 4NJIA 2CLOA 5FF2A 2C14A 4AEOA 4HPXA 1ZY9A 1M7OA 4KKXA 1ME9A 5LNUA 4MJMA 4JR5A 3W71A 2GVLA 1AW2A 1IXQA 3SGUA 3LM7A 5HQEA 1TPWA 2C1HA 3EX6A 4GUIA 2A5HA 1PE1A 5AC8A 1W8SA 3G8EA 3HG2A 4KWWA 1WBHA 4JYFA 3GVGA 4O54A 1OABA 5K2ZA 3SI9A 4I7UA 4LNYA 3LX9A 4JDBA 1TMHA 4JTSA 4NXSA 5T26A 4HNUA 4JX6A 4RK8A 1K7FA 3W1AA 1X1ZA 2Y89A 4QNEA 3P8JA 4WY0F 3L2IA 1GJPA 1I2OA 2QKFA 1OFDA 1FWWA 3C4UA 2ZCGA 3MI6A 5DN1A 4MOZA 1OJXA 1LM1A 5BMWA 2BLEA 5DY2A 3Q58A 1U83A 3BG5A 3QRHA 3GNNA 3FJLA 3O1NA 4UMCA 3S9YA 4N9EA 2W0UA 1GVOA 4R33A 2TRSA 2ZA3A 3P81A 3IVTA 2I9EA 2A7RA 4NT0A 5HWJA 2DJXA 3PUEA 3G1XA 1OFOA 4U28A 3QSRA 3LOTA 1W3TA 1NAL1 1SU5A 4BWLA 5D2TA 3UD6A 4MUZA 3QJAA 4O10A 3N2MA 4UMAA 1NSJA 1HFBA 1FCVA 1K03A 1W3IA 3LGEA 1DVJA 3G1VA 4XZ9A 2H3DA 3ANYA 3CT7A 1EPXA 1H7XA 1PHWA 1L2UA 3F4WA 4RJEA 2QUTA 2EF9A 5HNRA 3BGJA 3FA5A 1OYBA 3U8GA 4NXKA 1NF7A 4ZVJA 3EKLA 3TQKA 2I14A 3JS3A 5BOOA 2R14A 3TAKA 3NQDA 3PR2A 3RLVA 4O19A 1O5XA 1G7UA 2X1RA 4A3UA 4UNKA 3W7NA 3GK0A 3A9IA 4HN4A 4A21A 1OK6A 3P82A 1BEUA 1I2RA 2FPTA 2GPTA 4X22A 3QPZA 4L4LA 5FEPA 2BZNA 2ZRVA 2WSRA 4NJKA 1K7XA 1D3HA 3W7MA 3W7QA 4LRTA 2VEKA 3FS2A 4IMDA 1AL8A 3HG4A 2DZXA 1PVNA 5LHEA 2VFGA 3G0UA 3NQ2A 4NVTA 2C15A 2ZRUA 1QCWA 4LS2A 3PG9A 4O4WA 3W7HA 5D32A 5IBXC 3HGOA 4DBEA 7TIMA 3MBDA 2J27A 3NOEA 1MEWA 1W31A 1OFRA 3NQ7A 2ZZ2A 1A5AA 1SZGA 3VCRA 4UR8A 2NUWA 3C2RA 5BW6A 3Q94A 2H8ZA 1QFEA 3FKKA 1R2RA 4M6QA 5F1VA 1T0OA 3I65A 1EP2A 1LRQA 3VKJA 1VYPX 1OK4A 3IIPA 3RLUA 5HWMA 1H62A 3SY5A 1TPEA 3NQGA 4UFMA 3UY8A 2J88A 3P5ZA 4GRSA 1I2NA 4OHQA 4JTGA 1M7PA 1YLVA 1C29A 2PCQA 3R89A 3SECA 4RV8A 3H55A 4JYDA 3NQAA 4ADSA 1G4EA 3LLFA 1A5CA 3DHDA 1V7YA 2C3ZA 3BG9A 4JN6A 4HHPA 3A24A 2ZZ3A 5AHFA 3TSDA 3W2KA 3M5VA 3JR2A 1L6SA 1TJRA 3VE7A 4QIUA 4RXFA 3BLIA 4K8HA 1LOLA 1PS9A 1X8FA 2CZFA 3F4NA 2Q8LA 2OJPA 2VFHA 3TROA 3DFOA 4IXXA 1X7FA 4AMAA 3UWUA 2FIQA 2ZA1A 3A5VA 3R5EA 4WXYA 2QDHA 4O1DA 4YCPA 1LCOA 4UFJA 3CIWA 4JTJA 4FEZA 1SZNA 3CWOX 1L6WA 3M44A 3UWZA 3M1ZA 4AXKA 4JD4A 3O63A 1O5KA 1HTIA 4XKYA 1JUEA 3LBMA 4FX7A 3G3DA 1LTDA 5HUPA 2JBMA 5FF7A 2QJGA 4FNSA 1XUUA 2FLIA 3E12A 1GG0A 1K8XA 4DF0A 2WJZA 8TIMA 3HMJG 2VEMA 2B7OA 3LCLA 1GWJA 5AC7A 4XBSA 4LVDA 4EIVA 1K7EA 4PH6A 3GDTA 4MY8A 1QDSA 3R2GA 4LOCA 4OWGA 5IM51 3W7EA 4NU7A 4NJJA 3TJLA 2Y70A 1H63A 1K02A 3PBVA 3C8FA 3W84A 5CKSA 3FYOA 2G95A 5EA9A 4IX0A 3UWVA 3LRMA 1LORA 2VENA 4QISA 3LCGA 1YTDA 5AHNA 3W1MA 6ALDA 2A6NA 3UPBA 1VRDA 2CW6A 2C0AA 5DLCA 5J5DA 4OT7A 3KVMA 3M41A 4EF8A 2DP3A 3L5MA 5D38A 1QWGA 1VGAA 1TV8A 4MFDA 2YYTA 3PY2A 3IEBA 1P1XA 3CTLA 1QAPA 2P1FA 2AQWA 3MO7A 5G2WA 3EX4A 3CWNA 4B5NA 1JRBA 1FWSA 2Z1BA 3M5XA 4FXRA 1Z44A 3M0ZA 4NZFA 1KLZA 1L9WA 4J9JA 1GVQA 2X1TA 3W7KA 1F6PA 1H7RA 1FWRA 4DO4A 2YPIA 1TPDA 3L67A 4FNRA 1H1YA 5I3IA 4IMGA 3TCEA 3F1QA 1TV7A 1TIMA 1OF8A 2FFCA 5G5IA 1F76A 5I3HA 1VCGA 2A85A 2WPBA 1S5TA 4O1AA 2EGZA 4NZJA 4LS0A 1AL7A 5F2GA 4O50A 2GQ9A 3G1YA 3G3MA 2WKJA 4O52A 4PC8A 3CPRA 4JX5A 1Q45A 1Z48A 1TO3A 3LCIA 1IIHA 1VZWA 4Z1BA 2I1OA 3OEXA 1VLIA 1A5SA 3G1HA 5CGQA 1KLYA 2NXGA 3O8AA 1XDMA 3NYZA 4WOZA 4LTSA 3LHZA 4BWLC 2YGYA 1AK5A 4X2RA 3CHVA 3TMQA 4MZYA 1BTMA 4LVGA 2BX7A 3GX9A 1W37A 2V2HA 4ZZ9A 4ORIA 1M5WA 2VXNA 5IBXA 4YXGA 4NNBA 4K39A 5K4ZA 1QPQA 4MYAA 1J4EA 2TMDA 5CPLA 4LV4A 3WJZA 1F7BA 5AB3A 3DZ1A 5LGZA 3TXVA 3NQFA 1OFPA 3SIZA 1N55A 2GVGA 2V82A 3EWBX 4IPJA 4BFAA 3W1XA 1MO0A 2RDWA 3NGJA 5AHEA 1KFBA 1G67A 3W7OA 1OFBA 1W1ZA 1EP1A 3LTPA 1JR1A 3MW7A 4NNCA 5FF3A 3TKFA 3WK3A 4AHPA 1H60A 1OX4A 3NQMA 4EWND 3ZS4A 3S1XA 5LNWA 5G2HA 3NM1A 5AHLA 1PV8A 1L6YA 1N7KA 1JRCA 3TU9A 3NDOA 2DU2A 4IWWA 2CU0A 1SUXA 3Q37A 1W54A 4AWTA 1ZENA 4Z08A 4FX6M 3MYPA 2X30A 1TPH1 2RDUA 2B7PA 4Q4KA 3HGRA 5AHMA 2EAWA 2WSYA 4LT9A 3L68A 3L65A 4UFIA 5AYYA 1OFAA 5AYZA 3NPUA 1TJPA 3EWYA 5EPDA 3IGSA 1DBTA 4JTLA 3C61A 1SW0A 1JCLA 1XM3A 2E77A 4JY8A 1H50A 5K9XA 3W1LA 3S1WA 4N02A 3HB9A 4JGDA 4EF9A 2HMCA 2QF7A 2G5WA 4TIMA 3STEA 5C5YA 2QAPA 3CQ0A 2ZZ1A 3LHTA 3GKFA 5DBUA 1UASA 1XXXA 3M6YA 3M47A 2VC6A 3OVPA 4IJBA 4YMZA 1D9EA 3TV8A 4FB7A 5LSMA 4RCXA 4HSNA 3MI3A 5AOUA 1MXSA 4JS3A 4O13A 2P10A 4GXMA 1SZFA 2ZA2A 4UXDA 1F5ZA 5L9FA 3M5ZA 3UNDA 1FQ0A 3OG3A 3DFQA 4GC4A 1FX6A 3O06A 4LU0A 3DI0A 3LRLA 4Y6GA 1OX4B 4LVAA 1UB3A 1ZAHA 2ISVA 3WK1A 3HG3A 3QM3A 2WSQA 3W6YA 3W7PA 2C13A 4AVFA 3N19B 1W5NA 5K9CA 4QSHA 2WNQA 1XUZA 3W87A 2NUYA 3QSTA 1LRTA 4NNAA 1ME8A 1QNVA 3W83A 3UWYA 2W79A 3ZWSA 1Z41A 5H91A 2ISSA 4AWSA 4JIQA 3KRZA 4N6EA 4O14A 4PL2A 3LI1A 2XN1A 1GYNA 1ZHAA 1UCWA 2A0NA 4JDYA 4M5PA 2CWNA 2ZYFA 2QCMA 4IGHA 3G8RA 3BGGA 2E5DA 1IXOA 3N9SA 5I3KA 4IOTA 2V2CA 5I3GA 2X1UA 2E6AA 4CNPA 3TQVA 5CZTA 1ALDA 2YX0A 3N2XA 4TU1A 5F2IA 4O16A 3MP3A 3PC0A 1EWEA 2YW3A 5AYXA 1SPQA 3S1VA 1T96A 2YR1A 1UUMA 1PIIA 2A1YA 4R7JA 3TFCA 4A2SA 2FJKA 3WJWA 3OBKA 5KZDA 3NQEA 3DGRA 3HF3A 2ISWA 3WJYA 2Q3OA 2TPSA 2BTMA 4AF0A 1SZEA 3BK0A 3FYPA 1TTQA 2Z0IA 3PB2A 4JNMA 2E1DA 3BG3A 3I7SA 4O28A 1ZAJA 3W7CA 1AW5A 5I3FA 3LV6A 4A22A 4OU1A 3W75A 2ZDRA 3SSJA 3P60A 3HJZA 4IUOA 3W72A 2FDSA 3B03A 3C2OA 1ONRA 4YWIA 2B0MA 1H7NA 2QUVA 1KM4A 4S2CA 5HWNA 3MWAA 5BNKA 5F2LA 1BWLA 1C8VA 2OT1A 1TSIA 4WY0A 4O18A 1EUAA 4N4PA 4CNOA 3HG5A 3L21A 2NXHA 3N73A 3S42A 2JKPA 4P2VA 2PE4A 1OHLA 1WOAA 3KVKA 4O12A 3N14A 4CQ8A 5HULA 1SW7A 3PS7A 3KRUA 1J5TA 5KITA 1ZAIA 1BKSA 2J9XA 5DY3A 2BSLA 1KM6A 4PEKA 1MSSA 4JTUA 4WQ6A 5LZLA 3IIZA 3STFA 3M9YA 1XBYA 3FLUA 1H7PA 1EB3A 3EX1A 2DZSA 3KAOA 1AW1A 3TW6A 3G1SA 2E6YA 4ZQPA 5A5WA 1NEYA 2V81A 3NNTA 1ME7A 4AWUA 3MP4A 3PM6A 3THQA 5U7SA 4PODA 3UY7A 3W23A 1P4CA 4LC6A 5FF4A 2BWGA 3ATZA 3CLMA 5BRBA 5FF0A 4UNLA 1K8YA 2P0OA 4HKPA 1XFBA 1RR2A 3L0GA 1WAUA 5F4WA 4LUIA 3W1NA 1XDLA 3GDMA 2C19A 4FNPA 3SZ8A 5EL1A 3U2OA 5D04C 3EB2A 3W7DA 5LNRA 1TPB1 3PSWA 3TDFA 4NQ1A 4O1CA 3M43A 3TK7A 3G22A 1RPXA 3HPSA 2A2IA 1LROA 1KBJA 3GB6A 4MZ8A 3QQ1A 5BMXA 4K7VA 2NX1A 5CZJA 1W0MA 3DXIA 4WXZA 1VPXA 5LNSA 5D2XA 1R46A 3EX3A 4Y8FA 3W7IA 3E96A 2QCCA 4MJZA 4E2BA 1LRNA 2NV1A 2RH9A 4JIPA 4UMBA 3JRKA 2QJIA 5HJLA 5HINA 3UXDA 1XC4A 1G4SA 3G1AA 3R12A 3NQVA 1LYXA 1KM2A 2O7QA 5D05A 1O4UA 2QCDA 3W2LA 1AMKA 4DXVA 3MHGA 1B3OA 3U6WA 5F4XA 5D09A 3PBWA 2WOQA 3L0KA 2VELA 1TREA 2O7SA 1Y0EA 2WO5A 4DPQA 1NVMA 3A22A 1SFLA 4UCGA 3MJYA 5D02A 2YDAA 1KTBA 4C1KA 3R8RA 4LWWA 3W2NA 4UTWA 1TTPA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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