3AAPA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
353
structure length
353
Chain Sequence
KHSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
source organism Legionella pneumophila
total genus 105
structure length 353
sequence length 353
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aapA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aapA02
3SMPA 3VESA 3CQYA 2P9SB 4WYBA 2WUSA 3MN9A 4BRPA 1BO5O 5AQZA 3VEOA 1BOTO 2V7YA 2ITMA 2CH6A 3QFPA 4NO7A 4BRAA 3AAPA 4FPAA 1Q18A 5EXWA 3ZX0A 1Z6RA 1J6ZA 4FWQA 4WQ4C 1GLAG 4MLEA 3SJHA 2F9TA 4E1JA 1HPMA 1BU6O 3D2EA 2HF3A 3H46O 3HM8A 3F9MA 4FPBA 2F9WA 4XEIA 4H0VB 3JS6A 3IDHA 2H3GX 1LCUA 3EKUA 1NM1A 2IIRA 3EZWA 3CHWA 2E20A 3LDOA 1CZAN 5BREA 4AM6A 3BUZB 5KQ8A 1X3MA 3O5BA 5EOYA 4RWTA 4M63C 4FWPA 4PKIA 3LM9A 2CGJA 4IWVA 2ASPA 3IUCA 3KVGA 3UKUB 3W0LA 3L6QA 2ASOA 5E26A 2QW9A 4H0YB 5F1XA 4CZLA 3J8AA 3O80A 3LDPA 5EVZA 1SZ2A 2E1ZA 3HSCA 5F2RA 5AZIB 1E4GT 5AFUA 3CJ1A 3O6WA 1NGHA 3CJBA 2QWRA 3GOIA 4FOIA 3UB5A 3WXJA 4M7XA 2QWNA 3FZKA 3ULEB 3BF1A 3MCPA 5AQSA 3RSEA 4DQ8A 2P9IA 4GY2B 4B1WB 3EL2A 2FF3B 5BRFA 3H1VX 2J4RA 3DAWA 3FZFA 2Q1NA 1KAXA 1JCFA 4KBOA 2QWQA 1BA0A 4BRLA 4BRIA 2A41A 3AY9A 2E1YA 4QS8A 4BR0A 2P9KB 3ATUA 5E84A 4IJAA 2ZWHA 5AQNA 4IXCA 4IZ9A 3I33A 3L4IA 4H0XB 1BWFO 3CJ9A 4CZFA 2Q2RA 4CD1A 2Q0UA 3OHRA 3ZETA 5KPTA 3A5LC 3W3DA 4FWSA 1HLUA 5AQKA 1RFQA 2Q31A 2QWPA 4K43A 2D0OA 1NGFA 4RCHA 1HKCA 1SQKA 1JCEA 3EKSA 3UKRB 1NGIA 5AQPA 3VEWA 4YDUA 1QZ6A 1JCGA 1T44A 4CD3A 3ATVA 2QXLA 1YAGA 4M7YA 2FXUA 4FOEA 2E88A 4BRQA 4L3QA 3ENHA 4ISFA 1GLDG 4FWMA 4PKHA 3A8YA 4BR9A 1GLJO 3A5NC 1TYQB 3C7NB 1QZ5A 2GELA 2QWLA 4JD2B 3ZEUA 3VEXA 3LM2A 4HTLA 2YI1A 2FLOA 4CBWA 4YDUC 2GUPA 2IVOA 3WQUA 4C23A 2P9PA 4Y0WA 1MWMA 1ATNA 5AQVA 3A5MC 2E2OA 2P9SA 5AQRA 4CBXA 1Z05A 3VGLA 4FWKA 5JLFA 3KHYA 1TUUA 3H6EA 3EN9A 2PAVA 5AZJB 3CERA 3H1QA 1BG3A 3WEEB 3QFUA 5AQFA 2Q0RA 3LDLA 4BRNA 1NGJA 4I6MB 1QHAA 1XQSC 4BC5A 1YXQA 3FFKB 2E2PA 1S3XA 2D1KA 1QQOA 1V4TA 3MK6A 3MN6A 2BUPA 3VOVA 1ZBSA 3D7EO 5AQQA 2YJFA 4BRKA 1ESVA 1KAZA 2BTFA 2ZF5O 4EHTA 4BR5A 4IJNA 3BF3A 2A40A 5FPNA 4BVPA 5BRDA 1ATRA 4F9OA 3JXUA 1XC3A 4ISEA 4CZIA 1GLLO 1YUWA 4A62A 1HKGA 3O08A 3UKUA 5I9EB 4K25A 2CH5A 4CZGA 3CJ7A 3SK3A 4H0PA 5AQGA 3D2FB 3MDQA 4A2AA 1HX1A 3CQXA 3VPZA 1GLEG 1K8KB 4BG8A 4EFHA 3BP8A 4IO8A 3FLCO 1MA9B 4QS9A 1BDGA 1V4SA 4H5NA 2A6AA 3M6GA 1C0GA 2QWMA 4BGAA 3CI5A 3ULEA 4J8FA 2D0PA 3VENA 1NGDA 1DKGD 3AAQA 5B8HA 1U2VB 3MN7A 3U4LA 3WXIA 4FSVA 4CBUA 2YCHA 1P8ZA 3UE5A 2Q97A 4ISGA 2V7ZA 5ADXA 4MO5A 2V52B 2P9KA 2P9UB 4H03B 4MLHA 4Z94A 5JLHA 2AP1A 2FSNA 3BEXA 3VERA 3VF4A 3L0QA 2YJEA 4K42A 5TKYA 3EO3A 3U9DA 2VYPA 4BRCA 2A5XA 1XUPO 4FWRA 3CJAA 3CJCA 5AR0A 4BGBA 3VF2A 1H1VA 1U6ZA 2HOEA 1DGKN 2W41A 2ZGZA 2PBDA 3A5OC 4FWNA 4EHUA 3A0IX 3WUHA 2YHXA 3GG4A 5BPMA 4H5RA 5AQIA 3UKRA 4PL7A 5LJWA 2E2NA 3R8EA 1NGCA 3ENOA 3WXLA 2P9NA 4BRMA 4BR4A 5BPNA 3DXMB 1GLCG 2E2QA 3WT0A 4BR2A 5FPMA 4BQZA 1LOTB 1NMDA 4K41A 4H5WA 1X9JA 3VEYA 3IMXA 4A2BA 1KAYA 1RGIA 1TYQA 2V51B 4XH5A 3C7NA 4JHDB 5AQUA 4JD2A 4B1YB 1DEJA 1C0FA 4FL9A 4WQ5A 5BN9A 1IG8A 4H0OA 3HZ6A 4CZJA 4O8KA 1X3NA 3MN5A 3KZBA 3FZLA 3O1WA 1RDWX 3QICA 2HF4A 4PKGA 3HTVA 5AQYA 1NBWA 3DJCA 1IJJA 4QS7A 3G25A 4FWOA 2P9LB 4B9QA 3FZHA 3R6MA 4WQ5C 4WQ4A 3DXKB 3WEEA 2FSKA 3ID8A 4FWLA 3M1FA 3WQTA 5ADXH 4I6MA 5AQXA 2FSJA 5AQTA 3S41A 5LJVA 1QQNA 2I7PA 4CZHA 3QBWA 2UYTA 4BRFA 4BR7A 4B1ZA 3TPQA 2GEMA 2EWSA 3GBTA 2GTDA 3VF6A 4GNIA 4XH4A 3O8MA 4BRHA 4NB4A 3CIPA 2GWJA 3H45C 4BROA 5AQHA 5JMVA 3D2EB 5AQJA 1NWKA 3ZX2A 5CE3A 3QMLA 4BRGA 2NRHA 1D4XA 3D2FA 5BR9A 1GLFO 1G99A 1NGEA 5BN8A 1T6CA 5KQDA 3QBXA 1K8KA 2E8AA 4O5FA 4BG9A 4CZMA 2FF6A 2HMPA 3O1BA 3HBTA 3LDQA 5AZIA 3VEZA 3GE1A 1E4FT 5BRHA 3LDNA 3U9ZA 4B1VA 1BUPA 2AA4A 4JAXA 4CI6A 2ASMA 3IFRA 1U2VA 4DCHA 1HUXA 3VEVA 5AQMA 3TU5A 1MWKA 2CGKA 1GLBG 3QB0A 1HJOA 2Q36A 4H5TA 4RTFD 2P9UA 1YVNA 2YHWA 3RSEB 3U8XA 2P9IB 5JICA 3SLCA 4BC4A 4BVOA 3I8BA 2IVNA 4HWIA 1NGAA 4JN4A 4EAHD 2DPNA 2YHYA 2GWKA 4A61A 4MO4A 4DB3A 4BC2A 1TUYA 2A3ZA 2IVPA 2KHOA 2VCPA 2VWBA 4CZEA 4BREA 5ELZA 3C0BA 3CETA 1NLVA 5FPDA 3FZMA 2QWOA 3H3NO 3B8AX 1OKJA 5EX5A 4H5VA 4LC9B 1NGGA 3FR0A 1R59O 2A42A 3HI0A 3ZX3A 3MMVA 3ZETB 2D4WA 2I7NA 3FE1A 4AM7A 4BQLA 1QQMA 4BRDA 2ZGYA 3GDQA 5BPLA 4EIAA 3DXMA 2CGLA 3VETA 4BC3A 1S22A 4H0TB 5AQWA 4B1XB 1KXPA 1WUAA 1ZC6A 2W40A 3H3OB 3VGMA 3VGKA 4B1UB 5LY3A 3M3ZA 5FPEA 1NGBA 1BA1A 4PL8A 5EY4A 4JHDA 2NZTA 3R9PA 5AQOA 3WXKA 4CJ7A 3P4IA 1EQYA 4JNEA 5KPZA 4XH1A 2P9NB 3SMSA 5KPRA 2OANA 3GL1A 1MDUB 4FO0A 4CZKA 5AQLA 3QDKA 2NLXA 3LL3A 1WOQA 1ZXOA 1Y64A 1T6DA 1ATSA 3ZEUB 3AARA 1HKBA 3DWLA 2QM1A 1SAZA 4DHYA 5AZJA 2P9LA 3O4WA 5AFUH 3FGUA 5F0XA 3DXKA 2P9PB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IG9A 4JKHA 3DYAA 4K8XA 1KFSA 3CQYA 2P9SB 3TARA 5AQZA 1BOTO 2ITMA 1KLMA 2CH6A 4ZTFA 2OCEA 3QFPA 3CF5L 5JVHL 4NO7A 4BRAA 1LWFA 1YHQN 3AAPA 3L2VA 4FWQA 4WQ4C 2F9TA 3CC2N 1N32K 1QSYA 4FPBA 2WTUA 4XEIA 4CJWA 3JS6A 2RE2A 1LCUA 1O13A 1B9DA 2IIRA 1YITN 3IKMA 3CHWA 3JYTA 3BUZB 2VWKA 1TK0A 1IV0A 2QTDA 5EOYA 4LFBK 3QEIA 3O4NA 4JI8K 3OW2M 3OVNA 5F1XA 2ITGA 4KV8A 4JK9A 4E1NA 4FM2A 3V1OA 3E9LA 4JRQA 3CCMN 1HJRA 5F2RA 5KGWA 3CJ1A 2X6SA 3RR8A 3AVJA 3NF9A 3GOIA 1VHXA 2QWRA 4JEPA 2Z1GA 4LD0A 3BF1A 3MCPA 3RSEA 2VQEK 1WB9A 2I5JA 3KK7A 3RWUA 1NJYA 2Z1HA 2Q1NA 2QXFA 4KBOA 5J2PA 4LH4A 3RRGA 3AY9A 2E1YA 3PUFA 5GIPA 4IJAA 2ZWHA 3P83D 3I33A 1BWFO 5DM7L 3ID6A 1S9GA 2Q2RA 3KLHA 4CD1A 3OHRA 2BANA 3CXCM 3SAFA 1RBVA 4FWSA 1EO1A 1HLUA 1RFQA 2Q31A 3D45A 4DQPA 3AO3A 2F7TA 1WSGA 2YKNA 3MCAB 1JCEA 1HYVA 1J53A 1QZ6A 1T44A 3EE9A 4CD3A 4BDPA 3V9XA 4FOEA 1RILA 2O8DA 2FBXA 3ENHA 3NMUA 1GLDG 3AO1A 4PKHA 3A5NC 5KRTA 4K0KK 3M8PA 4FJKA 2QWLA 4LSLA 4CEBA 3VEXA 4HTLA 5KTQA 1LV5A 4CBWA 4HUEA 3TAFA 2IVOA 4EP5A 3WXMB 1OH5A 2KTQA 3BZCA 4UQGA 2OZSA 1MWMA 3NBPA 4HCBA 2YNGA 1ATNA 5AQVA 1NK0A 5AQRA 4CFDA 3VQ4A 4CGJA 1JLCA 4FWKA 4FVUA 3H6EA 3EN9A 2PAVA 3RTVA 1EX4A 4IG3A 4PQUA 1SL2A 3NE6A 1QHAA 2VG6A 1BI4A 2PZSA 2Z1IA 2D1KA 2YHAA 2YKMA 2QA4N 3MN6A 3SQ1A 1ZBSA 1KAZA 1RDCA 3QIPA 4E1MA 4EHTA 4YOXA 4BR5A 3QEVA 1N36K 4IJNA 3S3MA 2A40A 5M1PA 4OPHA 3NDKA 3CC7N 1GLLO 2VGNA 3SPZA 3V1QA 3OYNA 4B8CA 4K25A 4O4GA 4CZGA 3PY8A 3SK3A 4DFPA 4FYDA 4DKWA 5GINA 3VPZA 4JS5A 4EFHA 3BP8A 2B4JA 2AJQA 1WAFA 4FZXC 1V4SA 4H5NA 2A6AA 3PV8A 2OPRA 3ZT2A 1C0GA 4RW8A 4KI6A 3NAEA 1NGDA 1VSEA 2G8WA 1DKGD 4J2AA 2KZMA 4O0IA 3CMAN 4X65K 4CJKA 4FK0A 3V81A 1LAVA 4FSVA 1NNEA 4M3TA 2V52B 2P9KA 2ZE2A 1TKDA 1WBDA 3AO5A 2FSNA 3VF4A 2ZD1A 1N34K 3EO3A 4Z4GA 2VYPA 2DTUA 1XUPO 2E5LK 1JLEA 3D0PA 2G8HA 3CJCA 4B3TK 5HRRA 3RR7A 4BGBA 1EETA 3VF2A 5A2QO 1U6ZA 2HOEA 4DLGA 1DGKN 2ZGZA 2PBDA 5C2FA 4CIGA 3WUHA 2YHXA 3TAQA 3SUPA 4H5RA 5AQIA 3AA2A 3CC4N 2D0AA 3UKRA 4DFKA 4B9LA 4XIUA 3AVGA 1DT9A 1C0UA 4E3SA 1UA1A 3OS0A 2E2QA 4BR2A 4BQZA 1LOTB 3VEYA 3F9KA 5GAEP 3C95A 3ZSRA 1TKZA 1TYQA 4ILJA 4ID1A 2A1RA 1KSPA 3C7NA 3VA3A 3SZ2A 5AQUA 3CMEN 4B1YB 2KKZA 3CCEN 4FL9A 4IFEA 3VQBA 4WQ5A 3M5RA 1S1XA 4H0OA 1IBLK 3KJVA 3HZ6A 4CZJA 1X3NA 4EP4A 3OYHA 4F4KA 3MEEA 1K8AO 4WE1A 3MN5A 2HF4A 3AVNA 5AQYA 1NBWA 3DJCA 1IJJA 3G25A 1RTHA 1BIZA 4WQ5C 4X62K 4M3RA 3L8BA 4F3TA 4UY8O 3DXKB 4AH9A 1NJIO 4KREA 2FSKA 3M1FA 2LSNA 4F8RA 2ZJPL 2FSJA 3S41A 4YOUA 3QBWA 3VQAA 5KGXA 4N5SA 4BRFA 4B1ZA 4FZYA 2GEMA 3PO5A 2FBYA 1U4BA 4IEEA 4IOXA 2B5JA 4A5BA 4E7IA 4XH4A 1T3VA 3H45C 3AO2A 4BRGA 1D4XA 3NGZA 3D2FA 4JK7A 3HM9A 1GLFO 1RTDA 5BN8A 4OVLA 4V19S 3HYFA 3GE1A 1TL3A 3DRSA 4FVMA 2Y1IA 2O8FA 2X74A 4O44A 3G4SN 4B9TA 4M42A 4DSJA 1BL3A 4AILC 4F2RA 5C24A 3HOTA 3T19A 3C6UA 1U2VA 4JI4K 4DCHA 3ULDA 4I9QA 3R1XA 4JRPA 1HPZA 3TU5A 1MWKA 4DSEA 4ELVA 3V9ZA 1BGXT 4CHZA 1YVNA 2P9IB 1UA0A 1UAXA 2D0CA 1HNXK 4FW1A 2DPNA 4KB0A 4PWDA 4LH5A 4BC2A 2IVPA 4CZEA 3TABA 4BREA 3C0BA 3CETA 5LMNK 4KAZA 4FCYA 4ILGB 1T03A 1OKJA 5EX5A 4LC9B 1GOBA 1NGGA 3KD1E 4W5NA 4DTXA 2IOCA 3FE1A 4BQLA 3VQPA 2XO7A 4E7LA 5BPLA 2OYQA 4CECA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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