3AARA

Crystal structure of lp1ntpdase from legionella pneumophila in complex with amppnp
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
352
structure length
352
Chain Sequence
HSCIAVIDAGSTGSRLHIYSYDTDDTNTPIHIEEIWNKKIKPGFASIQPNSVTIDAYLTMLLADAPIHNIPVYFYATAGMRLLPQSQQKKYYDELEYWFRQQSQWQLVEAKTITGNDEALFDWLAVNYKLDTLKSVQNKSVGVMDMGGASVQIVFPMPKNAEISKHNQVELNIYGQNINLYVHSFLGLGQTEMSHQFLNSPSCFANDYPLPDGESGQGNAPSCKEEVTSLMNSVHKVNQQIQPLLALNPVNEWYSIGGISNLASSQLFHFENSELTNQSLLQQGDNQICHQQWDILNGQYPDDEYLYQYCLLSSYYYALMVDGYGINPNQTIHYIPPEQNLDWTIGVVLHRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase I
publication title Crystal Structure of a Legionella pneumophila Ecto -Triphosphate Diphosphohydrolase, A Structural and Functional Homolog of the Eukaryotic NTPDases
pubmed doi rcsb
source organism Legionella pneumophila
total genus 111
structure length 352
sequence length 352
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-11-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01150 GDA1_CD39 GDA1/CD39 (nucleoside phosphatase) family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3aarA01
3.30.420.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Exopolyphosphatase. Domain 2 3aarA02
1MA9B 5AQMA 4BRGA 1NMDA 4M7XA 2IIRA 3A5NC 3OHRA 3CJAA 3KVGA 4H0YB 2FF6A 1E4GT 3DXMB 2P9UB 2P9KB 3BEXA 1ZBSA 3HI0A 4BR0A 4JNEA 3EKSA 3W3DA 3GE1A 3H3NO 3FLCO 3O1BA 5BPMA 4CBWA 1JCGA 1U2VB 3ATUA 5BRFA 1ATNA 1BDGA 5AQXA 5AZJA 1XUPO 4FWPA 4K43A 5E84A 1KXPA 5CE3A 4DQ8A 1GLLO 3MCPA 4I6MB 4MO5A 5BN9A 3LDOA 2GWKA 3HM8A 3IDHA 4BRKA 3BP8A 4DCHA 1QQNA 5ELZA 4BREA 3WUHA 2AA4A 4IO8A 3QDKA 1TUYA 5AQKA 5AZIA 3QBWA 5KQ8A 4FPAA 3VETA 4PKHA 2P9NA 5BN8A 5AQHA 3IFRA 1QZ5A 1SZ2A 2KHOA 2IVPA 3LDLA 3L6QA 2E1YA 4B1VA 3ZX3A 3BF3A 3QMLA 5TKYA 4CZGA 3P4IA 1LOTB 3A5OC 1WOQA 1SAZA 3H45C 4GY2B 4FOEA 4B1UB 3WXJA 4FL9A 3D2EA 4JHDA 2E2PA 3D2FB 4CD1A 3H46O 3WXIA 1ATRA 3VEVA 1ATSA 2Q0UA 1HUXA 2ASPA 3ULEA 2ITMA 2YJEA 2Q36A 3C0BA 4ISEA 3VGKA 2FLOA 1RDWX 4CZFA 4BR4A 1R59O 4FWNA 5FPMA 3DXKB 5AQUA 3O1WA 3U8XA 1X3MA 4M7YA 2GTDA 5AQIA 4JAXA 4MO4A 3VF6A 4BRCA 2FSNA 4FWQA 1JCFA 4H0OA 4EHUA 3CJCA 4O5FA 4WQ4A 4BR5A 3UE5A 4CZIA 5BREA 2OANA 4YDUC 3SMPA 2D0PA 2Q0RA 2CGLA 4H0VB 1Z6RA 3VERA 3H6EA 4FWLA 5F2RA 3H1VX 3WXLA 4C23A 1KAXA 3GDQA 3ZETA 1TYQB 4Z94A 3EZWA 3FE1A 2YI1A 4H0TB 4BGBA 3O08A 1YAGA 3IUCA 1J6ZA 1NGCA 3FZHA 4MLHA 1YUWA 2E88A 2ASOA 3AARA 3FFKB 1NWKA 4EAHD 1T6DA 3M3ZA 1MWMA 5FPEA 3LL3A 4AM6A 4BRLA 3QFPA 1NGAA 2V51B 3UKRA 4XH5A 1NGHA 3MN7A 1HPMA 2YHXA 3BF1A 3JXUA 5AFUH 2GELA 2A41A 3G25A 3FZKA 1NM1A 3VF2A 4LC9B 3SLCA 4O8KA 4JD2A 2DPNA 3DJCA 3WT0A 1K8KB 5JMVA 1S22A 1GLAG 4K25A 1Y64A 2NRHA 3O80A 5KPRA 4CBXA 4CZHA 2Q2RA 4M63C 3LM9A 4BG8A 4IJNA 3UKUB 4XEIA 3CJ1A 3C7NB 3HBTA 3ZX0A 2J4RA 1ZXOA 5KPZA 3AAQA 3H3OB 5AQTA 4H5TA 2A6AA 2QWRA 1EQYA 3FZLA 2YJFA 4H03B 2FSKA 4XH4A 2I7NA 1C0FA 4BRFA 2P9UA 2P9KA 2D0OA 4BQLA 3QFUA 4B1ZA 5KPTA 3ZEUA 2P9IA 3ENOA 5AFUA 4FO0A 5KQDA 4BRQA 5AZIB 3J8AA 3S41A 4BGAA 3F9MA 1U2VA 5ADXH 4FWOA 1T6CA 2BUPA 3R9PA 5BPLA 5EOYA 5AQJA 1GLJO 4IXCA 4EHTA 1GLFO 2HF4A 5BR9A 5AQNA 5EVZA 4CZLA 4E1JA 2YHYA 4I6MA 3QB0A 4CBUA 3AY9A 2H3GX 3FR0A 1Q18A 4B1YB 4H5RA 2QWMA 4CZJA 1QQMA 3MN5A 3WQTA 5EXWA 1X3NA 5AQRA 1NGGA 4CI6A 5F0XA 4IWVA 4HWIA 4BC5A 4EFHA 3VPZA 2IVOA 4RCHA 1BG3A 1KAYA 2W40A 4EIAA 4PL8A 3O4WA 3TPQA 3ULEB 3L0QA 4FWKA 4BC2A 3U9ZA 3O5BA 2P9SB 1ESVA 1DGKN 3EL2A 3IMXA 3CI5A 2PAVA 4YDUA 1WUAA 2ZGYA 1HKCA 4PKIA 3ATVA 2FSJA 2Q1NA 3RSEB 3VOVA 2ASMA 4QS8A 5ADXA 3EO3A 2P9PA 3DAWA 3MMVA 5LJVA 1BO5O 2YHWA 2GWJA 3WEEA 1JCEA 1NGFA 4JN4A 4XH1A 1D4XA 3A0IX 2CGKA 4BQZA 4J8FA 5JLFA 2PBDA 4IJAA 1BWFO 2FF3B 3CQYA 3HSCA 3VEOA 2YCHA 3DXKA 4B1WB 1HX1A 4BVOA 1MWKA 5BRDA 3VGMA 4K42A 5AQFA 2FXUA 3TU5A 4H5NA 3CJ9A 5LJWA 3MN9A 4BROA 3A8YA 3KHYA 1T44A 4DHYA 2AP1A 2P9LA 1P8ZA 2E2QA 2CH6A 3R6MA 4WQ5C 3UKRB 3LDQA 3WQUA 1U6ZA 3W0LA 2A5XA 4GNIA 3O8MA 2E1ZA 2F9TA 1BU6O 3CQXA 3FZFA 3M6GA 1QZ6A 4A62A 5JICA 4JD2B 5F1XA 3CHWA 4HTLA 2E2NA 2ZGZA 3U4LA 4NB4A 3HZ6A 3JS6A 4AM7A 5BPNA 1S3XA 2QXLA 3SMSA 1HLUA 3SK3A 2A42A 5AQZA 2WUSA 3A5LC 3FGUA 4FWMA 2V7ZA 2Q97A 2E2OA 4B1XB 3LDPA 4FPBA 1BOTO 4BRHA 2GUPA 4QS9A 5AZJB 1HJOA 2ZF5O 4A2BA 5AQPA 2QWPA 5AQVA 3QICA 5B8HA 1K8KA 1CZAN 1NGEA 2A3ZA 3UB5A 3ZX2A 3DXMA 2VCPA 4A2AA 4A61A 2BTFA 3B8AX 1E4FT 1OKJA 2P9IB 1GLBG 3GG4A 4H0PA 5EY4A 2UYTA 3ZEUB 1LCUA 4BR9A 4Y0WA 4NO7A 1NBWA 3DWLA 3UKUA 5AQQA 1RFQA 3L4IA 5AQOA 3C7NA 1X9JA 4L3QA 4BVPA 2P9NB 2Q31A 2V7YA 1NGJA 3A5MC 4BC4A 2VWBA 1NGIA 1Z05A 4BR7A 1HKBA 3MK6A 4F9OA 2D1KA 3VEWA 1QHAA 3MN6A 3ENHA 1TUUA 4MLEA 3D2EB 4JHDB 1GLCG 5AR0A 3SJHA 1DEJA 4B9QA 1NLVA 1QQOA 3GL1A 5AQGA 3R8EA 5BRHA 1SQKA 4CZMA 1YXQA 2CGJA 3MDQA 2A40A 4RWTA 1GLEG 4WYBA 4BRDA 4H0XB 2NLXA 3I8BA 5AQSA 1GLDG 3EN9A 1YVNA 4FWRA 2HMPA 3D7EO 3U9DA 1C0GA 3CERA 4BC3A 4BRAA 4CJ7A 2ZWHA 2P9PB 1IG8A 4H5WA 5FPDA 4BRPA 3D2FA 1HKGA 5AQWA 2W41A 2VYPA 1H1VA 2I7PA 3WEEB 1XC3A 1G99A 2HOEA 3CETA 3KZBA 4FSVA 3ZETB 2QWQA 1IJJA 5FPNA 4RTFD 4BR2A 4CD3A 2P9SA 4FWSA 2V52B 4KBOA 4QS7A 5AQLA 1BUPA 1V4TA 4IZ9A 4WQ5A 3RSEA 3GOIA 3VEXA 4ISFA 3CJBA 3HTVA 3ID8A 2GEMA 4BG9A 1BA0A 3GBTA 3QBXA 1DKGD 2P9LB 3VENA 1V4SA 1ZC6A 2EWSA 2CH5A 5EX5A 3O6WA 4PKGA 1MDUB 1XQSC 1TYQA 2QM1A 4WQ4C 5E26A 2F9WA 2IVNA 1NGBA 3CIPA 3FZMA 3I33A 4H5VA 3EKUA 3VF4A 5I9EB 3BUZB 2D4WA 4ISGA 4BRIA 4CZKA 3CJ7A 3WXKA 1NGDA 3VEYA 3H1QA 3M1FA 4CZEA 1BA1A 2HF3A 4DB3A 4PL7A 2QWNA 2QWOA 3AAPA 2E20A 3VEZA 2QW9A 4K41A 5JLHA 2QWLA 4BRMA 5AQYA 4BRNA 3LM2A 2E8AA 2NZTA 4FOIA 3VESA 5LY3A 3VGLA 3LDNA 1RGIA 1KAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SYZA 4M3ZA 1TK5A 3A5NC 1QSYA 3OYJA 4LH4A 3KVGA 1KLNA 3I0SA 2P9UB 1Y97A 1ZBSA 4RW8A 4BR0A 4JNEA 3EKSA 1S1WA 3D0PA 1ZYQA 3IS9A 4NLCA 3DYAA 5BPMA 4CBWA 4F3OA 3LPTA 2PY5A 4ILGB 5AZJA 3G10A 1XUPO 4K43A 4JKFA 4LSNA 2Z1HA 1TKTA 3OYIA 1GLLO 5J2PA 3BZCA 5BN9A 4BRKA 1QQNA 1VSLA 1IKVA 2AA4A 3KKRA 4KV8A 3L2WA 4IO8A 4ID5A 3I0RA 5AQKA 1UOCA 3AA3A 3VETA 3OYHA 5KGXA 3IFRA 2HBKA 4OGEA 1ASVA 3LDLA 3SV4A 1VSMA 4MDAA 4LFAK 2NNWA 5C2FA 4CZGA 1CXQA 5DM6L 1WSJA 4KHYA 2HHXA 3KD5E 3ZSWA 4FL9A 4WFNL 2HHSA 2E2PA 3D2FB 1RT2A 3OVNA 4MDBA 4DSJA 3O9RA 3THVA 4FLZA 1ATSA 4I7FA 4KH4A 4E7LA 3D45A 2Q36A 4CVNE 2FLOA 4CF1A 4LFBK 4FWNA 3ZT3A 3U8XA 3VQ7A 2KZMA 4M7YA 1BISA 4MO4A 2FSNA 5KI6A 1KTQA 4RW9A 4WQ4A 3UE5A 3JYTA 1N5YA 3KD1E 1JLAA 4YOWA 3SMPA 2Q0RA 1Z6RA 2X78A 1A5VA 3H6EA 3KKSA 3CFRA 3AA5X 1RTHA 3BZKA 1FJGK 2HNZA 4FZXC 4OGCA 1BL3A 2GV9A 4C8OA 1YUWA 4CJ3A 1RNHA 3AARA 3MWPA 1BHLA 3O9SA 1C1BA 3VQCA 2HHUA 3QFPA 3QEWA 2W6KA 4XH5A 2OTJN 4B8CA 1HPMA 4CW7B 5IT9O 3RRHA 3TAFA 4AILC 1WSHA 2A41A 3G25A 3FZKA 2G8UA 4B9UA 1FKOA 3HPHA 1J5EK 2G8KA 2O8FB 4FYDA 3DJCA 3C94A 3WT0A 4DF4A 4FJHA 1VQKN 5JMVA 2UXCK 1S9EA 5FLXO 4CJRA 5HRRA 1LW0A 4K25A 3S3NA 3S3OA 1KSPA 4DQIA 3I55N 2Q2RA 2DFHA 4FJLA 4CJWA 2F7TA 3TABA 3R1XA 5GAHP 2R7YA 1SS6A 1HQUA 5AQTA 1EQYA 5SZTA 4AQYK 1JL1A 2YJFA 4O55A 4NXNK 3P38A 2FSKA 2OPQA 3HPGA 3V6DA 2D0OA 4GMJB 3NF9A 1VQMN 2O8DB 1RT4A 4KHPK 3PSIA 5KPTA 1KVCA 5AZIB 3FFIA 4KFBA 4BGAA 1NOYA 1U2VA 4CEFA 3M8SA 4EZ6A 4U67L 1EWRA 3M5RA 4M41A 4CZLA 4E1JA 4N47A 3OYAA 2H3GX 1Q18A 4JLHA 4DWIA 4CZJA 1O1WA 2X6NA 1NGGA 3DRRA 2KLAA 4JKCA 3CQ8A 4EFHA 4JKAA 2IVOA 4F3TA 2FBYA 1W7AA 1KAYA 4JI7K 2W40A 4CJLA 3JAMO 5H1SQ 2F8TA 2VG6A 4BC2A 2P9SB 1ESVA 2HB5A 4E19A 1WUAA 3ZSZA 1HKCA 4NYNA 3VOVA 2Q1NA 3QIPA 4CHYA 3DLBA 1VRUA 5E41A 4DV3K 2P9PA 3AO5A 4DV4K 2OPSA 3UIQA 2QK9A 1NGFA 3PO5A 4XH1A 1D4XA 4WFAL 3MX5A 4JK8A 4HHTA 5JLFA 1N36K 1HMVA 3TAMA 1KLMA 3CYMA 3PY8A 1XNRK 1VQ8N 4O4GA 3MCAB 2JWLA 4BVOA 3NGYA 5BRDA 1JJ2M 3LAMA 3DOLA 4H5NA 4CFBA 4DKWA 2E2QA 2CH6A 2O8EA 3LDQA 2B5JA 3THXA 2KZZA 3EYZA 1WB9A 3THWB 2X6SA 1BQNA 1WAFA 3O8MA 4FJ5A 1TKXA 2F9TA 3LALA 3FZFA 1J53A 5JICA 1CXUA 4C8NA 3BGRA 3OYDA 3CCSN 4JRQA 3AVJA 1TL3A 1X9MA 3A5LC 1REVA 3FGUA 4H4MA 1EETA 2IC3A 3SBTA 2JLEA 4LSLA 2HBMA 4IG3A 4B1XB 3SQ1A 5AZJB 3IG1A 4A2BA 3SQ0A 5HLFA 4DR7K 3QICA 1W2BM 2A3ZA 4HUFA 1T8EA 2YKMA 4PQUA 4A2AA 1DT9A 4BR9A 4DV2K 4NO7A 1RDUA 3DWLA 5AQQA 1RFQA 3L4IA 1OH8A 5AQOA 1SKRA 4DTMA 1ITGA 4BVPA 1K9MO 4LF9K 1VQ9N 2Q31A 3K9KA 3CCJN 1JLBA 4DFJA 4FLXA 1XHZA 4A59A 3PV8A 2A1RA 3RR8A 1HNIA 2XHBA 4F9OA 4JKDA 2D1KA 3HP6A 3MN6A 1FK9A 5J2NA 4AHSA 1XWLA 3ZT0A 4B9QA 5M1FA 2QXFA 1L3VA 4FJGA 5LMNK 5KRSA 4M3WA 1YXQA 3NH0A 2OTLN 4WYBA 4BRDA 2NLXA 3I8BA 1GLDG 1ZBLA 4QCLA 5HRNA 2YNHA 3V4IA 3U9DA 1C0GA 3CERA 4BC3A 1EKEA 2UUBK 2HNDA 3K9JA 4DSKA 1KVBA 4BRPA 3D2FA 1XMOK 2OA8A 2W41A 1LW2A 3LDSA 3WEEB 3ITHA 4ELTA 4FJIA 4A5BA 3O4QA 4LH5A 3A2FA 3KZBA 3L3UA 4FSVA 4B08A 1IJJA 1KVAA 3AO2A 3O3FA 4HCBA 4FWSA 4LF6K 2V52B 3P39A 4QS7A 5C25A 1VQ5N 3VEXA 1ILYA 3CJBA 2DFEA 4BG9A 1YIJN 3NH1A 4GV3A 3QBXA 3SUOA 4ICLA 1C0TA 4KO0A 4KH6A 2UUCK 4PKGA 3MEGA 1J9AA 2QKBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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