3ABOA

Crystal structure of ethanolamine ammonia-lyase from escherichia coli complexed with cn-cbl and ethanolamine
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
453
structure length
453
Chain Sequence
MKLKTTLFGNVYQFKDVKEVLAKANELRSGDVLAGVAAASSQERVAAKQVLSEMTVADIRNNPVIAYEDDCVTRLIQDDVNETAYNQIKNWSISELREYVLSDETSVDDIAFTRKGLTSEVVAAVAKICSNADLIYGAKKMPVIKKANTTIGIPGTFSARLQPNDTRDDVQSIAAQIYEGLSFGVGDAVIGVNPVTDDVENLSRVLDTIYGVIDKFNIPTQGCVLAHVTTQIEAIRRGAPGGLIFQSICGSEKGLKEFGVELAMLDEARAVGAEFNRIAGENCLYFETGQGSALSAGANFGADQVTMEARNYGLARHYDPFIVNTVVGFIGPEYLYNDRQIIRAGLEDHFMGKLSGISMGCDCCYTNHADADQNLNENLMILLATAGCNYIMGMPLGDDIMLNYQTTAFHDTATVRQLLNLRPSPEFERWLESMGIMANGRLTKRAGDPSLFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Lyase
molecule keywords Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
publication title Crystal structures of ethanolamine ammonia-lyase complexed with coenzyme B12 analogs and substrates.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 191
structure length 453
sequence length 453
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date 2009-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06751 EutB Ethanolamine ammonia lyase large subunit (EutB)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.220.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Annexin V; domain 1 lyase 3aboA02
2.30.170.30 Mainly Beta Roll Ribosomal Protein L24e; Chain: T; ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like 3aboA01
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3aboA03
3T44A 1MEHA 2OX1A 2YX0A 4CCEA 3C6CA 3EB2A 3STGA 2QF7A 1JCNA 5FF0A 4IPIA 3G1FA 1PS9A 1AW2A 3C52A 3QSTA 4ADSA 3QW3A 3FKKA 1C9DA 2TRSA 1THFD 1YXDA 4O16A 4ZQOA 3NVTA 4QITA 3O07A 3NDOA 1VJIA 3UWVA 4HSOA 2NXHA 3P67A 4IMFA 4S1FA 4FXRA 1H7XA 3LXBA 1NFBA 1DVJA 4QNWA 2PE4A 3CPRA 3MMTA 4LV4A 3C2EA 4DPQA 5TQLA 4AHPA 4I7UA 1RQHA 1EPXA 5G2HA 2ZZ7A 1ICPA 1ONRA 4WQ6A 3W7GA 1F76A 2HMCA 1U83A 3TXZA 4XBKA 4AF0B 2H6RA 1YXCA 1EP1A 3W71A 2WV8A 1H1YA 2ABAA 3UWZA 2ZRWA 1Z48A 4GFSA 1H51A 3L5AA 2XN1A 2VOMA 1WXJA 4GE8A 1QCWA 3DENA 3QC3A 2AQWA 1HL2A 3SFKA 2UV8G 1VHCA 2VFGA 2WSYA 3O16A 2A5HA 1O5KA 3S1XA 3C0JA 3GDTA 2I1OA 1NEYA 4BI5A 4LVAA 1YPFA 2FB2A 3GNNA 2YFOA 4O1BA 1SR9A 3HOJA 4B5NA 1XXXA 1OF6A 2TMDA 3GR7A 3MJYA 2QR6A 3D0CA 4RJEA 1DQWA 1FWWA 3QQ1A 1ZJIA 1GVSA 3B04A 1JJKA 2Y85A 5BW6A 1W56A 4IWWA 5LNUA 2W0UA 2ZQ0A 3MBDA 5EYWA 2GJLA 4TO8A 4JTKA 4EF9A 5KITA 4RCXA 3TU9A 3RNDA 3CEPA 1RD5A 1LCOA 3E12A 4GUIA 5G2WA 1G6CA 1TPB1 2A7RA 3ZR4A 3FIGA 5HQEA 3NPWA 4EF8A 1OFEA 3OG3A 3BW3A 1CW2A 1JQVA 1G4TA 2RHGA 2E6FA 2Y7EA 3GDRA 4NQ1A 4GWEA 2QDHA 3E96A 1RQBA 3NQDA 4UMCA 1LOLA 4LS2A 3H55A 2QCHA 3HO8A 4WOZA 3TC6A 1TTJA 1WDWA 1K8XA 2DZUA 4AWUA 5I3KA 2E6YA 4AWSA 1GVFA 1O94A 3S6DA 3HG4A 1H7PA 3G1SA 2AAMA 1I2OA 1FDJA 1GT8A 4JTGA 2CLMA 1SW7A 1OX6A 1RZMA 5LKYA 1R46A 3PVFA 3O6YX 4IUOA 1NF7A 3TXVA 4ZQPA 1OFPA 3LDVA 3PS7A 3GDLA 4JTIA 4KFOA 3NQ7A 4WD0A 4DO5A 1IGSA 3E0IA 1VPXA 1VQTA 2Z6IA 4MY1A 1F73A 3EX6A 3KFTA 3MI2A 4QIUA 5K9DA 2QAPA 4JIPA 2GVJA 4FNTA 5DXYA 4ZZ9A 1F6PA 4J9JA 1QR7A 3QPYA 3BO9A 2OT0A 3UWWA 1UJPA 4JD4A 3HG5A 2JKAA 2A2IA 3IVUA 4O52A 1OFOA 3NQVA 2RH9A 2EKCA 1RR2A 3WJWA 5AOUA 3BW2A 4A29A 1PCKA 1R2RA 5BNKA 4BF9A 3KRSA 5FEXA 1G7VA 3TMLA 4JY9A 4DEFA 4CCCA 2H90A 3GAKA 4KWVA 4YCOA 4GUGA 1DBTA 3G1DA 3NYZA 5F1VA 4WY0F 4ALDA 5CPMA 1R2TA 2A1YA 3M5YA 1KFCA 5U4NA 3HGRA 4EWND 4LC8A 3FJ6A 1TPWA 4MVAA 2X1TA 3MHFA 3WK2A 3L5MA 2EHHA 2E6DA 2Q8ZA 4O0KA 4ADTA 2WO5A 4UMAA 2NZLA 4UTIA 2RDTA 3B0PA 1CI1A 2IQTA 1XM3A 4Y8FA 3AO0A 2PRHA 2YCEA 1TCDA 5DCEA 3BG3A 4UTTA 1LRNA 4K8HA 4Y6GA 2JGQA 4Z08A 3WFAA 3WJSA 4X2RA 2H8ZA 3M5ZA 1SO5A 1LOQA 4JGDA 3W86A 5CPLA 3W75A 5DBTA 1YPIA 1W3IA 3KVLA 2G96A 2WQPA 1EUAA 1IIGA 1LRTA 5EBUA 4MZ8A 3QFEA 4QISA 3B4UA 1SU5A 4JY8A 2XN0A 2B7QA 4MUZA 4Z0JA 2CZ5A 3YPIA 3TCEA 4FIQA 5LNWA 2VEIA 4MY9A 1W5QA 3BV4A 4OT7A 1WAUA 4AHQA 1XCFA 3P5ZA 1H5YA 3IGXA 1YADA 1L6YA 1O4UA 4N6EA 2A7PA 3A23A 1JR1A 1OFDA 1AL7A 3CIXA 2HSAA 1XI3A 1WX0A 1GG0A 3MI6A 4I7WA 4C1LA 1ME9A 3FKRA 1LYXA 5AB3A 1M6JA 4E2DA 3W7CA 5BMXA 4RKAA 5EY5A 4UCGA 3ABQA 5CPNA 3KXQA 2GPTA 3ZWTA 1L6SA 3LBMA 3W7JA 1TREA 3W1QA 3W83A 4TMCA 1EWDA 3P8IA 4FNUA 3S0CA 3NPVA 1MEIA 5D02A 2JK2A 1QOQA 3DKJA 3W7NA 1LM1A 1QPOA 4E2BA 2DZWA 1HO4A 4MLRA 5F1UA 1EP3A 1K7EA 4Z1CA 3FS2A 4E0CA 3CB8A 3C61A 3M0ZA 1NSJA 3DGRA 1TSIA 3MW7A 3LV5A 5CZ0A 2CLIA 1GYLA 3G22A 3HQ1A 4LVBA 3OVRA 2Y62A 3W2KA 3UQNA 1HG3A 2QCMA 3BGGA 4IOTA 3DHFA 4LVDA 1K8ZA 2Y7GA 1H7NA 2ZTJA 4K6AA 3PB0A 1XFBA 4UTHA 4QNEA 4LU0A 3GB6A 4POCA 3W9ZA 4HT3A 4WXZA 4LRSA 4HNVA 1OK4A 3I7RA 4ONVA 5HJLA 3E49A 2J9ZA 4WY0A 5G4WA 1R47A 1LLWA 3LCXA 3BLEA 1G4EA 1SSGA 1OG0A 4JTUA 2JKPA 3IGSA 2H3BA 1H62A 4JYEA 2ZA2A 2CZDA 1MXSA 2YGYA 4LOCA 1NF0A 2DZVA 1RPXA 4KFNA 3G3MA 2QCGA 5LSMA 3P80A 1EIXA 4DBEA 2YR1A 1C8VA 4N9BA 4UTJA 3O6CA 4O19A 3GZ3A 4JIQA 2BX7A 3RF9A 3KX6A 4M19A 4TIMA 3OA3A 5G2IA 3H53A 3LV6A 5C5YA 2PCQA 4MFDA 1IXPA 3KRUA 3Q58A 3TJLA 3NGJA 5EMUA 4O57A 1DKWA 1W5NA 4AMAA 3LB0A 3W3OA 1ZCOA 3PB2A 2A6LA 4YWIA 1YTDA 4O18A 5AN7A 2J27A 5FESA 3GVGA 4O1AA 3TIMA 3R13A 1QOPA 1TV8A 2C19A 3W7PA 1W5PA 1JUEA 4LY8A 4NU7A 3R8RA 1W3TA 4R53A 1KM1A 3R2GA 1QPQA 3QF0A 4ICNA 3W7EA 2NXGA 3FYPA 1TQXA 2Z6JA 3FJLA 1O5XA 5LNRA 1KV5A 3SY5A 3PWAA 5CKSA 3CEUA 1YDVA 5I3IA 2RFGA 2VXNA 3NPXA 2G95A 3PC0A 1XBYA 1TTIA 4M7SA 5D2XA 3SJ3A 1ICQA 3NXFA 3KVMA 4O53A 5BRBA 4ZMGA 3TQKA 4FNPA 3LCIA 3VFLA 1DHPA 1FDYA 1SPQA 1I45A 4N9CA 4HPJA 4IMCA 1EUNA 1A5SA 2ZZ1A 2VFDA 2ZRZA 3TKFA 2VFHA 3HJZA 1LBLA 1LBMA 4ZQMA 4AXKA 4PL1A 3EWBX 4MPQA 4AH7A 4MZ1A 1DORA 1W37A 3UYCA 3A24A 3HPXA 1ME7A 4NJKA 3THQA 5CPOA 3THAA 1TPH1 3MHUA 2C6QA 2YSWA 3LBCA 3PF3A 2GVGA 4YMZA 1DL3A 2ATSA 2FPVA 2BZNA 2A85A 2YDAA 4O1CA 4M6QA 4Q32A 1VYSX 3R5EA 3HG3A 1N8FA 3L5LA 3INPA 1L2UA 4UTWC 1OFBA 3QSRA 3EKZA 3NR0A 2Y61A 5C6MA 3QMSA 2QUVA 4MY8A 2CLEA 3P81A 4N6FA 3LXAA 5G5IA 5AYYA 3W72A 5FI8A 1GG1A 3IIZA 1T96A 3BPWA 3TW6A 3IRDA 2GOUA 2HTMA 1H7WA 2DZPA 2FLIA 1J2WA 4PEKA 1B3OA 3EX3A 1JQXA 4S2CA 2NX3A 4RZ6A 1TIMA 5K9CA 3W2NA 2FIQA 2CLKA 1W1ZA 3L21A 2YFNA 2YW4A 5AYZA 3CC1A 1LBFA 2X1SA 3W1NA 3BARA 3FOKA 1QPRA 2FQIA 4A22A 5G4EA 1A53A 3W1PA 3QYQA 5KTLA 3DI0A 1X1ZA 3W7DA 3N19B 4ZQNA 1KFKA 5E0KA 4BK9A 1PHWA 2NWRA 2W79A 5DCDA 2VFFA 3W74A 2NX9A 2VKZG 3MWAA 1UCWA 5FF4A 5G1TA 2JBMA 4PFMA 3NQMA 4CQAA 2C15A 3W7IA 3TW7A 3G1HA 3LTSA 4H3DA 4JX4A 3UWYA 3EWWA 3DAQA 1G67A 5MHBA 1SZFA 1O60A 1PCWA 3M7WA 3S8HA 4HPXA 3TAKA 2F84A 2ZYFA 4MLJA 5D2YA 1Q6RA 2ALDA 3N3MA 2YYTA 2ATMA 2C16A 4A21A 3CT7A 4LVGA 3L66A 3O63A 3MP3A 3S1VA 4CNNA 2GQ9A 3M16A 3M5VA 3HB9A 3W23A 4UUIA 3DHDA 1RV8A 3V75A 1M5WA 3N9RA 1OYAA 1LRQA 4O54A 1A5BA 3C56A 1XBVA 2Y7FA 3PSWA 3C2VA 2ZFAA 3LLFA 2V5BA 3MBFA 1YTKA 3RK8A 3RLUA 4FX8A 1GWJA 1QDSA 5DN1A 1KM6A 5DCBA 2ZBTA 3S1WA 3NOEA 4DF2A 5AC6A 2X2GA 2ZZ4A 3TFCA 4FX7A 2DJXA 1DJNA 5HR6A 4BI7A 3PBWA 4UXDA 1OYBA 4GUHA 3WJYA 1QPNA 3P8JA 2DP3A 1SZGA 4K8EA 1MO0A 1TO3A 2DZSA 4H4IA 1S3HA 1TJRA 3DFSA 4O11A 3RFAA 5HNRA 4C1KA 3G8EA 1Z42A 1UUOA 3IV3A 2J9YA 3W7HA 1H63A 3VCRA 1LROA 4D2JA 4JTLA 1GVRA 3ATZA 1OX4A 1H7OA 2P1FA 4QJ1A 3OHIA 1V7YA 4XQ6A 3SW6A 3GR8A 4BI6A 3MYOA 3VE7A 3MP5A 1JCYA 1L6WA 1KFEA 3W85A 3LHTA 3W7QA 1W8SA 2C1HA 1O95A 4O0ZA 1SZNA 3W73A 4UFJA 4L4LA 4Z1AA 1U5JA 2A0NA 1IF2A 1IIHA 5E1QA 4JTFA 3UXDA 2E68A 1DJQA 2O7QA 1A50A 2DJLA 1XDLA 3FYOA 2DU2A 3LHYA 5LNVA 2C18A 3IIVA 3GIYA 2E5CA 3C4UA 1P1XA 2EF9A 5HWJA 2FJKA 1S5WA 1VC4A 3KOFA 2FPYA 2FFCA 3LI0A 2TYSA 5AC7A 3C2FA 5ABTA 4JS3A 1P5BA 4LW7A 4QAIA 2ISWA 1TPC1 3P60A 1KW1A 4ORMA 4TR9A 2CZEA 3NPUA 5LGZA 5AHIA 4DO6A 5EKYA 1W54A 3Q2DA 3BVJA 1JUKA 4NNAA 4OE7A 1ZAHA 2QDGA 5IBXC 2PRLA 3FA5A 1BKSA 4UR7A 4M6PA 4NUWA 3GNDA 2VEMA 3BGJA 1H60A 2GJNA 1LORA 1ALDA 4GUFA 1AW1A 3PG8A 4NNCA 1UB3A 2QCFA 4KKXA 4K39A 2Z2UA 3EEGA 1F6KA 4LVFA 1Q45A 4Q33A 2ZZ5A 6TIMA 5D33A 4LUIA 4WX2A 1KFJA 3W1XA 2E6AA 2ISSA 2VELA 3NA8A 4LWWA 3IGUA 3PUDA 4FIRA 3HGJA 3QMTA 1E51A 2BTMA 3LHZA 3WJXA 2YYUA 1PIIA 1S5TA 1K8YA 4K37A 3LCWA 4UR8A 4UTUA 2V2DA 1PL9A 1F74A 1NVMA 2VFIA 1LLZA 1XUUA 3P5YA 2V81A 3KVKA 5K2ZA 2QCNA 4HHPA 4A2SA 1TPUA 3N9SA 3L2IA 3LRLA 3S1UA 2RKXA 3DU0A 1FWSA 2Y6ZA 2VENA 3F1QA 4O1DA 3CHVA 2BSLA 4FX6M 4BR1A 4DELA 3GXPA 3GDKA 4NX5A 2DZXA 4UC5A 1OFRA 2WJZA 5TIMA 3F03K 3VE9A 3ELFA 1VRDA 3KVJA 3S5NA 1D3HA 4XBSA 1B4KA 4N9EA 3ANYA 4ZQRA 2VEKA 3PY2A 2J9XA 4ZQCA 3M47A 2ZZ6A 1VLWA 3VKJA 3NQ6A 3DFTA 3NAVA 3TA6A 3CQ0A 3I68A 4JYFA 3WK3A 8TIMA 1G4SA 1SFJA 1N55A 1K03A 1P4CA 4AHOA 3TSMA 1ZY9A 4HN4A 4AWTA 1P0NA 3NQFA 3NEVA 3LRMA 1QAPA 4UFIA 5FEZA 1AL8A 3HBLA 1A5CA 2WSRA 3W7KA 3UNDA 3LCHA 1WYIA 5DY3A 1X6UA 5J5DA 1Q6QA 3EWUA 5G1YA 1ZFJA 4HSNA 1EX5A 3QEZA 4OV4A 1I2QA 1EEPA 1TV7A 4U4MA 4WJEA 2E1DA 4X22A 3S9YA 4GUJA 5D30A 4JXCA 5L9FA 3HPZA 1QMLA 1TQJA 3EX2A 2FB3A 2QKFA 3A21A 4DXVA 5IM51 3G0XA 3TK7A 3PM6A 3ATYA 5I3HA 3EWYA 3CM4A 4N02A 4OV9A 4XWUA 3N2MA 5HUPA 5KZEA 3FFSA 2E5DA 1FQ0A 1VR6A 1YLVA 3GXNA 5KINA 1ADOA 3ZWSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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