3AFBA

Crystal structures of catalytic site mutants of active domain 2 of chitinase from pyrococcus furiosus
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
GPNANPIPEHFFAPYIDMSLSVHKPLVEYAKLTGTKYFTLAFILYSSVYNGPAWAGSIPLEKFVDEVRELREIGGEVIIAFGGAVGPYLCQQASTPEQLAEWYIKVIDTYNATYLDFAIEAGIDADKLADALLIVQRERPWVKFSFTLPSDPGIGLAGGYGIIETMAKKGVRVDRVNPMTMDYYWTPSNAENAIKVAENVFRQLKQIYPEKSDEEIWKMIGLTPMIGVNDDKSVFTLEDAQQLVDWAIQHKIGSLAFWSVDRDHPGPTGEVSPLHRGTNDPDWAFSHVFVKFMEAFGYTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Putative chitinase
publication title Kinetic and crystallographic analyses of the catalytic domain of chitinase from Pyrococcus furiosus- the role of conserved residues in the active site
pubmed doi rcsb
source organism Pyrococcus furiosus
total genus 113
structure length 300
sequence length 300
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-02-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3afbA00
5FCZA 2PWHA 4MTVA 4H41A 3ZJKA 3I3DA 2GDVA 5ABGA 3WF2A 3WBEA 4JIEA 3VMNA 3UESA 3GXFA 2XJ7A 3NDZA 3QHOA 4JFVA 4S3KA 3GTNA 2JFEX 3K46A 2WC3A 2D20A 1P6WA 1J11A 1X6NA 1KXVA 5I79A 3WF3A 1J12A 1WZMA 1QNSA 3L2MA 1XD1A 3WDIA 1N82A 4PMXA 4JHOA 5A2AA 4M8UA 4PMVA 3GNPA 4HZ8A 1C8XA 3WQWA 2J75A 2QMJA 1J0KA 1JZ6A 1SMAA 4S3JA 3AZTA 1XYFA 3WH6A 1QOXA 1JDAA 4A4AA 1UR0A 3AIVA 3G6LA 3VNYA 3WNKA 2ZX9A 3GNOA 1E40A 8A3HA 1C7TA 4U5IA 1O6IA 4B9ZA 1AMYA 1E6QM 1GJWA 1UWTA 4LQ1A 2XFFA 4B16A 1VFFA 3AYSA 3VIGA 1KFWA 2JEQA 4DUVA 2O9RA 4ACZA 3GZAA 2GFTA 1MW3A 3PZTA 1JL8A 1NOWA 4ZXLA 2Y8KA 3WL1A 1PJ9A 2DT2A 4XZBA 2X1IA 3OA5A 3F4VA 2OWCA 2DSVA 3AXHA 1WDQA 2G3MA 3WF0A 1QW9A 1ZBWA 3VD9A 2VL4A 5LA0A 2ZX7A 2WANA 4AISA 4FLOA 2F61A 3W4RA 3W24A 1KBBA 2BXZA 3W81A 2G3NA 1FOBA 1TUXA 2BXYA 4AD0A 3RMEA 5A94A 4GO8A 1PX3A 2VT0A 3VIPA 2WMKA 1WKYA 2J8FA 3BAIA 1US3A 1B31A 5TD4A 2DSUA 2J62A 5HNNA 1OINA 2FHBA 3FAWA 3F5LA 2XFRA 1UD2A 1YQ2A 1MVYA 4OUEA 1UKOA 3NYDA 4MNMA 4F79A 3AHTA 2CBIA 5A2CA 1HT6A 1MW0A 1E43A 2WNWA 4E8DA 2IXUA 3CMGA 2GVYA 3VGBA 1OT1A 5A8OA 3CGTA 3CZ8A 2WZEA 3SIMA 2F2HA 4RE3A 3WEZA 1BFNA 1GQKA 3HN3A 4UFHA 1K9FA 3AS0A 2X05A 2WXDM 1F4HA 2ZUMA 1FFQA 5BYWA 2YDSA 2WWCA 4OOUA 1A3HA 4AMCA 3GXIA 4PTMA 2VO5A 1BYAA 1PX4A 3DHUA 2WVSA 4A3HA 5HBFA 4HPHA 2E9MA 4OJYA 1Y7VA 1HJXA 1UD3A 3IJ8A 3U5UA 4W5UA 3ZJ7A 5I6SA 3VDAA 1CXKA 1HJSA 1QNOA 3BAYA 3NSMA 4PTWA 2BVYA 3PZGA 1JYVA 4D71A 2AOSA 4MJ4A 2JF6A 2WCAA 1BHGA 2Q8XA 3RO8A 1CGTA 2WHMA 1EA9C 2CETA 2B31A 1LJYA 2NSXA 4JAWA 3FHAA 1OGGA 1OD0A 1E4MM 1NP2A 3PBGA 3AS1A 3MMDA 2DIJA 1M04A 3MU7A 4P8VA 1FHLA 3VD4A 4B3LA 3WD2A 4XX6A 3I3EA 4IISA 4Z2KA 1CLVA 2UY3A 3BMWA 3SCTA 4Z2LA 2ZXDA 1UKTA 1IZJA 3SURA 3WY1A 3ZM8A 5IHSA 1Z32X 2XUCA 3DECA 1K9TA 3SCUA 3SCRA 4AD4A 1BQCA 2Y2WA 2XHYA 3CMJA 3VD7A 1ISVA 1HF6A 3OLGA 4C7DA 4MJ2A 2WMHA 1KWGA 3A47A 1G1YA 1H09A 1U2YA 1J0ZA 3ARRA 1E3ZA 4AY1A 1CGVA 4FLRA 3AXXA 1E70M 2VR5A 3PZIA 1OIMA 2W5FA 3UCQA 1UR2A 3K4AA 1UA7A 3QGVA 5CZKA 1UYQA 4AZCA 1JIBA 4XZWA 5A6BD 1QBAA 1KQYA 1HJQA 2OSXA 1UWSA 1E6ZA 4WLCA 2PWGA 1NP0A 1ITCA 2E40A 1DWIM 7CGTA 4D6FA 1L8NA 1OCQA 2D0GA 1FP9A 2XVPA 3LPOA 1EXPA 3WDQA 3KZSA 4CN1A 3GH5A 5GNYA 2ZWZA 2Y8VA 3N15A 1DWFM 4UFJA 3VDHA 1EH9A 4F66A 1C7SA 4DWSC 1I75A 2E8ZA 1WB0A 3N18A 4LYRA 2J74A 3L4ZA 2W92A 3VIKA 4DM2A 3QHMA 2J7EA 4EAMA 1MQQA 3VMPA 1M01A 4TTUA 2G3JA 2VVSA 4EANA 1OBAA 2JE8A 3HMCA 3VIHA 2Y24A 2CBJA 1VJZA 1J0JA 3L4XA 1R8LA 4PTXA 4HTYA 4L4OA 3AQUA 1IT0A 1Q6GA 1IZKA 3PZ9A 1HVXA 2WAGA 4D6JA 5DEZA 2CPUA 2G4FA 5CPSA 3PTQA 1GQLA 3GXMA 1CGYA 1GONA 4AZIA 3A4XA 3ZR6A 3CPUA 1CNVA 1E6PA 2WM0A 4YPJA 2JEPA 2FGZA 3PTKA 3J7HA 1D3CA 1E4IA 1NWRA 2NT1A 1M7XA 4NZCA 4OZOA 2ZE0A 2XWEA 1I1WA 3WH9A 1M03A 3CHFA 3AIEA 1B9ZA 2WVTA 3M07A 4AIUA 1KXTA 2JALA 2ZUNA 2O9OA 1W2VA 4W85A 4R5EA 2D2OA 2GJRA 3AHVA 2WMJA 5BRQA 3M46A 1XH2A 5HPCA 2J7GA 4MAZA 1VFOA 1TZ7A 3M7SA 4J3XA 2J78A 3QOKA 3K8KA 1W9DM 2RGLA 5BXRA 3DYPA 3VDBA 4YN5A 5HOSA 1FP8A 1LLOA 1HKMA 5DT7A 4J3SA 1MYRA 4AD2A 4X9YA 5A1AA 2VZSA 2YDRA 4D6IA 1NM9A 4H8UA 4J3TA 1LWJA 3AZSA 3CH9A 1NWTA 3ZO9A 3WF4A 3PZNA 4BCEA 1EQPA 1Q6EA 1XC6A 1GORA 4MPKA 4B9YA 1HIZA 4HMCA 4TVDA 3WFLA 2BFGA 3F5KA 5KZ6A 3NSNA 4DM1A 1KBKA 4MNKA 5FL0A 3BCFA 3OG2A 4UQAA 2E0PA 5FKYA 2CHNA 4BZYA 1SR0A 3AS3A 5E9AA 4W89A 1VRXA 3ARZA 6CGTA 3EYPA 3ZMRA 3N04A 4URIA 1ZU8A 3WH5A 2O92A 3IAPA 1Q6CA 3UG5A 4AD1A 2VCAA 4M56A 3IJ9A 1JF6A 2E9BA 4UQ9A 1RH9A 4JZ5A 2Z1KA 4QLJA 1JD9A 2BY2A 4W84A 1MWOA 4YHGA 5JBEA 1SYTA 2C8NA 3RILA 5IXEA 4JHZA 2ZIDA 2WCSA 1ESWA 3ZSSA 2OYKA 4HP5A 2VJXA 2HVMA 1EQCA 1JAEA 3ARPA 3CUIA 4UQDA 5I78A 2YDQA 5IDIA 3EMZA 3EDJA 3LPFA 2X09A 2X2YA 2WVVB 1E4NA 5D9PA 4B3KA 3AHYA 4OKDA 4WF7A 2GSJA 2NT0A 5CSYA 5A6LA 5D9NA 4CVUA 2ZUSA 3GBEA 1KCLA 1FA2A 1E6NA 2W91A 2WMIA 1ISWA 5M03A 1R7OA 5DF0A 3U57A 2YJQA 3QHNA 2YL9A 1OGBA 1CLXA 2UWFA 3W6MA 2DT3A 4BQ4A 5BWFA 3WNMA 4XUYA 1JZ7A 2DSZA 2ZICA 5F7UA 3HJEA 4PUDA 1LG1A 1LWHA 4W5ZA 3BH4A 4BA0A 1JNEA 3UR7A 2WYSA 1WNOA 5A8PA 3MUAA 3SCPA 2PC8A 5IHRA 2BV9A 4W7VA 4PMYA 4AWEA 5E09A 3FY1A 3VUPA 1C93A 4ATWA 4GI9A 1G5AA 1BGAA 4HMEA 4W87A 4IM4A 4CU7A 3CUJA 4CD6A 1ODZA 5FOOA 1E1EA 3SEPA 4KGJA 2YIHA 2FHFA 1HJVA 4ZEPA 4J3VA 3VIMA 1HL9A 2DH2A 1C3FA 4E2OA 2ZXQA 1LQ0A 5A6BA 3II1A 3WF1A 2PWDA 3L4VA 4JCLA 4KH2A 5CJ5A 5AYBA 1K9EA 4JFWA 4J3WA 1GVIA 1XYZA 3WMCA 1UH4A 1CXHA 1BYCA 2X8RA 4ZXOA 3AISA 3OLEA 2PBGA 4CU6A 1E9LA 4PTVA 3CLWA 2A3HA 1UQZA 1CBGA 3WSUA 1J0IA 1WPCA 3AHZA 3AZRA 1TMQA 2WK2A 1KXQA 1QNRA 3LMYA 3F5JA 3WIJA 2XVLA 3VGHA 1OSEA 1GOOA 3FN9A 3WH7A 3AYRA 3AMGA 1XRVA 4D6GA 4ML4A 4MDPA 3VPLA 3T0AA 2W62A 1PPIA 3WQ4A 4H8HA 3OB8A 1R85A 1EO7A 1JXJA 2WMGA 4M80A 2VVNA 1WDSA 2GK1A 4UOQA 3POHA 4HU8A 2OYMA 3ARWA 4PCSA 1VFMA 2WVVA 3AHXA 1HP5A 3CHCA 3VILA 3GYCA 2VTFA 4RL3A 1R87A 2VCCA 2OSYA 3UG3A 1JNDA 4HPGA 5EFDA 5CQ1A 3K8LA 1R7AA 1V6VA 1BG9A 2XVNA 3CHEA 4PBGA 2F8QA 2O9TA 1UH2A 1U33A 4AYSA 1ZBKA 1AVAA 3POCA 1V6UA 3WMSA 3OGVA 1V03A 4MDOA 3AOFA 3VX1A 3EBVA 1QHZA 5EMYA 1GOQA 3FW6A 1VENA 5ABHA 2OYLA 1GOMA 3PZOA 3RCNA 3WNPA 3KL3A 3CUHA 3D3AA 3TTSA 4DWSD 3MKKA 5GPRA 3GH7A 3GXDA 4WJXA 2WHKA 1D7FA 2PB1A 4JFSA 4QCFA 2CKRA 3NJ3A 1ISXA 3L4TA 2IXVA 3GM8A 1PIGA 3VDCA 4W8LA 3THDA 4J7RA 1W91A 3NSXA 4HU0A 3TONA 5HXMA 3BSGA 5DO8A 2X0YA 3DC0A 1JZ3A 4F9JA 3RM8A 1B0IA 3FNDA 1GPFA 3RM9A 1W1VA 1GQIA 3WNNA 5CLWA 1UD4A 1LL4A 3ARUA 4OBSA 3RDKA 2BS9A 1BTCA 2BY1A 2A3BA 3VGEA 5C8BB 2CCRA 2CESA 2VX4A 1JAKA 4UZUA 5A69A 1V3KA 2XM2A 1UR4A 4M24A 2V5CA 4GQRA 2CNCA 1XGZA 2W61A 1J10A 3EDKA 2BVDA 5AC4A 3L4WA 1V0KA 2J8GA 3BAKA 2O9PA 4HA4A 1JFHA 2VUYA 1B2YA 2VX6A 4QP0A 3I3BA 3WUEA 2VZTA 5BXTA 2WHLA 4QLLA 1LL6A 4LXFA 1UHVA 5CLTA 2A3CA 1V0NA 3B9AA 1U30A 1KR1A 3BLPX 3BMVA 3WNOA 5D8WA 2EPMX 3TTOA 1JDCA 2XSBA 4X0VA 3T2PA 4H2CA 3T2OA 2XIIA 5JIPA 4P8XA 1UD5A 1E0VA 4E4PA 1X6LA 3MSDA 1GQJA 4C7FA 1ECEA 1OGSA 5I5RA 3NUKA 5BROA 3ECQA 3O9NA 3A4AA 3MV11 1ISZA 3WD1A 3VIOA 1TCMA 2EJ1A 5AY7A 3TTYA 5C70A 3MSGA 1V3MA 2VZOA 1PX8A 1GNXA 3KEHA 2XIBA 3VINA 4U2ZA 5AYIA 3N1AA 4PMQA 5BCAA 1QPKA 4GI8A 3BC9A 5DFAA 5JUVA 4PMZA 1W3JA 2GDUA 1E4LA 5IFTA 1LF1A 3ALGA 1H3GA 4HA3A 5EFFA 2W66A 2YL8A 3L2LA 3U5YA 5M17A 1XCXA 4DWSB 2GJXB 1BF2A 4CD4A 2WBKA 2EPLX 1OD8A 2PWEA 4LPCA 2QMKA 2JIWA 8CGTA 2VI0A 1GUVA 1KXHA 1AQMA 1DHKA 1BAGA 1WO2A 1FH7A 2J7FA 4GZJA 3MS8A 4PMUA 1E5JA 1MFVA 3CBWA 3T09A 3PZUA 1CXEA 1KGXA 2CITA 2XVKA 4UCFA 1VF8A 3WNLA 5D4YA 1E6RA 1UZ1A 4N0RA 3W0KA 1TA3B 1CPUA 4D6CA 1MXGA 1TG7A 2A3AA 4Q22A 1BPLB 1JZ8A 5ABFB 1C91A 1W9PA 4FMVA 4AZ7A 2YA2A 4ZFMA 1W1PA 4KRUA 3VVGA 4GPNA 2G8ZA 4Q7NA 5D9MA 2DT0A 3VGGA 3ARSA 3ZQ9A 4TUFA 2OWXA 1WDPA 1BSIA 3NIYA 4JFTA 1G0CA 2FGLA 1B90A 2WVUA 3AMKA 3TP4A 4GO9A 2CBVA 4CUCA 3ARXA 1RP8A 3A4WA 1UD6A 1Q6DA 4U33A 2WZIA 2WSPA 4P7QA 1S46A 1CECA 1OT2A 3OLDA 4TOQA 3LPPA 1KGUA 3WN6A 1J01A 1CGUA 4UZSA 2DGAA 2C7FA 1CXLA 4QAWA 1BVZA 1UH3A 5GNZA 3WH8A 2VCBA 1CZ1A 3WDJA 2Y5EA 2YA0A 3W27A 5D9OA 3NDYA 1UQYA 1CGXA 2C0HA 2XTKA 3UERA 1EOKA 5LA1A 4PMRA 1E5NA 4CU8A 1SMDA 4LX4A 1JZ4A 5HPOA 4TVUA 2FH8A 3W38A 2AMGA 1J0YA 4JKLA 6A3HA 3G6MA 1ZBCA 1JI1A 1K6AA 2J7DA 2XGIA 1GW1A 1NH6A 1YHTA 4PCTA 4AD3A 1W9XA 3MMUA 1QNQA 2BNJA 3AIUA 3E1F1 1H1NA 4U3AA 3SUSA 4GI6A 3UG4A 1TVPA 1DWJM 1BLIA 5HDRA 3K8MA 1QNPA 4DWSA 2VOTA 1HP4A 2BY3A 4QCEA 4AIOA 1XSJA 3PZVA 2RGMA 4M81A 5A95A 3PTMA 1JD7A 3VIIA 3SUWA 4MB4A 3SCSA 3CZGA 2DH3A 3MUY1 1EHAA 3VU2A 4TX6A 3AJ7A 1M53A 1VAHA 4X0NA 1NWSA 5D8ZA 4PMDA 1V6XA 1B1YA 3CHDA 4Z2IA 1CDGA 3WUBA 1B3VA 3OGRA 1HKKA 2WLZA 3D5HA 5ABFA 1V0LA 3S2CA 4AEFA 5ECUA 4PRWA 4WKHA 5CXPA 4KGLA 3W6LA 2CKSA 1UR9A 5CGMA 4BS0A 1VJSA 1C8QA 1W2PA 3AICA 1XH0A 1W9BM 2NW0A 7TAAA 1UA3A 1UD8A 3S6TA 2MANA 1LL7A 2OWWA 4HA1A 1H4PA 3MANA 3NCOA 1BYBA 1W3HA 4AZGA 3WEMA 3RPMA 1E71M 4ACZB 4XB3A 1HVQA 1UG6A 2WC4A 3WQ6A 1B3WA 4QFUA 2TAAA 2PBOA 1PIFA 3W26A 4W86A 3FXYA 1JYNA 4H04A 2OSWA 1TFVA 2DEPA 1SFSA 1NOUA 2J4GA 4W7WA 4V2XA 4TTGA 3T08A 5BRPA 9CGTA 1DP0A 3AS2A 4CD7A 3SCVA 1JGIA 3TTQA 4W8BA 1H5VA 3CZLA 2V3EA 4MNJA 4BQ5A 3RJYA 1OB0A 2UY2A 1DWGM 2DSWA 3K1DA 3ARVA 4JCMA 1E56A 1CGWA 4P7LA 3QOMA 1G94A 5CGTA 5LYRA 4L4PA 4QLKA 1I1XA 4W93A 1MFUA 3MUZ1 5FIPA 4UNIA 4EKJA 4HMDA 1OWQA 3UR8A 1CIUA 1HJUA 4GZEA 4CN4A 3EDDA 2VQUA 3WD3A 3PHAA 3WKZA 1D2KA 3LPGA 3WDHA 3PZQA 4GZIA 1E3XA 3WDPP 2BHZA 1QW8A 3AMLA 2EPOA 3UEQA 1HX0A 2WB5A 3SUUA 4J28A 2YL5A 2BY0A 3VM7A 1XSIA 1HN1A 4AZBA 2VURA 1VEOA 1W3LA 1XH1A 3ZOAA 1UUQA 3DYOA 3ARYA 3HU7A 1QI5A 4NF7A 1ZB5A 3TOPA 1VEMA 4KMQA 4BF7A 4HOXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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