3AIQA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aiqA00
3ZM8A 3WEMA 3D3AA 3VGHA 1G1YA 4A3HA 1B3VA 3VDAA 2DT3A 5A6LA 3MUZ1 1XRVA 1JDDA 2X0YA 1UH2A 2XVNA 1GOQA 2WVTA 3PZGA 2EJ1A 4PCTA 3EBVA 3RJYA 1EO7A 1Z32X 3CUHA 4F79A 4MB3A 2CETA 2VCCA 1XH1A 1R7AA 2WZEA 4X0NA 1JZ7A 3WDPP 3VIFA 1HL8A 2VX6A 4CU6A 4B9YA 1PEZA 1HIZA 1W9VA 3B9DA 4WSKA 1ODUA 1V6WA 4M80A 3GXMA 1E3XA 4JIEA 3L4XA 1GJUA 1QVBA 1QI5A 3BAYA 2QPUA 2XSAA 3AXHA 4U3CA 5KZ6A 2DQXA 3AIVA 1PBGA 1V08A 1Q6GA 5M3WA 3IAQA 1BVZA 2Z1SA 3BAKA 3WSUA 2OWCA 1A47A 3W38A 3ARUA 1XD0A 2X05A 2XFYA 1W9DM 5I78A 1VFMA 2WAGA 4LYQA 1GQLA 1V3HA 4E4PA 3F4VA 3W53A 2WZIA 1GVYA 1HX0A 4OJYA 4B3KA 1V02E 2E9LA 1TVPA 3WL0A 1B0IA 2XFRA 1V6UA 3SCVA 1D7FA 3GM8A 3AHXA 4H2CA 1UR9A 4OBRA 3SCOA 4WIWA 1A3HA 2E4TA 1BSIA 1E4NA 1G0CA 4ATLA 3KEHA 2PWDA 1OIFA 2OLHA 4W88A 2CKSA 1W91A 3T2PA 3QOMA 3AHYA 3F5LA 2VR4A 4WKAA 2OWXA 2WVVA 2QMKA 2VJXA 2Y5EA 4W89A 3I3DA 1VEMA 1M04A 1W3LA 4W8LA 5CSUA 3MANA 1JNEA 1WNOA 4D1IA 3WDJA 4AIEA 4KMQA 4AC1X 4PMNA 1Q6EA 2YA2A 4TTGA 3BLKA 1LL4A 2WMJA 4P8VA 4TVDA 3RDKA 1JI2A 3GYCA 3WENA 3PZVA 4M81A 2OYMA 4XV0A 3AHTA 1AQHA 3FHAA 3TTYA 4QCFA 4HPGA 3SUTA 6CGTA 1CENA 1RD6A 5CGTA 1C3FA 1VFOA 2J7BA 4W85A 1QBAA 4C7GA 1W9UA 1W2PA 1JXKA 2J79A 1W3KA 4GQRA 1HKKA 5ABEA 3IAPA 1E0WA 4GPNA 3RPMA 1E6PA 5E9AA 2DSZA 4AW7A 2VX5A 1GOWA 3THDA 4MAZA 5A8PA 2J8FA 4AZHA 5FKYA 2WMKA 4W84A 1UG6A 4MDPA 4OOUA 1ISVA 2W5FA 4MTVA 1UWIA 3WF0A 1H11A 1BYCA 5A6AA 2VL4A 2EBNA 3SUWA 1RPKA 2YKKA 1G01A 3G6LA 4HTYA 2ZE0A 2J7HA 2XFFA 2ZUTA 1VRXA 3BAIA 2E8YA 2FHCA 1EO5A 2GJXB 1B30A 1BPLB 1Q6DA 4J3TA 4EAMA 3AS0A 4CN4A 3QR3A 3NSNA 1MW2A 1WDSA 2V38A 3N17A 4UQBA 3BMVA 3ARXA 3BSGA 2ZUVA 3M7SA 2WVSA 4J3UA 1B1YA 4UFKA 1TUXA 1UZ4A 2O9TA 3I3EA 5CG0A 1ISYA 3CGTA 4GI9A 1EDTA 4CGTA 1US3A 4D6FA 2VX4A 4CD4A 1HJQA 5M17A 4BQ4A 4IISA 1B3ZA 1KXVA 2XHYA 5BXRA 4J3XA 1QI0A 2YBTA 3T09A 2A3CA 4PSPA 1CXKA 1W3JA 1EXPA 4AIOA 4F8XA 2WCSA 1HJXA 2WMIA 3OBAA 5I77A 4GI8A 1Q6FA 3CUIA 1CLXA 4HZ7A 3PHAA 3ARTA 2G3JA 1AMYA 2ZXQA 2D20A 3T0AA 2PWEA 1DWAM 3THCA 3GH7A 3ZMRA 1WZKA 3MUAA 2JALA 5A6MA 3DHPA 1GQIA 3A47A 5EFDA 4UFMA 1GW1A 2DSVA 4FK9A 5A94A 4MNLA 4U5IA 2E9BA 1YQ2A 4YHGA 5FIPA 4TVCA 4CU8A 2WBGA 1UH3A 2WMFA 2ZX5A 1JDCA 2WHJA 1JDAA 5AYBA 4GKLA 5CPQA 3ZOAA 1J0YA 4P8UA 1CGUA 1GCYA 2GJPA 3PZQA 2PC8A 1LL7A 1CIUA 3AZRA 1J11A 2WXDM 3GNRA 2GDUA 3AYSA 2WLZA 3IK2A 2C7FA 1JZ5A 5AYIA 2RGLA 1DWGM 2WMHA 2WC4A 5CXPA 1ECEA 1PIGA 3WF4A 4A3YA 4D6HA 2WC3A 4EE9A 3BC9A 1UHVA 4H7VA 5IFPA 4LXFA 4EK7A 1ITXA 2F8QA 4PTXA 3ZSTA 4AZBA 4XZWA 3VD3A 2ZXDA 4CVWA 4P8WA 1ISZA 3BXWA 3K4AA 1FHLA 4JHOA 2CKRA 5AC4A 1CDGA 1VEPA 1TA3A 1UWRA 4WK9A 1UA7A 1DWJM 2GUYA 2NSXA 3ALGA 1E71M 4PMZA 1D3CA 3ARRA 3WD0A 2J7DA 5CJ5A 3WD4A 1XCXA 3MKKA 3PZTA 3VMOA 3L4UA 4MAVA 4PTWA 5DFAA 4F66A 4AD0A 2XVGA 2D2OA 2ZOXA 4HZ6A 4W86A 1BYAA 2VZTA 2WK2A 1UWQA 1CXLA 3W25A 1H5VA 1J18A 2NT0A 4CD6A 5ABHA 2V5DA 4JHZA 2DPEA 3GZAA 3WD1A 1WO2A 3WFZA 2RGMA 1UKQA 4W87A 4BCEA 4V27A 2JEQA 3U7BA 1Q6CA 2WLYA 1CGVA 4PEEA 2G4FA 1V3JA 3SUSA 2BNJA 1KQZA 3WMBA 3FXYA 4MPKA 9CGTA 4P8XA 3VILA 5E0FA 4CD7A 2EQDA 1QI2A 2F61A 4ACZA 3AZTA 1K9EA 4CUCA 4JKKA 4AD4A 1CGTA 1UWTA 2OYLA 3WH6A 1DTUA 1JZ3A 1VAHA 1SMAA 3PZMA 1TCMA 2VR5A 1C93A 5JIWA 1E6NA 3VOCA 1DWFM 5DO8A 2DT0A 2PBOA 3QHOA 3AS2A 4AZ6A 2J7FA 1IZJA 5GNZA 1E5JA 3WL1A 4QLLA 2W4XA 4QCEA 1C90A 3VIHA 2XGBA 1BLIA 1HVQA 3TP4A 1JGIA 2C0HA 2V3DA 2VCBA 1LQ0A 2GJRA 3AMKA 2CHNA 2WYSA 4HZ8A 2A3AA 3ARSA 1YHTA 3VGEA 2E40A 1XC6A 3SEPA 2B31A 2ESCA 3VIIA 3VPLA 3KZSA 3EDJA 3W27A 1E4LA 1JFHA 1GOMA 3VIKA 4CCCA 3NDYA 4D6JA 3VIJA 3VD4A 1SFSA 3EDKA 4BS0A 5D9NA 1MFVA 4CKQA 3NIYA 1HKMA 4TXEA 5A6BA 2WKLA 4OZOA 3IANA 4GXPA 3T2OA 1UD6A 3WH5A 1UR0A 4HMEA 4D71A 1ZBCA 5ABFB 2QHAA 6A3HA 1QNSA 2EPKX 5IHSA 1E6QM 2J78A 1V3IA 4HOWA 2VZOA 2WB5A 3U7VA 1UD2A 4UOZA 5A6SA 3VIPA 3AYRA 4AWEA 1W9BM 1JAKA 2QV4A 3B9AA 8A3HA 4WSJA 2HISA 3VGBA 2YBUA 5FL1A 5HBFA 3CO4A 3MV01 1J9YA 3ZT7A 2DEPA 5FCZA 2D3LA 1OBAA 1J0KA 5AC5A 1VFFA 2C8NA 3AICA 1E9LA 3LPPA 4AYSA 3NSMA 1DWHM 4LPCA 4W8AA 1KGWA 4BZYA 2YA1A 3RCNA 3AIWA 1D2KA 1C7TA 3PZUA 4FLSA 2DSWA 2FGLA 3AISA 4R5EA 3SURA 3WKZA 1E15A 4UR9A 4AISA 2CYGA 5HDRA 2OYKA 3TTOA 4PUDA 3WF2A 2VC9A 1J0JA 4HOXA 1VF8A 2VNCA 4UCFA 3PBGA 2FH8A 5E0CA 3WQ8A 4UZSA 2WSPA 4CN1A 4P7LA 3SCTA 5LA1A 3A4AA 2ZUUA 4M8UA 1J12A 3OGRA 4HMCA 5DEZA 1WB0A 2XM2A 4AZ7A 4Z2KA 4KH2A 4IM4A 1PIFA 4Y7EA 1NWUA 4Q7NA 1JG9A 3L4YA 2OSYA 1SYTA 1MQRA 2E0PA 5HNNA 4X0VA 2HVMA 1EHNA 2VI0A 1CGWA 3OA5A 3VD9A 4CU7A 5BRQA 2WNWA 1H3GA 5A2CA 1OGGA 3J7HA 3IJ9A 4QFUA 4AZCA 3PTMA 4AXNA 1GQJA 1W1YA 4PTVA 3WY1A 3AQUA 1ZBWA 3MU7A 3ZJKA 5LYRA 2W63A 5E70A 3DYPA 2V3FA 1EOMA 1MFUA 2PB1A 7A3HA 1B90A 4UQCA 3POHA 3WNKA 3BAXA 3ZQ9A 4YPJA 1E73M 1E1EA 2GK1B 3EDDA 3E1F1 1J0ZA 2J7GA 4D6IA 1GHSA 1TE1A 2XM1A 4MADA 4D6GA 4UNIA 3U5UA 2XYLA 1KGUA 2ZICA 3MSDA 1HJWA 1GNXA 3RO8A 3U57A 1U30A 4U3AA 3ZT6A 1EQPA 1FH8A 4BQ5A 1E55A 3DHUA 3AOFA 3L4ZA 4J3SA 4J7RA 3RMEA 4WKHA 3KL5A 2ZUMA 1CLVA 2BY1A 3PZ9A 3VIGA 1GUVA 4X9YA 5D8WA 3L4TA 3CZKA 1HN1A 4LX4A 3A4XA 3CHCA 1NP0A 3RILA 2WANA 1C91A 4JFTA 1ZBKA 5D8ZA 3WDHA 5I2UA 5F7UA 3W4RA 1I1XA 3MV11 1MWOA 4OUEA 3CPUA 3WUGA 5KEZA 5M5DA 4U5KA 1XSJA 1XYZA 3VIOA 1NP2A 1QW8A 1J10A 3WH8A 1KB3A 4AEFA 1UYQA 1E70M 3KWXA 4V28A 1NH6A 7CGTA 4QLKA 1KCKA 4QAWA 2XIBA 2D22A 3TA9A 1UR2A 4HU8A 1ODZA 5A2AA 2EXOA 3GNPA 3M6DA 2YL6A 1HKJA 3W82A 1GORA 4UFHA 4PMDA 4E8CA 3HJEA 4M82A 4R27A 1H2JA 1X6NA 3CIVA 1JF5A 3VNZA 4Z2JA 1B2YA 1BGGA 2VOTA 1KQYA 3VINA 5EFFA 3APGA 2CIPA 4OOZA 5DT7A 3N15A 1KR0A 3WUEA 3ECQA 3UESA 3AFBA 3LPFA 1OINA 1Q4NX 5JBDA 2DIEA 3CH9A 1AVAA 1E4IA 4FLQA 1C7SA 1E56A 1CEOA 2BS9A 2ZUWA 1BVNP 2PBGA 5CLWA 4AZ5A 3SCWA 4W7UA 1R86A 2YL8A 4AD1A 1CXHA 3AIQA 4Z2GA 4W5ZA 3RIKA 3LMYA 2G3MA 4PTMA 4PBGA 4TOQA 1EGZA 1F4AA 1E4MM 3MUY1 1LG1A 4ZFMA 3AROA 2JIWA 3GXFA 3RM8A 2QPSA 3CTTA 1UKPA 3SCRA 1C92A 1VENA 1R8LA 1GVIA 2CEQA 1JL8A 3VDHA 3WFLA 3ZJ7A 3NUKA 3ARQA 3EMQA 3FY1A 4LYRA 1Y7VA 4KGJA 1VEOA 1VJZA 4AD3A 3WNPA 1IZKA 2O9RA 4H8UA 3BGAA 3WEZA 3W29A 2CESA 1E40A 3VD5A 3QOKA 3FW6A 3W37A 2D0FA 2WCAA 1RP9A 1UQYA 3WD3A 3SCNA 1E0VA 5A69A 4XUYA 2WVVB 2XVPA 3TOPA 1U33A 3AMCA 4NRSA 2UY2A 1MYRA 5A2BA 3F5KA 2OSXA 1GOIA 3FN9A 4HU0A 1FP8A 1H4PA 4W5UA 3K8MA 1CTNA 2BY2A 1UKTA 2AMGA 1JYVA 2G3IA 2BV9A 2E3ZA 2YL5A 5CSYA 1JZ4A 2J4GA 3SCQA 2WM0A 1V0LA 1E3ZA 2YJQA 2XVLA 5GQBA 5DMYA 4B16A 4BA0A 4EANA 4HA4A 2UY5A 1E6RA 3WDRA 1B9ZA 2AAAA 1QPKA 5I5RA 4WF7A 5BWFA 3TTSA 2QLYA 4JKMA 5CQ1A 2D24A 2FDMA 1GHRA 2XVKA 4FMVA 4W7VA 1FP9A 4NZCA 3DECA 5A1AA 4W8BA 4JKLA 4MDOA 5D9MA 4BF7A 3HU7A 1US2A 1XSKA 3AJ7A 1FH7A 3B8SA 1E6XM 2XJ7A 4PCSA 4PMOA 3CMGA 4TVUA 1GOKA 1HL9A 1C8QA 3VX0A 1HKIA 4L4PA 3A3HA 5C8BB 3UCQA 1QI3A 2EEXA 3KL3A 3M07A 4IPNB 1KXTA 1CWYA 3O2LA 3GBDA 4HP5A 5CZKA 1ZU8A 1QHZA 1WCGA 1PZ2A 2Z1KA 1U2YA 2BHYA 1OD8A 2VO5A 4D6CA 4P7NA 2W67A 4C7FA 1R7OA 1FFQA 3QGVA 5GNYA 4CCDA 4UQEA 2IUZA 4XZBA 4P7RA 1IV8A 1J01A 4DUXA 2WVUA 3B9EA 4RE3A 3HN3A 3VM5A 3BCDA 5IFTA 4UOJA 2Y24A 5D9OA 2X0HA 4MNJA 1JNDA 5JBEA 3DYMA 4HOZA 3OG2A 3W6LA 2OSWA 2BVDA 1UR4A 8CGTA 1NOFA 3WH7A 1ZJBA 4F9DA 1CPUA 2CBVA 1JI1A 4F9JA 2X1IA 4K68A 3WQWA 3GH4A 2O9OA 3VU2A 4MJ2A 2XUCA 3ALFA 1K9DA 2GFTA 4M56A 1OT1A 1QW9A 3CLWA 1VBUA 4ZEPA 1NOWA 1CNVA 1P6WA 1WDQA 4DM1A 3PTQA 4A4AA 4CD5A 5DT5A 4AIUA 4DWSD 1E1FA 2JEPA 4GI6A 2G3NA 4D1JA 2CCRA 3OZOA 4DWSA 1MXDA 3BCFA 1TG7A 2WMIB 3OLEA 3VX1A 4EKJA 4PN2A 4JCLA 2Y2WA 1WE5A 4GQQA 3KL0A 4IUGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ZM8 A;  3WEM A;  3D3A A;  3VGH A;  1G1Y A;  4A3H A;  1B3V A;  3VDA A;  2DT3 A;  5A6L A;  3MUZ 1;  1XRV A;  1JDD A;  2X0Y A;  1UH2 A;  2XVN A;  1GOQ A;  2WVT A;  3PZG A;  2EJ1 A;  4PCT A;  3EBV A;  3RJY A;  1EO7 A;  1Z32 X;  3CUH A;  4F79 A;  4MB3 A;  2CET A;  2VCC A;  1XH1 A;  1R7A A;  2WZE A;  4X0N A;  1JZ7 A;  3WDP P;  3VIF A;  1HL8 A;  2VX6 A;  4CU6 A;  4B9Y A;  1PEZ A;  1HIZ A;  1W9V A;  3B9D A;  4WSK A;  1ODU A;  1V6W A;  4M80 A;  3GXM A;  1E3X A;  4JIE A;  3L4X A;  1GJU A;  1QVB A;  1QI5 A;  3BAY A;  2QPU A;  2XSA A;  3AXH A;  4U3C A;  5KZ6 A;  2DQX A;  3AIV A;  1PBG A;  1V08 A;  1Q6G A;  5M3W A;  3IAQ A;  1BVZ A;  2Z1S A;  3BAK A;  3WSU A;  2OWC A;  1A47 A;  3W38 A;  3ARU A;  1XD0 A;  2X05 A;  2XFY A;  1W9D M;  5I78 A;  1VFM A;  2WAG A;  4LYQ A;  1GQL A;  1V3H A;  4E4P A;  3F4V A;  3W53 A;  2WZI A;  1GVY A;  1HX0 A;  4OJY A;  4B3K A;  1V02 E;  2E9L A;  1TVP A;  3WL0 A;  1B0I A;  2XFR A;  1V6U A;  3SCV A;  1D7F A;  3GM8 A;  3AHX A;  4H2C A;  1UR9 A;  4OBR A;  3SCO A;  4WIW A;  1A3H A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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