3AIRA

Crystal structure of beta-glucosidase in wheat complexed with 2-deoxy-2-fluoroglucoside and dinitrophenol
Total Genus 185
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
185
sequence length
491
structure length
491
Chain Sequence
GPVFTKLKPWQIPKRDWFDKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDMTNGDVAANSYHLYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPDGTGKVNQAGIDYYNKLINSLIDNDIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLNRQIVDDYKQFAEVCFKNFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGMDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVQLFKARYNMHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDMSPDFTPTLNTDDAYASSETTGSDGNDIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPVFITENGIADVEGDESMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWSLGYSSRFGLVYIDKNDGNKRKLKKSAKWFSKFNSVPKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Triticum aestivum
total genus 185
structure length 491
sequence length 491
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3airA00
1HKKA 3WH7A 3AQUA 4P7RA 1QNQA 5JIWA 3EBVA 2UY4A 3GNPA 1QPKA 1V3JA 2XG9A 2BY1A 1D7FA 4PRWA 1DWGM 2VZTA 1TCMA 1NM9A 1W1VA 1E6SM 1E4MM 4MJ2A 3SURA 1JD9A 3HU7A 3DHPA 1ISYA 2EXOA 2WW5A 3MSGA 1WZKA 4R27A 4FLOA 5HBFA 5CZKA 4WIWA 1NOFA 3BAKA 3II1A 1GW1A 2CHNA 3AJ7A 1QNRA 1UKOA 4WKAA 2IUZA 4Z2GA 3IAPA 4JFUA 1FH9A 4JAWA 4Q22A 2D0FA 1GQIA 2J47A 1J0YA 2CEQA 1CLVA 2VOTA 1Q6EA 1OGGA 2XWDA 1OGSA 4UNIA 1UD4A 1V6XA 3VNYA 3AMGA 3LPGA 5A94A 3T0DA 2AOSA 1GJWA 1PZ3A 3O2LA 1UR4A 2WCAA 2BXYA 3SUWA 2CCRA 1EHAA 3N1AA 3BAYA 4PSPA 1E0WA 1KFWA 1VBRA 1E6RA 2WC3A 5E6ZA 1VRXA 2J78A 3KEHA 3QOMA 2ZX7A 4LXFA 2WVSA 1XYFA 2J7EA 5BCAA 3WL1A 4CU8A 1V03A 3FHQA 1MXGA 1A47A 4RL3A 1GHSA 1US3A 4W5ZA 4D6JA 4FMVA 3W0KA 4KMQA 4D6EA 1VB9A 2J8FA 1E70M 3WQ4A 5EFDA 1EQPA 3NIYA 2NT0A 2XIBA 5M5DA 4QP0A 2VX5A 1CXEA 2YA1A 4GZJA 4MJ4A 4DUVA 1TVNA 1W1PA 1BLIA 1FFRA 4AZ5A 2UY3A 2GFTA 3GDBA 4X9YA 5I77A 1GOMA 3W4RA 1UWSA 5LA2A 3NUKA 2EBNA 2FH8A 5JIPA 2FHFA 1L0PA 2A3EA 1W9UA 3WQ6A 5CG0A 4J27A 1GVYA 2EEXA 3MANA 5IFPA 1ZU8A 4UZSA 1JYVA 3POCA 2PI6A 3L2LA 4TVUA 1O7AA 3VGGA 1ODZA 2CBJA 5A6LA 4OKDA 2CBVA 5BYWA 3BH4A 4NF7A 2DPEA 3CZGA 1UA7A 2WSKA 3RDKA 3KWXA 3VMPA 2G3MA 4AIEA 4Q7NA 3WEOA 1CXFA 3AXHA 5TD4A 3PTKA 1XSKA 3ARZA 1FHLA 4PMYA 3VMNA 1E5JA 3AISA 5BRQA 1KWKA 3BAIA 1E3XA 4D6HA 4W8AA 3WH6A 5FCZA 2WMHA 1E72M 3EDFA 3A6OA 3OB8A 4AD2A 1I75A 2XFFA 4HMDA 3FNDA 4GO8A 1F4HA 3WQVA 4AIUA 4A3HA 4QDMA 1JF6A 4AMCA 4CU7A 2VX4A 5A69A 1UD2A 2G3IA 4EE9A 1E4NA 1JDCA 3WH9A 1BYDA 5ABGA 3L4WA 2IXUA 3B9DA 1DWAM 4URIA 1ISVA 2ZUMA 4AD3A 1HT6A 4CUCA 5GNXA 1GONA 4MDPA 1J0IA 1E6PA 3GNOA 1HIZA 3OG2A 3W24A 1A3HA 1GQLA 5BXRA 1WDSA 3RM9A 5HNNA 1XSIA 3N13A 4B9YA 3F5JA 2AMGA 5CLWA 4NRRA 2D23A 4CD8A 4JFWA 4W85A 1WE5A 1V6YA 1CGXA 1JXKA 3WY1A 4KGLA 2ZIDA 1N82A 4UOQA 1BVZA 5E70A 4D71A 3RCNA 4JIEA 3ARPA 3WQWA 4PYSA 1EOMA 2PBOA 3VGFA 3ZSTA 2NW0A 2ZE0A 2ZX6A 1KCLA 1ZBWA 3FAXA 1ISXA 1V0LA 3ZR6A 2PF0A 3ALFA 3WMSA 1FA2A 4U2ZA 1B9ZA 2VTFA 3UERA 3VGBA 4W7VA 4AZCA 2DIEA 4OUEA 1V3LA 2VUYA 1UOKA 3D5HA 5E0CA 2PWFA 4M82A 4B9ZA 1V02A 3J7HA 4J3UA 2TAAA 4CD4A 4IPNB 4OBRA 1B2YA 3WD3A 2FH6A 2PB1A 4HU8A 1Q6FA 1BG9A 2ZWZA 3N18A 1UKTA 1OIMA 1W1YA 4EKJA 3B9AA 5BROA 3VDAA 1WDPA 1I1XA 3O9NA 4MAZA 2VZOA 4AEFA 4D6FA 2G3JA 4UZUA 2VX6A 2W61A 4M81A 1MW2A 2W66A 2EPOA 1NWSA 4ZXOA 4D6GA 5FOOA 3S6TA 5CJ5A 4CN6A 5CPTA 1E40A 3CZLA 3WELA 5D9OA 3RMEA 3GXMA 4W7WA 1TUXA 3AMDA 2VRJA 2Z1KA 2W4XA 3VX0A 3AIQA 3UG4A 1M53A 3ARQA 2XWEA 4L4OA 2X05A 1WP6A 3UEQA 3GNRA 1HVXA 4S3JA 3VD5A 1CENA 2XIIA 4GZIA 3MKKA 2WKLA 4DUXA 2YDSA 3CIVA 3AIEA 3FXYA 1WO2A 4BZYA 5A8QA 3M7SA 5GNYA 3AYSA 2CKSA 1FFQA 4U33A 4W8BA 5IHRA 1DEDA 2VCCA 1GOOA 1QHPA 5LA1A 3JUGA 2XPKA 4PMRA 3O6AA 2VVNA 4JHOA 3LPFA 4JKLA 2YL9A 2Q8XA 3AZRA 4F9JA 1F4AA 2XVNA 3T2PA 1AMYA 5AYBA 4Z2HA 4PTVA 3FY1A 1CDGA 3N04A 1J0HA 3ARXA 3MUZ1 4W88A 4YPJA 1E71M 2WK2A 2DH3A 3QR3A 1TA3B 2DT1A 3VDHA 3FW6A 3LMYA 3ALGA 5ABFB 4YHEA 3K4DA 4AY1A 1GHRA 1E43A 2QMKA 3WUEA 1KB3A 1JAEA 4TTGA 5D4YA 3N11A 2O92A 3VILA 3K1DA 1EDGA 2E9LA 4FK9A 3BAXA 4E8CA 5IXEA 2DGAA 2WVVA 1E9LA 2VR5A 3FAWA 3WN6A 1QVBA 3EDDA 1GOIA 2WPGA 4RE4A 4BQ5A 4M29A 1PBGA 5I78A 3T2OA 1W2PA 1KR1A 1JYXA 4Z2LA 1JZ7A 1JDDA 2BXZA 2MANA 2A3CA 5I0DA 3GYCA 3AMCA 4WJXA 3W26A 1R87A 1JZ5A 2QV4A 1DWJM 1C7SA 2WZHA 3PHAA 1AQ0A 3K4AA 1SMDA 1HKIA 1XV8A 1XH0A 2ESCA 3KL5A 1C8YA 1B31A 2WWDA 3L4VA 3AIBA 2D20A 3WD2A 1QBAA 4J3SA 4H41A 4ATLA 1ZL1A 4HP5A 1JZ3A 4LX4A 3WUBA 3AFBA 3W82A 4DWSA 4TX8A 3WBEA 3VD9A 3ARYA 5BXPA 4ATWA 3WD4A 3PZQA 4HPHA 3BC9A 1NOWA 1MQRA 1H0GA 1VJSA 1Q4NX 1TR1A 3VIGA 1V0MA 3AHYA 3NJ3A 1EHNA 1QBBA 2E9MA 4MTVA 2X1IA 4ACZB 3GXDA 1BGGA 1M01A 2PWHA 1PIGA 4PMZA 3VKKA 1WDRA 1GOWA 5GNZA 3PZVA 3GTNA 1KBBA 3CUFA 3UESA 3T0AA 4JKKA 2BVYA 1HKMA 2QHAA 1JF5A 1JI1A 2OSYA 3WNKA 1J18A 2VQTA 2Y4SA 4FLQA 2BV9A 1GOKA 2WHLA 3G6LA 4KGJA 4HMEA 5I24A 3L4XA 2D0HA 4JL1A 2WSPA 1XH2A 2EPMX 1W9VA 3TTYA 2VMFA 5CSUA 1V02E 3MV01 1EQCA 2YBUA 5I2UA 4B3KA 3BLKA 1QI2A 4PN2A 3AHXA 1G94A 1FH8A 5A8OA 4X0VA 3HJEA 8CGTA 2J7CA 1E6ZA 3ZJ7A 2X2YA 1CXIA 2DQXA 1OD0A 1CXLA 4P8WA 4PTXA 1XCXA 2BVTA 1I1WA 2DT3A 2X0YA 3QHMA 2YKKA 3CZJA 4H7VA 4PBGA 1E6NA 3WNOA 2W91A 3KZSA 2WHMA 2VURA 1Z32X 1J0JA 1V0KA 2CKRA 1G1YA 5HOSA 2X09A 4LGXA 3ZQ9A 5C8BB 1OIFA 1SFSA 1IT0A 3F4VA 2ZUTA 3BMWA 1NWRA 4LYQA 4AWEA 1MFUA 2GDVA 1YQ2A 1JNDA 1OD8A 3WNPA 5CPSA 2O9OA 2Z1SA 5FD0A 5E0FA 2QLYA 1NH6A 4MNKA 3B9EA 2OYKA 3RJXA 3SUSA 1D2KA 5BXSA 5IFTA 3A3HA 3CUGA 3RILA 3L4TA 1CXHA 1JL8A 3BLPX 1ZJBA 1U30A 3A4AA 1HJWA 5A1AA 1B3WA 1WKYA 1OM0A 5M3WA 3WMCA 2BFGA 3AMKA 4UFLA 1W9XA 4BS0A 4IPLA 2F61A 4PCSA 1EDQA 3F5KA 1OT2A 4WKFA 4AZ6A 3RJYA 1EO5A 2NT1A 4AZIA 3DYOA 2ZXAA 2UY2A 3BMVA 2YOCA 3VVGA 5IDIA 3MUIA 4H8VA 2G41A 2ZUSA 1KQZA 1B30A 3ZM8A 3AROA 1X6NA 3FN9A 4MNMA 1QI4A 3TONA 2J62A 5DO8A 3U57A 2BNJA 1XCWA 4AD4A 3W29A 3B8SA 3PBGA 2YDRA 5HDRA 1LG2A 1NOUA 1VIWA 4CCCA 4MPKA 3NDYA 1SYTA 2Y8KA 1GUVA 1HVQA 1BHGA 2V3EA 1NP2A 1NWUA 1LL6A 3SCOA 1HJVA 1J01A 4GKLA 2ZWYA 2G3NA 3DC0A 2GSJA 1JNEA 1M03A 5A6AA 2VZUA 3VM7A 4BQ4A 1W1TA 2CERA 1X1NA 3ARUA 3ZT6A 4DM2A 1FH7A 5LYRA 1CGTA 4A4AA 5A2BA 1HN1A 1EGZA 3TA9A 1VEMA 3NCOA 1WCGA 2J7GA 2CYGA 2Y24A 2GJXB 3K8KA 3PZGA 1PX4A 3AS3A 5HPCA 4BCEA 5JBFA 3GXIA 2V5CA 3GXFA 1CECA 1GCYA 3WDQA 3SIMA 4JHZA 1IZKA 5I5RA 1MFVA 3EDJA 3M46A 4H8HA 3W6LA 1CPUA 4EK7A 7A3HA 4UCFA 1UH2A 2DSWA 4HOZA 3N15A 4WSKA 1KGWA 1NARA 3GH5A 4JCMA 2WANA 4PTWA 1H49A 1BPLB 1UUQA 3VIMA 3AS1A 1XSJA 1JGIA 1C3FA 1E4LA 3SUTA 1WDQA 1TFVA 3AHZA 3UR7A 2WZIA 4PMVA 4TX6A 1GOQA 2F8QA 2W92A 3T09A 4MADA 4UFHA 2XVLA 4JZ5A 4CD6A 4CD5A 2WYSA 1C90A 4W5UA 1XH1A 1G01A 4Z2KA 2ZUUA 1XYZA 2VCAA 3PZ9A 1HX0A 2CPUA 2G4FA 1FP9A 2WXDM 4JKMA 1UKPA 2VVSA 5AYIA 1JG9A 2J7DA 3BSHA 3CMGA 5DF0A 3AS0A 3NSNA 1PPIA 2YLAA 2VT0A 1JFHA 3WQ5A 2D0GA 3LPPA 1V08A 4QLKA 3WF0A 3W37A 1V6VA 2D2OA 3VM5A 4AD0A 3BSGA 2ZXQA 2X0HA 4L4PA 1KGXA 4XB3A 4NSBA 3WNNA 3AHTA 4GQQA 1EDTA 4WK9A 1E5NA 4ZEPA 5GPRA 1C7TA 2DT0A 4W87A 5F7UA 1K9DA 1QNPA 3DECA 3VIOA 3ZT7A 1W3KA 3A47A 5ABEA 1FOBA 3T2QA 4W8LA 3AYRA 4UFMA 1VEPA 1OGBA 4PMQA 3MU7A 1UD6A 3RIKA 3ZSSA 1H1NA 4AD1A 5A2CA 3A4WA 1KQYA 2D22A 5EMYA 2GJPA 1Q6DA 1H2JA 2WLYA 1W3LA 2WLZA 1SR0A 1UWUA 3RM8A 5E9AA 1P6WA 1ECEA 1VFOA 3I3DA 3S2CA 7TAAA 1E6XM 1YHTA 5CGTA 2ZX9A 1MXDA 3SCSA 3WH5A 3TOPA 1VFMA 4D6CA 4MAVA 3ZO9A 3W38A 1B3ZA 4UQCA 2CNCA 3I3EA 2PWDA 3IJ9A 4D1JA 1E56A 3WNLA 2YL8A 4J3XA 3T08A 2JFEX 4TUFA 4M24A 3WUFA 4GIAA 2GVYA 3VDBA 4XX6A 4ZENA 1M04A 1BGAA 1B0IA 4P7QA 2XFYA 4HOWA 4BQ3A 4HZ7A 1MWOA 2J79A 6TAAA 2JEQA 3AS2A 3SCVA 1RP9A 2WMIA 2W5FA 4CVUA 2WB5A 5BRPA 1UR2A 3EMZA 1J11A 4X0NA 1VENA 4MNJA 4XZBA 1TVPA 1JZ8A 3SCWA 1GPFA 1CIUA 2YJQA 1H3GA 1V0NA 4MB5A 4CKQA 1JI2A 3BCDA 2QPSA 1TE1A 2VZVA 3VIFA 1UKQA 3GBEA 1RPKA 1ZS2A 2V38A 4JFTA 2E8YA 1BQCA 4DM1A 1LF1A 4P7LA 3SCUA 2ZUWA 3CHDA 4U3CA 3W28A 4TTUA 1UKSA 3DYMA 4PUDA 1K9TA 3UG3A 2GK1A 2EQDA 3WDRA 2YL5A 3TTSA 2EPNA 3M07A 4TVCA 3KE0A 4PCTA 1KCKA 3AIVA 1QHZA 5HPOA 3WNMA 1M7XA 1WAWA 3VINA 2HVMA 1ISWA 1BSIA 2VZSA 4UFIA 2FGLA 4DWSC 4E8DA 3VD7A 1Y7VA 2FDMA 2B31A 3GM8A 1U2YA 4NI3A 1ZBCA 4P7NA 2DH2A 1ODUA 1V3IA 3UCQA 1V6WA 3CHEA 3CGTA 7CGTA 1VFFA 4F66A 2O9PA 1K6AA 3EDKA 1WB0A 2EPKX 4ZFMA 2CBUA 1HJQA 1AVAA 2CBIA 2WMGA 4J3VA 2DT2A 2VRKA 3GH4A 3MS8A 4FLRA 3QGVA 4D6DA 4PSRA 2XVPA 5FKYA 1ISZA 1AQMA 1R85A 1OINA 1GJUA 1UZ1A 2BHZA 2VQUA 1UD3A 2VJXA 4U5IA 4MB1A 1R7AA 5CPQA 5A8PA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HKK A;  3WH7 A;  3AQU A;  4P7R A;  1QNQ A;  5JIW A;  3EBV A;  2UY4 A;  3GNP A;  1QPK A;  1V3J A;  2XG9 A;  2BY1 A;  1D7F A;  4PRW A;  1DWG M;  2VZT A;  1TCM A;  1NM9 A;  1W1V A;  1E6S M;  1E4M M;  4MJ2 A;  3SUR A;  1JD9 A;  3HU7 A;  3DHP A;  1ISY A;  2EXO A;  2WW5 A;  3MSG A;  1WZK A;  4R27 A;  4FLO A;  5HBF A;  5CZK A;  4WIW A;  1NOF A;  3BAK A;  3II1 A;  1GW1 A;  2CHN A;  3AJ7 A;  1QNR A;  1UKO A;  4WKA A;  2IUZ A;  4Z2G A;  3IAP A;  4JFU A;  1FH9 A;  4JAW A;  4Q22 A;  2D0F A;  1GQI A;  2J47 A;  1J0Y A;  2CEQ A;  1CLV A;  2VOT A;  1Q6E A;  1OGG A;  2XWD A;  1OGS A;  4UNI A;  1UD4 A;  1V6X A;  3VNY A;  3AMG A;  3LPG A;  5A94 A;  3T0D A;  2AOS A;  1GJW A;  1PZ3 A;  3O2L A;  1UR4 A;  2WCA A;  2BXY A;  3SUW A;  2CCR A;  1EHA A;  3N1A A;  3BAY A;  4PSP A;  1E0W A;  1KFW A;  1VBR A;  1E6R A;  2WC3 A;  5E6Z A;  1VRX A;  2J78 A;  3KEH A;  3QOM A;  2ZX7 A;  4LXF A;  2WVS A;  1XYF A;  2J7E A;  5BCA A;  3WL1 A;  4CU8 A;  1V03 A;  3FHQ A;  1MXG A;  1A47 A;  4RL3 A;  1GHS A;  1US3 A;  4W5Z A;  4D6J A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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