3AIVA

Crystal structure of beta-glucosidase in rye complexed with an aglycone dimboa
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
486
structure length
486
Chain Sequence
VFTKLKPWQIPKRDWFSKDFLFGASTSAYQIEGAWNEDGKGPSTWDHFCHTYPERISDGTNGDVAANSYHMYEEDVKALKDMGMKVYRFSISWSRILPNGTGKPNQKGIDYYNNLINSLIRHGIVPYVTIWHWDTPQALEDKYGGFLDKQIVNDYKYFAELCFQSFGDRVKNWFTFNEPHTYCCFSYGEGIHAPGRCSPGLDCAVPEGDSLREPYTAGHHILLAHAEAVELFKAHYNKHGDSKIGMAFDVMGYEPYQDSFLDDQARERSIDYNMGWFLEPVVRGDYPFSMRSLIGDRLPMFTKEEQEKLASSCDIMGLNYYTSRFSKHVDISSDYTPTLNTDDAYASSETTGSDGNEIGPITGTYWIYMYPKGLTDLLLIMKEKYGNPPIFITENGIADVEGDPEMPDPLDDWKRLDYLQRHISAVKDAIDQGADVRGHFTWGLIDNFEWGSGYSSRFGLVYIDKEDGNKRKLKKSAKWFAKFNSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Active-site architecture of benzoxazinone-glucoside beta-D-glucosidases in Triticeae
pubmed doi rcsb
source organism Secale cereale
total genus 186
structure length 486
sequence length 486
ec nomenclature ec 3.2.1.182: 4-hydroxy-7-methoxy-3-oxo-3,4-dihydro-2H-1,4-benzoxazin-2-yl glucoside
pdb deposition date 2010-05-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3aivA00
1BYBA 1JD9A 3O9NA 1NOWA 1QW8A 4W7VA 3CUHA 1HP4A 4ZENA 2Z1SA 4AY1A 1QHPA 4KWUA 4TX8A 3W25A 1V6WA 2FDMA 2J78A 3OIHA 1J12A 1BAGA 2DSKA 2O92A 3WQ4A 3WQ6A 3WNKA 4AD0A 1KQZA 1OCQA 3O6AA 2CERA 3BXWA 3ZO9A 5D8ZA 3ZMRA 1IZKA 4PMYA 4W5UA 2WNWA 2PBOA 3AYRA 1LL7A 1ZJBA 1Q4NX 1C93A 4MJ4A 3AZTA 1C7TA 2Q8XA 2FGZA 5ABEA 2G3IA 1CENA 4BQ5A 2AMGA 1JZ8A 2V5CA 3CLWA 3T0AA 4W93A 3UESA 1KCLA 3AMGA 4UZSA 2VQUA 5ABHA 3IAQA 2UWFA 3GBEA 3VIOA 3MANA 2ZOXA 1GOWA 4W85A 2GFTA 4AZCB 2D1ZA 2PWFA 5GNXA 4KMQA 4WKAA 1JYNA 4HA3A 4CU7A 4UOZA 1QNQA 1QHZA 1PZ2A 3WUEA 4UQ9A 1GQLA 1BHGA 2J74A 1LJYA 1HN1A 4M8UA 3I3DA 3SCNA 1PX3A 4AYSA 1TA3A 3MUIA 3ARTA 1GHSA 3WH8A 2XVNA 3OLDA 5GNYA 3A3HA 3JUGA 2WVUA 4P8VA 4P8UA 3AHZA 1UH3A 1XHGA 3AXHA 4EE9A 1VJSA 3IJ9A 5LYRA 4AEEA 1NP2A 3AMDA 3L4WA 4X9YA 3WMSA 2WMFA 1HKKA 3CTTA 2VX4A 4QFUA 2BV9A 1LF1A 4M24A 4GKLA 2D0HA 1EGZA 2J7EA 2C0HA 1R7OA 2WHLA 5DT7A 5GNZA 2WHJA 3ZIZA 5I79A 3AYSA 2YL5A 3WNLA 3ARZA 4HMEA 1CWYA 5HPOA 1OIMA 4CCCA 3T2OA 1JNEA 2WCAA 3VX1A 2YDRA 2VR4A 4PYSA 4UOJA 3L4YA 3AHVA 3WQWA 1A3HA 5A6BA 1IZJA 1QW9A 1ZBCA 1OM0A 2ZE0A 3MMDA 2Y8KA 1G5AA 5DO8A 4ZE5A 5D8WA 1RP9A 3KEHA 3SCTA 4GO9A 1V3LA 3VD5A 2XFRA 4Q7NA 4TVUA 2PC8A 4Z2KA 3WF1A 3ECQA 3MSGA 2FH6A 2DT3A 2WM0A 2E9LA 3RIKA 1UHVA 1I1WA 3UETA 3PZVA 3OZPA 4JFVA 3WN6A 4PTXA 4L4OA 3NSNA 5JBFA 1KXTA 2EXOA 3APGA 3N13A 3GH4A 4W7UA 3WF0A 6A3HA 1H09A 4XX6A 1H0IA 1BFNA 2XJ7A 1WDPA 3AS1A 4ZXOA 2J75A 3KL3A 3SUWA 1XH0A 1BLIA 2WWDA 2EPOA 1E72M 3I3BA 4U3AA 2JEPA 2VZUA 3PN8A 3VMPA 1WP6A 4AIUA 1K9DA 2DSVA 2VI0A 1KWGA 2D3LA 2C7FA 4HZ8A 3GZAA 3VIIA 4DUWA 2WVVA 1GJWA 3N04A 3ARXA 5HBFA 3BSGA 4AD2A 1MFUA 1BGGA 2MANA 4PMUA 4AZ5A 3ZJKA 3AROA 2DIEA 1MXDA 4JCMA 1E70M 4LYRA 1UD3A 2E9MA 4W89A 2W63A 1ESWA 1UKOA 2XIIA 1RPKA 1UR2A 4UCFA 3EDEA 3AZSA 4UQCA 2G41A 5DMYA 4U31A 1XH1A 4MB4A 1DEDA 1CGYA 3T08A 2GDVA 1JFHA 4FMVA 3F4VA 4GI8A 1OIFA 4D6FA 4J3SA 3VM7A 3WKZA 3A4XA 2ZX5A 3KE0A 3ZT7A 3VIMA 4GZEA 4LQ1A 3RPMA 2CBIA 4NF7A 1V6YA 2WMHA 1UYQA 3ZR5A 3EMZA 3AIWA 4AXNA 1VFMA 4BS0A 2W67A 4D6DA 1ISYA 2E8ZA 3POCA 3IAPA 1Q6DA 1VFFA 4C7FA 5FKYA 1BVZA 3GBDA 3KZSA 1E0XA 4CD5A 1JYWA 2OSXA 4F79A 4MDOA 2G3JA 1SMAA 3LPFA 3VINA 2XGBA 4HZ7A 2WKLA 4BZYA 1E71M 3D3AA 4N0RA 1TR1A 3BLPX 3DHUA 5C71A 3DYOA 4W88A 1CGXA 2WMKA 1EHAA 1YHTA 4OOZA 3WL0A 3HN3A 1W9VA 2PWDA 1C91A 3EMQA 1ODUA 1UZ4A 3F5JA 1TA3B 3QOMA 4CN4A 1PX8A 1UD5A 2WMIA 1YQ2A 4D6IA 1GHRA 4PTWA 4UOQA 4AC1X 3ZJ7A 1VEPA 4LXFA 4MJ2A 3NDZA 4E2OA 1AVAA 4UQAA 3SCWA 1EA9C 1HJWA 4GZJA 2X09A 1UD8A 3PZQA 1XSJA 4GXPA 1HP5A 5D4YA 5LA0A 1AQ0A 4JFWA 2DSWA 6CGTA 4TXEA 3WDHA 4HOWA 2CHOA 3WBAA 4WIWA 4MAZA 3WL1A 4AISA 1EO7A 3II1A 3AQUA 1B2YA 3AJ7A 3K46A 1BPLB 1V0LA 1AMYA 3UG3A 1L8NA 4TVCA 5A6LA 4V28A 5CLTA 1VB9A 2XWDA 1SFSA 1H5VA 1MW0A 4R27A 2DGAA 4FLSA 3N1AA 1HJXA 1UH2A 2VX5A 3CZEA 2GK1A 4GQRA 2O9PA 5JBDA 2VRJA 1NWUA 4FLQA 3M46A 3IANA 5A1AA 1CEOA 2WSKA 1OD8A 3ARVA 2J25A 2YL9A 4W87A 1W3HA 2O9TA 2A3CA 2V3FA 2VURA 3ZT6A 5CSYA 1XV8A 1BG9A 2YA1A 4AZIA 3SCOA 2NW0A 1SR0A 1E6PA 3U57A 3HMCA 3BMVA 1HL9A 3VGHA 3PZOA 4TX6A 5CQ1A 4V2XA 2QMKA 4IPNB 1KXVA 4P7QA 3NYDA 4CCDA 5AC4A 3SUUA 1GW1A 3B9AA 1OGBA 1ZBKA 2WLZA 3BAYA 4UFJA 1UR9A 3F5LA 1VEOA 3TTOA 3VU2A 3ALGA 4HTYA 3K4AA 1W1VA 2YBUA 3G6MA 2D2OA 4B3LA 1MW3A 3ZJ6A 3VTRA 4RE2A 1XCXA 3VDHA 1W1YA 2WVVB 3K8MA 3GNPA 3T0DA 5A2CA 4M29A 1XD0A 1JDDA 5A2BA 1CXHA 3VM5A 4AIEA 3MKKA 1KCKA 2J79A 5CGMA 2GVYA 1QNSA 5CG0A 4X0VA 5A8NA 1QI5A 4LYPA 1PEZA 1E6RA 2W91A 3GXMA 3T2QA 2YBTA 1GQKA 1Z32X 2CBVA 1G1YA 1IV8A 2V3DA 1HJQA 1CXIA 2RGLA 4W8AA 2QF8A 5I6SA 5EMYA 4YHGA 3VIJA 3WUBA 3PZTA 5I77A 1B90A 1H11A 3LPGA 1JG9A 3AMCA 3WFZA 5A6BD 2FH8A 1GQJA 1ZL1A 1ISZA 4CUCA 4V27A 1HVQA 1PIFA 4C7GA 1NWRA 2FHCA 1B30A 5A6SA 5I0DA 3BAIA 3WSUA 4QCEA 2DSZA 1UWTA 2CCRA 8A3HA 2WANA 2ZICA 1BQCA 3HJEA 2W62A 3OLEA 1E9LA 3AFBA 1E1EA 1CGTA 2G3NA 1TG7A 2BY2A 5M17A 4PCTA 3OGSA 1ZJAA 1JGIA 1WNOA 1FFRA 4X0NA 3SCQA 3RILA 1MQPA 3MUZ1 3WQVA 4W86A 1VFOA 4DWSC 3IJ8A 3CO4A 4QP0A 3NDYA 1NWSA 2VZVA 3OLGA 3L4ZA 1OT1A 5HNNA 2PBGA 5BXTA 2BVDA 1UKQA 3RM8A 1XGZA 2W4XA 1EQPA 4CU6A 3ZT5A 2XVPA 2JFEX 2YOCA 5C70A 4B16A 1X1NA 3VNYA 1EDQA 1Q6EA 2YIHA 1JZ3A 2WW5A 3W6MA 3MU7A 4B15A 1CZ1A 2OWCA 1E4LA 1TMQA 4B9YA 2WMIB 5ABFA 1C8QA 1D7FA 2WLYA 3MSDA 2VC9A 1UG6A 4QLKA 4PMRA 4PEEA 3EDDA 1WB0A 2E4TA 5M5DA 2CITA 4EANA 2OSYA 5AC5A 4JCLA 3BAWA 2CIPA 2XPKA 2E3ZA 2ZUWA 4UNIA 2XVKA 2J62A 1CLVA 4UFIA 4BQ2A 4B3KA 1RH9A 2E8YA 2RGMA 2XFFA 1UA7A 1HVXA 3K4DA 2J7CA 4M56A 3OGRA 3WD4A 2VR5A 3AHTA 2Y5EA 2XVGA 4HU0A 2J4GA 1NP0A 3MV01 1CLXA 3VGBA 1OBAA 1CGVA 1KBBA 5DT5A 4U2ZA 4DWSA 4R5EA 3VD7A 1W9PA 1W2VA 1H49A 2JF7A 2J77A 5HXMA 2ZUUA 1JZ6A 3CZKA 4M1RA 3AIQA 2DIJA 1E1FA 4PRWA 2VQTA 1B3XA 2GK1B 4AD1A 1JIBA 1ZBVA 2OYKA 3NJ3A 3U7VA 2CKRA 3BAXA 2AAAA 1C8XA 1JI1A 4D6GA 2A3EA 2JE8A 3WH5A 1NARA 4Z2LA 5IHSA 2X1IA 1ISWA 4E8CA 1JNDA 4OBRA 4H8VA 1WZKA 4ACZA 3CHCA 1A47A 2QV4A 1M04A 2JIWA 4GO8A 4BF7A 1HJVA 4H8UA 4Z2HA 3GNOA 2WZIA 3FHQA 1UR0A 3PZUA 3BAKA 2X8RA 4XB3A 5A94A 1J10A 1OINA 2GJRA 2IUZA 4CU8A 1J0ZA 2WHKA 4OUEA 2WBGA 3WF4A 2PB1A 4EKJA 2OWWA 1FHLA 1D2KA 3M07A 3TOPA 1E4IA 1KGUA 4YN5A 4PSRA 3WD3A 1CYGA 1CTNA 2FGLA 1J18A 1H0GA 3PZ9A 2VOTA 4P8WA 2WCSA 3W0KA 1KFWA 3UCQA 3OLIA 2VT0A 4J27A 1V3JA 1GNXA 1JI2A 3IK2A 1MVYA 2BNJA 5I78A 3K8KA 1ZB5A 2UY3A 3FHAA 2QMJA 1CXLA 5GQBA 1QBAA 3WH7A 4JFUA 3AISA 4GI9A 5A69A 1JL8A 1MXGA 3ZR6A 1CGWA 4PUDA 4EK7A 3DC0A 1H41A 3WQ8A 4AD5A 2E40A 1LG1A 5E6ZA 5BCAA 4J3UA 1JYVA 1U2YA 2IXUA 3B8SA 4KRUA 1W9DM 4S3JA 4PMQA 1E15A 2DT0A 4F9JA 4CD4A 1C3FA 2CHNA 4CCEA 3VIFA 3ARPA 4HP5A 1MYRA 3DYMA 4TTUA 3UG4A 3J7HA 1E4NA 3N18A 1H3GA 2WBKA 4CN1A 3OG2A 2BS9A 2DQXA 4UR9A 3QHMA 2WVTA 4D6CA 2EQDA 3VMNA 4UQBA 3GH7A 3QHOA 1UA3A 2BHZA 3CUFA 4UFMA 3VGDA 3ZJ8A 4PMNA 4HOXA 4ZFMA 2J7HA 4HPHA 2JF6A 3WUGA 2XFYA 3QHNA 3N17A 1E5JA 2VCBA 5KEZA 5GPRA 3CMJA 4AD3A 1G0CA 2E9BA 5FD0A 4WJXA 3A6OA 5FIPA 1E55A 4H7VA 2FHBA 1V0MA 4PN2A 4AD4A 3VD3A 5IHRA 2XM1A 1VENA 3AOFA 3MMWA 4XZWA 5A8PA 4U3CA 3WEOA 1V03A 1W1PA 4ZXLA 3UR8A 1XCWA 1Q6CA 4MB3A 1N82A 2WKGA 3RJYA 5E0CA 1QOXA 2OYLA 1HX0A 5A6KA 1CXEA 1G01A 2WMJA 4A3HA 4UFLA 3CBWA 2WC7A 1R8LA 3PZNA 4AWEA 5BRPA 4GPNA 4DWSB 1E6QM 5JUVA 4OKDA 1GOOA 4OOUA 1QBBA 3K8LA 4PMOA 2WSPA 1DHKA 4S3KA 1UQYA 2XYLA 2X05A 4MNMA 3CPUA 4ZEPA 2Y4SA 4XV0A 5BXRA 1MW2A 4RE3A 2YDQA 2ZXQA 2XWEA 1GQIA 2O9RA 2ZWYA 4U5IA 4AW7A 3AIRA 4KRTA 1V6VA 1GORA 1VBRA 1F4AA 3LPOA 2BY3A 2EEXA 4K68A 1JF6A 1BYAA 4IPLA 4ATWA 4AZ7A 2D22A 4A4AA 4DUXA 3GM8A 1HKMA 1WZAA 4D6HA 2PWEA 3QOKA 4NRSA 4D72A 3W28A 1UD4A 4ACZB 1NWTA 5CLWA 2G3MA 3AICA 5BXSA 1TFVA 4HU8A 4CVUA 5TD4A 4P7LA 4J7RA 3PZMA 4KGLA 5AYBA 1VIWA 1KBKA 3M7SA 3L4VA 1J11A 3OB8A 2QHAA 3SURA 5HDRA 1UKSA 3PZGA 1GCYA 4ATLA 2WWCA 3WUFA 5LA1A 1WDRA 4D6EA 3DECA 4IM4A 2IXVA 3RDKA 1EIBA 5A8QA 5I5RA 2UY4A 3SCPA 1QI2A 3ALFA 2NSXA 1BVNP 3VIGA 3VMOA 1TVNA 4W5ZA 2VX6A 1GOIA 3SCSA 4CD6A 1Q6FA 1ITXA 5CPQA 3GDBA 3W81A 3W27A 1TZ7A 3W6LA 3ARWA 2ZX6A 1GONA 1ZS2A 2FHFA 4DWSD 2XSBA 2YL8A 1UWIA 3KL5A 5IXEA 2WXDM 3VIPA 4W8LA 1FP8A 3L4UA 3T0BA 4TOQA 3WDPP 3S2CA 1GOMA 2BHYA 2G8ZA 1EH9A 1QNRA 4AZHA 3OBAA 2G4FA 3W29A 2UY5A 2F61A 2DSUA 3SCUA 3QR3A 2XIBA 1TE1A 1XD1A 1JZ5A 1UR1A 4CVWA 1PZ3A 4JKLA 4LPCA 2D24A 4AZGA 3ARRA 9CGTA 2ZX8A 1FH9A 1MFVA 4M82A 3TTYA 1DWHM 4J3WA 3PTMA 1AQMA 3N9KA 2X2YA 3FAWA 3UEQA 4JKKA 5KZ6A 4Z2IA 1JXJA 1US3A 5FL0A 2ZUMA 1W2PA 1BTCA 5D9NA 1UOKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BYB A;  1JD9 A;  3O9N A;  1NOW A;  1QW8 A;  4W7V A;  3CUH A;  1HP4 A;  4ZEN A;  2Z1S A;  4AY1 A;  1QHP A;  4KWU A;  4TX8 A;  3W25 A;  1V6W A;  2FDM A;  2J78 A;  3OIH A;  1J12 A;  1BAG A;  2DSK A;  2O92 A;  3WQ4 A;  3WQ6 A;  3WNK A;  4AD0 A;  1KQZ A;  1OCQ A;  3O6A A;  2CER A;  3BXW A;  3ZO9 A;  5D8Z A;  3ZMR A;  1IZK A;  4PMY A;  4W5U A;  2WNW A;  2PBO A;  3AYR A;  1LL7 A;  1ZJB A;  1Q4N X;  1C93 A;  4MJ4 A;  3AZT A;  1C7T A;  2Q8X A;  2FGZ A;  5ABE A;  2G3I A;  1CEN A;  4BQ5 A;  2AMG A;  1JZ8 A;  2V5C A;  3CLW A;  3T0A A;  4W93 A;  3UES A;  1KCL A;  3AMG A;  4UZS A;  2VQU A;  5ABH A;  3IAQ A;  2UWF A;  3GBE A;  3VIO A;  3MAN A;  2ZOX A;  1GOW A;  4W85 A;  2GFT A;  4AZC B;  2D1Z A;  2PWF A;  5GNX A;  4KMQ A;  4WKA A;  1JYN A;  4HA3 A;  4CU7 A;  4UOZ A;  1QNQ A;  1QHZ A;  1PZ2 A;  3WUE A;  4UQ9 A;  1GQL A;  1BHG A;  2J74 A;  1LJY A;  1HN1 A;  4M8U A;  3I3D A;  3SCN A;  1PX3 A;  4AYS A;  1TA3 A;  3MUI A;  3ART A;  1GHS A;  3WH8 A;  2XVN A;  3OLD A;  5GNY A;  3A3H A;  3JUG A;  2WVU A;  4P8V A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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