3AMGA

Crystal structures of thermotoga maritima cel5a in complex with cellobiose substrate, mutant form
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
GVDPFERNKILGRGINIGNALEAPNEGDWGVVIKDEFFDIIKEAGFSHVRIPIRWSTHAYAFPPYKIMDRFFKRVDEVINGALKRGLAVVINIHHYEELMNDPEEHKERFLALWKQIADRYKDYPETLFFEILNAPHGNLTPEKWNELLEEALKVIRSIDKKHTIIIGTAEWGGISALEKLSVPKWEKNSIVTIHYYNPFEFTHQGAEWVEGSEKWLGRKWGSPDDQKHLIEEFNFIEEWSKKNKRPIYIGEFGAYRKADLESRIKWTSFVVREMEKRRWSWAYWEFCSGFGVYDTLRKTWNKDLLEALIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endoglucanase
publication title Diverse substrate recognition mechanism revealed by Thermotoga maritima Cel5A structures in complex with cellotetraose, cellobiose and mannotriose
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 120
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2010-08-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3amgA00
1JZ6A 1UYQA 1FFQA 3ARVA 1EDTA 1GOKA 5A6AA 3CHCA 3W82A 1XRVA 3MUY1 4H8HA 1EDQA 1VRXA 4LGXA 2YKKA 5I24A 1E72M 2DSWA 2ZUUA 2X8RA 3RO8A 1JAKA 3WNKA 4UZSA 4MNMA 3VMPA 1CXFA 1DEDA 2YDQA 4PSPA 3GM8A 5EBAA 1ESWA 2ZIDA 1XD0A 4Z2JA 1JGIA 1VAHA 2VRJA 4WSJA 1OGBA 4CN6A 1NARA 2ZX9A 3LMYA 4OOUA 1SR0A 1NOFA 2QLYA 4W87A 4IM4A 2YJQA 3MANA 4H8VA 3VIFA 1MW1A 3HMCA 3EMQA 3AXIA 1ISWA 1MQQA 4M82A 1VENA 4OOZA 1CGXA 1TCMA 2O92A 4A3HA 5BXTA 1ZJAA 1TVPA 4L4PA 4ZE4A 3OIHA 4TVDA 1RD6A 1R7OA 1GOMA 1ZB5A 1UR4A 3KZSA 1KR0A 4FLOA 1QNOA 1US3A 1CXIA 1V0KA 1JZ8A 3W27A 3ARRA 1QBBA 4YPJA 1AVAA 1V03A 4OBRA 2D2OA 4PCSA 4X0VA 9CGTA 4WLCA 1FP8A 2DEPA 2WK2A 4PN2A 4UOQA 5FKYA 3W26A 4UTFA 1AQMA 2D3NA 3WDPP 2O9RA 5D9NA 1E73M 5F7UA 4W5ZA 4S3JA 1UOKA 2VO5A 2Y8KA 3SIMA 2OWXA 4P7QA 1HJSA 4JAWA 3BAWA 2XGIA 1JYVA 3N17A 3VNYA 3WQ6A 4B15A 4D6JA 3W38A 3GBEA 3CZJA 2C7FA 1ECEA 2VVSA 1MQRA 3FHQA 1HJQA 2FH8A 2X1IA 2G4FA 2WHLA 5JIPA 4QDMA 3TTQA 2E8ZA 2JIEA 3AZSA 4W89A 4JKMA 1CXLA 1E9LA 2UY5A 3WL1A 4J28A 1WDSA 4QLLA 2EPMX 3GH4A 4M24A 5FD0A 1GQKA 3N1AA 4AD4A 5A8QA 5A2AA 4PYSA 1E4LA 2IXVA 3FHAA 1OT1A 2WNWA 1HXJA 4JCMA 3B9DA 3AIQA 4WK9A 2VCBA 1D3CA 3GH5A 3CZGA 1V3IA 1Q6FA 3U5YA 2WCSA 5A6LA 3AMKA 2FGZA 2E8YA 4R27A 2PWGA 3AXHA 5CLWA 4JL1A 2GVYA 5I6SA 4DUWA 1MW3A 4GQQA 4EKJA 2JIWA 2D0FA 4JKLA 3VKKA 1UHVA 3DYOA 1WNOA 2CESA 3VGHA 4E2OA 1V6UA 1W1TA 3RMEA 3ZSSA 1C7TA 2WC3A 1QVBA 3W53A 3NYDA 3QGVA 2QMKA 1TE1A 1KCKA 2CHNA 1J0IA 1B3VA 5I23A 1A47A 1GHSA 1OINA 1PPIA 2W91A 5A8MA 5CSUA 5IHSA 5A95A 1J0HA 1XGZA 4F9DA 3ZMRA 1BHGA 4NRSA 4TXEA 4CCDA 3VX1A 1RPKA 1H2JA 1DP0A 3WNLA 4PMRA 3W4RA 3BAIA 1WPCA 1QI5A 1V08A 4B9YA 3BSGA 4TVUA 3B9AA 4UQ9A 2EJ1A 2BXYA 4NF7A 3CUIA 3WUGA 1D2KA 2ZXQA 2E0PA 2E9BA 1CGTA 2IXUA 2XVNA 1JZ3A 1E1FA 5M17A 3VILA 3FAXA 5LA2A 4QFUA 2W5FA 1V6WA 1CGVA 4WKAA 3ZJ8A 3ZM8A 3EMZA 2WMIA 5GNXA 3WDIA 4D6IA 3NCOA 2Y5EA 4XB3A 2VX4A 2YBUA 3AJ7A 1UWUA 2PBGA 4Z2IA 2ZUNA 5CGTA 1NOWA 3GXDA 3W6LA 2W63A 4MB3A 2XYLA 3BSHA 3RM9A 1FHLA 3TTSA 1E3ZA 3N04A 2VI0A 2DSVA 3VDAA 1K9EA 3ZO9A 5A8PA 4CCCA 2WHKA 4M56A 4CU8A 1EGZA 1XH1A 3WEZA 1C3FA 2V3GA 2WKGA 1TA3B 1LF1A 2VVNA 2OYMA 1QNPA 3RPMA 3ARQA 1QI3A 3G6MA 7CGTA 1OGSA 1NWSA 2VTFA 2ZUMA 3LPPA 3EDKA 3VDBA 1JL8A 2EPLX 3WQ5A 1FH8A 2QV4A 3AHZA 4CN4A 3EMCA 4MAZA 3ZT7A 1TFVA 2UWFA 4PMVA 2VZSA 3MS8A 5AC4A 4MB4A 3L4ZA 2WCAA 2OYLA 2J7BA 3GDBA 4Z2KA 5M3WA 2A3AA 1CPUA 5BRPA 3N15A 4AD0A 3ZJ6A 4BQ3A 2XIBA 3VM5A 4PUDA 1GW1A 3EDJA 5HPCA 1HL9A 3BH4A 3AHYA 2BY2A 1C91A 1GQLA 1B30A 3DYMA 2WLZA 1ISZA 1LQ0A 1BPLB 2F2HA 1W32A 2DIJA 2XM2A 4Z2HA 3WNOA 3L4VA 1V6VA 1IZJA 3T0BA 4P7OA 4PMXA 1PX4A 4RL3A 1H11A 1MXDA 1TR1A 2VNCA 4LQ1A 1HKJA 3KL5A 3NSXA 4J27A 1VEMA 4W8LA 1KR1A 1UQZA 1E6SM 3CHDA 2YBTA 2WVVB 1CXKA 3VM7A 4W86A 1ITCA 3U7BA 3WMCA 3QHOA 5AYIA 3MV01 3S2CA 2BXZA 2EO7A 1CGUA 5BCAA 3O6AA 4QP0A 5E6YA 4FLQA 2J79A 3CZKA 1DWIM 1QHZA 2GJXA 2O9PA 2Z1KA 1CDGA 3QOKA 3BGAA 2VR5A 4WSKA 5DT5A 4BQ2A 2BVDA 2GFTA 4W7UA 4GI8A 4J3XA 4YN5A 1U2YA 1W3KA 3AIEA 1NOUA 2OLHA 2ZUTA 3IAQA 2VZOA 4UQEA 4J3UA 2JF6A 2ZXAA 3M7SA 1HL8A 1B3YA 3DYPA 3SCNA 2AOSA 3A47A 4W5UA 1PZ3A 3IAPA 1WDRA 1BFNA 1JDAA 3VDHA 1HJUA 3KL3A 2JE8A 2PC8A 5BXRA 1P6WA 1HIZA 4AEFA 1W9UA 4DUXA 3WEOA 3BCFA 4JFUA 1UUQA 4W84A 3GNPA 4M29A 1C90A 1WE5A 1C92A 1LLOA 1OBAA 4PMYA 4GZEA 3BC9A 1HT6A 4Z2LA 1E0VA 3GYCA 1G5AA 3WFLA 1B9ZA 3GXMA 4UOJA 3RM4A 1XC6A 5M5DA 3TOPA 3WQ8A 1MYRA 3THCA 1BYAA 3VGEA 1LG1A 1JI2A 3BMVA 1IZKA 1MW2A 1VFMA 3AROA 3NDYA 4TTUA 5HNNA 5IFPA 1OB0A 4M81A 3PZTA 1E1EA 3T08A 2J7CA 2DH2A 3WDRA 5CJ5A 1TMQA 1TG7A 3RDKA 2O9OA 1LL7A 2UY4A 3CMJA 1CGYA 1E0WA 2VX6A 5GNZA 2X0HA 2FGLA 1UD8A 5E0CA 3UR7A 1CECA 1G0CA 2CBJA 4D6HA 1UG6A 2J7EA 3ZOAA 3WNMA 5A1AA 1W1PA 3J7HA 3MU7A 3DC0A 2J7FA 4CU6A 3OB8A 1MXGA 3PZOA 3PZGA 1XD1A 4ATWA 1LG2A 1VEPA 4UZUA 4W93A 2XG9A 1LJYA 4JL2A 5JBDA 2DT2A 3DECA 1Q6EA 2PWEA 2J7GA 2HISA 2G41A 3DHPA 1KQYA 4WIWA 4BS0A 3W37A 1OD0A 4AY1A 4U31A 4ML4A 5JBFA 5D9OA 2XPKA 3OLGA 1I1WA 5JUVA 1SMDA 4IISA 4BQ5A 2V38A 1B2YA 3N12A 1SMAA 1UZ4A 4KRUA 3AIRA 2J7DA 4OIFA 1WZAA 1DWAM 3UG4A 4RE2A 2BHYA 1GORA 3U7VA 3HJEA 5CPTA 1FP9A 3UETA 1XSJA 2WVTA 3ALFA 1BSIA 4P8VA 1C8XA 3UG5A 2W61A 3GBDA 1QPKA 4P8XA 1I1XA 3WD2A 4JKKA 3CBWA 3WD3A 3WF3A 2X05A 1PZ2A 1E6PA 2WANA 3OA5A 4YHEA 1UR8A 3U5UA 5A6BD 1JIBA 5D9MA 1G9HA 3VOCA 1KXVA 1LL4A 1FH7A 5DT7A 3MUAA 2WMJA 2XGBA 4X0NA 4EE9A 4A4AA 1PBGA 5A8NA 4KMQA 3T09A 1JNDA 1V3MA 4D6CA 4DWSC 2ZUWA 1KGUA 2V3EA 4M80A 3T2QA 3L2LA 5A69A 3PBGA 5BROA 1JZ5A 6CGTA 2UY2A 1PX8A 1WZLA 2YA0A 2GJXB 1X1NA 2XFRA 5CGMA 3T0DA 1CBGA 4PTXA 1PEZA 1Z32X 2NSXA 1J0JA 3FNDA 1BGGA 4AD2A 1EH9A 1W3JA 4H7VA 7TAAA 1UD6A 1R7AA 3WD4A 1TA3A 1HJXA 4HZ8A 1E43A 4TOQA 3T2OA 3A6OA 3VIGA 2VC9A 2PF0A 3OLDA 4MAVA 2JEQA 4AMCA 4UQDA 1CXHA 3L4YA 3WENA 4URIA 1V02A 4HPGA 2JFEX 2GJRA 4PUEA 4HA1A 3VD7A 3UERA 1B3WA 3RCNA 4XV0A 4OJYA 1W9DM 1L8NA 3WBAA 4AZ5A 1BTCA 3SCOA 2D20A 2DT3A 3CZLA 1JYNA 2AMGA 3PZMA 1X6LA 5A2BA 3B8SA 3N11A 1CNVA 3QOMA 4CKQA 3EDEA 2CBVA 2G3MA 3L4XA 3AS3A 4RE3A 1GOQA 3PHAA 3T0AA 2VOTA 4AD3A 1UWQA 4HA4A 1JAEA 3MKKA 2JF7A 2VZTA 2PBOA 5A94A 5A3HA 3WNNA 1CIUA 2RGLA 4J3WA 4UFKA 2C8NA 3SUTA 3BMWA 3HU7A 1JFHA 2XUCA 4TTGA 4GXPA 1E15A 3ZIZA 4JFSA 3NJ3A 2WVVA 3WKZA 1EO5A 1EOMA 1KGWA 4JCLA 2XFYA 1M7XA 2WWDA 1KXTA 3QHMA 2XHYA 3F5LA 4LX4A 2J78A 5HBFA 1EQCA 1M03A 4HZ7A 3GNOA 4DUVA 2VR4A 3WL0A 2VJXA 3TTYA 3WUBA 3ARTA 3FN9A 3QR3A 2A3CA 3ZSTA 4CU7A 3AS1A 4OBSA 1J12A 2YDRA 1A3HA 3OGSA 4JFWA 5DFAA 2QMJA 3VNZA 5C71A 2D22A 1B1YA 3IJ9A 5E09A 1E55A 1OSEA 5C8BB 3CTTA 2D3LA 4WKFA 2EEXA 4B9ZA 4E8CA 1R85A 2VZVA 1Q6CA 2XTKA 3I3BA 2ZX8A 2VL4A 1QNRA 2CERA 2BFGA 1H0GA 1AQ0A 5CG0A 1K9FA 4U2ZA 1W1YA 1I75A 1QW9A 2WMGA 1JDDA 2WBGA 3CUHA 4AEEA 5KZ6A 1B0IA 3A4AA 2V3FA 1OWQA 5CQ1A 3OZOA 1EOKA 4GZJA 3GXIA 2D24A 3POHA 4GI6A 3VIJA 1UWRA 4HZ6A 3OGRA 2ZX5A 1J0KA 4ACZB 2WVUA 1E6XM 3MO4A 4M8UA 3AIWA 2XFFA 4PSRA 3MSDA 1BVNP 2E9LA 1V3HA 1TUXA 2Y8VA 4WKHA 1HKKA 3WBEA 1DWFM 2CPUA 1XCXA 3WUEA 1OGGA 4PTMA 4C7DA 1E40A 4OZOA 4AZGA 1BGAA 1BYDA 2ZE0A 3K1DA 2PB1A 4CD8A 1UWSA 3WSUA 4JFTA 1ZL1A 1WO2A 4AD5A 5IHRA 2Y24A 1FHDA 4NSBA 3OG2A 4MADA 1OM0A 1QNSA 4CUCA 2CBIA 1H3GA 1W1VA 1RP8A 1Q6DA 3SUUA 1CYGA 3D5HA 5AYBA 2J77A 4V27A 4MB5A 1DHKA 3KWXA 4D1IA 4Q22A 5DEZA 3WH6A 5A6KA 1V3KA 2VCAA 3MMDA 1M53A 5HDRA 3CPUA 3SURA 1XH0A 4AXNA 2GJPA 5CZKA 4AD1A 1W3LA 1QHPA 1R87A 1KWGA 1XHGA 4UFLA 4TX8A 3RJYA 1VB9A 1E5NA 1W9VA 4PRWA 2WPGA 2WMKA 3AISA 5LYRA 4NZCA 1Q4NX 2OSYA 2J62A 3BLPX 1TVNA 3BLKA 5EMYA 2CHOA 1NP0A 4K68A 4HA3A 3WF1A 1EQPA 3ARXA 2CKRA 2UY3A 5JBEA 4QCFA 3PZNA 3EDDA 1NWTA 3TP4A 2O9TA 2VRKA 1PIFA 5HPOA 1W2PA 4GO8A 4D6GA 4P8UA 1KCLA 1W9BM 4N42A 3SCWA 3CZ8A 1ZBKA 1RP9A 2DQXA 2VURA 3AMCA 1MFUA 2F8QA 8CGTA 2VQUA 5I5RA 2WXDM 3MUZ1 3ZR5A 1WCGA 1JI1A 2BHUA 3ARZA 1B3XA 1GONA 2GDUA 1ZBVA 4CD6A 3NDZA 3CGTA 4WF7A 5FL1A 4ZXLA 1UWTA 2DGAA 1UKTA 1GPFA 1V0NA 3PTKA 4AC1X 4HOWA 1AQHA 3CMGA 4PEEA 4F8XA 3TONA 4KH2A 3ARYA 2PWFA 3II1A 5A6JA 1GJUA 2IUZA 5IDIA 4QAWA 3BXWA 3VIMA 1E71M 1H5VA 4GKLA 1GOWA 1UR2A 3FW6A 3VIKA 2W67A 1JFXA 1W9XA 1WAWA 3WD1A 1SFSA 1JZ2A 5I78A 2EPNA 3ECQA 1CZ1A 5CXPA 1K9DA 1HKMA 4HOXA 1QHOA 4TUFA 4PMDA 1B3ZA 2YDSA 1CTNA 1NH6A 2G3IA 1J0YA 2RGMA 2WKLA 4D6EA 1IV8A 2WB5A 2CBUA 4D6DA 3OLEA 1HP5A 3GZAA 3U57A 3I3EA 3OZPA 4J7RA 2EXOA 3VGBA 1UQYA 3PZUA 1V0LA 1V3LA 1ITXA 4PMNA 4MB1A 1UD2A 4AYSA 4UFJA 2FH6A 5EB8A 2XIIA 4GO9A 2DSZA 3EYPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JZ6 A;  1UYQ A;  1FFQ A;  3ARV A;  1EDT A;  1GOK A;  5A6A A;  3CHC A;  3W82 A;  1XRV A;  3MUY 1;  4H8H A;  1EDQ A;  1VRX A;  4LGX A;  2YKK A;  5I24 A;  1E72 M;  2DSW A;  2ZUU A;  2X8R A;  3RO8 A;  1JAK A;  3WNK A;  4UZS A;  4MNM A;  3VMP A;  1CXF A;  1DED A;  2YDQ A;  4PSP A;  3GM8 A;  5EBA A;  1ESW A;  2ZID A;  1XD0 A;  4Z2J A;  1JGI A;  1VAH A;  2VRJ A;  4WSJ A;  1OGB A;  4CN6 A;  1NAR A;  2ZX9 A;  3LMY A;  4OOU A;  1SR0 A;  1NOF A;  2QLY A;  4W87 A;  4IM4 A;  2YJQ A;  3MAN A;  4H8V A;  3VIF A;  1MW1 A;  3HMC A;  3EMQ A;  3AXI A;  1ISW A;  1MQQ A;  4M82 A;  1VEN A;  4OOZ A;  1CGX A;  1TCM A;  2O92 A;  4A3H A;  5BXT A;  1ZJA A;  1TVP A;  4L4P A;  4ZE4 A;  3OIH A;  4TVD A;  1RD6 A;  1R7O A;  1GOM A;  1ZB5 A;  1UR4 A;  3KZS A;  1KR0 A;  4FLO A;  1QNO A;  1US3 A;  1CXI A;  1V0K A;  1JZ8 A;  3W27 A;  3ARR A;  1QBB A;  4YPJ A;  1AVA A;  1V03 A;  4OBR A;  2D2O A;  4PCS A;  4X0V A;  9CGT A;  4WLC A;  1FP8 A;  2DEP A;  2WK2 A;  4PN2 A;  4UOQ A;  5FKY A;  3W26 A;  4UTF A;  1AQM A;  2D3N A;  3WDP P; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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