3AQVA

Human amp-activated protein kinase alpha 2 subunit kinase domain (t172d) complexed with compound c
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
273
structure length
267
Chain Sequence
HDGRVKIGHYVLGDTLGVGTFGKVKIGEHQLTGHKVAVKILNRQKIRSLDVVGKIKREIQNLKLFRHPHIIKLYQVISTPTDFFMVMEYVSGGELFDYICKHGRVEEMEARRLFQQILSAVDYCHRHMVVHRDLKPENVLLDAHMNAKIADFGLSNMMSDGEFLPNYAAPEVISGRLYAGPEVDIWSCGVILYALLCGTLPFDDEHVPTLFKKIRGGVFYIPEYLNRSVATLLMHMLQVDPLKRATIKDIREHEWFKQDLPSYLFPE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2
publication title Structural basis for compound C inhibition of the human AMP-activated protein kinase alpha 2 subunit kinase domain
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 267
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3aqvA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3aqvA01
1PXKA 3PJ1A 2HXLA 3COMA 2SRCA 4ZSLA 4V05A 3ORPA 4FODA 2PU8A 2J0LA 5EHOA 2CGVA 2REIA 4IADA 3OT8A 4FZ6A 4AW2A 4GL9A 4BGQA 1OUYA 2W1GA 2X39A 3JY0A 4GU9A 3OEZA 4RA4A 2JC6A 4EOJA 3GOKA 3LMIA 3EMGA 4EH5A 4BGHA 1R0PA 3EZVA 2V22A 1Q3WA 2YCFA 1JKKA 4FSZA 2PSQA 2A19B 3CTQA 4HCUA 3EFKA 4E20A 1A06A 1OIUA 4QQCA 3KL8A 3COIA 3DJ5A 2GSFA 5DHJA 4E26A 4JVGA 5AUVA 2XBAA 3HRCA 5E8UA 1KV1A 3A4PA 1UU3A 3LHJA 4FKOA 3S00A 3R0TA 4HGLA 4MNFA 3KQ7A 5GNKA 4IACA 4FYNA 3HVCA 5I9UA 1M17A 4KWPA 4Y46A 4D0WA 4RC2A 3ULZA 4CFXA 4I6HA 5JSMA 2C6IA 4QMWA 2WMWA 4Z9LA 3UIUA 3LCTA 3N9XA 4MD7E 1DM2A 4QRCA 4R5YA 4YGAA 2GNFA 3DZOA 5J79A 4X2JA 4RX9A 4Q9SA 3LJ1A 3PFQA 4F0FA 3QRUA 2WXVA 2PK9A 3NAYA 4KIOA 4IW0A 2WTKC 4ONAA 3U51A 2F2CB 2PZRA 1F5QA 4O27B 3NUNA 3C0GA 2XUUA 3SHEA 3ZH8A 3CY2A 3PZEA 4G34A 5CVGA 1XH7A 2R3GA 2QKRA 5H8BA 4RVTA 4IFCA 2BDFA 4MTAA 5AP1A 1H8FA 3V5PA 5E1SA 3ZFXA 3WE8A 4Q9ZA 1GNGA 2VU3A 3AOXA 5C1QB 3R9DA 4FVRA 3TN8A 2XIZA 2R5TA 4NTSA 4A9UA 4Y85A 3TDVA 2X8EA 2WQNA 4LGHA 4EH3A 2VTMA 3QTUA 5FEEA 1B38A 3TG1A 5BMSA 4MHAA 3WIGA 1Y57A 4S30A 4EHZA 4F09A 4RX5A 3DY7A 2BAQA 3G0FA 3I0QA 4HPTE 5FDPA 4RVLA 3QXPA 2YM7A 5JEBA 5EQEA 2C0OA 4BIBA 2HW6A 4FUYA 5J1WA 2WMVA 2ZVAA 4ZTRA 3FMHA 3DQWA 2ZAZA 4CZUA 2UVYA 3HDNA 4ASXA 2JKKA 3QU0A 4ALVA 3EQPA 3G90X 4OW8A 4PP7A 5CAOA 4WG5A 1GZNA 4BDCA 3BHHA 1NVQA 3UP2A 3OG7A 4WBOA 5M4IA 3LCOA 1QPEA 3KEXA 4JNWA 4UWCA 3AT3A 5LARA 2ZOQA 2XNPA 4OTIA 5HX6A 5A54A 5IQDA 4AT4A 1TVOA 3SLSA 3SQQA 2X8DA 5CANA 3ATSA 4EL9A 5FD2A 5AAGA 2QU6A 5JFXA 1YVJA 5CWZA 2IZTA 3BIZA 4FEVA 2BIYA 3UMWA 4PMSA 5FUTA 5A4QA 3FMDA 3OXIA 3QD2B 5BVWA 2UZTA 4LOOA 3OTUA 3QUDA 5I9WA 1U5RA 4FSRA 4DFXE 1WBSA 4X3FB 4DH3A 1JAMA 3V8WA 2YFXA 4IX3A 3KULA 5HQ0A 1Z5MA 1CKIA 4UMPA 3AT4A 3OMVA 3KRXA 5DBXA 3GGFA 3NNVA 4FT5A 4USFA 2VN9A 5HO8A 5BQ0A 4FKGA 3L9NA 3LAUA 2C5NA 4H58A 2GMXA 2XM8A 3W2RA 2PMOX 4IANA 3ZO2A 4RC4A 1BL7A 3P7BA 3MPMA 1H0VA 3RCJA 4E4LA 5KHWA 4AFJA 4BCKA 4BKZA 4NM3A 3QTRA 3HUCA 2YHVA 1W84A 4WIHA 3BYUA 2PZPA 1M2RA 4NEUA 3OROA 1CSNA 3E92A 3GI3A 3G9NA 4IWDA 1JVPP 3QTQA 4OLIA 4NM7A 4TPTA 3FUPA 5CU6A 3TNWA 4BZOA 2CKPA 4PMMA 4TYIA 5L6WL 2IW8A 4L3JA 4RIYB 3CTHA 3WZKA 4DAWA 2R3QA 3ALNA 2XNGA 4J1RA 4BB4A 3QALE 4L43A 3IW7A 2IW9A 3NYOA 3LFCA 3HV6A 4G6NA 2WMBA 3EL8A 1PKDA 3VUKA 4O7NA 3CLYA 3RK7A 2W1CA 4HYHA 1XH5A 3H0ZA 3BYVA 3KB7A 2VWZA 4YNOA 2QG5A 5DRBA 3DKCA 2A27A 2JEDA 3F66A 3JY9A 4HOKA 4IX4A 4J7BA 4PF4A 4RVKA 5A3XA 3U6IA 4J96A 2B9FA 4RQKA 4F63A 4EWQA 2YEXA 3QD4A 4LQMA 4D28A 5HNIX 3ACKA 2IWIA 4NIFB 4QQTA 5HBJA 4PMTA 1OBGA 2I0YA 4FKPA 3LMGA 4H3PA 3DZQA 3RP9A 2IZRA 4FV8A 2YIXA 3FMJA 1CDKA 3W2SA 5CAVA 5KHXA 1UKIA 3CQEA 5AP5A 3ZZWA 1H25A 1HCKA 1YI4A 2YAAA 4JDHA 3TNIA 3QD3A 4XRJA 1R78A 4RWKA 3PA3A 4EI4A 3DAEA 5HIEA 5IG1A 3JUHA 4X6QC 1SM2A 3FI3A 2VX3A 5DT4A 3T3UA 4D4RA 4DEIA 4R8QA 4HGSA 3SX9A 3ZRMA 4ZMEA 2JLDA 2EVAA 2RIOA 2QNJA 3TM0A 4APPA 4BWPA 2FO0A 4AP7A 5E92A 1OPLA 2E9UA 3UG2A 3NLBA 5HIBA 1XH4A 4I92A 5BPYA 3SV0A 4BWXA 2BRBA 5CENA 3IW4A 5HIDA 2QCSA 4E3CA 4A06A 4KABA 2FSMX 5CVHA 3D5VA 1Q99A 3E3BX 3U6JA 2QKWB 3U87A 1H1QA 2GQSA 2XBJA 3RAIA 3EFWA 4I20A 5D11A 5H9BA 5HEZA 3WF5A 4ASDA 2ZM1A 4KBAA 1WBVA 4OBOA 3EQHA 4FTAA 4I6QA 4V0GB 2RG5A 3CE3A 4ZAUA 1O6YA 2ZJWA 3H3CA 4YZCA 5IZFA 3QTZA 4DCAA 1ZYSA 1BMKA 4J95A 3CJFA 5CF4A 3NDMA 2GHGA 3P08A 3ZO1A 4YUQA 5ETCA 2X9EA 1YHVA 4F64A 3ZUVA 4KIPA 3FBVA 3C4FA 2GQGA 2UV2A 1DAYA 2WO6A 3A61A 2PUPA 3FZOA 4O0VA 2E9OA 1KE9A 2J9MA 3DCVA 4FG9A 2C5XA 3PJ8A 3P7CA 4IJPA 4GUBA 5DWRA 1PYEA 3R7UA 4DG0E 3UDBA 2LGCA 3AD5A 3PIZA 3E63A 4I5HA 4WG4A 4CLJA 5IDPA 1PW2A 1BUHA 3DFAA 3Q96A 3PLAE 1UU7A 1W82A 4OGRA 4AN3A 3UBDA 4CMUA 5C4KA 2PE1A 4QTAA 3W32A 5ICPA 2QI8A 4F1OA 2VTOA 4PDSA 4YLKA 2QO9A 3E8EA 5L2IA 3R1YA 4CCBA 1WAKA 2CNUA 3QCSA 4FV5A 4U9AA 3DPKA 4CZYB 4O7VA 2R9SA 2WTVA 3NNUA 4RQVA 2WU6A 4BGGA 2R3FA 4BTJA 2ZV7A 4MCVA 4C8BA 4AOIA 5DR9A 1YRPA 4RFYA 4KNBA 5ETIA 4O0WA 3VUGA 4B9DA 4QT1A 5B0XA 4ZS4A 2FA2A 2JFLA 5D9HA 2GHMA 3M2WA 4OTRA 3I60A 4RA5A 3WF8A 1GZ8A 3OCTA 2X9FA 4R5SA 2QOLA 3L8PA 4RJ6A 4BY9E 3ZBXA 3O8PA 3DV3A 3VUTA 2OK1A 2R3LA 5AIRA 3MH1A 4M3QA 4GFOA 3JXWA 4L3PA 4HGTA 5E1EA 3FMKA 5AR8A 2CGUA 2WTJA 2YCRA 4KA3A 4NM0A 4BCOA 2PULA 3MS9A 3OOMA 5KKRB 4I23A 3LFEA 2G1TA 4QPSA 5HG8A 3WF6A 4EONA 3CPBA 4YR8A 4IFGA 2HXQA 4YJPA 3MGYA 3KRWA 3ODYX 5EW3A 3W55A 3QGWA 4MXOA 4DHFA 1YWVA 2XCHA 3D83A 3FSFA 4IAIA 4ZZMA 2IPXA 4D9TA 3MH2A 3DLZA 2Z7LA 3C1XA 5BVDA 4TKSA 4ACHA 4GG5A 4J52A 5KMMA 4RJ3A 3NR9A 3O17A 4C33A 3UIXA 5HHWA 4D2VA 2FSTX 3KXZA 5IQEA 4UMTA 4H05A 3LXNA 3B2WA 4R3CA 3QAME 3V5TA 5HD4A 3AC4A 3VS1A 3UZRA 2WAJA 2Y8OA 4B99A 4YURA 3DKFA 3FLSA 2GTMA 3ORLA 2O8YA 3FI2A 3S1HA 2WMQA 2E9NA 2IW6A 1YWNA 3FL4A 5AV1A 3RI1A 3TEIA 3UIBA 3C4XA 2WOUA 2WFYA 3DB6A 4G1WA 4TZRA 2BCJA 5HCZA 5J8IA 5CSPA 3UPXA 4QP2A 5AP0A 3ZUTA 3GUBA 4AT5A 2GFCA 5L2WA 5LOHA 2PVHA 3KN5A 1H1SA 5FBNC 4HVSA 1O6KA 4QMQA 2NPQA 5AX9A 5M55A 5AA8A 3M1SA 1PXJA 3OCBA 1H00A 4ENXA 5DR6A 5LVOA 2XEYA 1E9HA 1XHAA 4WT6A 4ZTQA 2XB7A 4TXCA 4HCTA 4LV5A 4DFYA 3DA6A 4GSBA 2WELA 3NS9A 4MWHA 3P9JA 3I7CA 4JQ8A 4ASZA 1ZYJA 2ITWA 3OOGA 1ZZ2A 4RFMA 4A9TA 3BYOA 1SVHA 1ZMUA 3FQHA 3G6GA 4ASEA 4KAOA 4MXAA 4O7WA 2I6LA 2YA9A 2JDOA 4NFMA 2WIPA 4CFUA 5KKRC 4BBFA 3PPZA 4AX8A 2J6MA 1QL6A 4NCTA 2GNGA 3WBLA 2W96B 5L2TA 2HK5A 3O50A 4MXYA 4ACGA 5JGBA 4NKSA 1FGKA 2QU5A 2B53A 2C4GA 3TV7A 3FMMA 4ERWA 5EM7A 4A4XA 4MWIA 5CYIA 5HKMA 2I1MA 4D5KA 4XMOA 2QQ7A 4JI9A 5F1ZA 3HV4A 1XH8A 5F9EA 4C4HA 4ZLZA 1UVRA 4IX6A 4C4IA 4KSPA 4MF0A 4L42A 2XKDA 3FKOA 3AC1A 1U4DA 4ZSAA 3QWJA 4IDTA 4EOIA 3PXRA 4FGBA 4L68A 3LPBA 2YJSA 2QHNA 3I6UA 4WRGA 3WZUA 3GC8A 3BGQA 1PXIA 3VBYA 4E7WA 3PLSA 3PA5A 2WNTA 1YXUA 4OTHA 3PRIA 4C4EA 3PA4A 4CT1A 4RVMA 2ACXA 2NRUA 4AZEA 5EH0A 5F94A 2BFYA 3VAPA 3CY3A 1FOTA 3KF7A 3PSCA 4I94A 1SVGA 4ITHA 3JVRA 1OI9A 4FV4A 1SYKA 4BIEA 1KSWA 2R3RA 3FPMA 3O51A 4BDFA 4EH6A 2UZNA 2J2IB 4B4LA 3FHRA 3PJ2A 3V51A 4ITJA 3W2QA 3LM0A 5LXMA 2BPMA 2GU8A 3D5WA 5CT7A 3T9TA 4RIWA 5IQGA 5FQDC 3HLLA 5EI6A 4NUSA 2X6EA 4L7SA 4CFNA 2UW9A 1JQHA 2Q0BA 3II5A 4FT7A 4KIKB 5LMAA 4EOMA 4NFNA 3E87A 3KFAA 4GS6A 1NXKA 4ITIA 3RZFA 4PRJA 4BICA 4YJVA 4DINA 4R1VA 4Z7GA 1U54B 4CYJA 4WNPA 2BZJA 5I4NA 4K1BA 3OUNB 4ACMA 3C4WA 2FSLX 3TZMA 4D55A 3PY1A 3SG8A 1CKPA 4FV9A 4O0SA 3OC1A 3F3TA 4FKRA 2OJ9A 3VF8A 4BRXA 2YZLA 4BTMA 3OWLA 3Q2JA 2GQRA 5M53A 4YJQA 4BDKA 1U5QA 3QBNA 2YABA 4YTHA 1XH9A 5HCYA 3UNJA 4D1XA 1PXOA 2WIHA 4FT0A 5AP7A 5FXQA 4GK3A 3SAYA 4UV0A 4BDHA 5EM5A 3LFBA 4ID7A 2WEIA 4ZZNA 3CS9A 4M14A 5AV4A 2C3IB 5HCXA 1WCCA 3C4CA 3OUKA 3SXFA 2GPHA 4HVHA 1JSVA 5CF6A 4Q2AA 5J7HA 4CG9A 3QRTA 5FG8A 3UODA 4IZ5A 5HICA 4NW5A 4FEUA 3P1AA 4ANOA 4BIDA 4DYMA 4FTMA 1G8SA 2XK3A 3Q4TA 5KCVA 1Q8ZA 3VJOA 5HI2A 4ZXTA 4EQCA 2WPAA 5IA3A 4S32A 4S2ZA 2OFUA 4IB5A 5JQ8A 5ETAA 2V7OA 2YM5A 5M09A 2PVLA 3TJCA 1JKTA 4IAZA 3IDPA 2PE0A 4C59A 4XV3A 4AW0A 5CNOA 3LQ5A 5AUWA 5FRIA 2YWVA 2CLQA 5J1VA 2OH0E 2BUJA 3QQKA 5AM6A 3BLQA 4DFBA 1WBNA 4BR3A 1BX6A 3NSZA 4QQJA 1J1CA 3ZTXA 5CF5A 4FEXA 2RFEA 3QQJA 4O81A 3SOAA 1PMUA 4EBVA 4AE9A 4BDEA 4NJDA 3Q6WA 3HRFA 3RWQA 3MH3A 3PY0A 3SW4A 3COKA 5FDXA 3D7ZA 3RPYA 3HDMA 1MRYA 3ROYA 4AW5A 1P14A 4WOVA 4BYIA 2F9GA 3QHRA 3GBZA 4H39A 2XIRA 2XNOA 4Y73A 4C58A 2QOKA 1CKJA 4I21A 4KSQA 4TYHA 3FKNA 4UZDA 4DGGA 2PUIA 4IB1A 4RT7A 3WE4A 4C38A 4UMRA 3MW1A 2J0KA 3K3JA 2IJMA 5HG9A 4CEGA 4L00A 4U0IA 3WZEA 4J98A 4TY1A 4G9RA 4WSYA 4H1JA 4ZTNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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