3ATVA

Crystal structure of human hsp70 nbd in the adp-bound and mg ion-free state
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
380
structure length
380
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A/1B
publication title Biochemical and structural studies on the high affinity of Hsp70 for ADP.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 380
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3atvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3atvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3atvA04
4XH5A 5AQVA 4M7YA 4M63C 2F9WA 2NRHA 1U2VB 4IZ9A 3KVGA 3QICA 3UKRB 4DB3A 4H0YB 5E84A 3D2FB 2P9LB 5EX5A 3A5MC 2V51B 4BR2A 3GG4A 3LM2A 1DKGD 4ISGA 4FWLA 1LOTB 4BRPA 1XUPO 1NGIA 2CGLA 4YDUC 5AQYA 4H5RA 1QZ6A 2QWQA 3BEXA 5EY4A 1T6DA 2E1YA 3SMSA 3ULEA 1ATNA 2FLOA 2ASPA 2OANA 3CETA 5AQNA 2I7PA 3RSEA 3A5LC 1S3XA 2P9NB 5JLFA 5KQ8A 1TUUA 3LDQA 4XEIA 4FOIA 5TKYA 3ZX2A 4CBXA 2ZGYA 4BROA 2GWJA 3UKUB 2FSKA 3MMVA 2NZTA 5AQXA 5AQRA 4GNIA 2IIRA 1ZC6A 2D0OA 1P8ZA 4JN4A 3O6WA 4FWQA 4K42A 1NBWA 1MWKA 5AQWA 3BF1A 3U9ZA 3DJCA 4WQ4C 2P9PA 2VCPA 3SMPA 2UYTA 2EWSA 2E2OA 2NLXA 4CZEA 1G99A 2HMPA 1XQSC 5AQMA 4H5NA 4BR5A 1BOTO 2A42A 2FSJA 2HF4A 3BF3A 3ULEB 5AQPA 4O5FA 1ZBSA 4BR4A 3RSEB 4EHUA 4JD2B 4WQ5C 1HUXA 4BVOA 1HPMA 3O1WA 4FOEA 4CZGA 2ZGZA 3WUHA 3FGUA 1Z05A 3L6QA 4O8KA 1NGHA 4YDUA 1BDGA 5AQKA 3FE1A 3H46O 3IDHA 1KAXA 1T6CA 2BTFA 3MN7A 3VEXA 2IVNA 2CGKA 4XH1A 2V7ZA 1V4TA 2I7NA 3CJ7A 3DAWA 3LDOA 1BG3A 3A8YA 3A5OC 4CZFA 3IMXA 4BC2A 4H0TB 1U6ZA 2P9SA 4JAXA 4DHYA 3GBTA 4CBUA 5AQIA 2GUPA 3LDNA 1DGKN 3M1FA 4PL8A 4FPAA 4BREA 4A61A 3MN5A 1JCFA 1J6ZA 1YUWA 1MA9B 3OHRA 1WUAA 4FSVA 1RGIA 3HBTA 4WYBA 2AA4A 3ZX0A 3DXMA 4BG8A 3QB0A 1BWFO 3AAPA 4L3QA 2P9IA 4IO8A 4BG9A 4Z94A 3QBWA 1Z6RA 2ZWHA 2Q1NA 5LJVA 2QM1A 1ZXOA 1HJOA 3M6GA 1BO5O 2YJFA 3SK3A 3VESA 5LY3A 3B8AX 2FF6A 2QWMA 1JCGA 3LM9A 3R6MA 3CHWA 3FR0A 2P9SB 4CD3A 3H6EA 1QZ5A 2QXLA 1GLFO 4H5WA 1NGAA 1SZ2A 1NMDA 1NGJA 1GLCG 2E1ZA 3VEYA 3WT0A 4FO0A 4MLEA 3SJHA 2CGJA 1X9JA 1NGEA 3HTVA 3BP8A 1TYQA 3CQYA 3WXJA 1TUYA 3CIPA 4BRMA 4BRNA 2FXUA 2D4WA 2P9UA 3R8EA 4BGAA 3H3OB 2YCHA 3ZEUA 5KPTA 4BRKA 5B8HA 5AFUH 1NLVA 4GY2B 5AQQA 3CJ1A 5EXWA 3AARA 3VENA 5BN8A 4QS8A 3AY9A 3QMLA 5FPNA 4FWPA 3MN9A 3H45C 5AZJA 3O8MA 3CI5A 5KPZA 2GEMA 3VEWA 4B1UB 4BC3A 1SAZA 2CH6A 3WXLA 5JMVA 3I33A 4H0PA 2WUSA 5AQOA 1KAYA 1YXQA 3FZKA 3FZHA 2A6AA 3LDLA 2VWBA 3QBXA 3VEVA 3C7NA 2A3ZA 3BUZB 1IJJA 3L4IA 2PAVA 2FF3B 4BRAA 3GE1A 3EZWA 3SLCA 4IJAA 4B1VA 2GTDA 5BPNA 3VETA 4FWMA 2IVPA 2A40A 2GWKA 3O08A 3ZETA 3CJBA 4CZJA 3ENHA 2F9TA 5AZJB 4MO4A 4KBOA 3O5BA 3WEEA 1C0FA 2IVOA 3DXKA 5BRHA 1ATRA 4C23A 4NO7A 5BPMA 3G25A 5ADXH 2Q2RA 2Q36A 4QS7A 4FWOA 2D0PA 4BQZA 5AQHA 5AQZA 3FFKB 3CJCA 1NGFA 2E8AA 3WXKA 1YVNA 2P9PB 5FPEA 4RCHA 3D2EA 4PKGA 1RFQA 3WQUA 3L0QA 2Q0UA 3WQTA 3DWLA 2QWRA 4EHTA 2HOEA 3VPZA 2QWOA 3VEZA 4BGBA 4CD1A 2V52B 3A5NC 3ID8A 4FWNA 3ZETB 4K41A 3U8XA 1T44A 4HTLA 1OKJA 4LC9B 4BRDA 4WQ4A 1D4XA 5AQUA 5BN9A 5ADXA 2ZF5O 2A5XA 4CZIA 5EVZA 3H3NO 4AM7A 3FLCO 4H0VB 5AR0A 1BUPA 4FL9A 3JS6A 3FZFA 4H5TA 5AQJA 5JLHA 2P9KA 4H03B 4WQ5A 2YHXA 1Q18A 4A2BA 5AQTA 3O4WA 3W0LA 5AQFA 4CI6A 1YAGA 1U2VA 3VEOA 2Q97A 4IJNA 4DQ8A 1S22A 3EKUA 3LDPA 3UKRA 3O80A 3CJAA 4ISEA 3D2FA 2P9LA 3UE5A 1QQNA 5F0XA 1X3NA 4BRIA 2E2PA 1BA1A 3W3DA 3MK6A 3ATVA 4B1WB 2CH5A 3VOVA 3DXMB 3MN6A 2VYPA 5BRDA 2A41A 4BRGA 3FZLA 4CZLA 1NGBA 1MDUB 2P9IB 4PKHA 5JICA 4A62A 1GLEG 4E1JA 4FPBA 4M7XA 4BRQA 3QDKA 1GLBG 1NWKA 3ENOA 3UKUA 2P9KB 3M3ZA 5FPDA 2ITMA 1SQKA 3GOIA 1HX1A 4CZMA 2ASMA 3CJ9A 4I6MA 4FWSA 3R9PA 3VF4A 4B1ZA 2W40A 2QWPA 3J8AA 4DCHA 4EIAA 4CZKA 5BREA 1HKGA 3A0IX 5KPRA 5KQDA 1NM1A 2QW9A 3CERA 1TYQB 1CZAN 3EN9A 3GL1A 2D1KA 2E88A 2V7YA 3U4LA 3D7EO 4IXCA 1QQOA 2KHOA 4JD2A 2H3GX 4B1YB 5AFUA 2P9UB 3C0BA 4H0XB 3VERA 4BRFA 3VF6A 3VGKA 3TU5A 5F2RA 1WOQA 3ZEUB 1ESVA 4CJ7A 2Q31A 1K8KA 4H5VA 1ATSA 4BRHA 3H1VX 4BC4A 1BU6O 5BR9A 1NGCA 2J4RA 1QQMA 4I6MB 5CE3A 4FWKA 3S41A 4AM6A 3HI0A 5EOYA 1X3MA 1MWMA 2ASOA 1Y64A 4BRCA 4IWVA 3IFRA 4B1XB 1BA0A 4RTFD 4F9OA 3KHYA 1E4GT 3QFPA 2E2QA 4BVPA 5F1XA 1JCEA 4K25A 3KZBA 3C7NB 5AQGA 2YHYA 4MLHA 2QWNA 1HLUA 3EL2A 2HF3A 3WXIA 1E4FT 5ELZA 1GLLO 2YHWA 3I8BA 3EKSA 1R59O 1K8KB 3EO3A 3LL3A 4J8FA 4MO5A 3VGLA 1HKBA 3H1QA 2AP1A 3HZ6A 4PL7A 2W41A 3MCPA 1EQYA 2PBDA 3MDQA 4JHDA 5I9EB 3ATUA 1HKCA 4H0OA 3TPQA 4RWTA 2YJEA 1IG8A 2FSNA 3JXUA 1NGGA 2QWLA 3WEEB 3DXKB 1QHAA 1RDWX 2GELA 3CQXA 3AAQA 5LJWA 4A2AA 5AZIA 5FPMA 4XH4A 3UB5A 5AQLA 2E2NA 4QS9A 4BQLA 3U9DA 4EFHA 4BR7A 4Y0WA 5BPLA 2DPNA 4JNEA 4BR9A 4EAHD 3D2EB 1XC3A 3F9MA 4HWIA 2BUPA 3VGMA 4B9QA 2E20A 4BC5A 1KAZA 3O1BA 4PKIA 2YI1A 4JHDB 1LCUA 3GDQA 1DEJA 2Q0RA 3FZMA 5AQSA 5E26A 1GLJO 3IUCA 4NB4A 3QFUA 1H1VA 4ISFA 3P4IA 3VF2A 3HM8A 5AZIB 4BRLA 5BRFA 2P9NA 4BR0A 1NGDA 1KXPA 4K43A 1C0GA 4CZHA 1GLAG 4FWRA 3ZX3A 1V4SA 3HSCA 1GLDG 4CBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XH5A 4DLGA 4M63C 4OPAA 3M8QA 1KRPA 2NRHA 3BDPA 4GVMA 1D9FA 1NK4A 3QICA 3UKRB 1VSKA 4DB3A 3A5MC 3VA0A 3OYGA 1DKGD 4ISGA 1NK0A 4FWLA 3H08A 2YHBA 3ISNC 5JVGL 3L2VA 4HUGA 1ILYA 1TKDA 5AQYA 4DR4K 1QZ6A 1YJ9N 1I3AA 3SMSA 5AQNA 2OPPA 4O8UA 1TUUA 3LDQA 4CBXA 2ZGYA 4CGHA 4BROA 3G10A 2IIRA 1EXQA 3VQ6A 1NKEA 3MWPA 2XY6A 1P8ZA 4YOWA 4B9MA 4FWQA 3ZSWA 1KSPA 4JS4A 3U3YA 5AQWA 3U9ZA 3AO5A 3RTVA 3THYB 2RHKA 3DJCA 4WQ4C 2P9PA 4EZ6A 4H4MA 2HVHA 2G8VA 2ASCA 4ZTFA 2HHHK 4IEIA 2NLXA 1VRUA 4DSEA 4BR5A 2HF4A 2E6LA 2Z1GA 2KZMA 3VQBA 4EZ9A 3L3UA 1NK8A 2VWKA 3C6AA 3I56N 4BVOA 4CF0A 4B3MK 3L6QA 1EX4A 5HRSA 4M42A 3IDHA 3MN7A 5FROA 3KOXA 2BTFA 3VEXA 1HR0K 4JI8K 4IDHA 4E0DA 4XH1A 2V7ZA 3CJ7A 2I7NA 3DAWA 1BG3A 3RR7A 4FZZA 4CZFA 2DY4A 4BC2A 4H0TB 1U6ZA 2P9SA 3QNNA 3CW4A 5AQIA 2YEOA 1ZFUA 1YJWN 1XRSB 4DV4K 1TVRA 4BREA 1D5AA 1LAVA 2XRIA 1J6ZA 1VSIA 3MXMA 4FSVA 4JI5K 3HBTA 4CJVA 5SWMA 3ZX0A 2UXDK 3I55N 3DXMA 3WXMB 1XHXA 1VQLN 3QB0A 1BWFO 1SUQA 3AAPA 2P9IA 2HHIA 3MXIA 4JKHA 1C6VA 2Q1NA 2W6LA 1ZXOA 1HJOA 1NJWA 3SPYA 4M41A 4UY8O 3VQ4A 4DR7K 2HHUA 4Y1CA 5CR4A 4LF5K 2DTUA 3M8PA 2QWMA 4NYFA 3LM9A 2BH1A 1VQNN 4CD3A 1RTJA 1SS6A 2PFUA 1GLFO 4H5WA 1SZ2A 3V4IA 5A2QO 4W5OA 1VQ9N 4JKFA 2E1ZA 1SKSA 4PWDA 2O8BA 4FO0A 4MLEA 1WMTA 1ICAA 3HTVA 4JI4K 3HT3A 4B3TK 1GOAA 3CQYA 3WXJA 1TUYA 4CHQA 2O8EA 4GV3A 4BRMA 4BRNA 4DS4A 3SAHA 1T3VA 3LAKA 1NG9A 1EO1A 4CGIA 2D4WA 2YCHA 3WNHA 1SL0A 1JZAA 3SYZA 2VG6A 4K8ZA 1NLVA 3CPEA 3CCUN 1VQMN 1KCFA 3BZCA 3VENA 4QS8A 2C1IA 5K14A 2NRWA 1U04A 4KREA 1XWLA 2GEMA 4B1UB 4BC3A 4KI6A 1VQPN 3V1OA 4O0IA 5JVHL 1SAZA 5JMVA 3I33A 1BIUA 3AA2A 3L2QA 4B9VA 3PX6A 3T1HK 2WUSA 3SUNA 5AQOA 3ID6A 4BWMA 4CJEA 1S1TA 1KLNA 3ZT4A 2GMOA 1BISA 2VWBA 2A6AA 2M8BB 1S1VA 3N4QA 2HSTA 4LSNA 5FDLA 4OPKA 1FH3A 2DFFA 1SL2A 3EZWA 3OS0A 3NE6A 3NF6A 1YHQN 5GIPA 2NY8X 3ZSRA 5BPNA 3U6FA 2ATQA 2A40A 1XC9A 2GWKA 3TSQA 3ENHA 1FJGK 4CJFA 2ITGA 2IVOA 5BRHA 4CK2A 2UXBK 1LW0A 4JKGA 3KK7A 1ATRA 3HVRA 3G25A 1JLAA 2NRVA 4RW4A 4QS7A 4BE2A 1RILA 3TI0A 1Y97A 3DI6A 2D0PA 1AYJA 3RMCA 3RRGA 4IOXA 1P0AA 4MDBA 4ZHRA 2F8SA 3R1XA 2NY9X 3D2EA 4PKGA 2Q0UA 3ZSQA 1ZUTA 2MBKA 3THXA 3E7RL 3VPZA 4X64K 2QWOA 3OYDA 4DUZK 3ZETB 2UUBK 1QS4A 5GINA 4LC9B 1N33K 2A5XA 4CZIA 2KYQA 4H0VB 5AR0A 3LWMA 2HVIA 4CJRA 4W5TA 3TAMA 4B08A 2JWLA 2E3GA 4H5TA 5AQJA 1CZBA 1S9EA 3KP0A 1Q18A 4AHCA 4A2BA 5HRRA 1ZYQA 3O4WA 4M3TA 4CIEA 4YOXA 1U45A 4CI6A 3AV9A 4DR6K 3UKRA 3O80A 3E9LA 4CEAA 2Y1JA 3J7AP 5F0XA 1BI4B 4F3TA 4BRIA 2E2PA 3RMBA 4Y1DA 3CFPA 3SQ0A 4U7BA 3VOVA 3TAPA 2VYPA 2ZQBA 1CHZA 2JDQD 1ASVA 4LD0A 1NGBA 5KTQA 3CCVN 4B3SK 4M7XA 4FVMA 1VQ7N 4RW6A 5FRMA 3KC6A 1YIJN 4O0JA 5DM6L 5FPDA 2ITMA 3KOWA 4GVEA 4CQKA 4BE1A 4KRFA 2ASMA 4I6MA 3R9PA 3HXMA 4B1ZA 3KTQA 4I9QA 1W9HA 4QAGA 2QWPA 4WFNL 2FBXA 3THYA 1SKWA 4BDZA 1JLCA 1HKGA 2WBNA 4FJKA 2FBVA 4CHNA 3CERA 1CZAN 4CGGA 3GL1A 2D1KA 2C1GA 2E88A 2V7YA 3U4LA 1QE1A 3K0SA 4IXCA 4DTOA 3TANA 4B1YB 2P9UB 4H0XB 5AJ3K 3VF6A 1ESVA 3E7UX 1RBUA 1ATSA 4CF1A 2G8UA 2B5JA 4JKBA 4CJUA 5CE3A 4FWKA 3S41A 4AM6A 3RR8A 3PSFA 4KTWA 3HI0A 3K57A 1Y64A 2UUAK 2VG5A 4FJIA 3O3HA 2A1SA 4F9OA 1E4GT 3QFPA 4TSXA 4BVPA 4QCLA 2HNDA 2VG7A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XH5 A;  4DLG A;  4M63 C;  4OPA A;  3M8Q A;  1KRP A;  2NRH A;  3BDP A;  4GVM A;  1D9F A;  1NK4 A;  3QIC A;  3UKR B;  1VSK A;  4DB3 A;  3A5M C;  3VA0 A;  3OYG A;  1DKG D;  4ISG A;  1NK0 A;  4FWL A;  3H08 A;  2YHB A;  3ISN C;  5JVG L;  3L2V A;  4HUG A;  1ILY A;  1TKD A;  5AQY A;  4DR4 K;  1QZ6 A;  1YJ9 N;  1I3A A;  3SMS A;  5AQN A;  2OPP A;  4O8U A;  1TUU A;  3LDQ A;  4CBX A;  2ZGY A;  4CGH A;  4BRO A;  3G10 A;  2IIR A;  1EXQ A;  3VQ6 A;  1NKE A;  3MWP A;  2XY6 A;  1P8Z A;  4YOW A;  4B9M A;  4FWQ A;  3ZSW A;  1KSP A;  4JS4 A;  3U3Y A;  5AQW A;  3U9Z A;  3AO5 A;  3RTV A;  3THY B;  2RHK A;  3DJC A;  4WQ4 C;  2P9P A;  4EZ6 A;  4H4M A;  2HVH A;  2G8V A;  2ASC A;  4ZTF A;  2HHH K;  4IEI A;  2NLX A;  1VRU A;  4DSE A;  4BR5 A;  2HF4 A;  2E6L A;  2Z1G A;  2KZM A;  3VQB A;  4EZ9 A;  3L3U A;  1NK8 A;  2VWK A;  3C6A A;  3I56 N;  4BVO A;  4CF0 A;  4B3M K;  3L6Q A;  1EX4 A;  5HRS A;  4M42 A;  3IDH A;  3MN7 A;  5FRO A;  3KOX A;  2BTF A;  3VEX A;  1HR0 K;  4JI8 K;  4IDH A;  4E0D A;  4XH1 A;  2V7Z A;  3CJ7 A; 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