3ATZA

Crystal structure of tcoye with phba
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
373
structure length
368
Chain Sequence
FPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDDHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRDGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQQNWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Prostaglandin F2a synthase
publication title Structural insight into the stereoselective production of PGF2(alpha) by Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 133
structure length 368
sequence length 373
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3atzA00
3EWUA 2OCZA 1EUAA 1JCNA 1B4EA 3LTPA 4IX0A 1UUMA 4X22A 2CLMA 2H8XA 1TYGA 1TV5A 3R89A 5FF4A 3OA3A 1HG3A 1WA3A 2ZDRA 3BGJA 5H2ZA 5DLCA 4WJEA 2WPBA 1RR2A 4LUJA 5D05A 2DORA 3LBMA 4OQVA 4NUWA 3IIXA 3HQ1A 5BOOA 1E51A 3JS3A 4O1AA 1LBLA 1XBXA 3DU0A 4UTWA 2F84A 1OX6A 3BG5A 4UXDA 1A5AA 3FS2A 1JJKA 4M19A 1YXYA 1VCFA 3HG5A 3S5YA 4B5NA 5FEPA 4QNEA 3W83A 4IXHA 4PEKA 1FDJA 4CNPA 3UWUA 5CPLA 2E6YA 3CLMA 3TSDA 2X30A 3CC1A 2KZHA 5HNRA 3LCLA 3M5VA 3G1DA 2GQAA 1K02A 3W71A 4WOZA 2BSLA 4N4PA 4YWIA 2CZFA 5TQLA 1K7FA 3OBKA 2C1HA 2Y85A 4K8HA 2F7FA 2JGQA 3W7NA 2VENA 4MY1A 2XN2A 2TMDA 1Q45A 4JTSA 4MYXA 3H55A 5BMWA 3A5FA 3HOJA 2IQTA 3TMLA 4QITA 3UY7A 4E38A 1FBAA 1WBHA 1I2QA 2YR1A 3B0PA 4LVBA 4IMCA 2Y61A 1JCYA 3PB0A 4NVTA 1GJPA 1IXNA 2A6LA 4N02A 4LV4A 4ZQMA 2RKXA 4GE8A 4MFEA 2A6NA 1YPFA 2E09A 5K4ZA 2Y62A 1FDYA 4MY8A 5L6UA 3W72A 1S5WA 1V7YA 1FUYA 4OHQA 3PF3A 4FNQA 3DHDA 3W7QA 1QOPA 4BI5A 1H7PA 1QOQA 4JTIA 2CFFA 4GWEA 1G69A 4KFPA 2WKJA 4BFAA 4AB4A 2ATSA 4HKPA 3EXSA 3O63A 3FFSA 2NUXA 1XBVA 1YTDA 3GKAA 3S5OA 3TW7A 3W07A 1O95A 3MBDA 2G97A 1Y0EA 4UTKA 1EA0A 2QUVA 3O1NA 3SR7A 3ABRA 1KV5A 2X1UA 5D03A 5EPDA 3PS7A 1SQ7A 5D30A 4LC8A 4MJMA 4YMZA 3TSBA 4NXSA 4LWWA 4CQAA 1IF2A 2PE4A 4JEQA 4H3DA 3NL2A 3A22A 4XKYA 1IXQA 3NQCA 2FLIA 4NNCA 5F2MA 5AYYA 4JGDA 4IX2A 3ZWSA 1JULA 4ZQPA 2Y7FA 5E1QA 4LVAA 3TSMA 3P82A 2ABBA 1VCGA 3GVGA 1H7OA 5G2IA 3W2JA 4UFJA 1RQEA 1YXCA 1XFBA 5DCEA 4AF0B 2YPIA 1LM1A 1P1XA 3G8RA 3NQ7A 1DJNA 1TQJA 1A5SA 1SFLA 3TR2A 2EAWA 1LOQA 4UR7A 4DPPA 1QDSA 1GWJA 1X6UA 3BLIA 3GR8A 3C61A 3T78A 2W6RA 5E93A 4A2RA 4O15A 1V5XA 3KVMA 5KZDA 1F5ZA 1L6WA 3S1XA 2V8ZA 3BPWA 2A21A 3N2XA 3W1MA 4PFMA 4HNNA 3NR0A 1TREA 3W2NA 1I45A 1ZAIA 1YTKA 5BNKA 4ZQCA 3EWYA 4PC8A 4X2RA 4Z0JA 4K39A 1OG0A 3UWYA 3G22A 1PIIA 3M43A 4Z0SA 3DGRA 4MIMA 3IIOA 3W7RA 2J9YA 4FB7A 3KHJA 3EWXA 3L65A 4LVFA 3LRKA 4WXYA 1GVFA 3V75A 2YW4A 3L0GA 2E5CA 3LHUA 4Y9AA 1HO1A 3NAVA 3IVUA 2AAMA 2VELA 4M7TA 3GXNA 2DZPA 2ZQ0A 3U2OA 4QNWA 3KVJA 5C55A 4UTLA 2DZXA 1IIHA 3O05A 3GXTA 3W86A 3CB8A 4IMDA 3STGA 4QAIA 4FIQA 3RU6A 3W1RA 5BMXA 1P4CA 3HGSA 4JTKA 3TC7A 1EP1A 1AW1A 1SZGA 1TIMA 1MEHA 4ADSA 1XXXA 3W85A 2VXNA 3STEA 3G8EA 3GXPA 1YPIA 4H6KA 3HPXA 3GLCA 5D2VA 3YPIA 3UY8A 1XBZA 3HIJA 2A85A 1UCWA 1OFAA 4BWLA 3N19B 4PA8A 3OG3A 1LP6A 4CQ8A 1KM5A 3OHIA 4MJZA 2VEPA 4BF9A 4Q4KA 3U6WA 4R33A 1IIGA 3E12A 5BRBA 1G4SA 2C0AA 2R8WA 2BWGA 5E0KA 4XQ6A 3I68A 1NEYA 1EWEA 3QJAA 4O18A 3R8RA 1YYAA 3KOFA 1GVOA 5HMSA 3FKRA 4RLIA 3IV3A 3I6RA 1HUVA 2JBMA 3UPBA 4WZHA 2NWRA 2VFIA 5DCDA 3KVKA 1VPXA 3TE9A 3I7RA 3EKLA 2VC6A 3EXTA 4M6PA 5EA9A 1LZOA 1P5BA 1XUZA 3CWNA 1T96A 1GEQA 2YCEA 3MHFA 4GRSA 2PRMA 3O8AA 2E6AA 4Y8FA 4ALDA 4W9TA 3P8IA 3TQVA 3W7KA 4EF8A 4RCXA 5CSRA 2FB2A 2BLEA 3NPVA 3GDMA 3PBYA 3DFPA 2ABAA 2J88A 1WQ5A 2WNZA 1ME9A 5I3FA 3JRKA 4AHPA 3B03A 4R7JA 3NYZA 1ML1A 2QAPA 1VQTA 4OBTA 3WK2A 3N34A 1P0KA 2FFCA 3WJWA 1JCXA 1KBJA 2RDTA 1TPFA 1KFKA 1KM1A 4H4IA 3MP5A 4DELA 1OK4A 3TA6A 1H7WA 3UWZA 3G3DA 1K03A 1OK6A 3W7DA 1GOXA 1VYPX 3FIGA 3A21A 2Y7DA 3O15A 4K7YA 2GVJA 1SZNA 3TJXA 5FF7A 3NQDA 1AL7A 3EEGA 3NQ8A 3PUDA 3W2MA 5AHEA 2CLOA 2V82A 1JUEA 5CPNA 1XL9A 3M5YA 2OZ0A 4JTHA 1KTCA 1TSIA 1MEWA 1VYSX 4XBKA 1S3HA 5AC6A 3SY5A 1OYAA 2BXVA 3PAJA 3O6CA 3EWZA 3TAKA 3G24A 3KRUA 1HTIA 2ZZ4A 3TDFA 3M7WA 3QC3A 3HPSA 5DXXA 3NZRA 2EF9A 4J9JA 1Z42A 1W54A 1QMLA 2W0UA 4NJGA 2NUYA 1I8JA 3KFTA 3QSTA 1VHNA 2GQ8A 2ZRWA 1NF7A 2QR6A 4N6EA 4U28A 3NL5A 1C8VA 2HS8A 5DELA 3T7VA 3EX6A 3G1SA 5DBTA 3TIMA 2X1RA 3C2EA 3A9IA 1VYRA 4P61A 5LKYA 4QSHA 1T8XA 4UCGA 3O07A 1YLVA 4WD0A 2Y7EA 3INPA 2WSYA 3CWOX 3LXAA 2ZYFA 1XM3A 3N2MA 4NZFA 3AO0A 3UNDA 2Z6JA 2C3ZA 3CQ0A 5KMYA 4O0ZA 3G1VA 1JRBA 3GX9A 1JCMP 3TQKA 1VHCA 3WK0A 3TQ0A 1OFQA 5FF0A 1LROA 2WSQA 4KFNA 5CPOA 3KAOA 5CZJA 3NQ6A 2HMCA 2QUTA 2ZZ1A 2YW3A 2H90A 2G95A 2ZZ2A 4R53A 4UTIA 1G7VA 3CIXA 4NXKA 2ISVA 1T99A 4FNTA 4N9EA 1SW0A 2J9ZA 3L0KA 1BWLA 1VLWA 3HJZA 1W37A 1KM6A 3N14A 3TXZA 1KFBA 4XUGA 3UPWA 4DO4A 5HINA 2V5BA 1B57A 4Z1CA 4Y6GA 4D2JA 3K30A 1X7FA 3GKFA 4L4MA 1SUXA 4UFHA 3PUEA 4KKXA 4O1DA 4UNKA 1AMKA 4LS2A 2GJLA 3SECA 3B05A 2Y88A 3DKJA 3QRHA 1M7PA 4IWWA 5FEZA 5EMUA 4X3ZA 1AG1O 2GOUA 4YLWA 1QO5A 5A5WA 4Q32A 5LHEA 1VLIA 3DI0A 4E2DA 1FWWA 1XDLA 7TIMA 3BG9A 3S5NA 4Y96A 2DZVA 2B4GA 3TX9A 1FWNA 3ZWTA 2DZWA 1I2PA 3BW2A 4UIOA 4Z1BA 5F4WA 5FEXA 3DFOA 3W1NA 2O7SA 5I3IA 1NFBA 1RZMA 4RZ6A 1YADA 1TCDA 3NM1A 2B7QA 3MO7A 1QO2A 5G5IA 3EXRA 2B7NA 3QSRA 1EP3A 4GUGA 3UXDA 2J27A 1L6SA 1DQXA 2ZZ5A 1UJPA 4O52A 1B4KA 1OVDA 5DY3A 3DI1A 1OABA 1SO4A 4TMBA 4A22A 1HFBA 4ML9A 3O6DA 3VCRA 3DH7A 1KFEA 2C15A 4DBEA 1EEPA 4O10A 3IGUA 3G3MA 3N9RA 1H62A 2LLEA 1QFEA 1GG1A 2QF7A 4CCEA 5C54A 2FQIA 2TPSA 4AWUA 3BVJA 4JIPA 1PHWA 1ZENA 1P0NA 4HNTA 4MFDA 2DJXA 2PURA 4PCFA 2RH9A 3W6YA 1W8SA 2YDAA 1LLWA 3G1XA 3UWWA 3NVTA 4RK8A 2V81A 2FJKA 1AW5A 4WXZA 3LCGA 4XWUA 3B8DA 3IIVA 1H5YA 1ZAHA 3QPZA 1AW2A 4RXGA 1DORA 5AC8A 4RKAA 3LHYA 5TBOA 2NX3A 2QDHA 2R91A 1BKSA 3L67A 1G7UA 2WV8A 5BW6A 2X16A 3PWAA 3C0JA 3ELFA 3G1AA 3BLEA 3QQ0A 2W79A 3C52A 3QMTA 2RDUA 4X9SA 3RLVA 1EWDA 1RQBA 3ANYA 2QCLA 5F1VA 3G1FA 5GVJA 4IMGA 2ZZ6A 3S6DA 5K2ZA 4GUFA 4PL1A 1OFBA 5HULA 1QR7A 3W2UA 5KINA 4WOQA 1FCUA 6ALDA 1QAPA 3M47A 3NPUA 4OV4A 1NVMA 5F4SA 1O5XA 1G4PA 5F2GA 3MI2A 4UMBA 2CLFA 5DXYA 1K3UA 1DBTA 1PHQA 5I3HA 4BI7A 3NNTA 4DF2A 3HMJG 3DKLA 5AHNA 4FO4A 4Z08A 1OYCA 4M7SA 4EOUA 1SW3A 3OVRA 3RK8A 5G4WA 1DKWA 1UUOA 2CWNA 1DV7A 3GDKA 5KTLA 3P5ZA 3STCA 4O4WA 3PUOA 4JIQA 4C1LA 3HPZA 2OJPA 2NX1A 3LHWA 1EUNA 2A4AA 1W3NA 3DENA 3NQAA 2NWSA 1JQXA 3B0UX 1S5VA 4IPJA 3TNOA 3P67A 3W87A 4UC5A 3THAA 1GQNA 5D38A 2E5DA 1H61A 4JTTA 4O4VA 2QCFA 4JTJA 3STFA 4QQ3A 1LORA 4FNPA 4JX4A 3C4UA 3I7QA 4JS3A 3H54A 2ZA3A 5EYWA 4LUIA 1LTDA 5FESA 3LV5A 1F05A 4JYEA 3TMQA 2H8ZA 4P2VA 4MKNA 4WUIA 3S42A 1GZGA 1XC4A 1TPUA 3CU2A 4IJBA 5MHBA 1F7BA 2DJLA 5IBXC 4AAJA 4CQ9A 5D37A 5D2YA 3TK7A 2QCDB 4JTFA 3HG3A 2CZDA 4MLJA 4PODA 1LBFA 1TV8A 2Z2UA 2V0TA 1O94A 2YYUA 3GK0A 5AN7A 3IRDA 3Q37A 2NV2A 2ZRVA 4A2SA 1EB3A 1OJXA 3W70A 2BTMA 1M6JA 4O19A 1VRDA 5D02A 2JKPA 1OFPA 1QCWA 3LHTA 2Q3OA 2VFDA 2XN1A 1W0MA 4BI6A 1F2JA 3PVFA 3QMSA 3O16A 3PM6A 3FJ6A 3HGRA 1OYBA 2I1OA 2ZRYA 1ZCOA 1KA9F 1O4UA 3QPYA 1MXSA 3LDVA 2FTPA 1D9EA 2ALDA 3DXIA 3KVLA 4XBSA 1R2SA 1LRQA 3HO8A 4NZJA 3TKFA 4QIUA 8TIMA 1TQXA 4A21A 3NQGA 4WQ6A 3WJSA 4GNJA 4AEOA 5LNSA 1C9DA 2ZRXA 3AJXA 1EP2A 1IXOA 2BX7A 3HGOA 4NU7A 1ADOA 4K36A 3BARA 3EWBX 3W22A 3GAYA 1W5QA 1XCFA 1SO6A 4XKYB 1FWSA 4K7VA 1VC4A 5D33A 5HJLA 5I3KA 3F4NA 2BZNA 2CLIA 4JR5A 1R2RA 5I3JA 2RHGA 4OT7A 3DBPA 4ONVA 1H7RA 2QAFA 3CEUA 4RZ4A 5AHFA 5F2LA 3MP3A 1OF8A 4OGZA 3EKZA 3M44A 3Q58A 5FI8A 3RFAA 1ZAJA 1SZFA 1LYXA 4FX8A 3MP4A 2FIQA 5K9DA 3MBFA 4I7UA 4NX5A 3OVQA 1TTPA 1GPWA 3PB2A 3G1YA 3R2GA 1MSSA 1SFJA 3QZEA 3W73A 1GG0A 2QDGA 1TTJA 4IMFA 2DP3A 3RMJA 1X8FA 3DFSA 4DQWA 2R14A 3P7YA 5AYXA 4TX9A 3LTYA 1DVJA 2B7PA 3GAKA 1OX4A 2ATMA 1YDNA 4MLRA 3W1XA 1TPDA 1VR6A 4FIRA 4UFIA 2CZEA 2Y89A 1W5OA 3LI1A 3IGXA 3NG3A 2NXHA 3NM3A 3Q94A 4FNSA 3NZ1A 1UASA 3N3MA 2DZSA 1C29A 5I3GA 1M5WA 2Q8LA 4TMCA 1SZEA 2EKCA 1GTEA 1FWRA 2ZRUA 1KM3A 4JTLA 5HUOA 3TCEA 1F6KA 4LS0A 2RDWA 2Y70A 3LLFA 4N6FA 1TO3A 2QCNA 2B0MA 1VJIA 3ABQA 4LV9A 1ZJIA 3GB6A 4ADTA 4O12A 3QYQA 4G1KA 3RLUA 3RNDA 3A23A 1VS1A 2RFGA 2QJHA 1WAUA 4MZ8A 2GUUA 5CZSA 1KFCA 4ZL1A 1XKYA 3R12A 1BWKA 4WY0A 1ME8A 2CZ5A 2D73A 2Y7GA 3PC0A 3EWWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2A3L A;  3FAX A;  1EUA A;  1JCN A;  1MYR A;  1B4E A;  2XUC A;  3TTQ A;  4X22 A;  2CLM A;  4YYF A;  4C6N A;  1S39 A;  4B5W A;  2ZDR A;  3N2C A;  5H2Z A;  2DH2 A;  2JIW A;  2DOR A;  2FMN A;  3ORW A;  3CO8 A;  1Y5X A;  2PLK A;  4J4K A;  1E51 A;  3JS3 A;  4O1A A;  3S2L A;  3N3T A;  3RM8 A;  3FX4 A;  1A5O C;  1OX6 A;  1YE4 A;  4NAF A;  2DY3 A;  3FS2 A;  1JJK A;  2QQ6 A;  4MJ4 A;  5FEP A;  4AZC B;  1EBG A;  4H9T A;  2ZX6 A;  3DHU A;  4PEK A;  4DJF D;  3TA9 A;  2AOS A;  2VUY A;  1S1R A;  1QAS A;  3FA4 A;  4CNP A;  3BTN A;  1W9D M;  5CPL A;  3NSX A;  3TSD A;  2X30 A;  3CC1 A;  5HNR A;  3LCL A;  1T41 A;  3FCP A;  2BHZ A;  4WRH A;  2OEL A;  1UKS A;  4ZE5 A;  4YWI A;  1V0N A;  2GWG A;  4Z2K A;  1V3K A;  2GYI A;  1JZ6 A;  4IJR A;  4K8H A;  2JEQ A;  2F7F A;  2JGQ A;  2VX4 A;  1V4Y A;  1R38 A;  3LGG A;  4PCN A;  4CU8 A;  4LEF A;  4F3H A;  2FTW A;  3H55 A;  3HOJ A;  3BAX A;  4E38 A;  1FBA A;  3KP1 A;  1I2Q A;  2YR1 A;  4FXF A;  4CN1 A;  4LVB A;  4I6V A;  4IMC A;  4PMR A;  1F4H A;  1OGB A;  3W02 A;  4DJE D; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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