3AYR | Genus

Total Genus 142

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	142
sequence length	366
structure length	366
Chain Sequence	HHVDDDDKIRDISSKELIKEMNFGWNLGNTMDAQCIEYLNYEKDQTASETCWGNPKTTEDMFKVLIDNQFNVFRIPTTWSGHFGEAPDYKIDEKWLKRVHEVVDYPYKNGAFVILNLHHETWNHAFSETLDTAKEILEKIWSQIAEEFKDYDEHLIFEGLNEPRKNDTPVEWTGGDQEGWDAVNAMNAVFLKTVRSAGGNNPKRHLMIPPYAAACNENSFNNFIFPEDDDKVIASVHAYAPYNFALNNGEGAVDKFDAAGKRDLEWNINLMKKRFVDQGIPMILGEYGAMNRDNEEDRATWAEFYMEKVTAMGVPQIWWDNGVFEGTGERFGLLDRKNLKIVYPTIVAALQKGRGLEVNVVHAIEK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Endoglucanase
publication title	Substrate binding of a GH5 endoglucanase from the ruminal fungus Piromyces rhizinflata. pubmed doi rcsb
source organism	Piromyces rhizinflatus
total genus	142
structure length	366
sequence length	366
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2011-05-16

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3ayrA00

4QLKA 1UD3A 4JHOA 3BAIA 3RPMA 3WEOA 4D71A 1JXJA 1UD8A 1XD1A 3TOPA 2VT0A 3LMYA 2WCSA 3GM8A 3MMDA 4D6DA 2BXYA 1EO5A 3A6OA 4HMDA 1JZ3A 4QCEA 1Q6DA 5I23A 5I79A 4YPJA 1KR1A 3L4UA 1J9YA 2W63A 1J0JA 5CLWA 3U57A 4AD0A 5JUVA 2BFGA 2VI0A 5D9MA 5GNYA 3WBAA 2JALA 1C3FA 1VRXA 1UR8A 2Y8KA 3EDEA 3VD4A 1LL7A 4J7RA 3BAKA 3W0KA 4GIAA 3RO8A 4UQCA 1QI3A 1L0PA 5FCZA 1DP0A 3I3BA 4M24A 4JAWA 4P7NA 2W61A 1FA2A 5FD0A 3OLGA 1HP4A 4P8XA 5I78A 2QHAA 4L4PA 1U33A 2XM2A 1HJWA 3FAXA 3E1F1 3PBGA 4HZ7A 4WKHA 2GJXA 4XB3A 5DT5A 2VC9A 4BQ2A 4MAVA 2YKKA 5DO8A 1SFSA 3SCTA 2BXZA 3BCDA 4EKJA 1J0YA 1M53A 3THDA 2VRJA 2XFFA 4WKAA 4EK7A 4RE4A 5AY7A 2G3MA 4TX8A 4F8XA 3WSUA 3N11A 4HA1A 4ACZA 3FHAA 1TMQA 2ZX6A 5E0FA 3N15A 3GBDA 1HIZA 4AZHA 1KBKA 3AIUA 3RIKA 3SURA 3DYOA 2XM1A 1JNEA 3W24A 1EO7A 1CXIA 2JF6A 3PZMA 3RJYA 1UD4A 3VIOA 1W32A 1LL4A 5A94A 3FNDA 2J62A 3VX0A 2YBTA 4UOZA 2CHNA 3CHFA 1NP0A 4KMQA 1UD2A 4H04A 5E09A 2YLAA 5EBAA 3SUUA 2VRQA 2ZUTA 4W87A 2WKLA 3TONA 4TTGA 2V3GA 1NOFA 1R86A 3HU7A 4V2XA 1ZU8A 4S3KA 2ZX7A 2V3DA 1B31A 2WMHA 1EDTA 4NZCA 4AMCA 1CTNA 1QW9A 2VCAA 3FXYA 1E4MM 1E43A 3VMNA 4ATLA 1BG9A 1FOBA 5M5DA 3AI0A 2XIBA 2D0FA 2Z1SA 1BLIA 1C90A 4U31A 1ZBVA 3L2LA 3AZRA 4M56A 1WDQA 4MB1A 2DSVA 3AXXA 4AIOA 3B9EA 5KZ6A 3ZT6A 3VDBA 3AMKA 3AYSA 5A8QA 2VMFA 4MJ4A 4ZENA 2Y5EA 3APGA 6CGTA 4F66A 4IPLA 3VD3A 3WMSA 4H8HA 2VR4A 3T08A 4M82A 1GQKA 1WDRA 1ODZA 2WAGA 3AHZA 1VJSA 1CLXA 2J4GA 1E6RA 1JZ6A 4BQ4A 1V03A 1W3KA 3AIQA 2AMGA 3FHQA 2WCGA 4MB4A 4JFVA 1J12A 5A8PA 5CQ1A 2UWFA 3AMCA 1C92A 3W38A 1MW2A 1NWTA 3W6MA 2VX5A 3N1AA 4H2CA 4MNKA 4R27A 2J7FA 1PX8A 4BQ3A 2WXDM 3LPOA 1JD7A 3N9KA 2QLYA 5CPSA 1J01A 3VNZA 3PZVA 1DWJM 1V6WA 2G8ZA 6TAAA 1KR0A 4Q7NA 4AD4A 2IXVA 5FL0A 1ZJAA 5M03A 2J7DA 3VGEA 1HJQA 2FGZA 2ZE0A 3B8SA 1OCQA 2B31A 4BS0A 4EANA 3MUY1 4HU0A 1ZBWA 4UFLA 1M03A 3LPFA 1US3A 1LG1A 5GNZA 1FHLA 3II1A 4M80A 5CSYA 1S46A 4AD5A 4CD7A 2V3EA 1OGSA 1VEOA 5LYRA 4MB5A 3WF4A 4HOXA 2WMIB 3K4DA 2YJQA 4ATDA 4FLOA 4B3LA 1W1VA 2D24A 3VDHA 2DQXA 2X2YA 5DF0A 4W8AA 1E5JA 2A3HA 1WP6A 3OA5A 2WMJA 4JFUA 5E70A 1UG6A 2GJPA 3GXDA 4W7UA 4GO9A 2X0HA 4CU8A 3VIPA 3A3HA 3BAYA 2V3FA 3TTSA 3KL5A 2WSPA 1GQIA 1K9FA 1C93A 4D6IA 1UOKA 1BTCA 5FOOA 4R5EA 3QHNA 1JZ5A 3WDIA 3WMCA 1YQ2A 2WLYA 3NIYA 4JFWA 1WO2A 3QOMA 1BFNA 3AIVA 4TVCA 4LXFA 1NOWA 2EEXA 1WPCA 3CHCA 3FY1A 2D0GA 1NARA 1E40A 1WDPA 2EJ1A 2VZTA 2YA1A 4GI9A 4FF5A 4DUXA 1H49A 2E4TA 3BLPX 2QPSA 1MQPA 1GHSA 4GPNA 1V0MA 3MV11 1XH2A 2OLHA 3W53A 2DT1A 5C8BB 1JZ8A 1V6YA 4AY1A 2C7FA 1XCWA 3VD7A 4IPNB 4PMXA 2ZXDA 1BSIA 1WE5A 1J18A 2VQTA 2A3EA 1ISVA 2XFYA 4PTMA 3T0DA 1GONA 1XCXA 1UH3A 1PX4A 2DT2A 2X09A 3AZSA 4JCMA 1ISXA 3VOCA 1QNPA 2VX7A 3WBEA 3SCNA 2O92A 2G3NA 2WBGA 5C70A 2J78A 2J47A 2J7EA 1XSIA 1BYAA 4GZJA 3AIEA 4W88A 4UOQA 1E6NA 2XVNA 1I1XA 4QP0A 2J74A 2XHYA 2WPGA 2JIEA 7TAAA 3VIIA 3VIGA 3AHTA 5DEZA 2GJXB 2J75A 1CGYA 3MMWA 1X1NA 1C8YA 3WELA 1VBRA 2OSWA 1TZ7A 3ALFA 2QMJA 3G6MA 1V3KA 5FL1A 3IJ7A 3ZJ8A 1CXFA 1HL9A 4JZ5A 4X0VA 2WKGA 5A1AA 1JF5A 4H7VA 1YHTA 3GNRA 3HMCA 2WHKA 4PTVA 4HA3A 3U5UA 4QDMA 4PEEA 3UR8A 4ACZB 2J7GA 4D6FA 2PWGA 3U7VA 2Q8XA 2DT0A 2CNCA 3K8KA 3AROA 4EAMA 3VDAA 1ZB5A 3VMPA 1AQHA 3BH4A 2GDUA 4WIWA 5E9AA 5I2UA 3WENA 1K9EA 5A6SA 1JYXA 1JZ4A 1OWQA 3QHMA 1UH2A 1WCGA 4ZE4A 2ZXBA 4AD3A 3QGVA 4UZSA 5A6KA 4NSBA 2QF8A 5DT7A 3BLKA 3T09A 1O6IA 4NI3A 2BNJA 4MADA 2YL9A 2ZOXA 4IISA 4JIEA 4A3YA 1PBGA 3CUHA 1BF2A 5BXSA 4J3WA 1E6SM 3CZJA 3F5LA 1CXEA 4J3XA 1R8LA 2FDMA 3N17A 4XV0A 3DHPA 4CVUA 3RM4A 4JFTA 1JFXA 1FH9A 1TG7A 4P7RA 2E0PA 3T0BA 5CLTA 2CYGA 2VX6A 1HJUA 4U3AA 2Y8VA 5A6BD 4AZIA 3ARZA 4HPHA 1BHGA 1UKTA 3OBAA 3UESA 2EPMX 1KQZA 5LA1A 2PB1A 4W5UA 4KRUA 1BYCA 5A95A 2AAAA 2WVVA 2YL8A 1EHNA 2BVDA 4M1RA 1XGZA 3W25A 1FH7A 1J11A 4PUDA 4AWEA 1E3ZA 2D1ZA 2D3LA 2JEQA 2PBGA 3PZIA 2C0HA 3OZOA 2PI6A 1B0IA 1QHPA 3PZTA 3WIJA 3WH6A 1KFWA 1UH4A 4UTFA 1B90A 3BAXA 2UY2A 3THCA 3SCRA 1XYZA 3AIBA 5CZKA 3WFZA 3TTYA 4TXEA 1JI2A 3OLIA 2GUYA 2J25A 1ISYA 1NH6A 1BG4A 1RP8A 2TAAA 1HNYA 3RM8A 3NDZA 1BAGA 1M7XA 1MXDA 1QI0A 3AS1A 4QCFA 1GOOA 3WUFA 4H8VA 2DH3A 1TR1A 1SMAA 3WDJA 1QHOA 4Z2JA 1EDGA 1HX0A 2WM0A 2PWDA 3TTOA 1CWYA 3CUGA 2VZOA 5A6JA 1JZ7A 4KGLA 3J7HA 4DM2A 4J3TA 2QMKA 2VTFA 3EDJA 3SCVA 3IAPA 5HOSA 1J0HA 1UR1A 4ATWA 1XD0A 4DM1A 5IXEA 5A6BA 1AMYA 2QPUA 1OB0A 1CBGA 1QOXA 1UYQA 4AZGA 5CSUA 3OIHA 5EB8A 2WHJA 1B3WA 4UQAA 3WNPA 4P8UA 3ARXA 1MFUA 3GTNA 2WVSA 2YLLA 1E5NA 2CBVA 4PMZA 1PX3A 3POCA 1V02A 3ZR5A 2E9BA 3OGSA 5BRPA 4WK9A 1PPIA 3SEPA 3VVGA 3AYRA 1E71M 5EFDA 1EIBA 2WMFA 1WZAA 1DEDA 1HJVA 5I5RA 1WB0A 4WSKA 3IANA 1BQCA 4PUEA 5A8NA 1NOUA 1KXVA 1RH9A 5CGTA 4EE9A 1E6ZA 5CPQA 3RMEA 2EPNA 2YL5A 3F4VA 1HVQA 1E6XM 3WF0A 3ZM8A 1NP2A 2DIEA 1RD6A 1Q4NX 5E6ZA 2ZWZA 1GNXA 1V08A 3SCQA 3ZT5A 3ARYA 3ZIZA 3BMVA 1CGUA 3VM7A 3CGTA 2OSXA 1ZBCA 1PZ3A 1H2JA 4ZFMA 1X6LA 1G5AA 2GSJA 3WQVA 3ZT7A 5EMYA 3SCWA 3AQUA 1W3LA 2HVMA 2GDVA 3UG4A 1WAWA 3CTTA 2ZWYA 1W9PA 1CZ1A 3GXMA 3L4WA 1NWSA 3A4XA 1QW8A 4PMOA 1H1NA 3VMOA 1W3JA 3OZPA 4U2YA 3W26A 2EPLX 3UEQA 2BV9A 3FAWA 1FHDA 4WSJA 2VL4A 1ZBKA 4MPKA 2XG9A 4PSRA 1W9XA 4CGTA 4RL3A 3CZLA 3UG5A 2O9PA 4F79A 2XIIA 8CGTA 2BHUA 2CXGA 1XSKA 3O9NA 4XZWA 5GNXA 3WQ5A 3L4YA 1LWHA 2WNWA 2WHMA 3K1DA 5HBFA 5IFTA 2XJ7A 4TOQA 3EDFA 1MW3A 4JCLA 1OSEA 4YHGA 4BF7A 4AC1X 2GJRA 2O9OA 2J8FA 1OD0A 3K8MA 1JNDA 1EGZA 4A4AA 2WBKA 4BA0A 5IDIA 4Z2LA 4W8BA 3WQ6A 4LGXA 2CETA 1D3CA 1UWIA 1B3ZA 4URIA 1JIBA 1W1TA 5JIPA 1GOMA 4UQ9A 3BXWA 3QHOA 3WL0A 1HL8A 2ZUUA 2GK1A 2PBOA 5CPTA 4D6HA 2YIHA 5A8OA 3MU7A 2YL6A 1JI1A 1H0IA 4KGJA 5JIWA 1VFMA 1H41A 1V6UA 1V3LA 1HVXA 5BXTA 5ECUA 3KZSA 1KGUA 4AZ5A 4GXPA 4HOWA 2CERA 1UZ1A 1E1FA 5AC4A 1XV8A 3UCQA 4D1JA 5F7UA 1ZL1A 2YBUA 4OUEA 1AQ0A 3TP4A 1E56A 5A6AA 3WNKA 2UY5A 1KXHA 3VM5A 3CMJA 3MUIA 1H0GA 4CCDA 3DC0A 4D1IA 1MVYA 2JF7A 5AYIA 2WVVB 3EMQA 4W7VA 2VRKA 1GQJA 3MO4A 1ESWA 3AHVA 4HP5A 3CHDA 1JDDA 5A3HA 4LYRA 4MB3A 3SCOA 3ARWA 2CBUA 4DWSC 4NF7A 2PF0A 3POHA 1UZ4A 4IM4A 1HN1A 1KCLA 1W2VA 3ALGA 2XVPA 5C71A 3L4XA 1R85A 1OIFA 1E4IA 4W7WA 2WC7A 3ZJKA 5CJ5A 3RCNA 3MV01 1HP5A 2VR5A 5EFFA 1JL8A 3NJ3A 2D22A 4NRRA 3WDPP 3OLDA 1TFVA 3IJ8A 1B3VA 5ABGA 1HKKA 1SR0A 5ABFB 4TX6A 1UWQA 2JE8A 3PZQA 3LPGA 1P6WA 1VEMA 1XC6A 1GOIA 1L8NA 3D3AA 4NRSA 5GPRA 2VNCA 4FLRA 1WKYA 2DSZA 5AYBA 3WF3A 1RPKA 2EO7A 1QHZA 1KWGA 2XWEA 3AMGA 3VKKA 1E1EA 3I3DA 5BCAA 2RGMA 3EBVA 1ZS2A 2CBIA 2WANA 3VUPA 3UR7A 3GBEA 4PYSA 2XFRA 1QNRA 3WKZA 2NT1A 4YHEA 3T2PA 4UFIA 3W82A 2CBJA 3F5KA 4W89A 4UFMA 3TTQA 1WZMA 1BPLB 1UKSA 3MMUA 2JIWA 1GW1A 5I24A 2EBNA 4AEFA 2E8ZA 4C7GA 1WNOA 1UD6A 1EQCA 2ZXAA 2ZXQA 3ARVA 4Z2HA 4HMEA 2WC4A 1VENA 1ZJBA 5ABEA 1UWRA 2Y2WA 3BCFA 3WH8A 1B3YA 2DGAA 2NT0A 1VIWA 2DSWA 1CGXA 3DHUA 3WUGA 3KEHA 4PN2A 5LA2A 4JL1A 2BVYA 4AW7A 4P8VA 4YN5A 4UNIA 3WNLA 2VVNA 3B9DA 1GVIA 4UFHA 2DSKA 3VD9A 5A2CA 1GJWA 1JAEA 1V02E 4XUYA 5A6LA 2XWDA 4CKQA 4HU8A 3BSHA 1E72M 2ZUMA 1EHAA 3VGHA 2OYLA 8A3HA 1W1YA 4AIEA 1LWJA 2XSBA 1U2YA 4HOZA 1E55A 3CUJA 1K9TA 3N04A 1MQQA 1GJUA 5D8ZA 4ZXOA 4UQEA 1DWHM 1GOKA 1HF6A 1KBBA 4C7DA 4PRWA 5IFPA 1H09A 1V3JA 2OWXA 3OLEA 1UA3A 3LPPA 1W3HA 3AHXA 3PTMA 3RM9A 1FFRA 4TVUA 3M6DA 3VILA 2VJXA 5LA0A 5BRQA 4Q22A 4FLSA 2VX4A 5FKYA 2WZIA 4CUCA 4B9ZA 3WN6A 1VFOA 4J3SA 1CGVA 2J79A 4JFSA 3W27A 1E6QM 3VD5A 1B2YA 3IK2A 1GORA 1G9HA 1Q6GA 5BWFA 1QNQA 2DSUA 5BXPA 1V3HA 3ZMRA 1MW0A 2J7CA 2VO5A 4E8DA 2EQDA 3CZGA 1UKOA 5A8MA 1A3HA 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3VGDA 3VU2A 1WZLA 4LPCA 1OGGA 3PTKA 2O9RA 4JKMA 2X1IA 3QOKA 3ZSTA 4P8WA 2VZSA 3AXHA 3WD2A 1V0KA 2WMKA 3K4AA 4PMUA 3WNNA 3AOFA 1QI4A 3QR3A 4H41A 3WF2A 3L4VA 4GI8A 4PMNA 4W84A 1PIFA 2UY3A 1C8QA 1D7FA 4DWSD 1PIGA 5IHSA 2XVLA 1SYTA 2FH6A 2F2HA 1IZJA 1W2PA 1E73M 1J10A 1PZ2A 2ZX8A 1D2KA 3VDCA 4F9DA 2CKRA 3WH9A 3CLWA 3M7SA 3SCSA 7A3HA 4QLJA 2WSKA 1UUQA 2VZVA 2RGLA 1EA9C 4CN1A 3BMWA 4M81A 2WC3A 5JBDA 3AMDA 1EDQA 3MKKA 4V27A 3S6TA 1ITCA 2FHFA 1CGTA 2V5DA 4AD1A 2WW5A 1CLVA 4RE3A 1ITXA 1UQYA 2G4FA 2YDSA 3WH5A 3WDHA 1VJZA 1XYFA 4KWUA 4UFJA 1TA3A 3W29A 2J7HA 4WKFA 1AQMA 4OOZA 4GKLA 3AIWA 1A47A 2WVTA 4J27A 4D72A 2FHCA 3JUGA 3PTQA 4B15A 3UG3A 1B1YA 1BGAA 4PMRA 4GZIA 1E4NA 1UHVA 3MUAA 4GINA 5CXPA 2VUYA 5D9PA 5M17A 1W9DM 3CH9A 2JFEX 2WYSA 1DTUA 1LL6A 2W4XA 1I1WA 4FK9A 4CN6A 1JDAA 4DUWA 2WMGA 1TVNA 3A4AA 4L4OA 4PTXA 1HT6A 4UCFA 2XGBA 3L4TA 1CXKA 3SIMA 4DWSA 3I3EA 2EPOA 4OZOA 4OIFA 3CZEA 4P7QA 1XH0A 2GFTA 2O9TA 3F5JA 1I75A 4IUGA 1B30A 4D6JA 1E4LA 3CIVA 2UY4A 1E9LA 1KCKA 1XHGA 4GZEA 1H11A 3SUSA 3RJXA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3AYRA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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