3B69A

T cruzi trans-sialidase complex with benzoylated nana derivative
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Trans-sialidase
publication title A new generation of specific Trypanosoma cruzi trans-sialidase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 182
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2007-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3b69A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3b69A01
1UL9A 3O9JA 1WW6A 4LBOA 2GDFA 3CL2A 5IK7A 1UPSA 4D69A 1LU2A 2QWHA 1KJRA 3V0AA 2ZHLA 3RMYA 4Q27A 1V3DA 3ZSMA 3TIAA 4MJVA 3ZYPA 3D5OA 1X50A 4GXLA 3IKWA 1WCSA 4MJUA 1U0AA 1H9PA 2A6YA 5T5OA 5GJ6A 3M3QA 3I8TA 3O0VA 4XDQA 1SNTA 4MWUA 2RHPA 4UW5A 1UZZA 1Z50A 2HT8A 3N36A 1GYKA 1IVGA 1IS3A 1JW6A 4YGBA 4BPZA 3V64A 4YZ2A 1NCCN 1L7HA 4LBJA 2D6NA 3ZYRA 5IT6A 4Q6KA 2SLIA 2ZABA 4FOQA 1QGLA 1FAYA 2R49A 5JOXA 4ZXKA 5T5PA 4XOGA 4CPLA 2HTVA 1DQ2A 1GZ9A 1DFQA 4LBQA 1SLLA 3MW4A 2R0FA 2A6ZA 1Z4VA 4YFZA 1G7YA 2BATA 1GKBA 3WDWA 5DZGA 1W6PA 3LSDA 2JDZA 2ZACA 1YYNA 2A3XA 3N7KA 4CRQA 2DUOA 3TIBA 1KRIA 1V0EA 4X47A 1NXD1 1PZ7A 4XMIA 3ZXLA 3WG3A 3A4UA 1LOCA 4JF7A 1INVA 3T1LA 1IVFA 1SCSA 2YXSA 5FRAA 1KITA 1LODA 2A6WA 1DIMA 1GZWB 5CAZA 1WD4A 1WW4A 3B01A 4Y1UA 5KXBA 2DVBA 2ZGTA 4UW3A 4XTMA 2ZGOA 1C1LA 3AJZA 2VWDA 1IVEA 2QWDA 3LCPA 4YG6A 2OUJA 2D7FA 1V0ZA 4NN9A 2AH2A 2UU8A 1ULGA 2F27A 2DURA 4AVVA 4GZOA 3UK9A 2UWCA 3M3OA 4XILA 4HZZA 3VKLA 1YO8A 4ISRA 4UF7A 3WHUA 2HU0A 3MW3A 1Q8SA 4C1WA 2D6PA 3PVOA 1DILA 1QOSA 3C2UA 4AVSA 5GZEA 3CNAA 3VUOA 1LHUA 3K36A 5T50A 2ZHKA 1Z4WA 1W8NA 4M4VA 1LGNA 1Z4YA 3SANA 4QN6A 4GWMA 4JC1A 3R4SA 5HCAA 2CY6A 2X9MA 2GN3A 1INGA 4LBQD 4P9YA 2CMLA 1HDKA 1WBFA 3RMXA 5GZCA 4UW6A 1SLAA 1W20A 1D2SA 2DTWA 1O4YA 1LHNA 4B7JA 4WA4A 1HQWA 5SV8A 1ULDA 4M3CA 1SLCA 1W6OA 1CIWA 2ARXA 2W5OA 2A3WA 1O4ZA 4HANA 4YGDA 3OY8A 5DG2A 2QWBA 4R9BA 1NCDN 1DZQA 1C1FA 2YZ4A 1JYIA 2CL2A 3WVJA 1F8EA 3IM0A 1WLCA 3CL0A 1GICA 2PELA 4Z8BA 2XZJA 4DFSA 4K3YA 1DQ6A 2F13A 2XG3A 1USXA 4WEFA 3USUA 2VVZA 1NSCA 2W38A 4QN4A 1MACA 3SNMA 3R4UA 3T2TA 1VLNA 2FMDA 2KM2A 3NV1A 1INHA 4WA3A 1CQ9A 4XJRA 3OJBA 1LEMA 1H30A 1ENSA 2ERFA 2SIMA 2P37A 3JU9A 4TYSA 1FNYA 4Y22B 4Y1ZA 7NN9A 4ATEA 4GZPA 2R16A 4FQZA 4K1IA 1V2IA 5CBLA 1S1AA 3OYWB 1KJLA 1IS5A 1IVCA 3AXEA 1INFA 1V3CA 1LGCA 4XJ8A 3QCWA 3PMEA 1HLCA 5GLTA 4KS2A 4XJAA 3ILRA 4NCSA 4M4NA 3V0AB 3A0KA 1EPWA 3VKOA 2A5ZA 4Y1VA 4GEZA 2DU0A 3AZWA 2QWKA 2PHXA 2AEPA 3M2MA 3WUCA 2WT0A 1MZ5A 2G4IA 4MWLA 5B2DA 1QU0A 3UJQA 3N35A 3PJQA 1LULA 4Y26A 4Y1XA 2ZHNA 2I2SA 1L7GA 4MWWA 1L7FA 2YROA 1S0BA 4GWNA 1N3OA 4BMBA 3A0NA 1V6NA 1S0CA 1WW5A 2A6XA 1N3QA 2VK5A 4J9TA 5LK5A 1QOOA 4ASMB 1AJOA 2EXIA 3KQRA 5HUNA 2QWCA 4FPOB 4DQAA 3FBYA 2DVGA 3K39A 3UL2A 4FP3A 3B69A 4M3CE 3O0WA 4KS3A 4FPEA 3T1MA 3WDUA 4FVVA 4FZHA 3VV1A 4P9XA 1BJQA 1GBGA 2CYFA 3VKNA 2C4LA 4LBQB 1IS4A 1S0IA 3GVLA 4W65A 1SACA 5IK5A 1A3KA 3ATGA 3HN1A 4WEGA 2A7AA 4XJ9A 1V6MA 1S0DA 1W6PB 3NWKA 1IS6A 1TEIA 4XIOA 3SH3A 1NN2A 1WD3A 5GLUA 2F0ZA 2C4AA 3WG1A 4X49A 1CPNA 4HL0A 1LOBA 2A75A 3AXDA 1VCJA 2CTVA 1W1XA 4GKYA 2ARBA 4Y1YA 4BBWA 1Z4XA 4GALA 4XXPA 1R1ZA 3WDYA 2DU1A 1DYPA 1V3EA 2VW0A 1LOFC 2A71A 1SFYA 3VKFC 3V0BA 1IVBA 2CWMA 1B9VA 5EYYA 2JD4A 4WA5A 1LEDA 2YA5A 4MC7A 3QLQA 4WZFA 5T55A 3TB0A 2D3SA 5HUMA 3HMYA 2YDPA 2HT7A 4M01A 2ZGQA 4CPMA 5JYYA 2GMEA 3AYCA 1VALA 2GALA 3CYEA 3FUOA 1YRZA 2XZIA 2ZB5A 1KDMA 5GZFA 2DVDA 4GDIA 1A8DA 4DPNA 2FHRA 1SBEA 4BM8A 3ENRA 3N7JA 4H53A 2P3IA 1QMJA 1G9BA 4FVKA 5JDBA 1JHNA 3CKZA 1W6MA 1ENRA 3H72A 3SH4A 4QN3A 3AYEA 4NC5A 2NMNA 2HTYA 5E89A 1EUUA 3A72A 1UMZA 1LTEA 1Q8QA 4B7QA 4XIKA 1N3PA 1JN2P 2VH9A 2WT1A 4Y20B 2GN7A 1IOAA 4R9DA 4P9WA 4WV8A 5NN9A 5EXOA 1GANA 3NV3A 3SITA 3ZSJA 4GJTA 5E88A 1LCLA 4FPHA 4AYUA 4WVWA 5DG1A 1ZA4A 4M3CB 1W6OB 2W68A 1AX1A 1B9SA 1LGBA 5CNAA 2ENRA 3OY8B 2ZHMA 1GNZA 4MX0A 5GLVA 2WLQA 1I3HA 2ZB6A 1HKDA 4M4UA 2EALA 3PVEA 3BEQA 3TICA 3JU4A 4HIZA 3INBA 1YXWA 2D3RA 1V00A 4JCKA 4QNPA 2E7QA 3H0OA 2BERA 3APBA 4XTPA 4BMEA 4YZ5A 3USUB 2ZA9A 3IPVA 5F9TA 2F24A 2GNMA 3PVNA 1JXNA 2JE9A 1QOTA 5GM0A 3GVJA 4QN7A 3ALXA 1NSBA 3B7EA 2DUPA 1B09A 2QWAA 4GZQA 3O9KA 4LBKA 5GZDA 1AX2A 1Q56A 1Q8PA 2NZ9A 3WDXA 2NM1A 3ZXJA 4TZDA 1DLLA 3WNXA 1NSDA 2YA7A 2E7TA 1SBFA 1LESA 2ZGPA 3DGTA 2VSMA 3B3QE 1F8DA 5CB7A 1AZDA 3TI8A 1FX5A 3AJYA 1VAVA 2XB6C 1MS1A 2F12A 3MEPA 3D11A 1INYA 3N3HA 5JOWA 3W09A 5H9RA 1BZWA 2TEPA 3W59A 2ZMNA 2E51A 2AR6A 1JUIA 4Y20A 1INWA 3I4IA 4KBBA 3ILNA 3TI4A 2HYKA 4B7MA 2WSUA 5JOZA 2GNBA 2UWBA 3WCRA 1BYHA 2R0HA 4IQPA 5T54A 1DQ0A 4GA9A 3AYAA 1DBNA 3WOGA 4XMAA 4AGRA 3K3AA 2PHWA 4YZ1A 1S0EA 2AGSA 1SLTA 4PCRA 5FREA 4MWRA 1PZ9A 3RRDA 3N7MA 3GALA 1EUSA 1MS0A 2OW4A 3R05A 2EF6A 1MS4A 3FLRA 3WDVA 5F5QA 4U36A 4P14A 2YY1A 1UN1A 1F8CA 2B8HA 1HQLA 4XJZA 1G9CA 1C4RA 4ZKTB 1V6OA 1A4GA 2F25A 3AZVA 3WG2A 4MWXA 3T1EA 4NOTA 5AVAA 4GZTA 1LOEA 5L73A 1URXA 2HTRA 2AREA 1WUVA 4X4AA 4Q8LA 3SISA 3AK0A 2C9AA 5KXEA 2WQZC 3LSEA 1J1TA 2VK7A 1QNYA 2OUHA 1NMCA 3V0BB 2WNEA 2B7YA 2EIGA 1IVDA 2VK6A 1W0OA 2QWFA 4YGCA 1V0FA 5GZGA 3ZXEA 1MVQA 2ZZJA 3WV6A 1WLWA 1NLSA 3BODA 1V6LA 3B9CA 3NV4A 1E8UA 3BOPA 1AXYA 4CTEA 2HTWA 1NMAN 1V6KA 3GVKA 1NCBN 1G86A 4YW3A 1PZ8A 1DHKB 4XBNA 1XOEA 4MZEA 1W6MB 4JRAA 3TI3A 4YW5A 1OQ1A 4XE9A 4CPNA 3TAYA 3TI5A 3OBTA 4DS0A 3AZXA 1MS3A 2JECA 1YI7A 2AEQA 1Z4ZA 2HU4A 4FPFA 4YG0A 4AVTA 1NNBA 1QDOA 2NYYA 4R9CA 4ITCA 5EYXA 1VCUA 4KS1A 2YA8A 3WZ1A 3UJOA 4B7RA 1F5FA 2F11A 4ISQA 2ZGMA 2QWIA 3RQ0A 3NV2A 1QNWA 1W6NA 4FOYA 5EWSA 5HUGA 4YLZA 5JLVA 2R1DA 1NNAA 2QWEA 2W08A 4YM0A 3H73A 1LHVA 4LBMA 1FATA 1UX6A 4Q2FA 1LECA 4DGRA 4CPYA 3IPVB 4FPCA 3INAA 4MWYA 6NN9A 1UKGA 1QDCA 5HUKA 4XJWA 2GNTA 2DYCA 2AYHA 4H55A 1SCRA 4XBLA 4YW4A 2EXKA 3M1HA 1WW7A 1OKQA 5GLZA 4XXAA 2CWSA 4YM3A 3L2YA 4FQ4A 4FOWA 4RL7A 1W6QA 4GZXA 2BZDA 4Q1PA 1SBDA 3V65A 1LOFA 3W58A 4BOWA 2ZMLA 1WBLA 1LHOA 1W21A 2A3YA 5HX0A 4I00A 1CESA 1LOGA 4X6KA 3D6EA 4FPLA 1MVEA 3WUDA 4R9AA 4MYEA 3SLIA 1ULCA 4YW2A 3H6JA 2JKBA 1Z0HA 1N1VA 2GMMA 2Z42A 1B9TA 4WVVA 4FPJA 5T5JA 1AF9A 4CZSA 1V6IA 2W5NA 1XQNA 5GLWA 4YM1A 1JOJA 3AX4A 1LU1A 2VXRA 4AGGA 2P3JA 3IMNA 3FFZA 1N1TA 1EUTA 2YA4A 1AXKA 2HTQA 1JYCA 2D6KA 1LOAA 1BQPA 4PQ9A 1Q8VA 2V73A 4Y24A 1DQ1A 4XHXA 1QF3A 1DIWA 2GMPA 4FOVA 1WCQA 2ZGUA 1E8VA 4Q1RA 2WSVA 4PBPA 2WT2A 4XBQA 4BLJA 2ZMKA 1A4QA 2ZAAA 3M3EA 5DUUA 4HZXA 4DRRA 4K1KA 1CN1A 4Q26A 2D3PA 1XOGA 1E8TA 3Q9OA 1CVNA 1RINA 5DUXA 1MWEA 2D6OX 3A71A 4KS5A 1GSLA 4L8QA 1N1SA 5E8AA 1G9DA 3K37A 2JJ6A 5HCFA 1UAIA 5CA6A 2E6VA 2UURA 1SLIA 1N1YA 1GZCA 3AZZA 3RSJA 4GB1A 2ZGRA 4K21A 2VY0A 1BXHA 3KM5A 1SO7A 2DVAA 2ZBJA 1JBCA 3AP4A 2ES3A 3FLPA 3POYA 3K38A 4F83A 2PHFA 2ZGNA 3SH5A 1RIRA 4C1XA 2PHTA 2XCYA 5DUWA 1APNA 3POSA 5GALA 1CR7A 4ATFA 3U4XA 1DGLA 1H9WA 2DWRA 1NNCA 4YM2A 1ONAA 2SBAA 1IKPA 3N7LA 5KXDA 4RA0A 2JE7A 4K1ZA 4MWJA 3M3CA 2ZGLA 2GNDA 2D43A 1AX0A 5DXDA 2PHRA 3OGGA 2QWGA 4YZ3A 4FPKA 3MW2A 1F9KA 3B00A 4M3MA 1OFSA 1RITA 4XJQA 3NSSA 3WHTA 2F10A 4UW4A 4MZAA 3ZVXA 2YDTA 1Z78A 2Q5TA 3ZSLA 3SALA 3ZSKA 2EAKA 1C57A 2YV8A 3WG4A 2D44A 4YW1A 1DQ4A 1LJ7A 4GZSA 2C5DA 1INXA 2W20A 4M00A 2XZKA 3IN9A 5KXCA 4PBOA 4MWQA 4YGEA 2F26A 3FUQA 5B2CA 4LBLA 4FP2A 2P3KA 1G9FA 1W6NB 4YZ4A 1S0JA 2P2KA 2PHUA 2D6LX 4Q8KA 4GZWA 1GNHA 1CONA 1D0HA 5BYNA 4PF5A 3OBRA 2WJSA 1GLHA 1SLBA 3AP6A 2VUAA 1V3BA 1DYKA 1VAMA 3ZXKA 2VW1A 5JOYA 4DRVA 1MZ6A 1KQRA 4D8SA 1S0FA 1VIWB 5HCBA 3SILA 1CPMA 3BIWE 2A6VA 1GZWA 2HTUA 3NN9A 2CNAA 2LALA 1AVBA 4AWDA 1NMBN 1Q8OA 5IK8A 3D4KA 1A78A 1W6QB 3BTAA 1IKQA 3D12A 3ZXFA 1FNZA 1GV9A 2R1BA 4B7NA 2VU9A 2WKKA 2HT5A 2LTNA 5DZFA 1A14N 1Y7BA 5JMCA 3AP5A 1WLDA 2SILA 3O12A 4AGVA 3AFKA 4NO4A 4SLIA 3WLUA 4KS4A 2DUQA 3JUUA 2F28A 1BKZA 2ZGSA 1MS5A 2DTYA 5T52A 5IUQA 5T5LA 2W39A 2ZKNA 4HZYA 2AUYA 4H52A 1KDKA 3GNEA 4CPOA 3POWA 2BQPA 2AENA 4QN5A 2BF6A 1AXZA 1W8OA 4GKXA 5H9QA 3ILFA 3AP7A 1N47A 2OVUA 3RS6A 3OPZA 3AYDA 4XZPA 1CJPA 2ZGKA 1ZM1A 4M3CF 1MR5A 4XJUA 4I30A 4YFWA 1FV3A 4FJ6A 2VW2A 1EURA 2E53A 4LBNA 1NCAN 1G8WA 1FYUA 1ENQA 4CPZA 3AZYA 4K1YA 2W52A 2QWJA 1UZYA 4FPYA 4K20A 2NN8A 3ASIA 2EXHA 4BLIA 3VKMA 2A70A 4K1HA 2NP0A 3HR9A 1I1EA 1LENA 4MWVA 2DV9A 2NMOA 3TI6A 1F31A 1BJIA 1MS9A 4FPGA 3RG0A 4XYXA 3H71A 1F8BA 1MS8A 1ULFA 5DZEA 4HZWA 3WCSA 1W0PA 1S0GA 2DVFA 1LHWA 4BQ1A 1V6JA 3FLTA 4GDJA 2VSKA 1USRA 1FV2A 2EXJA 5H9SA 5M1ZA 4XHBA 1G9AA 2RKCA 2UWAA 5IK4A 1YIFA 4U2AA 4YG3A 3DUIA 1AJKA 3O0XA 2F29A 4OZXA 4Y22A 3WDTA 5DUVA 5JVVA 3ZPYA 2D6MA 4K1JA 1QKQA 5H9PA 2V5YA 3OYWA 3O5SA 2H0BA 3ALWA 1ULEA 2P34A 3AP9A 2YA6A 3MPPG 2YMZA 4HZVA 1DQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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