3B8AX

Crystal structure of yeast hexokinase pi in complex with glucose
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
471
structure length
470
Chain Sequence
SMADVPKELMDEIHQLEDMFTVDSETLRKVVKHFIDELNKGLTKKGGNIPMIPGWVMEFPTGKESGNYLAIDLGGTNLRVVLVKLSGNHTFDTTQSKYKLPHDMRTTKHQEELWSFIADSLKDFMVEQELLNTDTLPLGFTFSYPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNVEGHDVVPLLQNEISKRELPIEIVALINDTVGTLIASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAFYDVVSDIEKLEGKLADDIPSNSPMAINCEYGSFDNEHLVLPRTKYDVAVDEQSPRPGQQAFEKMTSGYYLGELLRLVLLELNEKGLMLKDQDLSKLKQPYIMDTSYPARIEDDPFENLEDTDDIFQKDFGVKTTLPERKLIRRLCELIGTRAARLAVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNKYPGFKEAAAKGLRDIYGWTGDASKDPITIVPAEDGSGAGAAVIAALSEKRIAEGKSLGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-1
publication title Crystal structure of yeast hexokinase PI in complex with glucose: A classical "induced fit" example revised.
pubmed doi rcsb
total genus 150
structure length 470
sequence length 471
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2007-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3b8aX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3b8aX03
1HKBA 3QFPA 1HKGA 3WXJA 3DXMA 3UKRA 1QQOA 4FWSA 2CGLA 3I8BA 2HF3A 4PKHA 1ESVA 3VEVA 4I6MA 3CJAA 1NGIA 2P9LA 2Q31A 2Q0RA 4H5NA 3VF4A 2ASOA 4FWPA 5FPMA 4MO5A 3GE1A 5AZJB 3BEXA 4BRIA 3H1QA 1KAXA 1NGBA 1H1VA 1U6ZA 3S41A 3D2EB 4JAXA 2W41A 3QDKA 1HKCA 4BR7A 3IDHA 2YJEA 1QZ5A 2DPNA 1S3XA 1MWKA 5F1XA 2P9IB 4B1VA 4BC4A 1KXPA 2I7NA 2GTDA 4CZEA 2CH6A 4DB3A 2Q97A 4E1JA 3BF3A 4PL7A 1BWFO 1HJOA 4WQ5C 4M63C 3FZMA 4JD2A 1LOTB 4CD3A 1KAZA 4C23A 1DEJA 4BREA 4FOEA 5AQQA 4QS9A 4XEIA 2EWSA 3VEWA 4BR9A 5LY3A 5FPDA 4IJAA 3H45C 2P9UB 2FF3B 5AQOA 5AQFA 5AZIB 5AQPA 3ATUA 3MN7A 2ASPA 2FLOA 3L6QA 3C7NB 4FSVA 4IO8A 4BC5A 1GLFO 2YHXA 1NGDA 3WEEA 5EX5A 2CGKA 4WQ4A 4YDUC 3O80A 5E84A 2ASMA 4FPBA 3CHWA 3M3ZA 1NBWA 4K41A 1ATNA 2A5XA 3VGMA 1BA0A 2QWLA 1TUYA 4BQLA 3HI0A 3FE1A 4EFHA 3H6EA 1R59O 3VESA 3C7NA 1C0GA 4K25A 2A40A 3HTVA 1QZ6A 5BN8A 3R8EA 3KZBA 3VETA 4EHUA 4L3QA 3ZEUB 4BVOA 2P9KB 5AQNA 1KAYA 4KBOA 1RFQA 4CZFA 4BRKA 2QWPA 3KHYA 5AQYA 3CERA 1BO5O 3MMVA 1XUPO 2PAVA 2NLXA 3U9DA 1OKJA 4JHDA 2ITMA 4NO7A 1E4GT 3CIPA 1SQKA 4CBWA 1NGHA 3R6MA 4ISEA 4BRPA 2E88A 4BRCA 2P9KA 2QM1A 4AM7A 1YUWA 4H5TA 1G99A 2QWQA 2VWBA 3DJCA 4EIAA 2YJFA 2GWKA 3HZ6A 2E2NA 4BRNA 5JLHA 2FF6A 1E4FT 3A5OC 3FZLA 4CD1A 5EY4A 4A61A 5I9EB 4FL9A 4B1WB 2IVOA 4CI6A 3ZX3A 1MWMA 1EQYA 3MCPA 5AQTA 3VEOA 3GOIA 3UE5A 5EVZA 3LDLA 5TKYA 3EKUA 3AY9A 3RSEB 1Y64A 3CQYA 2E8AA 3O08A 2ZGYA 3MDQA 3O1WA 1GLDG 1RDWX 2P9SA 4H0TB 3W3DA 1NM1A 1NGAA 2D0OA 1V4SA 2D0PA 1JCGA 2E2QA 5CE3A 2CGJA 3I33A 1V4TA 1HPMA 3SJHA 2I7PA 3EZWA 4BC2A 4GNIA 3UB5A 3ZX0A 5KPTA 5AQJA 2GUPA 3FZFA 4WYBA 5JMVA 3ENHA 1GLAG 1WOQA 4IXCA 3ATVA 3HSCA 1P8ZA 4H5WA 1NMDA 2V52B 4BVPA 3SMPA 4BG9A 4BR4A 5BRFA 3L4IA 4A2AA 5AQGA 2P9NB 3SLCA 1GLJO 2AA4A 2YHWA 3AARA 3WQUA 4FWLA 5AZJA 1YVNA 3D2EA 2QWMA 5B8HA 2NZTA 2QWNA 2IVPA 5KPZA 1QQNA 3H1VX 3H46O 2V51B 4NB4A 3CQXA 4O5FA 2Q36A 1GLBG 4BRDA 2ZGZA 3VEZA 4H5RA 1S22A 2E2PA 4JNEA 1SZ2A 2FXUA 2P9IA 2P9NA 3HM8A 3MN9A 4FWRA 3M1FA 4BG8A 2QWRA 4H5VA 1NWKA 4A62A 5ADXA 5BREA 1QQMA 3CI5A 4DQ8A 3UKUB 1T6CA 1X9JA 2FSKA 2GELA 5BN9A 4O8KA 2J4RA 1BG3A 3W0LA 3CJCA 4BRGA 2BUPA 3LDNA 3IFRA 4BC3A 3GG4A 5AQHA 4H0PA 1IJJA 2A42A 3B8AX 2HOEA 2P9UA 5AZIA 2UYTA 4MLHA 3VF6A 5AQRA 4BRMA 2CH5A 3G25A 3IMXA 5BPNA 1SAZA 4J8FA 3ZX2A 4BQZA 3AAPA 4EAHD 2AP1A 4FWNA 1Q18A 1CZAN 5F0XA 5AQKA 1LCUA 3J8AA 5KPRA 3SMSA 5BRHA 3GDQA 2E20A 3O5BA 2KHOA 4M7YA 3QMLA 2VCPA 4BR0A 1ZBSA 2GEMA 3QFUA 2IIRA 3DWLA 1YXQA 2P9PB 4WQ4C 1ATRA 3A5MC 3CETA 3L0QA 2F9TA 3ZEUA 1MA9B 3HBTA 4K42A 1BA1A 3WXLA 4ISGA 3FLCO 1U2VB 4CZMA 4BRQA 2ZWHA 4Z94A 1TYQB 4H03B 5AQXA 3VERA 4CBUA 2QXLA 5EXWA 3M6GA 2Q0UA 4JN4A 5AQMA 4FWOA 1TUUA 3QB0A 4FWQA 3ID8A 1NGEA 3MN5A 5ELZA 2P9PA 4K43A 4IWVA 5AQLA 1YAGA 1BU6O 4BRLA 1U2VA 3WQTA 1C0FA 4CZLA 2BTFA 4H0VB 1Z6RA 2E1ZA 5JLFA 3H3NO 4PKGA 1XQSC 3DXMB 3UKRB 1TYQA 3O6WA 3VGLA 3A8YA 4CZHA 3ULEB 1DKGD 3FGUA 4BR2A 4I6MB 5AQVA 1MDUB 3TU5A 1NLVA 4B1XB 1ZXOA 2Q2RA 4WQ5A 5KQ8A 1BUPA 1HUXA 4H0XB 5F2RA 4RTFD 4XH1A 5BR9A 2V7YA 2FSNA 3RSEA 2IVNA 3A5LC 4FO0A 3U9ZA 5AQUA 1D4XA 4MLEA 3ULEA 3JS6A 2GWJA 3IUCA 3MN6A 4FWMA 3H3OB 2VYPA 5ADXH 5BPLA 3CJ9A 3A0IX 3A5NC 4B1YB 4JD2B 4CBXA 4BGAA 2W40A 3LDQA 4YDUA 1ATSA 3EN9A 2E2OA 5AQWA 4PKIA 1ZC6A 3O4WA 5KQDA 3BF1A 3CJ7A 1JCEA 1NGCA 1HLUA 4IZ9A 4BGBA 4GY2B 3VOVA 1X3MA 5EOYA 5E26A 2QW9A 1HX1A 3QBXA 3JXUA 1JCFA 3GL1A 1J6ZA 3SK3A 3WEEB 1XC3A 4H0YB 3FR0A 4MO4A 4BROA 3BP8A 3ENOA 3LL3A 4XH5A 4LC9B 3DAWA 1QHAA 3QBWA 4FOIA 1NGFA 1GLLO 4BRAA 1WUAA 2A3ZA 4Y0WA 3WXIA 2YHYA 3O8MA 3UKUA 4CZKA 2OANA 3WXKA 5FPNA 2QWOA 2V7ZA 3OHRA 4B1ZA 2D1KA 1K8KB 1T44A 3AAQA 3EO3A 1Z05A 3LM9A 3D2FB 1T6DA 4XH4A 1NGJA 2A6AA 3GBTA 4CZJA 5AR0A 3KVGA 2FSJA 3QICA 4HTLA 3MK6A 2F9WA 2PBDA 3DXKB 1IG8A 2HMPA 4QS8A 3VGKA 3R9PA 1BOTO 3TPQA 4JHDB 3WT0A 4H0OA 2E1YA 2HF4A 4IJNA 1GLCG 4HWIA 1K8KA 3ZETB 2ZF5O 4FPAA 3VENA 4CZGA 3U8XA 4BRHA 3EL2A 3LDOA 2YCHA 2YI1A 1X3NA 3D2FA 5BPMA 4RWTA 5AQZA 5AFUH 4BR5A 3DXKA 5AQIA 4EHTA 3P4IA 3VPZA 3WUHA 3EKSA 3VEYA 3VF2A 1RGIA 4DHYA 4BRFA 4CJ7A 3FZHA 2WUSA 2A41A 5LJVA 3ZETA 4RCHA 4QS7A 4F9OA 5BRDA 4DCHA 4CZIA 4PL8A 5AFUA 3CJBA 3O1BA 4M7XA 2H3GX 5FPEA 2NRHA 4ISFA 1NGGA 5LJWA 3U4LA 2D4WA 2P9SB 1DGKN 3BUZB 1BDGA 3LM2A 3C0BA 3LDPA 2P9LB 2Q1NA 4AM6A 1GLEG 3FZKA 3VEXA 3FFKB 4A2BA 3D7EO 4B1UB 5JICA 3F9MA 4FWKA 3CJ1A 5AQSA 4B9QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HKGA 3SCXA 3ZSQA 3MXMA 1A5XA 1QSLA 3CC2N 2UUAK 4F3OA 3QNNA 4R79A 1IBLK 1MU2A 2P9LA 4M3YA 1IKXA 4DR1K 3T69A 4CJQA 5AZJB 3BEXA 4C1NK 1NGBA 3ZT1A 3CCJN 4JAXA 2W41A 4PY5A 4GKJK 4BR7A 2YJEA 4KH5A 2DPNA 1S3XA 4FCYA 4DV2K 1ZBIA 1BHLA 1KQSM 1VSJA 2UXDK 3CCEN 4ZTFA 3V9SA 2GTDA 1F21A 3LZJA 1SV5A 1C1CA 2X74A 5DM7L 2P5GA 4F3TA 2G8FA 1YF5L 4CD3A 1NJYA 3ZSVA 4BREA 3AVNA 3TSPA 5AQQA 2EWSA 4KREA 4BR9A 5FPDA 3H45C 5AQOA 5AQPA 2FC0A 3E01A 2FLOA 3L6QA 4FSVA 4OKKA 2UXBK 2HHHK 1LW2A 2XY5A 1XC9A 1X9MA 1D8YA 1C6VA 4GV6A 3SQ1A 3ZYYX 4BE2A 4KI4A 4YDUC 3SV3A 2PZSA 1EKEA 3AVIA 4CJRA 2IS3A 3HVTA 4ID1A 2A5XA 1QVFM 4BQLA 4CIGA 1JKHA 1S1WA 1R59O 2ETJA 1Q9YA 1B9DA 1KCFA 1HJRA 2O8BB 4I2QA 4FM0A 1YI2N 1RBUA 2OPQA 3C65A 3KZBA 3UIQA 3CF5L 1N8RO 2P9KB 1KAYA 3VMFB 4OKEA 5CZ2A 4M45A 3KLGA 4DSEA 2QWPA 5C2FA 1N33K 3VQ7A 2FBVA 4C1NI 3G71N 2KTQA 2PAVA 2NLXA 4KPYA 4M3XA 4IO9L 4UY8O 1N5YA 2O8BA 3LP2A 3ZSXA 4U67L 4FJ9A 1HNXK 2P9KA 1YJNN 2P51A 2NRZA 3CFRA 3RR8A 4GV9A 4PQUA 1G99A 4PHTX 2VWKA 3HPOA 3I55N 4F2SA 3SUPA 4JI7K 2Y1IA 4G1QA 3FZLA 4JKHA 4A61A 4B1WB 3DLHA 1X1PA 3F5TA 1MWMA 1Z25A 1EQYA 3LAMA 2D0AA 3GOIA 4FW2A 2QTDA 3THYA 5EVZA 1Y64A 3CQYA 1UWBA 3O08A 3O1WA 3ZT2A 3K2PA 2D0OA 3VQ8A 4HHTA 5CE3A 3U3YA 2HSTA 1HPMA 4CJWA 2HBMA 4GNIA 3HXMA 5AQJA 3FZFA 4BY9C 1GLAG 4DG1A 4BDYA 2V52B 3AA5X 3J81O 4XIUA 1JXBA 4A2AA 2XY6A 2W42A 2P9NB 3HL8A 3HT3A 2G8HA 2YHWA 3OBWA 3RMDA 3CMAN 1YTUA 3MXJA 3OTOK 5SWMA 3D2EA 3L4QA 2IVPA 1RT7A 1QQNA 3H1VX 3H46O 2V51B 2HHTA 3CQXA 1GLBG 2ZGZA 3ZT3A 3VEZA 2ZQBA 1S22A 5K14A 3ZSWA 2P9NA 3HM8A 4DS5A 4BG8A 2QWRA 3HSTB 1HYZA 4FJKA 4O44A 4JRPA 3CI5A 2FSKA 2GELA 4DF8A 4OX9K 4O8KA 3RWUA 2BUPA 2UUBK 3IFRA 3BZCA 4DSKA 3GG4A 1IJJA 5GAHP 1LV5A 4DTUA 3QERA 3B8AX 2ATQA 1BI4B 3E9PA 2P9UA 3MX2A 3ULDA 5HP1A 5AZIA 5DMRA 3VF6A 4CEEA 4M3WA 2CH5A 3IMXA 2QXFA 5BPNA 2G8WA 1J54A 3HRGA 1FW6A 4J8FA 3AVBA 4BQZA 3NGIA 3CCRN 2A1RA 3MEEA 1OH5A 2G8KA 1Q18A 1RT4A 3CC7N 3LALA 3QEXA 5BRHA 4YOVA 2E20A 1JLBA 3QFUA 3HK2A 4IOCL 4FZYA 4HUFA 3A5MC 4WF9L 3HBTA 4JKGA 4CZMA 1ILYA 5KRSA 3WXMB 3G6EN 2OPPA 3VERA 3M8PA 3SYZA 4KHQA 5AQMA 4CJTA 1TUUA 1NGEA 5ELZA 1KFDA 3H08A 1UOCA 3TTDA 1JL1A 1YAGA 3OY9A 2KFNA 1WAJA 1NJXA 2BTFA 4H0VB 1Z6RA 4CEZA 2E1ZA 4H8KA 1XQSC 3DXMB 4MDAA 1OVQA 1E3MA 1DKGD 2F8TA 3K5NA 1IKWA 4JKCA 4DU3A 4FJNA 4UQGA 2ZJQL 4F2RA 4ILGB 3V1QA 4YOWA 4KHSA 2E5LK 5C12A 5C10A 3LPUA 1HNVA 3SUOA 3OYCA 4J2EA 4H0XB 1VQ8N 4DV7K 4KTZA 3K5OA 1XI1A 3L2VA 5BR9A 3NGYA 4CEAA 3RSEA 3OJSA 2BDPA 1CZBA 5AQUA 3JS6A 1P90A 4FWMA 2YKMA 4W5OA 2HVHA 4CK3A 3JAMO 4DV1K 3C6AA 3ZT0A 5BPLA 3OS1A 3TANA 4YNQA 3A0IX 1I94K 2B6AA 1RTHA 4CK2A 1TAUA 3EN9A 5A2QO 2NNWA 3OYBA 4PKIA 3O4WA 4EZ9A 3OW2M 3CJ7A 1LWCA 2F7TA 4CW7B 4FJLA 2HHUA 5EOYA 4AHUA 4ELUA 1WSJA 3GL1A 4DQRA 3SK3A 4E19A 3TAMA 1XC3A 4OPKA 4KV8A 3BP8A 3ENOA 4IEIA 1VQ4N 2YKNA 3LP3A 3NE6A 3K5MA 3SUNA 5FLXO 1NGFA 4BRAA 1LW0A 1NKCA 3KJVA 3O9QA 1S1UA 5J2QA 3WXIA 3UKUA 4CZKA 2OANA 1U48A 4B1ZA 2D1KA 1T44A 4FM2A 4DKWA 1L3VA 5FRMA 3D2FB 4XH4A 2OPSA 3GBTA 3WNGA 5GIOA 2RE2A 3KVGA 2FSJA 1Z26A 4JI1K 1TKZA 1IG8A 1WSEA 4DMNA 3OS2A 1BCOA 4FVMA 4LF5K 1BIUA 3QINA 4IJNA 4FPAA 4CZGA 4Z4CA 1QSSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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