The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
66
|
structure length |
66
|
Chain Sequence |
LVDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSQTEEDCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNSLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE
|
| publication title |
Electron transfer by domain movement in cytochrome bc1.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
20
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| structure length |
66
|
| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| H | PF02320 | UCR_hinge | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3H1K H; 1KB9 F; 1EZV H; 1SQX H; 2BCC H; 3L73 H; 1SQV H; 3H1I H; 3H1J H; 1BCC H; 1KYO F; 4U3F H; 1PP9 H; 1P84 F; 3L71 H; 1L0L H; 1SQQ H; 3H1H H; 1NTZ H; 3TGU H; 3L75 H; 1PPJ H; 1BGY H; 3L70 H; 3BCC H; 3H1L H; 1BE3 H; 1SQP H; 3CX5 F; 3L74 H; 2FYU H; 5KLV H; 3CWB H; 3CXH F; 2A06 H; 1NTM H; 2IBZ H; 4D6T H; 1SQB H; 1NTK H; 4PD4 F; 1NU1 H; 3L72 H; 1L0N H; #chains in the Genus database with same CATH topology 2JEX A; 4J80 A; 2X0L A; 1FXV A; 3AG7 A; 5K1P A; 4DR6 O; 2JGD A; 3SPJ A; 4CH6 A; 3ZRW B; 3OTO O; 4P9P A; 5CA0 B; 3J7A U; 3GVM A; 1SQG A; 5EYP A; 2YEV B; 1IX9 A; 1OCR B; 1WJZ A; 2JS3 A; 4NR1 A; 2JEU A; 4UXN A; 5AG2 A; 4RQE A; 4B7E A; 1PL0 A; 4Q6G A; 3TCU A; 2JGD B; 3N2K B; 4GYC B; 1YF2 A; 1M56 B; 2YI9 A; 4DR6 B; 2BCC H; 5JJJ B; 4GX5 A; 3OTO B; 1SZT A; 2EIK C; 4WF9 V; 1OCO B; 2WAM A; 3NR7 A; 2IW5 A; 4ZIB A; 3AG3 C; 3EXA A; 4X64 O; 2Y69 B; 1BE3 H; 3SYQ A; 2QKS A; 2QKC A; 2B1I A; 3VQW A; 2WWW A; 2IH1 C; 4B3R O; 4LWS A; 1SA0 A; 1JCH A; 1H8E G; 1AR5 A; 1EN6 A; 1OZ0 A; 4FLV A; 1J5E B; 4I50 B; 4JI6 O; 3N27 A; 2L35 A; 1PNL A; 2BE3 A; 5CA3 A; 4UVA A; 1VQ6 V; 5H2F Z; 4ZI7 A; 1I7F A; 4CBC A; 4AI8 A; 4CH5 A; 3UM7 A; 4LWS B; 4MVO A; 4RUF A; 1SA0 B; 3S3W A; 2VQF O; 1TGO A; 3IAY A; 2F43 G; 5J2U A; 2Q8V A; 4LFB O; 3EHB B; 3RT3 C; 4AQY O; 2FTK A; 4ZI7 B; 2DOS A; 3A0R A; 3ZMZ A; 5EZY A; 2LGQ A; 3HB3 B; 4RUE A; 1BQZ A; 5J2U B; 4JI8 O; 4WCE V; 1IXB A; 4QE9 A; 1KB9 F; 4DV6 O; 1XL6 A; 4JZG A; 4LFB B; 4W4L A; 4AIL C; 4AQY B; 2KG7 A; 2ZE6 A; 1SQF A; 3AG1 B; 4PA6 A; 5EZY B; 5KAF Z; 1V54 B; 4GX1 A; 1NH2 D; 3MHH C; 4IT5 A; 2IH3 C; 1Q82 W; 3AK2 A; 3X2Q C; 1BQ0 A; 3JD2 A; 4MSW C; 4LBE C; 1V54 C; 2ILM A; 1G4Y B; 5GTI Z; 4E2L A; 4KHP O; 1Q86 W; 4U7O A; 4JYY A; 3F5T A; 1PNM A; 2ZXW C; 1WAZ A; 2YID A; 1I0H A; 3CRC A; 4O4J B; 1U96 A; 3CX5 F; 4EFE A; 4BR6 A; 2PGG A; 1NI8 A; 1WN7 A; 2EIM C; 2BOC C; 1KUQ A; 4JGS A; 3WB2 A; 1K9M W; 1L0N H; 2EX3 A; 2UUB B; 5EC1 C; 1QVG U; 4P2Z A; 4H13 B; 1KP3 A; 4KHP B; 2QKA A; 3H1J H; 1R6K A; 4J10 A; 4IYI A; 2F93 B; 2QWQ B; 4EEQ A; 2XAF A; 3QVN A; 1V55 C; 1SF9 A; 3FKS G; 4DV5 O; 3A0B Z; 2ZQM A; 5B1B C; 5JCO C; 3LSU A; 2Z3Y A; 4DW1 A; 3CCR V; 1B04 A; 1DF4 A; 4JI1 O; 4TSF G; 3KKY A; 2EIL B; 3WB1 A; 4FFK A; 3K0G A; 2DYS C; 4OPA A; 5LL6 Y; 3R66 A; 3HKD A; 4WFA V; 3DSQ A; 1VF5 B; 2AHZ A; 2Y4T A; 2YC0 A; 4DV5 B; 2F4V O; 4PHZ A; 2XHB A; 2Q68 A; 2AHY A; 1R3L C; 1CXZ B; 1B06 A; 4JYB A; 4LP8 A; 1YIJ V; 4DV2 O; 5LMU O; 3BY6 A; 4HNA A; 4MVZ A; 4ZOL A; 1E79 G; 1VMG A; 3B77 A; 3CCM V; 4JZ2 A; 3QO5 A; 1DTO A; 3ZHV A; 4LF6 O; 4NKG B; 4O2A A; 1ZUQ A; 4I9W A; 1GN6 A; 5CA1 A; 4CC5 A; 4W4K A; 4J41 A; 1IBK O; 5B1A C; 2XTA A; 5LMU B; 4H37 A; 3SPH A; 4HNA B; 4UUJ C; 4ZOL B; 1FJG O; 1P4R A; 1YJ9 V; 5JJN B; 1AVM A; 1GK9 A; 3ETE A; 4O2A B; 3VQV A; 4DV7 O; 4FZ0 A; 4MS2 A; 3BHP A; 5CA1 B; 1A32 A; 4JAV A; 4LF6 B; 2IJJ A; 4MW8 A; 2KQX A; 4I55 A; 3FAV B; 3LNM B; 1FXK A; 1PL4 A; 3FB6 C; 1Y76 A; 4PDL A; 4D7T A; 1Y4M A; 2LJ2 A; 5LOV B; 1URF A; 1VAR A; 4J9Y B; 1YTF B; 1JX9 A; 3BVO A; 2UUC O; 1FJG B; 3B4S A; 1E1R G; 4PA7 A; 3QF7 A; 3E2E A; 5BXZ A; 5EBW C; 5LBQ A; 2XAJ A; 4NXN B; 3J81 N; 1PKX A; 1H2G A; 4I55 B; 3ABL B; 1AIL A; 1FXK B; 1BSM A; 2DYR B; 1Y76 B; 4UV8 A; 1AB3 A; 3CXH F; 3ABM B; 1FD9 A; 1R6T A; 5F2V O; 3JAK A; 3C90 A; 4UCT A; 2DYR C; 2DWE C; 1HWY A; 2YIB A; 5K1X A; 3B8N A; 2QWP B; 2PUS A; 1Q7Y W; 4TUY A; 4U7N A; 3HKC B; 3SPC A; 2VWJ A; 3JAW A; 3U11 A; 1NKD A; 1DLB A; 4N21 A; 1Z2G A; 5E1A C; 3JAK B; 4DV0 O; 3ZMT A; 3SJA C; 2PTM A; 2QJ1 A; 3MDS A; 3OR7 C; 3L73 H; 4TUY B; 2RQ6 A; 3JAW B; 3JCZ A; 2XAS A; 3B8M A; 1SC5 B; 2DWD C; 4HYO A; 3SJC C; 4DV0 B; 2LW1 A; 2UXD O; 1B6Q A; 1BHB A; 4OPH A; 1RP3 B; 2Y0P A; 4J7Z A; 2FML A; 1L1F A; 2NNU A; 3UO3 A; 3B2E E; 2P06 A; 2HVK C; 1GM7 A; 1BT8 A; 3CCU V; 1VQ8 V; 1YXB A; 1H2N A; 3RYC A; 5CN0 A; 1COW G; 1IBL O; 1U97 A; 3IJ4 A; 1NS1 A; 2IJH A; 1F51 A; 5EK0 A; 1HNZ O; 2WLJ A; 1FFT B; 1NTM H; 4UCU A; 2QTS A; 2UXD B; 3JAM N; 3DTU B; 1JMK C; 3OW2 U; 2E75 B; 2R9I A; 3A2F A; 2DN9 A; 3CSX A; 3VQX A; 1XIL A; 3OMA B; 1S5J A; 1WNS A; 3QO8 A; 4YY3 B; 1HNW O; 3JAS A; 1H38 A; 1IBL B; 5EBL C; 1Q8I A; 5FPR A; 1FYJ A; 5EBM C; 4B3T B; 3JD4 A; 2F95 B; 2OYQ A; 1F7Y A; 3SYA A; 2Q7G A; 3JAS B; 3S3X A; 1HNW B; 3CRQ A; 3ZS8 C; 1PPJ H; 1RSO A; 3SPG A; 5CBH A; 5KLV H; 2CGN A; 1YHQ V; 3MAQ A; 1J95 A; 5LHG A; 4TV8 A; 4Z1M G; 1N33 O; 1R73 A; 1SQB H; 2QM7 A; 3ICX A; 4DR7 O; 4WFG A; 4DYL A; 3AK3 A; 2UXC B; 1G1X B; 3RW0 A; 3KG2 A; 1RSO B; 1ZL8 A; 3FD9 A; 1N0J A; 1Q5O A; 3OEH G; 1AP6 A; 2QM4 A; 4I0X A; 4QPK A; 2JRI A; 3E83 A; 2E3C A; 4TV8 B; 4EFB A; 4IHJ A; 1M4U A; 2EIN B; 5CMU A; 2A06 H; 3F5W C; 1N33 B; 1JR9 A; 5BMV A; 4DR7 B; 4HAM A; 4J9Z B; 2Y48 A; 1ZL8 B; 4I0X B; 3OD4 A; 3ABU A; 2LFR A; 4IHJ B; 2A0L A; 1MZE A; 3D3I A; 2YI8 A; 1WP7 A; 3L9D A; 2AXT Z; 1TAE A; 5KHK A; 3STL C; 1VQ5 V; 1SQV H; 3I56 V; 3ZBH A; 4H44 B; 1AI4 A; 3B40 A; 3OE7 G; 3D3Q A; 2YS8 A; 4G2K A; 4NTX A; 1AJQ A; 3BA9 A; 3WB0 A; 3UCS C; 3FB7 C; 3Q4H A; 4GX2 A; 2QM8 A; 2QWN B; 4DV4 B; 3TXS A; 1XQ8 A; 4NXM B; 1M93 A; 4DR5 O; 2W6J G; 2GTA A; 3PJS K; 4XBF A; 5CB4 A; 2ZE8 A; 2F66 C; 3P32 A; 1VF6 A; 1SKV A; 4H0L B; 3Q4H B; 1EM1 A; 4ZHQ A; 1VP7 A; 5EIB D; 1K4D C; 4LFA O; 3ZMU A; 4NYK A; 1N32 O; 4X20 A; 4QPJ A; 3ZMS A; 3ABT A; 3HKE A; 4DR5 B; 3ZN0 A; 3ZCC A; 5CB4 B; 2WLI A; 2O57 A; 1MMM A; 1K5Q A; 1L8D A; 3M8A A; 4ZHQ B; 3L74 H; 2ZIO A; 1BL8 A; 2B9Z A; 3GWO A; 3TK1 A; 2H8P C; 1QLE C; 1VF6 C; 4MVU A; 4X20 B; 2E76 B; 1R3I C; 1RPO A; 4LFA B; 2Q73 A; 4LF5 B; 3HKE B; 4FJC C; 2ZE7 A; 1N32 B; 3DGE A; 5FL7 G; 3N2K A; 2WLI B; 4B7K A; 3E86 A; 1K33 A; 1BS3 A; 1Y74 B; 5B3S B; 4DV1 O; 2HR3 A; 3QO7 A; 5GON A; 4J7J A; 2EZO A; 4GKJ O; 2GHY A; 3U10 A; 2LW7 A; 1OCR C; 1GRJ A; 1YSC A; 1KMI Z; 3LDD A; 4QIW F; 3G6E V; 4UB8 Z; 4P9O A; 3T4Z A; 4LH6 A; 1JJO A; 3UT5 A; 5GON B; 1MOF A; 1KEC A; 1M56 C; 2MK3 A; 4I50 A; 3FYI B; 1V9P A; 3ZRS A; 4GX0 A; 1OCO C; 1XEQ A; 4OX9 O; 2Y69 C; 2BTO A; 2PYL A; 4X1Y A; 4O2B A; 1ZTE A; 3T1H O; 3UT5 B; 2HG5 C; 5DN6 G; 2X6A A; 4CH4 A; 4RQF A; 1NH2 B; 4X64 B; 4DO2 A; 1SQP H; 3JSL A; 1LUW A; 4CC6 A; 1W2B U; 2HHH O; 5IYD O; 4G27 B; 1F4N A; 3AG4 B; 5B1O A; 5HFL A; 2CTQ A; 4PDM A; 4LCU C; 4O2B B; 4X1Y B; 4B3R B; 3AG2 B; 5H9C A; 4GKK O; 1SES A; 3T1H B; 5D5Q A; 1L0L H; 2E74 B; 5LMN O; 2OIE A; 2WSS G; 2OWO A; 2PYJ A; 4FLW A; 5LXT A; 4LF9 O; 2ODM A; 4JI6 B; 3SGI A; 3AG2 C; 3CC4 V; 1X4T A; 2XAG A; 2RJZ A; 2WA4 A; 2JS5 A; 4JI5 O; 4JI7 O; 2ZIN A; 1JJ2 U; 1GN2 A; 1VQ7 V; 4JYC A; 2VQF B; 2UU9 O; 5LXT B; 1R3K C; 3C3T A; 4DK0 A; 1XOU A; 1XNR O; 4LF9 B; 4HBN A; 3AK1 A; 2UXB O; 5LA6 A; 1T5E A; 4O4J A; 1UPG A; 1VQ9 V; 3T1C A; 1S77 D; 1DK1 A; 3AG1 C; 4JI8 B; 4JPR A; 4I9Q A; 4DV6 B; 2R70 A; 3CPW U; 3A8T A; 4DUY O; 2XT9 A; 1K92 A; 4JTC B; 1KC8 W; 1XNR B; 5LGT A; 3CMA V; 5DEC A; 3AEI A; 5LA6 B; 2Q7H A; 1I5Y A; 2UXB B; 3HKB A; 3OAA G; 3H1L H; 4JAA A; 4PA9 A; 4FMT A; 2ZDI A; 3DC6 A; 2X7R B; 3GWK C; 4IGG A; 3G71 V; 3BPZ A; 3K9A A; 2XAH A; 2GUZ A; 3LSS A; 3JYC A; 4DUY B; 2A3Q A; 3UKM A; 3ASO B; 3HKB B; 4CH3 A; 1BGY H; 5D5P A; 1N4C A; 4X8A A; 5EC2 C; 4MVR A; 3OUS A; 3SPI A; 2W6I G; 1EN4 A; 2CUG A; 3ZN1 A; 4GT1 A; 1GN3 A; 4EB6 A; 2GUZ B; 4X65 O; 3CYO A; 1H2S B; 5A9G A; 1RFY A; 2QR4 A; 5ITZ A; 5JJE B; 1Q81 W; 3THO A; 2EIL C; 2OCH A; 2YDE A; 3PN1 A; 4FM2 A; 2WPD G; 3E22 B; 1DF5 A; 4EB6 B; 5IJ0 B; 4JI1 B; 5ITZ B; 3K5L A; 3ZJZ A; 2RMK B; 3E89 A; 1WA8 B; 4UCV A; 4KL1 A; 2F4V B; 3P30 A; 4L8J A; 4FLT A; 1NR1 A; 3FB8 C; 3E35 A; 3FAV A; 4OXS A; 1N34 O; 4D6T H; 3G6B A; 2HVJ C; 1OCZ B; 4DV2 B; 2IM9 A; 3CCE V; 5IJ9 A; 5LOV A; 1Z5W A; 1AR4 A; 2ATK C; 3CXC U; 4PDR A; 2AZ0 A; 1X59 A; 1OV9 A; 3OEE G; 3ZRV A; 4P30 A; 4FPP A; 1Q6U A; 4CS2 A; 4X1K A; 4R6Z A; 3HPL C; 3TJT A; 3CME V; 1YJN V; 1IBK B; 4JAU A; 5IJ9 B; 4K35 A; 4I7Z B; 4NB5 A; 4UFZ A; 2CH7 A; 2KKW A; 4YHH O; 4GUN A; 5CBF A; 4K3A A; 4X1K B; 4DV7 B; 4TQD A; 1VEW A; 3HKC A; 4ICG A; 3OTF A; 2P4K A; 3ZHR A; 2BOB C; 2ZIM A; 1M57 B; 3ABL C; 1FXK C; 2QGN A; 1UFI A; 2CH7 B; 2Y4U A; 2UUC B; 1M57 C; 1PP9 H; 3ABM C; 2H94 A; 3RWR D; 5IWA O; 4YHH B; 3BAB A; 2Q7E A; 2P7T C; 2JDI G; 5L3E A; 1QR8 A; 2YUA A; 2EZP A; 3OFN G; 4YJ2 A; 4BWA A; 3EFF K; 1SRY A; 1NU1 H; 2LP7 A; 3F7Y C; 1WP8 A; 3VBB A; 2EJ7 A; 1D5N A; 4FIP C; 4JI4 O; 2ZR2 A; 4UV9 A; 2RCV A; 5J9P C; 5LYJ A; 4F6R A; 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1HNX B; 1FAF A; 3H1H H; 3BRC A; 1IXM A; 4KUM A; 2N74 A; 4JF3 A; 4QE7 A; 2EUL A; 1XHX A; 2LGW A; 5KAI Z; 2UXX A; 2ITC C; 4DR4 O; 2VQE O; 3RYI B; 1GO3 F; 3SR2 C; 5EIB C; 4A5U B; 2ZKO A; 1TA8 A; 2JK5 C; 4MVM A; 4JI0 O; 1SS3 A; 4JI2 O; 1M9N A; 2A7W A; 3SJQ C; 3JD0 A; 4EKW A; 1E1Q G; 4KFM A; 4AHC A; 1VIB A; 1LR1 A; 1D5A A; 4F4L A; 2WLH A; 2FKX A; 1Q6I A; 4DR4 B; 3IC7 A; 4JTA B; 5BR8 O; 1G8M A; 1RM1 B; 2AW9 A; 1OJH A; 2M7W A; 2DMX A; 4GCZ A; 2OTL V; 4X88 A; 4MTF A; 4XDJ A; 2X6B A; 2B1G A; 1GMG A; 4LC1 A; 4JI0 B; 4JI2 B; 4C7U A; 1BZK A; 2CAZ C; 5KHG A; 3F7V C; 2KB1 A; 4JTD B; 2P67 A; 2NN4 A; 2OT5 A; 4LF8 O; 3T4D A; 1US6 A; 3ABK B; 2P6J A; 1MSW D; 2V7Q G; 4DRX A; 4U3F H; 3UQ8 A; 3O9O A; 2R9A A; 2P22 C; 5B66 Z; 1NVP D; 4UCR A; 4L87 A; 1KBH A; 4R7C A; 4TQF A; 4JI3 O; 3B09 A; 3RVY A; 3CHX A; 4FFB B; 1Y74 A; 2X6C A; 4B3S O; 2GV9 A; 2OCC B; 1QBZ A; 1IZ3 A; 2YXY A; 2EBO A; 4DRX B; 4LNU A; 4BIO A; 4DK1 A; 2OIG A; 4J11 A; 4FZ1 A; 4UCS A; 2WA3 A; 2FL4 A; 4R8C A; 1R3J C; 2QWR B; 2ADP A; 4X89 A; 1FFX A; 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