The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
50
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sequence length |
142
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structure length |
142
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Chain Sequence |
SLSDKDKDSIKAFWAKISPKAEDIGADALARMLTVYPQTKTYFSHWKDLSPGSAPVKKHGKTVMGSVAEAVSKIDDLTNGLLTLSELHAFQLRVDPANFKILSHNLLVVLAQQFPNDFTPEVHVSMDKFLSLLSWSLSEKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein/oxygen binding
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| molecule keywords |
Alpha-chain hemoglobin
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| publication title |
Crystal structure of oxy-hemoglobin from Brycon cephalus
rcsb |
| total genus |
50
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| structure length |
142
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| sequence length |
142
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-11-13 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2ZSX A; 3WFU A; 2ZSR A; 5CN9 A; 1VXE A; 3WCW A; 1XZV A; 3G4Y A; 2QU0 A; 1MBC A; 3IC0 A; 1YG5 B; 4NXA A; 2XKH A; 3PIA A; 1AJ9 B; 3MVC A; 2ZSO A; 4HSX A; 3QJC A; 5JDO F; 3DHT B; 5JGG A; 3QJE A; 3ECX A; 1A0U B; 1HAB A; 1UX8 A; 4L7Y A; 4F4O B; 2O5O X; 1CG5 A; 3VRF A; 5HLQ A; 2FRJ X; 5MBA A; 3GQG A; 4N8T A; 5ILM A; 4O1T A; 3DHR A; 4UZV A; 4FH7 A; 4HRT B; 1G9V A; 5KER B; 4MQC A; 4FWZ A; 2AA1 A; 1YEV A; 4HBI A; 3S48 C; 1O1O A; 1FAW A; 3HHB B; 1CMY B; 3W4U B; 1Y35 B; 3G4V A; 4IT8 A; 1LH7 A; 1YIH A; 3OZU A; 2ZS1 A; 2ZSZ A; 4MQK A; 2SPN A; 1A00 A; 2EB8 A; 3VRE A; 3WCW C; 1Y0C B; 1B86 B; 2YRS B; 3DUT B; 3UHE A; 1IRC A; 5HU6 A; 1ABY B; 1A6N A; 2R4Z A; 1VXA A; 1Y46 A; 3K8B A; 3D17 A; 1MOD A; 3NFE B; 3WTG A; 1O1I B; 2FRF A; 1XZ2 B; 1XXT A; 1HAC A; 2GKM A; 6HBW B; 3B75 A; 3EU1 A; 4KMV A; 2HBF B; 3NG6 A; 1N9F A; 5SW7 B; 1MYH A; 2ZS1 C; 1O1K A; 1Y01 B; 1YOH A; 2W6W A; 2B7H B; 1QI8 B; 5MBN A; 109M A; 1LTW A; 1MKO A; 1HHO B; 2LH6 A; 2D5X A; 1OUT A; 1YEN A; 1LH6 A; 5EET A; 1S56 A; 2G14 A; 104M A; 1Y0A B; 1M9P B; 1LFQ A; 1NAZ A; 2PEG A; 2ZWJ A; 1Y2Z A; 2RAO A; 3ARK A; 1Y4R A; 5CHR A; 1XZ4 A; 1HCO A; 4YU4 A; 1G09 A; 1V5H A; 1BIJ A; 3AT6 A; 1O1M B; 4XDI A; 1LFY B; 5CN8 A; 3CIU B; 1YVQ A; 1UFJ A; 1J40 B; 1QPW B; 4MAX A; 1HDS A; 5CNG A; 1LH2 A; 1S5Y A; 1JY7 B; 1RTX A; 1G0B A; 2FRI X; 4FWX A; 1V07 A; 1HDA A; 3WCU D; 5E83 A; 1LA6 B; 3ZJL A; 1Y83 B; 1Y7C B; 2OIF A; 1JP8 A; 1VWT B; 2ZFO D; 1MLS A; 3D1K A; 2GKN A; 2GTL D; 1VRE A; 1FSX B; 1RQ4 B; 4U8U B; 3LHB A; 1MLF A; 3VAU A; 5EV5 A; 3BCQ B; 2G0S A; 1SPG A; 3GK9 A; 3ONZ B; 2MGM A; 3MKB A; 3OVU C; 2IG3 A; 1GLI B; 1CH4 A; 1Y8K B; 3KUN A; 1YOG A; 3UHH A; 1IOP A; 2XKG A; 3S1J A; 1Y4F A; 1MYF A; 2NRM A; 1SHR A; 4XS0 A; 4ROM A; 1B0B A; 3WCV C; 1THB A; 4G51 B; 1SDK B; 2AUO A; 4TYX A; 5HLU A; 2QLS B; 2ZSY A; 4FH6 A; 3D1A A; 3WCU A; 1YGF A; 1K0Y B; 1CBL A; 5JDO D; 2ZFO A; 3UHG A; 2GTL A; 2JHO A; 5E6E A; 4X0L A; 3UGY A; 1AJH A; 1K1K B; 1Y4P A; 3ED9 A; 1BAB A; 2DN3 B; 1EBT A; 1XZV B; 1NZ2 A; 2GL3 A; 1HV4 B; 1VXD A; 2G12 A; 3UI0 A; 1YIE A; 3E4N A; 2NSS A; 1XY0 A; 3PIA B; 4M4A A; 4F6F A; 3PI1 A; 1NZ3 A; 2QSP B; 3UHR A; 1ECN A; 3QJC B; 1MOA A; 2Z6T A; 5EU2 A; 5AZQ A; 3QJE B; 2WY4 A; 5HLX A; 1X3K A; 1CG5 B; 3VRF B; 3ARJ A; 1URY A; 1AJG A; 1CH5 A; 1MBI A; 1MLO A; 1MWB A; 4DC7 A; 2V1K A; 1G9V B; 3LB1 A; 4MQC B; 2AA1 B; 3DHT A; 1OBM A; 1A0U A; 3WCU C; 3KUO A; 2ZFO C; 1UIW A; 1MLN A; 5KER A; 1ECA A; 4IRO A; 2HHD B; 3QZX A; 1CMY A; 3K3U A; 3W4U A; 1YE2 B; 2W6X A; 4F69 A; 2Z6N B; 1W92 A; 3O89 A; 1YCA A; 1GDI A; 4F6J A; 1SDL B; 1BBB B; 4NI0 B; 1GZX B; 2BLJ M; 5HU6 B; 5JDO E; 1GJN A; 4O2G A; 1Y0C A; 3UGZ A; 1RTE A; 1CG8 B; 2YRS A; 1GCW A; 1HGA A; 1J7Y A; 3D17 B; 3G46 A; 4F6G A; 3WTG B; 2VEB A; 3UHC A; 1MYT A; 1HAC B; 1YGD A; 1CP0 A; 5CN6 A; 1ABY A; 2D6C A; 4ZVA A; 5JDO C; 4L2M A; 3NFE A; 1O1K B; 3UHU A; 2EF2 A; 4M4B B; 1NQP A; 1I3D A; 3UHD A; 6HBI A; 2CMM A; 2O5T X; 1O1I A; 3UBC A; 3KMF A; 4KMW A; 1XZ2 A; 2DXM B; 1MYI A; 1OUT B; 1YEN B; 2HBF A; 1F65 A; 2O5Q X; 1O1N B; 2AUR A; 3QQQ A; 2B7H A; 1G0A A; 1S69 A; 2RAO B; 1VHB A; 1XZ4 B; 1HHO A; 1HCO B; 2MYE A; 1G09 B; 3WCT B; 3ZH0 A; 2GLN A; 5CN5 A; 1BIJ B; 3AT6 B; 3E55 A; 3V2V A; 1EMY A; 1YMA A; 2D2N B; 2O5L X; 3P5Q B; 4H2L A; 1R1X B; 3AQ5 A; 1NWI A; 4ODC B; 2G11 A; 1JP9 A; 5KDQ A; 1ITH A; 1HDA B; 1Y45 A; 1LFY A; 1Y85 A; 3MJU A; 1LFZ B; 3FH9 B; 1J3F A; 1BJE A; 3KMF C; 1DXU A; 1J40 A; 1A9W A; 1NWN A; 1QPW A; 2C0K A; 1JY7 A; 3D1K B; 3GDJ B; 3GQP B; 3GQR A; 1T1N B; 5HBI A; 1LH1 A; 3AQ9 A; 1YZI A; 3IC2 B; 3QZZ A; 3HEN A; 3QM7 A; 1C7C B; 1LA6 A; 1Y83 A; 1Y7C A; 3ORD A; 1WLA A; 4WJG A; 3ZJH A; 2ZSN A; 1FSX A; 1RQ4 A; 3PI9 A; 1Y4F B; 3BCQ A; 2ZFB A; 5EE4 D; 5D1V A; 1DO7 A; 1SHR B; 1UVX A; 1SWM A; 4XS0 B; 3LB4 A; 1BUW A; 1DXT B; 1O1J B; 1Y8K A; 1BZ0 B; 3QM5 A; 5CNE A; 112M A; 1H1X A; 2V1I A; 1YGF B; 5EYS A; 111M A; 3HXN B; 2R4Y A; 1CH1 A; 1NPF A; 2ZFO B; 4OF9 A; 3HF4 A; 3OZW A; 5C6E A; 7HBI A; 3QMA A; 1FHJ A; 2GTL B; 2QLS A; 1MLK A; 3ZJN A; 4X0L B; 2O5B X; 2H8F A; 1BAB B; 2ZLW A; 3MOU A; 1MLH A; 1K0Y A; 2MYA A; 1WMU B; 1XY0 B; 1JDO A; 4FC3 A; 1DXC A; 2W72 B; 2MGJ A; 4LPI A; 1JZK A; 1IWH B; 1K1K A; 1RQA B; 2DN3 A; 4U8U C; 1HBR A; 1YE0 A; 2BW9 M; 2HCO B; 2DHB B; 3UHB A; 1FLP A; 1HV4 A; 2VRY A; 2HZ3 A; 1Q1F A; 2QSP A; 3G4Q A; 3WFW A; 3H58 A; 2R80 A; 3UHI A; 1V4X A; 5E29 B; 4ROL B; 1XYE B; 1J3Z B; 1BZ6 A; 1EW6 A; 2W31 A; 1LH5 A; 3ZJQ A; 1YVT B; 1UIW B; 1MNO A; 4IRO B; 1MTK A; 101M A; 3SZK B; 3QM6 A; 2HBG A; 5B84 A; 1S6A A; 1FSL A; 1MLM A; 4DC8 A; 5CHQ A; 3WHM B; 2HHD A; 3EDB A; 2EKU A; 4O35 A; 1MCY A; 1YE2 A; 1V9Q A; 1Y8I B; 1GCW B; 1HGA B; 1J7Y B; 2Z6N A; 1XZ5 B; 1SDL A; 1BBB A; 4NI0 A; 3UHK A; 1GZX A; 3AQ7 A; 1YGD B; 1NEJ B; 3S1I A; 1C7D A; 3WCT D; 1CG8 A; 1GBU A; 1JF4 A; 2O5M X; 2DN1 A; 3ZOM A; 1MTI A; 1NQP B; 3TM3 A; 3S66 A; 2D2N D; 1MOB A; 1GDJ A; 3G52 A; 4M4B A; 2FAL A; 4N7O B; 1G0A B; 4F6B A; 1HJT A; 1V75 A; 2MGL A; 2DXM A; 3VHB A; 4KN3 A; 3PT7 B; 4B4Y A; 5CND A; 1MLJ A; 1O1N A; 3ODQ B; 1UT0 A; 105M A; 4H2L B; 3GOU A; 2VYY A; 3D7O A; 1PBX A; 3WCT A; 1Y0W B; 4KJT A; 5KDQ B; 5B85 A; 3V2Z A; 1Y45 B; 1Y85 B; 3G4U A; 3MJU B; 2Z6S A; 2SPL A; 2D2N A; 2D2M D; 3HEP A; 1DXU B; 3P5Q A; 5F0B A; 1R1X A; 4MBN A; 3HYU A; 4ESA B; 107M A; 3GQR B; 1Y5J B; 4ODC A; 3G53 A; 3GKT A; 1S61 A; 1YZI B; 3A5B A; 1HBH A; 1YHU D; 1MNH A; 1JZL A; 1LFZ A; 2G0X A; 2QFK A; 3FH9 A; 1MLQ A; 4NK2 A; 2VLY A; 1J3Y B; 1OFK A; 1NZ4 A; 3GDJ A; 3GQP A; 1T1N A; 4NZI A; 2MGK A; 3PI9 B; 3IC2 A; 1UFP A; 2ZFB B; 1GDK A; 1LHS A; 5CMV A; 1C7C A; 3UH7 A; 1MWD A; 3ECZ A; 1JEB A; 4NS2 A; 1BUW B; 1QSH B; 3WCT C; 3ZJS A; 2D5Z B; 5C6Y A; 1JZM A; 3A0G A; 1NZ5 A; 1A01 A; 3RJN B; 1DLY A; 3MN0 A; 1LFV A; 3UHV A; 1LFL B; 2D2N C; 3HF4 B; 1CH9 A; 5C6E B; 1DXT A; 1CQX A; 4VHB A; 1O1J A; 1FHJ B; 1BZ0 A; 1Y5K A; 3BJ1 B; 2ZT3 A; 1TES A; 1J52 A; 1M6C A; 2ZLU B; 2H8F B; 1Y0T B; 1CQ2 A; 2ZLW B; 1QXE B; 1YHU A; 1FDH G; 1XCH A; 3HXN A; 4HRR A; 3MYN A; 3LR9 A; 4NXC A; 1OR6 A; 2MB5 A; 2EKT A; 5ILR A; 4FC3 B; 4DWU A; 1LUE A; 2HHB B; 1HLB A; 1HBR B; 1YE0 B; 2GRF A; 2QMB B; 1WMU A; 2ZSP A; 1DXD A; 1Y8H A; 2VHB A; 2W72 A; 3BJ3 A; 1YHR B; 1IWH A; 1RQA A; 3G4R A; 1JF3 A; 4DWT A; 2R80 B; 3E5I A; 1V4X B; 2HCO A; 2DHB A; 4O4T A; 1N9X A; 1Y4Q B; 3WR1 B; 1YHU C; 1A0Z A; 5E29 A; 4ROL A; 1I3E A; 3OZV A; 110M A; 1J3Z A; 1XYE A; 1OR4 A; 1J41 A; 5EUI A; 3NML A; 3MYM A; 3UHS A; 1GCV B; 1YVT A; 2GTL C; 2XYK A; 1G08 B; 1MOC A; 1MGN A; 1NS9 A; 4TWV A; 3SZK A; 1CO9 A; 1DO4 A; 2H8D A; 1CH3 A; 2BK9 A; 3MJP B; 3H57 A; 2W72 C; 1VXG A; 1CIK A; 3UHQ A; 3WHM A; 1MLU A; 1ABS A; 2BLH A; 1C7D B; 1Y8I A; 2ZLX B; 1GBU B; 1S5X B; 3QJB B; 1XZ5 A; 3OO5 A; 2R1H A; 2DN1 B; 2EB9 A; 5ILE A; 1DKE B; 1VXF A; 3QQR A; 3S66 B; 3SDH A; 1NEJ A; 4HSW A; 1Y4G B; 2SPM A; 1CBM A; 2GNV A; 2OH9 A; 3AG0 A; 1Y31 B; 1EBC A; 1UVY A; 2DN2 B; 2OH8 A; 1V75 B; 3ZJP A; 1JL7 A; 3VRG B; 2ZT4 A; 2G0Z A; 3LQD B; 4N7O A; 2NX0 A; 1GBV A; 2AV0 A; 2ZT1 A; 1MLL A; 1S0H A; 2Z85 A; 3AT5 A; 4N7P B; 3GOU B; 1WVP A; 3D7O B; 1PBX B; 3PT7 A; 2VYW A; 4WJG 1; 1OFJ A; 3ODQ A; 2ZLT A; 2GNW A; 3AQ6 A; 1Y4B B; 2EVK A; 3HYU B; 1Y0W A; 1OJ6 A; 2M6Z A; 1MYM A; 1RQ3 A; 4MXL A; 4NK1 A; 1HBH B; 1ASH A; 2ZSS A; 2ZS0 B; 3BOM B; 1YEO A; 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2H8D B; 3QM8 A; 1GCV A; 1N9H A; 1YEU B; 2W6V A; 2VM0 A; 1G08 A; 4QAU A; 3PT8 A; 2HBD A; 4MPM A; 5EE4 C; 1YH9 B; 1IBE A; 1A3N A; 2E2Y A; 3TLD A; 3OO5 B; 3MJP A; 4PQ6 A; 2R1H B; 2BWH A; 1VXC A; 1R1Y A; 2PGH B; 3R5I B; 4C44 A; 1MNI A; 2D60 B; 5ILP A; 1Y09 B; 4F68 A; 3AQ8 A; 1SPE A; 2ZLX A; 1ECO A; 1HLM A; 2VLX A; 1S5X A; 1Y8W B; 3QJB A; 5CNF A; 2ZT2 A; 1IRD B; 2MYC A; 5D5R A; 1DLW A; 2ZLV B; 1DKE A; 3ZJI A; 1RPS B; 2KSC A; 2LH5 A; 3UHY A; 2O58 X; 1Y4G A; 1HGC A; 3OJ1 A; 1BZZ A; 1Y31 A; 3ECL A; 2DN2 A; 1IDR A; 4UIQ A; 4JYQ A; 1DXV A; 1GBV B; 4MQH A; 2H35 B; 1S0H B; 3QM9 A; 4GZG A; 5CNC A; 3ZJJ A; 2ZS0 D; 3AT5 B; 1COH B; 2HHE A; 2LH7 A; 3EDA A; 2MHB A; 3WCV D; 3M38 A; 3VRG A; 4MQG A; 1V4U A; 1BZR A; 3BJ2 B; 4N7N A; 2ZLT B; 3LQD A; 2SPO A; 103M A; 1EWA A; 4WCH D; 2GRH A; 1A4F A; 1FN3 B; 1DWS A; 4N7P A; 3RGK A; 1XZU B; 3SDN A; 4ILZ A; 4UUR A; 2M6Z B; 1RQ3 B; 3RJ6 A; 1J7W B; 2LH2 A; 1J7S B; 2V1H A; 1M6M A; 3M3B A; 4MQI B; 1MDN A; 1CLS B; 3IXF A; 1Y4B A; 1HSY A; 1YEO B; 3DR9 A; 2OHB A; 2HBS A; 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