3BEXA

Type iii pantothenate kinase from thermotoga maritima complexed with pantothenate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
MDPMYLLVDVGNTHSVFSITEDGKTFRRWRLSTGVFQTEDELFSHLHPLLGDAMREIKGIGVASVVPTQNTVIERFSQKYFHISPIWVKAKNGCVKWNVKNPSEVGADRVANVVAFVKEYGKNGIIIDMGTATTVDLVVNGSYEGGAILPGFFMMVHSLFRGTAKLPLVEVKPADFVVGKDTEENIRLGVVNGSVYALEGIIGRIKEVYGDLPVVLTGGQSKIVKDMIKHEIFDEDLTIKGVYHFCFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Structural basis for substrate binding and the catalytic mechanism of type III pantothenate kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 77
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bexA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bexA02
1NGCA 3EO3A 1NGJA 3JS6A 3KZBA 4K41A 5FPEA 4BRDA 3CJ9A 5F0XA 1RFQA 3LDQA 3UKUB 5KPRA 1ESVA 3AY9A 4FWOA 2P9NA 2QWPA 4DQ8A 3VEYA 4BGBA 5AQZA 3LM2A 4PKHA 2ITMA 4FPBA 3ULEA 5BPMA 3LM9A 1MWMA 1DEJA 5JICA 1HUXA 2ZWHA 2Q1NA 4BR2A 3AAPA 3QBWA 5LJWA 3GOIA 2A5XA 3VOVA 4CZIA 4BC2A 3R6MA 1NGBA 2E88A 4FWRA 1GLAG 3JXUA 3UKRB 3VEXA 4BRHA 3ZETB 2QWRA 4H5RA 3S41A 4H0TB 3WEEB 4BRQA 2FXUA 2I7NA 1R59O 3U8XA 3EKUA 3O08A 3CJ1A 2H3GX 5AQNA 4CZJA 1NM1A 3CETA 3DXMB 5EX5A 1BA0A 3D2FA 3VEOA 3VETA 1ATNA 4JN4A 2D1KA 2BTFA 3MN9A 4O8KA 1ATSA 1H1VA 3CHWA 4ISGA 1K8KA 3D2EB 3QMLA 5JMVA 2D0PA 1S22A 2GEMA 3U9DA 2V7YA 3IDHA 1BG3A 4XEIA 1XUPO 4CD1A 3ZX0A 1YUWA 5AQSA 2A42A 1BUPA 5ADXH 4AM7A 4BC5A 3VEZA 5AFUA 5AQIA 4B1UB 1JCFA 3O8MA 2P9IA 3H1QA 2CH6A 5E84A 2P9LB 3H3NO 3VGKA 3WXKA 3J8AA 1LCUA 1HPMA 2AA4A 3R8EA 4CZMA 1HJOA 1TYQB 1HLUA 5BRFA 4ISEA 3QBXA 4BR9A 3O1WA 2CGJA 4BROA 3HTVA 2YCHA 3MK6A 5AQWA 2OANA 1HX1A 4KBOA 3O6WA 5EOYA 4CZGA 1OKJA 3AAQA 4CBXA 3QB0A 2YHXA 4QS8A 3ZX3A 4FSVA 1GLEG 3BF1A 5I9EB 5AZIA 5EY4A 3VPZA 2QXLA 2F9WA 3L0QA 4BRIA 2IVNA 3GBTA 1X3NA 4CI6A 2ASPA 5KPTA 4I6MB 1T6DA 4PL8A 3DJCA 2ASMA 4CD3A 1MA9B 4BR4A 3ATVA 4H5TA 2P9PB 3LDOA 4CZHA 4BRKA 4H03B 3DWLA 4DHYA 4BRAA 3QFPA 3ZEUA 1QHAA 2YJFA 4BR7A 3WUHA 4FWPA 5AQRA 4QS7A 4IJNA 2IIRA 3ZETA 2GTDA 3HI0A 3A5MC 1SZ2A 1Y64A 1IG8A 4CZLA 4F9OA 4AM6A 2Q0UA 1GLJO 5TKYA 4WQ4C 2P9KB 5B8HA 1KXPA 2I7PA 5BR9A 2P9UB 4ISFA 3I8BA 4LC9B 2ZF5O 3F9MA 1BOTO 1ZBSA 2FF6A 1U6ZA 4K43A 2AP1A 3D7EO 1WUAA 3BP8A 5BRHA 3A5LC 4BQLA 3EN9A 3QICA 4M7YA 4DB3A 1NWKA 3FZLA 2Q31A 1T44A 3WXIA 2NZTA 3FFKB 3VERA 3WT0A 2VWBA 3HM8A 2GWJA 3B8AX 2FSKA 5KQDA 5AQVA 4BG9A 3FZKA 4BRLA 4XH5A 1NGFA 1BU6O 4CJ7A 2D4WA 4FWLA 5AZJB 3WQUA 1YXQA 2E20A 3U4LA 4PKIA 1RGIA 2P9SB 3L6QA 3U9ZA 2HF3A 2A3ZA 3C7NA 4JD2A 1V4TA 2J4RA 1CZAN 3RSEA 2IVPA 2A40A 2QWOA 2FLOA 3TU5A 5BN9A 1NLVA 3O4WA 3HZ6A 1BO5O 1TUYA 1HKCA 2E8AA 2YI1A 3L4IA 5F2RA 3OHRA 4BG8A 4FO0A 4IXCA 2YHYA 3GL1A 4MLHA 2WUSA 5AQJA 5KPZA 1GLBG 2Q2RA 3ZX2A 3CQYA 1G99A 5AQUA 3EZWA 4JHDB 3MCPA 3DXKA 1MDUB 3CERA 3QDKA 1QZ6A 2QWLA 4A61A 4BVPA 5AQQA 5FPMA 3H6EA 2EWSA 4IJAA 1U2VA 3WXLA 3M6GA 4IWVA 4NO7A 3HBTA 5LY3A 4H5VA 2NRHA 3ENHA 4BRFA 3KVGA 1C0FA 1ATRA 5AQTA 1P8ZA 2P9NB 1Z05A 3G25A 1YAGA 4MO5A 5AQLA 2CGLA 3ULEB 4RTFD 2QM1A 3C0BA 1NMDA 3W0LA 1KAZA 3BUZB 4JAXA 3UKUA 1KAXA 4K42A 5EXWA 2PBDA 5AQKA 1NGGA 3CJAA 5ELZA 4QS9A 5JLFA 4PL7A 1BDGA 2ASOA 1D4XA 3O80A 4BR0A 1NGAA 1WOQA 4HWIA 3W3DA 3FZHA 2E2OA 5LJVA 1T6CA 3D2FB 3UKRA 3CI5A 2FF3B 4MO4A 2E2PA 1E4GT 4WQ4A 4BRNA 2QWNA 3WEEA 1C0GA 1K8KB 1YVNA 4E1JA 4H0XB 5BN8A 1QQMA 3H3OB 4BQZA 3DXMA 2YJEA 3A0IX 3IMXA 3VGMA 3FLCO 3MN7A 4RWTA 1IJJA 3ENOA 3MN6A 3CJ7A 3FZMA 1ZC6A 4H0YB 4L3QA 3CJBA 4FWKA 1X3MA 4H0PA 5BPNA 4BRGA 2P9IB 3D2EA 4A2AA 4IZ9A 3SMSA 4B1VA 3I33A 1ZXOA 1HKGA 1GLCG 4BREA 2D0OA 4B1YB 2FSJA 1JCGA 5AFUH 3M1FA 3O1BA 4RCHA 2ZGYA 4WQ5C 2VCPA 3GE1A 2KHOA 3SMPA 5AQMA 1V4SA 3M3ZA 1NGDA 5AQYA 5AR0A 4MLEA 1KAYA 2HMPA 2A6AA 1BWFO 1XC3A 2E1YA 3FGUA 4FOEA 3CJCA 4YDUC 4BRCA 4FL9A 2P9LA 1SAZA 3LDLA 4BVOA 3IFRA 4K25A 1TYQA 3BEXA 4FOIA 1NGIA 4XH4A 5AZIB 2BUPA 1NGEA 2F9TA 4FWSA 1J6ZA 4H5WA 1S3XA 4B1ZA 4FWQA 5AQHA 2VYPA 3O5BA 2IVOA 4HTLA 4GNIA 3LDNA 3WXJA 5F1XA 2CH5A 1SQKA 4H0VB 2Q36A 5AQPA 3ZEUB 2E2NA 2CGKA 1TUUA 2Q97A 3BF3A 2GELA 1LOTB 3SJHA 1E4FT 3ID8A 4I6MA 4H0OA 5AQFA 2Q0RA 5AQGA 2P9PA 1NGHA 1GLDG 1XQSC 4BGAA 3DAWA 3VENA 1GLLO 3VEWA 3KHYA 3AARA 3SK3A 4WYBA 5CE3A 3SLCA 3MMVA 1GLFO 2GWKA 2HF4A 2V52B 2W41A 3QFUA 3LDPA 3A5NC 2P9KA 2QW9A 1QQNA 2HOEA 2QWMA 4IO8A 2A41A 2P9UA 1EQYA 3VESA 4EFHA 3CQXA 3IUCA 4B9QA 3R9PA 3VF2A 5BRDA 4Y0WA 5BPLA 5BREA 1BA1A 5AQOA 4BRPA 2FSNA 4O5FA 4CBWA 4DCHA 3VF6A 3EL2A 4A2BA 4EHUA 3GG4A 3A8YA 1X9JA 2PAVA 2ZGZA 3MN5A 4CZKA 4EHTA 3P4IA 3VEVA 2UYTA 5EVZA 1HKBA 3H46O 4B1XB 4CZEA 3H1VX 5KQ8A 3C7NB 3FZFA 4JD2B 1QZ5A 3RSEB 4BR5A 4FWMA 5AQXA 3ATUA 4BC3A 3A5OC 5AZJA 4CBUA 4M63C 3EKSA 4B1WB 2P9SA 2E1ZA 4FPAA 2W40A 3VF4A 5E26A 5FPNA 1Z6RA 3VGLA 5JLHA 4EAHD 4PKGA 4EIAA 2YHWA 3LL3A 1RDWX 1QQOA 4BC4A 3TPQA 3H45C 4H5NA 5FPDA 4J8FA 3DXKB 1NBWA 4WQ5A 3UE5A 2E2QA 3GDQA 4NB4A 4FWNA 4CZFA 1DKGD 3FR0A 5ADXA 2GUPA 4M7XA 1DGKN 1U2VB 4XH1A 4GY2B 4YDUA 4C23A 2DPNA 4JHDA 2V7ZA 2QWQA 1MWKA 1JCEA 3CIPA 3WQTA 3UB5A 3HSCA 4JNEA 4A62A 1Q18A 2NLXA 3FE1A 4BRMA 4Z94A 2V51B 3MDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A5WA 2IC3A 2GV9A 1RT1A 4DFPA 4GKKK 1RFQA 1U4BA 4F4KA 4FWOA 3VEYA 5AQZA 4PKHA 4CJLA 4IO9L 3T7ZA 3DYAA 1BQNA 2Q1NA 5M1NA 3GOIA 3CG7A 1TK5A 1QQCA 3R6MA 4FWRA 3UKRB 2P5GA 3THYB 4O0IA 1UA0A 2G8KA 4H0TB 2FXUA 3C95A 4KHYA 1R59O 4FYDA 4H4MA 3U8XA 3O08A 5FRNA 1QE1A 4GKJK 2H3GX 2HBLA 1ZYQA 3DXMB 3THXA 1XC9A 4FLUA 1ATNA 2BH1A 4KO0A 4JKAA 2BTFA 3MN9A 1ATSA 1H1VA 3DLRA 3D2EB 5JMVA 1LWCA 4CJ5A 3U9DA 4DU4A 2V7YA 4QAGA 3LP1A 1BG3A 4F2RA 1XUPO 1VSEA 2UUAK 3VEZA 3RR8A 3H1QA 5E84A 1NJIO 3E9LA 4OPAA 4CE9A 2OYQA 3OYNA 1LCUA 4CZMA 1TYQB 1HLUA 1Y97A 4ISEA 1C6VA 5D3GA 2ZJRL 1EO1A 3PX0A 3OW2M 4JI5K 3CCVN 4KBOA 5I3UA 3O6WA 1X9MA 4OPJA 1ZBLA 4CBXA 2YHXA 4HHTA 1EKEA 1GLEG 3AV9A 2QK9A 1K73O 2D5RA 2QXLA 3L0QA 2Q3SA 4BRIA 4C1NI 4PY5A 4CI6A 4BE2A 4RW4A 4CEBA 4CJEA 3LANA 3LDOA 2WOMA 4CZHA 3MECA 3OYJA 3NF6A 4KPYA 4CHZA 3P1GA 1RILA 3ZETA 5GAGP 4RW7A 4JKEA 1HNXK 5J2QA 1Y64A 3PO4A 1IG8A 4F9OA 1ITGA 2QKKA 3TTFA 3O9QA 1RDAA 2P9KB 1VSMA 2RHKA 1WSHA 4LC9B 2WFBA 4YOXA 1BQMA 4K43A 1WUAA 1VQPN 4CEOA 3QIOA 4CFDA 1CZBA 4M7YA 2HHTA 4OPHA 5GADP 4AHTA 5M1FA 1D9FA 5CHIA 1RTDA 4LF8K 2FSKA 2KFNA 2E5LK 3HO1A 4IDKA 4DF8A 3ID6A 1LW2A 1BU6O 4CJ7A 2UXCK 2D4WA 2HHSA 1NKBA 1L3SA 1QSLA 4MQ3A 3WQUA 3RMDA 5M1OA 3HJFA 3OBWA 4PKIA 3C6TA 3NVKA 3IKMA 2PZSA 2A3ZA 3HVRA 3KLIA 3TU5A 2QEXN 5BN9A 2WC9A 3OS2A 3O4WA 2XHBA 3QETA 4JI8K 1BO5O 4U67L 4N5SA 4JKGB 3OHRA 3SPYA 4BG8A 4FO0A 1RDDA 3JYTA 2WUSA 2UUCK 3ZX2A 3HYFA 1WSFA 5AQUA 1I3AA 1NOZA 4JHDB 3QNNA 3PSFA 3DXKA 2O8BA 3F9KA 4BDZA 2ZE2A 3QDKA 1VAZA 2IAJA 1N5YA 5FPMA 4JS5A 3H6EA 3WXLA 1KQSM 3CC2N 3ISNC 4GW6A 4A57A 4DV7K 1YVUA 5LY3A 1XNRK 3O3GA 3ENHA 3OYGA 2UU9K 3KVGA 3KTQA 1RNHA 1N36K 2VWKA 2D0BA 4MO5A 3OYEA 2KKZA 2CGLA 1L3VA 2PY5A 4CJ4A 3MX2A 2VG6A 3AVLA 3DI6A 3W0LA 4CEAA 3SI6A 4LF9K 1KAZA 4Z4CA 5KGWA 5EXWA 3O4QA 1S5JA 2O4IA 3CJAA 4FZYA 4QS9A 3M8SA 3TAPA 5SWMA 3LWMA 1NKEA 4DSKA 3O80A 1WOQA 1S9EA 4HWIA 5LJVA 4FM2A 1YF5L 1HMVA 3SCXA 2W42A 3UKRA 1C0UA 3THYA 4CJVA 4DSEA 2VWJA 4H0XB 3AVAA 4ID5A 3OA9A 3H3OB 4BQZA 4CHOA 4KRFA 3DXMA 4DTMA 3RMAA 2HBMA 3K5NA 2PFUA 4FLVA 3CJBA 1X3MA 5BPNA 3D2EA 3I33A 4CJSA 4BREA 1XNQK 3VQ5A 4DS4A 1KVAA 4B1YB 1SV5A 3O1BA 4JRPA 4WQ5C 2FBYA 4KI6A 1NGDA 3L2VA 4CJTA 4MLEA 1KAYA 3FGUA 5JS1A 4FLTA 5FDLA 4FL9A 1REVA 4JS4A 3EE9A 4RW9A 1VSFA 3KK1A 3IFRA 1TYQA 3BEXA 5LL6Z 5GIOA 1RBSA 2UXBK 5K14A 2ZJQL 4GV9A 2BGGA 4XH4A 2BUPA 1NGEA 1J6ZA 1JL1A 3V9SA 4FJ7A 4IEEA 2OZMA 5AQHA 3THWB 2VYPA 4HTLA 3RMCA 1U04A 4MFBA 4GNIA 4CF9A 1L3UA 3NMUA 5F1XA 1SQKA 2E2NA 2Q97A 3VQPA 4HUGA 5KTQA 3QNOA 1E4FT 4A5BA 3SYZA 4K8ZA 1SL0A 1HJRA 1E3MA 2Q0RA 5I42A 3NF7A 1XQSC 4DQIA 1ASWA 1F21A 3KKSA 3CCEN 3KHYA 1Z25A 3AARA 4CEZA 5HRPA 3EY1A 3BDPA 3F73A 4CJ3A 2VGNA 4I9LA 2V52B 3S3OA 1TKXA 1S1UA 1IKWA 4OJRA 1DT9A 3HXMA 2P9KA 1QQNA 3OY9A 2QWMA 4FVUA 2A41A 3VESA 3IUCA 3ZSZA 3VF2A 3LAKA 3V6DA 4CF0A 5EU7A 3TARA 5AQOA 1SKRA 4N41A 1U49A 4O5FA 1BGXT 3ZCMA 2KQ2A 2XY7A 3GG4A 4FM0A 2PAVA 3MN5A 3CQ8A 4EHTA 2NRWA 3O9SA 2UYTA 5EVZA 4N56A 3QINA 4JD2B 3PX6A 4CJFA 4DWIA 3TAQA 3A5OC 1NKCA 2G8WA 4M63C 3EKSA 3SV3A 5FPNA 1FXXA 5IWAK 3VGLA 5JLHA 1OH6A 4EAHD 2XY8A 2ATQA 1Q9XA 4EIAA 3LL3A 1VSJA 4ILJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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