3BF1A

Type iii pantothenate kinase from thermotoga maritima complexed with pantothenate and adp
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
MDPMYLLVDVGNTHSVFSITEDGKTFRRWRLSTGVFQTEDELFSHLHPLLGDAMREIKGIGVASVVPTQNTVIERFSQKYFHISPIWVKAKNGCVKWNVKNPSEVGADRVANVVAFVKEYGKNGIIIDMGTATTVDLVVNGSYEGGAILPGFFMMVHSLFRGTAKLPLVEVKPADFVVGKDTEENIRLGVVNGSVYALEGIIGRIKEVYGDLPVVLTGGQSKIVKDMIKHEIFDEDLTIKGVYHFCFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Structural basis for substrate binding and the catalytic mechanism of type III pantothenate kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 73
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf1A01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf1A02
2FF6A 1NGCA 1ATRA 3F9MA 2IVNA 4J8FA 5BN8A 4CJ7A 4BGAA 3D2FA 3IUCA 4FWLA 1BDGA 3WXLA 5B8HA 4CZLA 3U8XA 4C23A 2P9IA 4BRLA 4A61A 2ZWHA 3ZETA 3LDOA 4WYBA 4O5FA 5KPZA 5BRDA 5AQQA 3VF4A 2VYPA 4BRQA 2E2NA 2E88A 2HF3A 4KBOA 4XH4A 1S3XA 3A5LC 3SLCA 1QZ5A 3VEVA 3I33A 5AQKA 4EFHA 1NLVA 2AP1A 2P9LA 3HI0A 3IMXA 4FSVA 4JD2A 1MDUB 3QB0A 4K41A 3VERA 2Q2RA 5E84A 3DXMB 3HM8A 3RSEB 3QFPA 2F9TA 5AQWA 3O8MA 4CBXA 2P9UB 3WXKA 5EVZA 1S22A 3ENHA 1HX1A 2PAVA 4CZEA 2DPNA 1TYQA 4PL7A 3VOVA 2FLOA 3U9DA 3HTVA 4CD1A 3AAPA 4FL9A 3ULEA 3JXUA 3FGUA 4QS7A 3MK6A 1QZ6A 4B1VA 1IJJA 1ESVA 1U2VB 4WQ4A 5FPDA 1XC3A 1QQNA 4IXCA 2CH5A 3MN5A 4BRCA 1BG3A 4HTLA 1QHAA 3TU5A 2P9NB 3D2FB 3DXKB 3WT0A 5AFUA 5FPNA 4JHDA 1TUUA 4B1XB 2P9IB 5KPRA 4M63C 4BR2A 3WQUA 3FZHA 3R8EA 1ZC6A 5BRFA 3ZX3A 3KZBA 5AR0A 2EWSA 4IJAA 1HJOA 4WQ5C 3ZETB 5JLFA 1T6CA 3H3NO 3ATVA 5AQFA 3S41A 5AQIA 4H0VB 4YDUA 4BG8A 2P9PB 3CETA 2E2QA 1OKJA 1KAZA 1MWKA 1BA1A 2ITMA 3VEYA 4XEIA 4BR5A 2Q0UA 3CHWA 1LCUA 3O1WA 5AZIA 4XH1A 3SK3A 3FZFA 2P9LB 3C7NA 4AM7A 1D4XA 2AA4A 4JD2B 3HSCA 1GLJO 1ZXOA 3QDKA 2V7ZA 4MLHA 4A2AA 4EAHD 4BRKA 5BPNA 4CBWA 3O1BA 4BVOA 3M3ZA 5EOYA 3MN9A 1V4TA 5BPLA 2E1ZA 3OHRA 2A40A 4H0OA 2GUPA 4B1UB 5ELZA 3DWLA 4H5RA 3ULEB 1ZBSA 5ADXH 3MN7A 4EHTA 5AQTA 2YCHA 4BVPA 1E4GT 5FPMA 4H0PA 4BRMA 1Z05A 1IG8A 4HWIA 5AQSA 2A3ZA 3KVGA 5E26A 3VEXA 1BWFO 1NGIA 3UB5A 4FPAA 1RDWX 3EO3A 5BREA 5AZJA 3R6MA 4JHDB 4BRFA 5F1XA 4EIAA 1U6ZA 3U9ZA 2IIRA 4BR9A 1GLBG 1T6DA 4IZ9A 3UKUA 1TUYA 2P9KA 2Q0RA 3LM9A 4A2BA 4FWNA 5AQYA 4BREA 4MO5A 1HKCA 3A0IX 4BC4A 3ATUA 3C0BA 4E1JA 3L4IA 3O08A 4BRGA 4B1WB 2D0OA 1KAYA 2FSKA 4RWTA 2GTDA 4JN4A 3EKUA 1BO5O 2QW9A 4QS9A 4BC5A 5AZIB 1YAGA 1RGIA 5I9EB 2FF3B 3VETA 1JCGA 2E20A 1JCEA 3MN6A 4CI6A 1NGHA 2BTFA 4CZMA 4BC3A 1HKBA 2QWPA 1HLUA 3WEEA 3DJCA 3JS6A 1YXQA 2F9WA 3H45C 3L6QA 4B9QA 4WQ5A 1Y64A 5JICA 2YI1A 1GLEG 1K8KA 5JLHA 4PKHA 4MO4A 3GOIA 1NGFA 2V51B 2V7YA 4BQZA 4BR0A 3VPZA 3SMSA 4F9OA 3ZEUA 2QWLA 4CZIA 5KPTA 1NM1A 4IJNA 5BR9A 2D0PA 2NZTA 3VENA 3FZKA 2GWJA 2E8AA 3LL3A 4DB3A 3DAWA 3MMVA 3IDHA 3HBTA 4FWPA 3UKRA 5AQXA 2IVOA 5AQUA 4CD3A 5AZJB 4FWSA 5LJWA 2CH6A 2GWKA 1GLDG 5BN9A 3H1QA 4H5VA 3UKUB 3AARA 2NLXA 2P9KB 3HZ6A 5AFUH 3M6GA 2W40A 5EX5A 2YHYA 1YUWA 3BF3A 1X9JA 4B1ZA 3LDPA 1KXPA 2Q97A 1MWMA 4BRIA 1KAXA 3U4LA 2A5XA 2YHWA 5KQ8A 4FWOA 3VEOA 2YHXA 4H0XB 3FR0A 1HKGA 3P4IA 1JCFA 1DEJA 3CI5A 1QQMA 3GBTA 5LY3A 4DCHA 3G25A 2PBDA 2A41A 3MDQA 3EN9A 3KHYA 5CE3A 3UE5A 5AQZA 3W0LA 4A62A 2Q31A 3WXJA 3SJHA 2D1KA 3EKSA 5AQNA 2ZF5O 4FOIA 4JAXA 4WQ4C 2FSJA 3WEEB 3GG4A 1TYQB 4FWMA 2ASOA 3D2EA 1K8KB 2OANA 4BRHA 1BU6O 4BR7A 5BPMA 1BUPA 4FWKA 3ZX0A 4H5WA 1X3MA 1SZ2A 2QWMA 3M1FA 3QICA 3LM2A 4CZGA 4BR4A 3FE1A 3GE1A 3ZEUB 1E4FT 3L0QA 3BUZB 2QWNA 4XH5A 1NWKA 3QBWA 3CQXA 4IWVA 2QWRA 1GLLO 2P9SA 4IO8A 5EY4A 4DHYA 3WXIA 3CERA 3R9PA 4YDUC 3LDQA 3D7EO 5AQHA 4K43A 2E2OA 3IFRA 2QWOA 3UKRB 3QMLA 4CZFA 4H5TA 3EL2A 2D4WA 2CGJA 2P9NA 2GEMA 1WUAA 2H3GX 4GY2B 1P8ZA 3DXKA 4LC9B 4GNIA 4CZHA 1ATNA 1EQYA 1HPMA 1NGJA 2VCPA 2GELA 2HF4A 1BOTO 3TPQA 4I6MA 4NO7A 4ISEA 2I7NA 2Q1NA 4K25A 4H0YB 3WQTA 1CZAN 3BEXA 3H3OB 5AQOA 1NGGA 2BUPA 1NBWA 2IVPA 3C7NB 4Y0WA 3VESA 1XUPO 3BF1A 2QWQA 3CQYA 4L3QA 1Z6RA 2P9PA 3AAQA 1GLAG 3EZWA 5AQGA 5F0XA 1Q18A 3CIPA 1NGEA 3AY9A 3CJAA 4BG9A 2ASPA 3ENOA 3A5MC 4ISFA 3QFUA 3H1VX 4BQLA 5F2RA 1H1VA 3A8YA 5KQDA 2I7PA 3D2EB 3CJ7A 1GLFO 1MA9B 3WUHA 1NGDA 2E2PA 1SQKA 4FWQA 3GDQA 1SAZA 1XQSC 4CZKA 1NMDA 2HMPA 4AM6A 3B8AX 3VF6A 4EHUA 5AQMA 4H03B 4BGBA 1DKGD 2KHOA 5AQJA 3QBXA 2FSNA 1GLCG 4FPBA 4NB4A 1C0GA 1G99A 4MLEA 3CJ9A 3ID8A 4H5NA 3FFKB 2QXLA 3W3DA 2P9SB 4H0TB 3O80A 2E1YA 3SMPA 4BRAA 5BRHA 1V4SA 5TKYA 5AQLA 3H6EA 3LDNA 2VWBA 4ISGA 1J6ZA 2YJEA 4B1YB 4BC2A 3VEWA 3A5NC 4RCHA 5LJVA 3VF2A 3BP8A 1NGBA 5AQPA 3A5OC 5AQVA 3MCPA 1T44A 1RFQA 4I6MB 1LOTB 4Z94A 4JNEA 2ZGYA 4CZJA 3VGLA 4BRDA 2YJFA 2W41A 2UYTA 4RTFD 2FXUA 4PKGA 2NRHA 3FZMA 4BRNA 5EXWA 1X3NA 3VGMA 3FLCO 2J4RA 3O6WA 4O8KA 1C0FA 1NGAA 2CGLA 4PKIA 3O4WA 1BA0A 2A42A 2ASMA 2HOEA 3DXMA 3I8BA 1HUXA 4CBUA 2CGKA 3RSEA 3CJCA 5AQRA 4QS8A 2P9UA 4M7YA 5ADXA 1WOQA 4FO0A 4FWRA 3LDLA 3O5BA 1R59O 2A6AA 5FPEA 3CJBA 1DGKN 1QQOA 4BRPA 4DQ8A 3H46O 4FOEA 4K42A 4BROA 4PL8A 2QM1A 1YVNA 1ATSA 3VGKA 5JMVA 3J8AA 2Q36A 3CJ1A 3FZLA 3ZX2A 2WUSA 1U2VA 2V52B 2ZGZA 4M7XA 3GL1A 3VEZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FF6A 3AO3A 3TSPA 1NGCA 1ATRA 3M8PA 5BN8A 3SBGA 5J2QA 1KCFA 4FWLA 4RW9A 3WXLA 4E7LA 4W5RA 3KKSA 3OJUA 4JK9A 4EP5A 4J2DA 4DF8A 5CY4A 2ZJQL 3LDOA 3MWPA 1S6QA 5BRDA 1RDBA 5AQQA 1E3MA 1VHXA 2VYPA 1U48A 2HF3A 3CCEN 1ITGA 3CCLN 1NLVA 2P9LA 1HQUA 3HI0A 4FSVA 4BACA 3SUPA 4JI5K 2X6NA 3QB0A 2UXCK 1T03A 2YKMA 1NKBA 2PFUA 3DXMB 5IWAK 3HM8A 1WBDA 1SUQA 3QFPA 4IEIA 5AQWA 3O8MA 5CZ1A 4CBXA 4CJ3A 3ZSYA 3CCRN 3WXKA 1BIZA 1OVYA 4GW6A 2BH1A 4M3WA 3OJSA 4Z4EA 2RKIA 1IKVA 4FLUA 4CFAA 1XNQK 1QZ6A 3OYJA 1UOCA 3DOLA 2XY8A 1NOZA 3PUFA 2CH5A 5JVHL 3MN5A 4CVNE 4BRCA 4AH9A 1BG3A 4QCLA 1Q8IA 3WT0A 5M1QA 1RBUA 3U6FA 3WQUA 3R8EA 4FJHA 3KZBA 3MXIA 3T1AA 3T1HK 4IJAA 3ZETB 4IG3A 1REVA 1T6CA 1EWQA 1VSKA 4YDUA 3CETA 1TV6A 1OKJA 1I3AA 3QEVA 3VQPA 3VEYA 4XEIA 3ZSXA 4BR5A 2Q0UA 2ETJA 3CHWA 3CM6A 1VQ9N 3O1WA 1WLJA 3TAMA 4XH1A 2VG7A 5GAHP 3FZFA 3C7NA 4JD2B 3TABA 3G0ZA 4PQUA 3QDKA 4EAHD 3RR8A 4GV6A 3NDKA 4FJ7A 3PO5A 3M3ZA 4WFBL 5BPLA 2G8VA 2E1ZA 4CJ5A 3I8DA 3DLLL 1NJXA 3SJJA 1YF5L 4GVEA 3DLBA 4H5RA 3L2VA 2FC0A 4EHTA 2GUIA 3SBTA 1IBMK 2GBZA 4H0PA 1QTMA 1Y97A 3KVGA 4G9ZA 1BL3A 4FPAA 4E89A 3TAPA 3EO3A 2Z1GA 3AVHA 4JLHA 3TSQA 4ZHRA 1FK9A 1YJNN 4JKCA 4BRFA 4M3ZA 4EIAA 1WSJA 3OYEA 1T6DA 2WBNA 1RBVA 3UKUA 3G4SN 1JXEA 2OPSA 2P9KA 4FWNA 3LP1A 4CGFA 2O8BA 4WFNL 1HKCA 3UIQA 4O55A 4BRGA 4B1WB 2GTDA 3EKUA 1BO5O 2QW9A 3MEEA 1YAGA 4OKKA 4CJTA 4FXDA 4KKOA 4Y1CA 4LF7K 3P83D 2A1SA 3ZT2A 2GX9A 1NKEA 3KLFA 3THWB 2KW4A 1D5AA 4CZMA 2QWPA 3U3YA 3WEEA 3DJCA 3JS6A 5FROA 3P5JA 3H45C 3L6QA 2YNHA 4B9SA 5A2QO 1K8KA 4AF1A 1KVCA 4CHOA 3GOIA 3RTVA 1HNXK 3CMEN 4DR7K 4F9OA 4KI4A 4JEPA 1NM1A 2E8AA 1FKOA 4FJIA 4FM0A 3IDHA 4F2SA 5DMRA 4B3OA 5AQUA 4JKHA 4CD3A 5HOOA 3HXMA 2GWKA 1YHQN 5BN9A 4OKJA 4CJRA 1VQKN 4AHUA 4OKEA 3M5RA 3DLHA 4OLAA 1VSMA 2W40A 4FM1A 5C42A 4YOUA 4JKBA 3ZT1A 3VA0A 1TK8A 2YHYA 2X78A 3BF3A 2G8WA 4JI8K 3THVA 4PY5A 4PUOA 3IG1A 2YHXA 5KRTA 1XMOK 1RDDA 1EETA 3EZ5A 4R79A 5LY3A 4DCHA 3QINA 3MDQA 3UE5A 3HVRA 5LMNK 2G8HA 2Q31A 3K5LA 2YHAA 4DV1K 1K8AO 4WQ4C 4PA1A 1NJZA 1N33K 4E3SA 1J5EK 4FWMA 4KTQA 3PX0A 3SUNA 3L2QA 2O8FB 2OANA 5M1OA 4HCCA 1EX4A 2HW3A 4BR7A 1BUPA 5IT9O 1X3MA 4AHVA 3QESA 3LM2A 1BQNA 3HYFA 3FE1A 3ZEUB 4DQIA 1QSLA 1XHXA 2IC3A 3BUZB 2HNDA 4XH5A 4U7BA 4IWVA 4C1NK 1GLLO 3R9PA 2UUAK 4JS5A 3UKRB 2AJQA 5EU7A 4H5TA 2D4WA 4CHZA 3ALYA 2CGJA 3AO4A 2H3GX 4CF8A 1ATNA 1EQYA 1CZBA 2GELA 3ZSRA 1IH7A 4I6MA 4CGDA 4ISEA 3LP0A 2NRWA 4DTJA 3WQTA 2OPQA 3BEXA 3H3OB 1T3VA 3J80O 3CQYA 4JS4A 2XRIA 5F0XA 1Q18A 2KZMA 5AJ3K 4CJEA 3I56N 3RR7A 4JK8A 3H1VX 2KQ2A 5C24A 4BQLA 5F2RA 4H4OA 3CJ7A 3IRXA 3ZYYX 4N47A 3QEIA 3SQ2A 4DFPA 1X9SA 3GDQA 4B9VA 1XQSC 1CXUA 4AM6A 3G10A 4I2PA 3SYZA 1TK5A 4EHUA 4H03B 4BGBA 4O0IA 3QBXA 1GLCG 4C8MA 1G15A 4IEEA 3HL8A 4ILJA 1EP4A 4DS5A 3ID8A 4W5TA 4DR3K 3TI0A 2OA8A 3ZCMA 2P9SB 2KTQA 4BDPA 4DU4A 5TKYA 5AQLA 1N32K 4Y1DA 2VWBA 4B1YB 2YJEA 4BC2A 3RRGA 4LF9K 1C1AA 2I5JA 1O1WA 4RCHA 5LJVA 4A57A 5HRNA 1VSEA 4B08A 3E9OA 1GOAA 1NGBA 4R5PA 5AQPA 1ILYA 3E9PA 3LWMA 1S1TA 1VSLA 1RFQA 2UU9K 3L2UA 2XY5A 4CZJA 1RT6A 1OH7A 4CHNA 4HUFA 1RNHA 1LWEA 4BRNA 3HP6A 4H4MA 1CLQA 3KLHA 5C12A 4FJ9A 3RWUA 1EKEA 3MAQA 3OA9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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