3BF3A

Type iii pantothenate kinase from thermotoga maritima complexed with product phosphopantothenate
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
248
structure length
248
Chain Sequence
MDPMYLLVDVGNTHSVFSITEDGKTFRRWRLSTGVFQTEDELFSHLHPLLGDAMREIKGIGVASVVPTQNTVIERFSQKYFHISPIWVKAKNGCVKWNVKNPSEVGADRVANVVAFVKEYGKNGIIIDMGTATTVDLVVNGSYEGGAILPGFFMMVHSLFRGTAKLPLVEVKPADFVVGKDTEENIRLGVVNGSVYALEGIIGRIKEVYGDLPVVLTGGQSKIVKDMIKHEIFDEDLTIKGVYHFCFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Type III pantothenate kinase
publication title Structural basis for substrate binding and the catalytic mechanism of type III pantothenate kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Thermotoga maritima
total genus 77
structure length 248
sequence length 248
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf3A01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3bf3A02
3I8BA 2ASOA 1D4XA 2A3ZA 2CGLA 4J8FA 5BRFA 3G25A 3SK3A 2E20A 1SQKA 1QZ6A 2P9SA 2YI1A 3ATVA 4FO0A 3FFKB 2FF6A 5AQUA 1V4SA 5FPMA 3P4IA 4K43A 1ZBSA 4XH1A 1QZ5A 3LDQA 3SMSA 3VEYA 2Q0UA 4BGAA 3VGLA 5BRHA 2V7ZA 4BR7A 2A41A 3DAWA 1NGFA 3LM2A 1MDUB 5AQNA 5JMVA 1IG8A 4WQ4A 2V7YA 1KAXA 3ZETB 4NB4A 3A5MC 3VETA 2E2PA 3C0BA 1ZC6A 1C0GA 1HKGA 3SLCA 5BPNA 1EQYA 2FSNA 3ULEA 5AQOA 2Q31A 4AM7A 1WOQA 5JICA 4FOIA 3DXMA 2P9NA 3H1VX 4HTLA 2IVNA 2FF3B 1E4GT 4FSVA 4BRAA 4EIAA 1JCFA 1BA1A 1WUAA 4FWOA 4YDUA 5AQLA 3WQUA 5KPRA 3L6QA 2BTFA 4FWSA 1Z6RA 3WUHA 3H6EA 3A0IX 4JD2B 4FWMA 3O4WA 2P9UA 4FPBA 1HKBA 2P9KB 3B8AX 4I6MA 2HMPA 4BRIA 1QQOA 4CZEA 1SZ2A 3H45C 2ZF5O 4RTFD 3UKUA 5EXWA 3W0LA 5AQPA 1GLLO 2Q1NA 5AQYA 1NGDA 4FOEA 4KBOA 3RSEB 2UYTA 4MLEA 5AZJB 5AQVA 4BQZA 1NGGA 3A5OC 4F9OA 5ELZA 3UKRB 4BRNA 4H03B 3HI0A 5AQXA 3VF4A 4FWKA 3MCPA 4WQ4C 4IWVA 2KHOA 4BC4A 5FPEA 2E2QA 2V51B 2YCHA 4H5NA 3UE5A 1JCEA 1J6ZA 4Z94A 2Q0RA 2Q2RA 4BRFA 5EOYA 2E1ZA 5KPTA 5AFUA 2EWSA 4DB3A 3CJBA 3S41A 2FSKA 1NGBA 4QS8A 3AY9A 4BRDA 1X3NA 3CI5A 3L4IA 1IJJA 3VGKA 5KPZA 2E1YA 3MDQA 5I9EB 1ZXOA 2OANA 2YHYA 1DGKN 3ATUA 4ISGA 4Y0WA 4YDUC 5KQDA 5F0XA 4BG8A 2ZGZA 3SJHA 1BA0A 5BREA 3QDKA 2ITMA 2QM1A 2HF4A 3FZHA 2CGKA 1KXPA 4IJAA 4A2BA 4BC5A 4CZGA 2A40A 3KVGA 4RWTA 4CD1A 1HPMA 1GLBG 1BO5O 1SAZA 4B9QA 3H1QA 1BDGA 3QICA 4MO4A 1HX1A 3HM8A 3TU5A 1NWKA 4RCHA 3DJCA 1NGIA 2V52B 4FWNA 3ZX2A 4BR5A 2ZWHA 3QMLA 2QWQA 3JXUA 4BR0A 2YJEA 3WXIA 2J4RA 3ENOA 5AR0A 2E88A 3VF6A 2QW9A 3EN9A 3O5BA 3CIPA 5AQZA 3VPZA 3AAQA 2NZTA 5E26A 2E2OA 3ULEB 1HUXA 4CZMA 5JLFA 1RGIA 4B1VA 3LDPA 5F2RA 1V4TA 3WT0A 4BR9A 3LM9A 2P9LA 3DXMB 3JS6A 2P9NB 3GG4A 3M3ZA 2ZGYA 2YHXA 3EO3A 1GLFO 3VEOA 3VGMA 3R9PA 3ID8A 4BGBA 3WXLA 1BG3A 3BUZB 2Q97A 3VEWA 3ZX3A 2A42A 2HOEA 3MN6A 1Y64A 3GBTA 2P9UB 4CZKA 1NGHA 4L3QA 3QFPA 4FL9A 5LJWA 4B1XB 1GLEG 3M1FA 4XH4A 4I6MB 1S22A 2AA4A 3MN7A 2D0PA 3UKUB 3QBWA 1RDWX 1R59O 3FZKA 5AQJA 3BF1A 5BN9A 2IVPA 4BRMA 4K42A 2D4WA 2QXLA 4JNEA 5AQHA 1XQSC 1NGCA 1X3MA 3CJCA 5AZIA 3HTVA 1ATNA 3HBTA 4IO8A 4K25A 4K41A 2AP1A 4PL7A 1TUUA 2I7NA 2QWOA 3FZLA 2D0OA 3J8AA 4O8KA 4MO5A 5F1XA 1NGJA 2NLXA 1NM1A 1G99A 3BP8A 3CHWA 3LL3A 4FWPA 3U9DA 4CJ7A 4BR2A 2QWNA 4H0TB 3HZ6A 2ASMA 1YAGA 2P9PA 2VYPA 4CZJA 3QBXA 4H0XB 5AQQA 5AQSA 3VEVA 3SMPA 1P8ZA 5BN8A 1YXQA 2BUPA 3R8EA 4BRCA 3CJAA 1GLAG 4B1ZA 2A5XA 2W40A 3ZEUA 2Q36A 1ESVA 3MK6A 3VOVA 4BRGA 5EX5A 3KHYA 4BVPA 1K8KA 1ATRA 1C0FA 4BRKA 4WQ5A 4CZHA 5LY3A 4EHTA 4FWRA 3GOIA 1TYQA 4H0OA 1Z05A 5AQRA 4H5VA 3VESA 4BR4A 4M7YA 4BC2A 5BR9A 3QB0A 4PKHA 3FZFA 3IDHA 3GE1A 4PL8A 4B1WB 4XH5A 1HJOA 3O80A 3DXKA 2GTDA 5CE3A 3FZMA 3LDNA 5TKYA 4CBXA 2QWPA 4M7XA 5B8HA 3IUCA 3H3OB 5AQKA 1QQNA 2NRHA 4JAXA 4AM6A 4HWIA 5JLHA 3D2FA 5E84A 2P9LB 2CGJA 4BVOA 2YJFA 4M63C 3WXKA 2FLOA 1H1VA 3M6GA 3HSCA 3WEEA 2IVOA 2I7PA 4CI6A 4QS9A 3FE1A 3C7NA 3CJ1A 3O1WA 4BC3A 1MWKA 2VCPA 3MN5A 1NMDA 2IIRA 3DWLA 3CETA 3VEZA 4WQ5C 3D2EA 4BRPA 2CH5A 1Q18A 5ADXH 5AFUH 1X9JA 4MLHA 4EFHA 5BPMA 3CQXA 3O6WA 3TPQA 1LCUA 4IXCA 3LDOA 4H5TA 2QWMA 2YHWA 3D7EO 5AZIB 2D1KA 2F9TA 1JCGA 2QWLA 4CZIA 1MA9B 3A5LC 4PKIA 5BPLA 1DEJA 1NGAA 4GNIA 5EY4A 3EL2A 3EKSA 5AQIA 1CZAN 1RFQA 2P9IA 3R6MA 4JHDA 4C23A 1GLDG 2E2NA 3ENHA 5EVZA 3WXJA 1GLCG 1YVNA 3IMXA 2P9PB 3H46O 2CH6A 3MMVA 4BRHA 4BRLA 5FPNA 4CZLA 4IJNA 5BRDA 4H0PA 3L0QA 5AQWA 3F9MA 1NBWA 4ISFA 3ZEUB 3VF2A 3AARA 4FWLA 2GELA 1T6DA 3AAPA 1K8KB 3EZWA 4O5FA 5AQFA 3U9ZA 4DHYA 2GWJA 3FGUA 4A2AA 4B1YB 1KAZA 1TYQB 3ZX0A 4BROA 3IFRA 4XEIA 1MWMA 4QS7A 1QQMA 5LJVA 1BOTO 3I33A 1QHAA 2W41A 1S3XA 1BWFO 1U2VB 3BF3A 2VWBA 3O8MA 3O08A 3O1BA 3U4LA 3DXKB 3FR0A 3A5NC 4EHUA 2DPNA 1OKJA 3ZETA 4CBUA 3CERA 4EAHD 2E8AA 4JN4A 1E4FT 1XC3A 3D2FB 3CQYA 4WYBA 3QFUA 4CZFA 4BG9A 2QWRA 4E1JA 4CBWA 4GY2B 3WEEB 3CJ7A 3MN9A 1NLVA 2GEMA 5FPDA 5AQMA 1XUPO 3C7NB 1HLUA 1U2VA 4BREA 1TUYA 2H3GX 4LC9B 4JD2A 1ATSA 2HF3A 4B1UB 3KZBA 4H0VB 5ADXA 2P9KA 1T6CA 3BEXA 3D2EB 5AQGA 3EKUA 5AQTA 3WQTA 3H3NO 4CD3A 5KQ8A 1GLJO 3RSEA 4H0YB 5AZJA 4IZ9A 3OHRA 3UKRA 3UB5A 3VENA 4A61A 3A8YA 1KAYA 4H5RA 3W3DA 1HKCA 4FWQA 1NGEA 3GL1A 4BQLA 2ASPA 2P9SB 4A62A 1BU6O 1U6ZA 2WUSA 2GUPA 2PAVA 3VEXA 1DKGD 4DQ8A 3VERA 3FLCO 1YUWA 4H5WA 2A6AA 4BRQA 2F9WA 4DCHA 1BUPA 2P9IB 4JHDB 4FPAA 2FSJA 2GWKA 1T44A 4ISEA 2FXUA 3LDLA 3U8XA 2PBDA 3GDQA 4NO7A 1LOTB 3CJ9A 4PKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1NKEA 5JVHL 2A3ZA 3HT3A 1U48A 2IAJA 3OA9A 4CFBA 4E1MA 1SQKA 4OKKA 3S3NA 1RTDA 3G0ZA 1CZ9A 5C2FA 2WC9A 2D5RA 3RVCA 1Q86O 1ZBSA 2ZJRL 1L3VA 4DTUA 2G8KA 3RTVA 4BGAA 3LP2A 1VQ6N 1XHZA 4BR7A 3DAWA 3O3HA 3OYDA 2IC3A 4WQ4A 3SNNA 1EKEA 1LAWA 4CJPA 3L2UA 3NHGA 3PO4A 4NB4A 3WNEA 2W6KA 4DV2K 3AO5A 1JLBA 1S1UA 1C0GA 1ZC6A 3EZ5A 3OJSA 5M1QA 1EQYA 3OYCA 4DG1A 5AQOA 2GUIA 1JKHA 3ISNC 5KRSA 2P9NA 4HTLA 3MWPA 4FSVA 4Z4CA 1BA1A 5KPRA 1NOYA 3AO2A 4KRFA 3D45A 1HKBA 3L2RA 4IOAL 2B6AA 4J2AA 4BRIA 3H45C 4RTFD 4C8OA 5AQPA 1GLLO 1BQNA 5AQYA 4KBOA 5AZJB 5AQVA 1BQMA 3RR8A 1NGGA 1J53A 3ZT1A 5ELZA 3HI0A 4DUZK 2NUBA 2X74A 3L3VA 2OTLN 4W5NA 4IWVA 3O3GA 4C8KA 3KK3A 2ZM6K 1JCEA 4Z94A 5CY4A 1S5JA 3VQPA 3J7YP 5KPTA 4BE1A 2BGGA 2WONA 3VA0A 4DB3A 2FSKA 4N41A 4CHZA 4QS8A 4BRDA 1WSFA 5HROA 4ID1A 3L4IA 3VGKA 3L3UA 4M41A 3RRGA 5I9EB 3ATUA 4Y0WA 4FJIA 4UY8O 3QIOA 2KFZA 5BREA 2QM1A 1YJNN 2HF4A 4IJAA 4A2BA 1BI4A 3CFPA 3DRSA 1M90O 1HYSA 2OPPA 1UA0A 3O3FA 2A40A 4FVMA 3G6EN 1HPMA 1BO5O 4HUFA 1F21A 3JAMO 1KD1O 4KHPK 3L4QA 3ID6A 5GAGP 4BE0A 3HM8A 3ZSZA 4PY5A 3VQ7A 3SQ1A 1L3TA 4RCHA 3QNNA 3S9HA 2KZZA 4CESA 3KLEA 4M3XA 4AHRA 2RHKA 3PX6A 2QWQA 4BR0A 4CEOA 3KWIA 4DV5K 5J2MA 3ENOA 1O1WA 2GV9A 1X1PA 4RW8A 3VF6A 2QW9A 3CIPA 3AAQA 4CZMA 2E2OA 1C1BA 4FJ9A 1RGIA 3SAGA 1KQSM 2P9LA 3UIQA 2VG6A 3I55N 3EO3A 4I7FA 4BGBA 3WXLA 2B5JA 3NGYA 3VEWA 1NOZA 2P9UB 5LMNK 4O5BA 1TAQA 3DMJA 1U04A 1FW6A 4B9VA 2DFFA 3P5JA 1SS6A 4I6MB 4HUEA 4O55A 1S1XA 4LH5A 4CHQA 3CCSN 4CJ5A 1HNWK 1C6VA 3QBWA 1OH7A 3FZKA 1IV0A 3AO3A 5BN9A 3C94A 4CF2A 2VG5A 4BRMA 4DF8A 2D4WA 1Q82O 3TAQA 1NGCA 2G8UA 5AZIA 3HTVA 2NRXA 4IO8A 1SL0A 1TUUA 2I7NA 2QWOA 3FZLA 1LW2A 4RW7A 3EY1A 2F96A 2O8FA 3T69A 3U9DA 1WB9A 2O8EB 3SZ2A 1QVGM 4DTNA 1KFSA 4CGDA 4M3WA 2B4JA 3AA3A 3QBXA 4H0XB 5AQSA 1U45A 4M3YA 1S6QA 3OY9A 1UWBA 1YXQA 1VQ5N 2A5XA 1NMNA 4WFBL 4YORA 3KHYA 4BVPA 4IFYA 2EHGA 3OYNA 4WQ5A 1JLEA 3GOIA 5C12A 4YOVA 1BIZA 1Z05A 5AQRA 2A1SA 4H5VA 4BR4A 2YHAA 1P90A 5BR9A 3FZFA 4CIEA 3IDHA 4Z0UA 1N34K 2HB5A 2HVIA 3O80A 3CD6N 3DXKA 3KKSA 5M1PA 1Q7YO 5CE3A 1S9EA 3SPZA 5TKYA 3DM2A 1TL3A 2OCEA 5B8HA 4CK2A 3ITHA 4JAXA 3A2FA 1RDCA 1BCOA 5E84A 2CGJA 3IKMA 4JI0K 3NH2A 3LP3A 4IOXA 2WTUA 3K5OA 3SPYA 3HXMA 1RBUA 1QSSA 3HSTB 4CI6A 1VSLA 3CJ1A 4IEEA 1MWKA 2AJQA 3K5LA 3MN5A 4CJEA 4X64K 5LMUK 2X6SA 3DWLA 4CGIA 5HL7L 3HO1A 4DR6K 5E41A 3VEZA 3D2EA 5TKWA 4CJVA 5BPMA 3TI0A 4GVEA 4FM2A 2OTJN 3CQXA 2YKNA 3TPQA 3E9OA 4W5OA 2QWMA 4CJKA 4W5QA 3V81A 3KKRA 4AILC 2HBLA 3NGIA 4OJRA 4CHNA 4YOTA 4CZIA 3NF6A 1IG9A 4KTQA 4LH4A 1NGAA 4IG0A 3G4SN 3ZSVA 1KVBA 3THWA 3EKSA 3R6MA 4C23A 1GLDG 2E2NA 4FK2A 1S1WA 3WXJA 1JLAA 2UUAK 2QKBA 2DY4A 1GLCG 4CEAA 3IMXA 3H46O 3MMVA 2HMIA 3P83D 2O4IA 4ILHA 3IG1A 1WSIA 3ZEUB 1RCHA 4FWLA 2GELA 5JVGL 3DLBA 3MAQA 4KH6A 1RBVA 4Q0BA 5AQFA 3LAKA 4B1YB 3FGUA 1KAZA 4KHYA 4BROA 3Q7BA 1MWMA 3OVNA 4QS7A 3CM6A 1NJYA 1QQMA 2FC0A 3NFAA 4B8CA 1S3XA 3AVIA 3O8MA 3U4LA 3A5NC 4EHUA 3TTDA 3OYJA 2YHBA 4N5SA 3U3YA 3CF5L 4BWMA 3L2QA 3HPHA 4AHSA 2QI2A 4H4MA 2F8SA 1EWQA 1RTHA 1K9MO 1HNVA 2QWRA 4GY2B 3FFIA 1DLOA 4IG3A 3CJ7A 2YV0X 4B3OA 1NJXA 4YFUA 4CGGA 2H3GX 4MFBA 4JD2A 1ATSA 2HF3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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