3BGGA

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with bmp
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
publication title Crystal structure of Human Orotidine 5'-monophosphate Decarboxylase complexed with BMP
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 94
structure length 257
sequence length 257
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2007-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3bggA00
4AB4A 3W23A 1JQXA 3DGRA 4K36A 5D38A 4IQLA 5GVJA 1T99A 3INPA 1GG1A 1SW3A 4PC8A 1GT8A 3GAYA 4UTJA 4LU0A 3PSWA 3LX9A 1KTBA 2H3DA 3DH7A 3DZ1A 3JR2A 3THQA 5LNUA 2NWSA 1XUZA 4Y8FA 4AAJA 4WXZA 2B4GA 5C5YA 3ZR4A 3UPWA 1GVFA 3STFA 3VNDA 1RR2A 1KM1A 3QMSA 2CFFA 3KVMA 2DORA 1P1XA 3CTLA 3GDTA 3PB0A 5FF7A 1A5CA 3QYQA 5DCEA 1QPNA 2BTMA 4IPIA 3NQGA 3LHZA 3S5OA 1FDYA 3UWWA 2A0NA 3H53A 5F4SA 2GVGA 3EX3A 4JD4A 1O5XA 5AHMA 5KMYA 3NQDA 3HJZA 3P8JA 3QF0A 3I6RA 1L6YA 3HOJA 4JEQA 3DFOA 3SJ3A 3MUXA 2W6RA 3F4NA 2E68A 1DQWA 3KRSA 3MP4A 3STCA 1G6CA 5TQLA 1F74A 2VXNA 3NQ8A 3SY5A 4A2RA 1MEHA 3NPUA 2J6XA 3UYCA 4EWND 4U4MA 3P62A 5LNVA 1KTCA 3NQAA 1YDOA 4JYFA 4NX0A 4KKXA 3GNDA 3HG5A 1YLVA 4I7VA 3I68A 1Z48A 4LWWA 1RZMA 1G7VA 1ALDA 3MYPA 3OEXA 5HUPA 1KM0A 2V0TA 5CSSA 8TIMA 1TPH1 2RH9A 1S5VA 3PM6A 5BMWA 1Q6RA 4TO8A 1OFAA 4IMFA 3C0JA 5LNSA 1KM2A 3A22A 3S1VA 5CGQA 1KFJA 4O18A 2E5DA 5HWMA 4UNKA 3ELFA 3IIPA 3QPZA 3LCWA 1TTPA 3RFAA 7TIMA 4UTTC 3BG9A 2CZ5A 5G2HA 1Q3NA 1W31A 5F1UA 3UXAA 3TMQA 4TIMA 4MYXA 1I2RA 3TFCA 3QEZA 2DZTA 4TU1A 3W7QA 4N4QA 4XZ9A 1H7XA 3U2OA 5D32A 3NA8A 1VCGA 2GJLA 4PTNA 2I1OA 1YXDA 1EP3A 1TJRA 4Z1BA 2PE4A 3B0PA 4I7WA 1RQEA 1W8SA 1EX5A 4U28A 3NOEA 4MJZA 4ALDA 4MPQA 2VEMA 1LDCA 1KFKA 3R13A 3G3DA 1QPQA 3O16A 1LROA 2E77A 4GNJA 1TV7A 2W79A 3WK3A 2Y70A 4N9CA 2EAWA 1W56A 3NZ1A 5A5WA 4UTWA 1RVGA 5DY3A 1OYCA 1Q6LA 2C14A 3BLFA 2VEKA 1K7FA 4UMCA 4LUJA 3EKLA 2ZA2A 2C15A 4NZJA 1PVNA 3TX9A 4JY8A 4JX6A 1G67A 3GX9A 4S1FA 1D9EA 2WSRA 1JUBA 5E1QA 4H4IA 1LOLA 1KV8A 1LCOA 3LBMA 5AC6A 4GUGA 4L4MA 4FIRA 5C6MA 2C3ZA 5HJLA 3LB0A 2YW3A 3OHIA 4UR8A 4CCCA 4LY8A 3L0NA 4NU7A 3W72A 5EBUA 4FNSA 3QW4B 1PCKA 2VC6A 3R8RA 1PV8A 3QQ0A 4C1LA 2I9EA 3QZEA 5MHBA 3Q37A 3ABOA 4K7YA 1XBZA 3PG8A 1R2RA 4HSOA 2E6FA 1NAL1 3L68A 3LHTA 3G22A 3Q94A 4XUGA 2JKEA 2E6YA 3FKKA 4JICA 4IMCA 2QUVA 4MY8A 2Y85A 3NL3A 4DXVA 2YFNA 3IIXA 2VFIA 2WNNA 4H6KA 5F2LA 3LCLA 4RK8A 1RQHA 2ZZ5A 4O16A 3BGJA 3G8EA 1MXSA 4LC8A 4CNPA 2CZFA 3F1QA 3GZ3A 3TE9A 3BLIA 1N55A 3U8GA 2WO5A 3K30A 2ZZ4A 4UTMA 3LCHA 4HPXA 4FX7A 1LOSA 1KBIA 3PBVA 1OX4A 4FIQA 1UB3A 4QQ3A 3TSBA 3LCFA 3S42A 1A53A 1KTNA 2YDAA 5LZLA 3TROA 3GDLA 1M6JA 3O6DA 3STEA 1H1ZA 4N4PA 1FCQA 1UJPA 4YCPA 3B04A 3W1NA 2H8ZA 3O6CA 2XFWA 3M0ZA 3TW6A 4ZQCA 1TIMA 2WNQA 1R46A 2NX1A 2Y6ZA 2YW4A 4JIPA 1QPOA 4K39A 3N9SA 2HS8A 3DFSA 3MI3A 5CPLA 4GUFA 3LERA 3CM4A 3QFEA 2Y88A 4JYEA 5LHFA 4POCA 2QUTA 4I9AA 3UXDA 5FEPA 1UCWA 4UR7A 5K4XA 2YX0A 3HGJA 3TC7A 1OG0A 1B57A 3ZS4A 3IVTA 1JCYA 4NJKA 2CWNA 4K8HA 2ZRYA 4ZQOA 2TMDA 3LCGA 3UPBA 2V5LA 3L5MA 1TMHA 4O12A 3N34A 4PEKA 1E51A 4HSNA 1TB3A 1I2PA 2DZXA 1SR9A 4AWSA 3G1YA 5KITA 3L0KA 5ABTA 4UFLA 4BR1A 4R7JA 1T0OA 4IMEA 1QAPA 1LTDA 1SZFA 4AHQA 3W1RA 1FWRA 1PS9A 2QCGA 2ZDRA 2GOUA 3M47A 4CCEA 3W1QA 1GVOA 3C2RA 2PURA 1X7FA 1WYIA 2XN1A 2RDWA 1TTIA 5LHEA 1GTEA 2JKAA 3A21A 2NV1A 3W7DA 4FB7A 4K7VA 3LRLA 4FNTA 4IX0A 3VI2A 3W73A 4JTJA 3E96A 4XBSA 3W7HA 1VHCA 1B3OA 1FXQA 2A1YA 4PL1A 3R2GA 3FYPA 4AH7A 2RHGA 3KRUA 2YCEA 3OG3A 2ATSA 3DFPA 5HQEA 2WKJA 1OFPA 2ZZ6A 3OBKA 1EB3A 5DXXA 1VC4A 5E93A 3R5EA 1CX9A 3PG9A 3DENA 3EWZA 5F4XA 2ZA3A 3DFTA 3FJ6A 2V5BA 1DOSA 3FOKA 4O57A 3QH2A 3MI2A 3GKFA 1IGSA 1L6WA 4BK9A 3L5AA 1WQ5A 4RR4A 3EKZA 1ZENA 2ATMA 1IXOA 3F4WA 2HSAA 3QSTA 3WK2A 1SFJA 4R53A 1J5TA 4X2RA 3T78A 2GUUA 2OZ0A 3NNTA 5AB3A 2DZUA 3S5NA 2Y61A 1YTDA 4O13A 1YADA 1GPWA 4O0KA 3ATYA 2Y7EA 5EYWA 1OX6A 3N9RA 4WD0A 1B4EA 1JQVA 1ME9A 4DEFA 5HMSA 4MFDA 2TRSA 3N3MA 1S5WA 3W84A 3NQ2A 1C29A 3GKAA 2NV2A 1KM6A 3W9ZA 4JTTA 5TBOA 4ONVA 3W7IA 5DXYA 1KA9F 3THAA 2WV8A 1VH7A 2Q3OA 4DO5A 3FJLA 3CHVA 3UY7A 4M6QA 1L6SA 3IGUA 4EF9A 2ISWA 3PBUA 1ZAHA 1GTHA 2C13A 3M9YA 5CZ0A 3W1TA 4AF0A 2V8ZA 3BG3A 4NJIA 2V30A 1AK5A 3VE7A 4AHPA 2DZSA 5F4WA 3W2MA 3PS7A 4E2BA 2C6QA 4FX8A 1Z44A 3A9IA 5DCBA 4Y96A 5DELA 1EWDA 3GB6A 3B4UA 2QCHA 1XFBA 2A7RA 1OJXA 3KHJA 3LTYA 4R33A 4DF1A 2ZRXA 1TTQA 4K8EA 1H1YA 3C2FA 4ZQPA 1Q6QA 1JCJA 1RQBA 4MZ8A 1OK6A 3LHVA 4BWLC 4Y9AA 1TJPA 3PULA 3UD6A 5CZJA 3BGGA 5BNKA 6ALDA 4NT0A 3RU6A 3OVPA 4UXDA 3PUOA 2QCDB 2CLHA 4MVAA 3M43A 5FEWA 4PFMA 3WJWA 4CLMA 1TPC1 4UC5A 2A6NA 3TSDA 3I65A 4LNYA 3DU0A 2YYTA 1DL3A 3EB2A 1FDJA 1SPQA 3EXRA 4NUWA 3W7RA 3S8HA 1X8FA 1K7XA 4AEOA 4P61A 1J4EA 5IM51 3W7PA 1BWKA 1WX0A 5AN7A 4GFSA 2Y62A 2V2DA 3LLFA 3LBCA 3M6YA 1ME7A 3W75A 1SUXA 4MFEA 1SZGA 5CZSA 3HGRA 5A8GA 3W7CA 1DVJA 3FLUA 1QOQA 3NG3A 5C54A 3TQ0A 3UWVA 4NXSA 2QCLA 3QRHA 1MSSA 5DCDA 1VYRA 4IJBA 1TQJA 3EX6A 1KFCA 4JTIA 4LRTA 3M5ZA 2CLOA 3MHUA 1NF0A 3UQNA 3B8DA 3NM1A 1KLZA 1MZHA 3ATZA 1BKSA 1KFEA 3P84A 2ZCGA 2X1TA 4AXKA 4JNMA 1JULA 4C1KA 1W5QA 5AC8A 5D2WA 3O63A 3P80A 4NNAA 1D3GA 3E02A 2P0OA 5J5DA 1NEYA 3TIMA 3W7GA 3L5LA 1ZCOA 1B9BA 1EIXA 1WV2A 2CLLA 4L4LA 4UTIA 1OFBA 1YPIA 1YXYA 4M7TA 1I2NA 1G4EA 4ICNA 4TR9A 1G4SA 2C16A 4GC4A 3W2UA 4JYDA 3UWUA 4N9DA 1OFOA 4OV4A 4QISA 4A3UA 3RLVA 4FEZA 3MJYA 4JY9A 4N2YA 1I2QA 2VFHA 4RCXA 1SU5A 2X2GA 3HQ1A 1IXPA 1WAUA 2Q3RA 1H63A 5J5RA 1HTIA 2HMCA 3TJXA 2NUYA 3WFAA 2DJLA 4JTSA 1H61A 1WOBA 1G4TA 3TV8A 3B05A 2VENA 3EX2A 1XUUA 1LRTA 1N8FA 1O94A 2WQPA 3NAVA 4K6AA 2JBMA 2F84A 4YWIA 4OE7A 2EPHA 3CIWA 1GYLA 3ZFHA 3HG4A 2GPTA 2A4AA 5G1TA 1QR7A 4Y90A 1MO0A 3EXTA 1X1ZA 3HPXA 1PIIA 1TPEA 2PC4A 1IXQA 1K03A 2ALDA 3DXIA 3WK0A 1OFEA 3TFXA 1PL9A 1LP6A 2EGZA 3P61A 2NXIA 3SR7A 2PCQA 1LBMA 5CZTA 3BK0A 3S5YA 5LGXA 4JDBA 3VE9A 4FX6M 5K2ZA 5SWUA 3DHDA 2BZNA 4XKYA 4XQ6A 4O10A 4RLIA 2ZZ7A 4NJGA 1H7PA 5CKSA 2RDTA 2AAMA 1VYPX 4CCDA 4DO4A 4LRSA 3TW7A 3BPWA 1TPDA 4ZMGA 3EWUA 4IOTA 2ZA1A 4IXHA 3P7YA 1KM4A 1KLYA 1GQNA 4MY9A 5H2ZA 1T96A 4TMBA 2FDSA 5D37A 3GIYA 1TPUA 1QO5A 1YDNA 4LUIA 1SO6A 2B0MA 3NQCA 3OIXA 4YL2A 1T8XA 3NXFA 2ZRZA 2QJHA 3LHWA 1RD5A 3DHFA 5G4EA 3LHUA 1ADOA 3NVTA 4UTWC 4O50A 2Y7GA 2NUXA 3TK7A 2QCNA 3STGA 4R34A 3W87A 1SO4A 4JX5A 4M5PA 1JCMP 2YFOA 5BOOA 1SW0A 3DI1A 4MY1A 1DJNA 4EIVA 4IMGA 3MHFA 1SO3A 3A24A 3LV6A 4TMCA 3BARA 4QNEA 5BMXA 3S0CA 2WSYA 2BWGA 3H54A 1RPXA 2NUWA 3DAQA 1D3HA 3FIGA 1XI3A 1VHNA 4WXYA 2FIQA 4MIMA 5K3VA 1KV5A 5EPDA 1FXPA 4KFPA 3TSMA 3EX4A 2A85A 2HTMA 3CQ0A 2JK2A 3N2MA 2WNZA 1VYSX 3T7VA 1SZEA 5FI8A 4WX2A 4LS2A 2GQAA 3CWOX 1K8YA 3L9CA 3NQFA 4RV8A 4YMZA 2BXVA 5K9DA 2RKXA 3I7RA 5K7JA 1VCVA 2IQTA 2P10A 4FNUA 3SIZA 3LLDA 3KOFA 2YYUA 1OYAA 4WJEA 1UBSA 3GDRA 3C2EA 3TKFA 4XBKA 5CSRA 3MBFA 1ME8A 3HB9A 2ZFAA 4RZ6A 3NQVA 1DJQA 4HIBA 1EPXA 2OCZA 4IWWA 1FCVA 5AHFA 4O15A 4RX0A 3B0VC 2RDUA 2C1HA 1W5PA 4KFOA 3TXVA 4Q4KA 2DZWA 4TX9A 4OGZA 3IIOA 3GXPA 3CWNA 4DO6A 4A2SA 2YSWA 2G5WA 5BRBA 3KX6A 4DPQA 1P0KA 1VQTA 2CLMA 1XDMA 2GVLA 1GG0A 3S5ZA 4M7SA 1LBFA 5LSMA 1FWTA 4UMAA 3W6YA 2TYSA 3O07A 3LCXA 2E1DA 1JCXA 4FXRA 5I3IA 1F73A 2FB3A 5D2YA 4AWTA 3GVGA 1P5BA 5E0KA 1M7OA 3EEGA 3T4CA 2QUUA 1K7EA 2EF9A 1VZWA 4FXSA 3GYEA 2FPYA 2VFGA 3CU2A 4O14A 3LXAA 4EF8A 3NQ7A 1IIHA 1SW7A 2CLEA 3MWAA 3G1SA 2NLIA 1TTJA 4ZL1A 2JGYA 1H60A 1L9WA 1SSDA 1GZGA 4PH6A 3H55A 4DPPA 3CB8A 3N14A 3QW3A 4O53A 3GLCA 3W85A 1TPFA 2CZDA 3EWBX 1LORA 4OWGA 1A5AA 3W2JA 1WBHA 1H7OA 3RLUA 4WQ6A 2X16A 4J9JA 3A5FA 4XTDA 2ZRUA 1SZNA 3P60A 1XBYA 2V81A 4YCOA 3SFKA 2ABBA 4UUIA 3W7KA 1GVQA 2ZQ0A 1YTEA 3SI9A 4NVTA 3LM7A 2X1RA 1KM3A 3HGSA 1OF8A 2G97A 2OX1A 2ABAA 1NFBA 3SZ8A 2V82A 5G5IA 3CLMA 1WOAA 3LDVA 5HINA 4M19A 1XBVA 1GVSA 2QF7A 1NVMA 4DELA 4S2CA 1K8ZA 1FQ0A 3TXZA 3UWZA 4HNUA 2QJGA 4AWUA 3O1NA 3M5VA 4QM1A 5DBUA 3WK1A 3RMJA 1FCUA 2CU0A 4NNCA 2J24A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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