3BLIA

Crystal structure of the catalytic domain of licms in complexed with pyruvate and acetyl-coa
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
319
structure length
311
Chain Sequence
RLEILDVTLRDGEQTRGVSFSTSEKLNIAKFLLQKLNVDRVEIASARVSKGELETVQKIMEWAATEQLTERIEILGFVDGNKTVDWIKDSGAKVLNLLTKGSLHHLEKQLGKTPKEFFTDVSFVIEYAIKSGLKINVYLEDWSNGFRNSPDYVKSLVEHLSKEHIERIFLPDTLGVLSPEETFQGVDSLIQKYPDIHFEFHGHNDYDLSVANSLQAIRAGVKGLHASINGLGERAGNTPLEALVTTIHDKSNSKTNINEIAITEASRLVEVFSGKRISANRPIVGEDVFTQTAGVNLYANPILPERFGRKR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Citramalate synthase from Leptospira interrogans
publication title Molecular basis of the substrate specificity and the catalytic mechanism of citramalate synthase from Leptospira interrogans
pubmed doi rcsb
source organism Leptospira interrogans
total genus 117
structure length 311
sequence length 319
ec nomenclature ec 2.3.3.13: 2-isopropylmalate synthase.
pdb deposition date 2007-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00682 HMGL-like HMGL-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3bliA00
4A29A 1TTJA 4FNSA 4JTEA 4ORIA 3O63A 1UB3A 3KAOA 3TDFA 2HSAA 3GXTA 1GTEA 3LLFA 5HMSA 2Y7GA 4TO8A 1TPB1 3CWOX 3W1RA 3DFNA 1OFDA 2QCDA 4JTUA 3S5ZA 3MHFA 2Y85A 2YFNA 5E0KA 1M7OA 3GIYA 1KV5A 4X9SA 2E1DA 4BWLA 2NXIA 5HJLA 1SU5A 5BOOA 1UJPA 1VLWA 4M5PA 4UNKA 3KVJA 1EUNA 3TSDA 3ABQA 1LYXA 3FFSA 2A6NA 1Z48A 5HR6A 3HB9A 3V1PA 5AHFA 4LVDA 3P8JA 1VCVA 2GPTA 2V9DA 5G2IA 3EWBX 4NJHA 3S5NA 2WOQA 3C2VA 2Z2UA 1KFCA 1F6KA 4JN6A 2I9EA 1JUKA 3ZWSA 1I45A 4JGDA 4FX8A 2H3DA 3BLFA 2Y70A 2FDSA 2R91A 4Z1DA 5I3HA 4UTIA 1WXJA 4FIQA 3PG8A 1OX4B 2V5LA 1ICQA 5KZDA 1ME8A 2NUYA 1A5SA 1JCMP 1PS9A 5D37A 4PC8A 4MZ8A 1PCKA 1GVRA 1MEIA 2E6DA 4HSOA 3W7RA 3CQ0A 4GUHA 1B4EA 2E68A 1D3GA 3W83A 1LOQA 4Z08A 3FYPA 3PSVA 3W1UA 1TRIA 1F05A 3LX9A 3QSTA 4CLMA 3B04A 2RHGA 1TSIA 4M6QA 3UY8A 4PFMA 2R14A 3A5VA 4YXGA 1NF0A 2A7PA 4NXSA 1QWGA 2TYSA 4HHPA 3OA3A 3NQ7A 5LNVA 2ZTJA 4LOCA 2WSRA 3STEA 4JICA 3G24A 2WJZA 3CU2A 3I68A 4RLIA 4O15A 1IF2A 4HT3A 4M19A 5U4NA 3MHUA 3SGUA 1VHNA 1W3NA 5BRBA 3W75A 1W3IA 2DZXA 2VOMA 3BW2A 4MUZA 4AHOA 1GYLA 2W6RA 3W23A 1VZWA 3A23A 2FJKA 3GDKA 3OEXA 1LRNA 2VEKA 4UTWC 2ZBTA 2XFWA 1FX6A 1LP6A 3W3OA 5DCBA 4CQ9A 5E1QA 4DO5A 1DORA 3W74A 3JRKA 1ME7A 2CLHA 4O18A 3W2NA 3WJSA 3SI9A 3T44A 4UMAA 2GQ9A 5EYWA 5L6UA 1HO4A 4EIVA 4GUGA 4CNPA 2H90A 5EY5A 2A1YA 3A22A 2BSLA 4ADTA 2QAFA 4N2YA 3P80A 1WBHA 1XXXA 4P61A 1GOXA 2XN1A 4JY9A 2FPTA 3IGXA 5LKYA 4PCFA 3T55A 2EGZA 1LOLA 3NL2A 4AHPA 3GLCA 3QPYA 3W7OA 4KFNA 4GXMA 2ZQ0A 3KRSA 2PC4A 3EWUA 1TPWA 2FB2A 1XL9A 4C1LA 3W7IA 1HL2A 1S5TA 3GK0A 3IIOA 1T99A 4LS2A 3W2LA 3G0XA 3NPVA 3MBFA 3VFLA 1J2WA 4JXCA 3RLUA 5K2ZA 1N7KA 5FI8A 3GX9A 3NQFA 3MO7A 4ZMGA 3MBDA 2EHHA 4HKPA 1K7FA 3MP5A 4GWEA 5G4EA 4EF8A 1TPH1 2JKAA 1M6JA 1O4UA 4WY0F 3DKJA 3O6DA 4S1FA 4O1BA 5LZLA 2C6QA 4I9AA 1K8YA 2ZA1A 3EWWA 4I7WA 2G5WA 2P1FA 1F7BA 2WQPA 3PVFA 3GR7A 2XN0A 3DFSA 2OZ0A 4FO4A 4KKXA 3HG3A 1DKWA 4JTIA 3C52A 3L21A 5D2YA 3FJ6A 5KTLA 3LI1A 3LV6A 3EKLA 1K3UA 5E93A 2Y62A 2ISSA 3L65A 5T26A 1OFOA 3B0UX 3G8RA 2JKPA 4JTJA 5DY2A 3TW7A 1XUZA 2ZZ4A 5TIMA 2E6AA 5FEPA 3KVMA 3GZ3A 4MPQA 2UV8G 1OFQA 4QM1A 4UNLA 3NM3A 1FWNA 3M43A 2VKZG 4H4IA 3G1XA 3M6YA 4PL1A 3LCLA 4TMCA 4KFOA 1L6WA 4O8RA 3W2JA 5IM51 1WQ5A 3ZS4A 1WOAA 4PODA 2RDWA 3VKJA 2OX1A 4BI5A 2QDHA 2V2DA 1YTKA 1KFKA 4Y6GA 3LOTA 4QNEA 1TTIA 2QCMA 1GVFA 4O1DA 1P0NA 1CX9A 4ADUA 1OX5A 3LDVA 4IGHA 1EIXA 4NJKA 2DU2A 3W7EA 3HGSA 3W7KA 4YCOA 5HWMA 5EMUA 4O57A 1GPWA 1JCYA 2QCNA 3S1VA 1GJPA 3BPWA 4K39A 4Z1BA 3SR7A 1JCLA 4LW7A 3W86A 4DBEA 3C2FA 4R53A 1TV8A 2QCGA 4UFJA 2AQWA 3MMTA 1SR9A 3PBWA 2QKFA 4IPJA 1SFLA 1AG1O 4HNNA 1W5NA 3M41A 2BX7A 1FDYA 1QPOA 2CFFA 1W5OA 3NR0A 4JD4A 3O07A 3DZ1A 4FNRA 1F5ZA 3B0VC 2ZRUA 3FA5A 4N4PA 2RDTA 3GYEA 2PE4A 4R33A 4TIMA 5FEXA 4JTLA 3PAJA 1VC4A 1FY6A 1UUMA 3PUOA 3Q37A 3OVPA 1QMLA 1ZAIA 3CHVA 3AO0A 2CZEA 3PG9A 4XQ6A 3AJXA 1AMKA 2ZZ5A 5FF3A 2TPSA 3UWVA 3W7LA 3W1TA 4ONVA 4IMDA 5AYYA 4WXZA 2NV2A 3G0SA 4GJ1A 1XBZA 1ZCOA 1H7XA 2VFHA 2YZRA 3M9YA 3PC0A 2V2HA 4LU0A 2R94A 5AC7A 1TIMA 3UZJA 1PCWA 4HPJA 3HGRA 3LHVA 1I8JA 3FIGA 2Y6ZA 3PBVA 1VH7A 1VR6A 2B7PA 4U28A 1OFAA 4DBDA 4YLWA 3STFA 1TTPA 4O28A 3WK0A 1SW0A 5DBTA 2LLEA 2VEMA 1DHPA 3E9AA 3LTYA 2WNQA 4P2VA 2NV1A 4O0ZA 4S2BA 4JTSA 3GKAA 1QDSA 2P10A 3E49A 4GE8A 3W07A 4CQAA 3W87A 4YL2A 3Q58A 2ATMA 5F1UA 4HN4A 3UWZA 1F74A 2NUXA 3HG5A 4PH6A 3EB2A 3BO9A 1G6CA 1QO2A 4Y9AA 3HIJA 1KFEA 1LROA 2G96A 4JDBA 5TBOA 1H7NA 3F03K 3G8EA 3HG4A 5LNUA 8TIMA 1OFPA 2ZDRA 3G0UA 2OT1A 4NX5A 1Z41A 4BWLC 1PV8A 1BTMA 4JTGA 3LXBA 1LLZA 1S5VA 1BWKA 1SW7A 5CZ0A 3UWWA 2J9XA 1SZFA 3C2RA 3B8DA 4FNUA 5CZSA 2J6XA 5CZJA 3FKKA 5CGQA 2X30A 2C15A 3N19B 5DXYA 1ZALA 1K7EA 3EXSA 3D0CA 3C0JA 1GQNA 1JUEA 3UWYA 1A50A 3BLEA 3HJZA 3U6WA 1LCOA 4LC6A 3NQ8A 3H55A 3LLDA 4DPPA 1SZNA 2A6LA 3IRDA 3DENA 1Z44A 5LNRA 4N9CA 1TMHA 3QYQA 3JS3A 5D33A 1WA3A 2H3BA 1W1ZA 4OHQA 5BMXA 4MJZA 4IJBA 4O14A 2QCCA 2ZA3A 1X8FA 1F76A 1FCBA 4N6EA 2H8ZA 3C2OA 2WKJA 3EWYA 2WPBA 3P60A 1OF6A 4FF7A 4O53A 4W9TA 5FF7A 3ZWTA 2QCHA 2X1UA 3H53A 2FIQA 3R8RA 1YPFA 1I2OA 2J9YA 3W6YA 3G3DA 3ATYA 3NZ1A 1A5CA 4UTJA 2JGYA 3M5VA 4Z1CA 2Y7EA 3DI0A 1C29A 3O06A 3PULA 3TQVA 2QR6A 3TFCA 1B9BA 1RPXA 3LCHA 3TXZA 5I3GA 2VFGA 4AF0A 4NNCA 1VCGA 3NPUA 1Q3NA 3BARA 3L68A 4CCDA 3MWAA 5F2IA 3NPXA 5AYZA 1A5AA 1TO3A 5K7JA 5I3IA 1TPC1 1M5WA 1EUAA 3EEGA 1H7RA 2YFOA 4Q32A 4N6FA 3DFTA 3W22A 5G1YA 4E2DA 3PR2A 2ATSA 4LWWA 4LUIA 3L5MA 1SUXA 3PBYA 1PVNA 4N9DA 5MHBA 1J5TA 2OT0A 2DZTA 3LI0A 3N14A 3CEUA 3NEVA 3ZR4A 1JRBA 3NYZA 3LCGA 3Q94A 3TAKA 1AK5A 2OJPA 3LTSA 4BI7A 4HIBA 3W72A 3IIVA 2H6RA 1W37A 4C1KA 5SWUA 3W7GA 4FXSA 1J4EA 3QW3A 2C1HA 3BVJA 4HPXA 5D05A 4DQWA 3DBPA 3N73A 4UTUA 2DZUA 3U8GA 3PSWA 4LT9A 3GDLA 4MOZA 2RH9A 5D2WA 3TAOA 5AFDA 4ZVJA 1XBXA 4K37A 5KZMA 5FESA 2ZZ7A 4JEQA 4WD0A 3TH6A 3LCFA 1YTEA 1W0MA 1NAL1 4RZ5A 4WOZA 1EB3A 4H3DA 4WY0A 2O7QA 3P61A 4ADSA 1G4PA 4O12A 4GRSA 3MYPA 4S2CA 1BEUA 3P74A 3UD6A 4ALDA 2AGKA 3EWZA 2CLEA 5DLCA 3I65A 3MJYA 4PL2A 5CSSA 4NX0A 3N34A 3SGZA 1QO5A 1VS1A 2CZFA 1VLIA 3IIXA 4OV9A 2Z6IA 3TV8A 1FCUA 3R2GA 3A5FA 5KMYA 3TQ0A 1PHWA 4JNMA 4TMBA 1ICSA 2B0MA 3T4CA 1EPXA 3G1VA 1G7VA 1TREA 2VC6A 2BWGA 3N3MA 5K4ZA 2ABAA 4XBKA 3CPRA 3M5YA 2Q3OA 2E77A 1KM4A 1IXPA 2C18A 4LC8A 3KOFA 4JX4A 2VFDA 2V5BA 4RV8A 2DZSA 1SFJA 2GVLA 2E5BA 2CLFA 3W7HA 3L2IA 1Q6OA 3LBMA 4R34A 1MZHA 1FUYA 3TUUA 1N55A 1Z42A 2CWNA 1ME9A 1R2RA 1KLZA 4E2BA 1LORA 3HPSA 1H5YA 2YR1A 3SIZA 5CPOA 3WJWA 3GDTA 1OJXA 3IVUA 1U83A 1D3HA 1TYGA 2NLIA 1GG0A 1VYPX 1BKSA 2HS6A 3PUDA 5U7SA 2QCFA 2Y7FA 2ZA2A 1QFEA 1UCWA 2DP3A 3EX1A 3SFKA 3DAQA 4H6KA 3W1AA 4DF2A 2CLKA 1DOSA 2DORA 2GQAA 2I14A 1ZENA 1Q45A 3P84A 5CZTA 3RFAA 3TCEA 1H7PA 2J88A 1WX0A 3O05A 5G5IA 4NT0A 1W56A 1GVOA 4UTTC 2V82A 3WK1A 4LTSA 4N4QA 4GBUA 1N8FA 1MEWA 4A2SA 1ZAHA 5D04C 1HTIA 4CQ8A 1VGAA 2DJLA 4FX7A 1FXPA 2NX3A 3LM7A 7TIMA 1M7PA 3LBCA 4WUIA 1KTBA 3G3MA 1MO0A 2X1TA 5AHEA 3GKFA 3GB6A 4UFKA 4IX2A 2V30A 4NNAA 1JQXA 1OF8A 5DCDA 3MW7A 2H8XA 3PS7A 4K38A 3TU9A 3W7NA 4NJGA 2FPVA 3LV5A 4IX0A 3FLUA 4XKYA 4JR5A 1OFBA 1NF7A 3UQNA 2Y61A 5F4SA 3RLVA 1H60A 1W5MA 4DELA 3F1QA 3B06A 4HNVA 4YCPA 1IXQA 3C4UA 5EL1A 3W85A 2GUUA 5EPDA 2QJHA 2CZ5A 1DBTA 5DBUA 4QSHA 4Y90A 4FX6M 3SY5A 2BTMA 3HF3A 3HGJA 4WZHA 3G1HA 1FCVA 1L2UA 1OFRA 3O15A 4NJIA 1WAUA 1SO4A 1MSSA 2WSYA 3DI1A 2VFEA 4DPQA 5G4WA 4ZQRA 5AHIA 2NX1A 4JYFA 3GXPA 4AVFA 3KX6A 3EX6A 1PHQA 3CEPA 4MLRA 4RKAA 1T96A 1FDZA 2B4GA 3KVLA 1EP1A 5LNWA 3KRUA 3DFQA 4MZYA 2QCLA 4CCCA 2NZLA 3EKZA 4KWWA 1NEYA 3DH7A 5D32A 1DV7A 4FB7A 3TROA 3NQGA 3ELFA 3M16A 2YYUA 3W1QA 2QJGA 2A0NA 1KV8A 3LHWA 4NXKA 5BW6A 4BR1A 5CKSA 3SSJA 4O4VA 4UFLA 1L6SA 3T40A 2QF7A 1OX4A 4AAJA 2JBMA 1LRTA 5J5RA 3MP3A 2PRHA 3STCA 5HWNA 2TRSA 1V5XA 3C6CA 4GC4A 2ZYFA 3HG2A 4UTTA 5CG7A 3W9ZA 5ABTA 3L66A 4NZJA 4EWND 5F2MA 1S5WA 1VYRA 4AF0B 3TMLA 4LVAA 4ZZ9A 3P82A 4UTHA 3S9YA 3BG3A 1TTQA 2CLMA 2D73A 3BV4A 3MI3A 4DO6A 5CPMA 1VYSX 1SO3A 1TQXA 4OBTA 3V75A 1EEPA 4OQVA 2CZDA 3IVSA 4XZ9A 3TJLA 2CLLA 1R47A 2QUVA 2QCDB 3LXAA 3W7JA 3MHGA 3CLMA 2GJNA 3UZ5A 2YCEA 5KSWA 2TMDA 3PB0A 1F73A 2YPIA 3W88A 3PWAA 3GNDA 2ZRWA 3KXQA 3S6DA 1R2SA 3I7SA 5GVJA 4UXDA 1KM6A 4A3UA 3FS2A 3TXVA 1OG0A 6TIMA 2A85A 5FF0A 4IXHA 1H1YA 1SSGA 1B3OA 3P62A 4MKNA 4MY1A 1UUOA 3OBKA 1R30A 3HOJA 3IV3A 3CWNA 1TQJA 3W84A 2BLEA 4MYAA 4Y8FA 1FXQA 2QAPA 3THAA 3S1XA 4Z1AA 3THQA 1YDVA 3LRKA 3MUXA 3P67A 4HSNA 3PY2A 4AB4A 1B57A 3FEMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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