The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
147
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structure length |
147
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Chain Sequence |
VDWTDAERSAIVGLWGKISVDEIGPQALARLLIVSPWTQRHFSTFGNLSTPAAIMGNPAVAKHGKTVMHGLDRAVQNLDDIKNTYVTLSVMHSEKLFVDPDNFRLLADCITVCVAAKLGPAVFSADTQEAFQKFLAVVVSALGRQYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-4
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| publication title |
Trout Hemoglobin Crystal Structure at 1.35 Angstroms Resolution.
rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
147
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| sequence length |
147
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2007-12-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MGI A; 1YZI B; 1RVW A; 1DO7 A; 1JF4 A; 1G08 B; 1A01 B; 5HLX A; 1LFQ A; 2Z6S A; 1A6M A; 3G4V A; 5E83 B; 1O1L B; 1JY7 B; 5CNB A; 4IT8 A; 3OGB A; 1HGA B; 5EE4 C; 1M9P A; 1DLW A; 2H8D A; 2BW9 M; 1A4F A; 4FC3 A; 5AB8 A; 4HRT A; 1Y5J A; 4MQK B; 1MOH A; 1GDI A; 1BVD A; 3GQR A; 112M A; 3HRW A; 1MWC A; 3NFE B; 2D60 A; 3ZOM A; 1UIW B; 2MGJ A; 1LH5 A; 1XZU B; 1L2K A; 2W72 A; 2V1G A; 5JOM A; 1MNJ A; 1JF3 A; 2GTL D; 1CQ2 A; 2G0X A; 3UGY A; 3HXN A; 2XYK A; 2EKT A; 1LH3 A; 1YGD B; 1CH4 A; 2MGH A; 1H1X A; 4F69 A; 109M A; 1YE2 B; 1Y45 A; 3UI0 A; 1YOI A; 4FWX A; 4FWY A; 1B86 A; 6HBW A; 4HSX A; 1Y35 A; 2E2Y A; 1RQ4 A; 1S6A A; 5HLU A; 2HHB B; 1RVW B; 4N7P A; 1IRD B; 2MGG A; 1CH5 A; 3AQ5 A; 3BJ2 A; 1XZV A; 2VYY A; 1OFK A; 1H97 A; 2QLS A; 3S66 B; 1MLJ A; 1YEN B; 5ILP A; 1MOD A; 2FAL A; 1VWT A; 4F6J A; 3DUT A; 1QPW A; 1UFP A; 1MWD A; 4HRT B; 2H8F A; 3HRW B; 2W6V A; 4MQC A; 102M A; 1YHU C; 1JP9 A; 4H2L B; 3UHR A; 3IA3 B; 3PI4 A; 5C6Y A; 2MGE A; 5F0B A; 4B4Y A; 6HBI A; 1QXD A; 2V1H A; 2MGL A; 2MGB A; 4OOD A; 2W6Y A; 2Z85 A; 5EOH A; 3RGK A; 1Y4Q B; 2QRW A; 1BBB B; 1UX9 A; 2XKH A; 3WHM B; 2ZSN A; 3MJP A; 1EMY A; 1LJW A; 1MBC A; 4DWT A; 5M3S A; 1YE0 A; 3WCU C; 1YG5 B; 4M4A B; 2QU0 A; 2O5B X; 3WCT C; 1MLH A; 1B86 B; 4X0L B; 3K3U A; 1WMU B; 2MYA A; 3HYU A; 1SWM A; 1T1N B; 4ZVB A; 1RQ4 B; 4PQC A; 1ASH A; 1O1P B; 3D1A A; 1J7S A; 1JEB A; 1BAB A; 4N7P B; 1XZ7 B; 4MBA A; 2R4X A; 1GBV B; 4L2M A; 4MXL A; 3ZJQ A; 3VHB A; 1CO8 A; 1HBS B; 3ODQ A; 3BJ3 B; 1Q1F A; 1VWT B; 1VXC A; 1HLB A; 2AUQ A; 2W31 A; 1F65 A; 2D2M D; 1W92 A; 1CH2 A; 5MBA A; 2ZSO A; 1MYH A; 1MLN A; 1A3N B; 2PEG A; 3ARL A; 1RTX A; 2MHB A; 1XYE B; 5KER A; 1DKE B; 1YHU B; 2DHB B; 1YIH A; 2D6C A; 5E6E A; 2ZFO A; 4NI1 B; 3S1I A; 1QXD B; 1NEJ B; 1Y0C A; 2GTL C; 1GBU A; 3GDJ A; 3HHB A; 5HLQ A; 1YEV A; 3GK9 A; 1DUK A; 1Y4B A; 3ZOL A; 2ZLW A; 2R80 A; 4NI0 B; 1LJW B; 3S48 C; 1QSI A; 1XXT B; 2ZLT A; 4ODC B; 3WCU B; 1GCW A; 3AT5 B; 3WCT B; 1X3K A; 4MAX A; 3LR9 A; 3QQR A; 1BJE A; 5CN6 A; 1O1I A; 3SDH A; 4N7N A; 1QXE B; 3IC2 A; 3UGZ A; 1A3O A; 4XS0 B; 2YRS A; 1TU9 A; 1CLS B; 1R1Y A; 1ECA A; 1K0Y A; 1IOP A; 1GDK A; 2LHB A; 2EVK A; 2QSP A; 1MYI A; 3ZJI A; 2DN3 B; 1XQ5 B; 1HV4 B; 3G4Q A; 1LFT B; 1UC3 A; 1GCV B; 2ZSR A; 1CMY A; 1V5H A; 3QMA A; 3S65 A; 1HGB A; 1GZX B; 1FDH G; 1XY0 B; 1HBB A; 1J41 A; 1K1K B; 2DXM B; 1Y5K B; 1NZ4 A; 2GL3 A; 2ZS0 A; 1LH2 A; 3BCQ A; 1YMB A; 3WCP B; 3UH7 A; 3E55 A; 1O1K B; 1XCH A; 1CH9 A; 2WY4 A; 2HBE B; 2NRM A; 2ZLU B; 3OJ1 A; 3UH6 A; 1J40 B; 1NIH A; 1Y22 A; 3GQG B; 2ZS1 A; 1Y0C B; 2QMB B; 1EBC A; 1Y0A A; 3QJB A; 1C40 A; 1HRM A; 1Y0T B; 1N9F A; 3WCW A; 4G51 A; 2ZT1 A; 3NG6 A; 2MYD A; 2ZLT B; 5JDO F; 1G0A A; 3QJD A; 1GCW B; 3AT6 A; 4PNJ A; 1WLA A; 4AVE A; 1CG5 B; 3WFT A; 5HU6 A; 3WR1 A; 3R5I A; 2Z8A A; 1OUT B; 5HY8 A; 5CNE A; 3DHR B; 1MYJ A; 2OH9 A; 1ABW B; 1DXC A; 2ZFB B; 2LH3 A; 1A0Z A; 4YU4 B; 2ZSY A; 1AJ9 B; 3PT8 A; 2HBS A; 5EUI A; 1A00 B; 3NMM A; 2GDM A; 1JDO A; 3D7O B; 1O16 A; 2Z6T A; 1HJT A; 1HDS B; 2D2M C; 2D5X A; 1YCA A; 1FSX B; 1X9F D; 3QJE A; 1AJH A; 4MQJ A; 3PI2 A; 3MJU B; 1YH9 B; 1QI8 A; 2ZSZ A; 1HGC B; 1NZ2 A; 1MTI A; 4MQH A; 1KFR A; 2HBG A; 3UHX A; 3ASE A; 2AUO A; 1Y4V A; 2FRI X; 3A0G A; 4U8U A; 3BOM A; 3D17 B; 1Y46 A; 3RJ6 A; 4NS2 A; 3UBC A; 2G0S A; 5EV5 A; 1Y4G A; 1HBA A; 2D2N C; 5CN4 A; 3FS4 A; 1Y8I A; 1Y8H B; 5JDO C; 3AG0 A; 1COH B; 1V4X A; 1LH1 A; 3BJ1 B; 1G0A B; 1YZI A; 5JDO E; 1SHR B; 4XDI A; 3UHH A; 2FRK X; 1Y7G B; 5HBI A; 1C7B B; 1JY7 A; 2R4Z A; 1HGA A; 1URV A; 1AJG A; 1LA6 A; 4WJG 1; 1CQX A; 1OJ6 A; 111M A; 2GRZ A; 1SPG B; 2WTG A; 1Y01 B; 4MQK A; 2BKM A; 5EQM A; 2HBD B; 2BLH A; 4MQI B; 3NFE A; 1IRC A; 3NMM B; 3UHW A; 1UIW A; 2O5T X; 1Y85 A; 3GOU A; 3CIU A; 1A6N A; 1B0B A; 1DO3 A; 1XZU A; 1OBM A; 1JP6 A; 1LUE A; 3QJE B; 3GLN A; 1J3Z B; 1DXD A; 1VHB A; 2QFN A; 1V75 B; 1XZ5 A; 2DN1 A; 4MQH B; 4TYX A; 3MOU A; 1VRE A; 3KUO A; 1MBD A; 3ZJL A; 1YE2 A; 3ARJ A; 1Y0W B; 1S61 A; 1O1M B; 5AZR A; 1HDA B; 1Y4G B; 4ROM B; 4B3W A; 2D2N B; 2AUP A; 3UHQ A; 1O1J B; 3QJC B; 1V4X B; 5E29 B; 2DN2 B; 4IRO B; 1NS6 B; 1HDB B; 4F6F A; 1VXH A; 2HHB A; 1MTJ A; 1SI4 B; 1CBL A; 1IRD A; 4MBN A; 3LB2 A; 3ORD A; 1MOC A; 1F5P A; 1OUU B; 3S66 A; 2G10 A; 1YEN A; 1YIE B; 3A59 B; 1LA6 B; 1MOB A; 1AZI A; 1DM1 A; 2B7H B; 2H35 A; 1RQ3 B; 2O5S X; 1Y31 B; 2MB5 A; 5C6E B; 1Y7Z B; 5SW7 B; 4H2L A; 2MGF A; 3U3E A; 1Y85 B; 1X9F C; 3CIU B; 3GOU B; 2HHD B; 1YEO B; 1YOH A; 2NSR A; 4F6D A; 1MYM A; 2W6X A; 5CN9 A; 1GVH A; 1MBA A; 2R4Y A; 1Y4Q A; 1BBB A; 1XZ5 B; 1EBT A; 1ITH A; 3S1J A; 3WHM A; 1IWH A; 2DN1 B; 1Y8K B; 2EF2 A; 1MKO B; 1GLI B; 2IG3 A; 2ZFO D; 3OZV A; 3QQQ A; 2FRF A; 1YG5 A; 4M4A A; 2G0R A; 1LFV A; 2V1I A; 1JZK A; 2PGH B; 4ILZ A; 1S56 A; 1LH6 A; 4X0L A; 3QZX A; 3A5G A; 3D4X B; 3UHE A; 3ZJJ A; 2CMM A; 1WMU A; 1DXT B; 1T1N A; 1C7C B; 2XKG A; 4MQG B; 1O1P A; 4WJG A; 4KJT A; 1I3D A; 1N9X A; 1XZ7 A; 4N8T B; 4DWU A; 1SDK B; 1BIJ B; 1OFJ A; 4KMW A; 1GBV A; 2M6Z A; 2RI4 B; 5ILM A; 3WCV C; 2ZLX B; 1HBS A; 3GKV B; 3BJ3 A; 1YMC A; 1Y83 B; 1NGK A; 2H35 B; 3E5I A; 1YEU A; 2G12 A; 2AV3 A; 3HEN A; 2HCO B; 3M3B A; 4HBI A; 1JW8 A; 1A3N A; 3CY5 B; 1YCB A; 3M3A A; 1XYE A; 1DKE A; 1YHU A; 2DHB A; 2MBW A; 3LB3 A; 4NI1 A; 3GYS A; 2O58 X; 1NEJ A; 1LFZ B; 3EU1 B; 4DC8 A; 1S5Y B; 4VHB A; 1A6K A; 4HHB A; 1Y4R B; 2ZS0 D; 1X46 A; 2EVP A; 1IWH B; 4NI0 A; 3A9M A; 3HEO A; 1XXT A; 4ODC A; 2LH6 A; 4GZG A; 3WCU A; 3ED9 A; 1MLL A; 1MNO A; 1LFV B; 1N9H A; 4F4O B; 2ZS1 D; 2G3H A; 3AT5 A; 3WCT A; 108M A; 4ZVA A; 3TLD A; 3EDB A; 1MBS A; 1QXE A; 1YEQ A; 4XS0 A; 1J3Y A; 3AQ8 A; 3WCW D; 1MLQ A; 3AQ6 A; 1CLS A; 1NPF A; 1BIN A; 1A0U A; 2DN3 A; 1VXB A; 2SPO A; 1XQ5 A; 5KDQ B; 2M6Z B; 1HV4 A; 1J7Y B; 1LFT A; 1GCV A; 3WCV B; 1IT3 A; 3WI8 A; 2MYC A; 1GZX A; 2MGM A; 1XY0 A; 3MN0 A; 5CN8 A; 3K8B B; 3PI8 B; 4QAU A; 1YEU B; 1K1K A; 2DXM A; 1Y5K A; 5D1V A; 2HHE B; 3WFU A; 3WCP A; 3A5A A; 1O1K A; 1Y4P B; 2HBE A; 3GYS B; 2G0Z A; 3SZK B; 2ZLU A; 3LR7 A; 1J40 A; 4AVD A; 3GQG A; 2O5L X; 2ZSP A; 1NQP B; 4HHB B; 2QMB A; 1BZ1 B; 3G46 A; 1TES A; 5JGG B; 1Y0T A; 2ZFO C; 1MYG A; 1DLY A; 2SPM A; 4U8U D; 3OK5 A; 1CBM A; 3LHB A; 3V2V A; 4C0N A; 1CG5 A; 1FAW A; 1MLG A; 1OUT A; 2HBF B; 3ZJH A; 4MPM A; 1MCY A; 1YEQ B; 3A2G A; 1R1X B; 3DHR A; 1J3Y B; 1ABW A; 2ZFB A; 1UT0 A; 4YU4 A; 4PQ6 A; 2GNW A; 4NK1 A; 1Y7C B; 2BNL A; 3UHV A; 1CH7 A; 1AJ9 A; 2VLZ A; 1A0U B; 5EET A; 1CG8 B; 3ZJS A; 1RSE A; 5CHR A; 1A00 A; 4N7O B; 3UHY A; 1KD2 B; 1V4U A; 4H07 A; 2R1H A; 3D7O A; 1MNK A; 1HDS A; 2HZ1 A; 1FSX A; 1YFF B; 4LPI A; 3QM7 A; 5ILE A; 2NSS A; 3MJU A; 1YH9 A; 4YU3 B; 1HGC A; 5CNF A; 1GJN A; 4ESA B; 1F5O A; 3OO5 B; 1MGN A; 2O5M X; 2C0K A; 3WTG A; 3D17 A; 2VYZ A; 2ZT0 A; 4MXK A; 3UHS A; 2GTL B; 4L7Y B; 2AA1 B; 3MKB B; 1J52 A; 1LH7 A; 3PI1 A; 1Y8H A; 2AV0 A; 1COH A; 2ZST A; 1MYF A; 1ECO A; 1HBH B; 3BJ1 A; 1URY A; 3UHD A; 1LFY A; 3AQ9 A; 3G4R A; 1CO9 A; 1C7D B; 1YVQ B; 1YDZ B; 1SHR A; 3EDA A; 3SDN A; 1FAW B; 1XZ4 B; 1Y7G A; 1BUW B; 2RAO B; 1D8U A; 1C7B A; 2ZSS A; 2VEE A; 2QSS B; 1RPS B; 3KMF A; 5F2A A; 1BZ0 A; 1HSY A; 1IDR A; 3NL7 B; 3TM3 A; 1DXU B; 2LH2 A; 2VLY A; 4F6B A; 1DXV B; 1S0H A; 1SPG A; 1N9I A; 2BLI A; 3ONZ A; 2VHB A; 2HBD A; 4MQI A; 4JYQ A; 1JPB A; 1V4U B; 1Y0D B; 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5MBN A; 1Y5F B; 3VRE B; 4UUR A; 4FH6 A; 2ZLV B; 3D4X A; 1HAB B; 3B75 B; 1V07 A; 2NX0 A; 1DXT A; 3PIA B; 1C7C A; 4MQG A; 3G52 A; 3WCU D; 3IC0 B; 4PQB A; 1EW6 A; 4N8T A; 3WCT D; 1SDK A; 1BIJ A; 2JHO A; 3DHT B; 2RI4 A; 1MBI A; 2GRF A; 2D5Z B; 1MTK A; 3ECX A; 1LFL B; 2ZLX A; 3G4W A; 3GKV A; 3GQP B; 2W6W A; 1JZL A; 3O7N A; 1Y83 A; 3HF4 B; 1IBE B; 1VRF A; 2HCO A; 4NXA A; 1XZ2 B; 3E4N A; 3CY5 A; 3ECL A; 2VRY A; 1X9F A; 3ZHW A; 3LB4 A; 3EU1 A; 1LFZ A; 1S5Y A; 1V4W B; 1VXE A; 1Y4R A; 1BVC A; 4M4B B; 1LHT A; 1ABY B; 4SDH A; 2V1J A; 2XKI A; 1YHR B; 3PT7 B; 1VXG A; 1YGF B; 2W72 C; 1SDL B; 4F4O A; 2HZ2 A; 1DO4 A; 1QSH A; 3UHZ A; 2GNV A; 1I3E A; 3OZW A; 3EOK A; 5B85 A; 3OO4 A; 4FWZ A; 1FN3 A; 1Y7D B; 5KDQ A; 1J7Y A; 3VRG B; 3WCV A; 3VAU A; 1HAC A; 1NZ5 A; 2NRL A; 3K8B A; 3ZJN A; 3PI8 A; 1LFQ B; 2EKU A; 1CIO A; 3O89 A; 4OF9 A; 2HHE A; 1S5X A; 1MLM A; 1Y4P A; 1M9P B; 106M A; 1UVY A; 2G14 A; 2OHA A; 1G09 A; 2MYE A; 1X9F B; 3SZK A; 2H8D B; 1MYT A; 1U7S A; 103M A; 1A4F B; 4FC3 B; 1Y5J B; 1NQP A; 1MZ0 A; 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